
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  175 ( 1372),  selected  163 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  163 ( 1282),  selected  163 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:O  -ch2:B  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   163      13_B - 175_B       0.70     0.70
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   163      13_B - 175_B       0.70     0.70
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   163      13_B - 175_B       0.70     0.70
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  163
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     V    13_O     V    13_B    163  163  163     78  155  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    14_O     D    14_B    163  163  163     81  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    15_O     P    15_B    163  163  163     82  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    16_O     Q    16_B    163  163  163     81  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    17_O     V    17_B    163  163  163    108  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    18_O     V    18_B    163  163  163    101  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    19_O     L    19_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    20_O     S    20_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    21_O     D    21_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    22_O     K    22_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T    23_O     T    23_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    24_O     R    24_B    163  163  163    100  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    25_O     A    25_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    26_O     H    26_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I    27_O     I    27_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    28_O     D    28_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    29_O     H    29_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W    30_O     W    30_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    31_O     L    31_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    32_O     A    32_B    163  163  163     99  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    33_O     K    33_B    163  163  163    101  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    34_O     F    34_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    35_O     P    35_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    36_O     P    36_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    37_O     D    37_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    38_O     R    38_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    39_O     K    39_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    40_O     R    40_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    41_O     S    41_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    42_O     A    42_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    43_O     V    43_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    44_O     L    44_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    45_O     Q    45_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    46_O     G    46_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    47_O     L    47_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    48_O     H    48_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    49_O     A    49_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    50_O     A    50_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    51_O     Q    51_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    52_O     E    52_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    53_O     Q    53_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N    54_O     N    54_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    55_O     Q    55_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    56_O     G    56_B    163  163  163     78  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W    57_O     W    57_B    163  163  163     78  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    58_O     L    58_B    163  163  163    100  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T    59_O     T    59_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    60_O     D    60_B    163  163  163     96  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    61_O     E    61_B    163  163  163    100  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    62_O     L    62_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I    63_O     I    63_B    163  163  163     99  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    64_O     V    64_B    163  163  163     98  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    65_O     G    65_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    66_O     V    66_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    67_O     A    67_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    68_O     K    68_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y    