
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  124 (  959),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  820),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.70     0.70
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.70     0.70
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.70     0.70
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S    17_A     S    17_A    108  108  108      5   53  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    18_A     K    18_A    108  108  108     13   58  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    20_A     T    20_A    108  108  108     66  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    21_A     S    21_A    108  108  108     61  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    22_A     I    22_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    23_A     L    23_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    24_A     N    24_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    25_A     P    25_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    26_A     A    26_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    27_A     D    27_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    28_A     I    28_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    30_A     K    30_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    32_A     L    32_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    33_A     E    33_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    34_A     Q    34_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    35_A     C    35_A    108  108  108     58  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    36_A     A    36_A    108  108  108     31  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    37_A     A    37_A    108  108  108     31  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    38_A     G    38_A    108  108  108     31  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    39_A     F    39_A    108  108  108     38  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    40_A     H    40_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    41_A     H    41_A    108  108  108     65  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    42_A     T    42_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    43_A     A    43_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    45_A     F    45_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    46_A     K    46_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    47_A     A    47_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    48_A     S    48_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    49_A     G    49_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    50_A     L    50_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    52_A     K    52_A    108  108  108     67  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    53_A     K    53_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    54_A     S    54_A    108  108  108     61  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    55_A     D    55_A    108  108  108     57  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    56_A     A    56_A    108  108  108     57  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_A     E    57_A    108  108  108     57  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    58_A     L    58_A    108  108  108     63  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    59_A     A    59_A    108  108  108     57  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    60_A     E    60_A    108  108  108     57  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    61_A     I    61_A    108  108  108     57  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    62_A     F    62_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    63_A     N    63_A    108  108  108     63  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    64_A     V    64_A    108  108  108     32  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    65_A     L    65_A    108  108  108     27  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    66_A     D    66_A    108  108  108     49  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    67_A     G    67_A    108  108  108     43  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    68_A     D    68_A    108  108  108     21  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    69_A     Q    69_A    108  108  108     21  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    70_A     S    70_A    108  108  108     50  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    71_A     G    71_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    72_A     Y    72_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    73_A     I    73_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    74_A     E    74_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    75_A     V    75_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    76_A     E    76_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    77_A     E    77_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    