
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  175 ( 1372),  selected  163 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  163 ( 1282),  selected  163 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:O  -ch2:B  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   163      13_B - 175_B       2.25     2.25
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   161      15_B - 175_B       1.78     2.26
  LCS_AVERAGE:     97.60

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   101      36_B - 136_B       1.00     2.38
  LCS_AVERAGE:     58.82

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  163
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     V    13_O     V    13_B      4    5  163      3    3    6    7    8   12   17   23   29   40   43   80   84   88   97  112  129  163  163  163 
LCS_GDT     D    14_O     D    14_B      4    5  163      3    3    6    7    8   26   34   42   50   65   73   80   84   89  101  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     P    15_O     P    15_B      4  161  163      3    8    9   15   20   26   34   42   68   78  122  147  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     Q    16_O     Q    16_B      4  161  163      3    8    9   15   20   26   34   42   50   69   82  147  154  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     V    17_O     V    17_B      3  161  163      3    3    4   13   30   46   67   87  155  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     V    18_O     V    18_B     82  161  163     26   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     L    19_O     L    19_B     82  161  163     28   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     S    20_O     S    20_B     82  161  163     15   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     D    21_O     D    21_B     82  161  163      9   48  106  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     K    22_O     K    22_B     82  161  163     10   24   73  110  156  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     T    23_O     T    23_B     82  161  163     11   27  106  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     R    24_O     R    24_B     82  161  163     11   31   98  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     A    25_O     A    25_B     82  161  163     11   51   95  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     H    26_O     H    26_B     82  161  163     11   44   79  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     I    27_O     I    27_B     94  161  163     11   67  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     D    28_O     D    28_B     98  161  163     21   82  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     H    29_O     H    29_B     98  161  163     21   63  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     W    30_O     W    30_B     98  161  163     15   74  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     L    31_O     L    31_B     99  161  163     17   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     A    32_O     A    32_B     99  161  163     21   82  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     K    33_O     K    33_B     99  161  163     19   81  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     F    34_O     F    34_B     99  161  163     19   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     P    35_O     P    35_B     99  161  163     21   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     P    36_O     P    36_B    101  161  163     21   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     D    37_O     D    37_B    101  161  163     30   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     R    38_O     R    38_B    101  161  163     21   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     K    39_O     K    39_B    101  161  163     21   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     R    40_O     R    40_B    101  161  163      9   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     S    41_O     S    41_B    101  161  163     30   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     A    42_O     A    42_B    101  161  163     21   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     V    43_O     V    43_B    101  161  163     30   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     L    44_O     L    44_B    101  161  163     30   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     Q    45_O     Q    45_B    101  161  163     30   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     G    46_O     G    46_B    101  161  163     30   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     L    47_O     L    47_B    101  161  163     30   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     H    48_O     H    48_B    101  161  163     30   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     A    49_O     A    49_B    101  161  163     30   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     A    50_O     A    50_B    101  161  163     30   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     