
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  124 (  959),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  820),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.73     0.73
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.73     0.73
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.73     0.73
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S    17_A     S    17_A    108  108  108      5   15   82  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    18_A     K    18_A    108  108  108     13   40  101  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A    108  108  108     65  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    20_A     T    20_A    108  108  108     32  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    21_A     S    21_A    108  108  108     52  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    22_A     I    22_A    108  108  108     65  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    23_A     L    23_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    24_A     N    24_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    25_A     P    25_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    26_A     A    26_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    27_A     D    27_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    28_A     I    28_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    30_A     K    30_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    32_A     L    32_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    33_A     E    33_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    34_A     Q    34_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    35_A     C    35_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    36_A     A    36_A    108  108  108     39  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    37_A     A    37_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    38_A     G    38_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    39_A     F    39_A    108  108  108     60  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    40_A     H    40_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    41_A     H    41_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    42_A     T    42_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    43_A     A    43_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    45_A     F    45_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    46_A     K    46_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    47_A     A    47_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    48_A     S    48_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    49_A     G    49_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    50_A     L    50_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    52_A     K    52_A    108  108  108     65  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    53_A     K    53_A    108  108  108     65  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    54_A     S    54_A    108  108  108     60  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    55_A     D    55_A    108  108  108     53  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    56_A     A    56_A    108  108  108     53  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_A     E    57_A    108  108  108     53  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    58_A     L    58_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    59_A     A    59_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    60_A     E    60_A    108  108  108     60  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    61_A     I    61_A    108  108  108     62  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    62_A     F    62_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    63_A     N    63_A    108  108  108     64  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    64_A     V    64_A    108  108  108     39  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    65_A     L    65_A    108  108  108     27  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    66_A     D    66_A    108  108  108     27  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    67_A     G    67_A    108  108  108     27  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    68_A     D    68_A    108  108  108     27  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    69_A     Q    69_A    108  108  108     49  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    70_A     S    70_A    108  108  108     27  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    71_A     G    71_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    72_A     Y    72_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    73_A     I    73_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    74_A     E    74_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    75_A     V    75_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    76_A     E    76_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    77_A     E    77_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    78_A     