
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  175 ( 1372),  selected  163 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  163 ( 1282),  selected  163 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:O  -ch2:B  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   163      13_B - 175_B       1.83     1.83
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   163      13_B - 175_B       1.83     1.83
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   120      19_B - 138_B       0.99     1.95
  LCS_AVERAGE:     67.29

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  163
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     V    13_O     V    13_B      5  163  163      4    5    5    5    5   98  108  115  143  158  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    14_O     D    14_B      5  163  163      4    5    5   57   81   98  108  117  143  158  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    15_O     P    15_B      5  163  163      4   24   70   81   90  109  122  138  158  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    16_O     Q    16_B      5  163  163      9   23   41   81   89   98  122  132  153  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    17_O     V    17_B     84  163  163      3    5   14   21   57   93  112  155  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    18_O     V    18_B    112  163  163      4    4   34  108  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    19_O     L    19_B    120  163  163     14   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    20_O     S    20_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    21_O     D    21_B    120  163  163     49   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    22_O     K    22_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T    23_O     T    23_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    24_O     R    24_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    25_O     A    25_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    26_O     H    26_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I    27_O     I    27_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    28_O     D    28_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    29_O     H    29_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W    30_O     W    30_B    120  163  163     50   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    31_O     L    31_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    32_O     A    32_B    120  163  163     44   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    33_O     K    33_B    120  163  163     11   78  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    34_O     F    34_B    120  163  163     28   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    35_O     P    35_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    36_O     P    36_B    120  163  163     16   83  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    37_O     D    37_B    120  163  163     23   75   99  132  150  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    38_O     R    38_B    120  163  163     36   87  109  132  152  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    39_O     K    39_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    40_O     R    40_B    120  163  163     36   87  112  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    41_O     S    41_B    120  163  163     36   87  112  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    42_O     A    42_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    43_O     V    43_B    120  163  163     49   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    44_O     L    44_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    45_O     Q    45_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    46_O     G    46_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    47_O     L    47_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    48_O     H    48_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    49_O     A    49_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    50_O     A    50_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    51_O     Q    51_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    52_O     E    52_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    53_O     Q    53_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N    54_O     N    54_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    55_O     Q    55_B    120  163  163     44   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    56_O     G    56_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W    57_O     W    57_B    120  163  163      6   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    58_O     L    