
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  124 (  959),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  820),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.68     0.68
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.68     0.68
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.68     0.68
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S    17_A     S    17_A    108  108  108      0    3   28   79  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    18_A     K    18_A    108  108  108      3    3   81  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A    108  108  108     35  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    20_A     T    20_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    21_A     S    21_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    22_A     I    22_A    108  108  108     66  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    23_A     L    23_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    24_A     N    24_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    25_A     P    25_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    26_A     A    26_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    27_A     D    27_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    28_A     I    28_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    30_A     K    30_A    108  108  108     53  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A    108  108  108     74  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    32_A     L    32_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    33_A     E    33_A    108  108  108     76  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    34_A     Q    34_A    108  108  108     22  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    35_A     C    35_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    36_A     A    36_A    108  108  108      6   32  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    37_A     A    37_A    108  108  108      6   32  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    38_A     G    38_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    39_A     F    39_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    40_A     H    40_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    41_A     H    41_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    42_A     T    42_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    43_A     A    43_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    45_A     F    45_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    46_A     K    46_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    47_A     A    47_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    48_A     S    48_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    49_A     G    49_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    50_A     L    50_A    108  108  108     77  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    52_A     K    52_A    108  108  108     77  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    53_A     K    53_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    54_A     S    54_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    55_A     D    55_A    108  108  108     66  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    56_A     A    56_A    108  108  108     68  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_A     E    57_A    108  108  108     77  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    58_A     L    58_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    59_A     A    59_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    60_A     E    60_A    108  108  108     66  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    61_A     I    61_A    108  108  108     66  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    62_A     F    62_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    63_A     N    63_A    108  108  108     74  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    64_A     V    64_A    108  108  108     38  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    65_A     L    65_A    108  108  108     38  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    66_A     D    66_A    108  108  108     38  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    67_A     G    67_A    108  108  108     31  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    68_A     D    68_A    108  108  108     28  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    69_A     Q    69_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    70_A     S    70_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    71_A     G    71_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    72_A     Y    72_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    73_A     I    73_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    74_A     E    74_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    75_A     V    