
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  124 (  959),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  820),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.71     0.71
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.71     0.71
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.71     0.71
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S    17_A     S    17_A    108  108  108      5   14   76  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    18_A     K    18_A    108  108  108      9   38  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    20_A     T    20_A    108  108  108     52  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    21_A     S    21_A    108  108  108     60  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    22_A     I    22_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    23_A     L    23_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    24_A     N    24_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    25_A     P    25_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    26_A     A    26_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    27_A     D    27_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    28_A     I    28_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    30_A     K    30_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    32_A     L    32_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    33_A     E    33_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    34_A     Q    34_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    35_A     C    35_A    108  108  108     69  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    36_A     A    36_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    37_A     A    37_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    38_A     G    38_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    39_A     F    39_A    108  108  108     68  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    40_A     H    40_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    41_A     H    41_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    42_A     T    42_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    43_A     A    43_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    45_A     F    45_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    46_A     K    46_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    47_A     A    47_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    48_A     S    48_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    49_A     G    49_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    50_A     L    50_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    52_A     K    52_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    53_A     K    53_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    54_A     S    54_A    108  108  108     68  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    55_A     D    55_A    108  108  108     49  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    56_A     A    56_A    108  108  108     49  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_A     E    57_A    108  108  108     51  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    58_A     L    58_A    108  108  108     68  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    59_A     A    59_A    108  108  108     68  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    60_A     E    60_A    108  108  108     52  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    61_A     I    61_A    108  108  108     57  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    62_A     F    62_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    63_A     N    63_A    108  108  108     68  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    64_A     V    64_A    108  108  108     46  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    65_A     L    65_A    108  108  108     46  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    66_A     D    66_A    108  108  108     46  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    67_A     G    67_A    108  108  108     53  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    68_A     D    68_A    108  108  108     53  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    69_A     Q    69_A    108  108  108     62  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    70_A     S    70_A    108  108  108     53  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    71_A     G    71_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    72_A     Y    72_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    73_A     I    73_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    74_A     E    74_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    75_A     V    75_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    76_A     E    76_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    77_A     E    77_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    78_A     L    78_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_A     K    