
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  175 ( 1372),  selected  163 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  163 ( 1282),  selected  163 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:O  -ch2:B  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   163      13_B - 175_B       0.90     0.90
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   163      13_B - 175_B       0.90     0.90
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   163      13_B - 175_B       0.90     0.90
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  163
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     V    13_O     V    13_B    163  163  163     64  109  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    14_O     D    14_B    163  163  163     77  127  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    15_O     P    15_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    16_O     Q    16_B    163  163  163     71  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    17_O     V    17_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    18_O     V    18_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    19_O     L    19_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    20_O     S    20_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    21_O     D    21_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    22_O     K    22_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T    23_O     T    23_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    24_O     R    24_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    25_O     A    25_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    26_O     H    26_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I    27_O     I    27_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    28_O     D    28_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    29_O     H    29_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W    30_O     W    30_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    31_O     L    31_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    32_O     A    32_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    33_O     K    33_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    34_O     F    34_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    35_O     P    35_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    36_O     P    36_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    37_O     D    37_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    38_O     R    38_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    39_O     K    39_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    40_O     R    40_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    41_O     S    41_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    42_O     A    42_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    43_O     V    43_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    44_O     L    44_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    45_O     Q    45_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    46_O     G    46_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    47_O     L    47_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    48_O     H    48_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    49_O     A    49_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    50_O     A    50_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    51_O     Q    51_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    52_O     E    52_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    53_O     Q    53_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N    54_O     N    54_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    55_O     Q    55_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    56_O     G    56_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W    57_O     W    57_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    58_O     L    58_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T    59_O     T    59_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    60_O     D    60_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    61_O     E    61_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    62_O     L    62_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I    63_O     I    63_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    64_O     V    64_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    65_O     G    65_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    66_O     V    66_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    67_O     A    67_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    68_O     K    68_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y    69_O     Y    69_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    70_O     L    70_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    71_O     E    71_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    72_O     L    72_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    73_O     P    73_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    