
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  124 (  959),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  820),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.72     0.72
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.72     0.72
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.72     0.72
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S    17_A     S    17_A    108  108  108      6   29   75  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    18_A     K    18_A    108  108  108      9   43  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    20_A     T    20_A    108  108  108     16  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    21_A     S    21_A    108  108  108     52  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    22_A     I    22_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    23_A     L    23_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    24_A     N    24_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    25_A     P    25_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    26_A     A    26_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    27_A     D    27_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    28_A     I    28_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    30_A     K    30_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    32_A     L    32_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    33_A     E    33_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    34_A     Q    34_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    35_A     C    35_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    36_A     A    36_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    37_A     A    37_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    38_A     G    38_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    39_A     F    39_A    108  108  108     65  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    40_A     H    40_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    41_A     H    41_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    42_A     T    42_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    43_A     A    43_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    45_A     F    45_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    46_A     K    46_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    47_A     A    47_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    48_A     S    48_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    49_A     G    49_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    50_A     L    50_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    52_A     K    52_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    53_A     K    53_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    54_A     S    54_A    108  108  108     65  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    55_A     D    55_A    108  108  108     53  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    56_A     A    56_A    108  108  108     53  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_A     E    57_A    108  108  108     53  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    58_A     L    58_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    59_A     A    59_A    108  108  108     69  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    60_A     E    60_A    108  108  108     57  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    61_A     I    61_A    108  108  108     69  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    62_A     F    62_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    63_A     N    63_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    64_A     V    64_A    108  108  108     38  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    65_A     L    65_A    108  108  108     23  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    66_A     D    66_A    108  108  108     23  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    67_A     G    67_A    108  108  108     16  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    68_A     D    68_A    108  108  108     23  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    69_A     Q    69_A    108  108  108     45  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    70_A     S    70_A    108  108  108     17  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    71_A     G    71_A    108  108  108     69  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    72_A     Y    72_A    108  108  108     70  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    73_A     I    73_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    74_A     E    74_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    75_A     V    75_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    76_A     E    76_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    77_A     E    77_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    78_A     L    78_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_A     K    79_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    