
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  175 ( 1372),  selected  163 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  163 ( 1282),  selected  163 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:O  -ch2:B  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   163      13_B - 175_B       0.70     0.70
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   163      13_B - 175_B       0.70     0.70
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   163      13_B - 175_B       0.70     0.70
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  163
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     V    13_O     V    13_B    163  163  163     74  155  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    14_O     D    14_B    163  163  163     81  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    15_O     P    15_B    163  163  163    100  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    16_O     Q    16_B    163  163  163     76  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    17_O     V    17_B    163  163  163    100  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    18_O     V    18_B    163  163  163    100  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    19_O     L    19_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    20_O     S    20_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    21_O     D    21_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    22_O     K    22_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T    23_O     T    23_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    24_O     R    24_B    163  163  163    112  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    25_O     A    25_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    26_O     H    26_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I    27_O     I    27_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    28_O     D    28_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    29_O     H    29_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W    30_O     W    30_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    31_O     L    31_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    32_O     A    32_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    33_O     K    33_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    34_O     F    34_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    35_O     P    35_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    36_O     P    36_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    37_O     D    37_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    38_O     R    38_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    39_O     K    39_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    40_O     R    40_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    41_O     S    41_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    42_O     A    42_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    43_O     V    43_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    44_O     L    44_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    45_O     Q    45_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    46_O     G    46_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    47_O     L    47_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    48_O     H    48_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    49_O     A    49_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    50_O     A    50_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    51_O     Q    51_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    52_O     E    52_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    53_O     Q    53_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N    54_O     N    54_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    55_O     Q    55_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    56_O     G    56_B    163  163  163     88  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W    57_O     W    57_B    163  163  163     94  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    58_O     L    58_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T    59_O     T    59_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    60_O     D    60_B    163  163  163    100  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    61_O     E    61_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    62_O     L    62_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I    63_O     I    63_B    163  163  163    100  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    64_O     V    64_B    163  163  163    100  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    65_O     G    65_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    66_O     V    66_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    67_O     A    67_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    68_O     K    68_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y    69_O     Y    69_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    70_O     L    70_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    