
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  124 (  959),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  820),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.70     0.70
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.70     0.70
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.70     0.70
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S    17_A     S    17_A    108  108  108      5   29  100  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    18_A     K    18_A    108  108  108      5   52  100  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A    108  108  108     65  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    20_A     T    20_A    108  108  108     47  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    21_A     S    21_A    108  108  108     56  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    22_A     I    22_A    108  108  108     65  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    23_A     L    23_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    24_A     N    24_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    25_A     P    25_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    26_A     A    26_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    27_A     D    27_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    28_A     I    28_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    30_A     K    30_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    32_A     L    32_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    33_A     E    33_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    34_A     Q    34_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    35_A     C    35_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    36_A     A    36_A    108  108  108     57  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    37_A     A    37_A    108  108  108     52  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    38_A     G    38_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    39_A     F    39_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    40_A     H    40_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    41_A     H    41_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    42_A     T    42_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    43_A     A    43_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    45_A     F    45_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    46_A     K    46_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    47_A     A    47_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    48_A     S    48_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    49_A     G    49_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    50_A     L    50_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    52_A     K    52_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    53_A     K    53_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    54_A     S    54_A    108  108  108     65  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    55_A     D    55_A    108  108  108     54  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    56_A     A    56_A    108  108  108     54  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_A     E    57_A    108  108  108     56  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    58_A     L    58_A    108  108  108     65  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    59_A     A    59_A    108  108  108     61  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    60_A     E    60_A    108  108  108     54  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    61_A     I    61_A    108  108  108     58  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    62_A     F    62_A    108  108  108     68  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    63_A     N    63_A    108  108  108     61  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    64_A     V    64_A    108  108  108     32  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    65_A     L    65_A    108  108  108     47  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    66_A     D    66_A    108  108  108     59  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    67_A     G    67_A    108  108  108     59  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    68_A     D    68_A    108  108  108     58  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    69_A     Q    69_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    70_A     S    70_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    71_A     G    71_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    72_A     Y    72_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    73_A     I    73_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    74_A     E    74_A    108  108  108     64  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    75_A     V    75_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    76_A     E    76_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    77_A     E    77_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    78_A     L    78_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_A     K    