80_A     N    80_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    81_A     F    81_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    82_A     L    82_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    83_A     K    83_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    84_A     C    84_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    85_A     F    85_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    86_A     S    86_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    87_A     D    87_A    108  108  108     56  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    88_A     G    88_A    108  108  108     39  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    89_A     A    89_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    90_A     R    90_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    91_A     V    91_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_A     L    92_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    93_A     N    93_A    108  108  108     54  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    94_A     D    94_A    108  108  108     54  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    95_A     K    95_A    108  108  108     64  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    96_A     E    96_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    97_A     T    97_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    98_A     S    98_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    99_A     N    99_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L   101_A     L   101_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   103_A     A   103_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   105_A     D   105_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   106_A     S   106_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   107_A     D   107_A    108  108  108     58  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   108_A     G   108_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   109_A     D   109_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H   110_A     H   110_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   111_A     K   111_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   112_A     I   112_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   113_A     G   113_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   114_A     V   114_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   115_A     D   115_A    108  108  108     37  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   116_A     E   116_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   117_A     F   117_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   118_A     K   118_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   119_A     S   119_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   120_A     M   120_A    108  108  108     57  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   121_A     A   121_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   122_A     K   122_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   123_A     M   123_A    108  108  108     17   39  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T   124_A     T   124_A    108  108  108      3    3    3   17   78  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     72    104    105    107    107    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  66.67  96.30  97.22  99.07  99.07 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.36   0.51   0.53   0.62   0.62   0.72   0.72   0.72   0.72   0.72   0.72   0.72   0.72   0.72   0.72   0.72   0.72   0.72   0.72   0.72
GDT RMS_ALL_AT   0.74   0.72   0.72   0.72   0.72   0.72   0.72   0.72   0.72   0.72   0.72   0.72   0.72   0.72   0.72   0.72   0.72   0.72   0.72   0.72

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    33_A      E    33_A
#   possible swapping detected:  F    39_A      F    39_A
#   possible swapping detected:  E    57_A      E    57_A
#   possible swapping detected:  F    62_A      F    62_A
#   possible swapping detected:  E    74_A      E    74_A
#   possible swapping detected:  E    77_A      E    77_A
#   possible swapping detected:  F    81_A      F    81_A
#   possible swapping detected:  F    85_A      F    85_A
#   possible swapping detected:  E    96_A      E    96_A
#   possible swapping detected:  F   100_A      F   100_A
#   possible swapping detected:  E   116_A      E   116_A
#   possible swapping detected:  F   117_A      F   117_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S    17_A      S    17_A     2.511     0    0.570   0.913     4.627   63.333   56.984
LGA    K    18_A      K    18_A     2.109     0    0.092   0.810     2.687   73.095   68.519
LGA    I    19_A      I    19_A     0.420     0    0.058   0.630     1.638   97.619   88.512
LGA    T    20_A      T    20_A     0.759     0    0.043   0.061     1.365   90.476   86.599
LGA    S    21_A      S    21_A     0.665     0    0.110   0.111     1.101   90.476   87.460
LGA    I    22_A      I    22_A     0.313     0    0.038   0.090     0.883  100.000   96.429
