
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  124 (  959),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  820),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.74     0.74
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.74     0.74
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.74     0.74
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S    17_A     S    17_A    108  108  108      5   16   77  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    18_A     K    18_A    108  108  108     11   38  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    20_A     T    20_A    108  108  108     44  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    21_A     S    21_A    108  108  108     53  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    22_A     I    22_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    23_A     L    23_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    24_A     N    24_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    25_A     P    25_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    26_A     A    26_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    27_A     D    27_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    28_A     I    28_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    30_A     K    30_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    32_A     L    32_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    33_A     E    33_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    34_A     Q    34_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    35_A     C    35_A    108  108  108     57  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    36_A     A    36_A    108  108  108     18  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    37_A     A    37_A    108  108  108     40  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    38_A     G    38_A    108  108  108     54  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    39_A     F    39_A    108  108  108     46  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    40_A     H    40_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    41_A     H    41_A    108  108  108     54  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    42_A     T    42_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    43_A     A    43_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    45_A     F    45_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    46_A     K    46_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    47_A     A    47_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    48_A     S    48_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    49_A     G    49_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    50_A     L    50_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    52_A     K    52_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    53_A     K    53_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    54_A     S    54_A    108  108  108     51  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    55_A     D    55_A    108  108  108     44  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    56_A     A    56_A    108  108  108     45  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_A     E    57_A    108  108  108     47  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    58_A     L    58_A    108  108  108     53  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    59_A     A    59_A    108  108  108     47  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    60_A     E    60_A    108  108  108     44  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    61_A     I    61_A    108  108  108     47  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    62_A     F    62_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    63_A     N    63_A    108  108  108     52  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    64_A     V    64_A    108  108  108     34  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    65_A     L    65_A    108  108  108     31  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    66_A     D    66_A    108  108  108     36  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    67_A     G    67_A    108  108  108     31  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    68_A     D    68_A    108  108  108     31  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    69_A     Q    69_A    108  108  108     53  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    70_A     S    70_A    108  108  108     45  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    71_A     G    71_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    72_A     Y    72_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    73_A     I    73_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    74_A     E    74_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    75_A     V    75_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    76_A     E    76_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    77_A     E    77_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    78_A     L    