79_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    80_A     N    80_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    81_A     F    81_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    82_A     L    82_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    83_A     K    83_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    84_A     C    84_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    85_A     F    85_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    86_A     S    86_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    87_A     D    87_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    88_A     G    88_A    108  108  108     54  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    89_A     A    89_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    90_A     R    90_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    91_A     V    91_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_A     L    92_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    93_A     N    93_A    108  108  108     51  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    94_A     D    94_A    108  108  108     51  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    95_A     K    95_A    108  108  108     51  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    96_A     E    96_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    97_A     T    97_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    98_A     S    98_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    99_A     N    99_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L   101_A     L   101_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   103_A     A   103_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   105_A     D   105_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   106_A     S   106_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   107_A     D   107_A    108  108  108     53  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   108_A     G   108_A    108  108  108     63  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   109_A     D   109_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H   110_A     H   110_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   111_A     K   111_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   112_A     I   112_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   113_A     G   113_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   114_A     V   114_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   115_A     D   115_A    108  108  108     46  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   116_A     E   116_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   117_A     F   117_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   118_A     K   118_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   119_A     S   119_A    108  108  108     69  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   120_A     M   120_A    108  108  108     57  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   121_A     A   121_A    108  108  108     69  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   122_A     K   122_A    108  108  108     71  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   123_A     M   123_A    108  108  108     13   41  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T   124_A     T   124_A    108  108  108      3    3    5    7   76  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     71    104    105    107    107    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  65.74  96.30  97.22  99.07  99.07 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.34   0.49   0.51   0.62   0.62   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71
GDT RMS_ALL_AT   0.77   0.72   0.72   0.72   0.72   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    33_A      E    33_A
#   possible swapping detected:  F    39_A      F    39_A
#   possible swapping detected:  E    57_A      E    57_A
#   possible swapping detected:  F    62_A      F    62_A
#   possible swapping detected:  E    74_A      E    74_A
#   possible swapping detected:  E    77_A      E    77_A
#   possible swapping detected:  F    81_A      F    81_A
#   possible swapping detected:  F    85_A      F    85_A
#   possible swapping detected:  D    87_A      D    87_A
#   possible swapping detected:  E    96_A      E    96_A
#   possible swapping detected:  F   100_A      F   100_A
#   possible swapping detected:  E   116_A      E   116_A
#   possible swapping detected:  F   117_A      F   117_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S    17_A      S    17_A     2.635     0    0.540   0.732     4.516   61.190   55.556
LGA    K    18_A      K    18_A     2.258     0    0.084   0.682     3.195   73.095   65.132
LGA    I    19_A      I    19_A     0.304     0    0.073   0.589     1.512   97.619   90.714
LGA    T    20_A      T    20_A     0.587     0    0.037   0.067     1.283   95.238   90.612
LGA    S    21_A      S    21_A     0.520     0    0.098   0.095     0.989   92.857   92.063
LGA    I    22_A      I    22_A     0.245     0    0.044   0.106     0.795  100.000   97.619
