
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  175 ( 1372),  selected  163 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  163 ( 1282),  selected  163 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:O  -ch2:B  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   163      13_B - 175_B       2.27     2.27
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   161      15_B - 175_B       1.93     2.28
  LCS_AVERAGE:     97.59

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    86      38_B - 123_B       1.00     2.46
  LCS_AVERAGE:     45.17

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  163
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     V    13_O     V    13_B      3    4  163      0    3    3    3    6   13   17   24   28   33   56   68  102  124  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     D    14_O     D    14_B      3    4  163      3    3    3    3    4    4   11   11   18   23   33   90  152  156  159  160  162  162  163  163 
LCS_GDT     P    15_O     P    15_B      3  161  163      3    3    3   20   28   41   52   60   64   76  104  130  152  156  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     Q    16_O     Q    16_B      3  161  163      3    3    3    5   30   50   56   94   99  112  132  142  152  157  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     V    17_O     V    17_B      3  161  163      3    3   13   26   44   75   99  155  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     V    18_O     V    18_B     18  161  163      4   46  110  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     L    19_O     L    19_B     18  161  163     12   68  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     S    20_O     S    20_B     18  161  163     12   49  119  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     D    21_O     D    21_B     18  161  163     12   35   78  136  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     K    22_O     K    22_B     18  161  163     12   32   61  100  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     T    23_O     T    23_B     18  161  163     12   31   80  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     R    24_O     R    24_B     18  161  163     11   31   98  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     A    25_O     A    25_B     18  161  163     12   41   98  144  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     H    26_O     H    26_B     18  161  163     12   40   93  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     I    27_O     I    27_B     18  161  163     16   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     D    28_O     D    28_B     18  161  163     12   68  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     H    29_O     H    29_B     18  161  163     12   41  116  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     W    30_O     W    30_B     18  161  163     12   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     L    31_O     L    31_B     18  161  163     25   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     A    32_O     A    32_B     18  161  163     21   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     K    33_O     K    33_B     18  161  163     18   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     F    34_O     F    34_B     18  161  163     12   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     P    35_O     P    35_B     18  161  163      4   24   87  140  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     P    36_O     P    36_B     58  161  163      4    6   12   43   71  128  146  157  158  159  159  159  159  159  159  159  161  162  163  163 
LCS_GDT     D    37_O     D    37_B     85  161  163      8   51   91  137  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     R    38_O     R    38_B     86  161  163     24   71  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     K    39_O     K    39_B     86  161  163     10   58  121  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     R    40_O     R    40_B     86  161  163      9   71  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     S    41_O     S    41_B     86  161  163     33   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     A    42_O     A    42_B     86  161  163     33   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     V    43_O     V    43_B     86  161  163     33   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     L    44_O     L    44_B     86  161  163     33   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     Q    45_O     Q    45_B     86  161  163     33   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     G    46_O     G    46_B     86  161  163     33   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     L    47_O     L    47_B     86  161  163     33   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     H    48_O     H    48_B     86  161  163     33   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     A    49_O     A    49_B     86  161  163     33   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     A    50_O     A    50_B     86  161  163     33   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     