
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  175 ( 1372),  selected  163 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  163 ( 1282),  selected  163 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:O  -ch2:B  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   163      13_B - 175_B       1.12     1.12
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   163      13_B - 175_B       1.12     1.12
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   153      13_B - 165_B       0.99     1.13
  LCS_AVERAGE:     92.54

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  163
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     V    13_O     V    13_B    153  163  163     64  113  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    14_O     D    14_B    153  163  163     78  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    15_O     P    15_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    16_O     Q    16_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    17_O     V    17_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    18_O     V    18_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    19_O     L    19_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    20_O     S    20_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    21_O     D    21_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    22_O     K    22_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T    23_O     T    23_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    24_O     R    24_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    25_O     A    25_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    26_O     H    26_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I    27_O     I    27_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    28_O     D    28_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    29_O     H    29_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W    30_O     W    30_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    31_O     L    31_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    32_O     A    32_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    33_O     K    33_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    34_O     F    34_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    35_O     P    35_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    36_O     P    36_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    37_O     D    37_B    153  163  163     79  115  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    38_O     R    38_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    39_O     K    39_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    40_O     R    40_B    153  163  163     64  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    41_O     S    41_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    42_O     A    42_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    43_O     V    43_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    44_O     L    44_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    45_O     Q    45_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    46_O     G    46_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    47_O     L    47_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    48_O     H    48_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    49_O     A    49_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    50_O     A    50_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    51_O     Q    51_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    52_O     E    52_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    53_O     Q    53_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N    54_O     N    54_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    55_O     Q    55_B    153  163  163     49  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    56_O     G    56_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W    57_O     W    57_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    58_O     L    58_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T    59_O     T    59_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    60_O     D    60_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    61_O     E    61_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    62_O     L    62_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I    63_O     I    63_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    64_O     V    64_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    65_O     G    65_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    66_O     V    66_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    67_O     A    67_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    68_O     K    68_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y    69_O     Y    69_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    70_O     L    70_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    71_O     E    71_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    