
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  124 (  959),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  820),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.69     0.69
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.69     0.69
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.69     0.69
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S    17_A     S    17_A    108  108  108      5   18   86  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    18_A     K    18_A    108  108  108      5   40  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    20_A     T    20_A    108  108  108     54  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    21_A     S    21_A    108  108  108     67  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    22_A     I    22_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    23_A     L    23_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    24_A     N    24_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    25_A     P    25_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    26_A     A    26_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    27_A     D    27_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    28_A     I    28_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    30_A     K    30_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    32_A     L    32_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    33_A     E    33_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    34_A     Q    34_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    35_A     C    35_A    108  108  108     58  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    36_A     A    36_A    108  108  108     12  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    37_A     A    37_A    108  108  108     31  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    38_A     G    38_A    108  108  108     63  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    39_A     F    39_A    108  108  108     63  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    40_A     H    40_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    41_A     H    41_A    108  108  108     66  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    42_A     T    42_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    43_A     A    43_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    45_A     F    45_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    46_A     K    46_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    47_A     A    47_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    48_A     S    48_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    49_A     G    49_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    50_A     L    50_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    52_A     K    52_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    53_A     K    53_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    54_A     S    54_A    108  108  108     66  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    55_A     D    55_A    108  108  108     56  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    56_A     A    56_A    108  108  108     60  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_A     E    57_A    108  108  108     60  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    58_A     L    58_A    108  108  108     69  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    59_A     A    59_A    108  108  108     60  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    60_A     E    60_A    108  108  108     60  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    61_A     I    61_A    108  108  108     60  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    62_A     F    62_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    63_A     N    63_A    108  108  108     67  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    64_A     V    64_A    108  108  108     37  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    65_A     L    65_A    108  108  108     23  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    66_A     D    66_A    108  108  108     66  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    67_A     G    67_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    68_A     D    68_A    108  108  108     23  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    69_A     Q    69_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    70_A     S    70_A    108  108  108     71  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    71_A     G    71_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    72_A     Y    72_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    73_A     I    73_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    74_A     E    74_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    75_A     V    75_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    76_A     E    76_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    77_A     E    77_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    78_A     L    