Q    51_O     Q    51_B     86  161  163     28   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     E    52_O     E    52_B     86  161  163     18   71  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     Q    53_O     Q    53_B     86  161  163      8   40  110  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     N    54_O     N    54_B     86  161  163      6   51  118  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     Q    55_O     Q    55_B     86  161  163      3   24   72  112  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     G    56_O     G    56_B     86  161  163     10   51  119  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     W    57_O     W    57_B     86  161  163     30   72  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     L    58_O     L    58_B     86  161  163     33   72  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     T    59_O     T    59_B     86  161  163     33   72  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     D    60_O     D    60_B     86  161  163     28   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     E    61_O     E    61_B     86  161  163     31   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     L    62_O     L    62_B     86  161  163     31   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     I    63_O     I    63_B     86  161  163     24   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     V    64_O     V    64_B     86  161  163     24   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     G    65_O     G    65_B     86  161  163     30   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     V    66_O     V    66_B     86  161  163     30   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     A    67_O     A    67_B     86  161  163     24   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     K    68_O     K    68_B     86  161  163      7   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     Y    69_O     Y    69_B     86  161  163     27   70  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     L    70_O     L    70_B     86  161  163     31   71  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     E    71_O     E    71_B     86  161  163     33   71  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     L    72_O     L    72_B     86  161  163     32   71  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     P    73_O     P    73_B     86  161  163     33   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     P    74_O     P    74_B     86  161  163     33   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     V    75_O     V    75_B     86  161  163     33   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     W    76_O     W    76_B     86  161  163     33   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     A    77_O     A    77_B     86  161  163     33   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     Y    78_O     Y    78_B     86  161  163     33   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     E    79_O     E    79_B     86  161  163     33   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     V    80_O     V    80_B     86  161  163     33   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     A    81_O     A    81_B     86  161  163     33   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     S    82_O     S    82_B     86  161  163     33   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     F    83_O     F    83_B     86  161  163     33   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     Y    84_O     Y    84_B     86  161  163     33   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     S    85_O     S    85_B     86  161  163     18   69  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     M    86_O     M    86_B     86  161  163     30   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     F    87_O     F    87_B     86  161  163     33   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     E    88_O     E    88_B     86  161  163     33   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     T    89_O     T    89_B     86  161  163     33   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     E    90_O     E    90_B     86  161  163      9   70  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     K    91_O     K    91_B     86  161  163      7   65  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     V    92_O     V    92_B     86  161  163     18   65  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     G    93_O     G    93_B     86  161  163     13   68  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     R    94_O     R    94_B     86  161  163     19   62  113  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     H    95_O     H    95_B     86  161  163     28   68  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     N    96_O     N    96_B     86  161  163     22   62  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     V    97_O     V    97_B     86  161  163     19   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     A    98_O     A    98_B     86  161  163     33   