
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  124 (  959),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  820),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.77     0.77
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.77     0.77
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.77     0.77
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S    17_A     S    17_A    108  108  108      0    3   60   97  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    18_A     K    18_A    108  108  108      3    3    4  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A    108  108  108     63  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    20_A     T    20_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    21_A     S    21_A    108  108  108     33  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    22_A     I    22_A    108  108  108     32  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    23_A     L    23_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    24_A     N    24_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    25_A     P    25_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    26_A     A    26_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    27_A     D    27_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    28_A     I    28_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    30_A     K    30_A    108  108  108     69  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A    108  108  108     70  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    32_A     L    32_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    33_A     E    33_A    108  108  108     70  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    34_A     Q    34_A    108  108  108     32  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    35_A     C    35_A    108  108  108     68  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    36_A     A    36_A    108  108  108      4   41  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    37_A     A    37_A    108  108  108      4    6  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    38_A     G    38_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    39_A     F    39_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    40_A     H    40_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    41_A     H    41_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    42_A     T    42_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    43_A     A    43_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    45_A     F    45_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    46_A     K    46_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    47_A     A    47_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    48_A     S    48_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    49_A     G    49_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    50_A     L    50_A    108  108  108     65  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    108  108  108      4   95  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    52_A     K    52_A    108  108  108      3   11  102  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    53_A     K    53_A    108  108  108     50  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    54_A     S    54_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    55_A     D    55_A    108  108  108     68  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    56_A     A    56_A    108  108  108     74  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_A     E    57_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    58_A     L    58_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    59_A     A    59_A    108  108  108     74  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    60_A     E    60_A    108  108  108     39  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    61_A     I    61_A    108  108  108     39  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    62_A     F    62_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    63_A     N    63_A    108  108  108     68  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    64_A     V    64_A    108  108  108     35  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    65_A     L    65_A    108  108  108     35  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    66_A     D    66_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    67_A     G    67_A    108  108  108     71  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    68_A     D    68_A    108  108  108     57  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    69_A     Q    69_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    70_A     S    70_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    71_A     G    71_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    72_A     Y    72_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    73_A     I    73_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    74_A     E    