
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  175 ( 1372),  selected  163 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  163 ( 1282),  selected  163 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:O  -ch2:B  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   163      13_B - 175_B       1.72     1.72
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   163      13_B - 175_B       1.72     1.72
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   139      35_B - 173_B       1.00     1.82
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   139      36_B - 174_B       0.99     1.83
  LCS_AVERAGE:     81.77

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  163
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     V    13_O     V    13_B      4  163  163      3    4    4    4    4   49   68  151  158  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    14_O     D    14_B      4  163  163      3    4    4    4    7   18   36   46   76   89   99  130  161  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    15_O     P    15_B      4  163  163      3    4    4   23   33   49   86   95  105  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    16_O     Q    16_B      4  163  163      3    4    4    4    4   11   14   34   57   87  150  158  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    17_O     V    17_B     79  163  163      3    5   14   38   80  142  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    18_O     V    18_B     84  163  163      3    6   19   59   69  142  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    19_O     L    19_B    119  163  163      4   28  136  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    20_O     S    20_B    119  163  163     28   96  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    21_O     D    21_B    119  163  163     15   72  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    22_O     K    22_B    119  163  163     10   72  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T    23_O     T    23_B    119  163  163     10   94  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    24_O     R    24_B    119  163  163     15   72  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    25_O     A    25_B    119  163  163     15   72  138  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    26_O     H    26_B    119  163  163     10   72  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I    27_O     I    27_B    119  163  163     18   94  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    28_O     D    28_B    119  163  163     13   72  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    29_O     H    29_B    119  163  163     15   72  137  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W    30_O     W    30_B    119  163  163     23   74  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    31_O     L    31_B    119  163  163     23   86  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    32_O     A    32_B    133  163  163     23   72  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    33_O     K    33_B    133  163  163     23   72  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    34_O     F    34_B    138  163  163     23   86  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    35_O     P    35_B    139  163  163     23   83  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    36_O     P    36_B    139  163  163     23   94  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    37_O     D    37_B    139  163  163      4   91  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    38_O     R    38_B    139  163  163     23   94  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    39_O     K    39_B    139  163  163     23   94  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    40_O     R    40_B    139  163  163     23   94  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    41_O     S    41_B    139  163  163     23   97  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    42_O     A    42_B    139  163  163     23  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    43_O     V    43_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    44_O     L    44_B    139  163  163     31  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    45_O     Q    45_B    139  163  163     23  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    46_O     G    46_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    47_O     L    47_B    139  163  163     35  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    48_O     H    48_B    139  163  163     35  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    49_O     A    49_B    139  163  163     36  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    50_O     A    50_B    139  163  163     35  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    51_O     Q    51_B    