
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  124 (  959),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  820),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.71     0.71
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.71     0.71
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.71     0.71
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S    17_A     S    17_A    108  108  108      5   14   73  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    18_A     K    18_A    108  108  108     12   35  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    20_A     T    20_A    108  108  108     50  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    21_A     S    21_A    108  108  108     51  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    22_A     I    22_A    108  108  108     67  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    23_A     L    23_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    24_A     N    24_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    25_A     P    25_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    26_A     A    26_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    27_A     D    27_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    28_A     I    28_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    30_A     K    30_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    32_A     L    32_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    33_A     E    33_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    34_A     Q    34_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    35_A     C    35_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    36_A     A    36_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    37_A     A    37_A    108  108  108     37  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    38_A     G    38_A    108  108  108     39  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    39_A     F    39_A    108  108  108     39  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    40_A     H    40_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    41_A     H    41_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    42_A     T    42_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    43_A     A    43_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    45_A     F    45_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    46_A     K    46_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    47_A     A    47_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    48_A     S    48_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    49_A     G    49_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    50_A     L    50_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    52_A     K    52_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    53_A     K    53_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    54_A     S    54_A    108  108  108     63  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    55_A     D    55_A    108  108  108     48  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    56_A     A    56_A    108  108  108     48  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_A     E    57_A    108  108  108     50  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    58_A     L    58_A    108  108  108     67  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    59_A     A    59_A    108  108  108     63  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    60_A     E    60_A    108  108  108     53  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    61_A     I    61_A    108  108  108     53  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    62_A     F    62_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    63_A     N    63_A    108  108  108     67  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    64_A     V    64_A    108  108  108     47  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    65_A     L    65_A    108  108  108     31  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    66_A     D    66_A    108  108  108     47  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    67_A     G    67_A    108  108  108     52  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    68_A     D    68_A    108  108  108     31  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    69_A     Q    69_A    108  108  108     62  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    70_A     S    70_A    108  108  108     52  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    71_A     G    71_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    72_A     Y    72_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    73_A     I    73_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    74_A     E    74_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    75_A     V    75_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    76_A     E    76_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    77_A     E    77_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    78_A     L    