
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  175 ( 1372),  selected  163 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  163 ( 1282),  selected  163 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:O  -ch2:B  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   163      13_B - 175_B       1.86     1.86
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   163      13_B - 175_B       1.86     1.86
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    93      19_B - 111_B       1.00     2.01
  LCS_AVERAGE:     54.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  163
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     V    13_O     V    13_B      5  163  163      5    5    5    5   27   44   58  115  140  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    14_O     D    14_B      5  163  163      5    5    5    5    6   92  106  125  139  160  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    15_O     P    15_B      5  163  163     16   29   70   81   87   99  123  137  155  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    16_O     Q    16_B      5  163  163      5   20   72   81   86   96  123  130  155  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    17_O     V    17_B     84  163  163      5    5    5   25   61   94  128  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    18_O     V    18_B     91  163  163      3    4   79  136  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    19_O     L    19_B     93  163  163     36   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    20_O     S    20_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    21_O     D    21_B     93  163  163     47   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    22_O     K    22_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T    23_O     T    23_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    24_O     R    24_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    25_O     A    25_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    26_O     H    26_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I    27_O     I    27_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    28_O     D    28_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    29_O     H    29_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W    30_O     W    30_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    31_O     L    31_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    32_O     A    32_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    33_O     K    33_B     93  163  163     13   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    34_O     F    34_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    35_O     P    35_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    36_O     P    36_B     93  163  163     21   74  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    37_O     D    37_B     93  163  163     28   75  102  133  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    38_O     R    38_B     93  163  163     37   79  103  135  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    39_O     K    39_B     93  163  163     47   79  103  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    40_O     R    40_B     93  163  163     32   79  103  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    41_O     S    41_B     93  163  163     43   79  103  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    42_O     A    42_B     93  163  163     47   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    43_O     V    43_B     93  163  163     43   79  103  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    44_O     L    44_B     93  163  163     47   79  104  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    45_O     Q    45_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    46_O     G    46_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    47_O     L    47_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    48_O     H    48_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    49_O     A    49_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    50_O     A    50_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    51_O     Q    51_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    52_O     E    52_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    53_O     Q    53_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N    54_O     N    54_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    55_O     Q    55_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    56_O     G    56_B     93  163  163     42   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W    57_O     W    57_B     93  163  163      6   74  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    58_O     L    58_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T    59_O     T    