
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  116 (  887),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  820),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       1.20     1.20
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       1.20     1.20
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   104      19_A - 122_A       0.99     1.21
  LCS_AVERAGE:     95.38

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S    17_A     S    17_A     50  108  108      5   13   48   77  102  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    18_A     K    18_A     68  108  108      5   21   50   83  103  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A    104  108  108      5   68   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    20_A     T    20_A    104  108  108      5   29   78  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    21_A     S    21_A    104  108  108      5   42   80  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    22_A     I    22_A    104  108  108     14   68   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    23_A     L    23_A    104  108  108     23   79   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    24_A     N    24_A    104  108  108     24   68   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    25_A     P    25_A    104  108  108     25   75   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    26_A     A    26_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    27_A     D    27_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    28_A     I    28_A    104  108  108     39   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A    104  108  108     39   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    30_A     K    30_A    104  108  108     41   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A    104  108  108     26   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    32_A     L    32_A    104  108  108     19   64   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    33_A     E    33_A    104  108  108     16   70   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    34_A     Q    34_A    104  108  108     16   34   87  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    35_A     C    35_A    104  108  108      3   34   50   96  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    36_A     A    36_A    104  108  108      4   26   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    37_A     A    37_A    104  108  108     34   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    38_A     G    38_A    104  108  108     31   79   91  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    39_A     F    39_A    104  108  108      4   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    40_A     H    40_A    104  108  108     25   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    41_A     H    41_A    104  108  108     27   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    42_A     T    42_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    43_A     A    43_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    45_A     F    45_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    46_A     K    46_A    104  108  108     41   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    47_A     A    47_A    104  108  108     41   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    48_A     S    48_A    104  108  108     41   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    49_A     G    49_A    104  108  108     43   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    50_A     L    50_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    104  108  108     41   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    52_A     K    52_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    53_A     K    53_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    54_A     S    54_A    104  108  108     36   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    55_A     D    55_A    104  108  108     34   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    56_A     A    56_A    104  108  108     33   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_A     E    57_A    104  108  108     36   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    58_A     L    58_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    59_A     A    59_A    104  108  108     41   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    60_A     E    60_A    104  108  108     39   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    61_A     I    61_A    104  108  108     41   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    62_A     F    62_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    63_A     N    63_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    64_A     V    64_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    65_A     L    65_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    66_A     D    66_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    67_A     G    67_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    68_A     D    68_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    69_A     Q    69_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    70_A     S    70_A    104  108  108     39   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    71_A     G    71_A    104  108  108     32   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    