
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  116 (  887),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  820),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       1.24     1.24
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       1.24     1.24
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    98      25_A - 122_A       0.99     1.28
  LCS_AVERAGE:     87.58

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S    17_A     S    17_A     51  108  108      5   18   50   80  102  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    18_A     K    18_A     51  108  108      5   11   50   80  102  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A     57  108  108      5   64   91  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    20_A     T    20_A     66  108  108     16   47   87  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    21_A     S    21_A     66  108  108     13   47   86  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    22_A     I    22_A     66  108  108     25   64   91  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    23_A     L    23_A     66  108  108     25   75   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    24_A     N    24_A     66  108  108     22   66   91  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    25_A     P    25_A     98  108  108     17   65   91  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    26_A     A    26_A     98  108  108     33   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    27_A     D    27_A     98  108  108     34   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    28_A     I    28_A     98  108  108     29   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A     98  108  108     32   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    30_A     K    30_A     98  108  108     33   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A     98  108  108     18   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    32_A     L    32_A     98  108  108     18   63   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    33_A     E    33_A     98  108  108     18   72   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    34_A     Q    34_A     98  108  108     16   33   69  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    35_A     C    35_A     98  108  108      3   30   55   85  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    36_A     A    36_A     98  108  108      3   29   89  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    37_A     A    37_A     98  108  108     30   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    38_A     G    38_A     98  108  108      3   67   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    39_A     F    39_A     98  108  108      3   56   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    40_A     H    40_A     98  108  108     17   72   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    41_A     H    41_A     98  108  108     10   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    42_A     T    42_A     98  108  108     34   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    43_A     A    43_A     98  108  108     33   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A     98  108  108     34   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    45_A     F    45_A     98  108  108     34   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    46_A     K    46_A     98  108  108     34   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    47_A     A    47_A     98  108  108     33   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    48_A     S    48_A     98  108  108     33   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    49_A     G    49_A     98  108  108     34   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    50_A     L    50_A     98  108  108     34   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A     98  108  108     33   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    52_A     K    52_A     98  108  108     31   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    53_A     K    53_A     98  108  108     32   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    54_A     S    54_A     98  108  108     30   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    55_A     D    55_A     98  108  108     30   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    56_A     A    56_A     98  108  108     30   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_A     E    57_A     98  108  108     32   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    58_A     L    58_A     98  108  108     34   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    59_A     A    59_A     98  108  108     34   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    60_A     E    60_A     98  108  108     32   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    61_A     I    61_A     98  108  108     34   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    62_A     F    62_A     98  108  108     34   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    63_A     N    63_A     98  108  108     34   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    64_A     V    64_A     98  108  108     34   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    65_A     L    65_A     98  108  108     34   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    66_A     D    66_A     98  108  108     29   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    67_A     G    67_A     98  108  108     28   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    68_A     D    68_A     98  108  108     23   68   91  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    69_A     Q    69_A     98  108  108     23   70   