74_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    75_A     V    75_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    76_A     E    76_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    77_A     E    77_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    78_A     L    78_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_A     K    79_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    80_A     N    80_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    81_A     F    81_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    82_A     L    82_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    83_A     K    83_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    84_A     C    84_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    85_A     F    85_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    86_A     S    86_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    87_A     D    87_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    88_A     G    88_A    108  108  108     61  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    89_A     A    89_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    90_A     R    90_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    91_A     V    91_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_A     L    92_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    93_A     N    93_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    94_A     D    94_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    95_A     K    95_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    96_A     E    96_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    97_A     T    97_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    98_A     S    98_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    99_A     N    99_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L   101_A     L   101_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   103_A     A   103_A    108  108  108     35  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   105_A     D   105_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   106_A     S   106_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   107_A     D   107_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   108_A     G   108_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   109_A     D   109_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H   110_A     H   110_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   111_A     K   111_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   112_A     I   112_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   113_A     G   113_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   114_A     V   114_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   115_A     D   115_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   116_A     E   116_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   117_A     F   117_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   118_A     K   118_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   119_A     S   119_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   120_A     M   120_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   121_A     A   121_A    108  108  108     77  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   122_A     K   122_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   123_A     M   123_A    108  108  108     15   96  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T   124_A     T   124_A    108  108  108      3    3   13   20  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     77    100    104    105    106    107    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  71.30  92.59  96.30  97.22  98.15  99.07 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.31   0.44   0.54   0.56   0.65   0.69   0.77   0.77   0.77   0.77   0.77   0.77   0.77   0.77   0.77   0.77   0.77   0.77   0.77   0.77
GDT RMS_ALL_AT   0.78   0.77   0.77   0.77   0.77   0.77   0.77   0.77   0.77   0.77   0.77   0.77   0.77   0.77   0.77   0.77   0.77   0.77   0.77   0.77

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    33_A      E    33_A
#   possible swapping detected:  F    44_A      F    44_A
#   possible swapping detected:  F    45_A      F    45_A
#   possible swapping detected:  E    76_A      E    76_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S    17_A      S    17_A     3.410     0    0.099   0.675     6.961   46.905   37.857
LGA    K    18_A      K    18_A     3.133     0    0.624   0.729    13.224   65.238   32.646
LGA    I    19_A      I    19_A     0.712     0    0.113   0.865     2.521   90.833   84.226
LGA    T    20_A      T    20_A     0.525     0    0.086   0.122     1.398   90.595   86.667
LGA    S    21_A      S    21_A     0.834     0    0.030   0.051     1.307   88.214   85.952
LGA    I    22_A      I    22_A     0.651     0    0.048   0.069     1.581   95.238   89.524
LGA    L    23_A      L    23_A     0.191     0    0.037   0.053     0.698  100.000   97.619