72_A     Y    72_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    73_A     I    73_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    74_A     E    74_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    75_A     V    75_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    76_A     E    76_A    104  108  108     38   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    77_A     E    77_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    78_A     L    78_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_A     K    79_A    104  108  108     29   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    80_A     N    80_A    104  108  108     20   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    81_A     F    81_A    104  108  108     23   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    82_A     L    82_A    104  108  108     23   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    83_A     K    83_A    104  108  108     31   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    84_A     C    84_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    85_A     F    85_A    104  108  108      8   80   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    86_A     S    86_A    104  108  108     23   59   91  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    87_A     D    87_A    104  108  108      3    9   73   97  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    88_A     G    88_A    104  108  108      8   27   90  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    89_A     A    89_A    104  108  108      8   59   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    90_A     R    90_A    104  108  108      8   41   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    91_A     V    91_A    104  108  108     23   80   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_A     L    92_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    93_A     N    93_A    104  108  108     19   76   91  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    94_A     D    94_A    104  108  108     19   57   91  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    95_A     K    95_A    104  108  108     18   57   91  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    96_A     E    96_A    104  108  108     34   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    97_A     T    97_A    104  108  108     39   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    98_A     S    98_A    104  108  108     19   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    99_A     N    99_A    104  108  108     19   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L   101_A     L   101_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    104  108  108     41   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   103_A     A   103_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A    104  108  108     41   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   105_A     D   105_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   106_A     S   106_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   107_A     D   107_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   108_A     G   108_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   109_A     D   109_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H   110_A     H   110_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   111_A     K   111_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   112_A     I   112_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   113_A     G   113_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   114_A     V   114_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   115_A     D   115_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   116_A     E   116_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   117_A     F   117_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   118_A     K   118_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   119_A     S   119_A    104  108  108     39   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   120_A     M   120_A    104  108  108     32   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   121_A     A   121_A    104  108  108     40   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   122_A     K   122_A    104  108  108     44   81   93  100  104  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   123_A     M   123_A    102  108  108      3    3   72   91  100  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T   124_A     T   124_A     89  108  108      3    3   24   38   53   84  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  98.46  (  95.38  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     44     81     93    100    104    106    107    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  40.74  75.00  86.11  92.59  96.30  98.15  99.07 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.35   0.59   0.76   0.86   0.99   1.10   1.13   1.20   1.20   1.20   1.20   1.20   1.20   1.20   1.20   1.20   1.20   1.20   1.20   1.20
GDT RMS_ALL_AT   1.28   1.22   1.21   1.21   1.21   1.20   1.20   1.20   1.20   1.20   1.20   1.20   1.20   1.20   1.20   1.20   1.20   1.20   1.20   1.20

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  F    44_A      F    44_A