LGA    L    23_A      L    23_A     0.327     0    0.031   0.061     0.603  100.000   98.810
LGA    N    24_A      N    24_A     0.571     0    0.032   0.413     1.980   90.476   88.274
LGA    P    25_A      P    25_A     0.553     0    0.025   0.146     0.645   95.238   93.197
LGA    A    26_A      A    26_A     0.436     0    0.022   0.026     0.482  100.000  100.000
LGA    D    27_A      D    27_A     0.533     0    0.010   0.133     0.814   92.857   91.667
LGA    I    28_A      I    28_A     0.522     0    0.032   0.079     0.740   95.238   92.857
LGA    T    29_A      T    29_A     0.255     0    0.042   0.070     0.397  100.000  100.000
LGA    K    30_A      K    30_A     0.201     0    0.043   0.663     1.975  100.000   92.804
LGA    A    31_A      A    31_A     0.488     0    0.029   0.038     0.562   97.619   96.190
LGA    L    32_A      L    32_A     0.492     0    0.019   0.068     0.784  100.000   95.238
LGA    E    33_A      E    33_A     0.260     0    0.022   0.971     4.289  100.000   81.958
LGA    Q    34_A      Q    34_A     0.243     0    0.019   0.172     1.325  100.000   93.757
LGA    C    35_A      C    35_A     0.578     0    0.069   0.086     1.180   92.857   90.556
LGA    A    36_A      A    36_A     0.557     0    0.026   0.025     0.576   90.476   90.476
LGA    A    37_A      A    37_A     0.534     0    0.108   0.117     0.993   90.476   90.476
LGA    G    38_A      G    38_A     0.534     0    0.039   0.039     0.551   90.476   90.476
LGA    F    39_A      F    39_A     0.576     0    0.046   0.096     0.662   90.476   93.939
LGA    H    40_A      H    40_A     0.375     0    0.079   0.122     0.724  100.000   97.143
LGA    H    41_A      H    41_A     0.446     0    0.042   0.149     0.569  100.000   98.095
LGA    T    42_A      T    42_A     0.435     0    0.036   0.100     0.690   97.619   97.279
LGA    A    43_A      A    43_A     0.411     0    0.032   0.038     0.473  100.000  100.000
LGA    F    44_A      F    44_A     0.270     0    0.031   0.099     0.373  100.000  100.000
LGA    F    45_A      F    45_A     0.329     0    0.032   0.594     1.933  100.000   91.645
LGA    K    46_A      K    46_A     0.386     0    0.051   0.160     2.034   97.619   88.889
LGA    A    47_A      A    47_A     0.372     0    0.021   0.026     0.494  100.000  100.000
LGA    S    48_A      S    48_A     0.379     0    0.038   0.053     0.472  100.000  100.000
LGA    G    49_A      G    49_A     0.454     0    0.025   0.025     0.454  100.000  100.000
LGA    L    50_A      L    50_A     0.270     0    0.046   0.118     0.473  100.000  100.000
LGA    S    51_A      S    51_A     0.355     0    0.085   0.127     0.693   97.619   95.238
LGA    K    52_A      K    52_A     0.484     0    0.059   0.662     2.776  100.000   88.360
LGA    K    53_A      K    53_A     0.286     0    0.026   0.538     1.573  100.000   92.910
LGA    S    54_A      S    54_A     0.557     0    0.008   0.025     0.618   95.238   93.651
LGA    D    55_A      D    55_A     0.794     0    0.119   0.925     3.108   90.476   82.083
LGA    A    56_A      A    56_A     0.813     0    0.073   0.080     0.834   90.476   90.476
LGA    E    57_A      E    57_A     0.622     0    0.023   0.175     0.719   90.476   93.651
LGA    L    58_A      L    58_A     0.376     0    0.020   0.048     0.475  100.000  100.000
LGA    A    59_A      A    59_A     0.499     0    0.013   0.014     0.509   95.238   94.286
LGA    E    60_A      E    60_A     0.584     0    0.037   0.474     1.502   90.476   87.513
LGA    I    61_A      I    61_A     0.527     0    0.016   0.594     1.478   95.238   91.726
LGA    F    62_A      F    62_A     0.303     0    0.060   0.091     0.396  100.000  100.000
LGA    N    63_A      N    63_A     0.444     0    0.138   0.303     0.715  100.000   98.810
LGA    V    64_A      V    64_A     0.823     0    0.014   1.202     3.631   90.476   81.156
LGA    L    65_A      L    65_A     0.779     0    0.083   0.122     0.996   90.476   91.667
LGA    D    66_A      D    66_A     0.637     0    0.079   0.106     0.781   92.857   95.238
LGA    G    67_A      G    67_A     0.631     0    0.017   0.017     0.695   90.476   90.476
LGA    D    68_A      D    68_A     0.655     0    0.104   0.174     1.043   92.857   90.536
LGA    Q    69_A      Q    69_A     0.537     0    0.050   1.168     3.940   90.476   78.201
LGA    S    70_A      S    70_A     0.695     0    0.024   0.051     0.867   90.476   90.476
LGA    G    71_A      G    71_A     0.453     0    0.071   0.071     0.461  100.000  100.000
LGA    Y    72_A      Y    72_A     0.462     0    0.027   0.148     1.284   97.619   91.389
LGA    I    73_A      I    73_A     0.327     0    0.031   0.046     0.431  100.000  100.000
LGA    E    74_A      E    74_A     0.174     0    0.067   0.290     0.740  100.000   96.825
LGA    V    75_A      V    75_A     0.443     0    0.047   1.097     3.019  100.000   88.844
LGA    E    76_A      E    76_A     0.574     0    0.022   0.563     1.307   92.857   90.529
LGA    E    77_A      E    77_A     0.428     0    0.019   0.134     0.529   97.619   98.942
LGA    L    78_A      L    78_A     0.096     0    0.040   1.307     2.833  100.000   87.917