58_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T    59_O     T    59_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    60_O     D    60_B    120  163  163     44   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    61_O     E    61_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    62_O     L    62_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I    63_O     I    63_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    64_O     V    64_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    65_O     G    65_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    66_O     V    66_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    67_O     A    67_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    68_O     K    68_B    120  163  163     50   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y    69_O     Y    69_B    120  163  163     19   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    70_O     L    70_B    120  163  163     36   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    71_O     E    71_B    120  163  163     49   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    72_O     L    72_B    120  163  163     19   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    73_O     P    73_B    120  163  163      9   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    74_O     P    74_B    120  163  163      5   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    75_O     V    75_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W    76_O     W    76_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    77_O     A    77_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y    78_O     Y    78_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    79_O     E    79_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    80_O     V    80_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    81_O     A    81_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    82_O     S    82_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    83_O     F    83_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y    84_O     Y    84_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    85_O     S    85_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     M    86_O     M    86_B    120  163  163     40   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    87_O     F    87_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    88_O     E    88_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T    89_O     T    89_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    90_O     E    90_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    91_O     K    91_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    92_O     V    92_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    93_O     G    93_B    120  163  163     48   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    94_O     R    94_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    95_O     H    95_B    120  163  163     32   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N    96_O     N    96_B    120  163  163     27   74  108  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    97_O     V    97_B    120  163  163     32   69  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    98_O     A    98_B    120  163  163     32   69  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    99_O     F    99_B    120  163  163     20   68  114  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   100_O     C   100_B    120  163  163     20   69  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T   101_O     T   101_B    120  163  163     18   42  110  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N   102_O     N   102_B    120  163  163      3   30  110  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I   103_O     I   103_B    120  163  163     32   83  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S   104_O     S   104_B    120  163  163     20   78  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   105_O     C   105_B    120  163  163     32   70  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W   106_O     W   106_B    120  163  163     30   80  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   107_O     L   107_B    120  163  163     30   80  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N   108_O     N   108_B    120  163  163     28   72  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   109_O     G   109_B    120  163  163     32   70  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   110_O     A   110_B    120  163  163     32   70  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   111_O     E   111_B    120  163  163     32   78  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   112_O     D   112_B    120  163  163     