59_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    60_O     D    60_B     93  163  163     47   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    61_O     E    61_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    62_O     L    62_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I    63_O     I    63_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    64_O     V    64_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    65_O     G    65_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    66_O     V    66_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    67_O     A    67_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    68_O     K    68_B     93  163  163     29   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y    69_O     Y    69_B     93  163  163     15   79  103  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    70_O     L    70_B     93  163  163     15   79  103  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    71_O     E    71_B     93  163  163     15   79  103  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    72_O     L    72_B     93  163  163     15   79  103  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    73_O     P    73_B     93  163  163      7   79  104  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    74_O     P    74_B     93  163  163     32   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    75_O     V    75_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W    76_O     W    76_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    77_O     A    77_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y    78_O     Y    78_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    79_O     E    79_B     93  163  163     36   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    80_O     V    80_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    81_O     A    81_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    82_O     S    82_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    83_O     F    83_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y    84_O     Y    84_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    85_O     S    85_B     93  163  163     47   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     M    86_O     M    86_B     93  163  163     42   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    87_O     F    87_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    88_O     E    88_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T    89_O     T    89_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    90_O     E    90_B     93  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    91_O     K    91_B     93  163  163     47   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    92_O     V    92_B     93  163  163     40   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    93_O     G    93_B     93  163  163      9   50   79  122  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    94_O     R    94_B     93  163  163     15   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    95_O     H    95_B     93  163  163     33   74  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N    96_O     N    96_B     93  163  163      6   66  101  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    97_O     V    97_B     93  163  163     29   66  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    98_O     A    98_B     93  163  163     29   66  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    99_O     F    99_B     93  163  163     15   64  103  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   100_O     C   100_B     93  163  163     14   65  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T   101_O     T   101_B     93  163  163     18   46  103  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N   102_O     N   102_B     93  163  163      4   46  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I   103_O     I   103_B     93  163  163     12   74  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S   104_O     S   104_B     93  163  163     12   74  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   105_O     C   105_B     93  163  163     29   66  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W   106_O     W   106_B     93  163  163     22   74  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   107_O     L   107_B     93  163  163     17   74  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N   108_O     N   108_B     93  163  163     20   67  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   109_O     G   109_B     93  163  163     33   66  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   110_O     A   110_B     93  163  163     33   66  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   111_O     E   111_B     93  163  163     33   73  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   