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     F    99_O     F    99_B     86  161  163     16   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     C   100_O     C   100_B     86  161  163     16   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     T   101_O     T   101_B     86  161  163      5   52  118  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     N   102_O     N   102_B     86  161  163     22   68  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     I   103_O     I   103_B     86  161  163     28   68  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     S   104_O     S   104_B     86  161  163     17   71  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     C   105_O     C   105_B     86  161  163     28   71  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     W   106_O     W   106_B     86  161  163     28   68  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     L   107_O     L   107_B     86  161  163     28   68  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     N   108_O     N   108_B     86  161  163     22   68  121  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     G   109_O     G   109_B     86  161  163     22   68  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     A   110_O     A   110_B     86  161  163     28   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     E   111_O     E   111_B     86  161  163     28   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     D   112_O     D   112_B     86  161  163     20   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     L   113_O     L   113_B     86  161  163     12   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     L   114_O     L   114_B     86  161  163     28   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     A   115_O     A   115_B     86  161  163     23   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     H   116_O     H   116_B     86  161  163     27   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     A   117_O     A   117_B     86  161  163     28   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     E   118_O     E   118_B     86  161  163     22   68  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     K   119_O     K   119_B     86  161  163     18   61  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     K   120_O     K   120_B     86  161  163     23   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     L   121_O     L   121_B     86  161  163     28   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     G   122_O     G   122_B     86  161  163     18   62  118  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     C   123_O     C   123_B     86  161  163     22   68  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     K   124_O     K   124_B     85  161  163     11   68  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     L   125_O     L   125_B     81  161  163      7   63  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     G   126_O     G   126_B     81  161  163     27   62  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     Q   127_O     Q   127_B     81  161  163      7   62  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     S   128_O     S   128_B     81  161  163     11   68  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     T   129_O     T   129_B     81  161  163     28   72  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     A   130_O     A   130_B     81  161  163     24   68  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     D   131_O     D   131_B     81  161  163      6   70  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     G   132_O     G   132_B     81  161  163     28   68  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     R   133_O     R   133_B     81  161  163     28   68  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     V   134_O     V   134_B     81  161  163     28   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     Y   135_O     Y   135_B     81  161  163     22   68  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     L   136_O     L   136_B     81  161  163     22   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     K   137_O     K   137_B     81  161  163     18   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     R   138_O     R   138_B     81  161  163      3    5   30  120  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     E   139_O     E   139_B     81  161  163      3   13   94  141  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     E   140_O     E   140_B     81  161  163      3    3    4   65   99  135  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     E   141_O     E   141_B     81  161  163      6   62  119  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     C   142_O     C   142_B     81  161  163     25   69  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     L   143_O     L   143_B     81  161  163     23   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     A   144_O     A   144_B     81  161  163     28   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     A   145_O     A   145_B     81  161  163     25   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     