78_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_A     K    79_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    80_A     N    80_A    108  108  108     61  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    81_A     F    81_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    82_A     L    82_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    83_A     K    83_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    84_A     C    84_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    85_A     F    85_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    86_A     S    86_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    87_A     D    87_A    108  108  108     54  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    88_A     G    88_A    108  108  108     26  101  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    89_A     A    89_A    108  108  108     61  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    90_A     R    90_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    91_A     V    91_A    108  108  108     61  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_A     L    92_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    93_A     N    93_A    108  108  108     42  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    94_A     D    94_A    108  108  108     42  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    95_A     K    95_A    108  108  108     42  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    96_A     E    96_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    97_A     T    97_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    98_A     S    98_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    99_A     N    99_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L   101_A     L   101_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   103_A     A   103_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   105_A     D   105_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   106_A     S   106_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   107_A     D   107_A    108  108  108     61  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   108_A     G   108_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   109_A     D   109_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H   110_A     H   110_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   111_A     K   111_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   112_A     I   112_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   113_A     G   113_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   114_A     V   114_A    108  108  108     47  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   115_A     D   115_A    108  108  108     53  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   116_A     E   116_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   117_A     F   117_A    108  108  108     47  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   118_A     K   118_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   119_A     S   119_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   120_A     M   120_A    108  108  108     47  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   121_A     A   121_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   122_A     K   122_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   123_A     M   123_A    108  108  108     16   56  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T   124_A     T   124_A    108  108  108      3    3    5   21   32  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     62    103    105    107    107    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  57.41  95.37  97.22  99.07  99.07 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.35   0.54   0.56   0.65   0.65   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74
GDT RMS_ALL_AT   0.79   0.75   0.75   0.75   0.75   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    33_A      E    33_A
#   possible swapping detected:  F    39_A      F    39_A
#   possible swapping detected:  E    57_A      E    57_A
#   possible swapping detected:  E    60_A      E    60_A
#   possible swapping detected:  F    62_A      F    62_A
#   possible swapping detected:  E    74_A      E    74_A
#   possible swapping detected:  E    77_A      E    77_A
#   possible swapping detected:  F    81_A      F    81_A
#   possible swapping detected:  F    85_A      F    85_A
#   possible swapping detected:  E    96_A      E    96_A
#   possible swapping detected:  F   100_A      F   100_A
#   possible swapping detected:  E   116_A      E   116_A
#   possible swapping detected:  F   117_A      F   117_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S    17_A      S    17_A     2.552     0    0.593   0.782     4.620   65.119   58.175
LGA    K    18_A      K    18_A     2.123     0    0.076   0.726     2.733   73.095   67.672
LGA    I    19_A      I    19_A     0.214     0    0.058   0.610     1.556   97.619   90.714
LGA    T    20_A      T    20_A     0.594     0    0.037   0.062     1.315   95.238   90.612
LGA    S    21_A      S    21_A     0.442     0    0.112   0.662     2.934   95.357   88.175