112_O     D   112_B     86  163  163     32   66  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   113_O     L   113_B     86  163  163     20   66  103  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   114_O     L   114_B     86  163  163     33   69  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   115_O     A   115_B     86  163  163     33   74  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   116_O     H   116_B     86  163  163     20   66  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   117_O     A   117_B     86  163  163     20   66  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   118_O     E   118_B     86  163  163     33   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   119_O     K   119_B     86  163  163     33   74  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   120_O     K   120_B     86  163  163     33   74  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   121_O     L   121_B     86  163  163     29   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   122_O     G   122_B     86  163  163     42   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   123_O     C   123_B     86  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   124_O     K   124_B     86  163  163     48   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   125_O     L   125_B     86  163  163     34   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   126_O     G   126_B     86  163  163      9   74  103  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q   127_O     Q   127_B     86  163  163     20   79  103  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S   128_O     S   128_B     86  163  163     20   79  103  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T   129_O     T   129_B     86  163  163      9   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   130_O     A   130_B     86  163  163      9   65   83  131  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   131_O     D   131_B     86  163  163     32   69  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   132_O     G   132_B     86  163  163     32   66  103  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R   133_O     R   133_B     86  163  163     33   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V   134_O     V   134_B     86  163  163     42   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y   135_O     Y   135_B     86  163  163      8   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   136_O     L   136_B     86  163  163     43   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   137_O     K   137_B     86  163  163     32   74  103  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R   138_O     R   138_B     86  163  163     13   74  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   139_O     E   139_B     86  163  163      3    3   79  110  149  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   140_O     E   140_B     86  163  163      3   13   69   98  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   141_O     E   141_B     86  163  163      3   79  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   142_O     C   142_B     86  163  163     11   64  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   143_O     L   143_B     86  163  163      3   64  101  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   144_O     A   144_B     86  163  163      3   34   75  101  144  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   145_O     A   145_B     86  163  163     18   66   84  128  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   146_O     C   146_B     86  163  163     27   66   83  115  151  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S   147_O     S   147_B     86  163  163     24   66   83  115  151  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   148_O     A   148_B     86  163  163     24   66   84  126  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   149_O     A   149_B     86  163  163     33   66   84  135  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P   150_O     P   150_B     86  163  163     33   66  102  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     M   151_O     M   151_B     86  163  163     33   66   99  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     M   152_O     M   152_B     86  163  163     33   66  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V   153_O     V   153_B     86  163  163     33   66  103  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I   154_O     I   154_B     86  163  163     33   66  100  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N   155_O     N   155_B     86  163  163     28   66   84  135  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   156_O     G   156_B     86  163  163     33   66   84  128  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   157_O     H   157_B     86  163  