
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  124 (  959),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  820),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.71     0.71
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.71     0.71
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.71     0.71
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S    17_A     S    17_A    108  108  108      5   16   85  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    18_A     K    18_A    108  108  108      7   39  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    20_A     T    20_A    108  108  108     48  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    21_A     S    21_A    108  108  108     55  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    22_A     I    22_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    23_A     L    23_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    24_A     N    24_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    25_A     P    25_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    26_A     A    26_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    27_A     D    27_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    28_A     I    28_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    30_A     K    30_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    32_A     L    32_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    33_A     E    33_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    34_A     Q    34_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    35_A     C    35_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    36_A     A    36_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    37_A     A    37_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    38_A     G    38_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    39_A     F    39_A    108  108  108     61  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    40_A     H    40_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    41_A     H    41_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    42_A     T    42_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    43_A     A    43_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    45_A     F    45_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    46_A     K    46_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    47_A     A    47_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    48_A     S    48_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    49_A     G    49_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    50_A     L    50_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    52_A     K    52_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    53_A     K    53_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    54_A     S    54_A    108  108  108     63  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    55_A     D    55_A    108  108  108     50  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    56_A     A    56_A    108  108  108     50  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_A     E    57_A    108  108  108     61  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    58_A     L    58_A    108  108  108     67  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    59_A     A    59_A    108  108  108     63  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    60_A     E    60_A    108  108  108     61  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    61_A     I    61_A    108  108  108     63  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    62_A     F    62_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    63_A     N    63_A    108  108  108     65  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    64_A     V    64_A    108  108  108     38  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    65_A     L    65_A    108  108  108     28  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    66_A     D    66_A    108  108  108     28  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    67_A     G    67_A    108  108  108     23  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    68_A     D    68_A    108  108  108     28  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    69_A     Q    69_A    108  108  108     28  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    70_A     S    70_A    108  108  108     28  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    71_A     G    71_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    72_A     Y    72_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    73_A     I    73_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    74_A     E    74_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    75_A     V    75_A    108  108  108     67  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    76_A     E    76_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    77_A     E    77_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    78_A     L    78_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_A     