
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  124 (  959),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  820),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.73     0.73
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.73     0.73
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.73     0.73
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S    17_A     S    17_A    108  108  108      5   21  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    18_A     K    18_A    108  108  108      5   65  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A    108  108  108     63  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    20_A     T    20_A    108  108  108     35  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    21_A     S    21_A    108  108  108     51  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    22_A     I    22_A    108  108  108     61  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    23_A     L    23_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    24_A     N    24_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    25_A     P    25_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    26_A     A    26_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    27_A     D    27_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    28_A     I    28_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    30_A     K    30_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    32_A     L    32_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    33_A     E    33_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    34_A     Q    34_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    35_A     C    35_A    108  108  108     59  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    36_A     A    36_A    108  108  108     34  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    37_A     A    37_A    108  108  108     37  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    38_A     G    38_A    108  108  108     37  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    39_A     F    39_A    108  108  108     37  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    40_A     H    40_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    41_A     H    41_A    108  108  108     54  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    42_A     T    42_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    43_A     A    43_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    45_A     F    45_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    46_A     K    46_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    47_A     A    47_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    48_A     S    48_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    49_A     G    49_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    50_A     L    50_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    52_A     K    52_A    108  108  108     62  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    53_A     K    53_A    108  108  108     63  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    54_A     S    54_A    108  108  108     54  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    55_A     D    55_A    108  108  108     50  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    56_A     A    56_A    108  108  108     50  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_A     E    57_A    108  108  108     50  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    58_A     L    58_A    108  108  108     51  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    59_A     A    59_A    108  108  108     50  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    60_A     E    60_A    108  108  108     50  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    61_A     I    61_A    108  108  108     50  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    62_A     F    62_A    108  108  108     61  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    63_A     N    63_A    108  108  108     55  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    64_A     V    64_A    108  108  108     38  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    65_A     L    65_A    108  108  108     39  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    66_A     D    66_A    108  108  108     42  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    67_A     G    67_A    108  108  108     48  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    68_A     D    68_A    108  108  108     19  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    69_A     Q    69_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    70_A     S    70_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    71_A     G    71_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    72_A     Y    72_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    73_A     I    73_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    74_A     E    74_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    75_A     V    75_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    76_A     E    76_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    