#   possible swapping detected:  Y    72_A      Y    72_A
#   possible swapping detected:  E    76_A      E    76_A
#   possible swapping detected:  F   100_A      F   100_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S    17_A      S    17_A     3.451     0    0.567   0.906     4.873   48.571   45.952
LGA    K    18_A      K    18_A     3.275     0    0.035   0.210     7.729   55.476   37.619
LGA    I    19_A      I    19_A     1.464     0    0.078   0.639     2.335   75.119   71.964
LGA    T    20_A      T    20_A     2.214     0    0.189   1.032     4.212   64.762   64.490
LGA    S    21_A      S    21_A     2.319     0    0.137   0.665     4.395   66.786   60.238
LGA    I    22_A      I    22_A     1.461     0    0.040   0.095     1.948   79.286   78.214
LGA    L    23_A      L    23_A     1.010     0    0.711   0.702     3.047   73.571   80.893
LGA    N    24_A      N    24_A     1.511     0    0.168   0.390     1.817   81.786   81.667
LGA    P    25_A      P    25_A     1.278     0    0.078   0.254     1.757   85.952   80.340
LGA    A    26_A      A    26_A     0.705     0    0.013   0.021     0.968   95.238   94.286
LGA    D    27_A      D    27_A     0.219     0    0.042   0.280     1.567  100.000   94.226
LGA    I    28_A      I    28_A     0.607     0    0.019   0.117     1.385   92.857   90.536
LGA    T    29_A      T    29_A     0.539     0    0.020   0.051     0.705   92.857   91.837
LGA    K    30_A      K    30_A     0.475     0    0.024   0.747     4.114   95.238   72.434
LGA    A    31_A      A    31_A     0.961     0    0.040   0.044     1.560   83.810   85.143
LGA    L    32_A      L    32_A     1.314     0    0.022   0.043     1.574   79.286   79.286
LGA    E    33_A      E    33_A     1.330     0    0.013   0.948     4.578   77.143   67.249
LGA    Q    34_A      Q    34_A     2.067     0    0.093   0.321     2.958   66.786   64.815
LGA    C    35_A      C    35_A     2.678     0    0.162   0.177     3.852   62.857   57.460
LGA    A    36_A      A    36_A     1.783     0    0.045   0.045     2.031   75.119   74.667
LGA    A    37_A      A    37_A     0.781     0    0.339   0.318     1.475   85.952   85.048
LGA    G    38_A      G    38_A     1.417     0    0.360   0.360     3.047   73.690   73.690
LGA    F    39_A      F    39_A     0.788     0    0.038   0.191     0.990   90.476   90.476
LGA    H    40_A      H    40_A     0.818     0    0.043   1.227     5.587   90.476   66.333
LGA    H    41_A      H    41_A     0.733     0    0.108   0.904     2.670   90.476   79.524
LGA    T    42_A      T    42_A     0.368     0    0.018   1.154     2.618  100.000   88.844
LGA    A    43_A      A    43_A     0.227     0    0.010   0.020     0.417  100.000  100.000
LGA    F    44_A      F    44_A     0.101     0    0.025   0.159     0.672  100.000   98.268
LGA    F    45_A      F    45_A     0.236     0    0.040   0.332     1.111  100.000   96.580
LGA    K    46_A      K    46_A     0.482     0    0.034   0.785     5.182  100.000   73.016
LGA    A    47_A      A    47_A     0.555     0    0.009   0.012     0.672   95.238   94.286
LGA    S    48_A      S    48_A     0.461     0    0.094   0.109     0.493  100.000  100.000
LGA    G    49_A      G    49_A     0.474     0    0.059   0.059     0.474  100.000  100.000
LGA    L    50_A      L    50_A     0.222     0    0.036   1.317     3.182  100.000   85.952
LGA    S    51_A      S    51_A     0.404     0    0.064   0.062     0.874   95.238   93.651
LGA    K    52_A      K    52_A     0.296     0    0.016   0.688     2.272  100.000   92.169
LGA    K    53_A      K    53_A     0.212     0    0.050   0.571     2.451  100.000   91.111
LGA    S    54_A      S    54_A     0.584     0    0.018   0.040     0.704   92.857   92.063
LGA    D    55_A      D    55_A     0.691     0    0.079   0.808     2.866   90.476   80.893
LGA    A    56_A      A    56_A     0.760     0    0.027   0.031     0.975   90.476   90.476
LGA    E    57_A      E    57_A     0.531     0    0.012   0.130     0.685   95.238   93.651
LGA    L    58_A      L    58_A     0.230     0    0.033   0.068     0.496  100.000  100.000
LGA    A    59_A      A    59_A     0.245     0    0.017   0.022     0.451  100.000  100.000
LGA    E    60_A      E    60_A     0.392     0    0.010   1.188     4.904  100.000   73.280
LGA    I    61_A      I    61_A     0.351     0    0.008   0.605     1.767  100.000   96.607
LGA    F    62_A      F    62_A     0.177     0    0.017   0.167     0.498  100.000  100.000
LGA    N    63_A      N    63_A     0.325     0    0.021   0.141     0.580   97.619   97.619
LGA    V    64_A      V    64_A     0.400     0    0.065   1.175     2.689   95.238   84.762
LGA    L    65_A      L    65_A     0.474     0    0.050   0.119     0.901   95.238   94.048
LGA    D    66_A      D    66_A     0.539     0    0.037   0.062     0.832   92.857   91.667
LGA    G    67_A      G    67_A     0.735     0    0.023   0.023     0.990   90.476   90.476
LGA    D    68_A      D    68_A     0.899     0    0.024   1.222     3.923   90.476   80.179
LGA    Q    69_A      Q    69_A     0.803     0    0.027   1.060     3.117   90.476   84.974
LGA    S    70_A      S    70_A     1.079     0    0.020   0.043     1.137   83.690   84.444
LGA    G    71_A      G    71_A     0.914     0    0.011   0.011     0.919   90.476   90.476
LGA    Y    72_A      Y    72_A     0.692     0    0.052   0.256     2.452   90.476   80.278
LGA    I    73_A      I    73_A     0.416     0    0.024   0.651     2.523   97.619   91.071
LGA    E    74_A      E    74_A     0.129     0    0.036   0.717     2.911  100.000   88.307
LGA    V    75_A      V    75_A     0.525     0    0.060   1.130     3.072   92.857   83.537