LGA    N    24_A      N    24_A     0.116     0    0.064   1.055     3.689  100.000   84.167
LGA    P    25_A      P    25_A     0.257     0    0.034   0.141     0.479  100.000  100.000
LGA    A    26_A      A    26_A     0.244     0    0.045   0.051     0.303  100.000  100.000
LGA    D    27_A      D    27_A     0.279     0    0.028   0.064     0.409  100.000  100.000
LGA    I    28_A      I    28_A     0.279     0    0.021   0.588     1.786  100.000   95.417
LGA    T    29_A      T    29_A     0.268     0    0.032   0.934     2.031  100.000   91.088
LGA    K    30_A      K    30_A     0.562     0    0.030   1.009     3.602   92.857   83.651
LGA    A    31_A      A    31_A     0.526     0    0.034   0.044     0.617   95.238   96.190
LGA    L    32_A      L    32_A     0.161     0    0.019   0.106     0.681  100.000   98.810
LGA    E    33_A      E    33_A     0.568     0    0.032   1.113     4.182   92.857   76.243
LGA    Q    34_A      Q    34_A     0.852     0    0.091   1.147     2.489   88.214   80.741
LGA    C    35_A      C    35_A     0.711     0    0.206   0.859     1.844   90.595   87.619
LGA    A    36_A      A    36_A     1.686     0    0.065   0.069     2.585   73.333   73.238
LGA    A    37_A      A    37_A     2.031     0    0.299   0.296     3.164   65.119   65.048
LGA    G    38_A      G    38_A     0.055     0    0.048   0.048     0.446  100.000  100.000
LGA    F    39_A      F    39_A     0.165     0    0.040   0.043     0.451  100.000  100.000
LGA    H    40_A      H    40_A     0.269     0    0.047   0.167     1.109  100.000   94.333
LGA    H    41_A      H    41_A     0.313     0    0.021   0.299     1.591  100.000   91.667
LGA    T    42_A      T    42_A     0.401     0    0.035   1.118     2.444  100.000   89.932
LGA    A    43_A      A    43_A     0.395     0    0.027   0.040     0.541   97.619   98.095
LGA    F    44_A      F    44_A     0.223     0    0.023   0.099     0.595  100.000   98.268
LGA    F    45_A      F    45_A     0.170     0    0.054   0.662     2.162  100.000   88.398
LGA    K    46_A      K    46_A     0.297     0    0.050   0.668     3.275  100.000   83.545
LGA    A    47_A      A    47_A     0.304     0    0.036   0.048     0.338  100.000  100.000
LGA    S    48_A      S    48_A     0.275     0    0.028   0.039     0.522   97.619   98.413
LGA    G    49_A      G    49_A     0.451     0    0.086   0.086     0.547   97.619   97.619
LGA    L    50_A      L    50_A     0.630     0    0.036   0.200     1.121   90.476   89.345
LGA    S    51_A      S    51_A     1.175     0    0.668   0.579     3.030   75.833   74.841
LGA    K    52_A      K    52_A     1.725     0    0.144   0.592     5.706   79.405   59.683
LGA    K    53_A      K    53_A     0.739     0    0.062   0.864     1.866   90.595   85.556
LGA    S    54_A      S    54_A     0.506     0    0.037   0.051     0.631   97.619   95.238
LGA    D    55_A      D    55_A     0.658     0    0.090   0.925     3.306   90.476   78.869
LGA    A    56_A      A    56_A     0.626     0    0.029   0.045     0.830   90.476   90.476
LGA    E    57_A      E    57_A     0.426     0    0.025   0.336     1.107  100.000   97.937
LGA    L    58_A      L    58_A     0.326     0    0.040   0.224     0.892   97.619   96.429
LGA    A    59_A      A    59_A     0.589     0    0.030   0.049     0.775   90.476   90.476
LGA    E    60_A      E    60_A     0.830     0    0.034   0.883     3.906   90.476   78.519
LGA    I    61_A      I    61_A     0.713     0    0.038   0.711     2.774   90.476   86.310
LGA    F    62_A      F    62_A     0.406     0    0.029   0.081     0.645  100.000   96.537
LGA    N    63_A      N    63_A     0.695     0    0.066   1.019     4.343   88.214   72.321
LGA    V    64_A      V    64_A     0.988     0    0.065   0.097     1.837   90.476   82.925
LGA    L    65_A      L    65_A     0.739     0    0.049   0.059     0.918   90.476   90.476
LGA    D    66_A      D    66_A     0.498     0    0.043   0.070     0.566   92.857   96.429
LGA    G    67_A      G    67_A     0.609     0    0.088   0.088     0.632   90.476   90.476
LGA    D    68_A      D    68_A     0.788     0    0.137   0.231     1.109   90.476   89.345
LGA    Q    69_A      Q    69_A     0.523     0    0.084   0.882     4.541   95.238   74.603
LGA    S    70_A      S    70_A     0.160     0    0.034   0.038     0.328  100.000  100.000
LGA    G    71_A      G    71_A     0.399     0    0.034   0.034     0.399  100.000  100.000
LGA    Y    72_A      Y    72_A     0.208     0    0.043   0.090     0.916  100.000   96.032
LGA    I    73_A      I    73_A     0.291     0    0.020   0.105     0.456  100.000  100.000
LGA    E    74_A      E    74_A     0.178     0    0.029   0.150     0.499  100.000  100.000
LGA    V    75_A      V    75_A     0.070     0    0.036   1.025     2.377  100.000   89.932
LGA    E    76_A      E    76_A     0.272     0    0.034   0.965     5.883  100.000   69.630
LGA    E    77_A      E    77_A     0.351     0    0.046   0.111     0.699   97.619   95.767
LGA    L    78_A      L    78_A     0.239     0    0.031   1.340     2.788  100.000   86.726
LGA    K    79_A      K    79_A     0.311     0    0.092   0.774     1.926  100.000   90.847