72_O     L    72_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    73_O     P    73_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    74_O     P    74_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    75_O     V    75_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W    76_O     W    76_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    77_O     A    77_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y    78_O     Y    78_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    79_O     E    79_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    80_O     V    80_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    81_O     A    81_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    82_O     S    82_B    153  163  163     78  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    83_O     F    83_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y    84_O     Y    84_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    85_O     S    85_B    153  163  163     40  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     M    86_O     M    86_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    87_O     F    87_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    88_O     E    88_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T    89_O     T    89_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    90_O     E    90_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    91_O     K    91_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    92_O     V    92_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    93_O     G    93_B    153  163  163     66  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    94_O     R    94_B    153  163  163     53  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    95_O     H    95_B    153  163  163     66   85  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N    96_O     N    96_B    153  163  163     66  106  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    97_O     V    97_B    153  163  163     66  115  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    98_O     A    98_B    153  163  163     66  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    99_O     F    99_B    153  163  163     66  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   100_O     C   100_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T   101_O     T   101_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N   102_O     N   102_B    153  163  163     66  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I   103_O     I   103_B    153  163  163     66  110  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S   104_O     S   104_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   105_O     C   105_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W   106_O     W   106_B    153  163  163     76  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   107_O     L   107_B    153  163  163     78  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N   108_O     N   108_B    153  163  163     71  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   109_O     G   109_B    153  163  163     71  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   110_O     A   110_B    153  163  163     66  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   111_O     E   111_B    153  163  163     66  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   112_O     D   112_B    153  163  163     66  109  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   113_O     L   113_B    153  163  163     66  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   114_O     L   114_B    153  163  163     66  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   115_O     A   115_B    153  163  163     66  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   116_O     H   116_B    153  163  163     66  115  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   117_O     A   117_B    153  163  163     66  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   118_O     E   118_B    153  163  163     66  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   119_O     K   119_B    153  163  163     66  104  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   120_O     K   120_B    153  163  163     66  114  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   121_O     L   121_B    153  163  163     66  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   122_O     G   122_B    153  163  163     66  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   123_O     C   123_B    153  163  163     66  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   124_O     K   124_B    153  163  163     66  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   125_O     L   125_B    153  163  163     73  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   126_O     G   126_B    153  163  163     53  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q   127_O     Q   127_B    153  163  163     66  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S   128_O     S   128_B    153  163  163     66  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T   