69_O     Y    69_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    70_O     L    70_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    71_O     E    71_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    72_O     L    72_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    73_O     P    73_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    74_O     P    74_B    163  163  163    100  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    75_O     V    75_B    163  163  163    102  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W    76_O     W    76_B    163  163  163     99  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    77_O     A    77_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y    78_O     Y    78_B    163  163  163     99  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    79_O     E    79_B    163  163  163     86  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    80_O     V    80_B    163  163  163     99  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    81_O     A    81_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    82_O     S    82_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    83_O     F    83_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y    84_O     Y    84_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    85_O     S    85_B    163  163  163     60  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     M    86_O     M    86_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    87_O     F    87_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    88_O     E    88_B    163  163  163     78  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T    89_O     T    89_B    163  163  163     81  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    90_O     E    90_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    91_O     K    91_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    92_O     V    92_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    93_O     G    93_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    94_O     R    94_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    95_O     H    95_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N    96_O     N    96_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    97_O     V    97_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    98_O     A    98_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    99_O     F    99_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   100_O     C   100_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T   101_O     T   101_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N   102_O     N   102_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I   103_O     I   103_B    163  163  163    106  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S   104_O     S   104_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   105_O     C   105_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W   106_O     W   106_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   107_O     L   107_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N   108_O     N   108_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   109_O     G   109_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   110_O     A   110_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   111_O     E   111_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   112_O     D   112_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   113_O     L   113_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   114_O     L   114_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   115_O     A   115_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   116_O     H   116_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   117_O     A   117_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   118_O     E   118_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   119_O     K   119_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   120_O     K   120_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   121_O     L   121_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   122_O     G   122_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   123_O     C   123_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   124_O     K   124_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   125_O     L   125_B    163  163  163     70  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   126_O     G   126_B    163  163  163     70  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q   127_O     Q   127_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S   128_O     S   128_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T   129_O     T   129_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   130_O     A   130_B    163  163  163     62  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   131_O     D   131_B    163  163  163     78  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   132_O     G   132_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R   133_O     R   133_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V   