78_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_A     K    79_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    80_A     N    80_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    81_A     F    81_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    82_A     L    82_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    83_A     K    83_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    84_A     C    84_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    85_A     F    85_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    86_A     S    86_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    87_A     D    87_A    108  108  108     28  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    88_A     G    88_A    108  108  108     20   93  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    89_A     A    89_A    108  108  108     68  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    90_A     R    90_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    91_A     V    91_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_A     L    92_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    93_A     N    93_A    108  108  108     62  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    94_A     D    94_A    108  108  108     53  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    95_A     K    95_A    108  108  108     62  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    96_A     E    96_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    97_A     T    97_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    98_A     S    98_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    99_A     N    99_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L   101_A     L   101_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   103_A     A   103_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   105_A     D   105_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   106_A     S   106_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   107_A     D   107_A    108  108  108     50  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   108_A     G   108_A    108  108  108     67  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   109_A     D   109_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H   110_A     H   110_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   111_A     K   111_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   112_A     I   112_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   113_A     G   113_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   114_A     V   114_A    108  108  108     71  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   115_A     D   115_A    108  108  108     57  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   116_A     E   116_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   117_A     F   117_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   118_A     K   118_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   119_A     S   119_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   120_A     M   120_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   121_A     A   121_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   122_A     K   122_A    108  108  108     72  103  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   123_A     M   123_A    108  108  108      3   72  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T   124_A     T   124_A    108  108  108      3    4    6   32  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     72    103    105    107    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  66.67  95.37  97.22  99.07 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.33   0.49   0.52   0.61   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69
GDT RMS_ALL_AT   0.73   0.70   0.70   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    33_A      E    33_A
#   possible swapping detected:  F    39_A      F    39_A
#   possible swapping detected:  E    57_A      E    57_A
#   possible swapping detected:  E    60_A      E    60_A
#   possible swapping detected:  F    62_A      F    62_A
#   possible swapping detected:  E    74_A      E    74_A
#   possible swapping detected:  E    77_A      E    77_A
#   possible swapping detected:  F    81_A      F    81_A
#   possible swapping detected:  F    85_A      F    85_A
#   possible swapping detected:  E    96_A      E    96_A
#   possible swapping detected:  F   100_A      F   100_A
#   possible swapping detected:  E   116_A      E   116_A
#   possible swapping detected:  F   117_A      F   117_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S    17_A      S    17_A     2.488     0    0.610   0.770     4.606   69.048   60.794
LGA    K    18_A      K    18_A     2.126     0    0.091   0.158     5.913   73.095   53.069
LGA    I    19_A      I    19_A     0.327     0    0.060   0.624     1.551   97.619   89.643
LGA    T    20_A      T    20_A     0.664     0    0.037   0.067     1.320   95.238   90.612
LGA    S    21_A      S    21_A     0.482     0    0.099   0.665     2.851   97.619   89.683
LGA    I    22_A      I    22_A     0.187     0    0.062   0.119     0.649  100.000   97.619