71_O     E    71_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    72_O     L    72_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    73_O     P    73_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    74_O     P    74_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    75_O     V    75_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W    76_O     W    76_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    77_O     A    77_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y    78_O     Y    78_B    163  163  163    100  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    79_O     E    79_B    163  163  163     95  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    80_O     V    80_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    81_O     A    81_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    82_O     S    82_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    83_O     F    83_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y    84_O     Y    84_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    85_O     S    85_B    163  163  163     58  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     M    86_O     M    86_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    87_O     F    87_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    88_O     E    88_B    163  163  163     71  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T    89_O     T    89_B    163  163  163     88  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    90_O     E    90_B    163  163  163     95  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    91_O     K    91_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    92_O     V    92_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    93_O     G    93_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    94_O     R    94_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    95_O     H    95_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N    96_O     N    96_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    97_O     V    97_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    98_O     A    98_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    99_O     F    99_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   100_O     C   100_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T   101_O     T   101_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N   102_O     N   102_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I   103_O     I   103_B    163  163  163    100  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S   104_O     S   104_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   105_O     C   105_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W   106_O     W   106_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   107_O     L   107_B    163  163  163    112  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N   108_O     N   108_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   109_O     G   109_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   110_O     A   110_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   111_O     E   111_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   112_O     D   112_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   113_O     L   113_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   114_O     L   114_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   115_O     A   115_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   116_O     H   116_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   117_O     A   117_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   118_O     E   118_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   119_O     K   119_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   120_O     K   120_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   121_O     L   121_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   122_O     G   122_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   123_O     C   123_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   124_O     K   124_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   125_O     L   125_B    163  163  163     76  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   126_O     G   126_B    163  163  163     70  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q   127_O     Q   127_B    163  163  163    109  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S   128_O     S   128_B    163  163  163    109  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T   129_O     T   129_B    163  163  163    109  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   130_O     A   130_B    163  163  163     63  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   131_O     D   131_B    163  163  163     63  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   132_O     G   132_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R   133_O     R   133_B    163  163  163    109  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V   134_O     V   134_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y   135_O     Y   