
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  109 (  826),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  820),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.68     0.68
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.68     0.68
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.68     0.68
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S    17_A     S    17_A    108  108  108      4   35   74  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    18_A     K    18_A    108  108  108     13   39  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    20_A     T    20_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    21_A     S    21_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    22_A     I    22_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    23_A     L    23_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    24_A     N    24_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    25_A     P    25_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    26_A     A    26_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    27_A     D    27_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    28_A     I    28_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    30_A     K    30_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    32_A     L    32_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    33_A     E    33_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    34_A     Q    34_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    35_A     C    35_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    36_A     A    36_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    37_A     A    37_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    38_A     G    38_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    39_A     F    39_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    40_A     H    40_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    41_A     H    41_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    42_A     T    42_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    43_A     A    43_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    45_A     F    45_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    46_A     K    46_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    47_A     A    47_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    48_A     S    48_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    49_A     G    49_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    50_A     L    50_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    52_A     K    52_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    53_A     K    53_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    54_A     S    54_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    55_A     D    55_A    108  108  108     62  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    56_A     A    56_A    108  108  108     62  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_A     E    57_A    108  108  108     76  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    58_A     L    58_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    59_A     A    59_A    108  108  108     77  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    60_A     E    60_A    108  108  108     77  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    61_A     I    61_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    62_A     F    62_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    63_A     N    63_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    64_A     V    64_A    108  108  108     36  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    65_A     L    65_A    108  108  108     59  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    66_A     D    66_A    108  108  108     59  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    67_A     G    67_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    68_A     D    68_A    108  108  108     58  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    69_A     Q    69_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    70_A     S    70_A    108  108  108     72  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    71_A     G    71_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    72_A     Y    72_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    73_A     I    73_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    74_A     E    74_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    75_A     V    75_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    76_A     E    76_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    77_A     E    77_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    78_A     L    78_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_A     K    79_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    80_A     N    80_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    81_A     F    