75_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    76_A     E    76_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    77_A     E    77_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    78_A     L    78_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_A     K    79_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    80_A     N    80_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    81_A     F    81_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    82_A     L    82_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    83_A     K    83_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    84_A     C    84_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    85_A     F    85_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    86_A     S    86_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    87_A     D    87_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    88_A     G    88_A    108  108  108     77  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    89_A     A    89_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    90_A     R    90_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    91_A     V    91_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_A     L    92_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    93_A     N    93_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    94_A     D    94_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    95_A     K    95_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    96_A     E    96_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    97_A     T    97_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    98_A     S    98_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    99_A     N    99_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L   101_A     L   101_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   103_A     A   103_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   105_A     D   105_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   106_A     S   106_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   107_A     D   107_A    108  108  108     74  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   108_A     G   108_A    108  108  108     74  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   109_A     D   109_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H   110_A     H   110_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   111_A     K   111_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   112_A     I   112_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   113_A     G   113_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   114_A     V   114_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   115_A     D   115_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   116_A     E   116_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   117_A     F   117_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   118_A     K   118_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   119_A     S   119_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   120_A     M   120_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   121_A     A   121_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   122_A     K   122_A    108  108  108     78  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   123_A     M   123_A    108  108  108     33  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T   124_A     T   124_A    108  108  108     42  104  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     78    104    106    106    107    107    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  72.22  96.30  98.15  98.15  99.07  99.07 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.31   0.45   0.51   0.51   0.59   0.59   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68
GDT RMS_ALL_AT   0.70   0.69   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    33_A      E    33_A
#   possible swapping detected:  F    44_A      F    44_A
#   possible swapping detected:  F    62_A      F    62_A
#   possible swapping detected:  F    85_A      F    85_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S    17_A      S    17_A     3.569     0    0.160   0.660     7.235   46.905   37.302
LGA    K    18_A      K    18_A     3.068     0    0.622   1.007    12.254   67.262   33.439
LGA    I    19_A      I    19_A     0.906     0    0.102   0.866     2.679   90.833   82.024
LGA    T    20_A      T    20_A     0.551     0    0.104   0.151     1.329   90.595   86.667
LGA    S    21_A      S    21_A     0.469     0    0.031   0.046     0.971   97.619   95.238
LGA    I    22_A      I    22_A     0.641     0    0.042   0.118     1.406   95.238   90.595
LGA    L    23_A      L    23_A     0.373     0    0.049   0.081     0.910  100.000   95.238
LGA    N    24_A      N    24_A     0.378     0    0.062   1.143     3.647  100.000   80.238
LGA    P    25_A      P    25_A     0.470     0    0.033   0.142     0.554   97.619   98.639