C   146_O     C   146_B     81  161  163     28   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     S   147_O     S   147_B     81  161  163     25   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     A   148_O     A   148_B     81  161  163     21   72  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     A   149_O     A   149_B     81  161  163      3   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     P   150_O     P   150_B     81  161  163     28   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     M   151_O     M   151_B     81  161  163     17   72  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     M   152_O     M   152_B     81  161  163     33   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     V   153_O     V   153_B     81  161  163     28   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     I   154_O     I   154_B     81  161  163     28   68  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     N   155_O     N   155_B     81  161  163     28   68  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     G   156_O     G   156_B     81  161  163      3   49   88  138  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     H   157_O     H   157_B     81  161  163     22   62  118  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     Y   158_O     Y   158_B     81  161  163     28   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     H   159_O     H   159_B     81  161  163     33   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     E   160_O     E   160_B     81  161  163     33   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     H   161_O     H   161_B     81  161  163     33   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     L   162_O     L   162_B     81  161  163     32   73  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     T   163_O     T   163_B     81  161  163     28   72  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     K   164_O     K   164_B     81  161  163     28   62  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     E   165_O     E   165_B     81  161  163      5   35   86  133  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     K   166_O     K   166_B     81  161  163      6   60  105  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     V   167_O     V   167_B     81  161  163      6   60  120  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     D   168_O     D   168_B     81  161  163     11   65  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     A   169_O     A   169_B     81  161  163     21   62  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     L   170_O     L   170_B     81  161  163      6   62  113  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     L   171_O     L   171_B     81  161  163      6   68  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     D   172_O     D   172_B     81  161  163      6   70  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     G   173_O     G   173_B     81  161  163      4   72  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     L   174_O     L   174_B     35  161  163     12   72  122  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_GDT     E   175_O     E   175_B     35  161  163      3   60  119  145  153  156  156  157  158  159  159  159  159  159  159  161  162  162  163  163 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  80.92  (  45.17   97.59  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     33     73    122    145    153    156    156    157    158    159    159    159    159    159    159    161    162    162    163    163 
GDT PERCENT_AT  20.25  44.79  74.85  88.96  93.87  95.71  95.71  96.32  96.93  97.55  97.55  97.55  97.55  97.55  97.55  98.77  99.39  99.39 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.36   0.72   0.98   1.15   1.25   1.29   1.29   1.34   1.41   1.47   1.47   1.47   1.47   1.47   1.47   2.04   2.23   2.09   2.27   2.27
GDT RMS_ALL_AT   2.55   2.32   2.34   2.33   2.33   2.33   2.33   2.33   2.34   2.32   2.32   2.32   2.32   2.32   2.32   2.28   2.27   2.28   2.27   2.27

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  F    34_O      F    34_B
#   possible swapping detected:  E    52_O      E    52_B
#   possible swapping detected:  F    83_O      F    83_B
#   possible swapping detected:  E    88_O      E    88_B
#   possible swapping detected:  F    99_O      F    99_B
#   possible swapping detected:  E   139_O      E   139_B
#   possible swapping detected:  E   140_O      E   140_B
#   possible swapping detected:  E   141_O      E   141_B
#   possible swapping detected:  Y   158_O      Y   158_B
#   possible swapping detected:  E   165_O      E   165_B

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    V    13_O      V    13_B    10.734     0    0.331   0.367    12.363    0.000    0.680
LGA    D    14_O      D    14_B    12.405     0    0.596   0.790    18.750    0.000    0.000
LGA    P    15_O      P    15_B    12.266     0    0.635   0.518    15.809    0.000    0.000
LGA    Q    16_O      Q    16_B    10.881     0    0.681   1.212    14.427    0.357    0.159
LGA    V    17_O      V    17_B     5.754     0    0.606   1.508     8.100   24.048   18.776
