
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  175 ( 1372),  selected  163 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  163 ( 1282),  selected  163 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:O  -ch2:B  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   163      13_B - 175_B       1.88     1.88
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   163      13_B - 175_B       1.88     1.88
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    88      88_B - 175_B       0.99     2.88
  LCS_AVERAGE:     52.18

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  163
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     V    13_O     V    13_B      5  163  163      5    5    5    5   18   44   72  108  135  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    14_O     D    14_B      5  163  163      5    5    5    5   83   90   99  120  136  160  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    15_O     P    15_B      5  163  163      5   18   58   82   84   94  121  129  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    16_O     Q    16_B      5  163  163      5    5   71   82   84   98  121  129  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    17_O     V    17_B     82  163  163      5    5    5    5   52   84  104  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    18_O     V    18_B     85  163  163      4   19   76  104  151  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    19_O     L    19_B     86  163  163     25   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    20_O     S    20_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    21_O     D    21_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    22_O     K    22_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T    23_O     T    23_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    24_O     R    24_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    25_O     A    25_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    26_O     H    26_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I    27_O     I    27_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    28_O     D    28_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    29_O     H    29_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W    30_O     W    30_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    31_O     L    31_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    32_O     A    32_B     86  163  163     33   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    33_O     K    33_B     86  163  163      8   72  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    34_O     F    34_B     86  163  163     11   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    35_O     P    35_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    36_O     P    36_B     86  163  163     10   30   96  135  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    37_O     D    37_B     86  163  163      9   56   84  104  138  156  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    38_O     R    38_B     86  163  163     25   74   95  119  145  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    39_O     K    39_B     86  163  163     40   78  102  135  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    40_O     R    40_B     86  163  163     26   78  102  135  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    41_O     S    41_B     86  163  163     34   78  102  135  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    42_O     A    42_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    43_O     V    43_B     86  163  163     39   78  104  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    44_O     L    44_B     86  163  163     43   78  106  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    45_O     Q    45_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    46_O     G    46_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    47_O     L    47_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    48_O     H    48_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    49_O     A    49_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    50_O     A    50_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    51_O     Q    51_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    52_O     E    52_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    53_O     Q    53_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N    54_O     N    54_B     86  163  163     42   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    55_O     Q    55_B     86  163  163     42   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    56_O     G    56_B     86  163  163     32   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W    57_O     W    57_B     86  163  163     10   70  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    58_O     L    