79_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    80_A     N    80_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    81_A     F    81_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    82_A     L    82_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    83_A     K    83_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    84_A     C    84_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    85_A     F    85_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    86_A     S    86_A    108  108  108     73  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    87_A     D    87_A    108  108  108     24  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    88_A     G    88_A    108  108  108     13   76  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    89_A     A    89_A    108  108  108     17  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    90_A     R    90_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    91_A     V    91_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_A     L    92_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    93_A     N    93_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    94_A     D    94_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    95_A     K    95_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    96_A     E    96_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    97_A     T    97_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    98_A     S    98_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    99_A     N    99_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L   101_A     L   101_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   103_A     A   103_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   105_A     D   105_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   106_A     S   106_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   107_A     D   107_A    108  108  108     39  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   108_A     G   108_A    108  108  108      8  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   109_A     D   109_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H   110_A     H   110_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   111_A     K   111_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   112_A     I   112_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   113_A     G   113_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   114_A     V   114_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   115_A     D   115_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   116_A     E   116_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   117_A     F   117_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   118_A     K   118_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   119_A     S   119_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   120_A     M   120_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   121_A     A   121_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   122_A     K   122_A    108  108  108     76  103  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   123_A     M   123_A    108  108  108     13   30  105  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T   124_A     T   124_A    108  108  108      3    4    5   15   76   84  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     76    103    105    107    107    107    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  70.37  95.37  97.22  99.07  99.07  99.07 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.31   0.48   0.52   0.60   0.60   0.60   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70
GDT RMS_ALL_AT   0.77   0.71   0.71   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  D    27_A      D    27_A
#   possible swapping detected:  F    44_A      F    44_A
#   possible swapping detected:  F    45_A      F    45_A
#   possible swapping detected:  D    55_A      D    55_A
#   possible swapping detected:  E    57_A      E    57_A
#   possible swapping detected:  E    60_A      E    60_A
#   possible swapping detected:  D    66_A      D    66_A
#   possible swapping detected:  D    68_A      D    68_A
#   possible swapping detected:  Y    72_A      Y    72_A
#   possible swapping detected:  E    74_A      E    74_A
#   possible swapping detected:  E    76_A      E    76_A
#   possible swapping detected:  E    77_A      E    77_A
#   possible swapping detected:  D    87_A      D    87_A
#   possible swapping detected:  D    94_A      D    94_A
#   possible swapping detected:  E    96_A      E    96_A
#   possible swapping detected:  D   105_A      D   105_A
#   possible swapping detected:  D   107_A      D   107_A
#   possible swapping detected:  D   109_A      D   109_A
#   possible swapping detected:  D   115_A      D   115_A
#   possible swapping detected:  E   116_A      E   116_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S    17_A      S    17_A     2.398     0    0.571   0.907     4.457   67.262   60.556
LGA    K    18_A      K    18_A     2.088     0    0.046   0.116     5.256   73.095   55.608
LGA    I    19_A      I    19_A     0.499     0    0.064   0.653     1.831   92.976   87.321
LGA    T    20_A      T    20_A     0.715     0    0.046   0.067     0.927   90.476   90.476
