
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  116 (  887),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  820),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       1.23     1.23
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       1.23     1.23
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   100      23_A - 122_A       0.99     1.26
  LCS_AVERAGE:     90.23

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S    17_A     S    17_A     58  108  108      4   11   54   83  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    18_A     K    18_A     68  108  108      4   14   54   81  100  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A     69  108  108      4   61   91  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    20_A     T    20_A     69  108  108     20   50   87  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    21_A     S    21_A     69  108  108     21   50   86  100  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    22_A     I    22_A     69  108  108     28   61   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    23_A     L    23_A    100  108  108     28   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    24_A     N    24_A    100  108  108     21   61   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    25_A     P    25_A    100  108  108     21   61   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    26_A     A    26_A    100  108  108     28   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    27_A     D    27_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    28_A     I    28_A    100  108  108     23   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A    100  108  108     28   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    30_A     K    30_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A    100  108  108     23   74   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    32_A     L    32_A    100  108  108     23   64   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    33_A     E    33_A    100  108  108     23   67   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    34_A     Q    34_A    100  108  108     21   46   91  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    35_A     C    35_A    100  108  108      3   32   63  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    36_A     A    36_A    100  108  108      3   17   91  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    37_A     A    37_A    100  108  108     18   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    38_A     G    38_A    100  108  108     26   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    39_A     F    39_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    40_A     H    40_A    100  108  108     14   74   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    41_A     H    41_A    100  108  108     17   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    42_A     T    42_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    43_A     A    43_A    100  108  108     28   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    45_A     F    45_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    46_A     K    46_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    47_A     A    47_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    48_A     S    48_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    49_A     G    49_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    50_A     L    50_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    100  108  108     28   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    52_A     K    52_A    100  108  108     28   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    53_A     K    53_A    100  108  108     28   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    54_A     S    54_A    100  108  108     28   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    55_A     D    55_A    100  108  108     28   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    56_A     A    56_A    100  108  108     28   74   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_A     E    57_A    100  108  108     28   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    58_A     L    58_A    100  108  108     29   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    59_A     A    59_A    100  108  108     29   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    60_A     E    60_A    100  108  108     28   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    61_A     I    61_A    100  108  108     28   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    62_A     F    62_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    63_A     N    63_A    100  108  108     29   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    64_A     V    64_A    100  108  108     28   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    65_A     L    65_A    100  108  108     28   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    66_A     D    66_A    100  108  108     28   66   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    67_A     G    67_A    100  108  108     15   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    68_A     D    68_A    100  108  108     27   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    69_A     Q    69_A    100  108  108     27   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    70_A     S    70_A    100  108  108      9   68   