LGA    I    22_A      I    22_A     0.211     0    0.026   0.076     0.699  100.000   97.619
LGA    L    23_A      L    23_A     0.407     0    0.027   0.046     0.734  100.000   95.238
LGA    N    24_A      N    24_A     0.608     0    0.051   0.647     2.654   90.476   85.179
LGA    P    25_A      P    25_A     0.522     0    0.017   0.129     0.677   95.238   93.197
LGA    A    26_A      A    26_A     0.293     0    0.023   0.020     0.375  100.000  100.000
LGA    D    27_A      D    27_A     0.502     0    0.010   0.132     1.159   92.857   90.536
LGA    I    28_A      I    28_A     0.571     0    0.033   0.088     0.747   92.857   91.667
LGA    T    29_A      T    29_A     0.296     0    0.043   0.073     0.482  100.000  100.000
LGA    K    30_A      K    30_A     0.212     0    0.084   0.742     3.917   97.619   76.825
LGA    A    31_A      A    31_A     0.509     0    0.035   0.045     0.640   95.238   94.286
LGA    L    32_A      L    32_A     0.530     0    0.014   0.058     0.867   97.619   94.048
LGA    E    33_A      E    33_A     0.258     0    0.021   0.988     4.321  100.000   81.958
LGA    Q    34_A      Q    34_A     0.208     0    0.028   0.563     1.826  100.000   92.804
LGA    C    35_A      C    35_A     0.616     0    0.035   0.096     0.941   92.857   92.063
LGA    A    36_A      A    36_A     0.843     0    0.021   0.024     0.903   90.476   90.476
LGA    A    37_A      A    37_A     0.705     0    0.080   0.090     0.943   90.476   90.476
LGA    G    38_A      G    38_A     0.646     0    0.041   0.041     0.706   90.476   90.476
LGA    F    39_A      F    39_A     0.688     0    0.046   0.088     0.766   90.476   93.074
LGA    H    40_A      H    40_A     0.462     0    0.072   1.128     2.603   97.619   87.429
LGA    H    41_A      H    41_A     0.545     0    0.041   0.151     0.721   92.857   94.286
LGA    T    42_A      T    42_A     0.404     0    0.046   0.116     0.878   97.619   97.279
LGA    A    43_A      A    43_A     0.345     0    0.028   0.034     0.449  100.000  100.000
LGA    F    44_A      F    44_A     0.296     0    0.028   0.114     0.551  100.000   98.268
LGA    F    45_A      F    45_A     0.354     0    0.048   0.604     1.887  100.000   91.645
LGA    K    46_A      K    46_A     0.458     0    0.062   0.151     2.107   95.238   86.772
LGA    A    47_A      A    47_A     0.444     0    0.018   0.022     0.553  100.000   98.095
LGA    S    48_A      S    48_A     0.452     0    0.036   0.051     0.598   95.238   96.825
LGA    G    49_A      G    49_A     0.568     0    0.040   0.040     0.568   97.619   97.619
LGA    L    50_A      L    50_A     0.357     0    0.035   0.124     0.567  100.000   98.810
LGA    S    51_A      S    51_A     0.460     0    0.065   0.071     0.746   95.238   93.651
LGA    K    52_A      K    52_A     0.543     0    0.070   0.667     3.003   95.238   84.392
LGA    K    53_A      K    53_A     0.294     0    0.022   0.318     1.343  100.000   96.878
LGA    S    54_A      S    54_A     0.582     0    0.012   0.030     0.620   95.238   93.651
LGA    D    55_A      D    55_A     0.902     0    0.098   1.016     3.097   90.476   82.024
LGA    A    56_A      A    56_A     0.917     0    0.064   0.069     0.922   90.476   90.476
LGA    E    57_A      E    57_A     0.662     0    0.023   0.193     0.764   90.476   92.593
LGA    L    58_A      L    58_A     0.502     0    0.018   0.050     0.568   90.476   95.238
LGA    A    59_A      A    59_A     0.614     0    0.010   0.012     0.627   90.476   90.476
LGA    E    60_A      E    60_A     0.707     0    0.039   0.250     1.795   90.476   85.556
LGA    I    61_A      I    61_A     0.622     0    0.017   0.615     1.543   90.476   88.274
LGA    F    62_A      F    62_A     0.405     0    0.051   0.096     0.498  100.000  100.000
LGA    N    63_A      N    63_A     0.569     0    0.121   0.258     0.831   92.857   92.857
LGA    V    64_A      V    64_A     0.933     0    0.012   1.209     3.789   90.476   81.156
LGA    L    65_A      L    65_A     0.840     0    0.065   0.109     1.102   90.476   90.536
LGA    D    66_A      D    66_A     0.681     0    0.096   0.113     0.823   92.857   95.238
LGA    G    67_A      G    67_A     0.862     0    0.017   0.017     0.902   90.476   90.476
LGA    D    68_A      D    68_A     0.827     0    0.097   0.114     1.074   92.857   90.536
LGA    Q    69_A      Q    69_A     0.565     0    0.067   1.215     4.613   90.476   77.354
LGA    S    70_A      S    70_A     0.713     0    0.019   0.077     1.020   90.476   88.968
LGA    G    71_A      G    71_A     0.433     0    0.062   0.062     0.441  100.000  100.000
LGA    Y    72_A      Y    72_A     0.457     0    0.015   0.148     1.440   97.619   90.595
LGA    I    73_A      I    73_A     0.366     0    0.019   0.058     0.437  100.000  100.000
LGA    E    74_A      E    74_A     0.345     0    0.043   0.499     2.062  100.000   92.910
LGA    V    75_A      V    75_A     0.455     0    0.046   1.099     3.046  100.000   87.619
LGA    E    76_A      E    76_A     0.456     0    0.024   0.572     1.551   97.619   92.751
LGA    E    77_A      E    77_A     0.368     0    0.018   0.152     0.754  100.000   97.884
LGA    L    78_A      L    78_A     0.202     0    0.029   0.071     0.346  100.000  100.000