74_O     P    74_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    75_O     V    75_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W    76_O     W    76_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    77_O     A    77_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y    78_O     Y    78_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    79_O     E    79_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    80_O     V    80_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    81_O     A    81_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    82_O     S    82_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    83_O     F    83_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y    84_O     Y    84_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    85_O     S    85_B    163  163  163     62  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     M    86_O     M    86_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    87_O     F    87_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    88_O     E    88_B    163  163  163     77  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T    89_O     T    89_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    90_O     E    90_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    91_O     K    91_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    92_O     V    92_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    93_O     G    93_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    94_O     R    94_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    95_O     H    95_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N    96_O     N    96_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    97_O     V    97_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    98_O     A    98_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    99_O     F    99_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   100_O     C   100_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T   101_O     T   101_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N   102_O     N   102_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I   103_O     I   103_B    163  163  163     54  117  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S   104_O     S   104_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   105_O     C   105_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W   106_O     W   106_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   107_O     L   107_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N   108_O     N   108_B    163  163  163     72  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   109_O     G   109_B    163  163  163     72  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   110_O     A   110_B    163  163  163     77  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   111_O     E   111_B    163  163  163     77  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   112_O     D   112_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   113_O     L   113_B    163  163  163     76  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   114_O     L   114_B    163  163  163     77  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   115_O     A   115_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   116_O     H   116_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   117_O     A   117_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   118_O     E   118_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   119_O     K   119_B    163  163  163     77  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   120_O     K   120_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   121_O     L   121_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   122_O     G   122_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   123_O     C   123_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   124_O     K   124_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   125_O     L   125_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   126_O     G   126_B    163  163  163     58  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q   127_O     Q   127_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S   128_O     S   128_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T   129_O     T   129_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   130_O     A   130_B    163  163  163     53  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   131_O     D   131_B    163  163  163     58  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   132_O     G   132_B    163  163  163     65  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R   133_O     R   133_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V   134_O     V   134_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y   135_O     Y   135_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   136_O     L   136_B    163  163  163     79  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   137_O     K   137_B    163  163  163     72  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R   138_O     R   138_B    163  163  163     27  