135_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   136_O     L   136_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   137_O     K   137_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R   138_O     R   138_B    163  163  163     14  145  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   139_O     E   139_B    163  163  163      3    3   40   91  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   140_O     E   140_B    163  163  163      3    4    4   49   62  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   141_O     E   141_B    163  163  163      7   62  158  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   142_O     C   142_B    163  163  163    109  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   143_O     L   143_B    163  163  163    109  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   144_O     A   144_B    163  163  163     88  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   145_O     A   145_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   146_O     C   146_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S   147_O     S   147_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   148_O     A   148_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   149_O     A   149_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P   150_O     P   150_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     M   151_O     M   151_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     M   152_O     M   152_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V   153_O     V   153_B    163  163  163    109  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I   154_O     I   154_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N   155_O     N   155_B    163  163  163     88  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   156_O     G   156_B    163  163  163     46  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   157_O     H   157_B    163  163  163     53  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y   158_O     Y   158_B    163  163  163     99  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   159_O     H   159_B    163  163  163    110  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   160_O     E   160_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   161_O     H   161_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   162_O     L   162_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T   163_O     T   163_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   164_O     K   164_B    163  163  163    109  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   165_O     E   165_B    163  163  163     43  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   166_O     K   166_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V   167_O     V   167_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   168_O     D   168_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   169_O     A   169_B    163  163  163    109  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   170_O     L   170_B    163  163  163    109  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   171_O     L   171_B    163  163  163    114  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   172_O     D   172_B    163  163  163    112  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   173_O     G   173_B    163  163  163     46  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   174_O     L   174_B    163  163  163     46  157  159  160  161  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   175_O     E   175_B    163  163  163      0    3    4   39  115  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT    114    157    159    160    161    162    162    163    163    163    163    163    163    163    163    163    163    163    163    163 
GDT PERCENT_AT  69.94  96.32  97.55  98.16  98.77  99.39  99.39 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.35   0.47   0.49   0.50   0.56   0.63   0.64   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70
GDT RMS_ALL_AT   0.71   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    52_O      E    52_B
#   possible swapping detected:  Y    69_O      Y    69_B
#   possible swapping detected:  E    71_O      E    71_B
#   possible swapping detected:  E    79_O      E    79_B
#   possible swapping detected:  E    88_O      E    88_B
#   possible swapping detected:  E    90_O      E    90_B
#   possible swapping detected:  F    99_O      F    99_B
#   possible swapping detected:  E   111_O      E   111_B
#   possible swapping detected:  E   118_O      E   118_B
#   possible swapping detected:  Y   135_O      Y   135_B
#   possible swapping detected:  E   160_O      E   160_B

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    V    13_O      V    13_B     1.130     0    0.054   1.139     3.108   79.286   74.490
LGA    D    14_O      D    14_B     0.860     0    0.031   0.416     1.300   90.476   88.214
LGA    P    15_O      P    15_B     0.615     0    0.057   0.100     0.793   92.857   91.837
LGA    Q    16_O      Q    16_B     0.812     0    0.066   0.913     2.511   90.476   78.995
LGA    V    17_O      V    17_B     0.692     0    0.021   0.058     0.842   90.476   90.476