LGA    V    18_O      V    18_B     1.994     0    0.704   1.271     5.927   70.833   55.034
LGA    L    19_O      L    19_B     1.135     0    0.122   0.994     3.083   79.286   77.619
LGA    S    20_O      S    20_B     1.720     0    0.077   0.549     3.810   77.143   70.794
LGA    D    21_O      D    21_B     2.627     0    0.032   0.900     2.878   59.048   68.393
LGA    K    22_O      K    22_B     2.908     0    0.037   0.713     5.337   57.143   47.619
LGA    T    23_O      T    23_B     1.831     0    0.042   0.146     2.147   70.833   74.150
LGA    R    24_O      R    24_B     1.876     0    0.147   1.215     5.242   75.000   60.000
LGA    A    25_O      A    25_B     2.121     0    0.037   0.039     2.282   66.786   66.381
LGA    H    26_O      H    26_B     1.928     0    0.026   1.190     7.313   72.857   46.429
LGA    I    27_O      I    27_B     0.941     0    0.031   1.209     3.042   88.214   75.952
LGA    D    28_O      D    28_B     1.538     0    0.032   0.145     2.640   75.000   69.940
LGA    H    29_O      H    29_B     1.811     0    0.037   0.243     4.184   75.000   59.571
LGA    W    30_O      W    30_B     1.012     0    0.031   0.142     2.214   85.952   76.735
LGA    L    31_O      L    31_B     0.397     0    0.053   0.817     1.759   97.619   89.643
LGA    A    32_O      A    32_B     0.894     0    0.061   0.059     1.196   90.476   88.667
LGA    K    33_O      K    33_B     1.248     0    0.119   0.828     6.047   81.548   64.233
LGA    F    34_O      F    34_B     1.201     0    0.126   0.324     1.338   85.952   83.074
LGA    P    35_O      P    35_B     2.385     0    0.699   0.679     4.245   57.500   49.660
LGA    P    36_O      P    36_B     5.815     0    0.670   0.773     8.022   30.357   21.769
LGA    D    37_O      D    37_B     2.719     0    0.179   0.272     3.657   61.548   62.321
LGA    R    38_O      R    38_B     1.399     0    0.512   0.865     5.446   69.405   59.740
LGA    K    39_O      K    39_B     1.746     0    0.088   0.782     4.770   77.143   64.392
LGA    R    40_O      R    40_B     1.278     0    0.056   1.328     8.120   83.810   57.316
LGA    S    41_O      S    41_B     0.683     0    0.039   0.688     2.137   90.476   84.683
LGA    A    42_O      A    42_B     0.522     0    0.139   0.137     0.912   90.476   90.476
LGA    V    43_O      V    43_B     0.596     0    0.064   0.997     2.535   90.476   83.197
LGA    L    44_O      L    44_B     0.623     0    0.024   1.168     2.718   90.476   83.095
LGA    Q    45_O      Q    45_B     0.948     0    0.058   1.314     6.993   88.214   66.032
LGA    G    46_O      G    46_B     0.788     0    0.029   0.029     0.808   90.476   90.476
LGA    L    47_O      L    47_B     0.573     0    0.042   0.948     3.149   90.476   84.286
LGA    H    48_O      H    48_B     0.646     0    0.047   1.155     3.252   90.476   81.286
LGA    A    49_O      A    49_B     0.875     0    0.031   0.043     0.982   90.476   90.476
LGA    A    50_O      A    50_B     0.745     0    0.091   0.090     1.319   88.214   88.667
LGA    Q    51_O      Q    51_B     0.652     0    0.064   1.144     3.441   88.214   80.212
LGA    E    52_O      E    52_B     1.398     0    0.052   0.794     4.013   79.405   62.910
LGA    Q    53_O      Q    53_B     1.999     0    0.038   0.594     3.851   70.833   64.233
LGA    N    54_O      N    54_B     1.792     0    0.667   1.165     4.617   69.286   58.333
LGA    Q    55_O      Q    55_B     2.615     0    0.333   1.006     5.732   71.071   48.095
LGA    G    56_O      G    56_B     1.626     0    0.185   0.185     1.626   77.143   77.143
LGA    W    57_O      W    57_B     0.910     0    0.042   0.315     1.475   88.214   89.252
LGA    L    58_O      L    58_B     0.812     0    0.023   1.110     3.161   90.476   78.155
LGA    T    59_O      T    59_B     0.765     0    0.054   0.099     0.920   90.476   90.476
LGA    D    60_O      D    60_B     0.563     0    0.023   1.171     4.257   95.238   78.810
LGA    E    61_O      E    61_B     0.368     0    0.039   1.047     3.725   95.238   80.635
LGA    L    62_O      L    62_B     0.903     0    0.038   0.205     2.200   90.476   82.798
LGA    I    63_O      I    63_B     1.101     0    0.030   0.117     1.709   85.952   80.476
LGA    V    64_O      V    64_B     0.877     0    0.019   0.061     0.920   90.476   90.476
LGA    G    65_O      G    65_B     0.903     0    0.025   0.025     0.919   90.476   90.476
LGA    V    66_O      V    66_B     0.862     0    0.028   0.926     2.795   90.476   80.952
LGA    A    67_O      A    67_B     0.854     0    0.051   0.073     1.004   88.214   88.667
LGA    K    68_O      K    68_B     1.069     0    0.025   0.754     1.828   83.690   83.545
LGA    Y    69_O      Y    69_B     1.577     0    0.040   0.975     5.924   75.000   60.119
LGA    L    70_O      L    70_B     1.362     0    0.142   0.142     2.017   81.429   77.202
LGA    E    71_O      E    71_B     1.371     0    0.037   0.261     2.171   81.429   76.720
LGA    L    72_O      L    72_B     1.302     0    0.046   0.858     3.984   81.429   76.905
LGA    P    73_O      P    73_B     0.842     0    0.118   0.158     1.119   88.214   89.184