139  163  163     31  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    52_O     E    52_B    139  163  163     30  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    53_O     Q    53_B    139  163  163     30  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N    54_O     N    54_B    139  163  163     31  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    55_O     Q    55_B    139  163  163     35  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    56_O     G    56_B    139  163  163      9   56  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W    57_O     W    57_B    139  163  163     30  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    58_O     L    58_B    139  163  163     31  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T    59_O     T    59_B    139  163  163     19   83  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    60_O     D    60_B    139  163  163     22  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    61_O     E    61_B    139  163  163     20  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    62_O     L    62_B    139  163  163     18  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I    63_O     I    63_B    139  163  163     23   99  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    64_O     V    64_B    139  163  163     25  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    65_O     G    65_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    66_O     V    66_B    139  163  163     34  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    67_O     A    67_B    139  163  163     18  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    68_O     K    68_B    139  163  163     30  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y    69_O     Y    69_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    70_O     L    70_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    71_O     E    71_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    72_O     L    72_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    73_O     P    73_B    139  163  163     36  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    74_O     P    74_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    75_O     V    75_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W    76_O     W    76_B    139  163  163     18  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    77_O     A    77_B    139  163  163     25  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y    78_O     Y    78_B    139  163  163     31  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    79_O     E    79_B    139  163  163     25  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    80_O     V    80_B    139  163  163     23   83  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    81_O     A    81_B    139  163  163     18   89  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    82_O     S    82_B    139  163  163     23   94  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    83_O     F    83_B    139  163  163     23   93  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y    84_O     Y    84_B    139  163  163     31  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    85_O     S    85_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     M    86_O     M    86_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    87_O     F    87_B    139  163  163     31  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    88_O     E    88_B    139  163  163     31  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T    89_O     T    89_B    139  163  163     22  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    90_O     E    90_B    139  163  163     22   72  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    91_O     K    91_B    139  163  163     22   96  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    92_O     V    92_B    139  163  163      9   83  139  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    93_O     G    93_B    139  163  163     29  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    94_O     R    94_B    139  163  163      4   91  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    95_O     H    95_B    139  163  163     30  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N    96_O     N    96_B    139  163  163     24   92  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    97_O     V    97_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    98_O     A    98_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    99_O     F    99_B    139  163  163     26  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   100_O     C   100_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T   101_O     T   101_B    139  163  163      6  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N   102_O     N   102_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I   