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    71_A     G    71_A    100  108  108      8   70   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    72_A     Y    72_A    100  108  108     27   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    73_A     I    73_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    74_A     E    74_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    75_A     V    75_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    76_A     E    76_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    77_A     E    77_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    78_A     L    78_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_A     K    79_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    80_A     N    80_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    81_A     F    81_A    100  108  108     18   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    82_A     L    82_A    100  108  108     20   76   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    83_A     K    83_A    100  108  108     30   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    84_A     C    84_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    85_A     F    85_A    100  108  108     18   75   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    86_A     S    86_A    100  108  108     20   68   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    87_A     D    87_A    100  108  108      5   28   76   96  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    88_A     G    88_A    100  108  108      5   22   33   65   97  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    89_A     A    89_A    100  108  108      5   52   84  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    90_A     R    90_A    100  108  108      5   52   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    91_A     V    91_A    100  108  108     17   74   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_A     L    92_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    93_A     N    93_A    100  108  108     20   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    94_A     D    94_A    100  108  108     20   73   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    95_A     K    95_A    100  108  108     20   73   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    96_A     E    96_A    100  108  108     30   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    97_A     T    97_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    98_A     S    98_A    100  108  108     27   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    99_A     N    99_A    100  108  108     27   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L   101_A     L   101_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    100  108  108     22   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   103_A     A   103_A    100  108  108     27   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   105_A     D   105_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   106_A     S   106_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   107_A     D   107_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   108_A     G   108_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   109_A     D   109_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H   110_A     H   110_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   111_A     K   111_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   112_A     I   112_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   113_A     G   113_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   114_A     V   114_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   115_A     D   115_A    100  108  108     27   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   116_A     E   116_A    100  108  108     31   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   117_A     F   117_A    100  108  108     30   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   118_A     K   118_A    100  108  108     27   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   119_A     S   119_A    100  108  108     27   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   120_A     M   120_A    100  108  108     25   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   121_A     A   121_A    100  108  108     25   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   122_A     K   122_A    100  108  108     27   77   92  101  103  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   123_A     M   123_A     88  108  108      3    5   61   93  100  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T   124_A     T   124_A     34  108  108      3    3   24   35   61  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  96.74  (  90.23  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     31     77     92    101    103    106    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  28.70  71.30  85.19  93.52  95.37  98.15 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.37   0.66   0.79   0.95   1.01   1.16   1.23   1.23   1.23   1.23   1.23   1.23   1.23   1.23   1.23   1.23   1.23   1.23   1.23   1.23
GDT RMS_ALL_AT   1.36   1.27   1.26   1.24   1.24   1.24   1.23   1.23   1.23   1.23   1.23   1.23   1.23   1.23   1.23   1.23   1.23   1.23   1.23   1.23

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  F    44_A      F    44_A