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    70_A     S    70_A     98  108  108     21   70   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    71_A     G    71_A     98  108  108      9   70   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    72_A     Y    72_A     98  108  108     29   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    73_A     I    73_A     98  108  108     34   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    74_A     E    74_A     98  108  108     34   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    75_A     V    75_A     98  108  108     34   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    76_A     E    76_A     98  108  108     33   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    77_A     E    77_A     98  108  108     34   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    78_A     L    78_A     98  108  108     34   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_A     K    79_A     98  108  108     32   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    80_A     N    80_A     98  108  108     29   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    81_A     F    81_A     98  108  108     23   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    82_A     L    82_A     98  108  108     20   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    83_A     K    83_A     98  108  108     33   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    84_A     C    84_A     98  108  108     34   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    85_A     F    85_A     98  108  108     23   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    86_A     S    86_A     98  108  108     19   64   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    87_A     D    87_A     98  108  108      3    3   37   92  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    88_A     G    88_A     98  108  108      5   15   71   97  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    89_A     A    89_A     98  108  108      5   55   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    90_A     R    90_A     98  108  108      5   41   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    91_A     V    91_A     98  108  108     14   73   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_A     L    92_A     98  108  108     28   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    93_A     N    93_A     98  108  108     23   75   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    94_A     D    94_A     98  108  108     23   70   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    95_A     K    95_A     98  108  108     23   70   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    96_A     E    96_A     98  108  108     33   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    97_A     T    97_A     98  108  108     32   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    98_A     S    98_A     98  108  108     28   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    99_A     N    99_A     98  108  108     28   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A     98  108  108     34   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L   101_A     L   101_A     98  108  108     34   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A     98  108  108     32   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   103_A     A   103_A     98  108  108     33   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A     98  108  108     34   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   105_A     D   105_A     98  108  108     34   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   106_A     S   106_A     98  108  108     34   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   107_A     D   107_A     98  108  108     29   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   108_A     G   108_A     98  108  108     34   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   109_A     D   109_A     98  108  108     34   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H   110_A     H   110_A     98  108  108     34   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   111_A     K   111_A     98  108  108     34   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   112_A     I   112_A     98  108  108     34   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   113_A     G   113_A     98  108  108     34   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   114_A     V   114_A     98  108  108     34   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   115_A     D   115_A     98  108  108     32   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   116_A     E   116_A     98  108  108     34   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   117_A     F   117_A     98  108  108     34   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   118_A     K   118_A     98  108  108     33   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   119_A     S   119_A     98  108  108     28   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   120_A     M   120_A     98  108  108     22   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   121_A     A   121_A     98  108  108     28   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   122_A     K   122_A     98  108  108     28   76   92  100  103  105  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   123_A     M   123_A     88  108  108      3    4   28   70   93  104  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T   124_A     T   124_A     34  108  108      3    5   21   37   44  102  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  95.86  (  87.58  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     34     76     92    100    103    105    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  31.48  70.37  85.19  92.59  95.37  97.22 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.37   0.62   0.81   0.93   1.02   1.12   1.24   1.24   1.24   1.24   1.24   1.24   1.24   1.24   1.24   1.24   1.24   1.24   1.24   1.24