103_O     I   103_B    139  163  163     28  100  138  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S   104_O     S   104_B    139  163  163     23  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   105_O     C   105_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W   106_O     W   106_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   107_O     L   107_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N   108_O     N   108_B    139  163  163     28  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   109_O     G   109_B    139  163  163     25  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   110_O     A   110_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   111_O     E   111_B    139  163  163     29  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   112_O     D   112_B    139  163  163     18  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   113_O     L   113_B    139  163  163     23  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   114_O     L   114_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   115_O     A   115_B    139  163  163     20  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   116_O     H   116_B    139  163  163     17  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   117_O     A   117_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   118_O     E   118_B    139  163  163     33  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   119_O     K   119_B    139  163  163     18   87  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   120_O     K   120_B    139  163  163     33  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   121_O     L   121_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   122_O     G   122_B    139  163  163     24  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   123_O     C   123_B    139  163  163     33  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   124_O     K   124_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   125_O     L   125_B    139  163  163      9  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   126_O     G   126_B    139  163  163     14   91  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q   127_O     Q   127_B    139  163  163     18  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S   128_O     S   128_B    139  163  163     11  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T   129_O     T   129_B    139  163  163     33  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   130_O     A   130_B    139  163  163     29  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   131_O     D   131_B    139  163  163     33  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   132_O     G   132_B    139  163  163     34  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R   133_O     R   133_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V   134_O     V   134_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y   135_O     Y   135_B    139  163  163     24  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   136_O     L   136_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   137_O     K   137_B    139  163  163      6   99  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R   138_O     R   138_B    139  163  163      4   32   86  152  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   139_O     E   139_B    139  163  163      0   13   68  132  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   140_O     E   140_B    139  163  163      3    3    4    5  113  124  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   141_O     E   141_B    139  163  163      6   83  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   142_O     C   142_B    139  163  163     35  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   143_O     L   143_B    139  163  163     31  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   144_O     A   144_B    139  163  163     32  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   145_O     A   145_B    139  163  163     35  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   146_O     C   146_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S   147_O     S   147_B    139  163  163     35  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   148_O     A   148_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   149_O     A   149_B    139  163  163      3   90  138  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P   150_O     P   150_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     M   151_O     M   151_B    139  163  163     23  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     M   152_O     M   152_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V   153_O     V   153_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I   154_O     I   154_B    139  163  163     28  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N   