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   139_O     E   139_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   140_O     E   140_B    163  163  163     14   59  145  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   141_O     E   141_B    163  163  163     54   89  145  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   142_O     C   142_B    163  163  163     54   98  151  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   143_O     L   143_B    163  163  163     12   98  151  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   144_O     A   144_B    163  163  163     30   87  145  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   145_O     A   145_B    163  163  163     66  114  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   146_O     C   146_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S   147_O     S   147_B    163  163  163     38  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   148_O     A   148_B    163  163  163     64  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   149_O     A   149_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P   150_O     P   150_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     M   151_O     M   151_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     M   152_O     M   152_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V   153_O     V   153_B    163  163  163     66  121  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I   154_O     I   154_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N   155_O     N   155_B    163  163  163     66  123  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   156_O     G   156_B    163  163  163     46   89  141  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   157_O     H   157_B    163  163  163     46   89  138  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y   158_O     Y   158_B    163  163  163     66  108  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   159_O     H   159_B    163  163  163     66  121  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   160_O     E   160_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   161_O     H   161_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   162_O     L   162_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T   163_O     T   163_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   164_O     K   164_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   165_O     E   165_B    163  163  163     64  110  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   166_O     K   166_B    163  163  163     66  123  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V   167_O     V   167_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   168_O     D   168_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   169_O     A   169_B    163  163  163     66  117  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   170_O     L   170_B    163  163  163     66  122  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   171_O     L   171_B    163  163  163     66  129  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   172_O     D   172_B    163  163  163     66  126  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   173_O     G   173_B    163  163  163     64  103  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   174_O     L   174_B    163  163  163     38   87  155  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   175_O     E   175_B    163  163  163      3    3   36   98  122  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     79    129    155    162    162    162    163    163    163    163    163    163    163    163    163    163    163    163    163    163 
GDT PERCENT_AT  48.47  79.14  95.09  99.39  99.39  99.39 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.30   0.61   0.77   0.85   0.85   0.85   0.90   0.90   0.90   0.90   0.90   0.90   0.90   0.90   0.90   0.90   0.90   0.90   0.90   0.90
GDT RMS_ALL_AT   1.23   0.97   0.91   0.90   0.90   0.90   0.90   0.90   0.90   0.90   0.90   0.90   0.90   0.90   0.90   0.90   0.90   0.90   0.90   0.90

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    52_O      E    52_B
#   possible swapping detected:  Y    69_O      Y    69_B
#   possible swapping detected:  E    71_O      E    71_B
#   possible swapping detected:  E    79_O      E    79_B
#   possible swapping detected:  E    88_O      E    88_B
#   possible swapping detected:  E    90_O      E    90_B
#   possible swapping detected:  F    99_O      F    99_B
#   possible swapping detected:  E   111_O      E   111_B
#   possible swapping detected:  E   118_O      E   118_B
#   possible swapping detected:  Y   135_O      Y   135_B
#   possible swapping detected:  E   160_O      E   160_B

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    V    13_O      V    13_B     1.452     0    0.016   0.250     1.918   79.286   80.272
LGA    D    14_O      D    14_B     1.152     0    0.016   0.392     1.627   81.429   80.357
LGA    P    15_O      P    15_B     0.845     0    0.046   0.089     1.008   88.214   89.184
LGA    Q    16_O      Q    16_B     1.063     0    0.096   0.879     2.508   81.429   74.021
LGA    V    17_O      V    17_B     1.100     0    0.029   0.041     1.316   81.429   81.429