L    78_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_A     K    79_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    80_A     N    80_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    81_A     F    81_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    82_A     L    82_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    83_A     K    83_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    84_A     C    84_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    85_A     F    85_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    86_A     S    86_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    87_A     D    87_A    108  108  108     43  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    88_A     G    88_A    108  108  108     25  100  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    89_A     A    89_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    90_A     R    90_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    91_A     V    91_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_A     L    92_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    93_A     N    93_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    94_A     D    94_A    108  108  108     58  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    95_A     K    95_A    108  108  108     58  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    96_A     E    96_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    97_A     T    97_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    98_A     S    98_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    99_A     N    99_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L   101_A     L   101_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   103_A     A   103_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   105_A     D   105_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   106_A     S   106_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   107_A     D   107_A    108  108  108     34  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   108_A     G   108_A    108  108  108     61  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   109_A     D   109_A    108  108  108     58  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H   110_A     H   110_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   111_A     K   111_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   112_A     I   112_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   113_A     G   113_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   114_A     V   114_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   115_A     D   115_A    108  108  108     49  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   116_A     E   116_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   117_A     F   117_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   118_A     K   118_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   119_A     S   119_A    108  108  108     69  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   120_A     M   120_A    108  108  108     49  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   121_A     A   121_A    108  108  108     63  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   122_A     K   122_A    108  108  108     67  103  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   123_A     M   123_A    108  108  108     12   65  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T   124_A     T   124_A    108  108  108      3    5    7   16   84  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     69    103    105    107    107    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  63.89  95.37  97.22  99.07  99.07 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.35   0.52   0.55   0.64   0.64   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73
GDT RMS_ALL_AT   0.81   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    33_A      E    33_A
#   possible swapping detected:  F    39_A      F    39_A
#   possible swapping detected:  E    57_A      E    57_A
#   possible swapping detected:  E    60_A      E    60_A
#   possible swapping detected:  F    62_A      F    62_A
#   possible swapping detected:  E    74_A      E    74_A
#   possible swapping detected:  E    77_A      E    77_A
#   possible swapping detected:  F    81_A      F    81_A
#   possible swapping detected:  F    85_A      F    85_A
#   possible swapping detected:  E    96_A      E    96_A
#   possible swapping detected:  F   100_A      F   100_A
#   possible swapping detected:  E   116_A      E   116_A
#   possible swapping detected:  F   117_A      F   117_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S    17_A      S    17_A     2.528     0    0.578   0.536     3.366   63.333   60.079
LGA    K    18_A      K    18_A     2.128     0    0.077   0.179     5.941   73.095   53.069
LGA    I    19_A      I    19_A     0.399     0    0.059   0.617     1.605   97.619   89.583
LGA    T    20_A      T    20_A     0.712     0    0.038   0.059     1.258   90.476   86.599
LGA    S    21_A      S    21_A     0.605     0    0.098   0.106     0.998   90.476   90.476