LGA    K    79_A      K    79_A     0.594     0    0.050   1.098     4.678   92.857   75.820
LGA    N    80_A      N    80_A     0.768     0    0.074   0.081     1.206   90.476   87.083
LGA    F    81_A      F    81_A     0.458     0    0.073   0.129     0.575   97.619   99.134
LGA    L    82_A      L    82_A     0.434     0    0.020   0.088     0.750  100.000   95.238
LGA    K    83_A      K    83_A     0.323     0    0.059   0.701     2.253   97.619   91.111
LGA    C    84_A      C    84_A     0.290     0    0.059   0.117     0.557  100.000   98.413
LGA    F    85_A      F    85_A     0.544     0    0.033   0.093     0.707   90.476   90.476
LGA    S    86_A      S    86_A     0.614     0    0.013   0.054     0.642   90.476   90.476
LGA    D    87_A      D    87_A     0.768     0    0.024   1.124     3.835   90.476   78.036
LGA    G    88_A      G    88_A     1.148     0    0.030   0.030     1.372   83.690   83.690
LGA    A    89_A      A    89_A     0.698     0    0.043   0.041     0.821   90.476   90.476
LGA    R    90_A      R    90_A     0.574     0    0.035   0.111     0.655   90.476   93.939
LGA    V    91_A      V    91_A     0.761     0    0.031   0.104     1.286   90.476   87.891
LGA    L    92_A      L    92_A     0.576     0    0.014   0.050     0.793   90.476   94.048
LGA    N    93_A      N    93_A     0.893     0    0.045   0.175     1.030   90.476   89.345
LGA    D    94_A      D    94_A     1.046     0    0.017   0.186     1.286   85.952   83.690
LGA    K    95_A      K    95_A     0.946     0    0.030   0.087     1.824   90.476   83.545
LGA    E    96_A      E    96_A     0.485     0    0.028   0.151     0.623   97.619   97.884
LGA    T    97_A      T    97_A     0.418     0    0.036   0.087     0.550  100.000   97.279
LGA    S    98_A      S    98_A     0.540     0    0.034   0.071     0.777   92.857   92.063
LGA    N    99_A      N    99_A     0.599     0    0.021   0.089     0.868   90.476   90.476
LGA    F   100_A      F   100_A     0.338     0    0.022   0.060     0.554  100.000   98.268
LGA    L   101_A      L   101_A     0.309     0    0.069   0.071     0.451  100.000  100.000
LGA    A   102_A      A   102_A     0.611     0    0.100   0.099     0.889   90.476   90.476
LGA    A   103_A      A   103_A     0.581     0    0.131   0.132     0.734   92.857   92.381
LGA    G   104_A      G   104_A     0.381     0    0.074   0.074     0.443  100.000  100.000
LGA    D   105_A      D   105_A     0.375     0    0.048   0.204     1.078  100.000   95.298
LGA    S   106_A      S   106_A     0.270     0    0.021   0.597     2.229   97.619   92.540
LGA    D   107_A      D   107_A     0.710     0    0.108   0.110     1.323   88.214   88.214
LGA    G   108_A      G   108_A     0.526     0    0.061   0.061     0.534   95.238   95.238
LGA    D   109_A      D   109_A     0.300     0    0.069   0.147     0.551  100.000   97.619
LGA    H   110_A      H   110_A     0.326     0    0.034   1.036     2.460  100.000   90.095
LGA    K   111_A      K   111_A     0.217     0    0.058   0.197     1.971   97.619   92.804
LGA    I   112_A      I   112_A     0.458     0    0.040   0.090     0.790   97.619   96.429
LGA    G   113_A      G   113_A     0.454     0    0.070   0.070     0.495  100.000  100.000
LGA    V   114_A      V   114_A     0.550     0    0.063   0.076     0.670   97.619   94.558
LGA    D   115_A      D   115_A     0.495     0    0.023   0.148     1.153   97.619   92.976
LGA    E   116_A      E   116_A     0.462     0    0.107   0.129     0.659   97.619   97.884
LGA    F   117_A      F   117_A     0.556     0    0.021   0.053     0.585   95.238   97.403
LGA    K   118_A      K   118_A     0.396     0    0.031   0.657     1.720  100.000   91.852
LGA    S   119_A      S   119_A     0.376     0    0.060   0.066     0.644   97.619   98.413
LGA    M   120_A      M   120_A     0.602     0    0.021   1.085     2.917   90.476   82.976
LGA    A   121_A      A   121_A     0.349     0    0.043   0.056     0.412  100.000  100.000
LGA    K   122_A      K   122_A     0.338     0    0.035   0.791     4.092   95.238   79.048
LGA    M   123_A      M   123_A     1.305     0    0.041   0.822     6.295   73.452   61.310
LGA    T   124_A      T   124_A     3.809     0    0.115   1.193     7.070   45.238   39.932

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     820    820  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.743          0.736                  1.093           94.053   90.835

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  124  108    4.0    108    0.74    98.611    99.301    12.813

LGA_LOCAL      RMSD:   0.743  Number of atoms:  108  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.743  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.743  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.940373 * X  +  -0.051524 * Y  +  -0.336220 * Z  +   0.851363
  Y_new =  -0.340144 * X  +  -0.140934 * Y  +  -0.929752 * Z  +  -1.120401
  Z_new =   0.000520 * X  +   0.988677 * Y  +  -0.150056 * Z  +  11.524031 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -0.347070 -0.000520  1.721421   [DEG:  -19.8857   -0.0298   98.6302 ]
ZXZ: -0.346991  1.721421  0.000526   [DEG:  -19.8811   98.6302    0.0301 ]
 
# END of job