LGA    E    76_A      E    76_A     0.728     0    0.047   0.548     1.216   90.476   89.471
LGA    E    77_A      E    77_A     0.672     0    0.019   0.930     3.770   90.476   78.677
LGA    L    78_A      L    78_A     0.543     0    0.027   1.311     2.908   90.476   81.131
LGA    K    79_A      K    79_A     0.989     0    0.020   1.046     4.264   85.952   73.122
LGA    N    80_A      N    80_A     1.159     0    0.031   0.162     2.035   81.429   78.274
LGA    F    81_A      F    81_A     0.773     0    0.099   0.135     0.885   90.476   90.476
LGA    L    82_A      L    82_A     0.871     0    0.026   0.149     1.489   90.476   85.952
LGA    K    83_A      K    83_A     0.732     0    0.109   0.811     2.462   88.214   83.757
LGA    C    84_A      C    84_A     0.225     0    0.097   0.105     1.136   92.976   90.635
LGA    F    85_A      F    85_A     1.182     0    0.058   0.077     1.568   81.548   83.117
LGA    S    86_A      S    86_A     1.746     0    0.065   0.080     2.498   75.000   71.587
LGA    D    87_A      D    87_A     2.819     0    0.663   1.021     5.724   48.333   51.964
LGA    G    88_A      G    88_A     1.889     0    0.030   0.030     2.169   72.976   72.976
LGA    A    89_A      A    89_A     1.649     0    0.068   0.091     1.649   72.857   74.571
LGA    R    90_A      R    90_A     1.540     0    0.121   0.607     1.586   77.143   82.381
LGA    V    91_A      V    91_A     1.256     0    0.043   1.169     3.334   85.952   77.075
LGA    L    92_A      L    92_A     0.848     0    0.024   0.115     1.468   85.952   90.595
LGA    N    93_A      N    93_A     1.641     0    0.034   1.244     5.655   77.143   62.024
LGA    D    94_A      D    94_A     1.955     0    0.028   0.075     2.517   70.833   66.845
LGA    K    95_A      K    95_A     1.935     0    0.032   0.779     7.251   75.000   50.741
LGA    E    96_A      E    96_A     1.112     0    0.035   0.208     1.423   85.952   84.444
LGA    T    97_A      T    97_A     0.868     0    0.015   0.066     1.158   90.476   87.891
LGA    S    98_A      S    98_A     1.184     0    0.031   0.739     3.408   81.429   76.190
LGA    N    99_A      N    99_A     1.042     0    0.040   0.086     1.672   85.952   82.619
LGA    F   100_A      F   100_A     0.538     0    0.018   0.894     2.143   95.238   84.286
LGA    L   101_A      L   101_A     0.485     0    0.036   0.074     0.816   97.619   95.238
LGA    A   102_A      A   102_A     0.687     0    0.017   0.017     0.875   90.476   90.476
LGA    A   103_A      A   103_A     0.544     0    0.030   0.034     0.547   95.238   94.286
LGA    G   104_A      G   104_A     0.527     0    0.029   0.029     0.686   95.238   95.238
LGA    D   105_A      D   105_A     0.368     0    0.125   0.186     0.724   97.619   97.619
LGA    S   106_A      S   106_A     0.306     0    0.041   0.072     0.563   97.619   96.825
LGA    D   107_A      D   107_A     0.767     0    0.042   1.200     4.671   88.214   74.583
LGA    G   108_A      G   108_A     0.671     0    0.092   0.092     0.755   95.238   95.238
LGA    D   109_A      D   109_A     0.248     0    0.048   1.230     4.211  100.000   81.190
LGA    H   110_A      H   110_A     0.178     0    0.009   0.214     1.164  100.000   96.238
LGA    K   111_A      K   111_A     0.281     0    0.083   0.591     2.657  100.000   87.143
LGA    I   112_A      I   112_A     0.297     0    0.048   0.643     2.191  100.000   95.595
LGA    G   113_A      G   113_A     0.553     0    0.009   0.009     0.553   95.238   95.238
LGA    V   114_A      V   114_A     0.517     0    0.021   1.045     2.305   90.476   83.129
LGA    D   115_A      D   115_A     0.638     0    0.042   0.174     1.331   90.476   89.345
LGA    E   116_A      E   116_A     0.458     0    0.043   0.105     0.678  100.000   97.884
LGA    F   117_A      F   117_A     0.376     0    0.010   0.079     0.478  100.000  100.000
LGA    K   118_A      K   118_A     0.502     0    0.022   0.097     0.685   95.238   92.593
LGA    S   119_A      S   119_A     0.761     0    0.005   0.031     1.061   90.476   88.968
LGA    M   120_A      M   120_A     0.829     0    0.021   0.591     1.347   90.476   89.345
LGA    A   121_A      A   121_A     0.499     0    0.012   0.012     0.594   95.238   96.190
LGA    K   122_A      K   122_A     0.628     0    0.101   0.864     4.811   88.333   70.476
LGA    M   123_A      M   123_A     3.044     0    0.590   0.471     9.669   46.548   29.107
LGA    T   124_A      T   124_A     4.350     0    0.687   1.411     9.234   43.571   28.435

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     820    820  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.197          1.222                  1.791           87.932   82.984

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  116  108    4.0    108    1.20    91.898    96.061     8.324

LGA_LOCAL      RMSD:   1.197  Number of atoms:  108  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.197  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.197  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.034164 * X  +   0.922123 * Y  +   0.385385 * Z  +  -7.774867
  Y_new =  -0.896121 * X  +   0.198993 * Y  +  -0.396697 * Z  +  14.910377
  Z_new =  -0.442492 * X  +  -0.331799 * Y  +   0.833133 * Z  +  24.628073 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -1.532690  0.458376 -0.379001   [DEG:  -87.8167   26.2630  -21.7151 ]
ZXZ:  0.770935  0.586048 -2.214195   [DEG:   44.1713   33.5781 -126.8641 ]
 
# END of job