155_O     N   155_B    139  163  163     31  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   156_O     G   156_B    139  163  163      3   48  138  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   157_O     H   157_B    139  163  163     20   95  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y   158_O     Y   158_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   159_O     H   159_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   160_O     E   160_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   161_O     H   161_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   162_O     L   162_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T   163_O     T   163_B    139  163  163     37  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   164_O     K   164_B    139  163  163      6   99  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   165_O     E   165_B    139  163  163      6   65  132  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   166_O     K   166_B    139  163  163      7   65  132  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V   167_O     V   167_B    139  163  163      7   83  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   168_O     D   168_B    139  163  163      7   91  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   169_O     A   169_B    139  163  163     26  100  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   170_O     L   170_B    139  163  163      7   91  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   171_O     L   171_B    139  163  163      7   99  140  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   172_O     D   172_B    139  163  163      7   72  139  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   173_O     G   173_B    139  163  163     22   72  139  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   174_O     L   174_B    139  163  163     22   72  134  153  155  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   175_O     E   175_B    136  163  163      3   23   69  120  150  156  158  159  159  160  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  93.92  (  81.77  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     37    100    140    153    155    156    158    159    159    160    161    161    162    163    163    163    163    163    163    163 
GDT PERCENT_AT  22.70  61.35  85.89  93.87  95.09  95.71  96.93  97.55  97.55  98.16  98.77  98.77  99.39 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.35   0.65   0.94   1.03   1.06   1.09   1.16   1.20   1.20   1.32   1.45   1.45   1.57   1.72   1.72   1.72   1.72   1.72   1.72   1.72
GDT RMS_ALL_AT   1.82   1.86   1.76   1.76   1.75   1.76   1.75   1.75   1.75   1.74   1.73   1.73   1.72   1.72   1.72   1.72   1.72   1.72   1.72   1.72

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  D    14_O      D    14_B
#   possible swapping detected:  D    28_O      D    28_B
#   possible swapping detected:  F    34_O      F    34_B
#   possible swapping detected:  E    61_O      E    61_B
#   possible swapping detected:  F    83_O      F    83_B
#   possible swapping detected:  Y    84_O      Y    84_B
#   possible swapping detected:  E   111_O      E   111_B
#   possible swapping detected:  E   118_O      E   118_B
#   possible swapping detected:  Y   135_O      Y   135_B
#   possible swapping detected:  E   139_O      E   139_B
#   possible swapping detected:  Y   158_O      Y   158_B
#   possible swapping detected:  E   165_O      E   165_B

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    V    13_O      V    13_B     7.328     0    0.587   0.605     9.222    7.857    5.782
LGA    D    14_O      D    14_B     9.498     0    0.118   1.378    15.348    4.048    2.024
LGA    P    15_O      P    15_B     7.832     0    0.659   0.597    10.497    5.476    3.537
LGA    Q    16_O      Q    16_B     8.260     0    0.568   1.436    11.890   10.595    4.709
LGA    V    17_O      V    17_B     3.539     0    0.453   0.953     4.820   45.476   44.762
LGA    V    18_O      V    18_B     3.688     0    0.195   1.157     7.375   50.238   39.932
LGA    L    19_O      L    19_B     1.522     0    0.071   1.062     2.619   71.071   70.238
LGA    S    20_O      S    20_B     0.766     0    0.110   0.749     2.846   85.952   80.397
LGA    D    21_O      D    21_B     1.824     0    0.057   0.713     3.489   72.976   69.048
LGA    K    22_O      K    22_B     1.761     0    0.037   0.893     8.049   72.857   49.947
LGA    T    23_O      T    23_B     1.035     0    0.030   0.133     1.233   81.429   86.667
LGA    R    24_O      R    24_B     1.636     0    0.131   1.494     6.177   77.143   60.303
LGA    A    25_O      A    25_B     1.965     0    0.037   0.039     2.153   70.833   71.238
LGA    H    26_O      H    26_B     1.728     0    0.028   1.072     3.739   75.000   68.476
LGA    I    27_O      I    27_B     1.029     0    0.037   1.188     3.087   81.429   73.512