58_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T    59_O     T    59_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    60_O     D    60_B     86  163  163     40   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    61_O     E    61_B     86  163  163     32   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    62_O     L    62_B     86  163  163     42   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I    63_O     I    63_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    64_O     V    64_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    65_O     G    65_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    66_O     V    66_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    67_O     A    67_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    68_O     K    68_B     86  163  163     41   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y    69_O     Y    69_B     86  163  163     15   78  102  135  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    70_O     L    70_B     86  163  163     15   78  102  135  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    71_O     E    71_B     86  163  163     15   78  102  135  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    72_O     L    72_B     86  163  163     15   78  102  135  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    73_O     P    73_B     86  163  163     10   78  107  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    74_O     P    74_B     86  163  163     33   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    75_O     V    75_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W    76_O     W    76_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    77_O     A    77_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y    78_O     Y    78_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    79_O     E    79_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    80_O     V    80_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    81_O     A    81_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    82_O     S    82_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    83_O     F    83_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y    84_O     Y    84_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    85_O     S    85_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     M    86_O     M    86_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    87_O     F    87_B     86  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    88_O     E    88_B     88  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T    89_O     T    89_B     88  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    90_O     E    90_B     88  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    91_O     K    91_B     88  163  163     43   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    92_O     V    92_B     88  163  163     38   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    93_O     G    93_B     88  163  163      3   51   82  133  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    94_O     R    94_B     88  163  163     22   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    95_O     H    95_B     88  163  163     33   76  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N    96_O     N    96_B     88  163  163     29   70   94  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    97_O     V    97_B     88  163  163     36   70  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    98_O     A    98_B     88  163  163     36   70  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    99_O     F    99_B     88  163  163     19   67  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   100_O     C   100_B     88  163  163     19   70  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T   101_O     T   101_B     88  163  163     19   60  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N   102_O     N   102_B     88  163  163     19   61  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I   103_O     I   103_B     88  163  163     13   72  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S   104_O     S   104_B     88  163  163     13   70  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   105_O     C   105_B     88  163  163     36   70  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W   106_O     W   106_B     88  163  163     36   72  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   107_O     L   107_B     88  163  163     15   72  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N   108_O     N   108_B     88  163  163     36   70  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   109_O     G   109_B     88  163  163     36   70  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   110_O     A   110_B     88  163  163     36   70  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   111_O     E   111_B     88  163  