27   69  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   113_O     L   113_B    120  163  163     20   69  114  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   114_O     L   114_B    120  163  163     32   78  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   115_O     A   115_B    120  163  163     32   79  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   116_O     H   116_B    120  163  163     27   69  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   117_O     A   117_B    120  163  163     21   70  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   118_O     E   118_B    120  163  163     34   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   119_O     K   119_B    120  163  163     32   70  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   120_O     K   120_B    120  163  163     32   78  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   121_O     L   121_B    120  163  163     32   83  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   122_O     G   122_B    120  163  163     32   83  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   123_O     C   123_B    120  163  163     46   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   124_O     K   124_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   125_O     L   125_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   126_O     G   126_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q   127_O     Q   127_B    120  163  163     17   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S   128_O     S   128_B    120  163  163     27   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T   129_O     T   129_B    120  163  163     32   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   130_O     A   130_B    120  163  163     21   69  112  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   131_O     D   131_B    120  163  163     32   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   132_O     G   132_B    120  163  163     32   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R   133_O     R   133_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V   134_O     V   134_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y   135_O     Y   135_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   136_O     L   136_B    120  163  163     52   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   137_O     K   137_B    120  163  163     11   87  110  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R   138_O     R   138_B    120  163  163      3   87  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   139_O     E   139_B     96  163  163      3    3   37  112  140  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   140_O     E   140_B     88  163  163      3   15   70  134  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   141_O     E   141_B     88  163  163      0    4  110  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   142_O     C   142_B     88  163  163     10   71  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   143_O     L   143_B     88  163  163     10   69  110  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   144_O     A   144_B     88  163  163     10   67   86  121  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   145_O     A   145_B     88  163  163     18   68   90  133  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   146_O     C   146_B     88  163  163     32   68   89  133  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S   147_O     S   147_B     88  163  163      3   61   89  138  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   148_O     A   148_B     88  163  163     27   69   95  136  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   149_O     A   149_B     88  163  163     32   69  103  139  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P   150_O     P   150_B     88  163  163     32   69  110  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     M   151_O     M   151_B     88  163  163     32   69  108  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     M   152_O     M   152_B     88  163  163     32   69  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V   153_O     V   153_B     88  163  163     32   69  111  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I   154_O     I   154_B     88  163  163     32   69  108  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N   155_O     N   155_B     88  163  163     32   69   95  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   156_O     G   156_B     88  163  163     32   69   88  126  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   157_O     H   157_B     88  163  163     32   69   90  129  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y   158_O     Y   158_B     88  163  163     32   69   89  126  