
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  124 (  959),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  820),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.78     0.78
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.78     0.78
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.78     0.78
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S    17_A     S    17_A    108  108  108      0    0    3   38  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    18_A     K    18_A    108  108  108      3    3    4  101  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A    108  108  108     16  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    20_A     T    20_A    108  108  108     65  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    21_A     S    21_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    22_A     I    22_A    108  108  108     23  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    23_A     L    23_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    24_A     N    24_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    25_A     P    25_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    26_A     A    26_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    27_A     D    27_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    28_A     I    28_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    30_A     K    30_A    108  108  108     30  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A    108  108  108     46  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    32_A     L    32_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    33_A     E    33_A    108  108  108     44  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    34_A     Q    34_A    108  108  108     30  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    35_A     C    35_A    108  108  108     63  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    36_A     A    36_A    108  108  108      4   48   89  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    37_A     A    37_A    108  108  108      4    6  101  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    38_A     G    38_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    39_A     F    39_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    40_A     H    40_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    41_A     H    41_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    42_A     T    42_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    43_A     A    43_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    45_A     F    45_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    46_A     K    46_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    47_A     A    47_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    48_A     S    48_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    49_A     G    49_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    50_A     L    50_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    108  108  108     18  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    52_A     K    52_A    108  108  108     25   95  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    53_A     K    53_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    54_A     S    54_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    55_A     D    55_A    108  108  108     41  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    56_A     A    56_A    108  108  108     54  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_A     E    57_A    108  108  108     67  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    58_A     L    58_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    59_A     A    59_A    108  108  108     67  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    60_A     E    60_A    108  108  108     41  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    61_A     I    61_A    108  108  108     41  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    62_A     F    62_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    63_A     N    63_A    108  108  108     60  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    64_A     V    64_A    108  108  108     41  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    65_A     L    65_A    108  108  108     36  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    66_A     D    66_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    67_A     G    67_A    108  108  108     67  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    68_A     D    68_A    108  108  108     33  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    69_A     Q    69_A    108  108  108     67  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    70_A     S    70_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    71_A     G    71_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    72_A     Y    72_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    73_A     I    73_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    