
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  124 (  959),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  820),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.73     0.73
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.73     0.73
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.73     0.73
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S    17_A     S    17_A    108  108  108      5   14   78  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    18_A     K    18_A    108  108  108      8   34  103  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    20_A     T    20_A    108  108  108     55  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    21_A     S    21_A    108  108  108     56  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    22_A     I    22_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    23_A     L    23_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    24_A     N    24_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    25_A     P    25_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    26_A     A    26_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    27_A     D    27_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    28_A     I    28_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    30_A     K    30_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    32_A     L    32_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    33_A     E    33_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    34_A     Q    34_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    35_A     C    35_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    36_A     A    36_A    108  108  108     70  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    37_A     A    37_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    38_A     G    38_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    39_A     F    39_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    40_A     H    40_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    41_A     H    41_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    42_A     T    42_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    43_A     A    43_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    45_A     F    45_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    46_A     K    46_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    47_A     A    47_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    48_A     S    48_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    49_A     G    49_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    50_A     L    50_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    52_A     K    52_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    53_A     K    53_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    54_A     S    54_A    108  108  108     66  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    55_A     D    55_A    108  108  108     52  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    56_A     A    56_A    108  108  108     55  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_A     E    57_A    108  108  108     61  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    58_A     L    58_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    59_A     A    59_A    108  108  108     66  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    60_A     E    60_A    108  108  108     66  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    61_A     I    61_A    108  108  108     68  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    62_A     F    62_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    63_A     N    63_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    64_A     V    64_A    108  108  108     41  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    65_A     L    65_A    108  108  108     29  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    66_A     D    66_A    108  108  108     43  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    67_A     G    67_A    108  108  108     49  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    68_A     D    68_A    108  108  108     43  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    69_A     Q    69_A    108  108  108     49  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    70_A     S    70_A    108  108  108     43  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    71_A     G    71_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    72_A     Y    72_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    73_A     I    73_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    74_A     E    74_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    75_A     V    75_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    76_A     E    76_A    108  108  108     70  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    77_A     E    77_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    78_A     L    78_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_A     K    79_A    108  108  108     70  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    