LGA    V    18_O      V    18_B     0.939     0    0.102   1.150     3.027   90.476   78.639
LGA    L    19_O      L    19_B     0.584     0    0.014   0.094     0.865   90.476   95.238
LGA    S    20_O      S    20_B     0.725     0    0.084   0.131     0.848   90.476   90.476
LGA    D    21_O      D    21_B     0.862     0    0.032   0.579     2.643   90.476   84.048
LGA    K    22_O      K    22_B     0.736     0    0.016   0.584     2.083   90.476   88.677
LGA    T    23_O      T    23_B     0.369     0    0.018   0.095     0.496  100.000  100.000
LGA    R    24_O      R    24_B     0.856     0    0.191   0.768     2.084   90.476   84.113
LGA    A    25_O      A    25_B     0.691     0    0.022   0.028     0.805   90.476   90.476
LGA    H    26_O      H    26_B     0.705     0    0.011   0.284     1.175   90.476   90.524
LGA    I    27_O      I    27_B     0.648     0    0.040   0.104     0.869   90.476   90.476
LGA    D    28_O      D    28_B     0.659     0    0.024   0.088     0.770   90.476   91.667
LGA    H    29_O      H    29_B     0.918     0    0.028   1.153     2.451   88.214   80.000
LGA    W    30_O      W    30_B     0.652     0    0.019   0.197     1.376   90.476   88.537
LGA    L    31_O      L    31_B     0.802     0    0.086   0.154     0.935   90.476   90.476
LGA    A    32_O      A    32_B     1.123     0    0.056   0.053     1.545   81.548   81.524
LGA    K    33_O      K    33_B     1.299     0    0.024   0.277     1.952   81.429   78.571
LGA    F    34_O      F    34_B     1.165     0    0.011   0.046     1.237   81.429   84.719
LGA    P    35_O      P    35_B     1.215     0    0.049   0.066     1.517   83.690   81.497
LGA    P    36_O      P    36_B     1.139     0    0.028   0.048     1.395   81.429   81.429
LGA    D    37_O      D    37_B     1.055     0    0.071   0.148     1.619   81.429   80.357
LGA    R    38_O      R    38_B     1.156     0    0.105   0.758     6.720   83.690   60.173
LGA    K    39_O      K    39_B     0.762     0    0.083   0.834     1.864   88.214   86.614
LGA    R    40_O      R    40_B     0.836     0    0.078   0.944     8.178   90.476   59.004
LGA    S    41_O      S    41_B     0.895     0    0.034   0.090     0.929   90.476   90.476
LGA    A    42_O      A    42_B     0.646     0    0.057   0.070     0.726   90.476   92.381
LGA    V    43_O      V    43_B     0.573     0    0.067   0.114     0.807   90.476   90.476
LGA    L    44_O      L    44_B     0.605     0    0.037   0.721     3.418   90.476   78.988
LGA    Q    45_O      Q    45_B     0.483     0    0.051   0.381     1.830   92.857   88.624
LGA    G    46_O      G    46_B     0.542     0    0.025   0.025     0.544   92.857   92.857
LGA    L    47_O      L    47_B     0.336     0    0.025   0.115     0.605  100.000   98.810
LGA    H    48_O      H    48_B     0.375     0    0.009   1.151     4.608  100.000   73.571
LGA    A    49_O      A    49_B     0.439     0    0.025   0.026     0.457  100.000  100.000
LGA    A    50_O      A    50_B     0.325     0    0.046   0.059     0.443  100.000  100.000
LGA    Q    51_O      Q    51_B     0.436     0    0.012   0.145     0.630  100.000   98.942
LGA    E    52_O      E    52_B     0.413     0    0.033   0.112     0.911  100.000   96.825
LGA    Q    53_O      Q    53_B     0.467     0    0.002   0.197     0.782  100.000   97.884
LGA    N    54_O      N    54_B     0.283     0    0.026   0.092     0.605  100.000   98.810
LGA    Q    55_O      Q    55_B     0.745     0    0.008   1.015     2.408   95.238   84.921
LGA    G    56_O      G    56_B     0.495     0    0.059   0.059     0.548   97.619   97.619
LGA    W    57_O      W    57_B     0.470     0    0.041   0.075     0.551  100.000   99.320
LGA    L    58_O      L    58_B     0.494     0    0.043   0.130     0.712   95.238   94.048
LGA    T    59_O      T    59_B     0.637     0    0.026   0.066     0.776   90.476   91.837
LGA    D    60_O      D    60_B     0.913     0    0.040   0.164     1.344   90.476   85.952
LGA    E    61_O      E    61_B     0.738     0    0.053   1.161     4.983   90.476   70.159
LGA    L    62_O      L    62_B     0.636     0    0.016   0.103     0.858   90.476   90.476
LGA    I    63_O      I    63_B     0.731     0    0.045   0.108     0.884   90.476   90.476
LGA    V    64_O      V    64_B     0.775     0    0.018   0.042     1.101   90.476   89.184
LGA    G    65_O      G    65_B     0.573     0    0.047   0.047     0.607   95.238   95.238
LGA    V    66_O      V    66_B     0.484     0    0.015   0.036     0.569   95.238   95.918
LGA    A    67_O      A    67_B     0.587     0    0.011   0.009     0.682   90.476   90.476
LGA    K    68_O      K    68_B     0.460     0    0.029   0.437     1.889  100.000   90.741
LGA    Y    69_O      Y    69_B     0.506     0    0.005   0.144     1.007   92.857   91.310
LGA    L    70_O      L    70_B     0.613     0    0.017   0.087     0.946   90.476   91.667
LGA    E    71_O      E    71_B     0.667     0    0.016   0.370     1.604   90.476   89.577
LGA    L    72_O      L    72_B     0.809     0    0.037   0.222     0.976   90.476   90.476
LGA    P    73_O      P    73_B     0.821     0    0.048   0.104     1.066   90.476   89.184