163     36   70  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   112_O     D   112_B     88  163  163     23   70  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   113_O     L   113_B     88  163  163     23   70  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   114_O     L   114_B     88  163  163     28   70  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   115_O     A   115_B     88  163  163     36   72  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   116_O     H   116_B     88  163  163     23   70  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   117_O     A   117_B     88  163  163     23   70  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   118_O     E   118_B     88  163  163     36   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   119_O     K   119_B     88  163  163     36   70  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   120_O     K   120_B     88  163  163     36   72  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   121_O     L   121_B     88  163  163     36   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   122_O     G   122_B     88  163  163     36   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   123_O     C   123_B     88  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   124_O     K   124_B     88  163  163     44   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   125_O     L   125_B     88  163  163     32   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   126_O     G   126_B     88  163  163     26   75  101  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q   127_O     Q   127_B     88  163  163     26   75  100  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S   128_O     S   128_B     88  163  163     26   76  102  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T   129_O     T   129_B     88  163  163     26   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   130_O     A   130_B     88  163  163     10   59   86  132  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   131_O     D   131_B     88  163  163     26   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   132_O     G   132_B     88  163  163     26   70  105  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R   133_O     R   133_B     88  163  163     38   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V   134_O     V   134_B     88  163  163     43   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y   135_O     Y   135_B     88  163  163     22   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   136_O     L   136_B     88  163  163     37   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   137_O     K   137_B     88  163  163     29   70  101  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R   138_O     R   138_B     88  163  163     20   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   139_O     E   139_B     88  163  163      3    3   35   94  138  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   140_O     E   140_B     88  163  163      3    3   51  101  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   141_O     E   141_B     88  163  163     41   78  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   142_O     C   142_B     88  163  163     13   71  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   143_O     L   143_B     88  163  163     19   70  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   144_O     A   144_B     88  163  163     12   68   86  124  151  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   145_O     A   145_B     88  163  163     19   70   89  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   146_O     C   146_B     88  163  163     36   70   90  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S   147_O     S   147_B     88  163  163     36   70   89  129  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   148_O     A   148_B     88  163  163     36   70   89  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   149_O     A   149_B     88  163  163     36   70   90  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P   150_O     P   150_B     88  163  163     36   70  100  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     M   151_O     M   151_B     88  163  163     36   70   91  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     M   152_O     M   152_B     88  163  163     36   70  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V   153_O     V   153_B     88  163  163     36   70  101  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I   154_O     I   154_B     88  163  163     33   70  101  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N   155_O     N   155_B     88  163  163     29   70   86  135  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   156_O     G   156_B     88  163  163     29   70   85  117  151  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   157_O     H   157_B     88  