77_A     E    77_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    78_A     L    78_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_A     K    79_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    80_A     N    80_A    108  108  108     60  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    81_A     F    81_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    82_A     L    82_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    83_A     K    83_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    84_A     C    84_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    85_A     F    85_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    86_A     S    86_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    87_A     D    87_A    108  108  108     37  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    88_A     G    88_A    108  108  108     34  102  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    89_A     A    89_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    90_A     R    90_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    91_A     V    91_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_A     L    92_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    93_A     N    93_A    108  108  108     46  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    94_A     D    94_A    108  108  108     46  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    95_A     K    95_A    108  108  108     46  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    96_A     E    96_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    97_A     T    97_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    98_A     S    98_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    99_A     N    99_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L   101_A     L   101_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   103_A     A   103_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   105_A     D   105_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   106_A     S   106_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   107_A     D   107_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   108_A     G   108_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   109_A     D   109_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H   110_A     H   110_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   111_A     K   111_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   112_A     I   112_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   113_A     G   113_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   114_A     V   114_A    108  108  108     48  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   115_A     D   115_A    108  108  108     38  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   116_A     E   116_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   117_A     F   117_A    108  108  108     48  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   118_A     K   118_A    108  108  108     56  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   119_A     S   119_A    108  108  108     63  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   120_A     M   120_A    108  108  108     48  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   121_A     A   121_A    108  108  108     61  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   122_A     K   122_A    108  108  108     64  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   123_A     M   123_A    108  108  108     11   71  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T   124_A     T   124_A    108  108  108      3    3    4    6  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     64    103    105    107    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  59.26  95.37  97.22  99.07 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.32   0.53   0.55   0.63   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73
GDT RMS_ALL_AT   0.83   0.74   0.74   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  F    39_A      F    39_A
#   possible swapping detected:  E    57_A      E    57_A
#   possible swapping detected:  E    60_A      E    60_A
#   possible swapping detected:  F    62_A      F    62_A
#   possible swapping detected:  E    74_A      E    74_A
#   possible swapping detected:  E    77_A      E    77_A
#   possible swapping detected:  F    81_A      F    81_A
#   possible swapping detected:  F    85_A      F    85_A
#   possible swapping detected:  D    87_A      D    87_A
#   possible swapping detected:  E    96_A      E    96_A
#   possible swapping detected:  F   100_A      F   100_A
#   possible swapping detected:  E   116_A      E   116_A
#   possible swapping detected:  F   117_A      F   117_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S    17_A      S    17_A     2.346     0    0.552   0.734     4.430   69.048   61.746
LGA    K    18_A      K    18_A     1.960     0    0.081   0.165     5.434   75.119   56.667
LGA    I    19_A      I    19_A     0.344     0    0.057   0.608     1.519   97.619   90.714
LGA    T    20_A      T    20_A     0.695     0    0.037   0.060     1.214   90.476   87.891