81_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    82_A     L    82_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    83_A     K    83_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    84_A     C    84_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    85_A     F    85_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    86_A     S    86_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    87_A     D    87_A    108  108  108     77  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    88_A     G    88_A    108  108  108     43  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    89_A     A    89_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    90_A     R    90_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    91_A     V    91_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_A     L    92_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    93_A     N    93_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    94_A     D    94_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    95_A     K    95_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    96_A     E    96_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    97_A     T    97_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    98_A     S    98_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    99_A     N    99_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L   101_A     L   101_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   103_A     A   103_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   105_A     D   105_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   106_A     S   106_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   107_A     D   107_A    108  108  108     47  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   108_A     G   108_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   109_A     D   109_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H   110_A     H   110_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   111_A     K   111_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   112_A     I   112_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   113_A     G   113_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   114_A     V   114_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   115_A     D   115_A    108  108  108     64  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   116_A     E   116_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   117_A     F   117_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   118_A     K   118_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   119_A     S   119_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   120_A     M   120_A    108  108  108     64  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   121_A     A   121_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   122_A     K   122_A    108  108  108     81  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   123_A     M   123_A    108  108  108      3   39  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T   124_A     T   124_A    108  108  108      3    4    5   16   79  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     81    104    105    107    107    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  75.00  96.30  97.22  99.07  99.07 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.34   0.44   0.47   0.58   0.58   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68
GDT RMS_ALL_AT   0.73   0.69   0.69   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68   0.68

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    33_A      E    33_A
#   possible swapping detected:  F    39_A      F    39_A
#   possible swapping detected:  E    57_A      E    57_A
#   possible swapping detected:  F    62_A      F    62_A
#   possible swapping detected:  E    74_A      E    74_A
#   possible swapping detected:  E    77_A      E    77_A
#   possible swapping detected:  F    81_A      F    81_A
#   possible swapping detected:  F    85_A      F    85_A
#   possible swapping detected:  E    96_A      E    96_A
#   possible swapping detected:  F   100_A      F   100_A
#   possible swapping detected:  E   116_A      E   116_A
#   possible swapping detected:  F   117_A      F   117_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S    17_A      S    17_A     2.758     0    0.129   0.195     3.244   64.881   59.921
LGA    K    18_A      K    18_A     2.115     0    0.033   0.084     4.935   73.095   56.825
LGA    I    19_A      I    19_A     0.198     0    0.081   0.605     1.536   95.238   89.524
LGA    T    20_A      T    20_A     0.453     0    0.029   0.108     1.086  100.000   93.333
LGA    S    21_A      S    21_A     0.321     0    0.136   0.195     1.155   92.976   92.222
LGA    I    22_A      I    22_A     0.136     0    0.035   0.105     0.592  100.000   96.429
LGA    L    23_A      L    23_A     0.390     0    0.030   0.049     0.538  100.000   98.810
LGA    N    24_A      N    24_A     0.685     0    0.033   0.192     1.566   90.476   87.143