LGA    L    23_A      L    23_A     0.404     0    0.027   0.079     0.604  100.000   95.238
LGA    N    24_A      N    24_A     0.543     0    0.046   0.577     2.429   95.238   89.643
LGA    P    25_A      P    25_A     0.472     0    0.019   0.125     0.725   97.619   94.558
LGA    A    26_A      A    26_A     0.266     0    0.020   0.019     0.339  100.000  100.000
LGA    D    27_A      D    27_A     0.448     0    0.014   0.163     1.063  100.000   94.107
LGA    I    28_A      I    28_A     0.549     0    0.034   0.074     0.732   95.238   92.857
LGA    T    29_A      T    29_A     0.343     0    0.041   0.067     0.671  100.000   97.279
LGA    K    30_A      K    30_A     0.284     0    0.078   0.740     4.080  100.000   75.344
LGA    A    31_A      A    31_A     0.481     0    0.032   0.043     0.607   97.619   96.190
LGA    L    32_A      L    32_A     0.471     0    0.024   0.065     0.830  100.000   95.238
LGA    E    33_A      E    33_A     0.165     0    0.020   1.016     4.316  100.000   81.958
LGA    Q    34_A      Q    34_A     0.295     0    0.034   0.612     2.364  100.000   88.889
LGA    C    35_A      C    35_A     0.731     0    0.086   0.098     1.781   88.214   84.524
LGA    A    36_A      A    36_A     0.922     0    0.025   0.025     1.206   88.214   88.667
LGA    A    37_A      A    37_A     0.975     0    0.122   0.132     1.568   83.810   85.143
LGA    G    38_A      G    38_A     0.602     0    0.038   0.038     0.682   90.476   90.476
LGA    F    39_A      F    39_A     0.649     0    0.044   0.102     0.712   90.476   93.074
LGA    H    40_A      H    40_A     0.431     0    0.080   0.152     0.894  100.000   96.190
LGA    H    41_A      H    41_A     0.527     0    0.049   0.151     0.584   92.857   95.238
LGA    T    42_A      T    42_A     0.404     0    0.056   0.158     0.892   97.619   97.279
LGA    A    43_A      A    43_A     0.375     0    0.030   0.036     0.426  100.000  100.000
LGA    F    44_A      F    44_A     0.233     0    0.025   0.138     0.540  100.000   99.134
LGA    F    45_A      F    45_A     0.263     0    0.057   0.555     1.812  100.000   92.468
LGA    K    46_A      K    46_A     0.411     0    0.070   0.166     2.365   97.619   87.831
LGA    A    47_A      A    47_A     0.376     0    0.031   0.035     0.485  100.000  100.000
LGA    S    48_A      S    48_A     0.325     0    0.024   0.044     0.470  100.000  100.000
LGA    G    49_A      G    49_A     0.444     0    0.037   0.037     0.444  100.000  100.000
LGA    L    50_A      L    50_A     0.324     0    0.034   0.116     0.604  100.000   98.810
LGA    S    51_A      S    51_A     0.441     0    0.067   0.070     0.718   95.238   93.651
LGA    K    52_A      K    52_A     0.522     0    0.056   0.671     2.915   95.238   85.185
LGA    K    53_A      K    53_A     0.318     0    0.025   0.475     1.599  100.000   92.910
LGA    S    54_A      S    54_A     0.546     0    0.007   0.028     0.608   92.857   93.651
LGA    D    55_A      D    55_A     0.894     0    0.121   0.924     2.961   90.476   81.845
LGA    A    56_A      A    56_A     0.855     0    0.077   0.084     0.855   90.476   90.476
LGA    E    57_A      E    57_A     0.624     0    0.022   0.164     0.728   90.476   94.709
LGA    L    58_A      L    58_A     0.447     0    0.009   0.043     0.525   97.619   98.810
LGA    A    59_A      A    59_A     0.591     0    0.011   0.012     0.608   90.476   90.476
LGA    E    60_A      E    60_A     0.661     0    0.017   0.082     1.041   90.476   89.471
LGA    I    61_A      I    61_A     0.539     0    0.016   0.617     1.596   95.238   90.655
LGA    F    62_A      F    62_A     0.331     0    0.053   0.097     0.415  100.000  100.000
LGA    N    63_A      N    63_A     0.494     0    0.116   0.256     0.865   95.238   94.048
LGA    V    64_A      V    64_A     0.801     0    0.012   1.196     3.578   90.476   81.156
LGA    L    65_A      L    65_A     0.706     0    0.074   0.109     0.940   90.476   91.667
LGA    D    66_A      D    66_A     0.536     0    0.067   0.072     0.686   95.238   97.619
LGA    G    67_A      G    67_A     0.508     0    0.020   0.020     0.606   90.476   90.476
LGA    D    68_A      D    68_A     0.664     0    0.111   0.116     1.005   92.857   90.536
LGA    Q    69_A      Q    69_A     0.501     0    0.063   1.248     4.220   90.476   78.254
LGA    S    70_A      S    70_A     0.662     0    0.018   0.021     0.757   90.476   90.476
LGA    G    71_A      G    71_A     0.538     0    0.068   0.068     0.538   92.857   92.857
LGA    Y    72_A      Y    72_A     0.462     0    0.011   0.158     1.471   97.619   90.635
LGA    I    73_A      I    73_A     0.324     0    0.027   0.059     0.405  100.000  100.000
LGA    E    74_A      E    74_A     0.127     0    0.051   0.868     3.151  100.000   86.667
LGA    V    75_A      V    75_A     0.330     0    0.038   1.084     2.715  100.000   88.639
LGA    E    76_A      E    76_A     0.430     0    0.023   0.574     1.622  100.000   90.794
LGA    E    77_A      E    77_A     0.369     0    0.019   0.240     0.793  100.000   97.884
LGA    L    78_A      L    78_A     0.172     0    0.032   0.059     0.301  100.000  100.000
