
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  116 (  887),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  820),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       1.14     1.14
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       1.14     1.14
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   104      19_A - 122_A       0.97     1.15
  LCS_AVERAGE:     95.47

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S    17_A     S    17_A     59  108  108      4   12   63   93  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    18_A     K    18_A     68  108  108      4   12   60   84  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A    104  108  108      4   69   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    20_A     T    20_A    104  108  108     17   55   92  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    21_A     S    21_A    104  108  108     16   56   89  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    22_A     I    22_A    104  108  108     27   71   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    23_A     L    23_A    104  108  108     28   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    24_A     N    24_A    104  108  108     28   78   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    25_A     P    25_A    104  108  108     17   71   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    26_A     A    26_A    104  108  108     35   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    27_A     D    27_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    28_A     I    28_A    104  108  108     17   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A    104  108  108     30   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    30_A     K    30_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A    104  108  108     17   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    32_A     L    32_A    104  108  108     18   64   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    33_A     E    33_A    104  108  108     17   64   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    34_A     Q    34_A    104  108  108     17   32   87  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    35_A     C    35_A    104  108  108      3   31   55   88  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    36_A     A    36_A    104  108  108     10   21   91  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    37_A     A    37_A    104  108  108     17   61   94  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    38_A     G    38_A    104  108  108     20   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    39_A     F    39_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    40_A     H    40_A    104  108  108     20   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    41_A     H    41_A    104  108  108      5   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    42_A     T    42_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    43_A     A    43_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    45_A     F    45_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    46_A     K    46_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    47_A     A    47_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    48_A     S    48_A    104  108  108     34   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    49_A     G    49_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    50_A     L    50_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    104  108  108     33   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    52_A     K    52_A    104  108  108     33   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    53_A     K    53_A    104  108  108     33   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    54_A     S    54_A    104  108  108     30   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    55_A     D    55_A    104  108  108     30   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    56_A     A    56_A    104  108  108     30   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_A     E    57_A    104  108  108     30   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    58_A     L    58_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    59_A     A    59_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    60_A     E    60_A    104  108  108     33   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    61_A     I    61_A    104  108  108     33   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    62_A     F    62_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    63_A     N    63_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    64_A     V    64_A    104  108  108     33   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    65_A     L    65_A    104  108  108     32   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    66_A     D    66_A    104  108  108     35   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    67_A     G    67_A    104  108  108     30   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    68_A     D    68_A    104  108  108     30   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    69_A     Q    69_A    104  108  108     35   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    70_A     S    70_A    104  108  108     28   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    71_A     G    71_A    104  108  108     28   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    