129_O     T   129_B    153  163  163     53  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   130_O     A   130_B    153  163  163     36  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   131_O     D   131_B    153  163  163     36  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   132_O     G   132_B    153  163  163     57  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R   133_O     R   133_B    153  163  163     53  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V   134_O     V   134_B    153  163  163     66  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y   135_O     Y   135_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   136_O     L   136_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   137_O     K   137_B    153  163  163     79  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R   138_O     R   138_B    153  163  163     53  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   139_O     E   139_B    153  163  163     66  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   140_O     E   140_B    153  163  163      4   13   89  157  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   141_O     E   141_B    153  163  163     53   85  140  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   142_O     C   142_B    153  163  163     66   85  141  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   143_O     L   143_B    153  163  163     66   90  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   144_O     A   144_B    153  163  163     46   83  132  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   145_O     A   145_B    153  163  163     66   85  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   146_O     C   146_B    153  163  163     46  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S   147_O     S   147_B    153  163  163     46  103  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   148_O     A   148_B    153  163  163     66   85  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   149_O     A   149_B    153  163  163     66  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P   150_O     P   150_B    153  163  163     66  116  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     M   151_O     M   151_B    153  163  163     66  115  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     M   152_O     M   152_B    153  163  163     66  115  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V   153_O     V   153_B    153  163  163     66   85  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I   154_O     I   154_B    153  163  163     66   85  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N   155_O     N   155_B    153  163  163     66   83  119  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   156_O     G   156_B    153  163  163     62   83  102  144  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   157_O     H   157_B    153  163  163     46   83  102  143  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y   158_O     Y   158_B    153  163  163     66   83  129  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   159_O     H   159_B    153  163  163     66   85  140  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   160_O     E   160_B    153  163  163     66   85  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   161_O     H   161_B    153  163  163     66   91  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   162_O     L   162_B    153  163  163     66   91  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T   163_O     T   163_B    153  163  163     66   85  141  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   164_O     K   164_B    153  163  163     66   85  141  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   165_O     E   165_B    153  163  163     66   83  127  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   166_O     K   166_B    130  163  163     66   85  141  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V   167_O     V   167_B    130  163  163     66   85  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   168_O     D   168_B    130  163  163     66   85  141  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   169_O     A   169_B    127  163  163     66   85  131  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   170_O     L   170_B    117  163  163     66   85  141  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   171_O     L   171_B    117  163  163     66   86  143  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   172_O     D   172_B    117  163  163     66   85  141  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   173_O     G   173_B    104  163  163     66   83  129  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   174_O     L   174_B    104  163  163     57   83  131  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   175_O     E   175_B    102  163  163      3    3   46   85   97  117  160  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  97.51  (  92.54  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     79    116    143    159    162    162    162    163    163    163    163    163    163    163    163    163    163    163    163    163 