78_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_A     K    79_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    80_A     N    80_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    81_A     F    81_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    82_A     L    82_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    83_A     K    83_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    84_A     C    84_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    85_A     F    85_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    86_A     S    86_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    87_A     D    87_A    108  108  108     39  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    88_A     G    88_A    108  108  108     39  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    89_A     A    89_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    90_A     R    90_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    91_A     V    91_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_A     L    92_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    93_A     N    93_A    108  108  108     50  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    94_A     D    94_A    108  108  108     50  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    95_A     K    95_A    108  108  108     50  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    96_A     E    96_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    97_A     T    97_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    98_A     S    98_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    99_A     N    99_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L   101_A     L   101_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   103_A     A   103_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   105_A     D   105_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   106_A     S   106_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   107_A     D   107_A    108  108  108     36  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   108_A     G   108_A    108  108  108     55  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   109_A     D   109_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H   110_A     H   110_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   111_A     K   111_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   112_A     I   112_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   113_A     G   113_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   114_A     V   114_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   115_A     D   115_A    108  108  108     46  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   116_A     E   116_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   117_A     F   117_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   118_A     K   118_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   119_A     S   119_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   120_A     M   120_A    108  108  108     55  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   121_A     A   121_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   122_A     K   122_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   123_A     M   123_A    108  108  108     16   72  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T   124_A     T   124_A    108  108  108      3    4    6   19  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     70    104    105    107    107    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  64.81  96.30  97.22  99.07  99.07 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.34   0.51   0.53   0.63   0.63   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71
GDT RMS_ALL_AT   0.77   0.72   0.72   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    33_A      E    33_A
#   possible swapping detected:  F    39_A      F    39_A
#   possible swapping detected:  E    57_A      E    57_A
#   possible swapping detected:  F    62_A      F    62_A
#   possible swapping detected:  E    74_A      E    74_A
#   possible swapping detected:  E    77_A      E    77_A
#   possible swapping detected:  F    81_A      F    81_A
#   possible swapping detected:  F    85_A      F    85_A
#   possible swapping detected:  D    87_A      D    87_A
#   possible swapping detected:  E    96_A      E    96_A
#   possible swapping detected:  F   100_A      F   100_A
#   possible swapping detected:  E   116_A      E   116_A
#   possible swapping detected:  F   117_A      F   117_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S    17_A      S    17_A     2.597     0    0.554   0.736     4.557   61.190   55.556
LGA    K    18_A      K    18_A     2.227     0    0.073   0.674     3.074   73.095   65.132
LGA    I    19_A      I    19_A     0.300     0    0.063   0.617     1.494   95.357   90.655
LGA    T    20_A      T    20_A     0.583     0    0.044   0.061     1.208   95.238   90.612
LGA    S    21_A      S    21_A     0.614     0    0.101   0.664     3.059   90.595   83.810
LGA    I    22_A      I    22_A     0.352     0    0.031   0.089     0.948  100.000   96.429