Q    51_O     Q    51_B    101  161  163     21   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     E    52_O     E    52_B    101  161  163     19   83  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     Q    53_O     Q    53_B    101  161  163     23   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     N    54_O     N    54_B    101  161  163     30   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     Q    55_O     Q    55_B    101  161  163     30   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     G    56_O     G    56_B    101  161  163     29   83  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     W    57_O     W    57_B    101  161  163     30   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     L    58_O     L    58_B    101  161  163     21   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     T    59_O     T    59_B    101  161  163     21   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     D    60_O     D    60_B    101  161  163     21   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     E    61_O     E    61_B    101  161  163     20   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     L    62_O     L    62_B    101  161  163     21   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     I    63_O     I    63_B    101  161  163     19   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     V    64_O     V    64_B    101  161  163     15   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     G    65_O     G    65_B    101  161  163     19   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     V    66_O     V    66_B    101  161  163     19   77  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     A    67_O     A    67_B    101  161  163     17   77  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     K    68_O     K    68_B    101  161  163     19   83  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     Y    69_O     Y    69_B    101  161  163     11   55  133  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     L    70_O     L    70_B    101  161  163     11   45  133  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     E    71_O     E    71_B    101  161  163     11   77  134  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     L    72_O     L    72_B    101  161  163     11   78  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     P    73_O     P    73_B    101  161  163     11   83  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     P    74_O     P    74_B    101  161  163     14   81  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     V    75_O     V    75_B    101  161  163     14   83  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     W    76_O     W    76_B    101  161  163     14   83  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     A    77_O     A    77_B    101  161  163     19   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     Y    78_O     Y    78_B    101  161  163     19   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     E    79_O     E    79_B    101  161  163     19   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     V    80_O     V    80_B    101  161  163     14   82  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     A    81_O     A    81_B    101  161  163     14   76  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     S    82_O     S    82_B    101  161  163      7   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     F    83_O     F    83_B    101  161  163     19   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     Y    84_O     Y    84_B    101  161  163     23   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     S    85_O     S    85_B    101  161  163     34   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     M    86_O     M    86_B    101  161  163     28   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     F    87_O     F    87_B    101  161  163     30   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     E    88_O     E    88_B    101  161  163     19   80  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     T    89_O     T    89_B    101  161  163     19   83  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     E    90_O     E    90_B    101  161  163     14   59  134  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     K    91_O     K    91_B    101  161  163     14   64  134  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     V    92_O     V    92_B    101  161  163      9   53   92  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     G    93_O     G    93_B    101  161  163      4   72  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     R    94_O     R    94_B    101  161  163      4   67  123  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     H    95_O     H    95_B    101  161  163     37   82  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     N    96_O     N    96_B    101  161  163     19   67  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     V    97_O     V    97_B    101  