GDT PERCENT_AT  48.47  71.17  87.73  97.55  99.39  99.39  99.39 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.30   0.60   0.83   1.01   1.06   1.06   1.06   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12
GDT RMS_ALL_AT   1.42   1.25   1.15   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  D    21_O      D    21_B
#   possible swapping detected:  E    52_O      E    52_B
#   possible swapping detected:  Y    69_O      Y    69_B
#   possible swapping detected:  E    71_O      E    71_B
#   possible swapping detected:  E    79_O      E    79_B
#   possible swapping detected:  E    88_O      E    88_B
#   possible swapping detected:  E    90_O      E    90_B
#   possible swapping detected:  F    99_O      F    99_B
#   possible swapping detected:  E   111_O      E   111_B
#   possible swapping detected:  E   118_O      E   118_B
#   possible swapping detected:  Y   135_O      Y   135_B
#   possible swapping detected:  E   160_O      E   160_B

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    V    13_O      V    13_B     1.183     0    0.065   0.197     1.814   79.286   80.272
LGA    D    14_O      D    14_B     0.811     0    0.045   0.359     1.436   90.476   88.214
LGA    P    15_O      P    15_B     0.804     0    0.050   0.069     0.857   90.476   90.476
LGA    Q    16_O      Q    16_B     0.806     0    0.098   0.859     2.656   88.214   77.989
LGA    V    17_O      V    17_B     0.901     0    0.018   0.024     1.017   90.476   89.184
LGA    V    18_O      V    18_B     0.764     0    0.113   1.176     3.060   90.476   79.932
LGA    L    19_O      L    19_B     0.903     0    0.030   0.125     1.171   85.952   88.214
LGA    S    20_O      S    20_B     1.035     0    0.051   0.092     1.190   81.429   81.429
LGA    D    21_O      D    21_B     0.984     0    0.018   0.673     2.336   90.476   82.798
LGA    K    22_O      K    22_B     0.815     0    0.034   0.599     2.379   90.476   87.619
LGA    T    23_O      T    23_B     0.662     0    0.010   0.063     0.748   90.476   90.476
LGA    R    24_O      R    24_B     0.887     0    0.135   0.793     2.300   88.214   81.602
LGA    A    25_O      A    25_B     0.955     0    0.005   0.009     1.023   90.476   88.667
LGA    H    26_O      H    26_B     0.882     0    0.019   0.200     1.270   90.476   89.619
LGA    I    27_O      I    27_B     1.012     0    0.026   0.058     1.053   83.690   85.952
LGA    D    28_O      D    28_B     1.061     0    0.015   0.129     1.156   81.429   86.012
LGA    H    29_O      H    29_B     1.191     0    0.008   1.144     2.884   81.429   76.476
LGA    W    30_O      W    30_B     0.852     0    0.015   0.199     1.155   90.476   88.537
LGA    L    31_O      L    31_B     0.985     0    0.035   0.150     1.115   85.952   87.083
LGA    A    32_O      A    32_B     1.101     0    0.028   0.026     1.363   81.429   81.429
LGA    K    33_O      K    33_B     1.232     0    0.022   0.207     1.606   81.429   80.476
LGA    F    34_O      F    34_B     1.213     0    0.013   0.027     1.293   81.429   85.541
LGA    P    35_O      P    35_B     1.382     0    0.024   0.062     1.489   81.429   81.429
LGA    P    36_O      P    36_B     1.386     0    0.035   0.043     1.519   81.429   80.204
LGA    D    37_O      D    37_B     1.389     0    0.046   0.057     1.656   81.429   77.143
LGA    R    38_O      R    38_B     1.253     0    0.036   0.754     6.546   81.429   60.433
LGA    K    39_O      K    39_B     0.868     0    0.018   0.814     2.010   88.214   83.757
LGA    R    40_O      R    40_B     0.897     0    0.064   0.589     2.190   88.214   80.087
LGA    S    41_O      S    41_B     0.963     0    0.037   0.122     1.092   90.476   88.968
LGA    A    42_O      A    42_B     0.734     0    0.043   0.046     0.857   90.476   90.476
LGA    V    43_O      V    43_B     0.757     0    0.072   0.878     1.892   90.476   85.442
LGA    L    44_O      L    44_B     0.706     0    0.011   0.794     3.845   90.476   78.155
LGA    Q    45_O      Q    45_B     0.630     0    0.038   0.523     2.159   90.476   85.714
LGA    G    46_O      G    46_B     0.861     0    0.018   0.018     0.915   90.476   90.476
LGA    L    47_O      L    47_B     0.598     0    0.006   0.086     0.655   90.476   90.476
LGA    H    48_O      H    48_B     0.666     0    0.017   1.151     4.539   90.476   68.714
LGA    A    49_O      A    49_B     0.864     0    0.009   0.011     0.892   90.476   90.476
LGA    A    50_O      A    50_B     0.678     0    0.047   0.050     0.795   90.476   90.476
LGA    Q    51_O      Q    51_B     0.683     0    0.007   0.157     0.901   90.476   91.534
LGA    E    52_O      E    52_B     0.853     0    0.000   0.133     1.301   90.476   88.466
LGA    Q    53_O      Q    53_B     0.814     0    0.022   0.215     1.104   90.476   89.524
LGA    N    54_O      N    54_B     0.537     0    0.062   0.068     0.726   90.476   92.857
LGA    Q    55_O      Q    55_B     1.129     0    0.011   1.011     2.179   88.214   81.693
LGA    G    56_O      G    56_B     0.402     0    0.093   0.093     0.622   97.619   97.619