LGA    I    22_A      I    22_A     0.261     0    0.024   0.078     0.833  100.000   96.429
LGA    L    23_A      L    23_A     0.421     0    0.022   0.035     0.695  100.000   95.238
LGA    N    24_A      N    24_A     0.687     0    0.044   0.481     2.304   90.476   86.131
LGA    P    25_A      P    25_A     0.620     0    0.011   0.138     0.773   92.857   91.837
LGA    A    26_A      A    26_A     0.472     0    0.023   0.028     0.529   97.619   98.095
LGA    D    27_A      D    27_A     0.557     0    0.017   0.114     0.809   90.476   90.476
LGA    I    28_A      I    28_A     0.568     0    0.032   0.086     0.732   95.238   92.857
LGA    T    29_A      T    29_A     0.300     0    0.040   0.065     0.479  100.000  100.000
LGA    K    30_A      K    30_A     0.261     0    0.049   0.669     2.130   97.619   88.836
LGA    A    31_A      A    31_A     0.506     0    0.030   0.039     0.599   95.238   94.286
LGA    L    32_A      L    32_A     0.463     0    0.017   0.060     0.829  100.000   95.238
LGA    E    33_A      E    33_A     0.206     0    0.022   0.975     4.285  100.000   81.958
LGA    Q    34_A      Q    34_A     0.194     0    0.033   0.192     1.351  100.000   91.693
LGA    C    35_A      C    35_A     0.571     0    0.054   0.075     1.161   92.857   90.556
LGA    A    36_A      A    36_A     0.694     0    0.030   0.028     0.771   90.476   90.476
LGA    A    37_A      A    37_A     0.600     0    0.101   0.111     1.060   88.214   88.667
LGA    G    38_A      G    38_A     0.521     0    0.060   0.060     0.686   90.476   90.476
LGA    F    39_A      F    39_A     0.616     0    0.046   0.115     0.645   90.476   93.074
LGA    H    40_A      H    40_A     0.328     0    0.090   0.132     0.664  100.000   97.143
LGA    H    41_A      H    41_A     0.438     0    0.049   0.159     0.690  100.000   98.095
LGA    T    42_A      T    42_A     0.430     0    0.026   0.103     0.818   97.619   95.918
LGA    A    43_A      A    43_A     0.331     0    0.039   0.046     0.425  100.000  100.000
LGA    F    44_A      F    44_A     0.210     0    0.021   0.148     0.539  100.000   98.268
LGA    F    45_A      F    45_A     0.245     0    0.051   0.463     1.532  100.000   93.247
LGA    K    46_A      K    46_A     0.338     0    0.057   0.859     5.203   97.619   75.291
LGA    A    47_A      A    47_A     0.289     0    0.022   0.028     0.451  100.000  100.000
LGA    S    48_A      S    48_A     0.287     0    0.051   0.062     0.394  100.000  100.000
LGA    G    49_A      G    49_A     0.384     0    0.039   0.039     0.384  100.000  100.000
LGA    L    50_A      L    50_A     0.217     0    0.036   0.089     0.461  100.000  100.000
LGA    S    51_A      S    51_A     0.367     0    0.043   0.045     0.609   97.619   96.825
LGA    K    52_A      K    52_A     0.430     0    0.053   0.655     2.425  100.000   92.169
LGA    K    53_A      K    53_A     0.287     0    0.026   0.258     1.401  100.000   95.820
LGA    S    54_A      S    54_A     0.539     0    0.008   0.025     0.592   95.238   93.651
LGA    D    55_A      D    55_A     0.829     0    0.117   0.899     2.935   90.476   82.976
LGA    A    56_A      A    56_A     0.853     0    0.073   0.080     0.884   90.476   90.476
LGA    E    57_A      E    57_A     0.636     0    0.023   0.159     0.746   90.476   93.651
LGA    L    58_A      L    58_A     0.382     0    0.006   0.042     0.485  100.000  100.000
LGA    A    59_A      A    59_A     0.476     0    0.012   0.013     0.490  100.000  100.000
LGA    E    60_A      E    60_A     0.590     0    0.015   0.690     2.202   90.476   87.619
LGA    I    61_A      I    61_A     0.475     0    0.016   0.601     1.556  100.000   94.226
LGA    F    62_A      F    62_A     0.228     0    0.053   0.077     0.343  100.000  100.000
LGA    N    63_A      N    63_A     0.385     0    0.119   0.226     0.582  100.000   98.810
LGA    V    64_A      V    64_A     0.748     0    0.010   1.207     3.530   90.476   79.932
LGA    L    65_A      L    65_A     0.778     0    0.067   0.111     0.958   90.476   91.667
LGA    D    66_A      D    66_A     0.744     0    0.049   0.066     0.834   92.857   91.667
LGA    G    67_A      G    67_A     0.738     0    0.021   0.021     0.893   90.476   90.476
LGA    D    68_A      D    68_A     0.931     0    0.105   0.129     1.113   92.857   89.405
LGA    Q    69_A      Q    69_A     0.661     0    0.070   1.207     4.582   90.476   77.354
LGA    S    70_A      S    70_A     0.835     0    0.019   0.027     0.954   90.476   90.476
LGA    G    71_A      G    71_A     0.532     0    0.071   0.071     0.573   90.476   90.476
LGA    Y    72_A      Y    72_A     0.536     0    0.012   0.176     1.518   90.476   86.746
LGA    I    73_A      I    73_A     0.423     0    0.023   0.054     0.495  100.000  100.000
LGA    E    74_A      E    74_A     0.210     0    0.059   0.846     3.340  100.000   87.513
LGA    V    75_A      V    75_A     0.461     0    0.043   1.116     3.035  100.000   87.619
LGA    E    76_A      E    76_A     0.649     0    0.027   0.562     1.314   90.476   89.471
LGA    E    77_A      E    77_A     0.480     0    0.023   0.099     0.480  100.000  100.000
LGA    L    78_A      L    78_A     0.187     0    0.043   1.318     2.845  100.000   87.917