72_A     Y    72_A    104  108  108     30   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    73_A     I    73_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    74_A     E    74_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    75_A     V    75_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    76_A     E    76_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    77_A     E    77_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    78_A     L    78_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_A     K    79_A    104  108  108     25   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    80_A     N    80_A    104  108  108     25   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    81_A     F    81_A    104  108  108     35   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    82_A     L    82_A    104  108  108     27   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    83_A     K    83_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    84_A     C    84_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    85_A     F    85_A    104  108  108     13   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    86_A     S    86_A    104  108  108     19   64   93  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    87_A     D    87_A    104  108  108      3   14   63   89  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    88_A     G    88_A    104  108  108     10   77   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    89_A     A    89_A    104  108  108     18   73   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    90_A     R    90_A    104  108  108     10   64   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    91_A     V    91_A    104  108  108     21   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_A     L    92_A    104  108  108     35   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    93_A     N    93_A    104  108  108     25   76   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    94_A     D    94_A    104  108  108     25   64   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    95_A     K    95_A    104  108  108     25   64   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    96_A     E    96_A    104  108  108     35   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    97_A     T    97_A    104  108  108     25   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    98_A     S    98_A    104  108  108     25   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    99_A     N    99_A    104  108  108     25   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    104  108  108     35   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L   101_A     L   101_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    104  108  108     31   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   103_A     A   103_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   105_A     D   105_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   106_A     S   106_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   107_A     D   107_A    104  108  108     35   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   108_A     G   108_A    104  108  108     35   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   109_A     D   109_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H   110_A     H   110_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   111_A     K   111_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   112_A     I   112_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   113_A     G   113_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   114_A     V   114_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   115_A     D   115_A    104  108  108     32   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   116_A     E   116_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   117_A     F   117_A    104  108  108     36   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   118_A     K   118_A    104  108  108     35   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   119_A     S   119_A    104  108  108     30   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   120_A     M   120_A    104  108  108     30   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   121_A     A   121_A    104  108  108     32   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   122_A     K   122_A    104  108  108     28   80   96  102  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   123_A     M   123_A    103  108  108      3    4   51   91  101  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T   124_A     T   124_A     90  108  108      3   16   25   43  102  104  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  98.49  (  95.47  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     36     80     96    102    104    107    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  33.33  74.07  88.89  94.44  96.30  99.07 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.38   0.61   0.78   0.89   0.98   1.10   1.14   1.14   1.14   1.14   1.14   1.14   1.14   1.14   1.14   1.14   1.14   1.14   1.14   1.14
GDT RMS_ALL_AT   1.17   1.17   1.15   1.15   1.15   1.14   1.14   1.14   1.14   1.14   1.14   1.14   1.14   1.14   1.14   1.14   1.14   1.14   1.14   1.14

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  F    44_A      F    44_A