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   159_O     H   159_B     88  163  163     32   69  103  139  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   160_O     E   160_B     88  163  163     32   69  103  138  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   161_O     H   161_B     88  163  163     32   69  103  139  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   162_O     L   162_B     88  163  163     32   69  108  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T   163_O     T   163_B     88  163  163     32   69  108  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   164_O     K   164_B     88  163  163     32   69  110  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   165_O     E   165_B     88  163  163     32   69  110  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   166_O     K   166_B     88  163  163     32   69  110  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V   167_O     V   167_B     88  163  163     32   69  113  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   168_O     D   168_B     88  163  163     32   69  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   169_O     A   169_B     88  163  163     32   69  114  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   170_O     L   170_B     88  163  163     32   69  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   171_O     L   171_B     88  163  163     32   78  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   172_O     D   172_B     88  163  163     32   78  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   173_O     G   173_B     88  163  163     32   69  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   174_O     L   174_B     88  163  163     32   69  115  140  153  157  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   175_O     E   175_B     85  163  163      0    3    4   35   82  154  157  158  159  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  89.10  (  67.29  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     52     87    115    140    153    157    157    158    159    161    163    163    163    163    163    163    163    163    163    163 
GDT PERCENT_AT  31.90  53.37  70.55  85.89  93.87  96.32  96.32  96.93  97.55  98.77 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.36   0.55   0.91   1.14   1.30   1.36   1.36   1.39   1.45   1.65   1.83   1.83   1.83   1.83   1.83   1.83   1.83   1.83   1.83   1.83
GDT RMS_ALL_AT   2.30   2.25   1.93   1.89   1.87   1.87   1.87   1.87   1.86   1.84   1.83   1.83   1.83   1.83   1.83   1.83   1.83   1.83   1.83   1.83

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  D    21_O      D    21_B
#   possible swapping detected:  F    34_O      F    34_B
#   possible swapping detected:  E    52_O      E    52_B
#   possible swapping detected:  E    61_O      E    61_B
#   possible swapping detected:  Y    69_O      Y    69_B
#   possible swapping detected:  F    83_O      F    83_B
#   possible swapping detected:  Y    84_O      Y    84_B
#   possible swapping detected:  F    87_O      F    87_B
#   possible swapping detected:  E   140_O      E   140_B
#   possible swapping detected:  E   165_O      E   165_B

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    V    13_O      V    13_B     7.693     0    0.192   1.050     8.421    6.548   10.816
LGA    D    14_O      D    14_B     8.054     0    0.071   0.382     9.681    8.810    5.357
LGA    P    15_O      P    15_B     7.139     0    0.169   0.225     8.868   10.833    7.959
LGA    Q    16_O      Q    16_B     7.792     0    0.027   0.894    14.687   11.190    5.132
LGA    V    17_O      V    17_B     5.556     0    0.579   0.565     8.293   23.214   17.755
LGA    V    18_O      V    18_B     2.233     0    0.662   1.235     5.628   77.381   58.776
LGA    L    19_O      L    19_B     1.060     0    0.097   0.162     2.070   85.952   79.464
LGA    S    20_O      S    20_B     0.539     0    0.063   0.138     1.165   88.214   90.556
LGA    D    21_O      D    21_B     0.479     0    0.018   0.681     1.707   97.619   93.095
LGA    K    22_O      K    22_B     0.482     0    0.036   1.039     6.196   95.238   71.323
LGA    T    23_O      T    23_B     0.866     0    0.016   0.062     1.039   88.214   87.891
LGA    R    24_O      R    24_B     0.863     0    0.135   1.016     3.488   83.810   72.078
LGA    A    25_O      A    25_B     1.103     0    0.038   0.040     1.128   81.429   81.429
LGA    H    26_O      H    26_B     1.147     0    0.043   0.131     1.204   81.429   83.238
LGA    I    27_O      I    27_B     1.384     0    0.024   0.081     1.446   81.429   81.429
LGA    D    28_O      D    28_B     1.264     0    0.019   0.149     1.267   81.429   83.690
LGA    H    29_O      H    29_B     1.146     0    0.022   1.356     5.456   81.429   61.095