LGA    K    79_A      K    79_A     0.551     0    0.051   1.107     5.052   92.857   75.238
LGA    N    80_A      N    80_A     0.499     0    0.066   0.081     0.911  100.000   95.238
LGA    F    81_A      F    81_A     0.311     0    0.046   0.104     0.371  100.000  100.000
LGA    L    82_A      L    82_A     0.361     0    0.023   0.087     0.830  100.000   95.238
LGA    K    83_A      K    83_A     0.281     0    0.060   0.604     1.724   97.619   93.810
LGA    C    84_A      C    84_A     0.239     0    0.019   0.084     0.601  100.000   98.413
LGA    F    85_A      F    85_A     0.373     0    0.037   0.106     0.632   97.619   97.403
LGA    S    86_A      S    86_A     0.494     0    0.015   0.053     0.565   97.619   95.238
LGA    D    87_A      D    87_A     0.836     0    0.023   1.144     3.439   88.214   78.750
LGA    G    88_A      G    88_A     1.315     0    0.029   0.029     1.513   79.286   79.286
LGA    A    89_A      A    89_A     0.671     0    0.069   0.069     0.811   90.476   90.476
LGA    R    90_A      R    90_A     0.518     0    0.039   0.104     0.572   90.476   93.074
LGA    V    91_A      V    91_A     0.575     0    0.027   0.096     0.954   95.238   93.197
LGA    L    92_A      L    92_A     0.444     0    0.015   0.061     0.659   95.238   97.619
LGA    N    93_A      N    93_A     0.735     0    0.047   0.179     0.856   90.476   90.476
LGA    D    94_A      D    94_A     0.988     0    0.027   0.070     1.108   88.214   84.821
LGA    K    95_A      K    95_A     0.940     0    0.037   0.102     1.732   90.476   84.497
LGA    E    96_A      E    96_A     0.533     0    0.026   0.112     0.629   92.857   95.767
LGA    T    97_A      T    97_A     0.519     0    0.044   0.082     0.602   92.857   91.837
LGA    S    98_A      S    98_A     0.699     0    0.009   0.732     2.989   90.476   84.921
LGA    N    99_A      N    99_A     0.694     0    0.027   0.071     0.921   90.476   90.476
LGA    F   100_A      F   100_A     0.502     0    0.024   0.091     0.666   95.238   95.671
LGA    L   101_A      L   101_A     0.482     0    0.075   0.081     0.676   95.238   95.238
LGA    A   102_A      A   102_A     0.703     0    0.103   0.103     1.012   90.476   88.667
LGA    A   103_A      A   103_A     0.629     0    0.114   0.115     0.716   95.238   94.286
LGA    G   104_A      G   104_A     0.381     0    0.064   0.064     0.455  100.000  100.000
LGA    D   105_A      D   105_A     0.405     0    0.039   0.224     1.111  100.000   95.298
LGA    S   106_A      S   106_A     0.217     0    0.013   0.090     0.703   97.619   98.413
LGA    D   107_A      D   107_A     0.792     0    0.092   0.100     1.379   88.214   88.214
LGA    G   108_A      G   108_A     0.559     0    0.059   0.059     0.613   95.238   95.238
LGA    D   109_A      D   109_A     0.544     0    0.040   0.184     0.897   92.857   92.857
LGA    H   110_A      H   110_A     0.542     0    0.041   0.285     1.121   97.619   94.333
LGA    K   111_A      K   111_A     0.299     0    0.060   0.670     3.040   97.619   89.206
LGA    I   112_A      I   112_A     0.478     0    0.044   0.080     0.764   97.619   96.429
LGA    G   113_A      G   113_A     0.519     0    0.069   0.069     0.519   97.619   97.619
LGA    V   114_A      V   114_A     0.431     0    0.061   0.063     0.459  100.000  100.000
LGA    D   115_A      D   115_A     0.564     0    0.034   0.143     1.555   92.857   87.202
LGA    E   116_A      E   116_A     0.422     0    0.096   0.143     0.770  100.000   97.884
LGA    F   117_A      F   117_A     0.464     0    0.022   0.056     0.487  100.000  100.000
LGA    K   118_A      K   118_A     0.321     0    0.035   0.230     1.079  100.000   97.937
LGA    S   119_A      S   119_A     0.384     0    0.067   0.651     2.621   97.619   91.270
LGA    M   120_A      M   120_A     0.578     0    0.023   1.105     2.884   90.476   82.976
LGA    A   121_A      A   121_A     0.387     0    0.045   0.058     0.442  100.000  100.000
LGA    K   122_A      K   122_A     0.211     0    0.056   0.827     4.609   97.619   78.413
LGA    M   123_A      M   123_A     1.364     0    0.081   0.923     7.175   71.667   57.738
LGA    T   124_A      T   124_A     3.656     0    0.221   1.262     7.254   46.786   40.816

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     820    820  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.726          0.712                  1.131           94.302   90.949

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  124  108    4.0    108    0.73    98.611    99.301    13.080

LGA_LOCAL      RMSD:   0.726  Number of atoms:  108  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.726  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.726  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.513060 * X  +   0.537951 * Y  +  -0.668863 * Z  +   2.407918
  Y_new =  -0.396252 * X  +  -0.542798 * Y  +  -0.740510 * Z  +  -0.442408
  Z_new =  -0.761415 * X  +   0.644965 * Y  +  -0.065324 * Z  +  10.825778 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -0.657640  0.865494  1.671735   [DEG:  -37.6800   49.5891   95.7834 ]
ZXZ: -0.734606  1.636167 -0.868012   [DEG:  -42.0898   93.7455  -49.7334 ]
 
# END of job