80_A     N    80_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    81_A     F    81_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    82_A     L    82_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    83_A     K    83_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    84_A     C    84_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    85_A     F    85_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    86_A     S    86_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    87_A     D    87_A    108  108  108     30  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    88_A     G    88_A    108  108  108     25  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    89_A     A    89_A    108  108  108     70  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    90_A     R    90_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    91_A     V    91_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_A     L    92_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    93_A     N    93_A    108  108  108     70  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    94_A     D    94_A    108  108  108     55  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    95_A     K    95_A    108  108  108     55  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    96_A     E    96_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    97_A     T    97_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    98_A     S    98_A    108  108  108     70  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    99_A     N    99_A    108  108  108     70  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L   101_A     L   101_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    108  108  108     55  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   103_A     A   103_A    108  108  108     70  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   105_A     D   105_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   106_A     S   106_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   107_A     D   107_A    108  108  108     32  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   108_A     G   108_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   109_A     D   109_A    108  108  108     64  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H   110_A     H   110_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   111_A     K   111_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   112_A     I   112_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   113_A     G   113_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   114_A     V   114_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   115_A     D   115_A    108  108  108     64  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   116_A     E   116_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   117_A     F   117_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   118_A     K   118_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   119_A     S   119_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   120_A     M   120_A    108  108  108     67  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   121_A     A   121_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   122_A     K   122_A    108  108  108     71  104  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   123_A     M   123_A    108  108  108      3   37  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T   124_A     T   124_A    108  108  108      3    4    5    6   22  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     71    104    104    107    107    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  65.74  96.30  96.30  99.07  99.07 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.36   0.50   0.50   0.62   0.62   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73
GDT RMS_ALL_AT   0.76   0.74   0.74   0.74   0.74   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    33_A      E    33_A
#   possible swapping detected:  F    39_A      F    39_A
#   possible swapping detected:  E    57_A      E    57_A
#   possible swapping detected:  F    62_A      F    62_A
#   possible swapping detected:  E    74_A      E    74_A
#   possible swapping detected:  E    77_A      E    77_A
#   possible swapping detected:  F    81_A      F    81_A
#   possible swapping detected:  F    85_A      F    85_A
#   possible swapping detected:  E    96_A      E    96_A
#   possible swapping detected:  F   100_A      F   100_A
#   possible swapping detected:  E   116_A      E   116_A
#   possible swapping detected:  F   117_A      F   117_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S    17_A      S    17_A     2.538     0    0.602   0.768     4.432   61.190   56.508
LGA    K    18_A      K    18_A     2.186     0    0.089   0.179     5.890   73.095   53.069
LGA    I    19_A      I    19_A     0.395     0    0.065   0.614     1.551   97.619   89.643
LGA    T    20_A      T    20_A     0.627     0    0.037   0.064     1.245   95.238   90.612
LGA    S    21_A      S    21_A     0.621     0    0.098   0.099     1.044   88.214   87.460
LGA    I    22_A      I    22_A     0.312     0    0.034   0.098     0.822  100.000   96.429