#   possible swapping detected:  Y    72_A      Y    72_A
#   possible swapping detected:  E    76_A      E    76_A
#   possible swapping detected:  F   100_A      F   100_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S    17_A      S    17_A     3.049     0    0.575   0.906     4.926   52.262   49.603
LGA    K    18_A      K    18_A     3.295     0    0.042   0.218     7.927   53.571   36.772
LGA    I    19_A      I    19_A     1.379     0    0.095   0.632     2.056   79.286   74.048
LGA    T    20_A      T    20_A     1.721     0    0.017   0.066     2.094   72.857   70.544
LGA    S    21_A      S    21_A     1.986     0    0.181   0.657     3.975   70.833   65.238
LGA    I    22_A      I    22_A     1.280     0    0.066   0.126     1.778   81.429   79.286
LGA    L    23_A      L    23_A     0.934     0    0.139   0.202     2.082   79.524   86.190
LGA    N    24_A      N    24_A     1.274     0    0.037   0.182     1.701   88.333   81.667
LGA    P    25_A      P    25_A     1.294     0    0.034   0.136     2.372   85.952   79.184
LGA    A    26_A      A    26_A     0.624     0    0.014   0.023     0.857   95.238   94.286
LGA    D    27_A      D    27_A     0.203     0    0.042   0.291     1.578  100.000   94.226
LGA    I    28_A      I    28_A     0.693     0    0.015   0.091     1.396   92.857   90.536
LGA    T    29_A      T    29_A     0.603     0    0.019   0.054     0.733   92.857   91.837
LGA    K    30_A      K    30_A     0.494     0    0.020   0.753     4.100   95.238   72.434
LGA    A    31_A      A    31_A     1.037     0    0.028   0.034     1.510   81.548   83.333
LGA    L    32_A      L    32_A     1.367     0    0.021   0.030     1.665   79.286   80.357
LGA    E    33_A      E    33_A     1.474     0    0.013   0.930     4.347   75.119   65.979
LGA    Q    34_A      Q    34_A     2.076     0    0.043   0.334     3.171   64.881   61.481
LGA    C    35_A      C    35_A     2.822     0    0.211   0.216     4.205   60.952   54.048
LGA    A    36_A      A    36_A     2.028     0    0.621   0.610     3.663   61.429   63.714
LGA    A    37_A      A    37_A     1.866     0    0.536   0.543     3.804   67.619   67.048
LGA    G    38_A      G    38_A     0.863     0    0.079   0.079     0.962   90.476   90.476
LGA    F    39_A      F    39_A     0.283     0    0.253   0.295     2.092   95.357   85.931
LGA    H    40_A      H    40_A     0.994     0    0.012   1.090     5.761   90.476   64.286
LGA    H    41_A      H    41_A     0.828     0    0.071   1.346     6.571   90.476   59.238
LGA    T    42_A      T    42_A     0.462     0    0.010   1.137     2.772  100.000   87.483
LGA    A    43_A      A    43_A     0.339     0    0.009   0.021     0.536  100.000   98.095
LGA    F    44_A      F    44_A     0.297     0    0.013   0.184     0.805  100.000   98.268
LGA    F    45_A      F    45_A     0.083     0    0.046   0.499     2.281  100.000   90.043
LGA    K    46_A      K    46_A     0.423     0    0.022   0.913     5.568   97.619   71.429
LGA    A    47_A      A    47_A     0.640     0    0.008   0.011     0.765   90.476   90.476
LGA    S    48_A      S    48_A     0.644     0    0.083   0.103     0.644   90.476   92.063
LGA    G    49_A      G    49_A     0.570     0    0.083   0.083     0.600   95.238   95.238
LGA    L    50_A      L    50_A     0.262     0    0.041   1.355     3.152  100.000   83.988
LGA    S    51_A      S    51_A     0.562     0    0.057   0.059     1.021   92.857   90.556
LGA    K    52_A      K    52_A     0.520     0    0.049   0.681     2.439   92.857   88.995
LGA    K    53_A      K    53_A     0.431     0    0.013   0.253     1.914   95.238   91.746
LGA    S    54_A      S    54_A     0.780     0    0.019   0.032     0.913   90.476   90.476
LGA    D    55_A      D    55_A     0.768     0    0.081   0.808     2.978   90.476   79.940
LGA    A    56_A      A    56_A     0.817     0    0.037   0.038     1.065   90.476   88.667
LGA    E    57_A      E    57_A     0.649     0    0.012   0.119     0.832   95.238   92.593
LGA    L    58_A      L    58_A     0.317     0    0.033   0.076     0.411  100.000  100.000
LGA    A    59_A      A    59_A     0.328     0    0.018   0.022     0.486  100.000  100.000
LGA    E    60_A      E    60_A     0.515     0    0.009   0.548     2.145   95.238   90.794
LGA    I    61_A      I    61_A     0.482     0    0.006   0.613     1.881  100.000   93.036
LGA    F    62_A      F    62_A     0.259     0    0.016   0.159     0.499  100.000  100.000
LGA    N    63_A      N    63_A     0.308     0    0.023   0.138     0.530   97.619   97.619
LGA    V    64_A      V    64_A     0.454     0    0.070   1.175     3.059   95.238   84.898
LGA    L    65_A      L    65_A     0.611     0    0.043   0.115     1.060   90.476   89.345
LGA    D    66_A      D    66_A     0.606     0    0.030   0.057     0.885   90.476   90.476
LGA    G    67_A      G    67_A     0.834     0    0.024   0.024     1.063   88.214   88.214
LGA    D    68_A      D    68_A     1.056     0    0.025   1.222     3.823   83.690   75.655
LGA    Q    69_A      Q    69_A     0.857     0    0.025   1.060     2.983   88.214   83.810
LGA    S    70_A      S    70_A     1.200     0    0.020   0.042     1.284   81.429   81.429
LGA    G    71_A      G    71_A     1.017     0    0.010   0.010     1.017   85.952   85.952
LGA    Y    72_A      Y    72_A     0.777     0    0.057   0.254     2.718   90.476   78.968
LGA    I    73_A      I    73_A     0.460     0    0.051   0.657     2.477   97.619   92.024
LGA    E    74_A      E    74_A     0.075     0    0.037   0.721     3.018  100.000   86.667