163     32   66   84  130  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y   158_O     Y   158_B     86  163  163     32   66   84  128  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   159_O     H   159_B     86  163  163     33   66   92  136  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   160_O     E   160_B     86  163  163     33   66   84  135  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   161_O     H   161_B     86  163  163     33   66   84  135  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   162_O     L   162_B     86  163  163     33   66   99  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T   163_O     T   163_B     86  163  163     33   66   99  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   164_O     K   164_B     86  163  163     33   66  100  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   165_O     E   165_B     86  163  163     33   66   99  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   166_O     K   166_B     86  163  163     33   66   99  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V   167_O     V   167_B     86  163  163     28   66  103  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   168_O     D   168_B     86  163  163     27   66  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   169_O     A   169_B     86  163  163     28   66  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   170_O     L   170_B     86  163  163     33   66  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   171_O     L   171_B     86  163  163     33   74  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   172_O     D   172_B     86  163  163     33   74  105  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   173_O     G   173_B     86  163  163     28   66  103  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   174_O     L   174_B     86  163  163     23   60  103  137  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   175_O     E   175_B     86  163  163      6   29   79  135  152  158  158  158  159  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  84.67  (  54.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     48     79    105    137    152    158    158    158    159    162    163    163    163    163    163    163    163    163    163    163 
GDT PERCENT_AT  29.45  48.47  64.42  84.05  93.25  96.93  96.93  96.93  97.55  99.39 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.34   0.54   0.95   1.20   1.36   1.45   1.45   1.45   1.50   1.77   1.86   1.86   1.86   1.86   1.86   1.86   1.86   1.86   1.86   1.86
GDT RMS_ALL_AT   2.12   2.27   1.93   1.92   1.90   1.90   1.90   1.90   1.88   1.86   1.86   1.86   1.86   1.86   1.86   1.86   1.86   1.86   1.86   1.86

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  D    21_O      D    21_B
#   possible swapping detected:  F    34_O      F    34_B
#   possible swapping detected:  D    37_O      D    37_B
#   possible swapping detected:  E    52_O      E    52_B
#   possible swapping detected:  E    61_O      E    61_B
#   possible swapping detected:  Y    69_O      Y    69_B
#   possible swapping detected:  Y    78_O      Y    78_B
#   possible swapping detected:  F    83_O      F    83_B
#   possible swapping detected:  Y    84_O      Y    84_B
#   possible swapping detected:  F    87_O      F    87_B
#   possible swapping detected:  E    88_O      E    88_B
#   possible swapping detected:  E   140_O      E   140_B
#   possible swapping detected:  E   165_O      E   165_B

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    V    13_O      V    13_B     6.907     0    0.129   1.042     7.618    9.405   18.163
LGA    D    14_O      D    14_B     7.965     0    0.031   0.399    10.011   11.071    6.250
LGA    P    15_O      P    15_B     7.301     0    0.108   0.144     9.431   10.119    6.803
LGA    Q    16_O      Q    16_B     7.817     0    0.028   0.864    15.240   12.143    5.556
LGA    V    17_O      V    17_B     5.188     0    0.581   0.565     8.186   28.095   21.088
LGA    V    18_O      V    18_B     2.061     0    0.675   1.256     5.741   77.381   58.776
LGA    L    19_O      L    19_B     0.995     0    0.110   0.161     2.030   88.214   80.595
LGA    S    20_O      S    20_B     0.535     0    0.067   0.140     1.090   88.214   92.143
LGA    D    21_O      D    21_B     0.467     0    0.018   0.682     1.771   97.619   91.905
LGA    K    22_O      K    22_B     0.477     0    0.034   1.042     6.335   95.238   69.894
LGA    T    23_O      T    23_B     0.835     0    0.018   0.062     1.035   90.476   89.184
LGA    R    24_O      R    24_B     0.784     0    0.136   1.017     3.648   85.952   73.030
LGA    A    25_O      A    25_B     0.943     0    0.039   0.041     0.948   90.476   90.476
LGA    H    26_O      H    26_B     1.053     0    0.049   0.135     1.119   83.690   85.952
LGA    I    27_O      I    27_B     1.308     0    0.026   0.085     1.355   81.429   81.429