LGA    L    23_A      L    23_A     0.360     0    0.026   0.041     0.633  100.000   98.810
LGA    N    24_A      N    24_A     0.613     0    0.044   0.452     2.130   90.476   87.262
LGA    P    25_A      P    25_A     0.556     0    0.020   0.137     0.723   95.238   93.197
LGA    A    26_A      A    26_A     0.436     0    0.033   0.039     0.475  100.000  100.000
LGA    D    27_A      D    27_A     0.537     0    0.015   0.121     0.799   95.238   92.857
LGA    I    28_A      I    28_A     0.542     0    0.026   0.070     0.769   95.238   92.857
LGA    T    29_A      T    29_A     0.315     0    0.043   0.097     0.631  100.000   97.279
LGA    K    30_A      K    30_A     0.286     0    0.058   0.671     2.088   97.619   88.836
LGA    A    31_A      A    31_A     0.487     0    0.029   0.038     0.582   97.619   96.190
LGA    L    32_A      L    32_A     0.423     0    0.017   0.068     0.796  100.000   95.238
LGA    E    33_A      E    33_A     0.178     0    0.023   0.971     4.252  100.000   81.958
LGA    Q    34_A      Q    34_A     0.187     0    0.047   0.250     1.370  100.000   93.757
LGA    C    35_A      C    35_A     0.547     0    0.029   0.063     1.029   92.857   90.556
LGA    A    36_A      A    36_A     0.600     0    0.042   0.037     0.709   95.238   94.286
LGA    A    37_A      A    37_A     0.458     0    0.103   0.113     0.863  100.000   98.095
LGA    G    38_A      G    38_A     0.410     0    0.053   0.053     0.541   97.619   97.619
LGA    F    39_A      F    39_A     0.559     0    0.045   0.092     0.602   92.857   94.805
LGA    H    40_A      H    40_A     0.410     0    0.070   0.126     0.885  100.000   95.238
LGA    H    41_A      H    41_A     0.486     0    0.035   0.136     0.649   97.619   97.143
LGA    T    42_A      T    42_A     0.368     0    0.036   0.120     0.870   97.619   95.918
LGA    A    43_A      A    43_A     0.317     0    0.030   0.039     0.406  100.000  100.000
LGA    F    44_A      F    44_A     0.199     0    0.032   0.136     0.471  100.000  100.000
LGA    F    45_A      F    45_A     0.222     0    0.047   0.585     1.888  100.000   92.468
LGA    K    46_A      K    46_A     0.382     0    0.074   0.145     2.195   97.619   87.831
LGA    A    47_A      A    47_A     0.404     0    0.014   0.021     0.559  100.000   98.095
LGA    S    48_A      S    48_A     0.319     0    0.051   0.063     0.339  100.000  100.000
LGA    G    49_A      G    49_A     0.341     0    0.029   0.029     0.341  100.000  100.000
LGA    L    50_A      L    50_A     0.185     0    0.039   0.097     0.380  100.000  100.000
LGA    S    51_A      S    51_A     0.299     0    0.051   0.058     0.619   97.619   96.825
LGA    K    52_A      K    52_A     0.396     0    0.048   0.654     2.496  100.000   92.169
LGA    K    53_A      K    53_A     0.259     0    0.023   0.364     1.704  100.000   93.862
LGA    S    54_A      S    54_A     0.474     0    0.009   0.024     0.528   97.619   98.413
LGA    D    55_A      D    55_A     0.724     0    0.119   0.896     3.087   90.476   82.083
LGA    A    56_A      A    56_A     0.716     0    0.070   0.076     0.727   90.476   90.476
LGA    E    57_A      E    57_A     0.544     0    0.023   0.147     0.643   95.238   96.825
LGA    L    58_A      L    58_A     0.308     0    0.009   0.046     0.407  100.000  100.000
LGA    A    59_A      A    59_A     0.411     0    0.013   0.014     0.419  100.000  100.000
LGA    E    60_A      E    60_A     0.509     0    0.017   0.652     1.951   97.619   90.688
LGA    I    61_A      I    61_A     0.395     0    0.018   0.599     1.608  100.000   94.226
LGA    F    62_A      F    62_A     0.198     0    0.051   0.085     0.387  100.000  100.000
LGA    N    63_A      N    63_A     0.357     0    0.115   0.234     0.623  100.000   98.810
LGA    V    64_A      V    64_A     0.740     0    0.010   1.198     3.502   90.476   81.156
LGA    L    65_A      L    65_A     0.770     0    0.064   0.105     0.928   90.476   91.667
LGA    D    66_A      D    66_A     0.767     0    0.046   0.069     0.852   90.476   90.476
LGA    G    67_A      G    67_A     0.726     0    0.021   0.021     0.827   90.476   90.476
LGA    D    68_A      D    68_A     0.866     0    0.103   0.143     1.063   92.857   90.536
LGA    Q    69_A      Q    69_A     0.626     0    0.073   1.232     4.421   90.476   77.989
LGA    S    70_A      S    70_A     0.790     0    0.020   0.019     0.907   90.476   90.476
LGA    G    71_A      G    71_A     0.512     0    0.071   0.071     0.551   90.476   90.476
LGA    Y    72_A      Y    72_A     0.538     0    0.020   0.177     1.418   90.476   88.214
LGA    I    73_A      I    73_A     0.433     0    0.026   0.052     0.502   97.619   98.810
LGA    E    74_A      E    74_A     0.207     0    0.061   0.834     3.278  100.000   86.455
LGA    V    75_A      V    75_A     0.447     0    0.038   1.106     2.980  100.000   88.639
LGA    E    76_A      E    76_A     0.611     0    0.024   0.564     1.396   92.857   90.529
LGA    E    77_A      E    77_A     0.453     0    0.024   0.096     0.487  100.000  100.000
LGA    L    78_A      L    78_A     0.201     0    0.040   1.313     2.862  100.000   87.917