LGA    W    30_O      W    30_B     1.322     0    0.083   1.504     5.788   81.429   64.286
LGA    L    31_O      L    31_B     1.255     0    0.038   0.162     1.995   81.429   80.357
LGA    A    32_O      A    32_B     0.889     0    0.031   0.034     1.225   85.952   86.857
LGA    K    33_O      K    33_B     1.384     0    0.029   0.248     2.373   79.286   74.815
LGA    F    34_O      F    34_B     1.376     0    0.036   0.282     3.011   83.690   71.126
LGA    P    35_O      P    35_B     0.966     0    0.021   0.052     1.605   83.690   81.497
LGA    P    36_O      P    36_B     1.398     0    0.022   0.023     2.125   75.119   77.891
LGA    D    37_O      D    37_B     2.565     0    0.036   1.011     3.035   57.262   65.476
LGA    R    38_O      R    38_B     2.435     0    0.103   0.767     3.898   64.762   58.139
LGA    K    39_O      K    39_B     1.687     0    0.048   0.851     2.252   70.833   72.011
LGA    R    40_O      R    40_B     1.878     0    0.062   0.997     2.943   72.857   76.234
LGA    S    41_O      S    41_B     1.978     0    0.041   0.676     3.105   72.857   67.698
LGA    A    42_O      A    42_B     1.345     0    0.048   0.054     1.616   79.286   79.714
LGA    V    43_O      V    43_B     1.495     0    0.010   0.055     1.920   81.429   77.755
LGA    L    44_O      L    44_B     1.499     0    0.101   1.102     3.436   77.143   72.202
LGA    Q    45_O      Q    45_B     0.911     0    0.052   0.430     1.572   88.214   87.566
LGA    G    46_O      G    46_B     0.916     0    0.065   0.065     1.005   88.214   88.214
LGA    L    47_O      L    47_B     0.871     0    0.033   0.151     1.068   90.476   89.345
LGA    H    48_O      H    48_B     0.905     0    0.014   1.146     5.306   90.476   64.095
LGA    A    49_O      A    49_B     0.912     0    0.019   0.023     0.988   90.476   90.476
LGA    A    50_O      A    50_B     0.620     0    0.052   0.057     0.849   90.476   90.476
LGA    Q    51_O      Q    51_B     0.723     0    0.014   0.148     0.746   90.476   91.534
LGA    E    52_O      E    52_B     0.771     0    0.010   0.838     2.177   90.476   82.698
LGA    Q    53_O      Q    53_B     0.640     0    0.006   0.235     0.832   90.476   92.593
LGA    N    54_O      N    54_B     0.453     0    0.065   0.106     0.613   95.238   97.619
LGA    Q    55_O      Q    55_B     0.988     0    0.031   0.776     4.179   90.476   74.127
LGA    G    56_O      G    56_B     0.203     0    0.052   0.052     0.660   95.238   95.238
LGA    W    57_O      W    57_B     1.208     0    0.241   1.599     4.384   85.952   70.306
LGA    L    58_O      L    58_B     0.447     0    0.014   0.174     1.022   97.619   92.917
LGA    T    59_O      T    59_B     0.601     0    0.051   0.059     0.697   95.238   93.197
LGA    D    60_O      D    60_B     0.899     0    0.010   0.206     1.608   90.476   84.881
LGA    E    61_O      E    61_B     0.710     0    0.077   0.722     3.783   90.476   72.381
LGA    L    62_O      L    62_B     0.481     0    0.037   0.079     0.760   95.238   94.048
LGA    I    63_O      I    63_B     0.438     0    0.029   0.159     0.578   97.619   96.429
LGA    V    64_O      V    64_B     0.477     0    0.008   0.048     0.672   95.238   95.918
LGA    G    65_O      G    65_B     0.848     0    0.066   0.066     0.848   90.476   90.476
LGA    V    66_O      V    66_B     0.900     0    0.014   0.040     1.033   88.214   89.184
LGA    A    67_O      A    67_B     0.741     0    0.028   0.031     0.939   90.476   90.476
LGA    K    68_O      K    68_B     1.249     0    0.012   0.543     2.826   79.286   73.228
LGA    Y    69_O      Y    69_B     1.679     0    0.051   1.271     6.259   70.833   57.778
LGA    L    70_O      L    70_B     1.698     0    0.034   0.120     1.928   72.857   73.929
LGA    E    71_O      E    71_B     1.755     0    0.012   0.258     2.596   72.857   69.312
LGA    L    72_O      L    72_B     1.613     0    0.034   0.174     1.642   77.143   75.000
LGA    P    73_O      P    73_B     1.368     0    0.119   0.158     1.706   79.286   78.980
LGA    P    74_O      P    74_B     1.137     0    0.073   0.137     1.229   83.690   84.014
LGA    V    75_O      V    75_B     0.613     0    0.100   0.976     2.699   90.476   83.197
LGA    W    76_O      W    76_B     0.894     0    0.042   1.619     8.195   90.476   44.286
LGA    A    77_O      A    77_B     0.643     0    0.038   0.041     0.886   90.476   90.476
LGA    Y    78_O      Y    78_B     0.816     0    0.008   1.480     7.713   90.476   59.444
LGA    E    79_O      E    79_B     0.789     0    0.022   0.158     1.375   90.476   86.455
LGA    V    80_O      V    80_B     0.520     0    0.040   0.097     0.549   92.857   94.558
LGA    A    81_O      A    81_B     0.604     0    0.021   0.024     0.660   90.476   90.476
LGA    S    82_O      S    82_B     0.536     0    0.028   0.279     0.984   92.857   93.651