LGA    D    28_O      D    28_B     1.760     0    0.027   1.150     2.824   75.000   70.000
LGA    H    29_O      H    29_B     2.055     0    0.047   0.203     4.161   70.833   58.619
LGA    W    30_O      W    30_B     1.490     0    0.038   0.392     2.646   79.286   70.170
LGA    L    31_O      L    31_B     1.296     0    0.033   0.260     1.494   81.429   82.560
LGA    A    32_O      A    32_B     1.716     0    0.045   0.044     1.875   72.857   72.857
LGA    K    33_O      K    33_B     1.729     0    0.105   0.862     4.949   70.833   62.487
LGA    F    34_O      F    34_B     1.357     0    0.061   0.225     1.436   81.429   81.429
LGA    P    35_O      P    35_B     1.495     0    0.046   0.092     1.702   81.429   77.755
LGA    P    36_O      P    36_B     1.142     0    0.063   0.087     1.751   85.952   81.565
LGA    D    37_O      D    37_B     1.154     0    0.273   0.863     2.825   81.548   72.262
LGA    R    38_O      R    38_B     1.074     0    0.162   1.340     5.259   83.690   68.355
LGA    K    39_O      K    39_B     1.118     0    0.066   0.622     2.920   83.690   76.032
LGA    R    40_O      R    40_B     1.179     0    0.106   1.220     5.612   81.429   68.312
LGA    S    41_O      S    41_B     0.945     0    0.035   0.675     2.963   88.214   83.413
LGA    A    42_O      A    42_B     0.793     0    0.116   0.111     1.039   90.476   88.667
LGA    V    43_O      V    43_B     0.538     0    0.064   0.148     1.067   90.476   89.184
LGA    L    44_O      L    44_B     0.721     0    0.050   1.082     2.815   90.476   84.107
LGA    Q    45_O      Q    45_B     1.052     0    0.058   0.446     3.549   88.214   72.169
LGA    G    46_O      G    46_B     0.535     0    0.018   0.018     0.789   90.476   90.476
LGA    L    47_O      L    47_B     0.757     0    0.031   0.058     0.954   90.476   90.476
LGA    H    48_O      H    48_B     0.812     0    0.048   1.134     2.981   90.476   83.667
LGA    A    49_O      A    49_B     0.815     0    0.047   0.048     0.978   90.476   90.476
LGA    A    50_O      A    50_B     0.784     0    0.069   0.068     1.196   88.214   88.667
LGA    Q    51_O      Q    51_B     1.033     0    0.054   0.130     1.406   83.690   83.439
LGA    E    52_O      E    52_B     1.201     0    0.043   0.656     3.702   81.429   69.947
LGA    Q    53_O      Q    53_B     1.155     0    0.058   1.153     6.645   81.429   59.259
LGA    N    54_O      N    54_B     1.088     0    0.405   0.824     2.964   73.214   74.167
LGA    Q    55_O      Q    55_B     0.798     0    0.332   1.149     3.450   86.429   77.302
LGA    G    56_O      G    56_B     1.403     0    0.163   0.163     1.403   85.952   85.952
LGA    W    57_O      W    57_B     1.031     0    0.085   0.187     1.405   83.690   84.014
LGA    L    58_O      L    58_B     1.157     0    0.057   1.305     3.492   79.286   74.345
LGA    T    59_O      T    59_B     1.389     0    0.096   1.068     3.793   85.952   71.905
LGA    D    60_O      D    60_B     1.039     0    0.038   0.429     1.856   85.952   82.619
LGA    E    61_O      E    61_B     0.814     0    0.098   0.681     1.518   88.214   84.497
LGA    L    62_O      L    62_B     0.998     0    0.049   1.426     4.800   90.476   70.179
LGA    I    63_O      I    63_B     1.120     0    0.032   0.122     1.849   85.952   80.476
LGA    V    64_O      V    64_B     0.633     0    0.029   0.074     0.720   90.476   91.837
LGA    G    65_O      G    65_B     0.371     0    0.031   0.031     0.483  100.000  100.000
LGA    V    66_O      V    66_B     0.644     0    0.045   0.955     2.788   90.476   80.952
LGA    A    67_O      A    67_B     0.776     0    0.051   0.070     1.007   90.476   88.667
LGA    K    68_O      K    68_B     0.460     0    0.040   1.054     4.345   97.619   75.026
LGA    Y    69_O      Y    69_B     0.623     0    0.059   0.259     1.289   90.476   88.968
LGA    L    70_O      L    70_B     0.671     0    0.123   0.161     1.553   92.857   87.202
LGA    E    71_O      E    71_B     0.439     0    0.034   0.667     2.342   97.619   92.910
LGA    L    72_O      L    72_B     0.560     0    0.063   0.948     3.578   95.238   85.833
LGA    P    73_O      P    73_B     0.339     0    0.171   0.197     0.773  100.000   95.918
LGA    P    74_O      P    74_B     0.524     0    0.052   0.065     0.644   90.476   91.837
LGA    V    75_O      V    75_B     0.577     0    0.036   0.220     0.708   90.476   90.476
LGA    W    76_O      W    76_B     0.839     0    0.041   1.556     5.216   90.476   60.272
LGA    A    77_O      A    77_B     0.877     0    0.035   0.051     0.902   90.476   90.476
LGA    Y    78_O      Y    78_B     0.908     0    0.032   0.159     1.379   88.214   85.198
LGA    E    79_O      E    79_B     0.990     0    0.033   0.318     1.222   85.952   87.460
LGA    V    80_O      V    80_B     1.343     0    0.044   0.159     1.568   79.286   80.204