LGA    V    18_O      V    18_B     0.625     0    0.118   1.187     3.041   95.238   82.653
LGA    L    19_O      L    19_B     0.449     0    0.044   0.101     0.778   95.238   97.619
LGA    S    20_O      S    20_B     0.502     0    0.066   0.093     0.567   92.857   95.238
LGA    D    21_O      D    21_B     0.468     0    0.058   1.079     3.599  100.000   88.214
LGA    K    22_O      K    22_B     0.257     0    0.030   0.591     1.779  100.000   94.868
LGA    T    23_O      T    23_B     0.108     0    0.015   0.083     0.248  100.000  100.000
LGA    R    24_O      R    24_B     0.549     0    0.192   0.828     1.910   95.238   85.714
LGA    A    25_O      A    25_B     0.259     0    0.018   0.029     0.338  100.000  100.000
LGA    H    26_O      H    26_B     0.282     0    0.019   0.256     0.741  100.000   98.095
LGA    I    27_O      I    27_B     0.368     0    0.036   0.097     0.631  100.000   98.810
LGA    D    28_O      D    28_B     0.320     0    0.029   0.142     0.400  100.000  100.000
LGA    H    29_O      H    29_B     0.332     0    0.022   1.161     2.372  100.000   89.238
LGA    W    30_O      W    30_B     0.186     0    0.017   0.202     1.019  100.000   97.313
LGA    L    31_O      L    31_B     0.454     0    0.051   0.165     0.546   97.619   97.619
LGA    A    32_O      A    32_B     0.596     0    0.085   0.083     1.032   88.214   88.667
LGA    K    33_O      K    33_B     0.627     0    0.060   0.269     1.195   90.476   88.466
LGA    F    34_O      F    34_B     0.531     0    0.024   0.076     0.608   90.476   96.537
LGA    P    35_O      P    35_B     0.558     0    0.054   0.077     0.813   92.857   91.837
LGA    P    36_O      P    36_B     0.581     0    0.011   0.046     0.785   90.476   90.476
LGA    D    37_O      D    37_B     0.509     0    0.088   0.167     1.031   92.857   90.536
LGA    R    38_O      R    38_B     0.571     0    0.062   0.722     5.574   95.238   71.299
LGA    K    39_O      K    39_B     0.331     0    0.056   0.814     1.908   97.619   89.788
LGA    R    40_O      R    40_B     0.501     0    0.078   0.546     1.416   97.619   89.784
LGA    S    41_O      S    41_B     0.317     0    0.047   0.124     0.388  100.000  100.000
LGA    A    42_O      A    42_B     0.203     0    0.039   0.051     0.373  100.000  100.000
LGA    V    43_O      V    43_B     0.341     0    0.072   0.868     1.869  100.000   90.884
LGA    L    44_O      L    44_B     0.356     0    0.046   0.685     3.035   97.619   85.774
LGA    Q    45_O      Q    45_B     0.209     0    0.060   0.389     2.149  100.000   89.894
LGA    G    46_O      G    46_B     0.402     0    0.009   0.009     0.402  100.000  100.000
LGA    L    47_O      L    47_B     0.294     0    0.023   0.087     0.422  100.000  100.000
LGA    H    48_O      H    48_B     0.318     0    0.017   1.047     4.120  100.000   74.714
LGA    A    49_O      A    49_B     0.331     0    0.013   0.021     0.419  100.000  100.000
LGA    A    50_O      A    50_B     0.268     0    0.043   0.052     0.474  100.000  100.000
LGA    Q    51_O      Q    51_B     0.385     0    0.022   0.089     0.586  100.000   97.884
LGA    E    52_O      E    52_B     0.340     0    0.017   0.216     0.990  100.000   98.942
LGA    Q    53_O      Q    53_B     0.380     0    0.020   0.191     0.586  100.000   97.884
LGA    N    54_O      N    54_B     0.202     0    0.044   0.126     0.514  100.000   98.810
LGA    Q    55_O      Q    55_B     0.473     0    0.041   0.302     1.925  100.000   89.735
LGA    G    56_O      G    56_B     0.604     0    0.081   0.081     0.604   92.857   92.857
LGA    W    57_O      W    57_B     0.581     0    0.034   0.164     0.729   95.238   91.837
LGA    L    58_O      L    58_B     0.509     0    0.042   0.139     0.793   92.857   92.857
LGA    T    59_O      T    59_B     0.433     0    0.020   0.066     0.629   95.238   97.279
LGA    D    60_O      D    60_B     0.633     0    0.040   0.270     1.485   90.476   89.345
LGA    E    61_O      E    61_B     0.538     0    0.067   1.176     4.609   95.238   73.651
LGA    L    62_O      L    62_B     0.523     0    0.026   0.112     0.886   92.857   91.667
LGA    I    63_O      I    63_B     0.607     0    0.039   0.113     0.703   90.476   91.667
LGA    V    64_O      V    64_B     0.646     0    0.011   0.032     0.931   92.857   91.837
LGA    G    65_O      G    65_B     0.417     0    0.017   0.017     0.476  100.000  100.000
LGA    V    66_O      V    66_B     0.373     0    0.018   0.041     0.465  100.000  100.000
LGA    A    67_O      A    67_B     0.461     0    0.022   0.025     0.583  100.000   98.095
LGA    K    68_O      K    68_B     0.389     0    0.046   0.428     1.585  100.000   92.857
LGA    Y    69_O      Y    69_B     0.360     0    0.020   0.174     0.918  100.000   96.032
LGA    L    70_O      L    70_B     0.244     0    0.027   0.082     0.555  100.000   98.810
LGA    E    71_O      E    71_B     0.275     0    0.012   0.449     1.678  100.000   93.810
LGA    L    72_O      L    72_B     0.319     0    0.012   0.234     0.613  100.000   97.619
LGA    P    73_O      P    73_B     0.449     0    0.050   0.084     0.570   97.619   97.279
LGA    P    74_O      P    74_B     0.498     0    0.039   0.074     0.589   97.619   94.558