163  163     29   70   85  124  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y   158_O     Y   158_B     88  163  163     29   70   85  124  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   159_O     H   159_B     88  163  163     36   70   89  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   160_O     E   160_B     88  163  163     36   70   89  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   161_O     H   161_B     88  163  163     36   70   89  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   162_O     L   162_B     88  163  163     36   70   98  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T   163_O     T   163_B     88  163  163     36   70   98  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   164_O     K   164_B     88  163  163     29   70  100  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   165_O     E   165_B     88  163  163     36   70  100  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   166_O     K   166_B     88  163  163     36   70   98  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V   167_O     V   167_B     88  163  163     36   70  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   168_O     D   168_B     88  163  163     29   70  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   169_O     A   169_B     88  163  163     29   70  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   170_O     L   170_B     88  163  163     36   70  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   171_O     L   171_B     88  163  163     36   70  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   172_O     D   172_B     88  163  163     36   70  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   173_O     G   173_B     88  163  163     36   70  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   174_O     L   174_B     88  163  163     29   69  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   175_O     E   175_B     88  163  163      8   70  108  137  152  157  158  158  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  84.06  (  52.18  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     44     78    108    137    152    157    158    158    161    162    163    163    163    163    163    163    163    163    163    163 
GDT PERCENT_AT  26.99  47.85  66.26  84.05  93.25  96.32  96.93  96.93  98.77  99.39 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.33   0.56   0.99   1.25   1.38   1.45   1.47   1.47   1.73   1.80   1.88   1.88   1.88   1.88   1.88   1.88   1.88   1.88   1.88   1.88
GDT RMS_ALL_AT   2.30   2.30   1.95   1.93   1.93   1.93   1.93   1.93   1.89   1.89   1.88   1.88   1.88   1.88   1.88   1.88   1.88   1.88   1.88   1.88

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  D    21_O      D    21_B
#   possible swapping detected:  F    34_O      F    34_B
#   possible swapping detected:  D    37_O      D    37_B
#   possible swapping detected:  E    52_O      E    52_B
#   possible swapping detected:  E    61_O      E    61_B
#   possible swapping detected:  Y    69_O      Y    69_B
#   possible swapping detected:  E    71_O      E    71_B
#   possible swapping detected:  Y    78_O      Y    78_B
#   possible swapping detected:  F    83_O      F    83_B
#   possible swapping detected:  Y    84_O      Y    84_B
#   possible swapping detected:  F    87_O      F    87_B
#   possible swapping detected:  E    88_O      E    88_B
#   possible swapping detected:  E   140_O      E   140_B
#   possible swapping detected:  E   141_O      E   141_B
#   possible swapping detected:  E   165_O      E   165_B

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    V    13_O      V    13_B     7.071     0    0.079   1.042     7.822    8.571   16.054
LGA    D    14_O      D    14_B     8.078     0    0.025   0.494    10.216    9.762    5.595
LGA    P    15_O      P    15_B     7.614     0    0.114   0.155     9.671    8.571    5.782
LGA    Q    16_O      Q    16_B     7.837     0    0.014   0.831    14.967   11.190    5.132
LGA    V    17_O      V    17_B     5.435     0    0.576   0.553     8.257   25.476   18.571
LGA    V    18_O      V    18_B     2.283     0    0.665   1.238     5.799   77.381   58.776
LGA    L    19_O      L    19_B     1.010     0    0.098   0.148     2.039   85.952   79.464
LGA    S    20_O      S    20_B     0.554     0    0.067   0.140     1.114   88.214   92.143
LGA    D    21_O      D    21_B     0.529     0    0.019   0.684     1.858   95.238   89.524
LGA    K    22_O      K    22_B     0.522     0    0.036   1.032     6.248   92.857   69.683
LGA    T    23_O      T    23_B     0.891     0    0.018   0.070     1.116   88.214   87.891
LGA    R    24_O      R    24_B     0.875     0    0.135   1.015     3.641   85.952   73.030
LGA    A    25_O      A    25_B     1.068     0    0.038   0.040     1.080   83.690   83.238
LGA    H    26_O      H    26_B     1.141     0    0.046   0.140     1.200   81.429   83.238