134_O     V   134_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y   135_O     Y   135_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   136_O     L   136_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   137_O     K   137_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R   138_O     R   138_B    163  163  163      9  127  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   139_O     E   139_B    163  163  163      3    3   44   82  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   140_O     E   140_B    163  163  163      3    4    5   38   63  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   141_O     E   141_B    163  163  163      6   78  158  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   142_O     C   142_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   143_O     L   143_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   144_O     A   144_B    163  163  163     92  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   145_O     A   145_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   146_O     C   146_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S   147_O     S   147_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   148_O     A   148_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   149_O     A   149_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P   150_O     P   150_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     M   151_O     M   151_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     M   152_O     M   152_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V   153_O     V   153_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I   154_O     I   154_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N   155_O     N   155_B    163  163  163     93  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   156_O     G   156_B    163  163  163     57  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   157_O     H   157_B    163  163  163     57  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y   158_O     Y   158_B    163  163  163    106  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   159_O     H   159_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   160_O     E   160_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   161_O     H   161_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   162_O     L   162_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T   163_O     T   163_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   164_O     K   164_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   165_O     E   165_B    163  163  163     38  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   166_O     K   166_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V   167_O     V   167_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   168_O     D   168_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   169_O     A   169_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   170_O     L   170_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   171_O     L   171_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   172_O     D   172_B    163  163  163    113  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   173_O     G   173_B    163  163  163    103  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   174_O     L   174_B    163  163  163     55  157  159  160  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   175_O     E   175_B    163  163  163      3    3    3   39  147  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT    113    157    159    160    161    162    163    163    163    163    163    163    163    163    163    163    163    163    163    163 
GDT PERCENT_AT  69.33  96.32  97.55  98.16  98.77  99.39 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.35   0.47   0.49   0.51   0.56   0.64   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70
GDT RMS_ALL_AT   0.71   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    52_O      E    52_B
#   possible swapping detected:  Y    69_O      Y    69_B
#   possible swapping detected:  E    71_O      E    71_B
#   possible swapping detected:  E    79_O      E    79_B
#   possible swapping detected:  E    88_O      E    88_B
#   possible swapping detected:  E    90_O      E    90_B
#   possible swapping detected:  F    99_O      F    99_B
#   possible swapping detected:  E   111_O      E   111_B
#   possible swapping detected:  E   118_O      E   118_B
#   possible swapping detected:  Y   135_O      Y   135_B
#   possible swapping detected:  E   160_O      E   160_B

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    V    13_O      V    13_B     1.161     0    0.041   0.230     1.903   79.286   80.272
LGA    D    14_O      D    14_B     0.931     0    0.024   0.422     1.261   90.476   88.214
LGA    P    15_O      P    15_B     0.675     0    0.072   0.124     0.849   90.476   90.476
LGA    Q    16_O      Q    16_B     0.801     0    0.132   0.897     2.465   90.476   79.841
LGA    V    17_O      V    17_B     0.596     0    0.022   0.066     0.713   90.476   90.476
LGA    V    18_O      V    18_B     0.582     0    0.108   1.171     3.045   95.238   82.653