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     A    98_O     A    98_B    101  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     F    99_O     F    99_B    101  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     C   100_O     C   100_B    101  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     T   101_O     T   101_B    101  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     N   102_O     N   102_B    101  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     I   103_O     I   103_B    101  161  163     13   83  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     S   104_O     S   104_B    101  161  163     17   83  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     C   105_O     C   105_B    101  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     W   106_O     W   106_B    101  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     L   107_O     L   107_B    101  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     N   108_O     N   108_B    101  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     G   109_O     G   109_B    101  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     A   110_O     A   110_B    101  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     E   111_O     E   111_B    101  161  163     34   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     D   112_O     D   112_B    101  161  163     21   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     L   113_O     L   113_B    101  161  163     30   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     L   114_O     L   114_B    101  161  163     32   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     A   115_O     A   115_B    101  161  163     21   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     H   116_O     H   116_B    101  161  163     19   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     A   117_O     A   117_B    101  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     E   118_O     E   118_B    101  161  163     20   79  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     K   119_O     K   119_B    101  161  163     11   62  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     K   120_O     K   120_B    101  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     L   121_O     L   121_B    101  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     G   122_O     G   122_B    101  161  163     19   71  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     C   123_O     C   123_B    101  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     K   124_O     K   124_B    101  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     L   125_O     L   125_B    101  161  163     11   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     G   126_O     G   126_B    101  161  163     11   66  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     Q   127_O     Q   127_B    101  161  163     11   72  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     S   128_O     S   128_B    101  161  163     37   83  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     T   129_O     T   129_B    101  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     A   130_O     A   130_B    101  161  163     37   72  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     D   131_O     D   131_B    101  161  163     12   72  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     G   132_O     G   132_B    101  161  163     33   72  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     R   133_O     R   133_B    101  161  163     37   78  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     V   134_O     V   134_B    101  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     Y   135_O     Y   135_B    101  161  163     34   80  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     L   136_O     L   136_B    101  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     K   137_O     K   137_B    100  161  163      3   51  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     R   138_O     R   138_B     97  161  163      6   16  112  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     E   139_O     E   139_B     97  161  163     14   81  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     E   140_O     E   140_B     97  161  163     13   71  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     E   141_O     E   141_B     97  161  163      4   81  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     C   142_O     C   142_B     97  161  163     21   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     L   143_O     L   143_B     97  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     A   144_O     A   144_B     97  161  163     33   85  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     A   145_O     A   145_B     97  161  163      7   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     C   146_O     C   146_B     97  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     S   147_O     S   147_B     97  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     A   148_O     A   148_B     