LGA    I    27_O      I    27_B     1.367     0    0.022   0.086     1.385   81.429   81.429
LGA    D    28_O      D    28_B     1.160     0    0.016   0.146     1.189   81.429   83.690
LGA    H    29_O      H    29_B     0.995     0    0.021   1.349     5.445   83.690   62.857
LGA    W    30_O      W    30_B     1.228     0    0.079   1.510     5.848   81.429   63.299
LGA    L    31_O      L    31_B     1.100     0    0.041   0.151     1.929   85.952   82.619
LGA    A    32_O      A    32_B     0.537     0    0.032   0.035     0.924   90.476   90.476
LGA    K    33_O      K    33_B     1.197     0    0.028   0.248     2.382   83.690   76.772
LGA    F    34_O      F    34_B     1.147     0    0.043   0.291     2.939   85.952   74.113
LGA    P    35_O      P    35_B     0.780     0    0.027   0.049     1.633   83.810   81.565
LGA    P    36_O      P    36_B     2.011     0    0.050   0.061     3.162   63.333   67.483
LGA    D    37_O      D    37_B     3.235     0    0.063   1.007     3.736   50.119   57.857
LGA    R    38_O      R    38_B     2.837     0    0.141   0.762     4.581   60.952   50.649
LGA    K    39_O      K    39_B     1.904     0    0.049   0.817     2.295   70.833   71.058
LGA    R    40_O      R    40_B     2.056     0    0.060   1.007     3.072   68.810   71.039
LGA    S    41_O      S    41_B     2.138     0    0.042   0.679     3.060   68.810   65.000
LGA    A    42_O      A    42_B     1.387     0    0.053   0.059     1.713   79.286   79.714
LGA    V    43_O      V    43_B     1.642     0    0.010   0.064     2.123   75.000   71.769
LGA    L    44_O      L    44_B     1.618     0    0.098   1.107     3.656   75.000   70.298
LGA    Q    45_O      Q    45_B     0.913     0    0.049   0.428     1.683   88.214   86.561
LGA    G    46_O      G    46_B     0.847     0    0.072   0.072     0.953   90.476   90.476
LGA    L    47_O      L    47_B     0.880     0    0.033   0.149     1.147   90.476   88.214
LGA    H    48_O      H    48_B     0.865     0    0.010   1.153     5.388   90.476   63.333
LGA    A    49_O      A    49_B     0.852     0    0.018   0.020     0.952   90.476   90.476
LGA    A    50_O      A    50_B     0.551     0    0.058   0.067     0.802   90.476   90.476
LGA    Q    51_O      Q    51_B     0.637     0    0.019   0.154     0.705   90.476   90.476
LGA    E    52_O      E    52_B     0.707     0    0.012   0.841     2.134   90.476   83.651
LGA    Q    53_O      Q    53_B     0.570     0    0.005   0.235     0.876   95.238   93.651
LGA    N    54_O      N    54_B     0.240     0    0.023   1.001     4.388  100.000   83.333
LGA    Q    55_O      Q    55_B     0.612     0    0.021   0.960     2.432   95.238   85.873
LGA    G    56_O      G    56_B     0.181     0    0.056   0.056     0.859   95.238   95.238
LGA    W    57_O      W    57_B     1.330     0    0.254   1.596     4.203   85.952   69.252
LGA    L    58_O      L    58_B     0.428     0    0.204   0.297     1.264   95.238   89.464
LGA    T    59_O      T    59_B     0.627     0    0.030   0.062     0.697   90.476   91.837
LGA    D    60_O      D    60_B     0.924     0    0.010   0.185     1.400   90.476   85.952
LGA    E    61_O      E    61_B     0.833     0    0.068   0.672     3.467   90.476   73.915
LGA    L    62_O      L    62_B     0.620     0    0.017   1.368     3.530   90.476   79.167
LGA    I    63_O      I    63_B     0.676     0    0.024   0.132     0.849   90.476   90.476
LGA    V    64_O      V    64_B     0.675     0    0.009   0.049     0.825   90.476   90.476
LGA    G    65_O      G    65_B     0.936     0    0.066   0.066     0.936   90.476   90.476
LGA    V    66_O      V    66_B     0.994     0    0.016   0.035     1.131   85.952   85.306
LGA    A    67_O      A    67_B     0.898     0    0.036   0.039     1.060   85.952   86.857
LGA    K    68_O      K    68_B     1.312     0    0.011   0.401     3.876   79.286   69.947
LGA    Y    69_O      Y    69_B     1.747     0    0.055   1.269     6.225   70.833   57.778
LGA    L    70_O      L    70_B     1.901     0    0.027   0.164     2.350   70.833   70.833
LGA    E    71_O      E    71_B     1.941     0    0.010   0.710     2.911   72.857   66.667
LGA    L    72_O      L    72_B     1.839     0    0.026   0.180     1.856   72.857   72.857
LGA    P    73_O      P    73_B     1.533     0    0.093   0.128     1.947   72.857   74.082
LGA    P    74_O      P    74_B     1.253     0    0.054   0.092     1.353   81.429   81.429
LGA    V    75_O      V    75_B     1.061     0    0.032   1.044     3.179   81.429   74.558
LGA    W    76_O      W    76_B     1.260     0    0.047   1.612     8.462   81.429   40.340
LGA    A    77_O      A    77_B     0.928     0    0.047   0.048     1.102   85.952   86.857
LGA    Y    78_O      Y    78_B     0.953     0    0.014   0.094     1.104   90.476   87.460
LGA    E    79_O      E    79_B     1.065     0    0.044   0.171     1.855   83.690   80.529
LGA    V    80_O      V    80_B     0.831     0    0.057   0.088     0.857   90.476   90.476