LGA    L    23_A      L    23_A     0.411     0    0.020   0.034     0.751  100.000   95.238
LGA    N    24_A      N    24_A     0.719     0    0.039   0.356     1.995   90.476   87.143
LGA    P    25_A      P    25_A     0.663     0    0.009   0.137     0.764   90.476   90.476
LGA    A    26_A      A    26_A     0.532     0    0.023   0.028     0.586   92.857   92.381
LGA    D    27_A      D    27_A     0.597     0    0.017   0.073     0.851   90.476   90.476
LGA    I    28_A      I    28_A     0.580     0    0.033   0.091     0.771   95.238   92.857
LGA    T    29_A      T    29_A     0.289     0    0.040   0.072     0.469  100.000  100.000
LGA    K    30_A      K    30_A     0.277     0    0.073   0.690     2.285   97.619   87.831
LGA    A    31_A      A    31_A     0.511     0    0.033   0.042     0.610   95.238   94.286
LGA    L    32_A      L    32_A     0.480     0    0.015   0.061     0.830  100.000   95.238
LGA    E    33_A      E    33_A     0.237     0    0.026   0.971     4.312  100.000   81.958
LGA    Q    34_A      Q    34_A     0.129     0    0.020   0.393     1.678  100.000   92.804
LGA    C    35_A      C    35_A     0.480     0    0.047   0.077     0.981   95.238   93.651
LGA    A    36_A      A    36_A     0.575     0    0.029   0.027     0.629   92.857   92.381
LGA    A    37_A      A    37_A     0.476     0    0.132   0.142     0.984   92.857   92.381
LGA    G    38_A      G    38_A     0.493     0    0.056   0.056     0.646   95.238   95.238
LGA    F    39_A      F    39_A     0.607     0    0.049   0.086     0.629   90.476   93.074
LGA    H    40_A      H    40_A     0.343     0    0.093   0.152     0.636  100.000   97.143
LGA    H    41_A      H    41_A     0.407     0    0.053   0.190     0.833  100.000   97.143
LGA    T    42_A      T    42_A     0.421     0    0.032   0.127     0.802  100.000   97.279
LGA    A    43_A      A    43_A     0.417     0    0.038   0.045     0.501   97.619   98.095
LGA    F    44_A      F    44_A     0.260     0    0.035   0.132     0.542  100.000   98.268
LGA    F    45_A      F    45_A     0.273     0    0.033   0.486     1.711  100.000   92.468
LGA    K    46_A      K    46_A     0.365     0    0.049   0.753     5.018   97.619   74.444
LGA    A    47_A      A    47_A     0.337     0    0.018   0.024     0.492  100.000  100.000
LGA    S    48_A      S    48_A     0.286     0    0.059   0.084     0.401  100.000  100.000
LGA    G    49_A      G    49_A     0.372     0    0.033   0.033     0.372  100.000  100.000
LGA    L    50_A      L    50_A     0.255     0    0.048   0.104     0.523  100.000   98.810
LGA    S    51_A      S    51_A     0.432     0    0.077   0.134     0.697   95.238   93.651
LGA    K    52_A      K    52_A     0.485     0    0.060   0.660     2.540   97.619   90.265
LGA    K    53_A      K    53_A     0.329     0    0.021   0.366     1.774   97.619   92.804
LGA    S    54_A      S    54_A     0.598     0    0.014   0.023     0.633   92.857   92.063
LGA    D    55_A      D    55_A     0.826     0    0.126   0.906     3.062   90.476   79.940
LGA    A    56_A      A    56_A     0.792     0    0.067   0.073     0.792   90.476   90.476
LGA    E    57_A      E    57_A     0.614     0    0.021   0.146     0.714   92.857   93.651
LGA    L    58_A      L    58_A     0.378     0    0.012   0.052     0.479  100.000  100.000
LGA    A    59_A      A    59_A     0.470     0    0.014   0.014     0.476  100.000  100.000
LGA    E    60_A      E    60_A     0.560     0    0.028   0.596     2.158   90.476   85.608
LGA    I    61_A      I    61_A     0.457     0    0.019   0.611     1.575  100.000   94.226
LGA    F    62_A      F    62_A     0.218     0    0.050   0.081     0.366  100.000  100.000
LGA    N    63_A      N    63_A     0.421     0    0.110   0.248     0.723  100.000   98.810
LGA    V    64_A      V    64_A     0.800     0    0.011   1.209     3.606   90.476   81.156
LGA    L    65_A      L    65_A     0.838     0    0.060   0.100     0.963   90.476   91.667
LGA    D    66_A      D    66_A     0.804     0    0.036   0.066     0.871   90.476   90.476
LGA    G    67_A      G    67_A     0.763     0    0.021   0.021     0.889   90.476   90.476
LGA    D    68_A      D    68_A     0.964     0    0.100   0.115     1.160   90.476   85.952
LGA    Q    69_A      Q    69_A     0.741     0    0.067   1.244     4.390   90.476   77.989
LGA    S    70_A      S    70_A     0.898     0    0.017   0.022     0.978   90.476   90.476
LGA    G    71_A      G    71_A     0.597     0    0.073   0.073     0.650   90.476   90.476
LGA    Y    72_A      Y    72_A     0.539     0    0.026   0.139     1.349   90.476   88.214
LGA    I    73_A      I    73_A     0.349     0    0.027   0.057     0.447  100.000  100.000
LGA    E    74_A      E    74_A     0.133     0    0.060   0.862     3.457  100.000   87.513
LGA    V    75_A      V    75_A     0.527     0    0.040   1.105     3.034   97.619   87.483
LGA    E    76_A      E    76_A     0.670     0    0.019   0.563     1.168   90.476   89.471
LGA    E    77_A      E    77_A     0.470     0    0.030   0.108     0.491  100.000  100.000
LGA    L    78_A      L    78_A     0.089     0    0.040   1.242     2.818  100.000   87.917