K    79_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    80_A     N    80_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    81_A     F    81_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    82_A     L    82_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    83_A     K    83_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    84_A     C    84_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    85_A     F    85_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    86_A     S    86_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    87_A     D    87_A    108  108  108     28  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    88_A     G    88_A    108  108  108     28   93  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    89_A     A    89_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    90_A     R    90_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    91_A     V    91_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_A     L    92_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    93_A     N    93_A    108  108  108     67  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    94_A     D    94_A    108  108  108     37  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    95_A     K    95_A    108  108  108     37  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    96_A     E    96_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    97_A     T    97_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    98_A     S    98_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    99_A     N    99_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L   101_A     L   101_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   103_A     A   103_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   105_A     D   105_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   106_A     S   106_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   107_A     D   107_A    108  108  108     52  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   108_A     G   108_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   109_A     D   109_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H   110_A     H   110_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   111_A     K   111_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   112_A     I   112_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   113_A     G   113_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   114_A     V   114_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   115_A     D   115_A    108  108  108     47  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   116_A     E   116_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   117_A     F   117_A    108  108  108     65  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   118_A     K   118_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   119_A     S   119_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   120_A     M   120_A    108  108  108     50  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   121_A     A   121_A    108  108  108     68  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   122_A     K   122_A    108  108  108     70  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   123_A     M   123_A    108  108  108     20   70  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T   124_A     T   124_A    108  108  108      4    5    6   16   87  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     70    103    105    107    107    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  64.81  95.37  97.22  99.07  99.07 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.35   0.51   0.54   0.62   0.62   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71
GDT RMS_ALL_AT   0.79   0.72   0.72   0.72   0.72   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    33_A      E    33_A
#   possible swapping detected:  F    39_A      F    39_A
#   possible swapping detected:  E    57_A      E    57_A
#   possible swapping detected:  F    62_A      F    62_A
#   possible swapping detected:  E    74_A      E    74_A
#   possible swapping detected:  E    77_A      E    77_A
#   possible swapping detected:  F    81_A      F    81_A
#   possible swapping detected:  F    85_A      F    85_A
#   possible swapping detected:  E    96_A      E    96_A
#   possible swapping detected:  F   100_A      F   100_A
#   possible swapping detected:  E   116_A      E   116_A
#   possible swapping detected:  F   117_A      F   117_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S    17_A      S    17_A     2.434     0    0.601   0.768     4.426   67.262   60.556
LGA    K    18_A      K    18_A     2.144     0    0.077   1.031     2.798   73.095   67.672
LGA    I    19_A      I    19_A     0.366     0    0.060   0.612     1.561   97.619   90.714
LGA    T    20_A      T    20_A     0.575     0    0.039   0.058     1.250   95.238   90.612
LGA    S    21_A      S    21_A     0.568     0    0.117   0.118     1.158   90.595   90.556
LGA    I    22_A      I    22_A     0.219     0    0.061   0.104     0.655  100.000   97.619