LGA    A    26_A      A    26_A     0.371     0    0.046   0.051     0.471  100.000  100.000
LGA    D    27_A      D    27_A     0.442     0    0.027   0.100     0.838  100.000   96.429
LGA    I    28_A      I    28_A     0.352     0    0.022   0.156     0.692  100.000   97.619
LGA    T    29_A      T    29_A     0.325     0    0.029   0.920     2.047   97.619   89.728
LGA    K    30_A      K    30_A     0.715     0    0.032   1.026     4.353   90.476   77.090
LGA    A    31_A      A    31_A     0.572     0    0.040   0.047     0.636   90.476   90.476
LGA    L    32_A      L    32_A     0.194     0    0.016   0.141     0.815  100.000   98.810
LGA    E    33_A      E    33_A     0.466     0    0.017   0.882     2.977   95.238   79.683
LGA    Q    34_A      Q    34_A     0.985     0    0.113   0.987     2.649   88.214   80.794
LGA    C    35_A      C    35_A     0.602     0    0.057   0.784     1.427   90.595   87.540
LGA    A    36_A      A    36_A     1.710     0    0.052   0.056     2.448   75.238   73.143
LGA    A    37_A      A    37_A     1.962     0    0.314   0.311     3.162   67.143   66.667
LGA    G    38_A      G    38_A     0.031     0    0.039   0.039     0.376  100.000  100.000
LGA    F    39_A      F    39_A     0.187     0    0.036   0.045     0.560  100.000   97.403
LGA    H    40_A      H    40_A     0.301     0    0.035   0.127     1.258  100.000   92.476
LGA    H    41_A      H    41_A     0.394     0    0.042   0.318     1.482  100.000   92.524
LGA    T    42_A      T    42_A     0.445     0    0.021   0.042     0.494  100.000  100.000
LGA    A    43_A      A    43_A     0.357     0    0.032   0.042     0.437  100.000  100.000
LGA    F    44_A      F    44_A     0.225     0    0.022   0.227     1.022  100.000   96.580
LGA    F    45_A      F    45_A     0.198     0    0.060   0.087     0.602  100.000   97.403
LGA    K    46_A      K    46_A     0.320     0    0.030   0.718     1.987  100.000   89.894
LGA    A    47_A      A    47_A     0.340     0    0.034   0.049     0.440  100.000  100.000
LGA    S    48_A      S    48_A     0.418     0    0.042   0.043     0.753   95.238   96.825
LGA    G    49_A      G    49_A     0.523     0    0.091   0.091     0.546   95.238   95.238
LGA    L    50_A      L    50_A     0.612     0    0.017   0.163     1.083   90.476   89.345
LGA    S    51_A      S    51_A     0.588     0    0.168   0.174     1.279   88.214   87.460
LGA    K    52_A      K    52_A     0.681     0    0.138   1.127     4.214   88.214   73.280
LGA    K    53_A      K    53_A     0.332     0    0.039   0.466     1.261  100.000   95.820
LGA    S    54_A      S    54_A     0.500     0    0.039   0.597     1.654   95.238   90.714
LGA    D    55_A      D    55_A     0.665     0    0.077   0.839     2.976   90.476   79.940
LGA    A    56_A      A    56_A     0.652     0    0.030   0.047     0.884   90.476   90.476
LGA    E    57_A      E    57_A     0.520     0    0.028   0.070     0.590   95.238   93.651
LGA    L    58_A      L    58_A     0.279     0    0.038   0.213     0.782  100.000   97.619
LGA    A    59_A      A    59_A     0.482     0    0.034   0.049     0.751   95.238   94.286
LGA    E    60_A      E    60_A     0.739     0    0.038   1.192     5.613   90.476   65.397
LGA    I    61_A      I    61_A     0.624     0    0.040   0.702     2.758   90.476   86.310
LGA    F    62_A      F    62_A     0.264     0    0.032   0.221     0.780  100.000   95.671
LGA    N    63_A      N    63_A     0.608     0    0.073   0.929     4.235   90.595   72.917
LGA    V    64_A      V    64_A     0.978     0    0.075   0.091     1.816   90.476   82.925
LGA    L    65_A      L    65_A     0.804     0    0.059   0.063     1.004   90.476   89.345
LGA    D    66_A      D    66_A     0.618     0    0.065   0.152     0.833   90.476   92.857
LGA    G    67_A      G    67_A     0.685     0    0.086   0.086     0.735   90.476   90.476
LGA    D    68_A      D    68_A     0.744     0    0.129   0.226     1.038   95.238   91.726
LGA    Q    69_A      Q    69_A     0.473     0    0.059   1.271     4.436   97.619   80.212
LGA    S    70_A      S    70_A     0.197     0    0.031   0.038     0.445  100.000  100.000
LGA    G    71_A      G    71_A     0.156     0    0.039   0.039     0.175  100.000  100.000
LGA    Y    72_A      Y    72_A     0.280     0    0.034   0.202     2.169  100.000   87.103
LGA    I    73_A      I    73_A     0.312     0    0.031   0.483     1.622  100.000   95.417
LGA    E    74_A      E    74_A     0.215     0    0.035   0.171     0.497  100.000  100.000
LGA    V    75_A      V    75_A     0.026     0    0.028   0.087     0.452  100.000  100.000
LGA    E    76_A      E    76_A     0.301     0    0.030   1.347     7.236   97.619   67.302
LGA    E    77_A      E    77_A     0.364     0    0.048   0.118     0.590   97.619   98.942
LGA    L    78_A      L    78_A     0.235     0    0.028   1.327     2.749  100.000   87.917
LGA    K    79_A      K    79_A     0.284     0    0.088   0.829     3.318  100.000   81.693
LGA    N    80_A      N    80_A     0.265     0    0.081   1.117     2.274   97.619   90.000