LGA    L    19_O      L    19_B     0.374     0    0.009   0.111     0.471  100.000  100.000
LGA    S    20_O      S    20_B     0.414     0    0.084   0.113     0.710   97.619   96.825
LGA    D    21_O      D    21_B     0.423     0    0.026   0.550     2.346  100.000   92.024
LGA    K    22_O      K    22_B     0.227     0    0.023   0.586     1.531  100.000   94.868
LGA    T    23_O      T    23_B     0.097     0    0.017   0.099     0.293  100.000  100.000
LGA    R    24_O      R    24_B     0.641     0    0.189   0.776     1.919   97.619   89.870
LGA    A    25_O      A    25_B     0.279     0    0.028   0.030     0.326  100.000  100.000
LGA    H    26_O      H    26_B     0.256     0    0.014   0.272     0.815  100.000   98.095
LGA    I    27_O      I    27_B     0.330     0    0.037   0.101     0.623  100.000   98.810
LGA    D    28_O      D    28_B     0.262     0    0.026   0.157     0.573  100.000   98.810
LGA    H    29_O      H    29_B     0.282     0    0.026   1.156     2.368  100.000   88.381
LGA    W    30_O      W    30_B     0.122     0    0.020   0.183     1.090  100.000   96.633
LGA    L    31_O      L    31_B     0.433     0    0.069   0.138     0.545   97.619   97.619
LGA    A    32_O      A    32_B     0.679     0    0.086   0.083     1.014   88.214   88.667
LGA    K    33_O      K    33_B     0.704     0    0.066   0.286     1.278   90.476   87.460
LGA    F    34_O      F    34_B     0.488     0    0.017   0.080     0.527   95.238   97.403
LGA    P    35_O      P    35_B     0.465     0    0.056   0.082     0.763   97.619   95.918
LGA    P    36_O      P    36_B     0.430     0    0.012   0.050     0.600  100.000   97.279
LGA    D    37_O      D    37_B     0.344     0    0.135   0.262     1.444   97.619   92.917
LGA    R    38_O      R    38_B     0.467     0    0.098   0.703     5.436  100.000   74.329
LGA    K    39_O      K    39_B     0.300     0    0.067   0.835     2.010   97.619   88.889
LGA    R    40_O      R    40_B     0.498     0    0.052   0.973     7.492  100.000   68.398
LGA    S    41_O      S    41_B     0.233     0    0.055   0.127     0.334  100.000  100.000
LGA    A    42_O      A    42_B     0.137     0    0.035   0.047     0.327  100.000  100.000
LGA    V    43_O      V    43_B     0.356     0    0.076   0.865     1.858   97.619   89.524
LGA    L    44_O      L    44_B     0.383     0    0.034   0.697     3.113   97.619   85.774
LGA    Q    45_O      Q    45_B     0.258     0    0.056   0.337     2.016  100.000   90.899
LGA    G    46_O      G    46_B     0.451     0    0.021   0.021     0.451  100.000  100.000
LGA    L    47_O      L    47_B     0.310     0    0.027   0.108     0.499  100.000  100.000
LGA    H    48_O      H    48_B     0.345     0    0.020   1.054     4.277  100.000   74.714
LGA    A    49_O      A    49_B     0.301     0    0.019   0.027     0.391  100.000  100.000
LGA    A    50_O      A    50_B     0.214     0    0.048   0.058     0.430  100.000  100.000
LGA    Q    51_O      Q    51_B     0.431     0    0.017   0.099     0.665  100.000   96.825
LGA    E    52_O      E    52_B     0.380     0    0.028   0.214     1.137  100.000   95.820
LGA    Q    53_O      Q    53_B     0.443     0    0.011   0.200     0.528  100.000   98.942
LGA    N    54_O      N    54_B     0.269     0    0.029   0.145     0.447  100.000  100.000
LGA    Q    55_O      Q    55_B     0.460     0    0.022   0.348     1.760  100.000   90.794
LGA    G    56_O      G    56_B     0.822     0    0.075   0.075     0.822   90.476   90.476
LGA    W    57_O      W    57_B     0.756     0    0.034   0.124     0.871   90.476   90.476
LGA    L    58_O      L    58_B     0.583     0    0.033   0.102     0.693   90.476   90.476
LGA    T    59_O      T    59_B     0.524     0    0.023   0.087     0.645   90.476   94.558
LGA    D    60_O      D    60_B     0.734     0    0.043   0.346     1.845   90.476   87.143
LGA    E    61_O      E    61_B     0.610     0    0.066   1.167     4.555   90.476   71.534
LGA    L    62_O      L    62_B     0.517     0    0.019   0.105     0.750   90.476   91.667
LGA    I    63_O      I    63_B     0.650     0    0.038   0.095     0.764   90.476   90.476
LGA    V    64_O      V    64_B     0.685     0    0.018   0.029     0.945   90.476   90.476
LGA    G    65_O      G    65_B     0.508     0    0.046   0.046     0.508   97.619   97.619
LGA    V    66_O      V    66_B     0.405     0    0.016   0.037     0.464  100.000  100.000
LGA    A    67_O      A    67_B     0.495     0    0.024   0.024     0.622  100.000   98.095
LGA    K    68_O      K    68_B     0.437     0    0.044   0.431     1.685  100.000   91.799
LGA    Y    69_O      Y    69_B     0.369     0    0.021   0.155     0.902  100.000   96.825
LGA    L    70_O      L    70_B     0.260     0    0.020   0.105     0.655  100.000   98.810
LGA    E    71_O      E    71_B     0.253     0    0.017   0.472     1.743  100.000   93.810
LGA    L    72_O      L    72_B     0.302     0    0.016   0.223     0.616  100.000   98.810
LGA    P    73_O      P    73_B     0.521     0    0.048   0.088     0.696   95.238   93.197
LGA    P    74_O      P    74_B     0.589     0    0.033   0.056     0.701   90.476   90.476