97  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     A   149_O     A   149_B     97  161  163      4   74  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     P   150_O     P   150_B     97  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     M   151_O     M   151_B     97  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     M   152_O     M   152_B     97  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     V   153_O     V   153_B     97  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     I   154_O     I   154_B     97  161  163     37   77  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     N   155_O     N   155_B     97  161  163     13   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     G   156_O     G   156_B     97  161  163      3   66  134  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     H   157_O     H   157_B     97  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     Y   158_O     Y   158_B     97  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     H   159_O     H   159_B     97  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     E   160_O     E   160_B     97  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     H   161_O     H   161_B     97  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     L   162_O     L   162_B     97  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     T   163_O     T   163_B     97  161  163     37   88  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     K   164_O     K   164_B     97  161  163     15   68  135  153  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     E   165_O     E   165_B     97  161  163      7   31   90  147  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     K   166_O     K   166_B     97  161  163      7   33  113  150  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     V   167_O     V   167_B     97  161  163      7   33  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     D   168_O     D   168_B     97  161  163      6   67  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     A   169_O     A   169_B     97  161  163     33   71  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     L   170_O     L   170_B     97  161  163      6   68  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     L   171_O     L   171_B     97  161  163      6   78  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     D   172_O     D   172_B     97  161  163      6   63  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     G   173_O     G   173_B     97  161  163      6   79  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     L   174_O     L   174_B     97  161  163      3   83  135  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_GDT     E   175_O     E   175_B     97  161  163     21   61  133  154  157  158  158  158  158  159  159  159  159  161  161  162  162  163  163  163 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  85.47  (  58.82   97.60  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     37     88    135    154    157    158    158    158    158    159    159    159    159    161    161    162    162    163    163    163 
GDT PERCENT_AT  22.70  53.99  82.82  94.48  96.32  96.93  96.93  96.93  96.93  97.55  97.55  97.55  97.55  98.77  98.77  99.39  99.39 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.31   0.72   0.97   1.11   1.14   1.16   1.16   1.16   1.16   1.28   1.28   1.28   1.28   1.78   1.78   2.05   2.05   2.25   2.25   2.25
GDT RMS_ALL_AT   2.93   2.36   2.31   2.32   2.32   2.32   2.32   2.32   2.32   2.30   2.30   2.30   2.30   2.26   2.26   2.25   2.25   2.25   2.25   2.25

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  D    21_O      D    21_B
#   possible swapping detected:  D    60_O      D    60_B
#   possible swapping detected:  E    61_O      E    61_B
#   possible swapping detected:  F    83_O      F    83_B
#   possible swapping detected:  E    90_O      E    90_B
#   possible swapping detected:  E   111_O      E   111_B
#   possible swapping detected:  E   140_O      E   140_B
#   possible swapping detected:  E   141_O      E   141_B
#   possible swapping detected:  Y   158_O      Y   158_B
#   possible swapping detected:  E   165_O      E   165_B
#   possible swapping detected:  D   172_O      D   172_B

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    V    13_O      V    13_B    12.775     0    0.096   0.177    14.272    0.000    0.068
LGA    D    14_O      D    14_B    13.621     0    0.060   0.139    16.879    0.000    0.000
LGA    P    15_O      P    15_B    11.271     0    0.603   0.621    13.268    0.000    0.000
LGA    Q    16_O      Q    16_B    11.898     0    0.531   0.925    19.037    0.000    0.000
LGA    V    17_O      V    17_B     6.942     0    0.600   0.793     9.806   20.357   13.741
LGA    V    18_O      V    18_B     0.436     0    0.708   0.576     4.787   86.905   73.810
LGA    L    19_O      L    19_B     0.282     0    0.130   1.041     3.386   92.976   83.333
LGA    S    20_O      S    20_B     0.772     0    0.060   0.697     2.349   88.214   84.683