GDT RMS_ALL_AT   1.27   1.26   1.27   1.26   1.25   1.25   1.24   1.24   1.24   1.24   1.24   1.24   1.24   1.24   1.24   1.24   1.24   1.24   1.24   1.24

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  F    44_A      F    44_A
#   possible swapping detected:  Y    72_A      Y    72_A
#   possible swapping detected:  E    76_A      E    76_A
#   possible swapping detected:  D    87_A      D    87_A
#   possible swapping detected:  F   100_A      F   100_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S    17_A      S    17_A     3.255     0    0.578   0.906     5.019   48.571   45.079
LGA    K    18_A      K    18_A     3.386     0    0.088   0.271     7.844   53.571   36.772
LGA    I    19_A      I    19_A     1.551     0    0.090   0.618     2.223   70.833   69.821
LGA    T    20_A      T    20_A     1.819     0    0.030   0.081     2.196   72.857   69.388
LGA    S    21_A      S    21_A     2.137     0    0.185   0.657     4.055   66.905   60.317
LGA    I    22_A      I    22_A     1.405     0    0.070   0.129     1.887   79.286   78.214
LGA    L    23_A      L    23_A     0.992     0    0.132   0.200     2.115   79.524   86.190
LGA    N    24_A      N    24_A     1.412     0    0.038   0.185     1.875   83.690   78.274
LGA    P    25_A      P    25_A     1.413     0    0.035   0.134     2.520   83.690   76.803
LGA    A    26_A      A    26_A     0.820     0    0.014   0.023     1.059   90.595   88.762
LGA    D    27_A      D    27_A     0.235     0    0.040   0.290     1.586   97.619   93.036
LGA    I    28_A      I    28_A     0.679     0    0.015   0.097     1.445   92.857   90.536
LGA    T    29_A      T    29_A     0.613     0    0.025   0.052     0.861   95.238   93.197
LGA    K    30_A      K    30_A     0.426     0    0.020   0.748     4.223   95.238   72.434
LGA    A    31_A      A    31_A     1.012     0    0.035   0.043     1.582   81.548   83.333
LGA    L    32_A      L    32_A     1.371     0    0.019   0.045     1.757   79.286   79.286
LGA    E    33_A      E    33_A     1.232     0    0.015   0.950     4.271   77.143   69.683
LGA    Q    34_A      Q    34_A     2.176     0    0.090   0.294     3.160   62.976   60.635
LGA    C    35_A      C    35_A     2.973     0    0.150   0.160     4.347   60.952   54.048
LGA    A    36_A      A    36_A     1.836     0    0.061   0.062     2.141   75.119   74.667
LGA    A    37_A      A    37_A     0.900     0    0.351   0.329     1.299   88.333   86.952
LGA    G    38_A      G    38_A     1.350     0    0.354   0.354     2.747   75.357   75.357
LGA    F    39_A      F    39_A     1.293     0    0.069   0.423     3.895   81.429   67.143
LGA    H    40_A      H    40_A     1.020     0    0.032   1.189     5.806   88.214   63.381
LGA    H    41_A      H    41_A     0.879     0    0.047   1.403     7.190   90.476   56.571
LGA    T    42_A      T    42_A     0.427     0    0.007   1.126     2.626  100.000   88.844
LGA    A    43_A      A    43_A     0.367     0    0.008   0.018     0.593  100.000   98.095
LGA    F    44_A      F    44_A     0.266     0    0.012   0.202     0.733  100.000   98.268
LGA    F    45_A      F    45_A     0.050     0    0.047   0.677     3.315  100.000   87.489
LGA    K    46_A      K    46_A     0.359     0    0.022   0.794     5.128  100.000   73.016
LGA    A    47_A      A    47_A     0.500     0    0.009   0.013     0.674   97.619   96.190
LGA    S    48_A      S    48_A     0.432     0    0.089   0.113     0.437  100.000  100.000
LGA    G    49_A      G    49_A     0.309     0    0.073   0.073     0.367  100.000  100.000
LGA    L    50_A      L    50_A     0.151     0    0.045   1.357     3.184   97.619   82.798
LGA    S    51_A      S    51_A     0.535     0    0.059   0.058     0.957   92.857   92.063
LGA    K    52_A      K    52_A     0.605     0    0.044   0.683     2.247   90.595   85.873
LGA    K    53_A      K    53_A     0.510     0    0.012   0.254     2.066   90.476   87.725
LGA    S    54_A      S    54_A     0.790     0    0.022   0.036     0.906   90.476   90.476
LGA    D    55_A      D    55_A     0.706     0    0.087   0.830     3.364   90.476   78.036
LGA    A    56_A      A    56_A     0.662     0    0.036   0.037     0.882   90.476   90.476
LGA    E    57_A      E    57_A     0.590     0    0.012   0.115     0.828   95.238   92.593
LGA    L    58_A      L    58_A     0.282     0    0.032   0.084     0.366  100.000  100.000
LGA    A    59_A      A    59_A     0.243     0    0.019   0.023     0.376  100.000  100.000
LGA    E    60_A      E    60_A     0.445     0    0.009   0.550     2.086   97.619   90.794
LGA    I    61_A      I    61_A     0.434     0    0.008   0.611     1.871  100.000   95.417
LGA    F    62_A      F    62_A     0.258     0    0.012   0.157     0.519  100.000   99.134
LGA    N    63_A      N    63_A     0.352     0    0.030   0.139     0.590   97.619   97.619
LGA    V    64_A      V    64_A     0.478     0    0.090   1.162     2.923   92.976   84.626
LGA    L    65_A      L    65_A     0.551     0    0.036   0.149     0.958   90.476   92.857
LGA    D    66_A      D    66_A     0.887     0    0.380   1.125     2.601   79.881   79.881
LGA    G    67_A      G    67_A     0.992     0    0.166   0.166     1.893   83.810   83.810
LGA    D    68_A      D    68_A     1.920     0    0.061   1.188     4.615   72.976   62.798
LGA    Q    69_A      Q    69_A     1.739     0    0.028   1.152     4.956   72.857   64.762
LGA    S    70_A      S    70_A     1.670     0    0.014   0.062     1.703   72.857   74.286
LGA    G    71_A      G    71_A     1.364     0    0.013   0.013     1.372   81.429   81.429