LGA    V    75_O      V    75_B     0.583     0    0.040   1.252     3.044   90.476   79.932
LGA    W    76_O      W    76_B     0.636     0    0.029   0.088     0.805   90.476   90.476
LGA    A    77_O      A    77_B     0.465     0    0.039   0.042     0.560   92.857   94.286
LGA    Y    78_O      Y    78_B     0.703     0    0.024   0.081     1.181   90.476   87.460
LGA    E    79_O      E    79_B     0.801     0    0.031   0.183     0.907   90.476   93.651
LGA    V    80_O      V    80_B     0.665     0    0.050   0.097     0.729   90.476   90.476
LGA    A    81_O      A    81_B     0.497     0    0.038   0.040     0.563   97.619   96.190
LGA    S    82_O      S    82_B     0.438     0    0.037   0.246     1.089  100.000   96.905
LGA    F    83_O      F    83_B     0.564     0    0.020   0.096     0.796   90.476   90.476
LGA    Y    84_O      Y    84_B     0.467     0    0.103   0.133     1.029   95.238   91.310
LGA    S    85_O      S    85_B     0.651     0    0.038   0.215     1.363   97.619   92.222
LGA    M    86_O      M    86_B     0.318     0    0.078   0.815     4.296   97.619   86.250
LGA    F    87_O      F    87_B     0.442     0    0.097   0.213     0.681  100.000   98.268
LGA    E    88_O      E    88_B     0.985     0    0.094   0.201     1.944   88.214   81.587
LGA    T    89_O      T    89_B     0.834     0    0.051   0.060     1.119   90.476   87.891
LGA    E    90_O      E    90_B     0.510     0    0.073   1.062     3.745   92.857   73.704
LGA    K    91_O      K    91_B     0.108     0    0.120   0.981     5.782   97.619   78.836
LGA    V    92_O      V    92_B     0.170     0    0.029   0.128     0.504  100.000   98.639
LGA    G    93_O      G    93_B     0.234     0    0.050   0.050     0.445  100.000  100.000
LGA    R    94_O      R    94_B     0.265     0    0.056   1.087     2.933  100.000   89.351
LGA    H    95_O      H    95_B     0.217     0    0.041   0.070     0.682  100.000   97.143
LGA    N    96_O      N    96_B     0.279     0    0.045   0.137     0.815  100.000   96.429
LGA    V    97_O      V    97_B     0.336     0    0.026   0.051     0.460  100.000  100.000
LGA    A    98_O      A    98_B     0.323     0    0.028   0.032     0.362  100.000  100.000
LGA    F    99_O      F    99_B     0.494     0    0.027   0.042     0.597   95.238   95.671
LGA    C   100_O      C   100_B     0.453     0    0.081   0.105     0.674   97.619   96.825
LGA    T   101_O      T   101_B     0.194     0    0.033   0.052     0.297  100.000  100.000
LGA    N   102_O      N   102_B     0.329     0    0.066   0.112     0.736  100.000   98.810
LGA    I   103_O      I   103_B     0.607     0    0.038   1.311     4.309   95.238   78.095
LGA    S   104_O      S   104_B     0.307     0    0.026   0.058     0.484  100.000  100.000
LGA    C   105_O      C   105_B     0.157     0    0.015   0.054     0.281  100.000  100.000
LGA    W   106_O      W   106_B     0.241     0    0.030   0.339     1.347  100.000   93.946
LGA    L   107_O      L   107_B     0.426     0    0.073   0.077     0.616   97.619   95.238
LGA    N   108_O      N   108_B     0.191     0    0.099   1.125     2.466   97.619   90.000
LGA    G   109_O      G   109_B     0.455     0    0.051   0.051     0.455  100.000  100.000
LGA    A   110_O      A   110_B     0.215     0    0.075   0.081     0.474  100.000  100.000
LGA    E   111_O      E   111_B     0.159     0    0.050   0.691     2.210  100.000   88.942
LGA    D   112_O      D   112_B     0.195     0    0.017   0.046     0.444  100.000  100.000
LGA    L   113_O      L   113_B     0.379     0    0.032   1.136     2.693  100.000   89.048
LGA    L   114_O      L   114_B     0.406     0    0.062   0.178     0.534  100.000   98.810
LGA    A   115_O      A   115_B     0.441     0    0.024   0.033     0.500   97.619   98.095
LGA    H   116_O      H   116_B     0.265     0    0.045   0.084     0.659  100.000   96.190
LGA    A   117_O      A   117_B     0.308     0    0.042   0.044     0.348  100.000  100.000
LGA    E   118_O      E   118_B     0.313     0    0.014   0.241     1.292  100.000   95.820
LGA    K   119_O      K   119_B     0.195     0    0.041   0.781     5.979  100.000   79.153
LGA    K   120_O      K   120_B     0.301     0    0.041   0.600     1.431   97.619   94.762
LGA    L   121_O      L   121_B     0.160     0    0.027   0.086     0.405  100.000  100.000
LGA    G   122_O      G   122_B     0.116     0    0.033   0.033     0.257  100.000  100.000
LGA    C   123_O      C   123_B     0.296     0    0.013   0.178     0.946  100.000   98.413
LGA    K   124_O      K   124_B     0.433     0    0.028   0.826     4.110  100.000   82.593
LGA    L   125_O      L   125_B     0.708     0    0.127   0.178     1.197   90.476   89.345
LGA    G   126_O      G   126_B     0.811     0    0.152   0.152     0.992   90.476   90.476
LGA    Q   127_O      Q   127_B     0.534     0    0.012   0.170     0.940   92.857   93.651
LGA    S   128_O      S   128_B     0.453     0    0.046   0.099     0.752   95.238   93.651
LGA    T   129_O      T   129_B     0.503     0    0.058   0.071     0.729   92.857   94.558
LGA    A   130_O      A   130_B     0.843     0    0.039   0.039     1.082   88.214   86.857