LGA    V    75_O      V    75_B     0.416     0    0.042   1.287     2.980  100.000   87.755
LGA    W    76_O      W    76_B     0.518     0    0.022   0.059     0.746   90.476   90.476
LGA    A    77_O      A    77_B     0.437     0    0.031   0.033     0.511   95.238   96.190
LGA    Y    78_O      Y    78_B     0.646     0    0.030   0.185     1.061   90.476   88.968
LGA    E    79_O      E    79_B     0.783     0    0.018   0.198     0.912   90.476   90.476
LGA    V    80_O      V    80_B     0.594     0    0.048   0.108     0.694   92.857   93.197
LGA    A    81_O      A    81_B     0.405     0    0.045   0.047     0.495  100.000  100.000
LGA    S    82_O      S    82_B     0.383     0    0.064   0.241     1.025  100.000   95.317
LGA    F    83_O      F    83_B     0.487     0    0.023   0.071     0.803   95.238   93.074
LGA    Y    84_O      Y    84_B     0.365     0    0.096   0.139     0.980  100.000   93.651
LGA    S    85_O      S    85_B     0.755     0    0.050   0.209     1.416   95.238   90.635
LGA    M    86_O      M    86_B     0.259     0    0.071   0.831     4.394  100.000   87.440
LGA    F    87_O      F    87_B     0.374     0    0.102   0.222     0.593  100.000   98.268
LGA    E    88_O      E    88_B     0.899     0    0.078   0.207     1.774   90.476   84.550
LGA    T    89_O      T    89_B     0.765     0    0.033   0.050     1.083   90.476   89.184
LGA    E    90_O      E    90_B     0.588     0    0.048   1.055     3.564   92.857   73.704
LGA    K    91_O      K    91_B     0.084     0    0.139   0.987     5.948   95.357   77.831
LGA    V    92_O      V    92_B     0.119     0    0.026   0.085     0.312  100.000  100.000
LGA    G    93_O      G    93_B     0.251     0    0.040   0.040     0.383  100.000  100.000
LGA    R    94_O      R    94_B     0.302     0    0.036   1.066     2.921  100.000   91.039
LGA    H    95_O      H    95_B     0.350     0    0.038   0.061     0.891  100.000   95.238
LGA    N    96_O      N    96_B     0.370     0    0.054   0.104     0.721  100.000   96.429
LGA    V    97_O      V    97_B     0.336     0    0.043   0.059     0.416  100.000  100.000
LGA    A    98_O      A    98_B     0.293     0    0.017   0.062     0.371  100.000  100.000
LGA    F    99_O      F    99_B     0.465     0    0.025   0.056     0.586   95.238   95.671
LGA    C   100_O      C   100_B     0.442     0    0.056   0.087     0.595   97.619   96.825
LGA    T   101_O      T   101_B     0.200     0    0.022   0.039     0.334  100.000  100.000
LGA    N   102_O      N   102_B     0.340     0    0.059   0.071     0.614  100.000   98.810
LGA    I   103_O      I   103_B     0.652     0    0.033   1.333     4.324   92.857   75.893
LGA    S   104_O      S   104_B     0.284     0    0.011   0.073     0.532  100.000   98.413
LGA    C   105_O      C   105_B     0.123     0    0.017   0.061     0.214  100.000  100.000
LGA    W   106_O      W   106_B     0.292     0    0.031   0.375     1.434  100.000   93.946
LGA    L   107_O      L   107_B     0.446     0    0.075   0.081     0.713   97.619   95.238
LGA    N   108_O      N   108_B     0.205     0    0.104   1.120     2.533   97.619   90.060
LGA    G   109_O      G   109_B     0.444     0    0.046   0.046     0.444  100.000  100.000
LGA    A   110_O      A   110_B     0.236     0    0.079   0.088     0.513  100.000   98.095
LGA    E   111_O      E   111_B     0.147     0    0.051   0.680     2.300  100.000   89.048
LGA    D   112_O      D   112_B     0.169     0    0.016   0.089     0.455  100.000  100.000
LGA    L   113_O      L   113_B     0.354     0    0.028   1.153     2.691  100.000   89.048
LGA    L   114_O      L   114_B     0.347     0    0.066   0.166     0.475  100.000  100.000
LGA    A   115_O      A   115_B     0.401     0    0.021   0.028     0.467  100.000  100.000
LGA    H   116_O      H   116_B     0.224     0    0.038   0.081     0.650  100.000   97.143
LGA    A   117_O      A   117_B     0.283     0    0.041   0.041     0.324  100.000  100.000
LGA    E   118_O      E   118_B     0.287     0    0.016   0.302     1.449  100.000   95.820
LGA    K   119_O      K   119_B     0.153     0    0.033   0.781     6.112  100.000   78.677
LGA    K   120_O      K   120_B     0.251     0    0.030   0.582     1.428  100.000   95.820
LGA    L   121_O      L   121_B     0.179     0    0.019   0.088     0.413  100.000  100.000
LGA    G   122_O      G   122_B     0.104     0    0.032   0.032     0.311  100.000  100.000
LGA    C   123_O      C   123_B     0.346     0    0.015   0.170     1.010  100.000   96.905
LGA    K   124_O      K   124_B     0.391     0    0.039   0.833     4.514  100.000   81.005
LGA    L   125_O      L   125_B     0.614     0    0.129   0.173     1.071   90.476   90.536
LGA    G   126_O      G   126_B     0.748     0    0.142   0.142     0.913   90.476   90.476
LGA    Q   127_O      Q   127_B     0.487     0    0.020   0.177     0.962   97.619   94.709
LGA    S   128_O      S   128_B     0.443     0    0.058   0.123     0.694   97.619   95.238
LGA    T   129_O      T   129_B     0.557     0    0.047   0.118     0.773   92.857   93.197
LGA    A   130_O      A   130_B     0.914     0    0.035   0.032     1.159   88.214   86.857