LGA    A    81_O      A    81_B     1.373     0    0.022   0.037     1.500   79.286   79.714
LGA    S    82_O      S    82_B     1.181     0    0.022   0.225     1.851   81.429   80.000
LGA    F    83_O      F    83_B     1.217     0    0.019   0.181     1.471   81.429   81.429
LGA    Y    84_O      Y    84_B     0.566     0    0.021   0.226     1.269   90.476   90.595
LGA    S    85_O      S    85_B     0.593     0    0.032   0.197     1.171   92.857   90.556
LGA    M    86_O      M    86_B     0.635     0    0.131   0.955     2.593   90.476   80.893
LGA    F    87_O      F    87_B     0.787     0    0.056   0.267     0.973   90.476   90.476
LGA    E    88_O      E    88_B     0.991     0    0.038   1.183     5.223   90.476   74.339
LGA    T    89_O      T    89_B     1.083     0    0.112   1.028     2.013   81.429   77.823
LGA    E    90_O      E    90_B     1.481     0    0.064   0.886     3.736   81.429   65.820
LGA    K    91_O      K    91_B     1.251     0    0.050   1.045     4.152   81.429   72.751
LGA    V    92_O      V    92_B     1.483     0    0.037   0.066     2.246   83.690   77.891
LGA    G    93_O      G    93_B     0.914     0    0.082   0.082     1.269   83.690   83.690
LGA    R    94_O      R    94_B     1.292     0    0.070   0.946     2.826   83.690   70.303
LGA    H    95_O      H    95_B     0.677     0    0.034   1.150     2.725   88.214   81.810
LGA    N    96_O      N    96_B     1.035     0    0.057   0.513     3.131   88.214   79.821
LGA    V    97_O      V    97_B     0.554     0    0.058   1.034     3.398   95.238   83.742
LGA    A    98_O      A    98_B     0.474     0    0.047   0.055     0.513   97.619   98.095
LGA    F    99_O      F    99_B     0.609     0    0.058   1.264     6.990   90.476   60.260
LGA    C   100_O      C   100_B     0.522     0    0.038   0.045     1.030   88.214   88.968
LGA    T   101_O      T   101_B     1.062     0    0.168   0.239     1.883   81.548   81.497
LGA    N   102_O      N   102_B     0.486     0    0.063   0.191     1.671   90.595   89.524
LGA    I   103_O      I   103_B     1.328     0    0.036   1.513     6.249   81.429   66.786
LGA    S   104_O      S   104_B     1.147     0    0.030   0.773     1.638   83.690   81.508
LGA    C   105_O      C   105_B     0.815     0    0.042   0.135     0.990   90.476   90.476
LGA    W   106_O      W   106_B     0.660     0    0.030   0.222     1.619   90.476   85.986
LGA    L   107_O      L   107_B     0.665     0    0.160   0.224     1.081   88.214   90.536
LGA    N   108_O      N   108_B     0.575     0    0.307   1.121     4.186   88.214   79.345
LGA    G   109_O      G   109_B     0.780     0    0.145   0.145     0.815   95.238   95.238
LGA    A   110_O      A   110_B     0.510     0    0.075   0.085     0.835   95.238   94.286
LGA    E   111_O      E   111_B     0.840     0    0.038   0.918     5.516   90.476   71.640
LGA    D   112_O      D   112_B     0.850     0    0.047   1.210     5.523   90.476   70.595
LGA    L   113_O      L   113_B     0.651     0    0.033   1.314     6.047   95.238   70.774
LGA    L   114_O      L   114_B     0.737     0    0.049   1.213     3.235   92.857   80.417
LGA    A   115_O      A   115_B     0.981     0    0.039   0.041     1.455   90.476   88.667
LGA    H   116_O      H   116_B     0.849     0    0.034   1.020     3.759   90.476   73.333
LGA    A   117_O      A   117_B     0.325     0    0.038   0.039     0.754  100.000   98.095
LGA    E   118_O      E   118_B     0.666     0    0.092   0.787     4.136   90.595   71.905
LGA    K   119_O      K   119_B     1.231     0    0.059   0.904     3.085   88.214   72.751
LGA    K   120_O      K   120_B     0.628     0    0.073   1.314     4.552   92.857   76.032
LGA    L   121_O      L   121_B     0.138     0    0.111   0.186     0.714   97.619   96.429
LGA    G   122_O      G   122_B     0.815     0    0.091   0.091     0.815   90.476   90.476
LGA    C   123_O      C   123_B     0.507     0    0.074   0.889     2.539   88.214   83.413
LGA    K   124_O      K   124_B     0.389     0    0.061   0.855     3.727   95.238   82.169
LGA    L   125_O      L   125_B     0.877     0    0.037   1.329     3.062   85.952   75.655
LGA    G   126_O      G   126_B     1.243     0    0.105   0.105     1.466   81.429   81.429
LGA    Q   127_O      Q   127_B     1.075     0    0.066   0.521     2.850   81.429   72.487
LGA    S   128_O      S   128_B     0.954     0    0.050   0.730     3.050   88.214   80.714
LGA    T   129_O      T   129_B     0.627     0    0.063   0.890     2.513   90.476   83.197
LGA    A   130_O      A   130_B     0.998     0    0.094   0.093     1.461   90.476   88.667
LGA    D   131_O      D   131_B     0.751     0    0.195   0.378     1.900   92.857   89.464
LGA    G   132_O      G   132_B     0.433     0    0.055   0.055     0.649   97.619   97.619
LGA    R   133_O      R   133_B     0.330     0    0.017   1.190     6.428  100.000   73.723