LGA    L    23_A      L    23_A     0.298     0    0.028   0.040     0.606  100.000   98.810
LGA    N    24_A      N    24_A     0.580     0    0.037   0.557     2.334   90.476   87.262
LGA    P    25_A      P    25_A     0.556     0    0.023   0.142     0.629   92.857   91.837
LGA    A    26_A      A    26_A     0.439     0    0.022   0.026     0.481  100.000  100.000
LGA    D    27_A      D    27_A     0.516     0    0.011   0.163     0.793   92.857   91.667
LGA    I    28_A      I    28_A     0.539     0    0.032   0.102     0.696   95.238   92.857
LGA    T    29_A      T    29_A     0.317     0    0.045   0.076     0.481  100.000  100.000
LGA    K    30_A      K    30_A     0.224     0    0.066   0.678     2.067   97.619   88.836
LGA    A    31_A      A    31_A     0.502     0    0.046   0.054     0.593   92.857   92.381
LGA    L    32_A      L    32_A     0.502     0    0.014   0.053     0.800   97.619   94.048
LGA    E    33_A      E    33_A     0.303     0    0.032   0.978     4.507  100.000   81.323
LGA    Q    34_A      Q    34_A     0.202     0    0.016   0.335     1.483  100.000   94.815
LGA    C    35_A      C    35_A     0.468     0    0.072   0.100     0.782   97.619   95.238
LGA    A    36_A      A    36_A     0.489     0    0.022   0.026     0.598   95.238   96.190
LGA    A    37_A      A    37_A     0.766     0    0.111   0.120     1.286   88.214   88.667
LGA    G    38_A      G    38_A     0.725     0    0.053   0.053     0.725   90.476   90.476
LGA    F    39_A      F    39_A     0.707     0    0.050   0.092     0.815   90.476   92.208
LGA    H    40_A      H    40_A     0.401     0    0.080   0.125     0.771  100.000   97.143
LGA    H    41_A      H    41_A     0.475     0    0.042   0.142     0.570   97.619   97.143
LGA    T    42_A      T    42_A     0.414     0    0.060   0.152     0.838   97.619   97.279
LGA    A    43_A      A    43_A     0.390     0    0.030   0.037     0.453  100.000  100.000
LGA    F    44_A      F    44_A     0.253     0    0.025   0.117     0.416  100.000  100.000
LGA    F    45_A      F    45_A     0.309     0    0.029   0.560     1.827  100.000   92.468
LGA    K    46_A      K    46_A     0.389     0    0.053   0.157     2.055   97.619   87.831
LGA    A    47_A      A    47_A     0.371     0    0.023   0.027     0.487  100.000  100.000
LGA    S    48_A      S    48_A     0.325     0    0.053   0.062     0.449  100.000  100.000
LGA    G    49_A      G    49_A     0.430     0    0.026   0.026     0.430  100.000  100.000
LGA    L    50_A      L    50_A     0.259     0    0.046   0.111     0.511  100.000   98.810
LGA    S    51_A      S    51_A     0.380     0    0.081   0.127     0.644   97.619   95.238
LGA    K    52_A      K    52_A     0.471     0    0.066   0.661     2.770  100.000   88.360
LGA    K    53_A      K    53_A     0.276     0    0.022   0.319     1.479  100.000   95.873
LGA    S    54_A      S    54_A     0.573     0    0.010   0.026     0.625   92.857   92.063
LGA    D    55_A      D    55_A     0.845     0    0.117   0.926     3.026   90.476   80.952
LGA    A    56_A      A    56_A     0.866     0    0.068   0.074     0.883   90.476   90.476
LGA    E    57_A      E    57_A     0.638     0    0.023   0.187     0.744   90.476   92.593
LGA    L    58_A      L    58_A     0.404     0    0.019   0.046     0.502   97.619   98.810
LGA    A    59_A      A    59_A     0.520     0    0.011   0.013     0.532   92.857   92.381
LGA    E    60_A      E    60_A     0.601     0    0.035   0.437     1.616   90.476   85.556
LGA    I    61_A      I    61_A     0.528     0    0.015   0.609     1.545   95.238   90.655
LGA    F    62_A      F    62_A     0.302     0    0.061   0.102     0.420  100.000  100.000
LGA    N    63_A      N    63_A     0.428     0    0.129   0.313     0.729  100.000   98.810
LGA    V    64_A      V    64_A     0.738     0    0.014   1.212     3.556   90.476   81.156
LGA    L    65_A      L    65_A     0.706     0    0.082   0.124     0.931   90.476   91.667
LGA    D    66_A      D    66_A     0.597     0    0.072   0.099     0.718   92.857   95.238
LGA    G    67_A      G    67_A     0.651     0    0.018   0.018     0.739   90.476   90.476
LGA    D    68_A      D    68_A     0.756     0    0.104   0.137     1.037   92.857   90.536
LGA    Q    69_A      Q    69_A     0.579     0    0.054   1.180     4.001   90.476   76.455
LGA    S    70_A      S    70_A     0.779     0    0.022   0.056     0.953   90.476   90.476
LGA    G    71_A      G    71_A     0.562     0    0.071   0.071     0.562   90.476   90.476
LGA    Y    72_A      Y    72_A     0.521     0    0.012   0.128     1.383   90.476   88.214
LGA    I    73_A      I    73_A     0.354     0    0.029   0.046     0.460  100.000  100.000
LGA    E    74_A      E    74_A     0.322     0    0.069   0.274     0.652  100.000   95.767
LGA    V    75_A      V    75_A     0.437     0    0.047   1.093     3.051  100.000   87.619
LGA    E    76_A      E    76_A     0.573     0    0.022   0.567     1.327   92.857   90.529
LGA    E    77_A      E    77_A     0.433     0    0.026   0.156     0.505   97.619   98.942
LGA    L    78_A      L    78_A     0.129     0    0.039   1.314     2.799  100.000   87.917