LGA    S    21_A      S    21_A     0.568     0    0.080   0.665     3.019   92.857   85.317
LGA    I    22_A      I    22_A     0.286     0    0.063   0.109     0.842  100.000   96.429
LGA    L    23_A      L    23_A     0.379     0    0.023   0.075     0.607  100.000   95.238
LGA    N    24_A      N    24_A     0.525     0    0.042   0.495     2.121   95.238   89.643
LGA    P    25_A      P    25_A     0.454     0    0.028   0.136     0.710  100.000   95.918
LGA    A    26_A      A    26_A     0.336     0    0.023   0.021     0.369  100.000  100.000
LGA    D    27_A      D    27_A     0.454     0    0.009   0.109     0.925   97.619   94.048
LGA    I    28_A      I    28_A     0.574     0    0.028   0.066     0.710   92.857   91.667
LGA    T    29_A      T    29_A     0.378     0    0.050   0.086     0.547  100.000   97.279
LGA    K    30_A      K    30_A     0.098     0    0.059   0.748     3.727  100.000   77.884
LGA    A    31_A      A    31_A     0.473     0    0.031   0.042     0.575   97.619   96.190
LGA    L    32_A      L    32_A     0.537     0    0.012   0.074     0.901   95.238   92.857
LGA    E    33_A      E    33_A     0.340     0    0.028   1.149     4.831  100.000   82.063
LGA    Q    34_A      Q    34_A     0.273     0    0.027   0.324     1.287  100.000   95.820
LGA    C    35_A      C    35_A     0.599     0    0.069   0.098     0.888   90.476   90.476
LGA    A    36_A      A    36_A     0.654     0    0.027   0.026     0.699   90.476   90.476
LGA    A    37_A      A    37_A     0.796     0    0.136   0.146     1.343   88.214   88.667
LGA    G    38_A      G    38_A     0.814     0    0.055   0.055     0.822   90.476   90.476
LGA    F    39_A      F    39_A     0.784     0    0.048   0.071     0.890   90.476   92.208
LGA    H    40_A      H    40_A     0.496     0    0.088   0.152     0.913   95.238   92.381
LGA    H    41_A      H    41_A     0.591     0    0.047   0.138     0.627   92.857   94.286
LGA    T    42_A      T    42_A     0.447     0    0.035   0.086     0.787   97.619   97.279
LGA    A    43_A      A    43_A     0.368     0    0.038   0.045     0.439  100.000  100.000
LGA    F    44_A      F    44_A     0.229     0    0.026   0.112     0.438  100.000  100.000
LGA    F    45_A      F    45_A     0.291     0    0.033   0.515     1.724  100.000   92.468
LGA    K    46_A      K    46_A     0.446     0    0.049   0.173     2.407   97.619   87.831
LGA    A    47_A      A    47_A     0.463     0    0.018   0.024     0.569  100.000   98.095
LGA    S    48_A      S    48_A     0.412     0    0.036   0.052     0.566   97.619   98.413
LGA    G    49_A      G    49_A     0.539     0    0.041   0.041     0.539   97.619   97.619
LGA    L    50_A      L    50_A     0.287     0    0.053   0.150     0.622  100.000   98.810
LGA    S    51_A      S    51_A     0.441     0    0.099   0.150     0.818   95.238   93.651
LGA    K    52_A      K    52_A     0.509     0    0.058   0.666     2.800   97.619   87.302
LGA    K    53_A      K    53_A     0.314     0    0.025   0.534     1.620  100.000   93.968
LGA    S    54_A      S    54_A     0.617     0    0.008   0.027     0.673   92.857   92.063
LGA    D    55_A      D    55_A     0.955     0    0.118   0.930     2.891   90.476   81.845
LGA    A    56_A      A    56_A     0.939     0    0.077   0.084     0.942   90.476   90.476
LGA    E    57_A      E    57_A     0.701     0    0.022   0.184     0.803   90.476   91.534
LGA    L    58_A      L    58_A     0.490     0    0.014   0.048     0.580   92.857   96.429
LGA    A    59_A      A    59_A     0.640     0    0.011   0.011     0.657   90.476   90.476
LGA    E    60_A      E    60_A     0.728     0    0.018   0.054     1.010   90.476   89.471
LGA    I    61_A      I    61_A     0.604     0    0.014   0.623     1.614   90.476   88.274
LGA    F    62_A      F    62_A     0.375     0    0.053   0.096     0.468  100.000  100.000
LGA    N    63_A      N    63_A     0.482     0    0.128   0.257     0.772   97.619   96.429
LGA    V    64_A      V    64_A     0.797     0    0.007   1.214     3.584   90.476   79.932
LGA    L    65_A      L    65_A     0.694     0    0.085   0.138     1.019   90.476   90.536
LGA    D    66_A      D    66_A     0.612     0    0.085   0.092     0.759   90.476   94.048
LGA    G    67_A      G    67_A     0.573     0    0.023   0.023     0.696   90.476   90.476
LGA    D    68_A      D    68_A     0.770     0    0.116   0.112     0.966   92.857   91.667
LGA    Q    69_A      Q    69_A     0.554     0    0.066   1.223     4.214   90.476   77.989
LGA    S    70_A      S    70_A     0.730     0    0.020   0.023     0.838   90.476   90.476
LGA    G    71_A      G    71_A     0.619     0    0.058   0.058     0.619   90.476   90.476
LGA    Y    72_A      Y    72_A     0.543     0    0.021   0.139     1.594   90.476   85.992
LGA    I    73_A      I    73_A     0.326     0    0.027   0.070     0.438  100.000  100.000
LGA    E    74_A      E    74_A     0.185     0    0.051   0.824     3.507  100.000   86.772
LGA    V    75_A      V    75_A     0.394     0    0.042   1.097     2.974  100.000   88.639
LGA    E    76_A      E    76_A     0.554     0    0.024   0.577     1.403   92.857   90.529
LGA    E    77_A      E    77_A     0.454     0    0.015   0.172     0.689   97.619   97.884