LGA    S    21_A      S    21_A     0.785     0    0.100   0.671     2.828   88.214   81.905
LGA    I    22_A      I    22_A     0.384     0    0.035   0.078     0.904  100.000   97.619
LGA    L    23_A      L    23_A     0.263     0    0.016   0.109     0.467  100.000  100.000
LGA    N    24_A      N    24_A     0.476     0    0.040   0.316     1.510  100.000   93.036
LGA    P    25_A      P    25_A     0.522     0    0.018   0.090     0.722   95.238   93.197
LGA    A    26_A      A    26_A     0.381     0    0.026   0.027     0.461  100.000  100.000
LGA    D    27_A      D    27_A     0.334     0    0.019   0.150     0.587  100.000   98.810
LGA    I    28_A      I    28_A     0.411     0    0.009   0.068     0.581  100.000   97.619
LGA    T    29_A      T    29_A     0.256     0    0.005   0.056     0.488  100.000  100.000
LGA    K    30_A      K    30_A     0.178     0    0.019   0.671     2.260  100.000   90.952
LGA    A    31_A      A    31_A     0.371     0    0.034   0.036     0.441  100.000  100.000
LGA    L    32_A      L    32_A     0.381     0    0.031   0.049     0.547  100.000   98.810
LGA    E    33_A      E    33_A     0.199     0    0.035   1.121     4.677  100.000   82.857
LGA    Q    34_A      Q    34_A     0.091     0    0.017   0.085     1.092  100.000   94.815
LGA    C    35_A      C    35_A     0.569     0    0.035   0.063     0.926   92.857   92.063
LGA    A    36_A      A    36_A     0.774     0    0.041   0.040     0.863   90.476   90.476
LGA    A    37_A      A    37_A     0.691     0    0.112   0.115     1.024   90.476   88.667
LGA    G    38_A      G    38_A     0.511     0    0.048   0.048     0.706   90.476   90.476
LGA    F    39_A      F    39_A     0.519     0    0.019   0.080     0.752   90.476   93.074
LGA    H    40_A      H    40_A     0.504     0    0.061   0.170     1.399   95.238   89.667
LGA    H    41_A      H    41_A     0.536     0    0.008   0.096     0.667   92.857   94.286
LGA    T    42_A      T    42_A     0.448     0    0.010   0.115     0.948   97.619   95.918
LGA    A    43_A      A    43_A     0.360     0    0.007   0.011     0.425  100.000  100.000
LGA    F    44_A      F    44_A     0.114     0    0.014   0.068     0.267  100.000  100.000
LGA    F    45_A      F    45_A     0.139     0    0.045   0.606     1.862  100.000   92.468
LGA    K    46_A      K    46_A     0.333     0    0.038   0.112     1.459   97.619   91.693
LGA    A    47_A      A    47_A     0.395     0    0.023   0.032     0.410  100.000  100.000
LGA    S    48_A      S    48_A     0.402     0    0.015   0.042     0.640   95.238   96.825
LGA    G    49_A      G    49_A     0.597     0    0.087   0.087     0.597   95.238   95.238
LGA    L    50_A      L    50_A     0.295     0    0.017   0.159     0.540  100.000   98.810
LGA    S    51_A      S    51_A     0.383     0    0.095   0.104     0.859   97.619   96.825
LGA    K    52_A      K    52_A     0.403     0    0.024   0.680     2.932  100.000   88.360
LGA    K    53_A      K    53_A     0.073     0    0.004   0.497     1.630  100.000   94.921
LGA    S    54_A      S    54_A     0.403     0    0.018   0.053     0.470  100.000  100.000
LGA    D    55_A      D    55_A     0.766     0    0.077   0.771     2.563   90.476   81.964
LGA    A    56_A      A    56_A     0.792     0    0.018   0.022     0.917   90.476   90.476
LGA    E    57_A      E    57_A     0.649     0    0.016   0.093     0.665   90.476   94.709
LGA    L    58_A      L    58_A     0.478     0    0.015   0.080     0.514   92.857   96.429
LGA    A    59_A      A    59_A     0.528     0    0.006   0.016     0.593   90.476   90.476
LGA    E    60_A      E    60_A     0.743     0    0.009   0.143     1.200   90.476   89.471
LGA    I    61_A      I    61_A     0.636     0    0.022   0.616     1.848   90.476   88.274
LGA    F    62_A      F    62_A     0.406     0    0.007   0.058     0.469  100.000  100.000
LGA    N    63_A      N    63_A     0.534     0    0.024   0.090     0.755   90.476   91.667
LGA    V    64_A      V    64_A     0.846     0    0.078   1.174     3.724   90.476   81.156
LGA    L    65_A      L    65_A     0.733     0    0.017   0.095     1.196   90.476   89.345
LGA    D    66_A      D    66_A     0.569     0    0.015   0.097     0.622   90.476   95.238
LGA    G    67_A      G    67_A     0.563     0    0.032   0.032     0.672   90.476   90.476
LGA    D    68_A      D    68_A     0.609     0    0.009   0.110     0.845   90.476   90.476
LGA    Q    69_A      Q    69_A     0.448     0    0.027   1.226     4.465   92.857   81.164
LGA    S    70_A      S    70_A     0.523     0    0.017   0.030     0.602   95.238   93.651
LGA    G    71_A      G    71_A     0.345     0    0.044   0.044     0.345  100.000  100.000
LGA    Y    72_A      Y    72_A     0.355     0    0.010   0.139     1.364  100.000   92.183
LGA    I    73_A      I    73_A     0.470     0    0.027   0.061     0.520  100.000   97.619
LGA    E    74_A      E    74_A     0.468     0    0.057   0.756     2.959  100.000   87.090
LGA    V    75_A      V    75_A     0.281     0    0.047   1.105     2.985  100.000   88.639
LGA    E    76_A      E    76_A     0.666     0    0.034   1.010     4.324   92.857   75.450
LGA    E    77_A      E    77_A     0.623     0    0.024   0.150     1.257   90.476   89.471