LGA    D    28_O      D    28_B     1.103     0    0.014   0.142     1.140   81.429   84.821
LGA    H    29_O      H    29_B     0.918     0    0.027   1.361     5.655   83.690   61.810
LGA    W    30_O      W    30_B     1.335     0    0.068   1.407     4.852   81.429   68.163
LGA    L    31_O      L    31_B     1.272     0    0.027   0.147     1.992   81.429   80.357
LGA    A    32_O      A    32_B     0.675     0    0.030   0.032     0.835   90.476   90.476
LGA    K    33_O      K    33_B     1.037     0    0.039   0.236     2.190   83.690   78.677
LGA    F    34_O      F    34_B     1.075     0    0.034   0.248     2.021   85.952   80.823
LGA    P    35_O      P    35_B     0.918     0    0.032   0.055     1.456   83.690   82.721
LGA    P    36_O      P    36_B     1.451     0    0.031   0.313     2.023   75.119   75.374
LGA    D    37_O      D    37_B     2.371     0    0.026   0.944     2.789   64.881   71.369
LGA    R    38_O      R    38_B     2.256     0    0.104   0.770     3.414   64.762   61.429
LGA    K    39_O      K    39_B     1.767     0    0.041   0.848     2.328   72.857   71.958
LGA    R    40_O      R    40_B     1.988     0    0.060   1.023     3.020   72.857   73.983
LGA    S    41_O      S    41_B     1.969     0    0.034   0.125     2.104   72.857   71.508
LGA    A    42_O      A    42_B     1.442     0    0.051   0.057     1.688   75.000   76.286
LGA    V    43_O      V    43_B     1.642     0    0.014   0.076     2.121   75.000   71.769
LGA    L    44_O      L    44_B     1.613     0    0.122   1.100     3.724   75.000   69.345
LGA    Q    45_O      Q    45_B     0.925     0    0.046   0.394     1.452   88.214   88.519
LGA    G    46_O      G    46_B     0.809     0    0.071   0.071     0.927   90.476   90.476
LGA    L    47_O      L    47_B     0.802     0    0.032   0.148     1.113   90.476   88.214
LGA    H    48_O      H    48_B     0.805     0    0.015   1.149     5.262   90.476   64.095
LGA    A    49_O      A    49_B     0.782     0    0.017   0.021     0.866   90.476   90.476
LGA    A    50_O      A    50_B     0.550     0    0.053   0.059     0.796   90.476   90.476
LGA    Q    51_O      Q    51_B     0.691     0    0.019   0.155     0.721   90.476   90.476
LGA    E    52_O      E    52_B     0.657     0    0.008   0.839     2.180   90.476   81.746
LGA    Q    53_O      Q    53_B     0.544     0    0.011   0.240     0.889   95.238   94.709
LGA    N    54_O      N    54_B     0.390     0    0.053   0.073     0.478  100.000  100.000
LGA    Q    55_O      Q    55_B     0.413     0    0.031   0.928     3.528  100.000   83.810
LGA    G    56_O      G    56_B     0.087     0    0.043   0.043     0.778   95.238   95.238
LGA    W    57_O      W    57_B     1.280     0    0.249   1.601     4.131   88.214   69.898
LGA    L    58_O      L    58_B     0.434     0    0.161   0.252     1.131   95.238   89.464
LGA    T    59_O      T    59_B     0.583     0    0.044   0.061     0.669   92.857   91.837
LGA    D    60_O      D    60_B     0.884     0    0.019   0.218     1.307   90.476   85.952
LGA    E    61_O      E    61_B     0.843     0    0.081   0.731     3.257   90.476   75.608
LGA    L    62_O      L    62_B     0.738     0    0.034   0.081     0.982   90.476   90.476
LGA    I    63_O      I    63_B     0.717     0    0.031   0.160     0.876   90.476   91.667
LGA    V    64_O      V    64_B     0.762     0    0.008   0.060     0.881   90.476   90.476
LGA    G    65_O      G    65_B     1.073     0    0.073   0.073     1.073   85.952   85.952
LGA    V    66_O      V    66_B     1.033     0    0.014   0.035     1.113   81.429   82.721
LGA    A    67_O      A    67_B     0.838     0    0.034   0.037     0.956   90.476   90.476
LGA    K    68_O      K    68_B     1.307     0    0.011   0.382     4.021   79.286   67.566
LGA    Y    69_O      Y    69_B     1.736     0    0.051   1.275     6.345   70.833   57.778
LGA    L    70_O      L    70_B     1.874     0    0.033   0.148     2.274   70.833   70.833
LGA    E    71_O      E    71_B     1.938     0    0.014   0.267     2.678   70.833   66.667
LGA    L    72_O      L    72_B     1.817     0    0.032   0.171     1.836   72.857   72.857
LGA    P    73_O      P    73_B     1.547     0    0.117   0.155     1.944   72.857   74.082
LGA    P    74_O      P    74_B     1.289     0    0.070   0.134     1.395   81.429   81.429
LGA    V    75_O      V    75_B     0.872     0    0.081   0.987     3.001   88.214   80.884
LGA    W    76_O      W    76_B     1.168     0    0.051   1.612     8.434   81.429   40.544
LGA    A    77_O      A    77_B     0.845     0    0.042   0.045     1.044   88.214   88.667
LGA    Y    78_O      Y    78_B     0.972     0    0.019   1.078     7.189   85.952   56.032
LGA    E    79_O      E    79_B     1.095     0    0.026   0.110     2.294   85.952   76.931
LGA    V    80_O      V    80_B     0.733     0    0.056   0.090     0.769   90.476   90.476