LGA    L    78_A      L    78_A     0.170     0    0.031   0.067     0.375  100.000  100.000
LGA    K    79_A      K    79_A     0.600     0    0.061   1.101     4.686   92.857   75.820
LGA    N    80_A      N    80_A     0.761     0    0.093   0.127     1.358   92.857   88.274
LGA    F    81_A      F    81_A     0.497     0    0.049   0.142     0.618   97.619   98.268
LGA    L    82_A      L    82_A     0.406     0    0.015   0.116     0.754  100.000   95.238
LGA    K    83_A      K    83_A     0.310     0    0.119   0.617     2.071   97.619   92.910
LGA    C    84_A      C    84_A     0.339     0    0.078   0.133     0.573  100.000   98.413
LGA    F    85_A      F    85_A     0.536     0    0.027   0.067     0.665   90.476   92.208
LGA    S    86_A      S    86_A     0.585     0    0.021   0.122     0.627   90.476   90.476
LGA    D    87_A      D    87_A     0.833     0    0.077   0.821     2.035   90.476   83.929
LGA    G    88_A      G    88_A     1.121     0    0.060   0.060     1.417   83.690   83.690
LGA    A    89_A      A    89_A     0.678     0    0.059   0.058     0.739   90.476   90.476
LGA    R    90_A      R    90_A     0.571     0    0.030   0.098     0.703   90.476   90.476
LGA    V    91_A      V    91_A     0.747     0    0.028   0.102     1.317   90.476   87.891
LGA    L    92_A      L    92_A     0.572     0    0.015   0.062     0.797   90.476   94.048
LGA    N    93_A      N    93_A     0.906     0    0.045   0.176     1.000   90.476   89.345
LGA    D    94_A      D    94_A     1.047     0    0.019   0.176     1.301   85.952   83.690
LGA    K    95_A      K    95_A     0.938     0    0.033   0.106     1.853   90.476   83.545
LGA    E    96_A      E    96_A     0.511     0    0.029   0.170     0.691   95.238   93.651
LGA    T    97_A      T    97_A     0.417     0    0.030   0.091     0.571  100.000   97.279
LGA    S    98_A      S    98_A     0.440     0    0.033   0.072     0.618   97.619   95.238
LGA    N    99_A      N    99_A     0.540     0    0.029   0.087     0.893   92.857   91.667
LGA    F   100_A      F   100_A     0.318     0    0.025   0.084     0.462  100.000  100.000
LGA    L   101_A      L   101_A     0.247     0    0.074   0.083     0.369  100.000  100.000
LGA    A   102_A      A   102_A     0.500     0    0.112   0.112     0.954   92.857   92.381
LGA    A   103_A      A   103_A     0.508     0    0.135   0.137     0.693   95.238   94.286
LGA    G   104_A      G   104_A     0.318     0    0.100   0.100     0.591   97.619   97.619
LGA    D   105_A      D   105_A     0.265     0    0.050   0.210     1.041   97.619   94.107
LGA    S   106_A      S   106_A     0.314     0    0.014   0.595     2.335   97.619   92.540
LGA    D   107_A      D   107_A     0.646     0    0.118   0.131     1.281   88.214   88.214
LGA    G   108_A      G   108_A     0.558     0    0.071   0.071     0.558   95.238   95.238
LGA    D   109_A      D   109_A     0.252     0    0.075   0.147     0.536  100.000   97.619
LGA    H   110_A      H   110_A     0.208     0    0.041   1.121     2.437  100.000   88.381
LGA    K   111_A      K   111_A     0.217     0    0.064   0.184     1.785   97.619   92.804
LGA    I   112_A      I   112_A     0.471     0    0.049   0.073     0.759   97.619   95.238
LGA    G   113_A      G   113_A     0.481     0    0.065   0.065     0.481  100.000  100.000
LGA    V   114_A      V   114_A     0.529     0    0.064   0.095     0.644   95.238   93.197
LGA    D   115_A      D   115_A     0.631     0    0.029   0.120     1.462   90.476   87.083
LGA    E   116_A      E   116_A     0.479     0    0.101   0.117     0.660  100.000   98.942
LGA    F   117_A      F   117_A     0.573     0    0.023   0.050     0.590   90.476   94.805
LGA    K   118_A      K   118_A     0.468     0    0.029   0.262     1.426   97.619   93.704
LGA    S   119_A      S   119_A     0.373     0    0.078   0.643     2.468   97.619   92.540
LGA    M   120_A      M   120_A     0.556     0    0.017   1.091     2.933   95.238   85.357
LGA    A   121_A      A   121_A     0.367     0    0.041   0.056     0.441  100.000  100.000
LGA    K   122_A      K   122_A     0.099     0    0.018   0.785     4.326  100.000   79.048
LGA    M   123_A      M   123_A     1.339     0    0.064   0.860     7.285   73.452   56.190
LGA    T   124_A      T   124_A     3.870     0    0.079   0.162     5.228   45.238   37.823

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     820    820  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.731          0.728                  1.119           94.020   90.628

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  124  108    4.0    108    0.73    98.611    99.362    12.995

LGA_LOCAL      RMSD:   0.731  Number of atoms:  108  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.731  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.731  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.217371 * X  +   0.843964 * Y  +  -0.490382 * Z  +   0.825385
  Y_new =   0.538095 * X  +   0.315548 * Y  +   0.781590 * Z  +   1.237979
  Z_new =   0.814373 * X  +  -0.433768 * Y  +  -0.385542 * Z  +  10.130301 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  1.186877 -0.951648 -2.297401   [DEG:   68.0030  -54.5254 -131.6314 ]
ZXZ: -2.581258  1.966591  2.060214   [DEG: -147.8952  112.6774  118.0415 ]
 
# END of job