LGA    P    74_O      P    74_B     0.811     0    0.046   0.408     2.068   90.476   84.286
LGA    V    75_O      V    75_B     0.702     0    0.037   0.993     2.773   90.476   83.197
LGA    W    76_O      W    76_B     0.791     0    0.048   1.236     7.964   90.476   52.143
LGA    A    77_O      A    77_B     0.563     0    0.027   0.048     0.628   92.857   92.381
LGA    Y    78_O      Y    78_B     0.454     0    0.032   0.173     1.861   97.619   88.373
LGA    E    79_O      E    79_B     0.440     0    0.033   1.246     4.920  100.000   81.799
LGA    V    80_O      V    80_B     0.537     0    0.038   0.151     0.662   90.476   91.837
LGA    A    81_O      A    81_B     0.479     0    0.028   0.038     0.525   97.619   98.095
LGA    S    82_O      S    82_B     0.339     0    0.086   0.203     1.132  100.000   95.317
LGA    F    83_O      F    83_B     0.242     0    0.024   0.967     5.373  100.000   69.913
LGA    Y    84_O      Y    84_B     0.433     0    0.025   0.207     0.773   95.238   92.063
LGA    S    85_O      S    85_B     1.161     0    0.083   0.475     3.438   83.690   77.698
LGA    M    86_O      M    86_B     0.750     0    0.148   0.961     4.119   88.214   82.679
LGA    F    87_O      F    87_B     0.109     0    0.049   0.238     0.758  100.000   98.268
LGA    E    88_O      E    88_B     0.414     0    0.037   0.708     1.819   97.619   90.794
LGA    T    89_O      T    89_B     0.424     0    0.088   1.213     3.589   92.976   81.497
LGA    E    90_O      E    90_B     1.150     0    0.024   1.110     3.202   83.690   74.339
LGA    K    91_O      K    91_B     1.521     0    0.054   0.976     4.046   79.286   71.323
LGA    V    92_O      V    92_B     1.406     0    0.066   0.120     2.262   81.429   75.442
LGA    G    93_O      G    93_B     1.155     0    0.068   0.068     1.654   79.286   79.286
LGA    R    94_O      R    94_B     1.910     0    0.080   0.878     4.156   75.000   62.727
LGA    H    95_O      H    95_B     1.158     0    0.034   1.147     2.780   81.429   74.810
LGA    N    96_O      N    96_B     1.583     0    0.100   1.030     5.031   79.286   64.524
LGA    V    97_O      V    97_B     0.815     0    0.058   1.073     3.540   92.976   80.204
LGA    A    98_O      A    98_B     0.384     0    0.111   0.110     0.582   97.619   96.190
LGA    F    99_O      F    99_B     0.933     0    0.073   1.275     6.803   90.476   59.654
LGA    C   100_O      C   100_B     0.857     0    0.066   0.090     1.303   85.952   87.460
LGA    T   101_O      T   101_B     1.679     0    0.128   0.115     2.561   79.286   71.973
LGA    N   102_O      N   102_B     1.441     0    0.046   0.620     2.129   79.286   78.274
LGA    I   103_O      I   103_B     1.348     0    0.587   1.523     4.197   69.762   65.893
LGA    S   104_O      S   104_B     1.320     0    0.170   0.726     1.866   81.429   81.508
LGA    C   105_O      C   105_B     1.244     0    0.046   0.094     1.260   81.429   81.429
LGA    W   106_O      W   106_B     1.264     0    0.041   1.184     6.305   81.429   65.782
LGA    L   107_O      L   107_B     1.475     0    0.155   0.232     2.206   81.429   78.274
LGA    N   108_O      N   108_B     1.653     0    0.291   1.096     5.347   75.000   67.202
LGA    G   109_O      G   109_B     1.615     0    0.117   0.117     1.706   77.143   77.143
LGA    A   110_O      A   110_B     0.579     0    0.060   0.077     0.922   95.238   94.286
LGA    E   111_O      E   111_B     0.415     0    0.036   0.681     3.173   95.238   84.550
LGA    D   112_O      D   112_B     1.053     0    0.037   0.870     3.823   88.214   73.988
LGA    L   113_O      L   113_B     0.980     0    0.029   0.333     2.811   90.476   78.750
LGA    L   114_O      L   114_B     0.974     0    0.054   1.202     4.315   90.476   78.274
LGA    A   115_O      A   115_B     0.747     0    0.036   0.041     0.988   90.476   90.476
LGA    H   116_O      H   116_B     0.693     0    0.035   0.338     1.497   90.476   88.667
LGA    A   117_O      A   117_B     0.612     0    0.029   0.040     1.073   92.857   90.571
LGA    E   118_O      E   118_B     1.175     0    0.055   0.533     2.116   81.548   77.725
LGA    K   119_O      K   119_B     1.609     0    0.073   0.726     4.845   79.286   62.222
LGA    K   120_O      K   120_B     0.785     0    0.075   0.613     1.807   88.214   87.672
LGA    L   121_O      L   121_B     1.000     0    0.114   0.178     1.819   83.810   84.881
LGA    G   122_O      G   122_B     1.878     0    0.094   0.094     1.878   75.000   75.000
LGA    C   123_O      C   123_B     1.409     0    0.051   0.868     3.230   79.286   74.762
LGA    K   124_O      K   124_B     1.121     0    0.081   0.870     3.828   81.429   73.545
LGA    L   125_O      L   125_B     1.286     0    0.045   1.366     5.960   81.429   63.750
LGA    G   126_O      G   126_B     1.391     0    0.071   0.071     1.679   79.286   79.286
LGA    Q   127_O      Q   127_B     1.473     0    0.055   0.488     3.134   81.429   74.180
LGA    S   128_O      S   128_B     1.192     0    0.054   0.150     1.470   81.429   81.429
LGA    T   129_O      T   129_B     0.928     0    0.035   0.094     1.301   85.952   86.599
LGA    A   130_O      A   130_B     1.426     0    0.639   0.580     4.196   66.190   69.238