LGA    W    57_O      W    57_B     0.562     0    0.014   0.061     0.562   92.857   97.279
LGA    L    58_O      L    58_B     0.610     0    0.022   0.113     1.035   90.476   89.345
LGA    T    59_O      T    59_B     0.640     0    0.004   0.074     0.789   90.476   90.476
LGA    D    60_O      D    60_B     0.760     0    0.010   0.174     1.150   90.476   88.214
LGA    E    61_O      E    61_B     0.704     0    0.081   1.216     4.740   90.476   69.153
LGA    L    62_O      L    62_B     0.670     0    0.012   0.071     1.002   90.476   89.345
LGA    I    63_O      I    63_B     0.718     0    0.041   0.099     0.847   90.476   91.667
LGA    V    64_O      V    64_B     0.799     0    0.012   0.050     0.967   90.476   90.476
LGA    G    65_O      G    65_B     0.682     0    0.010   0.010     0.682   90.476   90.476
LGA    V    66_O      V    66_B     0.654     0    0.012   0.027     0.748   90.476   90.476
LGA    A    67_O      A    67_B     0.742     0    0.014   0.017     0.758   90.476   90.476
LGA    K    68_O      K    68_B     0.705     0    0.044   0.460     1.582   90.476   86.508
LGA    Y    69_O      Y    69_B     0.870     0    0.008   0.098     1.466   88.214   85.198
LGA    L    70_O      L    70_B     0.987     0    0.038   0.104     1.165   85.952   87.083
LGA    E    71_O      E    71_B     1.093     0    0.041   0.334     1.739   81.429   80.529
LGA    L    72_O      L    72_B     1.051     0    0.010   0.251     1.274   83.690   84.821
LGA    P    73_O      P    73_B     1.046     0    0.080   0.121     1.200   83.690   84.014
LGA    P    74_O      P    74_B     0.629     0    0.039   0.099     0.660   90.476   93.197
LGA    V    75_O      V    75_B     0.797     0    0.011   1.301     3.698   90.476   80.068
LGA    W    76_O      W    76_B     0.784     0    0.013   0.060     1.034   90.476   89.830
LGA    A    77_O      A    77_B     0.677     0    0.034   0.038     0.783   90.476   90.476
LGA    Y    78_O      Y    78_B     0.801     0    0.027   0.105     1.024   90.476   88.968
LGA    E    79_O      E    79_B     0.933     0    0.013   0.173     1.253   90.476   85.450
LGA    V    80_O      V    80_B     0.688     0    0.049   0.131     0.929   92.857   91.837
LGA    A    81_O      A    81_B     0.451     0    0.006   0.007     0.547   97.619   96.190
LGA    S    82_O      S    82_B     0.463     0    0.013   0.170     0.973  100.000   96.825
LGA    F    83_O      F    83_B     0.308     0    0.013   0.168     0.752  100.000   97.403
LGA    Y    84_O      Y    84_B     0.202     0    0.031   0.065     1.109  100.000   93.690
LGA    S    85_O      S    85_B     0.911     0    0.032   0.196     1.563   90.476   86.032
LGA    M    86_O      M    86_B     0.610     0    0.062   0.669     2.985   90.476   79.940
LGA    F    87_O      F    87_B     0.570     0    0.044   0.215     0.796   92.857   91.342
LGA    E    88_O      E    88_B     0.585     0    0.081   0.190     0.691   90.476   91.534
LGA    T    89_O      T    89_B     0.548     0    0.057   0.094     0.851   92.857   91.837
LGA    E    90_O      E    90_B     0.517     0    0.038   1.036     4.438   97.619   72.857
LGA    K    91_O      K    91_B     0.734     0    0.058   1.059     5.924   90.476   74.603
LGA    V    92_O      V    92_B     0.639     0    0.027   0.074     0.801   90.476   90.476
LGA    G    93_O      G    93_B     0.604     0    0.022   0.022     0.756   90.476   90.476
LGA    R    94_O      R    94_B     0.928     0    0.043   1.024     3.098   85.952   85.195
LGA    H    95_O      H    95_B     1.286     0    0.017   0.103     2.166   83.690   77.286
LGA    N    96_O      N    96_B     1.179     0    0.065   1.098     4.327   81.429   71.667
LGA    V    97_O      V    97_B     1.008     0    0.032   0.056     1.038   85.952   87.891
LGA    A    98_O      A    98_B     0.910     0    0.034   0.037     1.132   90.476   88.667
LGA    F    99_O      F    99_B     0.567     0    0.031   0.058     0.749   90.476   93.074
LGA    C   100_O      C   100_B     0.484     0    0.036   0.060     0.569  100.000   98.413
LGA    T   101_O      T   101_B     0.494     0    0.069   0.078     0.793   95.238   94.558
LGA    N   102_O      N   102_B     0.946     0    0.019   0.307     1.735   90.476   84.881
LGA    I   103_O      I   103_B     1.286     0    0.028   1.400     5.490   85.952   69.167
LGA    S   104_O      S   104_B     0.576     0    0.005   0.103     0.863   95.238   93.651
LGA    C   105_O      C   105_B     0.215     0    0.008   0.087     0.592   97.619   98.413
LGA    W   106_O      W   106_B     0.864     0    0.006   0.287     2.445   88.214   79.286
LGA    L   107_O      L   107_B     0.844     0    0.091   0.087     1.171   90.476   89.345
LGA    N   108_O      N   108_B     0.534     0    0.117   1.116     2.573   90.476   83.095
LGA    G   109_O      G   109_B     0.473     0    0.079   0.079     0.785   92.857   92.857
LGA    A   110_O      A   110_B     0.765     0    0.048   0.049     0.831   90.476   90.476
LGA    E   111_O      E   111_B     0.918     0    0.013   0.713     3.396   90.476   77.407
LGA    D   112_O      D   112_B     1.059     0    0.014   0.116     1.396   85.952   83.690