LGA    A    81_O      A    81_B     0.865     0    0.019   0.020     0.942   90.476   90.476
LGA    S    82_O      S    82_B     0.744     0    0.105   0.343     1.191   92.857   90.556
LGA    F    83_O      F    83_B     1.180     0    0.044   1.190     5.589   81.429   61.775
LGA    Y    84_O      Y    84_B     1.153     0    0.051   0.212     1.299   81.429   81.429
LGA    S    85_O      S    85_B     1.139     0    0.031   0.174     1.287   81.429   82.937
LGA    M    86_O      M    86_B     0.932     0    0.060   0.637     3.404   85.952   75.119
LGA    F    87_O      F    87_B     1.078     0    0.058   0.144     1.538   79.286   83.939
LGA    E    88_O      E    88_B     0.675     0    0.033   0.684     2.676   90.476   78.201
LGA    T    89_O      T    89_B     0.696     0    0.021   0.063     0.915   90.476   90.476
LGA    E    90_O      E    90_B     0.484     0    0.042   1.015     3.604   95.238   75.503
LGA    K    91_O      K    91_B     0.532     0    0.061   1.028     6.181   88.214   73.439
LGA    V    92_O      V    92_B     0.861     0    0.599   0.583     2.487   81.786   85.510
LGA    G    93_O      G    93_B     2.365     0    0.123   0.123     2.681   62.857   62.857
LGA    R    94_O      R    94_B     1.654     0    0.096   1.444     5.513   72.857   65.584
LGA    H    95_O      H    95_B     1.576     0    0.068   0.115     1.594   75.000   80.667
LGA    N    96_O      N    96_B     1.881     0    0.060   1.012     5.673   72.857   58.036
LGA    V    97_O      V    97_B     1.195     0    0.066   0.103     1.373   81.429   82.721
LGA    A    98_O      A    98_B     1.137     0    0.164   0.203     1.387   81.429   81.429
LGA    F    99_O      F    99_B     1.582     0    0.054   0.077     1.595   75.000   77.532
LGA    C   100_O      C   100_B     1.201     0    0.038   0.110     1.342   81.429   84.444
LGA    T   101_O      T   101_B     1.640     0    0.075   0.076     1.847   72.857   72.857
LGA    N   102_O      N   102_B     1.370     0    0.045   0.916     4.473   85.952   69.286
LGA    I   103_O      I   103_B     0.541     0    0.021   1.112     3.640   95.238   77.738
LGA    S   104_O      S   104_B     0.677     0    0.015   0.123     0.899   90.476   90.476
LGA    C   105_O      C   105_B     1.228     0    0.027   0.064     1.839   83.690   80.079
LGA    W   106_O      W   106_B     0.481     0    0.008   0.247     2.024   92.857   85.578
LGA    L   107_O      L   107_B     0.508     0    0.129   0.116     0.698   92.857   96.429
LGA    N   108_O      N   108_B     1.116     0    0.144   1.127     3.767   83.690   76.726
LGA    G   109_O      G   109_B     1.258     0    0.028   0.028     1.269   81.429   81.429
LGA    A   110_O      A   110_B     1.178     0    0.051   0.063     1.271   81.429   81.429
LGA    E   111_O      E   111_B     0.855     0    0.028   0.955     4.023   88.214   75.873
LGA    D   112_O      D   112_B     1.377     0    0.040   0.376     2.526   81.429   77.321
LGA    L   113_O      L   113_B     1.578     0    0.025   1.155     4.630   77.143   69.881
LGA    L   114_O      L   114_B     0.884     0    0.077   0.184     1.098   88.214   89.345
LGA    A   115_O      A   115_B     0.747     0    0.006   0.011     0.996   90.476   90.476
LGA    H   116_O      H   116_B     1.394     0    0.060   0.148     1.995   81.429   76.286
LGA    A   117_O      A   117_B     1.096     0    0.023   0.023     1.193   85.952   85.048
LGA    E   118_O      E   118_B     0.221     0    0.019   0.218     0.779   97.619   96.825
LGA    K   119_O      K   119_B     1.062     0    0.009   1.069     7.648   88.214   60.952
LGA    K   120_O      K   120_B     0.721     0    0.048   0.471     1.566   95.238   88.624
LGA    L   121_O      L   121_B     0.405     0    0.076   0.131     0.674   95.238   94.048
LGA    G   122_O      G   122_B     0.772     0    0.114   0.114     0.896   90.476   90.476
LGA    C   123_O      C   123_B     0.721     0    0.019   0.173     1.053   92.857   90.556
LGA    K   124_O      K   124_B     0.587     0    0.022   0.927     5.279   90.476   72.910
LGA    L   125_O      L   125_B     0.748     0    0.035   0.146     1.499   90.595   87.143
LGA    G   126_O      G   126_B     1.710     0    0.043   0.043     2.259   72.976   72.976
LGA    Q   127_O      Q   127_B     1.819     0    0.067   0.223     2.537   72.857   68.413
LGA    S   128_O      S   128_B     1.752     0    0.024   0.691     4.643   72.857   64.603
LGA    T   129_O      T   129_B     1.379     0    0.024   0.039     1.970   77.143   80.272
LGA    A   130_O      A   130_B     2.309     0    0.040   0.044     2.613   66.786   64.857
LGA    D   131_O      D   131_B     1.589     0    0.012   0.150     1.704   72.857   75.000
LGA    G   132_O      G   132_B     1.920     0    0.042   0.042     1.920   72.857   72.857
LGA    R   133_O      R   133_B     1.376     0    0.013   1.171     6.593   81.429   58.874