LGA    L    23_A      L    23_A     0.341     0    0.028   0.047     0.583  100.000   98.810
LGA    N    24_A      N    24_A     0.562     0    0.043   0.489     2.265   90.476   87.262
LGA    P    25_A      P    25_A     0.511     0    0.021   0.139     0.639   95.238   93.197
LGA    A    26_A      A    26_A     0.449     0    0.034   0.042     0.497  100.000  100.000
LGA    D    27_A      D    27_A     0.535     0    0.018   0.151     0.822   92.857   91.667
LGA    I    28_A      I    28_A     0.502     0    0.027   0.052     0.691   95.238   92.857
LGA    T    29_A      T    29_A     0.260     0    0.052   0.085     0.537  100.000   98.639
LGA    K    30_A      K    30_A     0.296     0    0.065   0.681     2.083   97.619   88.836
LGA    A    31_A      A    31_A     0.504     0    0.031   0.039     0.564   95.238   94.286
LGA    L    32_A      L    32_A     0.443     0    0.017   0.076     0.743  100.000   97.619
LGA    E    33_A      E    33_A     0.249     0    0.022   0.984     4.477  100.000   81.958
LGA    Q    34_A      Q    34_A     0.242     0    0.023   0.348     1.549  100.000   91.746
LGA    C    35_A      C    35_A     0.517     0    0.050   0.070     0.977   92.857   92.063
LGA    A    36_A      A    36_A     0.478     0    0.033   0.030     0.480  100.000  100.000
LGA    A    37_A      A    37_A     0.486     0    0.095   0.105     0.845   95.238   94.286
LGA    G    38_A      G    38_A     0.560     0    0.058   0.058     0.659   90.476   90.476
LGA    F    39_A      F    39_A     0.631     0    0.046   0.127     0.681   90.476   93.074
LGA    H    40_A      H    40_A     0.392     0    0.082   0.127     0.707  100.000   97.143
LGA    H    41_A      H    41_A     0.461     0    0.048   0.128     0.498  100.000  100.000
LGA    T    42_A      T    42_A     0.354     0    0.026   0.099     0.697   97.619   97.279
LGA    A    43_A      A    43_A     0.275     0    0.039   0.046     0.384  100.000  100.000
LGA    F    44_A      F    44_A     0.222     0    0.022   0.126     0.470  100.000  100.000
LGA    F    45_A      F    45_A     0.272     0    0.050   0.519     1.729  100.000   92.468
LGA    K    46_A      K    46_A     0.314     0    0.048   0.845     5.119  100.000   76.349
LGA    A    47_A      A    47_A     0.231     0    0.020   0.025     0.400  100.000  100.000
LGA    S    48_A      S    48_A     0.272     0    0.040   0.053     0.320  100.000  100.000
LGA    G    49_A      G    49_A     0.321     0    0.039   0.039     0.321  100.000  100.000
LGA    L    50_A      L    50_A     0.166     0    0.039   0.093     0.381  100.000  100.000
LGA    S    51_A      S    51_A     0.344     0    0.050   0.051     0.633   97.619   96.825
LGA    K    52_A      K    52_A     0.455     0    0.044   0.664     2.364  100.000   92.169
LGA    K    53_A      K    53_A     0.338     0    0.031   0.525     1.750  100.000   93.968
LGA    S    54_A      S    54_A     0.555     0    0.007   0.022     0.599   92.857   92.063
LGA    D    55_A      D    55_A     0.810     0    0.114   0.901     2.954   90.476   82.976
LGA    A    56_A      A    56_A     0.797     0    0.066   0.074     0.805   90.476   90.476
LGA    E    57_A      E    57_A     0.598     0    0.023   0.148     0.694   90.476   93.651
LGA    L    58_A      L    58_A     0.376     0    0.010   0.047     0.471  100.000  100.000
LGA    A    59_A      A    59_A     0.477     0    0.011   0.014     0.486  100.000  100.000
LGA    E    60_A      E    60_A     0.576     0    0.029   0.480     1.751   90.476   87.513
LGA    I    61_A      I    61_A     0.466     0    0.024   0.594     1.541  100.000   94.226
LGA    F    62_A      F    62_A     0.242     0    0.053   0.090     0.355  100.000  100.000
LGA    N    63_A      N    63_A     0.452     0    0.098   0.260     0.837  100.000   98.810
LGA    V    64_A      V    64_A     0.822     0    0.015   1.208     3.638   90.476   81.156
LGA    L    65_A      L    65_A     0.817     0    0.071   0.122     1.055   90.476   90.536
LGA    D    66_A      D    66_A     0.744     0    0.043   0.064     0.841   90.476   90.476
LGA    G    67_A      G    67_A     0.674     0    0.027   0.027     0.799   90.476   90.476
LGA    D    68_A      D    68_A     0.841     0    0.100   0.125     1.058   92.857   90.536
LGA    Q    69_A      Q    69_A     0.692     0    0.066   1.213     4.146   90.476   76.455
LGA    S    70_A      S    70_A     0.810     0    0.019   0.020     0.924   90.476   90.476
LGA    G    71_A      G    71_A     0.472     0    0.075   0.075     0.542   95.238   95.238
LGA    Y    72_A      Y    72_A     0.514     0    0.019   0.158     1.274   90.476   89.008
LGA    I    73_A      I    73_A     0.437     0    0.028   0.050     0.496  100.000  100.000
LGA    E    74_A      E    74_A     0.214     0    0.059   0.823     3.067  100.000   86.455
LGA    V    75_A      V    75_A     0.539     0    0.045   1.101     3.070   97.619   87.483
LGA    E    76_A      E    76_A     0.692     0    0.026   0.559     1.295   90.476   90.529
LGA    E    77_A      E    77_A     0.497     0    0.024   0.113     0.581   97.619   96.825
LGA    L    78_A      L    78_A     0.108     0    0.045   1.317     2.947  100.000   87.917