LGA    K    79_A      K    79_A     0.474     0    0.050   1.098     4.921   95.238   76.878
LGA    N    80_A      N    80_A     0.572     0    0.083   0.084     0.858   95.238   92.857
LGA    F    81_A      F    81_A     0.443     0    0.049   0.119     0.524   97.619   99.134
LGA    L    82_A      L    82_A     0.387     0    0.021   0.099     0.779  100.000   96.429
LGA    K    83_A      K    83_A     0.261     0    0.062   0.593     1.855   97.619   93.810
LGA    C    84_A      C    84_A     0.285     0    0.050   0.104     0.745  100.000   98.413
LGA    F    85_A      F    85_A     0.399     0    0.026   0.086     0.577   97.619   97.403
LGA    S    86_A      S    86_A     0.503     0    0.021   0.031     0.612   95.238   93.651
LGA    D    87_A      D    87_A     0.839     0    0.067   0.817     2.112   88.214   82.798
LGA    G    88_A      G    88_A     1.234     0    0.042   0.042     1.480   83.690   83.690
LGA    A    89_A      A    89_A     0.653     0    0.071   0.072     0.767   90.476   90.476
LGA    R    90_A      R    90_A     0.492     0    0.032   0.100     0.641   95.238   95.671
LGA    V    91_A      V    91_A     0.610     0    0.028   0.104     1.120   95.238   91.905
LGA    L    92_A      L    92_A     0.472     0    0.011   0.057     0.646   95.238   97.619
LGA    N    93_A      N    93_A     0.742     0    0.062   0.228     0.909   92.857   91.667
LGA    D    94_A      D    94_A     0.880     0    0.018   0.146     1.062   90.476   89.345
LGA    K    95_A      K    95_A     0.790     0    0.038   0.086     1.610   92.857   86.561
LGA    E    96_A      E    96_A     0.443     0    0.021   0.136     0.594   97.619   97.884
LGA    T    97_A      T    97_A     0.392     0    0.024   0.049     0.559  100.000   97.279
LGA    S    98_A      S    98_A     0.446     0    0.036   0.080     0.669   97.619   96.825
LGA    N    99_A      N    99_A     0.487     0    0.028   0.128     0.745  100.000   96.429
LGA    F   100_A      F   100_A     0.294     0    0.020   0.073     0.461  100.000  100.000
LGA    L   101_A      L   101_A     0.263     0    0.078   0.104     0.311  100.000  100.000
LGA    A   102_A      A   102_A     0.421     0    0.114   0.113     0.726   97.619   96.190
LGA    A   103_A      A   103_A     0.375     0    0.108   0.108     0.502   97.619   98.095
LGA    G   104_A      G   104_A     0.238     0    0.084   0.084     0.297  100.000  100.000
LGA    D   105_A      D   105_A     0.315     0    0.049   0.215     1.157   97.619   94.107
LGA    S   106_A      S   106_A     0.337     0    0.011   0.592     2.203   95.238   90.952
LGA    D   107_A      D   107_A     0.844     0    0.100   0.111     1.390   88.214   88.214
LGA    G   108_A      G   108_A     0.672     0    0.072   0.072     0.672   95.238   95.238
LGA    D   109_A      D   109_A     0.226     0    0.063   0.148     0.614  100.000   97.619
LGA    H   110_A      H   110_A     0.204     0    0.025   1.160     2.614  100.000   85.000
LGA    K   111_A      K   111_A     0.152     0    0.063   0.190     2.118   97.619   90.847
LGA    I   112_A      I   112_A     0.425     0    0.040   0.080     0.715   97.619   97.619
LGA    G   113_A      G   113_A     0.496     0    0.071   0.071     0.496  100.000  100.000
LGA    V   114_A      V   114_A     0.476     0    0.061   0.073     0.521  100.000   98.639
LGA    D   115_A      D   115_A     0.575     0    0.043   0.130     1.478   95.238   89.464
LGA    E   116_A      E   116_A     0.442     0    0.083   0.123     0.713  100.000   98.942
LGA    F   117_A      F   117_A     0.483     0    0.016   0.047     0.504   97.619   99.134
LGA    K   118_A      K   118_A     0.359     0    0.026   0.277     1.332  100.000   96.878
LGA    S   119_A      S   119_A     0.350     0    0.058   0.065     0.540   97.619   98.413
LGA    M   120_A      M   120_A     0.448     0    0.016   0.216     0.797  100.000   96.429
LGA    A   121_A      A   121_A     0.214     0    0.012   0.023     0.318  100.000  100.000
LGA    K   122_A      K   122_A     0.032     0    0.040   0.802     4.430  100.000   79.048
LGA    M   123_A      M   123_A     1.263     0    0.060   0.808     6.452   73.452   60.476
LGA    T   124_A      T   124_A     3.425     0    0.087   1.111     6.859   52.024   42.245

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     820    820  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.691          0.683                  1.106           95.215   91.624

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  124  108    4.0    108    0.69    98.611    99.362    13.657

LGA_LOCAL      RMSD:   0.691  Number of atoms:  108  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.691  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.691  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.122203 * X  +  -0.986462 * Y  +  -0.109360 * Z  +  -1.926348
  Y_new =  -0.892340 * X  +   0.157439 * Y  +  -0.423015 * Z  +  -0.846671
  Z_new =   0.434506 * X  +   0.045893 * Y  +  -0.899499 * Z  +  10.064713 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -1.706896 -0.449490  3.090617   [DEG:  -97.7980  -25.7539  177.0793 ]
ZXZ: -0.252986  2.689418  1.465566   [DEG:  -14.4950  154.0923   83.9708 ]
 
# END of job