LGA    V   134_O      V   134_B     1.156     0    0.043   0.075     1.366   81.429   84.014
LGA    Y   135_O      Y   135_B     1.617     0    0.063   0.432     4.660   79.286   58.373
LGA    L   136_O      L   136_B     0.916     0    0.199   0.211     1.565   81.548   87.202
LGA    K   137_O      K   137_B     1.627     0    0.563   0.613     3.958   67.619   62.857
LGA    R   138_O      R   138_B     0.640     0    0.175   1.038     9.515   78.095   45.238
LGA    E   139_O      E   139_B     2.779     0    0.057   1.017    11.223   71.071   35.661
LGA    E   140_O      E   140_B     2.520     0    0.700   0.702     7.933   62.976   35.503
LGA    E   141_O      E   141_B     1.521     0    0.523   0.872     6.711   79.643   51.005
LGA    C   142_O      C   142_B     1.199     0    0.091   0.141     1.686   83.690   81.508
LGA    L   143_O      L   143_B     1.714     0    0.242   0.276     2.011   70.833   76.190
LGA    A   144_O      A   144_B     3.301     0    0.076   0.082     3.593   53.571   51.524
LGA    A   145_O      A   145_B     2.630     0    0.091   0.087     2.743   57.143   57.143
LGA    C   146_O      C   146_B     2.977     0    0.053   0.122     3.105   57.143   54.762
LGA    S   147_O      S   147_B     3.063     0    0.035   0.106     3.543   53.571   51.270
LGA    A   148_O      A   148_B     2.717     0    0.015   0.016     2.780   59.048   58.667
LGA    A   149_O      A   149_B     2.310     0    0.030   0.038     2.463   64.762   64.762
LGA    P   150_O      P   150_B     1.752     0    0.044   0.342     2.132   68.810   69.388
LGA    M   151_O      M   151_B     1.908     0    0.068   1.068     4.173   72.857   65.357
LGA    M   152_O      M   152_B     1.233     0    0.065   1.004     2.514   79.286   76.369
LGA    V   153_O      V   153_B     1.523     0    0.013   1.023     3.739   79.286   69.048
LGA    I   154_O      I   154_B     1.651     0    0.023   0.078     2.046   70.833   71.905
LGA    N   155_O      N   155_B     2.180     0    0.015   0.127     2.534   64.881   67.857
LGA    G   156_O      G   156_B     2.450     0    0.019   0.019     2.545   62.857   62.857
LGA    H   157_O      H   157_B     2.399     0    0.054   1.105     4.383   66.786   64.667
LGA    Y   158_O      Y   158_B     2.481     0    0.016   0.363     4.942   64.762   49.127
LGA    H   159_O      H   159_B     2.033     0    0.083   0.106     2.238   64.762   69.619
LGA    E   160_O      E   160_B     2.246     0    0.074   0.183     2.676   64.762   63.069
LGA    H   161_O      H   161_B     2.322     0    0.018   0.075     2.735   64.762   62.476
LGA    L   162_O      L   162_B     1.915     0    0.060   0.129     2.152   68.810   69.821
LGA    T   163_O      T   163_B     1.923     0    0.013   0.026     2.208   72.857   69.388
LGA    K   164_O      K   164_B     1.771     0    0.021   0.544     2.568   72.857   71.111
LGA    E   165_O      E   165_B     1.785     0    0.026   0.821     3.946   72.857   66.085
LGA    K   166_O      K   166_B     1.852     0    0.061   0.893     3.630   72.857   67.989
LGA    V   167_O      V   167_B     1.595     0    0.016   0.037     1.875   77.143   75.306
LGA    D   168_O      D   168_B     1.291     0    0.045   0.812     3.183   81.429   74.345
LGA    A   169_O      A   169_B     1.400     0    0.019   0.023     1.583   81.429   79.714
LGA    L   170_O      L   170_B     1.399     0    0.011   0.114     1.752   81.429   79.286
LGA    L   171_O      L   171_B     0.788     0    0.042   0.070     0.978   90.476   90.476
LGA    D   172_O      D   172_B     0.739     0    0.058   0.161     1.459   85.952   85.952
LGA    G   173_O      G   173_B     1.576     0    0.110   0.110     2.112   72.976   72.976
LGA    L   174_O      L   174_B     1.739     0    0.369   0.440     3.158   67.143   73.214
LGA    E   175_O      E   175_B     2.037     0    0.376   0.768     8.545   47.619   31.270

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      163     652    652  100.00    1282   1282  100.00               163
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.855          1.852                  2.571           78.558   73.633

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  175  163    4.0    158    1.45    82.362    91.045    10.173

LGA_LOCAL      RMSD:   1.453  Number of atoms:  158  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.896  Number of assigned atoms:  163 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.855  Standard rmsd on all 163 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.890234 * X  +  -0.422911 * Y  +  -0.169205 * Z  +  30.404305
  Y_new =   0.451134 * X  +   0.767271 * Y  +   0.455822 * Z  +  27.149343
  Z_new =  -0.062946 * X  +  -0.482123 * Y  +   0.873840 * Z  +  11.078079 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  0.469040  0.062988 -0.504170   [DEG:   26.8740    3.6089  -28.8868 ]
ZXZ: -2.786150  0.507752 -3.011766   [DEG: -159.6346   29.0921 -172.5615 ]
 
# END of job