LGA    D    21_O      D    21_B     2.019     0    0.039   0.279     2.776   66.786   65.833
LGA    K    22_O      K    22_B     2.685     0    0.052   1.364    10.261   60.952   39.788
LGA    T    23_O      T    23_B     1.996     0    0.057   0.137     2.083   70.833   71.701
LGA    R    24_O      R    24_B     1.850     0    0.126   1.539     5.397   75.000   61.991
LGA    A    25_O      A    25_B     1.963     0    0.045   0.044     2.044   68.810   68.000
LGA    H    26_O      H    26_B     2.108     0    0.034   0.957     3.924   68.810   64.381
LGA    I    27_O      I    27_B     1.444     0    0.040   0.578     2.014   79.286   77.202
LGA    D    28_O      D    28_B     1.124     0    0.029   0.122     1.748   81.429   80.357
LGA    H    29_O      H    29_B     1.405     0    0.038   1.143     4.151   81.429   72.381
LGA    W    30_O      W    30_B     1.258     0    0.046   0.386     3.767   81.429   62.857
LGA    L    31_O      L    31_B     0.874     0    0.030   1.170     2.701   88.214   81.964
LGA    A    32_O      A    32_B     1.197     0    0.048   0.048     1.337   81.429   81.429
LGA    K    33_O      K    33_B     1.188     0    0.097   1.206     5.207   81.429   65.291
LGA    F    34_O      F    34_B     0.818     0    0.053   0.136     0.908   90.476   90.476
LGA    P    35_O      P    35_B     0.734     0    0.040   0.085     0.941   90.476   90.476
LGA    P    36_O      P    36_B     0.613     0    0.055   0.087     0.799   90.476   90.476
LGA    D    37_O      D    37_B     1.102     0    0.273   0.948     2.722   88.214   78.631
LGA    R    38_O      R    38_B     0.860     0    0.188   1.207     8.515   83.690   56.017
LGA    K    39_O      K    39_B     0.970     0    0.056   0.873     2.273   90.476   84.603
LGA    R    40_O      R    40_B     1.099     0    0.092   1.140     5.426   88.214   68.095
LGA    S    41_O      S    41_B     0.538     0    0.032   0.631     1.923   90.476   89.127
LGA    A    42_O      A    42_B     0.777     0    0.126   0.122     1.206   90.476   88.667
LGA    V    43_O      V    43_B     0.554     0    0.067   1.252     3.455   90.476   81.020
LGA    L    44_O      L    44_B     0.648     0    0.029   0.947     3.061   90.476   83.155
LGA    Q    45_O      Q    45_B     0.882     0    0.063   0.612     3.861   90.476   74.815
LGA    G    46_O      G    46_B     0.500     0    0.029   0.029     0.582   92.857   92.857
LGA    L    47_O      L    47_B     0.654     0    0.039   0.082     1.072   90.476   89.345
LGA    H    48_O      H    48_B     0.814     0    0.044   1.142     3.413   90.476   82.238
LGA    A    49_O      A    49_B     0.802     0    0.030   0.041     0.815   90.476   90.476
LGA    A    50_O      A    50_B     0.590     0    0.076   0.075     1.082   88.214   88.667
LGA    Q    51_O      Q    51_B     0.898     0    0.042   0.421     2.250   88.214   82.698
LGA    E    52_O      E    52_B     1.114     0    0.034   0.214     2.009   83.690   78.677
LGA    Q    53_O      Q    53_B     0.902     0    0.019   0.976     4.948   90.476   71.111
LGA    N    54_O      N    54_B     1.048     0    0.155   0.840     4.828   88.214   69.881
LGA    Q    55_O      Q    55_B     0.633     0    0.062   0.855     3.771   90.476   81.323
LGA    G    56_O      G    56_B     1.141     0    0.096   0.096     1.141   88.214   88.214
LGA    W    57_O      W    57_B     0.739     0    0.077   0.122     1.882   90.476   80.952
LGA    L    58_O      L    58_B     0.992     0    0.080   0.732     2.860   85.952   78.571
LGA    T    59_O      T    59_B     0.915     0    0.049   0.047     1.078   90.476   89.184
LGA    D    60_O      D    60_B     0.949     0    0.049   1.007     3.349   90.476   80.952
LGA    E    61_O      E    61_B     0.862     0    0.094   1.191     4.813   88.214   70.476
LGA    L    62_O      L    62_B     0.972     0    0.039   1.007     5.633   88.214   68.631
LGA    I    63_O      I    63_B     0.997     0    0.026   0.651     2.325   88.214   82.738
LGA    V    64_O      V    64_B     0.851     0    0.021   0.074     1.210   88.214   89.184
LGA    G    65_O      G    65_B     1.059     0    0.026   0.026     1.390   83.690   83.690
LGA    V    66_O      V    66_B     1.385     0    0.036   0.103     1.556   79.286   76.531
LGA    A    67_O      A    67_B     1.404     0    0.046   0.064     1.652   79.286   79.714
LGA    K    68_O      K    68_B     1.247     0    0.043   1.208     3.395   79.286   71.481
LGA    Y    69_O      Y    69_B     1.796     0    0.046   0.264     4.387   70.833   58.492
LGA    L    70_O      L    70_B     1.822     0    0.091   0.181     2.151   72.857   71.845
LGA    E    71_O      E    71_B     1.689     0    0.048   0.996     4.679   72.857   64.762
LGA    L    72_O      L    72_B     1.571     0    0.057   0.261     2.858   77.143   70.060
LGA    P    73_O      P    73_B     1.192     0    0.177   0.202     1.522   83.690   80.272
LGA    P    74_O      P    74_B     1.294     0    0.052   0.309     2.353   81.429   77.823
LGA    V    75_O      V    75_B     1.197     0    0.034   0.186     1.392   81.429   81.429