LGA    F    83_O      F    83_B     0.645     0    0.010   0.040     0.769   90.476   90.476
LGA    Y    84_O      Y    84_B     0.749     0    0.056   0.153     1.204   90.476   87.460
LGA    S    85_O      S    85_B     0.776     0    0.034   0.170     0.884   90.476   90.476
LGA    M    86_O      M    86_B     0.435     0    0.061   0.689     4.279   92.857   80.655
LGA    F    87_O      F    87_B     0.719     0    0.022   0.080     0.942   90.476   90.476
LGA    E    88_O      E    88_B     0.400     0    0.054   0.141     1.491   97.619   91.693
LGA    T    89_O      T    89_B     0.293     0    0.037   0.087     0.498  100.000  100.000
LGA    E    90_O      E    90_B     0.596     0    0.029   1.006     4.327   97.619   72.857
LGA    K    91_O      K    91_B     0.648     0    0.023   1.047     5.732   90.476   74.603
LGA    V    92_O      V    92_B     0.457     0    0.020   0.075     1.144   90.595   91.905
LGA    G    93_O      G    93_B     1.173     0    0.058   0.058     1.173   83.690   83.690
LGA    R    94_O      R    94_B     1.202     0    0.044   1.273     4.908   81.429   66.667
LGA    H    95_O      H    95_B     1.118     0    0.108   0.146     1.237   81.429   88.762
LGA    N    96_O      N    96_B     1.800     0    0.053   1.098     5.751   72.857   58.869
LGA    V    97_O      V    97_B     1.193     0    0.059   0.095     1.336   81.429   82.721
LGA    A    98_O      A    98_B     1.109     0    0.153   0.189     1.370   83.690   83.238
LGA    F    99_O      F    99_B     1.434     0    0.042   0.075     1.464   81.429   81.429
LGA    C   100_O      C   100_B     1.271     0    0.049   0.691     1.989   81.429   80.000
LGA    T   101_O      T   101_B     1.848     0    0.086   0.087     2.195   70.833   68.231
LGA    N   102_O      N   102_B     1.639     0    0.075   0.271     3.881   79.405   68.452
LGA    I   103_O      I   103_B     0.602     0    0.061   1.545     5.812   95.238   73.214
LGA    S   104_O      S   104_B     0.480     0    0.013   0.117     0.683   92.857   92.063
LGA    C   105_O      C   105_B     1.038     0    0.031   0.062     1.840   85.952   83.016
LGA    W   106_O      W   106_B     0.347     0    0.013   0.274     1.963   95.238   86.837
LGA    L   107_O      L   107_B     0.439     0    0.130   0.128     0.755   95.238   96.429
LGA    N   108_O      N   108_B     1.013     0    0.152   1.044     3.738   88.214   81.190
LGA    G   109_O      G   109_B     1.124     0    0.026   0.026     1.142   81.429   81.429
LGA    A   110_O      A   110_B     1.065     0    0.051   0.060     1.148   83.690   83.238
LGA    E   111_O      E   111_B     0.749     0    0.026   0.950     4.104   90.476   76.032
LGA    D   112_O      D   112_B     1.289     0    0.040   0.378     2.385   81.429   78.274
LGA    L   113_O      L   113_B     1.465     0    0.026   1.152     4.503   81.429   73.036
LGA    L   114_O      L   114_B     0.729     0    0.076   0.189     0.978   90.476   90.476
LGA    A   115_O      A   115_B     0.676     0    0.008   0.013     0.952   90.476   90.476
LGA    H   116_O      H   116_B     1.308     0    0.064   0.147     1.961   81.429   76.286
LGA    A   117_O      A   117_B     0.972     0    0.023   0.024     1.055   88.214   86.857
LGA    E   118_O      E   118_B     0.214     0    0.021   0.223     0.882  100.000   96.825
LGA    K   119_O      K   119_B     1.050     0    0.010   1.070     7.534   88.214   60.952
LGA    K   120_O      K   120_B     0.732     0    0.045   0.477     1.539   92.857   87.566
LGA    L   121_O      L   121_B     0.422     0    0.065   0.124     0.630   95.238   95.238
LGA    G   122_O      G   122_B     0.721     0    0.117   0.117     0.868   90.476   90.476
LGA    C   123_O      C   123_B     0.687     0    0.020   0.180     1.110   90.476   88.968
LGA    K   124_O      K   124_B     0.627     0    0.025   0.925     5.439   90.476   72.910
LGA    L   125_O      L   125_B     0.618     0    0.033   0.153     1.119   92.857   90.536
LGA    G   126_O      G   126_B     1.375     0    0.029   0.029     1.793   77.143   77.143
LGA    Q   127_O      Q   127_B     1.574     0    0.060   0.227     2.347   75.000   72.011
LGA    S   128_O      S   128_B     1.414     0    0.021   0.681     4.070   79.286   71.190
LGA    T   129_O      T   129_B     1.106     0    0.022   0.063     1.510   79.286   82.789
LGA    A   130_O      A   130_B     1.775     0    0.033   0.037     1.994   75.000   74.571
LGA    D   131_O      D   131_B     1.309     0    0.012   0.065     1.384   81.429   81.429
LGA    G   132_O      G   132_B     1.493     0    0.042   0.042     1.493   81.429   81.429
LGA    R   133_O      R   133_B     1.099     0    0.026   1.013     4.755   81.429   61.861
LGA    V   134_O      V   134_B     0.930     0    0.038   0.094     1.092   83.690   86.599