LGA    L    78_A      L    78_A     0.130     0    0.019   1.281     2.731  100.000   87.917
LGA    K    79_A      K    79_A     0.575     0    0.040   1.014     4.165   92.857   76.455
LGA    N    80_A      N    80_A     0.597     0    0.010   0.065     1.119   92.857   90.536
LGA    F    81_A      F    81_A     0.254     0    0.054   0.099     0.388  100.000  100.000
LGA    L    82_A      L    82_A     0.172     0    0.009   0.074     0.497  100.000  100.000
LGA    K    83_A      K    83_A     0.189     0    0.014   0.567     1.896  100.000   94.868
LGA    C    84_A      C    84_A     0.247     0    0.004   0.047     0.701  100.000   98.413
LGA    F    85_A      F    85_A     0.399     0    0.015   0.143     0.687   97.619   94.805
LGA    S    86_A      S    86_A     0.600     0    0.028   0.034     0.767   95.238   93.651
LGA    D    87_A      D    87_A     0.996     0    0.036   0.858     2.083   85.952   80.595
LGA    G    88_A      G    88_A     1.305     0    0.027   0.027     1.441   81.429   81.429
LGA    A    89_A      A    89_A     0.698     0    0.026   0.031     0.761   90.476   90.476
LGA    R    90_A      R    90_A     0.521     0    0.009   0.110     0.591   90.476   96.537
LGA    V    91_A      V    91_A     0.704     0    0.019   0.079     1.275   92.857   89.252
LGA    L    92_A      L    92_A     0.572     0    0.029   0.044     0.652   90.476   90.476
LGA    N    93_A      N    93_A     0.681     0    0.030   0.071     0.786   90.476   90.476
LGA    D    94_A      D    94_A     0.714     0    0.025   0.203     0.984   90.476   90.476
LGA    K    95_A      K    95_A     0.716     0    0.019   0.112     1.336   92.857   90.529
LGA    E    96_A      E    96_A     0.470     0    0.032   0.102     0.543   97.619   97.884
LGA    T    97_A      T    97_A     0.427     0    0.007   0.047     0.562  100.000   95.918
LGA    S    98_A      S    98_A     0.387     0    0.028   0.127     0.648  100.000   98.413
LGA    N    99_A      N    99_A     0.456     0    0.029   0.058     0.504  100.000   98.810
LGA    F   100_A      F   100_A     0.434     0    0.021   0.126     0.789  100.000   95.671
LGA    L   101_A      L   101_A     0.362     0    0.008   0.037     0.608  100.000   98.810
LGA    A   102_A      A   102_A     0.465     0    0.018   0.022     0.535  100.000   98.095
LGA    A   103_A      A   103_A     0.396     0    0.041   0.044     0.441  100.000  100.000
LGA    G   104_A      G   104_A     0.248     0    0.051   0.051     0.457  100.000  100.000
LGA    D   105_A      D   105_A     0.215     0    0.076   0.098     0.377  100.000  100.000
LGA    S   106_A      S   106_A     0.383     0    0.056   0.614     2.270   95.238   90.952
LGA    D   107_A      D   107_A     0.865     0    0.009   0.177     1.273   85.952   87.083
LGA    G   108_A      G   108_A     0.897     0    0.061   0.061     0.897   90.476   90.476
LGA    D   109_A      D   109_A     0.403     0    0.035   0.088     1.045  100.000   94.107
LGA    H   110_A      H   110_A     0.195     0    0.048   1.019     2.346   97.619   86.571
LGA    K   111_A      K   111_A     0.577     0    0.041   0.192     2.604   92.857   82.011
LGA    I   112_A      I   112_A     0.573     0    0.019   0.090     0.698   90.476   92.857
LGA    G   113_A      G   113_A     0.380     0    0.026   0.026     0.463  100.000  100.000
LGA    V   114_A      V   114_A     0.288     0    0.028   0.082     0.455  100.000  100.000
LGA    D   115_A      D   115_A     0.268     0    0.025   0.324     1.234  100.000   94.167
LGA    E   116_A      E   116_A     0.161     0    0.037   0.057     0.282  100.000  100.000
LGA    F   117_A      F   117_A     0.346     0    0.017   0.033     0.421  100.000  100.000
LGA    K   118_A      K   118_A     0.208     0    0.018   0.082     1.008  100.000   95.820
LGA    S   119_A      S   119_A     0.222     0    0.011   0.659     2.198  100.000   94.127
LGA    M   120_A      M   120_A     0.297     0    0.009   0.343     1.234  100.000   96.488
LGA    A   121_A      A   121_A     0.126     0    0.022   0.026     0.258  100.000  100.000
LGA    K   122_A      K   122_A     0.192     0    0.046   0.795     4.326   97.619   77.989
LGA    M   123_A      M   123_A     1.514     0    0.141   0.540     6.330   69.524   55.119
LGA    T   124_A      T   124_A     3.732     0    0.057   1.114     7.213   48.452   41.769

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     820    820  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.703          0.694                  1.090           94.753   91.563

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  124  108    4.0    108    0.70    98.611    99.245    13.456

LGA_LOCAL      RMSD:   0.703  Number of atoms:  108  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.703  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.703  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.695257 * X  +   0.103590 * Y  +   0.711257 * Z  +   0.363727
  Y_new =  -0.088161 * X  +  -0.994378 * Y  +   0.058646 * Z  +  -0.851156
  Z_new =   0.713334 * X  +  -0.021931 * Y  +   0.700481 * Z  +  11.110879 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -3.015462 -0.794244 -0.031298   [DEG: -172.7733  -45.5068   -1.7933 ]
ZXZ:  1.653065  0.794725  1.601531   [DEG:   94.7136   45.5344   91.7610 ]
 
# END of job