LGA    P    25_A      P    25_A     0.648     0    0.020   0.141     0.789   92.857   91.837
LGA    A    26_A      A    26_A     0.367     0    0.025   0.029     0.478  100.000  100.000
LGA    D    27_A      D    27_A     0.536     0    0.019   0.094     0.817   95.238   92.857
LGA    I    28_A      I    28_A     0.538     0    0.028   0.095     0.755   95.238   92.857
LGA    T    29_A      T    29_A     0.313     0    0.044   0.069     0.572  100.000   97.279
LGA    K    30_A      K    30_A     0.323     0    0.051   0.671     2.436  100.000   86.984
LGA    A    31_A      A    31_A     0.458     0    0.031   0.040     0.597  100.000   98.095
LGA    L    32_A      L    32_A     0.438     0    0.017   0.062     0.852  100.000   95.238
LGA    E    33_A      E    33_A     0.254     0    0.020   0.978     4.094  100.000   81.958
LGA    Q    34_A      Q    34_A     0.125     0    0.038   0.250     1.343  100.000   92.751
LGA    C    35_A      C    35_A     0.469     0    0.034   0.080     0.828   95.238   93.651
LGA    A    36_A      A    36_A     0.604     0    0.036   0.032     0.691   92.857   92.381
LGA    A    37_A      A    37_A     0.471     0    0.105   0.115     0.739   92.857   92.381
LGA    G    38_A      G    38_A     0.468     0    0.054   0.054     0.632   95.238   95.238
LGA    F    39_A      F    39_A     0.567     0    0.046   0.126     0.627   92.857   94.805
LGA    H    40_A      H    40_A     0.288     0    0.074   0.113     0.504  100.000   99.048
LGA    H    41_A      H    41_A     0.339     0    0.055   0.145     0.442  100.000  100.000
LGA    T    42_A      T    42_A     0.331     0    0.043   0.117     0.665  100.000   98.639
LGA    A    43_A      A    43_A     0.330     0    0.037   0.044     0.425  100.000  100.000
LGA    F    44_A      F    44_A     0.232     0    0.023   0.140     0.527  100.000   98.268
LGA    F    45_A      F    45_A     0.230     0    0.030   0.459     1.594  100.000   92.468
LGA    K    46_A      K    46_A     0.341     0    0.041   0.186     2.102   97.619   88.889
LGA    A    47_A      A    47_A     0.348     0    0.016   0.022     0.500  100.000  100.000
LGA    S    48_A      S    48_A     0.273     0    0.051   0.063     0.347  100.000  100.000
LGA    G    49_A      G    49_A     0.352     0    0.032   0.032     0.352  100.000  100.000
LGA    L    50_A      L    50_A     0.209     0    0.052   0.101     0.467  100.000  100.000
LGA    S    51_A      S    51_A     0.321     0    0.081   0.134     0.608   97.619   95.238
LGA    K    52_A      K    52_A     0.420     0    0.059   0.658     2.505  100.000   91.323
LGA    K    53_A      K    53_A     0.327     0    0.026   0.319     1.375  100.000   95.820
LGA    S    54_A      S    54_A     0.471     0    0.008   0.026     0.515   97.619   98.413
LGA    D    55_A      D    55_A     0.771     0    0.112   0.926     3.063   90.476   82.083
LGA    A    56_A      A    56_A     0.719     0    0.069   0.076     0.719   90.476   90.476
LGA    E    57_A      E    57_A     0.497     0    0.022   0.158     0.600   97.619   97.884
LGA    L    58_A      L    58_A     0.368     0    0.016   0.041     0.424  100.000  100.000
LGA    A    59_A      A    59_A     0.467     0    0.014   0.015     0.479  100.000  100.000
LGA    E    60_A      E    60_A     0.501     0    0.021   0.546     1.697   97.619   90.688
LGA    I    61_A      I    61_A     0.422     0    0.016   0.604     1.636  100.000   94.226
LGA    F    62_A      F    62_A     0.268     0    0.055   0.110     0.369  100.000  100.000
LGA    N    63_A      N    63_A     0.421     0    0.133   0.219     0.741   97.619   97.619
LGA    V    64_A      V    64_A     0.752     0    0.020   1.146     3.432   90.476   82.177
LGA    L    65_A      L    65_A     0.657     0    0.085   0.103     0.800   90.476   91.667
LGA    D    66_A      D    66_A     0.586     0    0.067   0.083     0.710   95.238   96.429
LGA    G    67_A      G    67_A     0.487     0    0.018   0.018     0.593   92.857   92.857
LGA    D    68_A      D    68_A     0.655     0    0.113   0.127     0.863   92.857   91.667
LGA    Q    69_A      Q    69_A     0.480     0    0.070   1.175     4.502   92.857   80.317
LGA    S    70_A      S    70_A     0.612     0    0.022   0.026     0.739   90.476   90.476
LGA    G    71_A      G    71_A     0.382     0    0.069   0.069     0.420  100.000  100.000
LGA    Y    72_A      Y    72_A     0.437     0    0.008   0.135     1.215  100.000   92.937
LGA    I    73_A      I    73_A     0.389     0    0.019   0.051     0.427  100.000  100.000
LGA    E    74_A      E    74_A     0.294     0    0.048   0.670     2.150  100.000   89.947
LGA    V    75_A      V    75_A     0.450     0    0.047   1.105     2.954  100.000   88.639
LGA    E    76_A      E    76_A     0.558     0    0.027   0.562     1.368   92.857   90.529
LGA    E    77_A      E    77_A     0.395     0    0.025   0.142     0.535  100.000   98.942
LGA    L    78_A      L    78_A     0.115     0    0.045   1.313     2.836  100.000   87.917
LGA    K    79_A      K    79_A     0.516     0    0.046   1.093     4.867   92.857   75.820