LGA    P    74_O      P    74_B     0.684     0    0.026   0.067     0.776   90.476   90.476
LGA    V    75_O      V    75_B     0.864     0    0.025   1.286     3.377   90.476   79.932
LGA    W    76_O      W    76_B     0.907     0    0.030   0.081     1.557   90.476   84.048
LGA    A    77_O      A    77_B     0.747     0    0.032   0.033     0.839   90.476   90.476
LGA    Y    78_O      Y    78_B     0.964     0    0.021   0.125     1.352   88.214   85.198
LGA    E    79_O      E    79_B     1.219     0    0.045   0.152     1.364   81.429   81.429
LGA    V    80_O      V    80_B     1.017     0    0.061   0.107     1.078   85.952   86.599
LGA    A    81_O      A    81_B     0.755     0    0.033   0.032     0.847   90.476   90.476
LGA    S    82_O      S    82_B     0.728     0    0.061   0.193     1.037   90.476   88.968
LGA    F    83_O      F    83_B     0.875     0    0.026   0.152     1.264   90.476   86.364
LGA    Y    84_O      Y    84_B     0.739     0    0.090   0.121     1.440   92.857   86.746
LGA    S    85_O      S    85_B     0.391     0    0.017   0.188     0.835  100.000   96.825
LGA    M    86_O      M    86_B     0.378     0    0.029   0.656     3.299   97.619   81.845
LGA    F    87_O      F    87_B     0.502     0    0.068   0.193     0.753   95.238   93.939
LGA    E    88_O      E    88_B     0.790     0    0.097   0.174     1.418   90.476   87.460
LGA    T    89_O      T    89_B     0.706     0    0.080   0.120     0.997   90.476   90.476
LGA    E    90_O      E    90_B     0.508     0    0.035   1.057     4.165   95.238   72.487
LGA    K    91_O      K    91_B     0.167     0    0.099   0.960     5.436   97.619   81.005
LGA    V    92_O      V    92_B     0.113     0    0.035   0.090     0.294  100.000  100.000
LGA    G    93_O      G    93_B     0.142     0    0.043   0.043     0.319  100.000  100.000
LGA    R    94_O      R    94_B     0.321     0    0.026   1.057     2.994   97.619   92.684
LGA    H    95_O      H    95_B     0.551     0    0.046   0.042     1.180   97.619   90.619
LGA    N    96_O      N    96_B     0.647     0    0.068   0.149     1.157   92.857   88.274
LGA    V    97_O      V    97_B     0.610     0    0.010   0.066     0.613   90.476   90.476
LGA    A    98_O      A    98_B     0.694     0    0.020   0.033     0.719   90.476   90.476
LGA    F    99_O      F    99_B     0.472     0    0.008   0.048     0.599   95.238   96.537
LGA    C   100_O      C   100_B     0.493     0    0.079   0.088     0.522   97.619   98.413
LGA    T   101_O      T   101_B     0.662     0    0.014   0.028     0.976   90.476   90.476
LGA    N   102_O      N   102_B     0.996     0    0.069   0.169     1.428   92.857   87.143
LGA    I   103_O      I   103_B     1.257     0    0.038   1.082     3.997   85.952   71.131
LGA    S   104_O      S   104_B     0.635     0    0.031   0.114     0.921   95.238   93.651
LGA    C   105_O      C   105_B     0.355     0    0.024   0.065     0.543   97.619   98.413
LGA    W   106_O      W   106_B     0.769     0    0.056   0.260     1.919   90.476   83.503
LGA    L   107_O      L   107_B     0.730     0    0.067   0.071     1.035   90.476   88.214
LGA    N   108_O      N   108_B     0.242     0    0.111   1.101     2.553   97.619   90.060
LGA    G   109_O      G   109_B     0.327     0    0.053   0.053     0.438  100.000  100.000
LGA    A   110_O      A   110_B     0.526     0    0.086   0.091     0.642   97.619   96.190
LGA    E   111_O      E   111_B     0.716     0    0.040   0.683     3.240   90.476   78.413
LGA    D   112_O      D   112_B     0.812     0    0.032   0.134     1.292   90.476   89.345
LGA    L   113_O      L   113_B     0.475     0    0.030   1.131     2.825   97.619   90.060
LGA    L   114_O      L   114_B     0.287     0    0.067   0.167     0.489  100.000  100.000
LGA    A   115_O      A   115_B     0.603     0    0.018   0.024     0.703   92.857   92.381
LGA    H   116_O      H   116_B     0.658     0    0.055   0.087     1.163   90.476   88.667
LGA    A   117_O      A   117_B     0.479     0    0.055   0.063     0.549   97.619   98.095
LGA    E   118_O      E   118_B     0.476     0    0.019   0.263     1.345   95.238   92.646
LGA    K   119_O      K   119_B     0.765     0    0.025   0.769     6.720   90.476   69.471
LGA    K   120_O      K   120_B     0.762     0    0.044   0.576     1.888   90.476   86.508
LGA    L   121_O      L   121_B     0.613     0    0.037   0.099     0.747   90.476   91.667
LGA    G   122_O      G   122_B     0.610     0    0.030   0.030     0.698   90.476   90.476
LGA    C   123_O      C   123_B     0.531     0    0.019   0.178     1.095   95.238   92.143
LGA    K   124_O      K   124_B     0.408     0    0.021   0.867     4.983  100.000   78.624
LGA    L   125_O      L   125_B     0.379     0    0.053   0.132     0.754  100.000   98.810
LGA    G   126_O      G   126_B     0.723     0    0.150   0.150     1.217   88.214   88.214
LGA    Q   127_O      Q   127_B     0.649     0    0.024   0.170     1.291   90.476   87.460
LGA    S   128_O      S   128_B     0.534     0    0.051   0.088     0.732   90.476   90.476
LGA    T   129_O      T   129_B     0.631     0    0.036   0.045     0.755   92.857   91.837
LGA    A   130_O      A   130_B     0.981     0    0.031   0.034     1.299   90.476   88.667