LGA    Y   135_O      Y   135_B     1.296     0    0.028   0.249     4.129   81.429   65.000
LGA    L   136_O      L   136_B     1.025     0    0.080   0.134     1.384   81.429   85.952
LGA    K   137_O      K   137_B     1.638     0    0.568   0.657     3.739   67.619   67.037
LGA    R   138_O      R   138_B     0.805     0    0.168   1.104     9.382   72.024   44.026
LGA    E   139_O      E   139_B     2.982     0    0.037   1.106    11.247   71.071   35.661
LGA    E   140_O      E   140_B     2.274     0    0.695   0.955     9.334   63.095   34.762
LGA    E   141_O      E   141_B     1.890     0    0.536   0.877     6.901   77.381   48.730
LGA    C   142_O      C   142_B     1.094     0    0.012   0.172     1.677   81.548   80.079
LGA    L   143_O      L   143_B     1.665     0    0.107   0.183     2.074   72.976   79.464
LGA    A   144_O      A   144_B     2.932     0    0.042   0.048     3.165   55.357   54.286
LGA    A   145_O      A   145_B     2.692     0    0.023   0.032     2.738   57.143   57.143
LGA    C   146_O      C   146_B     2.766     0    0.661   0.580     5.320   47.619   50.794
LGA    S   147_O      S   147_B     2.338     0    0.022   0.049     3.088   64.762   61.032
LGA    A   148_O      A   148_B     2.510     0    0.048   0.048     2.820   62.857   61.714
LGA    A   149_O      A   149_B     2.170     0    0.031   0.046     2.424   64.762   64.762
LGA    P   150_O      P   150_B     1.707     0    0.038   0.342     2.028   70.833   71.701
LGA    M   151_O      M   151_B     1.914     0    0.068   1.042     4.248   72.857   66.369
LGA    M   152_O      M   152_B     1.257     0    0.068   1.010     2.516   79.286   76.369
LGA    V   153_O      V   153_B     1.564     0    0.016   1.035     3.787   77.143   67.823
LGA    I   154_O      I   154_B     1.662     0    0.036   0.091     2.018   70.833   72.917
LGA    N   155_O      N   155_B     2.148     0    0.017   1.109     3.623   66.786   66.131
LGA    G   156_O      G   156_B     2.536     0    0.023   0.023     2.659   59.048   59.048
LGA    H   157_O      H   157_B     2.442     0    0.050   1.103     4.362   66.786   63.905
LGA    Y   158_O      Y   158_B     2.510     0    0.019   0.370     5.104   60.952   46.389
LGA    H   159_O      H   159_B     2.061     0    0.073   0.094     2.191   64.762   69.619
LGA    E   160_O      E   160_B     2.213     0    0.076   0.181     2.469   64.762   64.762
LGA    H   161_O      H   161_B     2.215     0    0.019   0.064     2.549   64.762   63.238
LGA    L   162_O      L   162_B     1.833     0    0.056   0.139     2.049   68.810   70.833
LGA    T   163_O      T   163_B     1.827     0    0.022   0.034     2.132   72.857   70.544
LGA    K   164_O      K   164_B     1.662     0    0.020   0.543     2.465   72.857   71.958
LGA    E   165_O      E   165_B     1.673     0    0.028   0.822     3.924   72.857   66.931
LGA    K   166_O      K   166_B     1.727     0    0.065   0.449     2.187   75.000   72.011
LGA    V   167_O      V   167_B     1.528     0    0.016   0.044     1.783   77.143   75.306
LGA    D   168_O      D   168_B     1.256     0    0.046   0.813     3.146   81.429   74.345
LGA    A   169_O      A   169_B     1.322     0    0.017   0.020     1.486   81.429   81.429
LGA    L   170_O      L   170_B     1.287     0    0.014   0.125     1.677   81.429   80.357
LGA    L   171_O      L   171_B     0.658     0    0.025   0.067     0.863   92.857   91.667
LGA    D   172_O      D   172_B     0.665     0    0.043   0.177     1.405   90.476   88.214
LGA    G   173_O      G   173_B     1.125     0    0.096   0.096     1.531   81.548   81.548
LGA    L   174_O      L   174_B     1.124     0    0.592   0.531     1.336   83.690   82.560
LGA    E   175_O      E   175_B     4.022     0    0.610   0.737    11.118   35.000   18.624

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      163     652    652  100.00    1282   1282  100.00               163
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.830          1.821                  2.556           79.850   75.001

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  175  163    4.0    158    1.39    84.049    91.960    10.587

LGA_LOCAL      RMSD:   1.392  Number of atoms:  158  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.875  Number of assigned atoms:  163 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.830  Standard rmsd on all 163 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.957396 * X  +   0.195239 * Y  +   0.212778 * Z  +  27.871275
  Y_new =  -0.235410 * X  +   0.954420 * Y  +   0.183479 * Z  +  25.680218
  Z_new =  -0.167257 * X  +  -0.225752 * Y  +   0.959719 * Z  +   8.330287 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -0.241103  0.168047 -0.231027   [DEG:  -13.8142    9.6284  -13.2369 ]
ZXZ:  2.282388  0.284795 -2.503947   [DEG:  130.7712   16.3176 -143.4656 ]
 
# END of job