LGA    Y    72_A      Y    72_A     0.812     0    0.051   0.267     2.950   88.214   78.214
LGA    I    73_A      I    73_A     0.598     0    0.068   0.105     0.959   95.238   92.857
LGA    E    74_A      E    74_A     0.136     0    0.026   0.743     3.434  100.000   85.767
LGA    V    75_A      V    75_A     0.479     0    0.066   1.132     3.045   97.619   86.258
LGA    E    76_A      E    76_A     0.525     0    0.023   0.559     1.264   95.238   91.587
LGA    E    77_A      E    77_A     0.596     0    0.019   0.122     1.407   92.857   88.519
LGA    L    78_A      L    78_A     0.560     0    0.020   1.320     3.077   90.476   80.238
LGA    K    79_A      K    79_A     0.915     0    0.028   1.047     4.031   88.214   75.132
LGA    N    80_A      N    80_A     1.053     0    0.030   0.172     1.741   83.690   82.619
LGA    F    81_A      F    81_A     0.856     0    0.106   0.158     0.989   90.476   90.476
LGA    L    82_A      L    82_A     0.957     0    0.017   0.145     1.684   90.476   84.881
LGA    K    83_A      K    83_A     0.608     0    0.018   0.793     2.243   92.857   86.720
LGA    C    84_A      C    84_A     0.327     0    0.080   0.076     0.965   95.238   93.651
LGA    F    85_A      F    85_A     1.116     0    0.036   0.117     1.484   83.690   82.251
LGA    S    86_A      S    86_A     1.697     0    0.080   0.101     2.377   75.000   71.587
LGA    D    87_A      D    87_A     3.149     0    0.697   1.106     6.100   43.810   47.083
LGA    G    88_A      G    88_A     2.549     0    0.026   0.026     2.784   62.976   62.976
LGA    A    89_A      A    89_A     1.773     0    0.062   0.085     1.860   72.857   74.571
LGA    R    90_A      R    90_A     1.691     0    0.110   0.580     1.751   75.000   83.247
LGA    V    91_A      V    91_A     1.248     0    0.053   1.163     3.152   85.952   77.075
LGA    L    92_A      L    92_A     0.825     0    0.007   0.110     1.303   85.952   88.214
LGA    N    93_A      N    93_A     1.460     0    0.013   0.062     1.608   81.429   77.143
LGA    D    94_A      D    94_A     1.606     0    0.025   0.080     2.014   75.000   72.917
LGA    K    95_A      K    95_A     1.566     0    0.017   0.794     6.642   77.143   54.709
LGA    E    96_A      E    96_A     0.835     0    0.028   0.120     1.100   88.214   88.466
LGA    T    97_A      T    97_A     0.790     0    0.010   0.069     1.089   90.476   89.184
LGA    S    98_A      S    98_A     1.058     0    0.028   0.730     3.262   85.952   79.206
LGA    N    99_A      N    99_A     0.953     0    0.037   0.087     1.378   90.476   85.952
LGA    F   100_A      F   100_A     0.653     0    0.018   0.896     2.331   92.857   83.420
LGA    L   101_A      L   101_A     0.561     0    0.030   0.091     0.830   92.857   92.857
LGA    A   102_A      A   102_A     0.863     0    0.024   0.025     0.991   90.476   90.476
LGA    A   103_A      A   103_A     0.768     0    0.033   0.030     0.768   90.476   90.476
LGA    G   104_A      G   104_A     0.594     0    0.060   0.060     0.701   90.476   90.476
LGA    D   105_A      D   105_A     0.615     0    0.128   0.191     0.987   90.476   90.476
LGA    S   106_A      S   106_A     0.313     0    0.040   0.076     0.713  100.000   98.413
LGA    D   107_A      D   107_A     0.748     0    0.046   1.198     4.634   88.214   74.583
LGA    G   108_A      G   108_A     0.604     0    0.084   0.084     0.690   95.238   95.238
LGA    D   109_A      D   109_A     0.235     0    0.037   1.228     4.487  100.000   81.429
LGA    H   110_A      H   110_A     0.360     0    0.010   0.210     1.223  100.000   94.381
LGA    K   111_A      K   111_A     0.411     0    0.034   0.617     2.408  100.000   88.889
LGA    I   112_A      I   112_A     0.447     0    0.035   0.066     0.563  100.000   98.810
LGA    G   113_A      G   113_A     0.414     0    0.023   0.023     0.462  100.000  100.000
LGA    V   114_A      V   114_A     0.381     0    0.028   1.039     2.276  100.000   88.571
LGA    D   115_A      D   115_A     0.602     0    0.048   0.189     1.713   92.857   87.202
LGA    E   116_A      E   116_A     0.355     0    0.049   0.100     0.649  100.000   97.884
LGA    F   117_A      F   117_A     0.480     0    0.012   0.093     0.608   95.238   98.268
LGA    K   118_A      K   118_A     0.615     0    0.020   0.129     0.820   90.476   90.476
LGA    S   119_A      S   119_A     0.887     0    0.012   0.031     1.099   90.476   87.460
LGA    M   120_A      M   120_A     0.930     0    0.009   1.076     2.899   90.476   82.976
LGA    A   121_A      A   121_A     0.745     0    0.009   0.015     0.927   90.476   92.381
LGA    K   122_A      K   122_A     1.003     0    0.099   0.988     4.301   79.405   67.884
LGA    M   123_A      M   123_A     3.530     0    0.576   0.669    10.546   43.214   25.179
LGA    T   124_A      T   124_A     3.663     0    0.679   0.962     7.329   46.905   32.109

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     820    820  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.244          1.285                  1.876           86.803   81.769

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  116  108    4.0    108    1.24    90.741    95.561     8.033

LGA_LOCAL      RMSD:   1.244  Number of atoms:  108  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.244  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.244  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.774091 * X  +   0.522930 * Y  +   0.356830 * Z  +  -8.665113
  Y_new =  -0.476073 * X  +   0.109305 * Y  +   0.872586 * Z  +  15.641391
  Z_new =   0.417298 * X  +  -0.845338 * Y  +   0.333565 * Z  +  23.546679 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -0.551383 -0.430470 -1.194960   [DEG:  -31.5919  -24.6641  -68.4661 ]
ZXZ:  2.753408  1.230714  2.683041   [DEG:  157.7587   70.5147  153.7269 ]
 
# END of job