LGA    D   131_O      D   131_B     0.865     0    0.046   0.108     0.943   90.476   91.667
LGA    G   132_O      G   132_B     0.263     0    0.029   0.029     0.519   97.619   97.619
LGA    R   133_O      R   133_B     0.529     0    0.010   1.202     8.144   95.238   62.165
LGA    V   134_O      V   134_B     0.451     0    0.011   0.130     1.175  100.000   95.986
LGA    Y   135_O      Y   135_B     0.284     0    0.020   0.153     1.787  100.000   89.167
LGA    L   136_O      L   136_B     0.240     0    0.051   0.126     0.599  100.000   98.810
LGA    K   137_O      K   137_B     0.489     0    0.056   0.468     1.480   95.238   92.646
LGA    R   138_O      R   138_B     0.926     0    0.057   0.315     1.508   90.476   83.939
LGA    E   139_O      E   139_B     0.930     0    0.000   0.204     1.503   83.810   84.497
LGA    E   140_O      E   140_B     1.861     0    0.048   0.791     5.777   72.976   56.508
LGA    E   141_O      E   141_B     1.900     0    0.032   0.958     6.794   75.000   53.175
LGA    C   142_O      C   142_B     1.738     0    0.055   0.140     2.080   72.857   71.508
LGA    L   143_O      L   143_B     1.648     0    0.044   0.073     1.768   72.857   76.071
LGA    A   144_O      A   144_B     2.025     0    0.117   0.118     2.472   68.810   68.000
LGA    A   145_O      A   145_B     1.313     0    0.061   0.071     1.345   81.429   81.429
LGA    C   146_O      C   146_B     0.849     0    0.029   0.169     1.334   88.214   87.460
LGA    S   147_O      S   147_B     1.001     0    0.027   0.217     2.005   85.952   81.667
LGA    A   148_O      A   148_B     0.883     0    0.025   0.054     1.006   90.476   88.667
LGA    A   149_O      A   149_B     0.450     0    0.022   0.028     0.613   95.238   96.190
LGA    P   150_O      P   150_B     0.247     0    0.036   0.059     0.472  100.000  100.000
LGA    M   151_O      M   151_B     0.664     0    0.073   0.469     1.748   92.857   86.071
LGA    M   152_O      M   152_B     0.652     0    0.043   0.790     2.070   90.476   86.131
LGA    V   153_O      V   153_B     1.127     0    0.041   0.076     1.668   88.214   82.857
LGA    I   154_O      I   154_B     0.862     0    0.046   0.085     1.432   85.952   88.214
LGA    N   155_O      N   155_B     1.076     0    0.023   0.278     1.577   81.548   83.750
LGA    G   156_O      G   156_B     1.879     0    0.015   0.015     2.241   70.833   70.833
LGA    H   157_O      H   157_B     1.977     0    0.023   1.150     3.693   75.000   63.714
LGA    Y   158_O      Y   158_B     1.450     0    0.046   0.453     2.083   79.286   75.079
LGA    H   159_O      H   159_B     1.130     0    0.012   0.167     1.668   85.952   81.524
LGA    E   160_O      E   160_B     0.891     0    0.043   0.153     1.241   90.476   87.460
LGA    H   161_O      H   161_B     0.747     0    0.038   0.182     1.325   90.476   88.667
LGA    L   162_O      L   162_B     0.576     0    0.075   0.083     0.785   92.857   92.857
LGA    T   163_O      T   163_B     0.894     0    0.017   0.071     1.114   90.476   86.599
LGA    K   164_O      K   164_B     1.028     0    0.056   0.550     1.525   81.429   80.476
LGA    E   165_O      E   165_B     1.323     0    0.013   0.454     1.980   81.429   78.571
LGA    K   166_O      K   166_B     1.110     0    0.057   0.425     1.900   81.429   80.529
LGA    V   167_O      V   167_B     0.856     0    0.029   0.050     0.971   90.476   90.476
LGA    D   168_O      D   168_B     0.978     0    0.036   0.227     1.190   85.952   85.952
LGA    A   169_O      A   169_B     1.232     0    0.010   0.020     1.274   81.429   81.429
LGA    L   170_O      L   170_B     1.125     0    0.022   0.078     1.175   81.429   82.560
LGA    L   171_O      L   171_B     0.815     0    0.079   0.125     0.921   90.476   90.476
LGA    D   172_O      D   172_B     1.071     0    0.036   0.064     1.271   81.429   82.560
LGA    G   173_O      G   173_B     1.351     0    0.102   0.102     1.792   79.286   79.286
LGA    L   174_O      L   174_B     1.278     0    0.581   0.526     2.214   77.262   81.607
LGA    E   175_O      E   175_B     3.805     0    0.557   0.986    10.437   29.405   17.725

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      163     652    652  100.00    1282   1282  100.00               163
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.902          0.954                  1.478           90.055   86.548

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  175  163    4.0    163    0.90    94.632    97.866    16.266

LGA_LOCAL      RMSD:   0.902  Number of atoms:  163  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.902  Number of assigned atoms:  163 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.902  Standard rmsd on all 163 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.342944 * X  +   0.907974 * Y  +  -0.240775 * Z  +  17.522984
  Y_new =  -0.930922 * X  +  -0.294241 * Y  +   0.216347 * Z  +  35.282684
  Z_new =   0.125591 * X  +   0.298338 * Y  +   0.946161 * Z  +   0.175093 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -1.923761 -0.125924  0.305446   [DEG: -110.2234   -7.2149   17.5008 ]
ZXZ: -2.302807  0.329632  0.398453   [DEG: -131.9411   18.8865   22.8297 ]
 
# END of job