78_A     L    78_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_A     K    79_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    80_A     N    80_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    81_A     F    81_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    82_A     L    82_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    83_A     K    83_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    84_A     C    84_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    85_A     F    85_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    86_A     S    86_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    87_A     D    87_A    108  108  108     30  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    88_A     G    88_A    108  108  108     15   75  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    89_A     A    89_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    90_A     R    90_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    91_A     V    91_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_A     L    92_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    93_A     N    93_A    108  108  108     51  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    94_A     D    94_A    108  108  108     51  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    95_A     K    95_A    108  108  108     51  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    96_A     E    96_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    97_A     T    97_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    98_A     S    98_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    99_A     N    99_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L   101_A     L   101_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   103_A     A   103_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   105_A     D   105_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   106_A     S   106_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   107_A     D   107_A    108  108  108     58  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   108_A     G   108_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   109_A     D   109_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H   110_A     H   110_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   111_A     K   111_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   112_A     I   112_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   113_A     G   113_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   114_A     V   114_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   115_A     D   115_A    108  108  108     52  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   116_A     E   116_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   117_A     F   117_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   118_A     K   118_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   119_A     S   119_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   120_A     M   120_A    108  108  108     55  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   121_A     A   121_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   122_A     K   122_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   123_A     M   123_A    108  108  108     21   82  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T   124_A     T   124_A    108  108  108      4    5    7  102  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     68    103    105    107    107    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  62.96  95.37  97.22  99.07  99.07 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.33   0.52   0.54   0.62   0.62   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70
GDT RMS_ALL_AT   0.76   0.71   0.71   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    33_A      E    33_A
#   possible swapping detected:  F    39_A      F    39_A
#   possible swapping detected:  E    57_A      E    57_A
#   possible swapping detected:  E    60_A      E    60_A
#   possible swapping detected:  F    62_A      F    62_A
#   possible swapping detected:  E    74_A      E    74_A
#   possible swapping detected:  E    77_A      E    77_A
#   possible swapping detected:  F    81_A      F    81_A
#   possible swapping detected:  F    85_A      F    85_A
#   possible swapping detected:  E    96_A      E    96_A
#   possible swapping detected:  F   100_A      F   100_A
#   possible swapping detected:  E   116_A      E   116_A
#   possible swapping detected:  F   117_A      F   117_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S    17_A      S    17_A     2.327     0    0.565   0.747     4.530   69.048   60.794
LGA    K    18_A      K    18_A     2.051     0    0.077   0.163     5.832   73.095   53.810
LGA    I    19_A      I    19_A     0.300     0    0.069   0.626     1.604   97.619   90.714
LGA    T    20_A      T    20_A     0.513     0    0.035   0.063     1.176   95.238   90.612
LGA    S    21_A      S    21_A     0.466     0    0.095   0.097     1.019   92.976   92.143
LGA    I    22_A      I    22_A     0.180     0    0.073   0.125     0.720  100.000   97.619