74_A     E    74_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    75_A     V    75_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    76_A     E    76_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    77_A     E    77_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    78_A     L    78_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_A     K    79_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    80_A     N    80_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    81_A     F    81_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    82_A     L    82_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    83_A     K    83_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    84_A     C    84_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    85_A     F    85_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    86_A     S    86_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    87_A     D    87_A    108  108  108     57  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    88_A     G    88_A    108  108  108     57  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    89_A     A    89_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    90_A     R    90_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    91_A     V    91_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_A     L    92_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    93_A     N    93_A    108  108  108     56  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    94_A     D    94_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    95_A     K    95_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    96_A     E    96_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    97_A     T    97_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    98_A     S    98_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    99_A     N    99_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L   101_A     L   101_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   103_A     A   103_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   105_A     D   105_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   106_A     S   106_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   107_A     D   107_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   108_A     G   108_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   109_A     D   109_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H   110_A     H   110_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   111_A     K   111_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   112_A     I   112_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   113_A     G   113_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   114_A     V   114_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   115_A     D   115_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   116_A     E   116_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   117_A     F   117_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   118_A     K   118_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   119_A     S   119_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   120_A     M   120_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   121_A     A   121_A    108  108  108     68  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   122_A     K   122_A    108  108  108     36  101  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   123_A     M   123_A    108  108  108      3   70  103  105  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T   124_A     T   124_A    108  108  108      0    3   13   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     68    101    103    105    106    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  62.96  93.52  95.37  97.22  98.15 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.33   0.50   0.54   0.60   0.65   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78
GDT RMS_ALL_AT   0.81   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  F    44_A      F    44_A
#   possible swapping detected:  F    45_A      F    45_A
#   possible swapping detected:  E    57_A      E    57_A
#   possible swapping detected:  E    76_A      E    76_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S    17_A      S    17_A     3.173     0    0.307   0.440     6.312   52.500   43.095
LGA    K    18_A      K    18_A     3.161     0    0.630   0.835    14.471   65.238   32.169
LGA    I    19_A      I    19_A     1.145     0    0.100   0.902     2.862   86.190   77.619
LGA    T    20_A      T    20_A     0.674     0    0.102   1.220     3.692   88.214   75.374
LGA    S    21_A      S    21_A     0.509     0    0.027   0.580     1.106   92.857   90.556
LGA    I    22_A      I    22_A     0.845     0    0.049   1.218     3.141   95.238   79.286
LGA    L    23_A      L    23_A     0.332     0    0.063   0.093     1.010  100.000   94.107
LGA    N    24_A      N    24_A     0.327     0    0.058   1.173     3.992  100.000   83.155