LGA    D   131_O      D   131_B     0.917     0    0.067   0.183     1.290   90.476   88.214
LGA    G   132_O      G   132_B     0.503     0    0.039   0.039     0.687   95.238   95.238
LGA    R   133_O      R   133_B     0.559     0    0.009   1.583     6.874   95.238   69.957
LGA    V   134_O      V   134_B     0.348     0    0.019   0.032     0.539  100.000   98.639
LGA    Y   135_O      Y   135_B     0.091     0    0.062   0.185     1.553  100.000   91.468
LGA    L   136_O      L   136_B     0.174     0    0.092   0.134     0.729  100.000   98.810
LGA    K   137_O      K   137_B     0.216     0    0.095   0.556     1.613   95.238   92.751
LGA    R   138_O      R   138_B     1.366     0    0.609   0.843     2.978   81.548   68.139
LGA    E   139_O      E   139_B     3.113     0    0.302   1.140     8.688   45.833   25.238
LGA    E   140_O      E   140_B     3.789     0    0.625   0.571    11.014   50.595   25.397
LGA    E   141_O      E   141_B     1.766     0    0.244   1.087     7.715   81.548   50.476
LGA    C   142_O      C   142_B     0.586     0    0.115   0.174     0.904   90.476   90.476
LGA    L   143_O      L   143_B     0.494     0    0.024   0.077     0.561   92.857   95.238
LGA    A   144_O      A   144_B     0.800     0    0.109   0.105     1.230   88.214   86.857
LGA    A   145_O      A   145_B     0.466     0    0.110   0.106     0.590  100.000   98.095
LGA    C   146_O      C   146_B     0.504     0    0.023   0.190     0.610   95.238   93.651
LGA    S   147_O      S   147_B     0.317     0    0.011   0.234     0.936  100.000   98.413
LGA    A   148_O      A   148_B     0.362     0    0.022   0.041     0.568   97.619   96.190
LGA    A   149_O      A   149_B     0.222     0    0.053   0.053     0.355  100.000  100.000
LGA    P   150_O      P   150_B     0.199     0    0.026   0.057     0.275  100.000  100.000
LGA    M   151_O      M   151_B     0.390     0    0.042   0.261     0.782  100.000   96.429
LGA    M   152_O      M   152_B     0.436     0    0.018   0.793     1.946  100.000   91.905
LGA    V   153_O      V   153_B     0.531     0    0.019   0.073     0.740   97.619   94.558
LGA    I   154_O      I   154_B     0.448     0    0.028   0.061     0.718   95.238   96.429
LGA    N   155_O      N   155_B     0.615     0    0.022   0.284     1.237   90.476   89.345
LGA    G   156_O      G   156_B     1.028     0    0.010   0.010     1.158   83.690   83.690
LGA    H   157_O      H   157_B     1.021     0    0.011   1.154     2.981   88.214   76.762
LGA    Y   158_O      Y   158_B     0.622     0    0.039   0.150     0.919   90.476   90.476
LGA    H   159_O      H   159_B     0.473     0    0.024   0.129     1.066  100.000   92.476
LGA    E   160_O      E   160_B     0.254     0    0.047   0.177     0.642  100.000   98.942
LGA    H   161_O      H   161_B     0.286     0    0.036   0.138     0.721  100.000   98.095
LGA    L   162_O      L   162_B     0.176     0    0.087   0.091     0.387  100.000  100.000
LGA    T   163_O      T   163_B     0.353     0    0.036   0.080     0.551  100.000   95.918
LGA    K   164_O      K   164_B     0.482     0    0.057   0.580     1.483   95.238   90.582
LGA    E   165_O      E   165_B     0.673     0    0.015   0.470     1.835   90.476   87.566
LGA    K   166_O      K   166_B     0.387     0    0.062   0.422     1.904  100.000   92.804
LGA    V   167_O      V   167_B     0.462     0    0.022   0.039     0.521   97.619   95.918
LGA    D   168_O      D   168_B     0.456     0    0.033   0.146     0.579   97.619   97.619
LGA    A   169_O      A   169_B     0.506     0    0.018   0.022     0.541   90.476   92.381
LGA    L   170_O      L   170_B     0.507     0    0.021   0.076     0.536   90.476   95.238
LGA    L   171_O      L   171_B     0.406     0    0.057   0.105     0.589   97.619   95.238
LGA    D   172_O      D   172_B     0.478     0    0.035   0.049     0.689   95.238   97.619
LGA    G   173_O      G   173_B     0.546     0    0.087   0.087     0.827   92.857   92.857
LGA    L   174_O      L   174_B     0.634     0    0.596   0.542     1.303   90.595   92.917
LGA    E   175_O      E   175_B     3.890     0    0.670   1.002    10.757   30.476   16.984

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      163     652    652  100.00    1282   1282  100.00               163
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.702          0.765                  1.453           95.451   91.412

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  175  163    4.0    163    0.70    98.620    99.244    20.324

LGA_LOCAL      RMSD:   0.702  Number of atoms:  163  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.702  Number of assigned atoms:  163 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.702  Standard rmsd on all 163 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.837508 * X  +  -0.546033 * Y  +  -0.020690 * Z  +  15.380177
  Y_new =  -0.108452 * X  +  -0.128993 * Y  +  -0.985697 * Z  +  37.219612
  Z_new =   0.535555 * X  +   0.827773 * Y  +  -0.167251 * Z  +  -1.176752 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -0.128777 -0.565164  1.770162   [DEG:   -7.3784  -32.3815  101.4228 ]
ZXZ: -0.020988  1.738837  0.574251   [DEG:   -1.2025   99.6280   32.9022 ]
 
# END of job