LGA    A    81_O      A    81_B     0.877     0    0.018   0.020     0.951   90.476   90.476
LGA    S    82_O      S    82_B     0.852     0    0.114   0.346     1.266   90.476   88.968
LGA    F    83_O      F    83_B     1.311     0    0.057   1.177     5.853   81.429   60.563
LGA    Y    84_O      Y    84_B     1.250     0    0.062   0.216     1.520   81.429   80.000
LGA    S    85_O      S    85_B     1.192     0    0.022   0.177     1.393   81.429   81.429
LGA    M    86_O      M    86_B     1.066     0    0.029   0.829     4.000   81.429   72.857
LGA    F    87_O      F    87_B     1.112     0    0.053   0.089     1.463   81.429   83.896
LGA    E    88_O      E    88_B     0.631     0    0.031   0.681     2.610   90.476   78.201
LGA    T    89_O      T    89_B     0.645     0    0.021   0.072     0.858   90.476   90.476
LGA    E    90_O      E    90_B     0.507     0    0.039   1.016     3.609   92.857   74.444
LGA    K    91_O      K    91_B     0.531     0    0.065   1.026     6.255   88.214   73.439
LGA    V    92_O      V    92_B     0.822     0    0.637   0.600     2.556   82.143   85.714
LGA    G    93_O      G    93_B     2.247     0    0.105   0.105     2.370   64.762   64.762
LGA    R    94_O      R    94_B     1.434     0    0.076   1.135     2.537   79.286   73.074
LGA    H    95_O      H    95_B     1.479     0    0.108   0.147     1.547   79.286   82.381
LGA    N    96_O      N    96_B     2.017     0    0.055   1.047     5.795   70.833   56.071
LGA    V    97_O      V    97_B     1.268     0    0.069   0.109     1.457   81.429   82.721
LGA    A    98_O      A    98_B     1.216     0    0.160   0.197     1.528   81.429   79.714
LGA    F    99_O      F    99_B     1.563     0    0.042   0.070     1.592   77.143   78.312
LGA    C   100_O      C   100_B     1.267     0    0.035   0.102     1.409   81.429   84.444
LGA    T   101_O      T   101_B     1.636     0    0.087   0.095     1.945   72.857   72.857
LGA    N   102_O      N   102_B     1.445     0    0.073   0.237     2.978   81.429   76.250
LGA    I   103_O      I   103_B     0.563     0    0.019   1.108     3.652   90.476   76.310
LGA    S   104_O      S   104_B     0.883     0    0.016   0.125     1.088   85.952   85.952
LGA    C   105_O      C   105_B     1.435     0    0.030   0.055     2.117   81.429   77.222
LGA    W   106_O      W   106_B     0.712     0    0.008   0.254     1.690   88.214   86.735
LGA    L   107_O      L   107_B     0.671     0    0.129   0.119     0.819   90.476   91.667
LGA    N   108_O      N   108_B     1.294     0    0.153   1.045     4.195   83.690   78.274
LGA    G   109_O      G   109_B     1.395     0    0.030   0.030     1.395   81.429   81.429
LGA    A   110_O      A   110_B     1.290     0    0.051   0.062     1.395   81.429   81.429
LGA    E   111_O      E   111_B     0.935     0    0.033   0.961     3.912   85.952   75.556
LGA    D   112_O      D   112_B     1.422     0    0.041   0.375     2.645   81.429   76.250
LGA    L   113_O      L   113_B     1.612     0    0.024   1.158     4.685   77.143   69.881
LGA    L   114_O      L   114_B     0.901     0    0.073   0.185     1.123   88.214   89.345
LGA    A   115_O      A   115_B     0.728     0    0.008   0.012     0.966   90.476   90.476
LGA    H   116_O      H   116_B     1.381     0    0.059   0.147     1.987   81.429   76.286
LGA    A   117_O      A   117_B     1.078     0    0.024   0.024     1.191   85.952   85.048
LGA    E   118_O      E   118_B     0.189     0    0.020   0.221     0.896  100.000   96.825
LGA    K   119_O      K   119_B     1.060     0    0.011   1.070     7.684   88.214   60.952
LGA    K   120_O      K   120_B     0.706     0    0.049   0.464     1.581   95.238   88.624
LGA    L   121_O      L   121_B     0.389     0    0.073   0.132     0.652   95.238   94.048
LGA    G   122_O      G   122_B     0.800     0    0.118   0.118     0.967   90.476   90.476
LGA    C   123_O      C   123_B     0.761     0    0.023   0.171     1.111   90.476   88.968
LGA    K   124_O      K   124_B     0.682     0    0.026   0.927     5.449   90.476   72.910
LGA    L   125_O      L   125_B     0.862     0    0.033   0.153     1.529   85.952   83.750
LGA    G   126_O      G   126_B     1.796     0    0.035   0.035     2.295   70.833   70.833
LGA    Q   127_O      Q   127_B     1.886     0    0.052   0.217     2.659   72.857   68.413
LGA    S   128_O      S   128_B     1.766     0    0.023   0.693     4.612   72.857   64.603
LGA    T   129_O      T   129_B     1.362     0    0.009   0.042     1.924   77.143   80.272
LGA    A   130_O      A   130_B     2.306     0    0.035   0.039     2.661   66.786   64.857
LGA    D   131_O      D   131_B     1.489     0    0.011   0.120     1.671   77.143   79.286
LGA    G   132_O      G   132_B     1.829     0    0.037   0.037     1.829   72.857   72.857
LGA    R   133_O      R   133_B     1.244     0    0.039   0.875     6.185   81.429   59.784