LGA    W    76_O      W    76_B     1.275     0    0.036   1.638     7.122   81.429   49.082
LGA    A    77_O      A    77_B     1.066     0    0.032   0.049     1.109   85.952   85.048
LGA    Y    78_O      Y    78_B     0.903     0    0.036   0.165     1.182   88.214   85.952
LGA    E    79_O      E    79_B     0.880     0    0.047   0.125     0.940   90.476   90.476
LGA    V    80_O      V    80_B     1.297     0    0.045   0.199     1.677   79.286   78.980
LGA    A    81_O      A    81_B     1.442     0    0.029   0.040     1.510   79.286   79.714
LGA    S    82_O      S    82_B     0.939     0    0.031   0.507     1.148   88.214   87.460
LGA    F    83_O      F    83_B     0.780     0    0.024   1.389     5.304   92.857   71.775
LGA    Y    84_O      Y    84_B     0.464     0    0.013   0.212     1.476   97.619   89.841
LGA    S    85_O      S    85_B     0.660     0    0.054   0.726     3.002   92.857   83.810
LGA    M    86_O      M    86_B     0.281     0    0.144   1.138     3.578  100.000   80.476
LGA    F    87_O      F    87_B     0.508     0    0.064   0.247     0.977   92.857   93.074
LGA    E    88_O      E    88_B     1.043     0    0.032   0.297     2.281   88.214   79.735
LGA    T    89_O      T    89_B     1.015     0    0.108   1.227     3.991   81.429   75.986
LGA    E    90_O      E    90_B     1.548     0    0.063   1.039     2.994   75.000   74.974
LGA    K    91_O      K    91_B     1.552     0    0.043   0.903     4.623   72.857   66.455
LGA    V    92_O      V    92_B     1.979     0    0.047   0.965     4.479   75.000   69.252
LGA    G    93_O      G    93_B     1.376     0    0.083   0.083     1.891   75.000   75.000
LGA    R    94_O      R    94_B     1.972     0    0.073   1.161     4.898   72.857   57.403
LGA    H    95_O      H    95_B     1.016     0    0.034   0.054     1.811   81.429   79.762
LGA    N    96_O      N    96_B     1.414     0    0.023   1.124     3.659   81.429   70.476
LGA    V    97_O      V    97_B     0.766     0    0.037   0.054     1.179   90.595   89.252
LGA    A    98_O      A    98_B     0.414     0    0.067   0.069     0.586   97.619   98.095
LGA    F    99_O      F    99_B     0.450     0    0.050   1.277     6.753  100.000   65.065
LGA    C   100_O      C   100_B     0.531     0    0.039   0.047     0.854   92.857   93.651
LGA    T   101_O      T   101_B     0.958     0    0.087   0.171     1.473   85.952   84.014
LGA    N   102_O      N   102_B     0.679     0    0.058   0.596     2.196   88.214   88.512
LGA    I   103_O      I   103_B     1.216     0    0.034   1.393     5.806   81.429   68.095
LGA    S   104_O      S   104_B     1.261     0    0.028   0.779     1.384   81.429   81.429
LGA    C   105_O      C   105_B     0.908     0    0.056   0.124     1.052   88.214   88.968
LGA    W   106_O      W   106_B     0.663     0    0.031   1.643     7.111   90.476   65.986
LGA    L   107_O      L   107_B     0.762     0    0.138   0.896     2.565   88.214   82.976
LGA    N   108_O      N   108_B     0.985     0    0.305   0.790     4.016   88.214   76.131
LGA    G   109_O      G   109_B     0.914     0    0.100   0.100     1.079   90.595   90.595
LGA    A   110_O      A   110_B     0.482     0    0.072   0.083     0.649   97.619   96.190
LGA    E   111_O      E   111_B     0.400     0    0.052   1.139     4.631  100.000   78.413
LGA    D   112_O      D   112_B     0.482     0    0.040   0.147     1.377  100.000   91.845
LGA    L   113_O      L   113_B     0.790     0    0.043   1.233     4.422   90.476   78.333
LGA    L   114_O      L   114_B     0.942     0    0.044   0.196     2.294   90.476   82.798
LGA    A   115_O      A   115_B     0.749     0    0.034   0.038     1.022   90.476   88.667
LGA    H   116_O      H   116_B     0.446     0    0.036   0.653     1.970  100.000   88.952
LGA    A   117_O      A   117_B     0.577     0    0.033   0.038     1.049   92.857   90.571
LGA    E   118_O      E   118_B     1.120     0    0.059   0.417     2.125   81.548   75.873
LGA    K   119_O      K   119_B     1.416     0    0.081   0.930     6.117   81.429   62.328
LGA    K   120_O      K   120_B     0.681     0    0.062   0.867     1.492   88.214   85.450
LGA    L   121_O      L   121_B     0.942     0    0.126   0.895     2.425   83.810   79.583
LGA    G   122_O      G   122_B     1.459     0    0.083   0.083     1.459   81.429   81.429
LGA    C   123_O      C   123_B     0.725     0    0.065   0.241     1.506   88.214   86.032
LGA    K   124_O      K   124_B     0.507     0    0.076   1.130     3.694   92.857   81.587
LGA    L   125_O      L   125_B     1.034     0    0.036   1.020     3.603   83.690   77.798
LGA    G   126_O      G   126_B     1.462     0    0.067   0.067     1.685   79.286   79.286
LGA    Q   127_O      Q   127_B     1.260     0    0.056   0.507     2.182   81.429   79.577
LGA    S   128_O      S   128_B     1.013     0    0.051   0.116     1.274   85.952   84.444
LGA    T   129_O      T   129_B     0.792     0    0.018   0.059     1.133   88.214   89.184
LGA    A   130_O      A   130_B     1.417     0    0.069   0.069     1.699   79.286   78.000
LGA    D   131_O      D   131_B     1.603     0    0.251   1.220     4.479   79.286   70.595