LGA    K    79_A      K    79_A     0.587     0    0.049   1.119     5.150   92.857   75.238
LGA    N    80_A      N    80_A     0.509     0    0.063   0.090     0.932   97.619   94.048
LGA    F    81_A      F    81_A     0.299     0    0.042   0.107     0.374  100.000  100.000
LGA    L    82_A      L    82_A     0.307     0    0.022   0.089     0.729  100.000   96.429
LGA    K    83_A      K    83_A     0.258     0    0.060   0.569     1.589   97.619   93.810
LGA    C    84_A      C    84_A     0.240     0    0.029   0.090     0.646  100.000   98.413
LGA    F    85_A      F    85_A     0.422     0    0.029   0.103     0.663   97.619   97.403
LGA    S    86_A      S    86_A     0.531     0    0.017   0.042     0.587   92.857   92.063
LGA    D    87_A      D    87_A     0.825     0    0.040   1.197     3.217   88.214   82.024
LGA    G    88_A      G    88_A     1.245     0    0.044   0.044     1.480   81.429   81.429
LGA    A    89_A      A    89_A     0.612     0    0.066   0.067     0.753   90.476   90.476
LGA    R    90_A      R    90_A     0.416     0    0.040   0.093     0.474  100.000  100.000
LGA    V    91_A      V    91_A     0.524     0    0.031   0.107     0.929   95.238   93.197
LGA    L    92_A      L    92_A     0.426     0    0.012   0.051     0.617   95.238   97.619
LGA    N    93_A      N    93_A     0.670     0    0.065   0.211     0.830   92.857   91.667
LGA    D    94_A      D    94_A     0.900     0    0.020   0.071     0.998   90.476   90.476
LGA    K    95_A      K    95_A     0.857     0    0.040   0.098     1.645   90.476   84.497
LGA    E    96_A      E    96_A     0.506     0    0.021   0.104     0.589   95.238   96.825
LGA    T    97_A      T    97_A     0.499     0    0.024   0.034     0.599   95.238   93.197
LGA    S    98_A      S    98_A     0.647     0    0.030   0.070     0.865   90.476   90.476
LGA    N    99_A      N    99_A     0.648     0    0.031   0.056     0.810   90.476   90.476
LGA    F   100_A      F   100_A     0.534     0    0.023   0.065     0.582   92.857   95.671
LGA    L   101_A      L   101_A     0.528     0    0.073   0.080     0.668   92.857   92.857
LGA    A   102_A      A   102_A     0.729     0    0.100   0.099     1.018   90.476   88.667
LGA    A   103_A      A   103_A     0.647     0    0.120   0.121     0.712   95.238   94.286
LGA    G   104_A      G   104_A     0.452     0    0.045   0.045     0.513   97.619   97.619
LGA    D   105_A      D   105_A     0.497     0    0.041   0.217     1.174   97.619   94.107
LGA    S   106_A      S   106_A     0.189     0    0.021   0.097     0.625   97.619   98.413
LGA    D   107_A      D   107_A     0.714     0    0.098   0.104     1.304   88.214   88.214
LGA    G   108_A      G   108_A     0.437     0    0.050   0.050     0.498  100.000  100.000
LGA    D   109_A      D   109_A     0.514     0    0.053   0.150     0.799   92.857   92.857
LGA    H   110_A      H   110_A     0.565     0    0.033   0.294     1.215   97.619   94.333
LGA    K   111_A      K   111_A     0.331     0    0.057   0.190     2.122   97.619   89.841
LGA    I   112_A      I   112_A     0.517     0    0.042   0.088     0.824   92.857   94.048
LGA    G   113_A      G   113_A     0.512     0    0.068   0.068     0.512   97.619   97.619
LGA    V   114_A      V   114_A     0.347     0    0.067   0.073     0.378  100.000  100.000
LGA    D   115_A      D   115_A     0.500     0    0.035   0.137     1.534   97.619   89.583
LGA    E   116_A      E   116_A     0.364     0    0.098   0.142     0.747  100.000   97.884
LGA    F   117_A      F   117_A     0.400     0    0.025   0.054     0.440  100.000  100.000
LGA    K   118_A      K   118_A     0.262     0    0.030   0.286     1.268  100.000   97.937
LGA    S   119_A      S   119_A     0.337     0    0.065   0.651     2.557   97.619   91.270
LGA    M   120_A      M   120_A     0.441     0    0.018   1.100     2.776  100.000   87.738
LGA    A   121_A      A   121_A     0.318     0    0.021   0.035     0.412  100.000  100.000
LGA    K   122_A      K   122_A     0.146     0    0.039   0.827     4.383   95.238   77.989
LGA    M   123_A      M   123_A     1.684     0    0.020   0.913     7.470   67.619   53.988
LGA    T   124_A      T   124_A     4.111     0    0.657   1.232     6.938   43.690   36.803

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     820    820  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.734          0.716                  1.105           94.830   91.608

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  124  108    4.0    108    0.73    98.843    99.306    12.944

LGA_LOCAL      RMSD:   0.734  Number of atoms:  108  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.734  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.734  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.117181 * X  +   0.278432 * Y  +  -0.953281 * Z  +   0.827223
  Y_new =   0.421211 * X  +  -0.883214 * Y  +  -0.206190 * Z  +   0.264007
  Z_new =  -0.899361 * X  +  -0.377371 * Y  +  -0.220774 * Z  +   9.044497 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  1.299457  1.118306 -2.100138   [DEG:   74.4534   64.0742 -120.3290 ]
ZXZ: -1.357783  1.793405 -1.968083   [DEG:  -77.7952  102.7545 -112.7628 ]
 
# END of job