LGA    V   134_O      V   134_B     1.090     0    0.041   0.087     1.339   81.429   84.014
LGA    Y   135_O      Y   135_B     1.625     0    0.063   0.413     4.619   79.286   58.373
LGA    L   136_O      L   136_B     0.967     0    0.186   0.190     1.645   81.548   86.012
LGA    K   137_O      K   137_B     1.779     0    0.579   0.644     4.009   66.071   59.683
LGA    R   138_O      R   138_B     0.378     0    0.178   1.043     9.328   78.333   46.320
LGA    E   139_O      E   139_B     3.078     0    0.073   0.995    11.561   67.262   33.598
LGA    E   140_O      E   140_B     2.547     0    0.653   0.623     7.898   62.976   35.503
LGA    E   141_O      E   141_B     0.554     0    0.095   0.558     5.197   88.214   68.730
LGA    C   142_O      C   142_B     0.870     0    0.104   0.164     1.340   90.476   87.460
LGA    L   143_O      L   143_B     1.370     0    0.248   0.293     1.683   79.286   82.619
LGA    A   144_O      A   144_B     2.903     0    0.081   0.087     3.127   57.143   55.714
LGA    A   145_O      A   145_B     2.384     0    0.065   0.062     2.480   64.762   64.762
LGA    C   146_O      C   146_B     2.238     0    0.028   0.297     2.374   64.762   64.762
LGA    S   147_O      S   147_B     2.729     0    0.013   0.099     3.226   57.143   55.952
LGA    A   148_O      A   148_B     2.388     0    0.023   0.023     2.436   64.762   64.762
LGA    A   149_O      A   149_B     2.286     0    0.028   0.040     2.556   64.762   63.238
LGA    P   150_O      P   150_B     1.819     0    0.049   0.347     2.176   68.810   69.388
LGA    M   151_O      M   151_B     2.022     0    0.068   1.069     4.252   70.833   64.345
LGA    M   152_O      M   152_B     1.342     0    0.067   1.007     2.582   75.000   74.226
LGA    V   153_O      V   153_B     1.690     0    0.015   1.035     3.885   72.857   65.374
LGA    I   154_O      I   154_B     1.788     0    0.035   0.086     2.178   68.810   70.893
LGA    N   155_O      N   155_B     2.317     0    0.014   1.107     3.859   60.952   62.202
LGA    G   156_O      G   156_B     2.739     0    0.019   0.019     2.858   57.143   57.143
LGA    H   157_O      H   157_B     2.622     0    0.042   1.107     4.534   60.952   57.857
LGA    Y   158_O      Y   158_B     2.618     0    0.021   0.362     5.033   59.048   46.230
LGA    H   159_O      H   159_B     2.140     0    0.090   0.110     2.328   64.762   69.619
LGA    E   160_O      E   160_B     2.291     0    0.070   0.181     2.621   64.762   63.915
LGA    H   161_O      H   161_B     2.335     0    0.017   0.090     2.550   64.762   63.238
LGA    L   162_O      L   162_B     1.955     0    0.062   0.130     2.196   66.786   68.810
LGA    T   163_O      T   163_B     1.953     0    0.015   0.026     2.246   72.857   69.388
LGA    K   164_O      K   164_B     1.776     0    0.022   0.546     2.635   72.857   71.111
LGA    E   165_O      E   165_B     1.772     0    0.026   0.821     3.903   72.857   66.085
LGA    K   166_O      K   166_B     1.843     0    0.058   0.889     3.559   72.857   69.735
LGA    V   167_O      V   167_B     1.600     0    0.018   0.037     1.906   77.143   75.306
LGA    D   168_O      D   168_B     1.286     0    0.045   0.814     3.169   81.429   74.345
LGA    A   169_O      A   169_B     1.395     0    0.019   0.023     1.569   81.429   79.714
LGA    L   170_O      L   170_B     1.396     0    0.011   0.113     1.783   81.429   79.286
LGA    L   171_O      L   171_B     0.797     0    0.034   0.074     1.020   90.476   89.345
LGA    D   172_O      D   172_B     0.753     0    0.082   0.156     1.412   85.952   85.952
LGA    G   173_O      G   173_B     1.441     0    0.079   0.079     1.927   77.143   77.143
LGA    L   174_O      L   174_B     1.573     0    0.248   0.351     2.639   71.071   75.179
LGA    E   175_O      E   175_B     1.207     0    0.251   0.753     7.072   62.500   42.593

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      163     652    652  100.00    1282   1282  100.00               163
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.885          1.875                  2.557           78.209   73.429

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  175  163    4.0    158    1.47    82.209    91.155    10.068

LGA_LOCAL      RMSD:   1.469  Number of atoms:  158  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.927  Number of assigned atoms:  163 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.885  Standard rmsd on all 163 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.348367 * X  +  -0.735555 * Y  +  -0.581033 * Z  +  33.014801
  Y_new =   0.688739 * X  +   0.621326 * Y  +  -0.373621 * Z  +  25.561607
  Z_new =   0.635830 * X  +  -0.270023 * Y  +   0.723055 * Z  +   8.410252 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  1.102517 -0.689083 -0.357409   [DEG:   63.1696  -39.4815  -20.4780 ]
ZXZ: -0.999337  0.762582  1.972394   [DEG:  -57.2578   43.6927  113.0099 ]
 
# END of job