LGA    G   132_O      G   132_B     1.451     0    0.079   0.079     1.621   79.286   79.286
LGA    R   133_O      R   133_B     1.194     0    0.033   1.412     7.122   83.690   59.221
LGA    V   134_O      V   134_B     0.776     0    0.078   1.001     2.595   90.476   82.041
LGA    Y   135_O      Y   135_B     1.093     0    0.123   0.533     2.626   83.690   73.889
LGA    L   136_O      L   136_B     0.616     0    0.264   1.134     2.855   90.476   84.107
LGA    K   137_O      K   137_B     1.454     0    0.040   0.617     3.192   83.690   71.587
LGA    R   138_O      R   138_B     2.140     0    0.176   0.906     6.390   70.833   52.294
LGA    E   139_O      E   139_B     1.058     0    0.078   0.686     2.414   72.976   73.069
LGA    E   140_O      E   140_B     1.500     0    0.100   0.797     2.141   77.262   73.968
LGA    E   141_O      E   141_B     1.120     0    0.189   1.006     3.579   81.548   71.746
LGA    C   142_O      C   142_B     0.914     0    0.060   0.176     1.954   90.476   86.032
LGA    L   143_O      L   143_B     0.822     0    0.248   0.214     1.676   88.214   86.012
LGA    A   144_O      A   144_B     0.996     0    0.552   0.542     2.451   81.786   78.381
LGA    A   145_O      A   145_B     0.776     0    0.264   0.256     1.807   92.857   88.857
LGA    C   146_O      C   146_B     0.441     0    0.059   0.173     0.652   97.619   96.825
LGA    S   147_O      S   147_B     0.464     0    0.091   0.707     2.407   95.238   90.952
LGA    A   148_O      A   148_B     0.436     0    0.279   0.273     1.046   95.357   96.286
LGA    A   149_O      A   149_B     1.251     0    0.139   0.201     3.747   74.167   68.000
LGA    P   150_O      P   150_B     0.731     0    0.073   0.227     1.322   90.476   89.184
LGA    M   151_O      M   151_B     0.449     0    0.036   0.577     1.463   97.619   94.107
LGA    M   152_O      M   152_B     0.475     0    0.035   0.838     2.304   95.238   83.214
LGA    V   153_O      V   153_B     0.714     0    0.033   1.007     2.875   90.476   82.041
LGA    I   154_O      I   154_B     1.146     0    0.625   1.527     3.870   72.024   73.631
LGA    N   155_O      N   155_B     0.880     0    0.604   0.532     2.931   82.143   87.560
LGA    G   156_O      G   156_B     1.555     0    0.268   0.268     2.417   70.833   70.833
LGA    H   157_O      H   157_B     0.850     0    0.070   0.241     2.086   92.857   83.571
LGA    Y   158_O      Y   158_B     0.883     0    0.023   0.435     2.710   90.476   79.127
LGA    H   159_O      H   159_B     0.593     0    0.129   0.230     1.959   95.238   85.286
LGA    E   160_O      E   160_B     0.419     0    0.036   0.144     1.048   97.619   94.762
LGA    H   161_O      H   161_B     0.740     0    0.029   1.143     2.786   90.476   82.714
LGA    L   162_O      L   162_B     0.677     0    0.031   0.087     1.060   88.214   90.536
LGA    T   163_O      T   163_B     0.960     0    0.027   0.052     1.118   85.952   85.306
LGA    K   164_O      K   164_B     1.638     0    0.054   0.543     2.558   75.000   70.265
LGA    E   165_O      E   165_B     2.519     0    0.027   1.095     2.975   60.952   63.280
LGA    K   166_O      K   166_B     2.191     0    0.042   0.886     6.345   64.762   50.794
LGA    V   167_O      V   167_B     1.691     0    0.029   0.952     3.249   75.000   67.551
LGA    D   168_O      D   168_B     1.366     0    0.026   0.117     1.710   79.286   78.214
LGA    A   169_O      A   169_B     1.574     0    0.039   0.044     1.838   75.000   74.571
LGA    L   170_O      L   170_B     1.708     0    0.043   1.415     3.578   72.857   69.167
LGA    L   171_O      L   171_B     1.146     0    0.040   0.105     1.718   79.286   79.286
LGA    D   172_O      D   172_B     1.441     0    0.687   1.379     4.682   69.762   59.881
LGA    G   173_O      G   173_B     1.168     0    0.155   0.155     1.490   85.952   85.952
LGA    L   174_O      L   174_B     1.191     0    0.053   0.867     3.131   79.286   72.500
LGA    E   175_O      E   175_B     1.849     0    0.534   1.143     8.718   79.405   47.725

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      163     652    652  100.00    1282   1282  100.00               163
SUMMARY(RMSD_GDC):     2.245          2.243                  2.879           82.460   76.164

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  175  163    4.0    158    1.16    86.196    92.740    12.578

LGA_LOCAL      RMSD:   1.156  Number of atoms:  158  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   2.319  Number of assigned atoms:  163 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   2.245  Standard rmsd on all 163 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.861788 * X  +   0.415389 * Y  +  -0.291158 * Z  +  41.082165
  Y_new =  -0.220454 * X  +   0.823625 * Y  +   0.522535 * Z  +  -4.762318
  Z_new =   0.456860 * X  +  -0.386127 * Y  +   0.801364 * Z  +   4.455760 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -0.250440 -0.474462 -0.449012   [DEG:  -14.3491  -27.1847  -25.7265 ]
ZXZ: -2.633236  0.641224  2.272484   [DEG: -150.8733   36.7394  130.2037 ]
 
# END of job