LGA    K    79_A      K    79_A     0.630     0    0.050   1.108     5.016   92.857   75.238
LGA    N    80_A      N    80_A     0.670     0    0.093   0.122     1.248   95.238   90.595
LGA    F    81_A      F    81_A     0.379     0    0.049   0.116     0.497  100.000  100.000
LGA    L    82_A      L    82_A     0.357     0    0.027   0.107     0.742  100.000   96.429
LGA    K    83_A      K    83_A     0.347     0    0.064   0.636     2.060   97.619   92.910
LGA    C    84_A      C    84_A     0.357     0    0.027   0.090     0.636  100.000   98.413
LGA    F    85_A      F    85_A     0.424     0    0.026   0.087     0.638   97.619   97.403
LGA    S    86_A      S    86_A     0.510     0    0.021   0.056     0.546   95.238   93.651
LGA    D    87_A      D    87_A     0.944     0    0.023   1.106     3.315   85.952   78.690
LGA    G    88_A      G    88_A     1.316     0    0.029   0.029     1.421   81.429   81.429
LGA    A    89_A      A    89_A     0.564     0    0.071   0.072     0.741   95.238   94.286
LGA    R    90_A      R    90_A     0.358     0    0.031   0.085     0.508  100.000   99.134
LGA    V    91_A      V    91_A     0.601     0    0.029   0.097     0.996   92.857   91.837
LGA    L    92_A      L    92_A     0.554     0    0.015   0.057     0.738   90.476   92.857
LGA    N    93_A      N    93_A     0.819     0    0.043   0.175     0.968   90.476   90.476
LGA    D    94_A      D    94_A     0.923     0    0.025   0.073     0.984   90.476   90.476
LGA    K    95_A      K    95_A     0.864     0    0.032   0.088     1.560   90.476   84.497
LGA    E    96_A      E    96_A     0.539     0    0.026   0.129     0.621   92.857   94.709
LGA    T    97_A      T    97_A     0.521     0    0.033   0.078     0.569   92.857   91.837
LGA    S    98_A      S    98_A     0.606     0    0.036   0.085     0.816   90.476   90.476
LGA    N    99_A      N    99_A     0.632     0    0.030   0.067     0.849   90.476   90.476
LGA    F   100_A      F   100_A     0.471     0    0.024   0.109     0.689   97.619   96.537
LGA    L   101_A      L   101_A     0.437     0    0.076   0.085     0.539  100.000   98.810
LGA    A   102_A      A   102_A     0.616     0    0.102   0.101     0.898   90.476   90.476
LGA    A   103_A      A   103_A     0.570     0    0.124   0.125     0.672   95.238   94.286
LGA    G   104_A      G   104_A     0.414     0    0.055   0.055     0.457  100.000  100.000
LGA    D   105_A      D   105_A     0.466     0    0.045   0.222     1.231  100.000   95.298
LGA    S   106_A      S   106_A     0.207     0    0.006   0.092     0.572   97.619   98.413
LGA    D   107_A      D   107_A     0.725     0    0.097   0.105     1.220   88.214   88.214
LGA    G   108_A      G   108_A     0.406     0    0.024   0.024     0.514   97.619   97.619
LGA    D   109_A      D   109_A     0.468     0    0.063   0.149     0.669   95.238   95.238
LGA    H   110_A      H   110_A     0.534     0    0.024   0.936     2.211   97.619   88.190
LGA    K   111_A      K   111_A     0.294     0    0.064   0.176     1.912   97.619   91.746
LGA    I   112_A      I   112_A     0.500     0    0.043   0.041     0.645   95.238   92.857
LGA    G   113_A      G   113_A     0.559     0    0.071   0.071     0.559   92.857   92.857
LGA    V   114_A      V   114_A     0.446     0    0.061   0.060     0.468  100.000  100.000
LGA    D   115_A      D   115_A     0.603     0    0.033   0.139     1.514   90.476   86.012
LGA    E   116_A      E   116_A     0.455     0    0.100   0.138     0.778  100.000   96.825
LGA    F   117_A      F   117_A     0.515     0    0.022   0.072     0.529   95.238   97.403
LGA    K   118_A      K   118_A     0.381     0    0.030   0.214     1.044  100.000   94.762
LGA    S   119_A      S   119_A     0.432     0    0.070   0.653     2.685   97.619   89.683
LGA    M   120_A      M   120_A     0.605     0    0.021   1.097     2.845   90.476   82.976
LGA    A   121_A      A   121_A     0.368     0    0.034   0.046     0.450  100.000  100.000
LGA    K   122_A      K   122_A     0.160     0    0.056   0.819     4.531   97.619   78.413
LGA    M   123_A      M   123_A     1.334     0    0.057   0.858     7.067   71.667   56.964
LGA    T   124_A      T   124_A     3.645     0    0.199   1.275     7.330   46.786   40.816

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     820    820  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.714          0.701                  1.088           94.579   91.428

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  124  108    4.0    108    0.71    98.611    99.301    13.272

LGA_LOCAL      RMSD:   0.714  Number of atoms:  108  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.714  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.714  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.600536 * X  +   0.141297 * Y  +  -0.787014 * Z  +   1.238789
  Y_new =  -0.371417 * X  +  -0.822340 * Y  +  -0.431052 * Z  +  -1.753525
  Z_new =  -0.708100 * X  +   0.551173 * Y  +  -0.441365 * Z  +   9.779307 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -0.553894  0.786804  2.246009   [DEG:  -31.7358   45.0805  128.6868 ]
ZXZ: -1.069717  2.027915 -0.909376   [DEG:  -61.2903  116.1910  -52.1034 ]
 
# END of job