LGA    P    25_A      P    25_A     0.511     0    0.027   0.145     0.565   95.238   97.279
LGA    A    26_A      A    26_A     0.385     0    0.048   0.053     0.492  100.000  100.000
LGA    D    27_A      D    27_A     0.420     0    0.023   0.084     0.507  100.000   97.619
LGA    I    28_A      I    28_A     0.337     0    0.021   0.137     0.754  100.000   97.619
LGA    T    29_A      T    29_A     0.305     0    0.030   1.166     2.727  100.000   88.844
LGA    K    30_A      K    30_A     0.673     0    0.026   1.014     4.005   92.857   76.296
LGA    A    31_A      A    31_A     0.600     0    0.035   0.045     0.618   90.476   90.476
LGA    L    32_A      L    32_A     0.218     0    0.019   0.126     1.089  100.000   96.488
LGA    E    33_A      E    33_A     0.632     0    0.032   1.059     5.249   92.857   73.439
LGA    Q    34_A      Q    34_A     0.928     0    0.074   0.608     2.058   88.214   82.593
LGA    C    35_A      C    35_A     0.743     0    0.197   0.852     1.895   90.595   87.619
LGA    A    36_A      A    36_A     1.715     0    0.060   0.064     2.566   73.333   71.619
LGA    A    37_A      A    37_A     2.051     0    0.304   0.301     3.180   65.119   65.048
LGA    G    38_A      G    38_A     0.127     0    0.050   0.050     0.482  100.000  100.000
LGA    F    39_A      F    39_A     0.212     0    0.035   0.046     0.583  100.000   97.403
LGA    H    40_A      H    40_A     0.137     0    0.050   1.259     6.419  100.000   69.667
LGA    H    41_A      H    41_A     0.282     0    0.031   0.306     1.565  100.000   91.667
LGA    T    42_A      T    42_A     0.468     0    0.017   1.169     2.426  100.000   88.571
LGA    A    43_A      A    43_A     0.461     0    0.032   0.045     0.597   97.619   98.095
LGA    F    44_A      F    44_A     0.281     0    0.020   0.263     1.016  100.000   96.580
LGA    F    45_A      F    45_A     0.181     0    0.052   0.642     2.179  100.000   88.398
LGA    K    46_A      K    46_A     0.218     0    0.036   0.855     4.483  100.000   78.201
LGA    A    47_A      A    47_A     0.417     0    0.041   0.052     0.481  100.000  100.000
LGA    S    48_A      S    48_A     0.444     0    0.034   0.594     1.985   97.619   93.889
LGA    G    49_A      G    49_A     0.426     0    0.058   0.058     0.439  100.000  100.000
LGA    L    50_A      L    50_A     0.369     0    0.039   0.668     1.795   97.619   92.024
LGA    S    51_A      S    51_A     0.658     0    0.673   0.835     3.013   82.738   80.873
LGA    K    52_A      K    52_A     1.312     0    0.119   0.779     2.027   88.333   80.741
LGA    K    53_A      K    53_A     0.260     0    0.062   0.263     0.921   97.619   97.884
LGA    S    54_A      S    54_A     0.377     0    0.041   0.063     0.528   97.619   95.238
LGA    D    55_A      D    55_A     0.781     0    0.083   0.795     3.175   90.476   76.012
LGA    A    56_A      A    56_A     0.638     0    0.030   0.048     0.822   90.476   90.476
LGA    E    57_A      E    57_A     0.571     0    0.023   0.519     1.560   90.476   88.571
LGA    L    58_A      L    58_A     0.465     0    0.038   0.181     0.519  100.000   98.810
LGA    A    59_A      A    59_A     0.555     0    0.037   0.055     0.778   90.476   90.476
LGA    E    60_A      E    60_A     0.849     0    0.037   0.942     3.421   90.476   73.862
LGA    I    61_A      I    61_A     0.801     0    0.058   1.514     4.277   90.476   77.440
LGA    F    62_A      F    62_A     0.361     0    0.023   0.054     0.457  100.000  100.000
LGA    N    63_A      N    63_A     0.638     0    0.043   1.122     5.308   90.476   72.321
LGA    V    64_A      V    64_A     0.904     0    0.066   0.087     1.534   90.476   84.150
LGA    L    65_A      L    65_A     0.763     0    0.038   0.075     1.113   90.476   89.345
LGA    D    66_A      D    66_A     0.516     0    0.039   0.097     0.549   92.857   96.429
LGA    G    67_A      G    67_A     0.588     0    0.078   0.078     0.744   90.476   90.476
LGA    D    68_A      D    68_A     0.956     0    0.122   0.233     1.244   90.476   88.214
LGA    Q    69_A      Q    69_A     0.627     0    0.099   1.178     5.305   95.238   71.058
LGA    S    70_A      S    70_A     0.421     0    0.044   0.043     0.571   97.619   98.413
LGA    G    71_A      G    71_A     0.336     0    0.041   0.041     0.343  100.000  100.000
LGA    Y    72_A      Y    72_A     0.348     0    0.045   0.073     0.885  100.000   96.825
LGA    I    73_A      I    73_A     0.374     0    0.023   0.089     0.462  100.000  100.000
LGA    E    74_A      E    74_A     0.256     0    0.030   0.164     0.610  100.000   98.942
LGA    V    75_A      V    75_A     0.193     0    0.040   0.117     0.416  100.000  100.000
LGA    E    76_A      E    76_A     0.361     0    0.032   1.270     6.678   97.619   68.730
LGA    E    77_A      E    77_A     0.423     0    0.054   0.137     0.697   97.619   96.825
LGA    L    78_A      L    78_A     0.275     0    0.027   1.336     2.835  100.000   87.917
LGA    K    79_A      K    79_A     0.300     0    0.065   0.604     2.115   97.619   85.979