LGA    V   134_O      V   134_B     0.320     0    0.062   0.090     0.487  100.000  100.000
LGA    Y   135_O      Y   135_B     0.771     0    0.142   0.651     2.930   88.214   75.516
LGA    L   136_O      L   136_B     0.511     0    0.178   0.175     0.876   95.238   92.857
LGA    K   137_O      K   137_B     1.078     0    0.147   1.212     3.958   83.690   73.492
LGA    R   138_O      R   138_B     2.345     0    0.571   1.398     5.214   53.452   58.139
LGA    E   139_O      E   139_B     2.752     0    0.122   0.951     9.489   62.976   35.979
LGA    E   140_O      E   140_B     3.850     0    0.695   1.062    11.126   46.667   23.016
LGA    E   141_O      E   141_B     1.193     0    0.077   0.818     3.738   81.548   71.111
LGA    C   142_O      C   142_B     0.490     0    0.046   0.132     0.768   97.619   96.825
LGA    L   143_O      L   143_B     0.766     0    0.149   0.135     1.883   92.857   85.000
LGA    A   144_O      A   144_B     0.996     0    0.127   0.121     1.839   83.810   83.333
LGA    A   145_O      A   145_B     0.622     0    0.125   0.117     0.821   90.476   90.476
LGA    C   146_O      C   146_B     0.663     0    0.052   0.209     1.508   90.476   87.540
LGA    S   147_O      S   147_B     0.988     0    0.053   0.699     2.961   88.214   81.905
LGA    A   148_O      A   148_B     0.404     0    0.229   0.214     1.506   88.452   87.048
LGA    A   149_O      A   149_B     1.446     0    0.214   0.324     3.661   75.833   69.333
LGA    P   150_O      P   150_B     0.756     0    0.073   0.424     1.694   90.476   86.667
LGA    M   151_O      M   151_B     0.993     0    0.074   1.274     5.831   90.476   74.345
LGA    M   152_O      M   152_B     0.394     0    0.020   0.760     2.094  100.000   93.214
LGA    V   153_O      V   153_B     0.424     0    0.031   0.124     0.591  100.000   95.918
LGA    I   154_O      I   154_B     0.690     0    0.049   0.589     2.038   90.476   87.262
LGA    N   155_O      N   155_B     0.621     0    0.635   0.601     2.979   82.143   87.500
LGA    G   156_O      G   156_B     1.666     0    0.133   0.133     1.666   79.405   79.405
LGA    H   157_O      H   157_B     1.020     0    0.041   1.143     3.727   88.333   67.762
LGA    Y   158_O      Y   158_B     0.423     0    0.074   0.728     3.769   95.238   79.008
LGA    H   159_O      H   159_B     0.426     0    0.111   0.162     1.426   97.619   89.714
LGA    E   160_O      E   160_B     0.477     0    0.034   0.179     1.710  100.000   89.788
LGA    H   161_O      H   161_B     0.847     0    0.032   1.122     3.149   90.476   81.143
LGA    L   162_O      L   162_B     0.713     0    0.035   0.078     0.978   90.476   91.667
LGA    T   163_O      T   163_B     0.556     0    0.045   0.077     0.751   90.476   91.837
LGA    K   164_O      K   164_B     1.167     0    0.043   1.089     4.540   83.690   72.434
LGA    E   165_O      E   165_B     2.014     0    0.035   0.839     2.693   68.810   69.365
LGA    K   166_O      K   166_B     1.796     0    0.047   0.597     3.147   72.857   67.672
LGA    V   167_O      V   167_B     1.366     0    0.022   0.149     1.979   81.548   79.048
LGA    D   168_O      D   168_B     1.087     0    0.022   0.974     4.981   85.952   67.143
LGA    A   169_O      A   169_B     0.807     0    0.030   0.037     1.061   90.476   88.667
LGA    L   170_O      L   170_B     1.186     0    0.030   1.018     2.912   83.690   82.976
LGA    L   171_O      L   171_B     1.122     0    0.049   0.102     1.570   81.548   81.488
LGA    D   172_O      D   172_B     1.747     0    0.084   0.155     2.340   72.857   68.810
LGA    G   173_O      G   173_B     1.629     0    0.123   0.123     1.629   77.143   77.143
LGA    L   174_O      L   174_B     1.705     0    0.594   0.766     4.045   70.833   64.405
LGA    E   175_O      E   175_B     3.234     0    0.560   0.785    10.146   34.881   21.270

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      163     652    652  100.00    1282   1282  100.00               163
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.718          1.722                  2.512           83.610   77.219

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  175  163    4.0    159    1.20    88.190    94.266    12.275

LGA_LOCAL      RMSD:   1.195  Number of atoms:  159  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.753  Number of assigned atoms:  163 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.718  Standard rmsd on all 163 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.440822 * X  +  -0.051150 * Y  +  -0.896136 * Z  + -56.822979
  Y_new =  -0.732036 * X  +  -0.557255 * Y  +   0.391906 * Z  +  26.151655
  Z_new =  -0.519423 * X  +   0.828764 * Y  +   0.208206 * Z  +   1.087129 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -2.112822  0.546175  1.324665   [DEG: -121.0558   31.2935   75.8977 ]
ZXZ: -1.983063  1.361056 -0.559852   [DEG: -113.6211   77.9827  -32.0772 ]
 
# END of job