LGA    L    23_A      L    23_A     0.345     0    0.030   0.053     0.579  100.000   98.810
LGA    N    24_A      N    24_A     0.545     0    0.042   0.485     2.130   92.857   88.452
LGA    P    25_A      P    25_A     0.495     0    0.024   0.138     0.654   97.619   94.558
LGA    A    26_A      A    26_A     0.405     0    0.028   0.025     0.433  100.000  100.000
LGA    D    27_A      D    27_A     0.480     0    0.015   0.118     0.911   97.619   94.048
LGA    I    28_A      I    28_A     0.517     0    0.027   0.083     0.634   95.238   92.857
LGA    T    29_A      T    29_A     0.280     0    0.045   0.082     0.462  100.000  100.000
LGA    K    30_A      K    30_A     0.218     0    0.078   0.742     3.671   97.619   76.825
LGA    A    31_A      A    31_A     0.485     0    0.036   0.045     0.554   97.619   96.190
LGA    L    32_A      L    32_A     0.486     0    0.017   0.059     0.775  100.000   95.238
LGA    E    33_A      E    33_A     0.284     0    0.021   0.989     4.502  100.000   81.323
LGA    Q    34_A      Q    34_A     0.273     0    0.027   0.505     1.921  100.000   91.746
LGA    C    35_A      C    35_A     0.675     0    0.071   0.086     1.407   90.476   87.460
LGA    A    36_A      A    36_A     0.758     0    0.026   0.026     0.943   90.476   90.476
LGA    A    37_A      A    37_A     0.825     0    0.104   0.112     1.348   88.214   88.667
LGA    G    38_A      G    38_A     0.685     0    0.052   0.052     0.765   90.476   90.476
LGA    F    39_A      F    39_A     0.710     0    0.048   0.103     0.784   90.476   92.208
LGA    H    40_A      H    40_A     0.436     0    0.084   0.141     0.801   97.619   94.286
LGA    H    41_A      H    41_A     0.508     0    0.043   0.127     0.534   95.238   97.143
LGA    T    42_A      T    42_A     0.354     0    0.028   0.100     0.744   97.619   97.279
LGA    A    43_A      A    43_A     0.285     0    0.037   0.046     0.390  100.000  100.000
LGA    F    44_A      F    44_A     0.223     0    0.020   0.129     0.478  100.000  100.000
LGA    F    45_A      F    45_A     0.322     0    0.029   0.523     1.801  100.000   92.468
LGA    K    46_A      K    46_A     0.318     0    0.031   0.852     5.172  100.000   75.503
LGA    A    47_A      A    47_A     0.222     0    0.022   0.027     0.377  100.000  100.000
LGA    S    48_A      S    48_A     0.227     0    0.033   0.045     0.346  100.000  100.000
LGA    G    49_A      G    49_A     0.339     0    0.032   0.032     0.339  100.000  100.000
LGA    L    50_A      L    50_A     0.240     0    0.044   0.097     0.501  100.000   98.810
LGA    S    51_A      S    51_A     0.353     0    0.078   0.140     0.610   97.619   95.238
LGA    K    52_A      K    52_A     0.432     0    0.055   0.675     2.693  100.000   91.323
LGA    K    53_A      K    53_A     0.305     0    0.030   0.527     1.716  100.000   93.968
LGA    S    54_A      S    54_A     0.563     0    0.007   0.027     0.623   92.857   92.063
LGA    D    55_A      D    55_A     0.905     0    0.114   0.913     2.851   90.476   81.845
LGA    A    56_A      A    56_A     0.908     0    0.073   0.080     0.930   90.476   90.476
LGA    E    57_A      E    57_A     0.670     0    0.024   0.149     0.770   90.476   93.651
LGA    L    58_A      L    58_A     0.456     0    0.009   0.041     0.543   97.619   98.810
LGA    A    59_A      A    59_A     0.579     0    0.012   0.013     0.589   90.476   90.476
LGA    E    60_A      E    60_A     0.685     0    0.017   0.642     2.167   90.476   87.619
LGA    I    61_A      I    61_A     0.586     0    0.020   0.606     1.535   90.476   88.274
LGA    F    62_A      F    62_A     0.334     0    0.058   0.115     0.430  100.000  100.000
LGA    N    63_A      N    63_A     0.486     0    0.113   0.222     0.731  100.000   98.810
LGA    V    64_A      V    64_A     0.810     0    0.008   1.222     3.658   90.476   81.156
LGA    L    65_A      L    65_A     0.771     0    0.068   0.115     1.051   90.476   90.536
LGA    D    66_A      D    66_A     0.633     0    0.054   0.073     0.753   92.857   92.857
LGA    G    67_A      G    67_A     0.648     0    0.025   0.025     0.820   90.476   90.476
LGA    D    68_A      D    68_A     0.889     0    0.107   0.130     1.083   90.476   88.214
LGA    Q    69_A      Q    69_A     0.670     0    0.066   1.245     4.329   90.476   77.196
LGA    S    70_A      S    70_A     0.865     0    0.019   0.021     0.969   90.476   90.476
LGA    G    71_A      G    71_A     0.620     0    0.074   0.074     0.620   90.476   90.476
LGA    Y    72_A      Y    72_A     0.569     0    0.013   0.122     1.335   90.476   88.214
LGA    I    73_A      I    73_A     0.380     0    0.028   0.055     0.483  100.000  100.000
LGA    E    74_A      E    74_A     0.200     0    0.056   0.816     3.117  100.000   87.513
LGA    V    75_A      V    75_A     0.425     0    0.044   1.089     2.943  100.000   89.864
LGA    E    76_A      E    76_A     0.576     0    0.023   0.565     1.386   92.857   90.529
LGA    E    77_A      E    77_A     0.468     0    0.029   0.166     0.658   97.619   96.825
LGA    L    78_A      L    78_A     0.087     0    0.035   1.304     2.782  100.000   87.917