#   possible swapping detected:  Y    72_A      Y    72_A
#   possible swapping detected:  E    76_A      E    76_A
#   possible swapping detected:  D    87_A      D    87_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S    17_A      S    17_A     3.269     0    0.575   0.906     4.997   48.571   45.952
LGA    K    18_A      K    18_A     3.493     0    0.040   0.227     8.177   53.571   34.392
LGA    I    19_A      I    19_A     1.557     0    0.090   0.627     2.253   70.833   69.821
LGA    T    20_A      T    20_A     1.902     0    0.018   0.064     2.292   72.857   69.388
LGA    S    21_A      S    21_A     2.212     0    0.179   0.657     4.172   64.762   58.889
LGA    I    22_A      I    22_A     1.419     0    0.077   0.142     1.898   79.286   78.214
LGA    L    23_A      L    23_A     1.053     0    0.147   0.225     2.223   77.262   85.060
LGA    N    24_A      N    24_A     1.555     0    0.022   0.071     2.477   81.548   75.179
LGA    P    25_A      P    25_A     1.439     0    0.034   0.137     2.537   81.548   74.422
LGA    A    26_A      A    26_A     0.812     0    0.019   0.025     1.040   90.595   88.762
LGA    D    27_A      D    27_A     0.218     0    0.023   0.064     1.157   97.619   94.107
LGA    I    28_A      I    28_A     0.666     0    0.008   0.084     1.362   92.857   90.536
LGA    T    29_A      T    29_A     0.630     0    0.022   0.052     0.843   92.857   91.837
LGA    K    30_A      K    30_A     0.334     0    0.033   0.772     4.493   95.238   71.746
LGA    A    31_A      A    31_A     0.937     0    0.036   0.043     1.490   85.952   86.857
LGA    L    32_A      L    32_A     1.310     0    0.018   0.042     1.584   79.286   80.357
LGA    E    33_A      E    33_A     1.319     0    0.008   0.938     4.470   77.143   67.884
LGA    Q    34_A      Q    34_A     1.784     0    0.069   0.295     2.403   68.810   70.159
LGA    C    35_A      C    35_A     2.352     0    0.134   0.144     3.250   66.786   62.381
LGA    A    36_A      A    36_A     1.800     0    0.635   0.614     3.786   65.476   66.952
LGA    A    37_A      A    37_A     1.297     0    0.041   0.040     1.710   85.952   83.333
LGA    G    38_A      G    38_A     0.543     0    0.101   0.101     0.715   90.476   90.476
LGA    F    39_A      F    39_A     0.339     0    0.242   0.432     1.369   95.357   94.892
LGA    H    40_A      H    40_A     0.924     0    0.017   1.082     5.865   90.476   63.714
LGA    H    41_A      H    41_A     0.694     0    0.081   1.293     6.053   95.238   67.762
LGA    T    42_A      T    42_A     0.340     0    0.018   1.174     3.166  100.000   86.463
LGA    A    43_A      A    43_A     0.513     0    0.010   0.023     0.710   97.619   96.190
LGA    F    44_A      F    44_A     0.332     0    0.017   0.162     0.752  100.000   97.403
LGA    F    45_A      F    45_A     0.230     0    0.052   0.696     3.418  100.000   84.935
LGA    K    46_A      K    46_A     0.476     0    0.021   1.000     7.047  100.000   69.153
LGA    A    47_A      A    47_A     0.573     0    0.010   0.016     0.687   92.857   92.381
LGA    S    48_A      S    48_A     0.560     0    0.079   0.096     0.560   95.238   95.238
LGA    G    49_A      G    49_A     0.508     0    0.084   0.084     0.537   95.238   95.238
LGA    L    50_A      L    50_A     0.324     0    0.057   1.357     3.068   97.619   82.798
LGA    S    51_A      S    51_A     0.716     0    0.062   0.062     1.184   90.595   89.048
LGA    K    52_A      K    52_A     0.718     0    0.015   0.695     2.025   90.476   85.661
LGA    K    53_A      K    53_A     0.525     0    0.037   0.513     2.229   90.476   86.878
LGA    S    54_A      S    54_A     0.776     0    0.020   0.036     0.882   90.476   90.476
LGA    D    55_A      D    55_A     0.786     0    0.081   0.813     2.859   90.476   80.893
LGA    A    56_A      A    56_A     0.847     0    0.037   0.038     1.077   90.476   88.667
LGA    E    57_A      E    57_A     0.655     0    0.011   0.131     0.821   95.238   92.593
LGA    L    58_A      L    58_A     0.344     0    0.032   0.074     0.430  100.000  100.000
LGA    A    59_A      A    59_A     0.351     0    0.018   0.022     0.494  100.000  100.000
LGA    E    60_A      E    60_A     0.558     0    0.008   0.548     2.219   92.857   88.677
LGA    I    61_A      I    61_A     0.481     0    0.008   0.619     1.842  100.000   94.226
LGA    F    62_A      F    62_A     0.291     0    0.012   0.155     0.700  100.000   97.403
LGA    N    63_A      N    63_A     0.452     0    0.038   0.142     0.761   95.238   96.429
LGA    V    64_A      V    64_A     0.688     0    0.094   1.166     3.231   88.214   80.884
LGA    L    65_A      L    65_A     0.743     0    0.037   0.146     1.114   88.214   89.405
LGA    D    66_A      D    66_A     1.234     0    0.391   1.134     3.224   73.690   77.738
LGA    G    67_A      G    67_A     1.072     0    0.171   0.171     1.072   85.952   85.952
LGA    D    68_A      D    68_A     1.279     0    0.065   1.212     3.973   81.429   74.524
LGA    Q    69_A      Q    69_A     1.285     0    0.015   1.060     3.307   81.429   77.937
LGA    S    70_A      S    70_A     1.615     0    0.011   0.048     1.750   75.000   75.714
LGA    G    71_A      G    71_A     1.396     0    0.009   0.009     1.396   81.429   81.429
LGA    Y    72_A      Y    72_A     0.768     0    0.064   0.260     2.932   90.476   78.968
LGA    I    73_A      I    73_A     0.430     0    0.039   0.098     0.815   97.619   97.619
LGA    E    74_A      E    74_A     0.247     0    0.038   0.702     2.794  100.000   88.307