LGA    N    80_A      N    80_A     0.309     0    0.089   0.354     1.363   97.619   95.298
LGA    F    81_A      F    81_A     0.166     0    0.047   0.090     0.408  100.000  100.000
LGA    L    82_A      L    82_A     0.210     0    0.020   0.075     0.449  100.000  100.000
LGA    K    83_A      K    83_A     0.252     0    0.052   0.175     1.185  100.000   93.757
LGA    C    84_A      C    84_A     0.391     0    0.069   0.071     0.664   97.619   95.238
LGA    F    85_A      F    85_A     0.372     0    0.057   0.105     0.659  100.000   98.268
LGA    S    86_A      S    86_A     0.234     0    0.093   0.100     0.379  100.000  100.000
LGA    D    87_A      D    87_A     0.585     0    0.051   1.150     3.475   92.857   81.071
LGA    G    88_A      G    88_A     0.759     0    0.113   0.113     0.759   95.238   95.238
LGA    A    89_A      A    89_A     0.333     0    0.032   0.046     0.462  100.000  100.000
LGA    R    90_A      R    90_A     0.240     0    0.020   0.168     0.420  100.000  100.000
LGA    V    91_A      V    91_A     0.275     0    0.018   0.151     0.687  100.000   97.279
LGA    L    92_A      L    92_A     0.276     0    0.054   0.072     0.329  100.000  100.000
LGA    N    93_A      N    93_A     0.485     0    0.034   0.858     2.384   92.857   84.107
LGA    D    94_A      D    94_A     0.481     0    0.052   0.117     0.832  100.000   97.619
LGA    K    95_A      K    95_A     0.330     0    0.020   1.214     6.055  100.000   79.894
LGA    E    96_A      E    96_A     0.351     0    0.036   0.139     0.843  100.000   96.825
LGA    T    97_A      T    97_A     0.392     0    0.028   0.103     0.710  100.000   95.918
LGA    S    98_A      S    98_A     0.168     0    0.049   0.739     2.133  100.000   94.127
LGA    N    99_A      N    99_A     0.313     0    0.026   1.182     4.899  100.000   80.714
LGA    F   100_A      F   100_A     0.496     0    0.025   0.623     1.727  100.000   89.913
LGA    L   101_A      L   101_A     0.487     0    0.026   0.088     0.579   97.619   97.619
LGA    A   102_A      A   102_A     0.422     0    0.048   0.049     0.598   95.238   96.190
LGA    A   103_A      A   103_A     0.689     0    0.019   0.035     0.905   90.476   90.476
LGA    G   104_A      G   104_A     0.488     0    0.034   0.034     0.516   97.619   97.619
LGA    D   105_A      D   105_A     0.384     0    0.036   0.208     0.517   97.619   97.619
LGA    S   106_A      S   106_A     0.362     0    0.153   0.630     1.078   97.619   93.730
LGA    D   107_A      D   107_A     0.476     0    0.159   0.204     1.217   92.976   90.595
LGA    G   108_A      G   108_A     0.392     0    0.044   0.044     0.392  100.000  100.000
LGA    D   109_A      D   109_A     0.448     0    0.098   0.140     0.675   95.238   96.429
LGA    H   110_A      H   110_A     0.492     0    0.030   1.405     5.766  100.000   69.000
LGA    K   111_A      K   111_A     0.452     0    0.029   0.600     1.283  100.000   94.815
LGA    I   112_A      I   112_A     0.309     0    0.017   0.593     2.439  100.000   95.595
LGA    G   113_A      G   113_A     0.099     0    0.026   0.026     0.234  100.000  100.000
LGA    V   114_A      V   114_A     0.234     0    0.019   1.066     2.570  100.000   88.844
LGA    D   115_A      D   115_A     0.130     0    0.027   0.197     0.854  100.000   97.619
LGA    E   116_A      E   116_A     0.205     0    0.034   0.155     0.587  100.000   98.942
LGA    F   117_A      F   117_A     0.301     0    0.025   0.117     0.824  100.000   95.671
LGA    K   118_A      K   118_A     0.248     0    0.030   0.046     0.617  100.000   97.884
LGA    S   119_A      S   119_A     0.114     0    0.019   0.658     2.469  100.000   94.127
LGA    M   120_A      M   120_A     0.247     0    0.025   0.678     2.007  100.000   92.083
LGA    A   121_A      A   121_A     0.314     0    0.048   0.051     0.570   97.619   98.095
LGA    K   122_A      K   122_A     0.657     0    0.081   0.683     5.984   92.857   68.413
LGA    M   123_A      M   123_A     1.449     0    0.273   0.635     8.148   75.476   48.155
LGA    T   124_A      T   124_A     2.920     0    0.147   1.159     6.683   64.881   49.592

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     820    820  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.768          0.779                  1.583           94.993   89.417

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  124  108    4.0    108    0.77    97.454    98.765    12.450

LGA_LOCAL      RMSD:   0.768  Number of atoms:  108  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.767  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.768  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.868156 * X  +  -0.368729 * Y  +   0.332180 * Z  +  -4.525084
  Y_new =  -0.131144 * X  +   0.815977 * Y  +   0.563012 * Z  + -39.734673
  Z_new =  -0.478650 * X  +   0.445219 * Y  +  -0.756752 * Z  +  66.293198 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -2.991666  0.499117  2.609799   [DEG: -171.4099   28.5973  149.5305 ]
ZXZ:  2.608555  2.429127 -0.821568   [DEG:  149.4592  139.1787  -47.0724 ]
 
# END of job