LGA    K    79_A      K    79_A     0.521     0    0.054   1.100     4.767   92.857   75.820
LGA    N    80_A      N    80_A     0.641     0    0.088   0.104     1.093   95.238   91.726
LGA    F    81_A      F    81_A     0.459     0    0.050   0.111     0.542   97.619   99.134
LGA    L    82_A      L    82_A     0.439     0    0.028   0.083     0.770  100.000   95.238
LGA    K    83_A      K    83_A     0.332     0    0.068   0.572     2.620   97.619   90.106
LGA    C    84_A      C    84_A     0.419     0    0.043   0.097     0.829  100.000   98.413
LGA    F    85_A      F    85_A     0.464     0    0.026   0.087     0.672   95.238   95.671
LGA    S    86_A      S    86_A     0.491     0    0.011   0.037     0.491  100.000  100.000
LGA    D    87_A      D    87_A     0.613     0    0.065   0.901     2.719   90.476   80.833
LGA    G    88_A      G    88_A     0.854     0    0.028   0.028     1.016   88.214   88.214
LGA    A    89_A      A    89_A     0.560     0    0.055   0.053     0.617   90.476   90.476
LGA    R    90_A      R    90_A     0.468     0    0.039   0.099     0.659   95.238   95.671
LGA    V    91_A      V    91_A     0.628     0    0.032   0.100     1.073   90.476   87.891
LGA    L    92_A      L    92_A     0.522     0    0.012   0.058     0.712   90.476   95.238
LGA    N    93_A      N    93_A     0.793     0    0.045   0.184     0.947   90.476   90.476
LGA    D    94_A      D    94_A     0.893     0    0.018   0.093     1.028   90.476   89.345
LGA    K    95_A      K    95_A     0.801     0    0.031   0.104     1.545   92.857   86.561
LGA    E    96_A      E    96_A     0.434     0    0.019   0.146     0.537   97.619   96.825
LGA    T    97_A      T    97_A     0.409     0    0.031   0.077     0.492  100.000  100.000
LGA    S    98_A      S    98_A     0.484     0    0.030   0.068     0.678   97.619   95.238
LGA    N    99_A      N    99_A     0.504     0    0.025   0.061     0.725   95.238   92.857
LGA    F   100_A      F   100_A     0.358     0    0.026   0.066     0.650  100.000   97.403
LGA    L   101_A      L   101_A     0.363     0    0.070   0.077     0.475  100.000  100.000
LGA    A   102_A      A   102_A     0.600     0    0.101   0.101     0.864   90.476   90.476
LGA    A   103_A      A   103_A     0.558     0    0.125   0.126     0.660   95.238   94.286
LGA    G   104_A      G   104_A     0.447     0    0.083   0.083     0.523   97.619   97.619
LGA    D   105_A      D   105_A     0.500     0    0.029   0.207     1.182  100.000   95.298
LGA    S   106_A      S   106_A     0.275     0    0.019   0.596     2.082   97.619   92.540
LGA    D   107_A      D   107_A     0.874     0    0.102   0.112     1.479   88.214   85.952
LGA    G   108_A      G   108_A     0.565     0    0.053   0.053     0.584   95.238   95.238
LGA    D   109_A      D   109_A     0.275     0    0.058   0.146     0.538  100.000   97.619
LGA    H   110_A      H   110_A     0.427     0    0.030   0.277     1.209  100.000   96.238
LGA    K   111_A      K   111_A     0.145     0    0.065   0.200     1.872   97.619   92.804
LGA    I   112_A      I   112_A     0.444     0    0.032   0.058     0.755   97.619   95.238
LGA    G   113_A      G   113_A     0.485     0    0.070   0.070     0.510   97.619   97.619
LGA    V   114_A      V   114_A     0.458     0    0.066   0.074     0.521  100.000   97.279
LGA    D   115_A      D   115_A     0.587     0    0.046   0.151     1.660   92.857   86.131
LGA    E   116_A      E   116_A     0.426     0    0.108   0.120     0.663  100.000   98.942
LGA    F   117_A      F   117_A     0.490     0    0.022   0.062     0.518  100.000   99.134
LGA    K   118_A      K   118_A     0.406     0    0.030   0.272     1.261  100.000   96.878
LGA    S   119_A      S   119_A     0.422     0    0.049   0.055     0.541   97.619   98.413
LGA    M   120_A      M   120_A     0.528     0    0.014   1.112     3.015   95.238   84.464
LGA    A   121_A      A   121_A     0.391     0    0.035   0.049     0.448  100.000  100.000
LGA    K   122_A      K   122_A     0.262     0    0.053   0.800     3.988   95.238   80.476
LGA    M   123_A      M   123_A     1.548     0    0.167   0.650     5.487   69.524   54.048
LGA    T   124_A      T   124_A     3.748     0    0.064   0.114     5.520   48.452   38.231

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     820    820  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.714          0.696                  1.042           94.975   91.892

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  124  108    4.0    108    0.71    98.843    99.375    13.276

LGA_LOCAL      RMSD:   0.714  Number of atoms:  108  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.714  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.714  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.189650 * X  +   0.981504 * Y  +  -0.026147 * Z  +   2.970820
  Y_new =   0.075689 * X  +   0.041165 * Y  +   0.996281 * Z  +  -0.446304
  Z_new =   0.978930 * X  +   0.186966 * Y  +  -0.082096 * Z  +   9.451831 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  2.761863 -1.365154  1.984547   [DEG:  158.2431  -78.2176  113.7062 ]
ZXZ: -3.115355  1.652985  1.382079   [DEG: -178.4967   94.7091   79.1873 ]
 
# END of job