LGA    V    75_A      V    75_A     0.654     0    0.058   1.130     3.189   92.857   83.537
LGA    E    76_A      E    76_A     0.819     0    0.044   0.549     1.038   90.476   91.587
LGA    E    77_A      E    77_A     0.632     0    0.032   0.958     4.151   90.476   76.349
LGA    L    78_A      L    78_A     0.453     0    0.029   1.324     3.024   92.857   81.429
LGA    K    79_A      K    79_A     0.829     0    0.060   1.102     4.398   88.214   75.132
LGA    N    80_A      N    80_A     0.967     0    0.019   0.151     1.664   88.214   86.012
LGA    F    81_A      F    81_A     0.803     0    0.092   0.150     1.045   90.476   89.654
LGA    L    82_A      L    82_A     0.975     0    0.013   0.158     1.755   90.476   82.738
LGA    K    83_A      K    83_A     0.551     0    0.095   0.927     4.051   90.476   72.698
LGA    C    84_A      C    84_A     0.255     0    0.081   0.076     1.187   95.238   92.143
LGA    F    85_A      F    85_A     1.093     0    0.027   0.119     1.429   83.690   82.251
LGA    S    86_A      S    86_A     1.528     0    0.059   0.093     1.941   77.143   75.714
LGA    D    87_A      D    87_A     2.585     0    0.024   0.952     3.610   57.262   53.690
LGA    G    88_A      G    88_A     3.524     0    0.058   0.058     3.684   46.667   46.667
LGA    A    89_A      A    89_A     2.033     0    0.052   0.070     2.331   68.810   69.619
LGA    R    90_A      R    90_A     1.759     0    0.091   0.609     1.843   75.000   86.710
LGA    V    91_A      V    91_A     1.365     0    0.063   1.184     4.683   83.810   73.197
LGA    L    92_A      L    92_A     0.747     0    0.026   0.113     1.214   85.952   90.595
LGA    N    93_A      N    93_A     1.393     0    0.019   0.128     1.691   81.429   78.214
LGA    D    94_A      D    94_A     1.604     0    0.019   0.050     1.995   75.000   73.929
LGA    K    95_A      K    95_A     1.597     0    0.018   0.786     6.589   77.143   54.709
LGA    E    96_A      E    96_A     0.890     0    0.036   0.227     1.127   88.214   89.471
LGA    T    97_A      T    97_A     0.835     0    0.010   0.067     1.045   90.476   89.184
LGA    S    98_A      S    98_A     1.209     0    0.031   0.736     3.539   81.429   75.079
LGA    N    99_A      N    99_A     1.128     0    0.031   0.079     1.580   83.690   81.488
LGA    F   100_A      F   100_A     0.656     0    0.012   0.762     2.365   90.476   85.801
LGA    L   101_A      L   101_A     0.663     0    0.028   0.091     1.031   90.476   90.536
LGA    A   102_A      A   102_A     1.099     0    0.024   0.025     1.272   83.690   83.238
LGA    A   103_A      A   103_A     0.995     0    0.026   0.024     0.995   90.476   90.476
LGA    G   104_A      G   104_A     0.632     0    0.046   0.046     0.694   90.476   90.476
LGA    D   105_A      D   105_A     0.610     0    0.127   0.185     0.978   90.476   90.476
LGA    S   106_A      S   106_A     0.341     0    0.040   0.077     0.626   97.619   96.825
LGA    D   107_A      D   107_A     0.712     0    0.046   1.199     4.586   92.857   76.905
LGA    G   108_A      G   108_A     0.585     0    0.085   0.085     0.650   95.238   95.238
LGA    D   109_A      D   109_A     0.144     0    0.041   1.229     4.336  100.000   82.381
LGA    H   110_A      H   110_A     0.408     0    0.012   0.216     1.191  100.000   94.333
LGA    K   111_A      K   111_A     0.315     0    0.077   0.596     2.685  100.000   87.143
LGA    I   112_A      I   112_A     0.413     0    0.033   0.055     0.621  100.000   98.810
LGA    G   113_A      G   113_A     0.502     0    0.022   0.022     0.510   95.238   95.238
LGA    V   114_A      V   114_A     0.500     0    0.029   1.037     2.348   90.476   83.129
LGA    D   115_A      D   115_A     0.781     0    0.048   0.189     1.779   90.476   86.012
LGA    E   116_A      E   116_A     0.508     0    0.055   0.098     0.602   90.476   93.651
LGA    F   117_A      F   117_A     0.579     0    0.010   0.098     0.685   90.476   96.537
LGA    K   118_A      K   118_A     0.694     0    0.020   0.137     0.793   90.476   90.476
LGA    S   119_A      S   119_A     0.868     0    0.005   0.027     1.058   90.476   87.460
LGA    M   120_A      M   120_A     0.900     0    0.018   1.064     2.961   90.476   85.179
LGA    A   121_A      A   121_A     0.728     0    0.008   0.018     0.961   90.476   92.381
LGA    K   122_A      K   122_A     0.881     0    0.106   0.859     4.299   85.952   72.593
LGA    M   123_A      M   123_A     2.967     0    0.555   0.687     8.675   49.524   31.310
LGA    T   124_A      T   124_A     3.792     0    0.646   1.359     7.998   45.238   35.102

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     820    820  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.232          1.260                  1.803           86.442   81.720

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  116  108    4.0    108    1.23    91.204    95.756     8.105

LGA_LOCAL      RMSD:   1.232  Number of atoms:  108  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.232  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.232  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.256470 * X  +   0.949763 * Y  +   0.179372 * Z  +  -7.001089
  Y_new =  -0.679405 * X  +  -0.045148 * Y  +  -0.732373 * Z  +  13.827868
  Z_new =  -0.687482 * X  +  -0.309698 * Y  +   0.656853 * Z  +  25.760410 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -1.931749  0.758016 -0.440578   [DEG: -110.6811   43.4311  -25.2433 ]
ZXZ:  0.240191  0.854159 -1.994050   [DEG:   13.7619   48.9397 -114.2507 ]
 
# END of job