LGA    K    79_A      K    79_A     0.549     0    0.056   1.091     4.721   92.857   75.820
LGA    N    80_A      N    80_A     0.624     0    0.079   0.077     0.957   95.238   92.857
LGA    F    81_A      F    81_A     0.469     0    0.050   0.106     0.546   97.619   99.134
LGA    L    82_A      L    82_A     0.440     0    0.029   0.085     0.774  100.000   95.238
LGA    K    83_A      K    83_A     0.386     0    0.069   0.618     1.959   97.619   93.810
LGA    C    84_A      C    84_A     0.448     0    0.046   0.103     0.780  100.000   98.413
LGA    F    85_A      F    85_A     0.459     0    0.025   0.085     0.650   95.238   96.537
LGA    S    86_A      S    86_A     0.537     0    0.010   0.027     0.573   95.238   93.651
LGA    D    87_A      D    87_A     0.755     0    0.064   0.901     2.489   90.476   82.917
LGA    G    88_A      G    88_A     0.984     0    0.040   0.040     1.174   88.214   88.214
LGA    A    89_A      A    89_A     0.604     0    0.067   0.067     0.654   90.476   90.476
LGA    R    90_A      R    90_A     0.504     0    0.038   0.105     0.612   92.857   94.805
LGA    V    91_A      V    91_A     0.662     0    0.028   0.096     1.147   90.476   87.891
LGA    L    92_A      L    92_A     0.527     0    0.013   0.070     0.734   90.476   95.238
LGA    N    93_A      N    93_A     0.828     0    0.044   0.185     0.973   90.476   90.476
LGA    D    94_A      D    94_A     0.945     0    0.018   0.111     1.101   88.214   87.083
LGA    K    95_A      K    95_A     0.851     0    0.028   0.096     1.643   92.857   85.556
LGA    E    96_A      E    96_A     0.459     0    0.024   0.148     0.584   97.619   96.825
LGA    T    97_A      T    97_A     0.411     0    0.029   0.083     0.518  100.000   98.639
LGA    S    98_A      S    98_A     0.479     0    0.029   0.067     0.660   97.619   95.238
LGA    N    99_A      N    99_A     0.520     0    0.026   0.068     0.779   95.238   92.857
LGA    F   100_A      F   100_A     0.356     0    0.027   0.066     0.623  100.000   97.403
LGA    L   101_A      L   101_A     0.313     0    0.071   0.079     0.445  100.000  100.000
LGA    A   102_A      A   102_A     0.542     0    0.106   0.105     0.821   90.476   90.476
LGA    A   103_A      A   103_A     0.502     0    0.129   0.131     0.621   97.619   96.190
LGA    G   104_A      G   104_A     0.370     0    0.084   0.084     0.514   97.619   97.619
LGA    D   105_A      D   105_A     0.404     0    0.037   0.209     1.122  100.000   95.298
LGA    S   106_A      S   106_A     0.292     0    0.021   0.597     2.112   95.238   90.952
LGA    D   107_A      D   107_A     0.915     0    0.100   0.119     1.563   88.214   84.881
LGA    G   108_A      G   108_A     0.637     0    0.064   0.064     0.647   95.238   95.238
LGA    D   109_A      D   109_A     0.279     0    0.053   0.148     0.622  100.000   97.619
LGA    H   110_A      H   110_A     0.354     0    0.034   0.523     1.759  100.000   91.762
LGA    K   111_A      K   111_A     0.182     0    0.058   0.211     2.033   97.619   90.847
LGA    I   112_A      I   112_A     0.463     0    0.040   0.069     0.777   97.619   95.238
LGA    G   113_A      G   113_A     0.499     0    0.069   0.069     0.513   97.619   97.619
LGA    V   114_A      V   114_A     0.477     0    0.064   0.071     0.509  100.000   97.279
LGA    D   115_A      D   115_A     0.592     0    0.042   0.147     1.570   90.476   86.012
LGA    E   116_A      E   116_A     0.454     0    0.102   0.117     0.696  100.000   97.884
LGA    F   117_A      F   117_A     0.501     0    0.020   0.047     0.514   95.238   97.403
LGA    K   118_A      K   118_A     0.415     0    0.032   0.247     1.194  100.000   94.762
LGA    S   119_A      S   119_A     0.418     0    0.063   0.071     0.578   97.619   98.413
LGA    M   120_A      M   120_A     0.578     0    0.016   1.103     2.960   90.476   82.976
LGA    A   121_A      A   121_A     0.353     0    0.021   0.032     0.450  100.000  100.000
LGA    K   122_A      K   122_A     0.140     0    0.035   0.786     4.136  100.000   80.106
LGA    M   123_A      M   123_A     1.331     0    0.052   0.160     4.180   73.452   62.976
LGA    T   124_A      T   124_A     3.475     0    0.084   1.056     6.987   53.690   42.381

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     820    820  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.708          0.695                  1.033           94.579   91.479

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  124  108    4.0    108    0.71    98.843    99.375    13.363

LGA_LOCAL      RMSD:   0.708  Number of atoms:  108  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.708  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.708  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.154280 * X  +   0.984224 * Y  +  -0.086605 * Z  +   3.364100
  Y_new =   0.032071 * X  +   0.092597 * Y  +   0.995187 * Z  +  -0.670510
  Z_new =   0.987507 * X  +   0.150760 * Y  +  -0.045850 * Z  +   9.281470 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  2.936640 -1.412559  1.866036   [DEG:  168.2570  -80.9336  106.9160 ]
ZXZ: -3.054788  1.616663  1.419298   [DEG: -175.0264   92.6280   81.3198 ]
 
# END of job