LGA    D   131_O      D   131_B     0.860     0    0.074   0.140     0.926   90.476   90.476
LGA    G   132_O      G   132_B     0.494     0    0.018   0.018     0.693   97.619   97.619
LGA    R   133_O      R   133_B     0.507     0    0.010   1.573     7.205   95.238   68.225
LGA    V   134_O      V   134_B     0.273     0    0.012   0.036     0.512  100.000   98.639
LGA    Y   135_O      Y   135_B     0.112     0    0.046   0.227     1.753  100.000   90.714
LGA    L   136_O      L   136_B     0.232     0    0.083   0.136     0.819  100.000   98.810
LGA    K   137_O      K   137_B     0.246     0    0.096   0.549     1.676   92.976   92.804
LGA    R   138_O      R   138_B     1.426     0    0.607   0.757     3.791   81.548   64.935
LGA    E   139_O      E   139_B     3.145     0    0.311   1.180     8.879   45.833   24.921
LGA    E   140_O      E   140_B     3.790     0    0.639   0.560    10.884   50.595   25.397
LGA    E   141_O      E   141_B     1.683     0    0.256   1.097     7.727   83.810   52.751
LGA    C   142_O      C   142_B     0.491     0    0.140   0.201     0.920   97.619   95.238
LGA    L   143_O      L   143_B     0.457     0    0.024   0.087     0.513   95.238   97.619
LGA    A   144_O      A   144_B     0.757     0    0.152   0.146     1.429   88.214   88.667
LGA    A   145_O      A   145_B     0.447     0    0.099   0.098     0.565  100.000   98.095
LGA    C   146_O      C   146_B     0.498     0    0.043   0.209     0.632   97.619   95.238
LGA    S   147_O      S   147_B     0.335     0    0.019   0.251     1.003  100.000   96.905
LGA    A   148_O      A   148_B     0.362     0    0.026   0.047     0.520   97.619   96.190
LGA    A   149_O      A   149_B     0.252     0    0.037   0.041     0.423  100.000  100.000
LGA    P   150_O      P   150_B     0.204     0    0.034   0.064     0.287  100.000  100.000
LGA    M   151_O      M   151_B     0.361     0    0.046   0.169     0.560  100.000   98.810
LGA    M   152_O      M   152_B     0.404     0    0.027   0.800     1.956  100.000   91.905
LGA    V   153_O      V   153_B     0.481     0    0.020   0.085     0.734  100.000   97.279
LGA    I   154_O      I   154_B     0.407     0    0.034   0.076     0.706   95.238   96.429
LGA    N   155_O      N   155_B     0.584     0    0.025   0.259     1.105   92.857   90.536
LGA    G   156_O      G   156_B     0.916     0    0.012   0.012     1.006   88.214   88.214
LGA    H   157_O      H   157_B     0.889     0    0.015   1.159     2.810   90.476   80.190
LGA    Y   158_O      Y   158_B     0.563     0    0.055   0.145     0.788   90.476   90.476
LGA    H   159_O      H   159_B     0.501     0    0.028   0.147     1.001   97.619   92.429
LGA    E   160_O      E   160_B     0.315     0    0.057   0.181     0.621  100.000   98.942
LGA    H   161_O      H   161_B     0.285     0    0.033   0.119     0.635  100.000   98.095
LGA    L   162_O      L   162_B     0.178     0    0.073   0.073     0.283  100.000  100.000
LGA    T   163_O      T   163_B     0.318     0    0.028   0.097     0.412  100.000  100.000
LGA    K   164_O      K   164_B     0.410     0    0.055   0.570     1.579   95.238   91.746
LGA    E   165_O      E   165_B     0.647     0    0.012   0.518     2.090   90.476   86.667
LGA    K   166_O      K   166_B     0.354     0    0.068   0.439     1.903  100.000   92.804
LGA    V   167_O      V   167_B     0.441     0    0.021   0.043     0.560  100.000   97.279
LGA    D   168_O      D   168_B     0.441     0    0.027   0.129     0.597  100.000   98.810
LGA    A   169_O      A   169_B     0.404     0    0.022   0.029     0.421  100.000  100.000
LGA    L   170_O      L   170_B     0.400     0    0.029   0.076     0.416  100.000  100.000
LGA    L   171_O      L   171_B     0.387     0    0.042   0.102     0.597   97.619   97.619
LGA    D   172_O      D   172_B     0.479     0    0.036   0.061     0.743   95.238   97.619
LGA    G   173_O      G   173_B     0.547     0    0.096   0.096     0.819   92.857   92.857
LGA    L   174_O      L   174_B     0.681     0    0.585   0.527     1.914   86.071   89.464
LGA    E   175_O      E   175_B     3.748     0    0.622   0.960    10.611   30.476   17.989

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      163     652    652  100.00    1282   1282  100.00               163
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.701          0.770                  1.483           95.508   91.442

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  175  163    4.0    163    0.70    98.620    99.279    20.350

LGA_LOCAL      RMSD:   0.701  Number of atoms:  163  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.701  Number of assigned atoms:  163 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.701  Standard rmsd on all 163 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.938842 * X  +  -0.339899 * Y  +   0.055177 * Z  +  15.705418
  Y_new =  -0.063165 * X  +  -0.327508 * Y  +  -0.942735 * Z  +  36.980793
  Z_new =   0.338505 * X  +   0.881594 * Y  +  -0.328948 * Z  +  -0.969224 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -0.067179 -0.345328  1.927926   [DEG:   -3.8491  -19.7858  110.4620 ]
ZXZ:  0.058462  1.905986  0.366611   [DEG:    3.3496  109.2050   21.0053 ]
 
# END of job