LGA    K    79_A      K    79_A     0.581     0    0.047   1.093     4.842   92.857   75.820
LGA    N    80_A      N    80_A     0.669     0    0.086   0.094     1.111   92.857   90.536
LGA    F    81_A      F    81_A     0.433     0    0.052   0.111     0.540   97.619   99.134
LGA    L    82_A      L    82_A     0.379     0    0.021   0.099     0.788  100.000   96.429
LGA    K    83_A      K    83_A     0.278     0    0.060   0.639     2.201   97.619   93.968
LGA    C    84_A      C    84_A     0.291     0    0.041   0.103     0.547  100.000   98.413
LGA    F    85_A      F    85_A     0.378     0    0.045   0.080     0.634   97.619   97.403
LGA    S    86_A      S    86_A     0.467     0    0.020   0.030     0.596  100.000   96.825
LGA    D    87_A      D    87_A     0.968     0    0.020   1.061     3.212   85.952   78.690
LGA    G    88_A      G    88_A     1.396     0    0.027   0.027     1.511   79.286   79.286
LGA    A    89_A      A    89_A     0.618     0    0.070   0.070     0.789   90.476   90.476
LGA    R    90_A      R    90_A     0.402     0    0.033   0.097     0.566  100.000   99.134
LGA    V    91_A      V    91_A     0.577     0    0.029   0.097     0.983   92.857   91.837
LGA    L    92_A      L    92_A     0.542     0    0.015   0.061     0.749   90.476   94.048
LGA    N    93_A      N    93_A     0.846     0    0.060   0.206     0.998   92.857   91.667
LGA    D    94_A      D    94_A     0.962     0    0.019   0.106     1.130   88.214   85.952
LGA    K    95_A      K    95_A     0.853     0    0.038   0.099     1.636   92.857   85.556
LGA    E    96_A      E    96_A     0.524     0    0.023   0.147     0.629   95.238   95.767
LGA    T    97_A      T    97_A     0.482     0    0.026   0.039     0.667   97.619   94.558
LGA    S    98_A      S    98_A     0.529     0    0.037   0.075     0.723   95.238   93.651
LGA    N    99_A      N    99_A     0.561     0    0.031   0.060     0.797   95.238   92.857
LGA    F   100_A      F   100_A     0.364     0    0.023   0.111     0.657  100.000   97.403
LGA    L   101_A      L   101_A     0.310     0    0.080   0.085     0.441  100.000  100.000
LGA    A   102_A      A   102_A     0.494     0    0.106   0.106     0.782   95.238   94.286
LGA    A   103_A      A   103_A     0.454     0    0.130   0.132     0.583   97.619   96.190
LGA    G   104_A      G   104_A     0.297     0    0.083   0.083     0.398  100.000  100.000
LGA    D   105_A      D   105_A     0.393     0    0.030   0.210     1.190  100.000   95.298
LGA    S   106_A      S   106_A     0.360     0    0.010   0.589     2.294   95.238   90.952
LGA    D   107_A      D   107_A     0.765     0    0.104   0.110     1.288   88.214   88.214
LGA    G   108_A      G   108_A     0.581     0    0.028   0.028     0.588   95.238   95.238
LGA    D   109_A      D   109_A     0.255     0    0.062   0.149     0.590  100.000   97.619
LGA    H   110_A      H   110_A     0.316     0    0.029   0.922     2.529  100.000   89.381
LGA    K   111_A      K   111_A     0.183     0    0.063   0.199     2.049   97.619   90.847
LGA    I   112_A      I   112_A     0.452     0    0.045   0.078     0.742   97.619   97.619
LGA    G   113_A      G   113_A     0.542     0    0.073   0.073     0.542   95.238   95.238
LGA    V   114_A      V   114_A     0.451     0    0.061   0.066     0.476  100.000  100.000
LGA    D   115_A      D   115_A     0.582     0    0.027   0.118     1.351   90.476   87.083
LGA    E   116_A      E   116_A     0.457     0    0.098   0.118     0.717   97.619   96.825
LGA    F   117_A      F   117_A     0.517     0    0.022   0.042     0.530   95.238   97.403
LGA    K   118_A      K   118_A     0.377     0    0.030   0.217     1.127  100.000   94.762
LGA    S   119_A      S   119_A     0.340     0    0.079   0.640     2.470   97.619   92.540
LGA    M   120_A      M   120_A     0.574     0    0.020   1.085     2.820   92.857   84.167
LGA    A   121_A      A   121_A     0.327     0    0.043   0.056     0.413  100.000  100.000
LGA    K   122_A      K   122_A     0.220     0    0.052   0.789     4.601  100.000   78.413
LGA    M   123_A      M   123_A     1.144     0    0.076   0.778     6.245   73.452   60.476
LGA    T   124_A      T   124_A     3.401     0    0.174   1.264     7.022   53.690   44.762

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     820    820  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.700          0.693                  1.135           94.658   91.037

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  124  108    4.0    108    0.70    98.611    99.301    13.508

LGA_LOCAL      RMSD:   0.700  Number of atoms:  108  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.700  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.700  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.727388 * X  +  -0.196484 * Y  +  -0.657496 * Z  +   1.124286
  Y_new =   0.567286 * X  +   0.711293 * Y  +   0.415029 * Z  +   0.268960
  Z_new =   0.386126 * X  +  -0.674875 * Y  +   0.628848 * Z  +  11.143061 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  0.662361 -0.396428 -0.820688   [DEG:   37.9505  -22.7136  -47.0220 ]
ZXZ: -2.133860  0.890725  2.621907   [DEG: -122.2612   51.0348  150.2242 ]
 
# END of job