LGA    V    75_A      V    75_A     0.473     0    0.062   1.127     3.092   95.238   84.898
LGA    E    76_A      E    76_A     0.643     0    0.049   0.551     1.239   90.476   89.471
LGA    E    77_A      E    77_A     0.615     0    0.020   0.905     3.791   90.476   78.677
LGA    L    78_A      L    78_A     0.575     0    0.028   1.318     3.080   90.476   80.238
LGA    K    79_A      K    79_A     0.984     0    0.026   1.045     4.030   85.952   73.122
LGA    N    80_A      N    80_A     1.077     0    0.026   0.146     1.554   81.429   81.488
LGA    F    81_A      F    81_A     0.804     0    0.106   0.153     0.914   90.476   91.342
LGA    L    82_A      L    82_A     0.790     0    0.015   0.181     1.404   90.476   87.083
LGA    K    83_A      K    83_A     0.634     0    0.019   0.654     2.013   90.476   87.619
LGA    C    84_A      C    84_A     0.512     0    0.075   0.069     1.053   90.476   88.968
LGA    F    85_A      F    85_A     1.020     0    0.028   0.100     1.464   83.690   83.896
LGA    S    86_A      S    86_A     1.727     0    0.058   0.076     2.377   75.000   71.587
LGA    D    87_A      D    87_A     2.969     0    0.661   0.982     5.518   48.333   47.500
LGA    G    88_A      G    88_A     1.272     0    0.019   0.019     1.605   79.286   79.286
LGA    A    89_A      A    89_A     1.374     0    0.065   0.086     1.429   81.429   81.429
LGA    R    90_A      R    90_A     1.435     0    0.124   0.597     1.555   81.429   85.584
LGA    V    91_A      V    91_A     1.166     0    0.051   1.171     3.021   85.952   78.299
LGA    L    92_A      L    92_A     0.811     0    0.010   0.089     1.305   85.952   89.405
LGA    N    93_A      N    93_A     1.473     0    0.025   0.130     1.782   81.429   78.214
LGA    D    94_A      D    94_A     1.577     0    0.020   0.082     2.040   77.143   73.988
LGA    K    95_A      K    95_A     1.502     0    0.019   0.786     6.498   77.143   55.820
LGA    E    96_A      E    96_A     0.806     0    0.028   0.204     1.053   88.214   89.471
LGA    T    97_A      T    97_A     0.799     0    0.010   0.068     1.120   90.476   87.891
LGA    S    98_A      S    98_A     1.044     0    0.028   0.733     3.266   85.952   79.206
LGA    N    99_A      N    99_A     0.928     0    0.030   0.089     1.371   90.476   87.083
LGA    F   100_A      F   100_A     0.612     0    0.023   0.852     2.184   95.238   85.065
LGA    L   101_A      L   101_A     0.484     0    0.030   0.091     0.793   97.619   96.429
LGA    A   102_A      A   102_A     0.722     0    0.023   0.024     0.842   90.476   90.476
LGA    A   103_A      A   103_A     0.587     0    0.033   0.032     0.587   95.238   94.286
LGA    G   104_A      G   104_A     0.463     0    0.058   0.058     0.622   97.619   97.619
LGA    D   105_A      D   105_A     0.482     0    0.128   0.190     0.830   97.619   97.619
LGA    S   106_A      S   106_A     0.243     0    0.040   0.077     0.617   97.619   96.825
LGA    D   107_A      D   107_A     0.755     0    0.044   1.198     4.675   90.595   75.774
LGA    G   108_A      G   108_A     0.650     0    0.085   0.085     0.734   95.238   95.238
LGA    D   109_A      D   109_A     0.231     0    0.038   1.228     4.378  100.000   82.381
LGA    H   110_A      H   110_A     0.234     0    0.012   0.212     1.260  100.000   94.381
LGA    K   111_A      K   111_A     0.290     0    0.033   0.620     2.589  100.000   87.143
LGA    I   112_A      I   112_A     0.444     0    0.042   0.077     0.624   97.619   97.619
LGA    G   113_A      G   113_A     0.463     0    0.025   0.025     0.503   97.619   97.619
LGA    V   114_A      V   114_A     0.413     0    0.028   1.036     2.313  100.000   88.571
LGA    D   115_A      D   115_A     0.630     0    0.046   0.190     1.761   90.476   86.012
LGA    E   116_A      E   116_A     0.335     0    0.049   0.100     0.675  100.000   96.825
LGA    F   117_A      F   117_A     0.445     0    0.011   0.082     0.568   95.238   98.268
LGA    K   118_A      K   118_A     0.569     0    0.021   0.134     0.725   90.476   90.476
LGA    S   119_A      S   119_A     0.738     0    0.008   0.026     0.914   90.476   90.476
LGA    M   120_A      M   120_A     0.756     0    0.007   1.062     2.825   90.476   85.179
LGA    A   121_A      A   121_A     0.584     0    0.011   0.014     0.754   90.476   92.381
LGA    K   122_A      K   122_A     0.868     0    0.132   0.874     4.328   85.952   70.794
LGA    M   123_A      M   123_A     3.077     0    0.548   0.670    10.307   47.738   28.452
LGA    T   124_A      T   124_A     3.534     0    0.559   1.343     7.752   48.690   37.075

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     820    820  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.144          1.189                  1.773           87.910   82.919

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  116  108    4.0    108    1.14    92.130    96.434     8.685

LGA_LOCAL      RMSD:   1.144  Number of atoms:  108  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.144  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.144  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.497817 * X  +  -0.697650 * Y  +  -0.515231 * Z  +  -4.351162
  Y_new =  -0.116846 * X  +  -0.642611 * Y  +   0.757231 * Z  +  11.640944
  Z_new =  -0.859375 * X  +  -0.316760 * Y  +  -0.401420 * Z  +  27.510818 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -0.230544  1.034046 -2.473536   [DEG:  -13.2092   59.2465 -141.7231 ]
ZXZ: -2.544132  1.983863 -1.923938   [DEG: -145.7681  113.6670 -110.2335 ]
 
# END of job