LGA    F    81_A      F    81_A     0.130     0    0.041   0.101     0.478  100.000  100.000
LGA    L    82_A      L    82_A     0.263     0    0.024   0.099     0.514  100.000   98.810
LGA    K    83_A      K    83_A     0.336     0    0.058   0.714     3.200  100.000   88.201
LGA    C    84_A      C    84_A     0.497     0    0.047   0.738     3.155   97.619   88.492
LGA    F    85_A      F    85_A     0.332     0    0.062   0.140     0.617  100.000   97.403
LGA    S    86_A      S    86_A     0.215     0    0.102   0.565     2.061  100.000   94.127
LGA    D    87_A      D    87_A     0.543     0    0.064   0.931     2.963   92.857   84.107
LGA    G    88_A      G    88_A     0.722     0    0.117   0.117     0.722   95.238   95.238
LGA    A    89_A      A    89_A     0.345     0    0.046   0.062     0.443  100.000  100.000
LGA    R    90_A      R    90_A     0.322     0    0.026   0.737     1.728  100.000   91.602
LGA    V    91_A      V    91_A     0.303     0    0.029   1.218     2.944  100.000   88.844
LGA    L    92_A      L    92_A     0.351     0    0.037   0.057     0.377  100.000  100.000
LGA    N    93_A      N    93_A     0.508     0    0.043   0.770     2.931   95.238   85.357
LGA    D    94_A      D    94_A     0.401     0    0.058   1.000     3.772  100.000   84.107
LGA    K    95_A      K    95_A     0.344     0    0.031   0.742     4.960  100.000   82.857
LGA    E    96_A      E    96_A     0.273     0    0.029   0.149     0.671  100.000   97.884
LGA    T    97_A      T    97_A     0.326     0    0.024   0.101     0.675  100.000   97.279
LGA    S    98_A      S    98_A     0.150     0    0.047   0.741     2.214  100.000   94.127
LGA    N    99_A      N    99_A     0.299     0    0.026   1.190     4.744  100.000   81.667
LGA    F   100_A      F   100_A     0.295     0    0.026   0.516     1.303  100.000   93.160
LGA    L   101_A      L   101_A     0.269     0    0.028   1.058     2.909  100.000   89.048
LGA    A   102_A      A   102_A     0.264     0    0.051   0.052     0.505   97.619   98.095
LGA    A   103_A      A   103_A     0.545     0    0.016   0.038     0.735   92.857   92.381
LGA    G   104_A      G   104_A     0.312     0    0.035   0.035     0.380  100.000  100.000
LGA    D   105_A      D   105_A     0.248     0    0.040   0.093     0.449  100.000  100.000
LGA    S   106_A      S   106_A     0.232     0    0.158   0.617     1.872   97.619   92.302
LGA    D   107_A      D   107_A     0.523     0    0.167   0.241     1.492   90.595   89.405
LGA    G   108_A      G   108_A     0.574     0    0.041   0.041     0.574   97.619   97.619
LGA    D   109_A      D   109_A     0.335     0    0.092   0.162     0.820   97.619   96.429
LGA    H   110_A      H   110_A     0.378     0    0.021   1.454     5.875  100.000   68.810
LGA    K   111_A      K   111_A     0.392     0    0.029   0.151     1.566  100.000   91.799
LGA    I   112_A      I   112_A     0.381     0    0.015   0.574     2.283  100.000   95.595
LGA    G   113_A      G   113_A     0.213     0    0.022   0.022     0.311  100.000  100.000
LGA    V   114_A      V   114_A     0.147     0    0.019   1.111     2.521  100.000   88.844
LGA    D   115_A      D   115_A     0.039     0    0.030   0.457     1.927  100.000   94.226
LGA    E   116_A      E   116_A     0.274     0    0.046   0.327     0.982  100.000   97.884
LGA    F   117_A      F   117_A     0.309     0    0.025   0.086     0.412  100.000  100.000
LGA    K   118_A      K   118_A     0.277     0    0.035   0.690     2.181  100.000   92.169
LGA    S   119_A      S   119_A     0.217     0    0.024   0.043     0.289  100.000  100.000
LGA    M   120_A      M   120_A     0.316     0    0.031   1.110     2.320  100.000   89.881
LGA    A   121_A      A   121_A     0.269     0    0.050   0.055     0.501   97.619   98.095
LGA    K   122_A      K   122_A     0.421     0    0.122   0.968     5.925   97.619   74.339
LGA    M   123_A      M   123_A     0.770     0    0.566   0.816     3.408   82.262   71.905
LGA    T   124_A      T   124_A     0.696     0    0.694   1.088     4.861   67.381   57.347

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     820    820  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.682          0.751                  1.543           95.593   89.481

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  124  108    4.0    108    0.68    98.611    99.322    13.812

LGA_LOCAL      RMSD:   0.682  Number of atoms:  108  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.682  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.682  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.835787 * X  +  -0.416710 * Y  +   0.357509 * Z  +  -6.846903
  Y_new =  -0.140548 * X  +   0.791819 * Y  +   0.594365 * Z  + -41.728481
  Z_new =  -0.530760 * X  +   0.446515 * Y  +  -0.720360 * Z  +  64.812660 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -2.974990  0.559497  2.586705   [DEG: -170.4543   32.0568  148.2073 ]
ZXZ:  2.600073  2.375117 -0.871389   [DEG:  148.9732  136.0842  -49.9269 ]
 
# END of job