LGA    D   131_O      D   131_B     1.033     0    0.185   0.437     1.663   85.952   84.881
LGA    G   132_O      G   132_B     1.280     0    0.044   0.044     1.329   81.429   81.429
LGA    R   133_O      R   133_B     1.333     0    0.020   1.106     6.547   81.429   59.091
LGA    V   134_O      V   134_B     0.952     0    0.091   0.141     1.130   83.690   87.959
LGA    Y   135_O      Y   135_B     1.363     0    0.129   0.514     3.009   81.429   69.921
LGA    L   136_O      L   136_B     0.858     0    0.149   0.150     1.269   90.476   87.083
LGA    K   137_O      K   137_B     1.035     0    0.206   0.831     4.559   83.690   73.333
LGA    R   138_O      R   138_B     2.767     0    0.551   1.082     4.677   52.619   63.160
LGA    E   139_O      E   139_B     2.222     0    0.046   0.836     9.327   63.452   36.984
LGA    E   140_O      E   140_B     4.392     0    0.709   1.027    11.869   43.690   21.058
LGA    E   141_O      E   141_B     1.584     0    0.079   0.955     4.584   68.810   66.085
LGA    C   142_O      C   142_B     1.118     0    0.036   0.140     1.259   81.429   82.937
LGA    L   143_O      L   143_B     1.011     0    0.145   0.931     3.708   85.952   77.857
LGA    A   144_O      A   144_B     0.491     0    0.104   0.100     0.669   95.238   96.190
LGA    A   145_O      A   145_B     0.788     0    0.197   0.190     1.037   90.476   88.667
LGA    C   146_O      C   146_B     0.857     0    0.067   0.178     1.017   90.476   88.968
LGA    S   147_O      S   147_B     0.503     0    0.046   0.523     1.610   90.476   87.540
LGA    A   148_O      A   148_B     0.984     0    0.259   0.245     1.496   88.214   86.857
LGA    A   149_O      A   149_B     1.062     0    0.206   0.302     3.701   74.167   68.000
LGA    P   150_O      P   150_B     0.804     0    0.075   0.413     2.018   90.476   84.286
LGA    M   151_O      M   151_B     0.947     0    0.076   0.930     2.350   90.476   80.714
LGA    M   152_O      M   152_B     0.394     0    0.016   0.643     2.483   95.238   90.833
LGA    V   153_O      V   153_B     0.967     0    0.019   0.115     1.346   88.214   85.306
LGA    I   154_O      I   154_B     1.217     0    0.035   0.585     1.992   81.429   80.357
LGA    N   155_O      N   155_B     1.159     0    0.204   1.218     3.407   73.214   71.250
LGA    G   156_O      G   156_B     2.288     0    0.050   0.050     2.898   64.881   64.881
LGA    H   157_O      H   157_B     1.621     0    0.076   1.120     4.539   79.405   62.333
LGA    Y   158_O      Y   158_B     0.989     0    0.043   0.535     4.537   88.214   67.183
LGA    H   159_O      H   159_B     0.479     0    0.121   0.161     1.931   97.619   86.238
LGA    E   160_O      E   160_B     0.266     0    0.040   0.113     0.507  100.000   98.942
LGA    H   161_O      H   161_B     0.585     0    0.034   0.156     0.754   92.857   93.333
LGA    L   162_O      L   162_B     0.614     0    0.024   0.060     1.070   88.214   91.726
LGA    T   163_O      T   163_B     1.093     0    0.034   1.017     3.455   83.690   77.007
LGA    K   164_O      K   164_B     1.610     0    0.041   1.069     4.121   75.000   64.815
LGA    E   165_O      E   165_B     2.509     0    0.034   1.437     2.936   60.952   65.079
LGA    K   166_O      K   166_B     2.142     0    0.042   0.809     4.508   64.762   61.376
LGA    V   167_O      V   167_B     1.682     0    0.033   0.114     2.072   77.143   75.374
LGA    D   168_O      D   168_B     1.234     0    0.029   0.098     1.888   79.286   77.143
LGA    A   169_O      A   169_B     1.698     0    0.033   0.042     1.993   75.000   74.571
LGA    L   170_O      L   170_B     1.896     0    0.026   0.910     2.778   72.857   73.155
LGA    L   171_O      L   171_B     1.270     0    0.055   0.139     1.383   81.429   81.429
LGA    D   172_O      D   172_B     1.254     0    0.062   0.254     1.700   83.690   81.488
LGA    G   173_O      G   173_B     1.168     0    0.133   0.133     1.223   83.690   83.690
LGA    L   174_O      L   174_B     1.174     0    0.600   1.329     3.385   75.357   76.786
LGA    E   175_O      E   175_B     1.822     0    0.554   1.266     8.970   55.476   33.704

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      163     652    652  100.00    1282   1282  100.00               163
SUMMARY(RMSD_GDC):     2.272          2.249                  2.974           80.280   73.939

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  175  163    4.0    157    1.34    82.209    90.615    10.935

LGA_LOCAL      RMSD:   1.336  Number of atoms:  157  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   2.330  Number of assigned atoms:  163 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   2.272  Standard rmsd on all 163 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.413490 * X  +  -0.103966 * Y  +  -0.904553 * Z  + -56.687962
  Y_new =  -0.740922 * X  +  -0.539000 * Y  +   0.400642 * Z  +  26.372366
  Z_new =  -0.529208 * X  +   0.835865 * Y  +   0.145840 * Z  +  -2.889717 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -2.079818  0.557666  1.398057   [DEG: -119.1648   31.9519   80.1028 ]
ZXZ: -1.987744  1.424434 -0.564421   [DEG: -113.8893   81.6141  -32.3390 ]
 
# END of job