LGA    N    80_A      N    80_A     0.329     0    0.071   0.169     0.798   97.619   96.429
LGA    F    81_A      F    81_A     0.300     0    0.042   0.102     0.481  100.000  100.000
LGA    L    82_A      L    82_A     0.413     0    0.024   0.088     0.593  100.000   98.810
LGA    K    83_A      K    83_A     0.539     0    0.067   0.815     2.112   90.476   84.603
LGA    C    84_A      C    84_A     0.585     0    0.055   0.840     3.613   92.857   84.206
LGA    F    85_A      F    85_A     0.603     0    0.050   0.130     0.788   90.476   93.939
LGA    S    86_A      S    86_A     0.611     0    0.093   0.096     0.818   90.476   93.651
LGA    D    87_A      D    87_A     0.809     0    0.066   1.174     3.919   90.476   77.024
LGA    G    88_A      G    88_A     0.829     0    0.104   0.104     0.829   90.476   90.476
LGA    A    89_A      A    89_A     0.589     0    0.041   0.049     0.635   90.476   90.476
LGA    R    90_A      R    90_A     0.538     0    0.026   0.991     1.839   90.476   85.628
LGA    V    91_A      V    91_A     0.426     0    0.027   1.125     2.875  100.000   88.844
LGA    L    92_A      L    92_A     0.372     0    0.051   0.080     0.396  100.000  100.000
LGA    N    93_A      N    93_A     0.709     0    0.056   0.724     1.816   90.476   84.940
LGA    D    94_A      D    94_A     0.432     0    0.061   0.184     0.701   97.619   97.619
LGA    K    95_A      K    95_A     0.427     0    0.028   1.139     6.126  100.000   71.587
LGA    E    96_A      E    96_A     0.400     0    0.032   0.352     1.204  100.000   94.815
LGA    T    97_A      T    97_A     0.441     0    0.023   0.104     0.792  100.000   95.918
LGA    S    98_A      S    98_A     0.254     0    0.041   0.730     2.038  100.000   94.127
LGA    N    99_A      N    99_A     0.343     0    0.034   0.862     1.916  100.000   92.024
LGA    F   100_A      F   100_A     0.443     0    0.020   0.681     1.770  100.000   89.091
LGA    L   101_A      L   101_A     0.399     0    0.025   1.028     2.444  100.000   91.190
LGA    A   102_A      A   102_A     0.337     0    0.029   0.040     0.472  100.000  100.000
LGA    A   103_A      A   103_A     0.620     0    0.012   0.036     0.787   92.857   92.381
LGA    G   104_A      G   104_A     0.619     0    0.027   0.027     0.657   90.476   90.476
LGA    D   105_A      D   105_A     0.451     0    0.063   0.162     0.653   97.619   97.619
LGA    S   106_A      S   106_A     0.441     0    0.123   0.116     1.167   97.619   93.730
LGA    D   107_A      D   107_A     0.484     0    0.155   0.191     1.172   92.976   90.595
LGA    G   108_A      G   108_A     0.377     0    0.045   0.045     0.377  100.000  100.000
LGA    D   109_A      D   109_A     0.365     0    0.107   0.166     0.725   97.619   97.619
LGA    H   110_A      H   110_A     0.410     0    0.032   0.388     1.225  100.000   94.381
LGA    K   111_A      K   111_A     0.366     0    0.027   0.600     2.373  100.000   90.899
LGA    I   112_A      I   112_A     0.441     0    0.017   0.627     2.426  100.000   92.024
LGA    G   113_A      G   113_A     0.281     0    0.025   0.025     0.359  100.000  100.000
LGA    V   114_A      V   114_A     0.153     0    0.016   1.073     2.383  100.000   89.932
LGA    D   115_A      D   115_A     0.171     0    0.031   0.238     0.773  100.000   97.619
LGA    E   116_A      E   116_A     0.334     0    0.038   0.354     1.126  100.000   96.878
LGA    F   117_A      F   117_A     0.346     0    0.019   0.149     1.090  100.000   93.160
LGA    K   118_A      K   118_A     0.319     0    0.032   0.625     1.800  100.000   92.910
LGA    S   119_A      S   119_A     0.244     0    0.015   0.044     0.265  100.000  100.000
LGA    M   120_A      M   120_A     0.380     0    0.020   0.948     3.227   97.619   90.179
LGA    A   121_A      A   121_A     0.523     0    0.040   0.045     0.847   92.857   94.286
LGA    K   122_A      K   122_A     0.789     0    0.085   0.553     2.288   90.595   79.894
LGA    M   123_A      M   123_A     1.675     0    0.277   1.105    10.131   71.071   45.357
LGA    T   124_A      T   124_A     2.685     0    0.525   0.578     4.060   65.000   55.782

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     820    820  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.778          0.768                  1.659           94.446   88.351

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  124  108    4.0    108    0.78    97.685    98.826    12.305

LGA_LOCAL      RMSD:   0.778  Number of atoms:  108  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.778  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.778  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.323851 * X  +   0.369462 * Y  +  -0.870987 * Z  +  27.042250
  Y_new =   0.490543 * X  +   0.852763 * Y  +   0.179338 * Z  + -11.781956
  Z_new =   0.809004 * X  +  -0.369178 * Y  +  -0.457406 * Z  +  -2.496277 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  2.154301 -0.942456 -2.462529   [DEG:  123.4323  -53.9987 -141.0925 ]
ZXZ: -1.773860  2.045872  1.998907   [DEG: -101.6347  117.2198  114.5290 ]
 
# END of job