LGA    N    80_A      N    80_A     0.537     0    0.080   0.121     1.038   97.619   92.917
LGA    F    81_A      F    81_A     0.346     0    0.045   0.098     0.423  100.000  100.000
LGA    L    82_A      L    82_A     0.350     0    0.023   0.078     0.771  100.000   96.429
LGA    K    83_A      K    83_A     0.299     0    0.072   0.637     1.911   97.619   94.868
LGA    C    84_A      C    84_A     0.262     0    0.034   0.098     0.515  100.000   98.413
LGA    F    85_A      F    85_A     0.288     0    0.032   0.061     0.479  100.000  100.000
LGA    S    86_A      S    86_A     0.309     0    0.016   0.067     0.339  100.000  100.000
LGA    D    87_A      D    87_A     0.526     0    0.022   1.119     3.638   92.857   82.440
LGA    G    88_A      G    88_A     0.990     0    0.026   0.026     1.233   88.214   88.214
LGA    A    89_A      A    89_A     0.552     0    0.063   0.064     0.638   95.238   94.286
LGA    R    90_A      R    90_A     0.419     0    0.030   0.107     0.613  100.000   97.403
LGA    V    91_A      V    91_A     0.483     0    0.027   0.106     0.875  100.000   95.918
LGA    L    92_A      L    92_A     0.446     0    0.012   0.067     0.570   95.238   97.619
LGA    N    93_A      N    93_A     0.631     0    0.041   0.186     0.839   92.857   91.667
LGA    D    94_A      D    94_A     0.717     0    0.052   0.100     0.776   90.476   90.476
LGA    K    95_A      K    95_A     0.664     0    0.037   0.091     1.270   95.238   90.582
LGA    E    96_A      E    96_A     0.406     0    0.029   0.114     0.478  100.000  100.000
LGA    T    97_A      T    97_A     0.401     0    0.031   0.083     0.466  100.000  100.000
LGA    S    98_A      S    98_A     0.441     0    0.023   0.728     2.664   97.619   91.270
LGA    N    99_A      N    99_A     0.455     0    0.027   0.071     0.614  100.000   95.238
LGA    F   100_A      F   100_A     0.397     0    0.024   0.073     0.682  100.000   96.537
LGA    L   101_A      L   101_A     0.393     0    0.070   0.084     0.472  100.000  100.000
LGA    A   102_A      A   102_A     0.543     0    0.101   0.100     0.786   90.476   90.476
LGA    A   103_A      A   103_A     0.496     0    0.125   0.125     0.593   97.619   96.190
LGA    G   104_A      G   104_A     0.396     0    0.062   0.062     0.439  100.000  100.000
LGA    D   105_A      D   105_A     0.427     0    0.060   0.229     1.056  100.000   95.298
LGA    S   106_A      S   106_A     0.188     0    0.006   0.075     0.498  100.000  100.000
LGA    D   107_A      D   107_A     0.720     0    0.101   0.102     1.190   88.214   88.214
LGA    G   108_A      G   108_A     0.429     0    0.033   0.033     0.489  100.000  100.000
LGA    D   109_A      D   109_A     0.397     0    0.071   0.149     0.614   97.619   97.619
LGA    H   110_A      H   110_A     0.523     0    0.025   0.947     2.168   97.619   88.190
LGA    K   111_A      K   111_A     0.182     0    0.067   0.198     1.952   97.619   92.804
LGA    I   112_A      I   112_A     0.421     0    0.040   0.053     0.687  100.000   97.619
LGA    G   113_A      G   113_A     0.453     0    0.069   0.069     0.453  100.000  100.000
LGA    V   114_A      V   114_A     0.438     0    0.065   0.080     0.564  100.000   97.279
LGA    D   115_A      D   115_A     0.575     0    0.029   0.141     1.643   95.238   87.321
LGA    E   116_A      E   116_A     0.372     0    0.095   0.137     0.701  100.000   98.942
LGA    F   117_A      F   117_A     0.465     0    0.024   0.054     0.479  100.000  100.000
LGA    K   118_A      K   118_A     0.401     0    0.031   0.267     1.225  100.000   96.878
LGA    S   119_A      S   119_A     0.393     0    0.068   0.638     2.523   97.619   91.270
LGA    M   120_A      M   120_A     0.553     0    0.021   1.113     3.040   92.857   83.274
LGA    A   121_A      A   121_A     0.323     0    0.033   0.046     0.415  100.000  100.000
LGA    K   122_A      K   122_A     0.083     0    0.035   0.801     4.225  100.000   79.048
LGA    M   123_A      M   123_A     1.498     0    0.027   0.189     4.869   71.667   58.690
LGA    T   124_A      T   124_A     3.758     0    0.105   1.214     7.556   46.786   38.639

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     820    820  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.682          0.658                  1.036           96.139   92.648

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  109  108    4.0    108    0.68    98.843    99.375    13.811

LGA_LOCAL      RMSD:   0.682  Number of atoms:  108  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.682  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.682  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.325960 * X  +   0.765611 * Y  +   0.554608 * Z  +  -1.798054
  Y_new =   0.007318 * X  +  -0.588674 * Y  +   0.808337 * Z  +   1.067768
  Z_new =   0.945355 * X  +  -0.259428 * Y  +  -0.197487 * Z  +  10.163301 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  0.022446 -1.238682 -2.221453   [DEG:    1.2860  -70.9713 -127.2799 ]
ZXZ:  2.540251  1.769590  1.838626   [DEG:  145.5456  101.3900  105.3455 ]
 
# END of job