LGA    K    79_A      K    79_A     0.544     0    0.047   1.088     4.774   92.857   75.820
LGA    N    80_A      N    80_A     0.553     0    0.061   0.100     0.957   95.238   92.857
LGA    F    81_A      F    81_A     0.373     0    0.049   0.103     0.449  100.000  100.000
LGA    L    82_A      L    82_A     0.351     0    0.026   0.088     0.775  100.000   96.429
LGA    K    83_A      K    83_A     0.279     0    0.062   0.524     1.464   97.619   94.762
LGA    C    84_A      C    84_A     0.313     0    0.019   0.083     0.664  100.000   98.413
LGA    F    85_A      F    85_A     0.384     0    0.026   0.098     0.666   97.619   97.403
LGA    S    86_A      S    86_A     0.431     0    0.017   0.020     0.495  100.000  100.000
LGA    D    87_A      D    87_A     0.722     0    0.068   1.136     3.138   90.476   83.155
LGA    G    88_A      G    88_A     1.076     0    0.040   0.040     1.287   85.952   85.952
LGA    A    89_A      A    89_A     0.510     0    0.066   0.065     0.614   95.238   96.190
LGA    R    90_A      R    90_A     0.392     0    0.043   0.103     0.537  100.000   99.134
LGA    V    91_A      V    91_A     0.498     0    0.033   0.088     0.952   97.619   94.558
LGA    L    92_A      L    92_A     0.472     0    0.015   0.061     0.671   95.238   97.619
LGA    N    93_A      N    93_A     0.753     0    0.064   0.202     0.921   92.857   91.667
LGA    D    94_A      D    94_A     0.893     0    0.017   0.108     1.065   90.476   89.345
LGA    K    95_A      K    95_A     0.798     0    0.041   0.095     1.621   92.857   86.561
LGA    E    96_A      E    96_A     0.495     0    0.021   0.095     0.578   97.619   97.884
LGA    T    97_A      T    97_A     0.474     0    0.026   0.035     0.615  100.000   95.918
LGA    S    98_A      S    98_A     0.520     0    0.034   0.071     0.709   95.238   93.651
LGA    N    99_A      N    99_A     0.539     0    0.029   0.056     0.738   95.238   92.857
LGA    F   100_A      F   100_A     0.391     0    0.023   0.049     0.467  100.000  100.000
LGA    L   101_A      L   101_A     0.386     0    0.073   0.081     0.576  100.000   98.810
LGA    A   102_A      A   102_A     0.573     0    0.102   0.102     0.856   90.476   90.476
LGA    A   103_A      A   103_A     0.510     0    0.122   0.123     0.591   95.238   94.286
LGA    G   104_A      G   104_A     0.390     0    0.047   0.047     0.415  100.000  100.000
LGA    D   105_A      D   105_A     0.480     0    0.031   0.233     1.292  100.000   94.107
LGA    S   106_A      S   106_A     0.185     0    0.016   0.085     0.528   97.619   98.413
LGA    D   107_A      D   107_A     0.635     0    0.095   0.126     1.135   90.595   89.405
LGA    G   108_A      G   108_A     0.425     0    0.057   0.057     0.489  100.000  100.000
LGA    D   109_A      D   109_A     0.337     0    0.067   0.147     0.607  100.000   98.810
LGA    H   110_A      H   110_A     0.409     0    0.041   0.266     1.049  100.000   96.238
LGA    K   111_A      K   111_A     0.133     0    0.077   0.184     1.767   97.619   92.804
LGA    I   112_A      I   112_A     0.398     0    0.047   0.085     0.757   97.619   97.619
LGA    G   113_A      G   113_A     0.464     0    0.071   0.071     0.464  100.000  100.000
LGA    V   114_A      V   114_A     0.428     0    0.061   0.066     0.472  100.000  100.000
LGA    D   115_A      D   115_A     0.597     0    0.037   0.126     1.625   95.238   87.321
LGA    E   116_A      E   116_A     0.367     0    0.107   0.152     0.709  100.000   98.942
LGA    F   117_A      F   117_A     0.459     0    0.025   0.061     0.491  100.000  100.000
LGA    K   118_A      K   118_A     0.363     0    0.033   0.270     1.237  100.000   95.820
LGA    S   119_A      S   119_A     0.373     0    0.062   0.650     2.519   97.619   91.270
LGA    M   120_A      M   120_A     0.525     0    0.016   1.107     2.898   95.238   85.357
LGA    A   121_A      A   121_A     0.382     0    0.018   0.031     0.489  100.000  100.000
LGA    K   122_A      K   122_A     0.083     0    0.033   0.782     4.010  100.000   80.847
LGA    M   123_A      M   123_A     1.522     0    0.038   0.339     5.180   69.524   56.964
LGA    T   124_A      T   124_A     3.732     0    0.167   0.201     6.063   50.119   37.891

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     820    820  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.715          0.697                  1.070           95.077   91.684

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  124  108    4.0    108    0.72    98.843    99.375    13.250

LGA_LOCAL      RMSD:   0.715  Number of atoms:  108  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.715  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.715  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.023063 * X  +  -0.827860 * Y  +  -0.560460 * Z  +   0.293349
  Y_new =   0.977487 * X  +  -0.136281 * Y  +   0.161078 * Z  +  -0.218096
  Z_new =  -0.209731 * X  +  -0.544128 * Y  +   0.812366 * Z  +   9.056453 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  1.594386  0.211299 -0.590173   [DEG:   91.3516   12.1066  -33.8144 ]
ZXZ: -1.850657  0.622599 -2.773698   [DEG: -106.0349   35.6723 -158.9212 ]
 
# END of job