LGA    L   113_O      L   113_B     0.745     0    0.013   1.133     3.165   90.476   82.202
LGA    L   114_O      L   114_B     0.356     0    0.043   0.164     0.625   95.238   96.429
LGA    A   115_O      A   115_B     0.833     0    0.011   0.011     1.024   88.214   86.857
LGA    H   116_O      H   116_B     0.957     0    0.034   0.095     1.641   90.476   83.333
LGA    A   117_O      A   117_B     0.689     0    0.011   0.011     0.762   90.476   90.476
LGA    E   118_O      E   118_B     0.630     0    0.027   0.114     0.848   90.476   90.476
LGA    K   119_O      K   119_B     1.081     0    0.053   0.760     7.031   85.952   64.762
LGA    K   120_O      K   120_B     0.984     0    0.052   0.528     1.793   90.476   82.593
LGA    L   121_O      L   121_B     0.742     0    0.045   0.104     0.898   90.476   90.476
LGA    G   122_O      G   122_B     0.778     0    0.098   0.098     0.993   90.476   90.476
LGA    C   123_O      C   123_B     0.565     0    0.013   0.175     1.030   90.476   90.556
LGA    K   124_O      K   124_B     0.561     0    0.032   0.967     5.875   95.238   72.963
LGA    L   125_O      L   125_B     0.479     0    0.028   0.074     0.767   95.238   92.857
LGA    G   126_O      G   126_B     0.841     0    0.084   0.084     1.271   88.214   88.214
LGA    Q   127_O      Q   127_B     0.690     0    0.022   0.142     1.448   92.857   87.513
LGA    S   128_O      S   128_B     0.455     0    0.048   0.122     0.651   95.238   95.238
LGA    T   129_O      T   129_B     0.466     0    0.016   0.022     0.689   97.619   94.558
LGA    A   130_O      A   130_B     0.849     0    0.040   0.045     1.300   90.476   88.667
LGA    D   131_O      D   131_B     0.665     0    0.029   0.169     1.259   92.857   91.726
LGA    G   132_O      G   132_B     0.249     0    0.031   0.031     0.542   97.619   97.619
LGA    R   133_O      R   133_B     0.720     0    0.019   1.579     6.435   90.476   68.831
LGA    V   134_O      V   134_B     0.715     0    0.023   0.036     1.014   92.857   90.544
LGA    Y   135_O      Y   135_B     0.599     0    0.030   0.169     2.437   90.476   80.952
LGA    L   136_O      L   136_B     0.537     0    0.077   0.098     0.809   92.857   94.048
LGA    K   137_O      K   137_B     0.766     0    0.021   0.350     1.363   90.476   87.460
LGA    R   138_O      R   138_B     0.922     0    0.029   0.758     3.001   90.476   73.723
LGA    E   139_O      E   139_B     0.884     0    0.028   0.332     2.013   81.786   80.635
LGA    E   140_O      E   140_B     2.228     0    0.097   0.686     7.147   67.024   45.079
LGA    E   141_O      E   141_B     1.787     0    0.045   0.923     7.232   77.143   51.164
LGA    C   142_O      C   142_B     1.674     0    0.025   0.149     1.985   72.857   72.857
LGA    L   143_O      L   143_B     1.460     0    0.020   0.079     1.645   75.000   79.345
LGA    A   144_O      A   144_B     2.185     0    0.032   0.030     2.704   66.786   64.857
LGA    A   145_O      A   145_B     1.613     0    0.068   0.065     1.619   77.143   76.286
LGA    C   146_O      C   146_B     0.859     0    0.010   0.199     1.570   88.214   86.032
LGA    S   147_O      S   147_B     1.058     0    0.025   0.160     1.912   83.690   81.508
LGA    A   148_O      A   148_B     1.249     0    0.011   0.010     1.487   81.429   81.429
LGA    A   149_O      A   149_B     0.668     0    0.023   0.025     0.822   90.476   90.476
LGA    P   150_O      P   150_B     0.600     0    0.059   0.082     0.809   90.476   90.476
LGA    M   151_O      M   151_B     0.917     0    0.023   0.501     1.609   90.476   84.881
LGA    M   152_O      M   152_B     0.945     0    0.034   0.758     2.324   85.952   83.869
LGA    V   153_O      V   153_B     1.458     0    0.039   0.080     1.866   81.429   77.755
LGA    I   154_O      I   154_B     1.490     0    0.031   0.050     2.024   75.119   77.202
LGA    N   155_O      N   155_B     1.933     0    0.043   0.156     2.332   68.810   70.833
LGA    G   156_O      G   156_B     2.502     0    0.041   0.041     2.780   59.048   59.048
LGA    H   157_O      H   157_B     2.638     0    0.020   1.145     3.952   62.976   53.238
LGA    Y   158_O      Y   158_B     1.978     0    0.006   0.307     2.305   68.810   70.159
LGA    H   159_O      H   159_B     1.747     0    0.041   0.161     2.238   72.857   70.429
LGA    E   160_O      E   160_B     1.370     0    0.037   0.127     1.519   79.286   79.524
LGA    H   161_O      H   161_B     1.164     0    0.016   0.155     1.692   81.429   79.714
LGA    L   162_O      L   162_B     1.181     0    0.024   0.070     1.366   81.429   81.429
LGA    T   163_O      T   163_B     1.604     0    0.038   0.075     2.145   75.000   72.925
LGA    K   164_O      K   164_B     1.683     0    0.029   0.555     2.434   72.857   71.058
LGA    E   165_O      E   165_B     2.090     0    0.003   0.355     2.607   66.786   64.815
LGA    K   166_O      K   166_B     1.788     0    0.053   0.834     3.752   72.857   69.735
LGA    V   167_O      V   167_B     1.361     0    0.014   0.022     1.501   79.286   80.204
LGA    D   168_O      D   168_B     1.639     0    0.012   0.180     1.864   72.857   72.857
LGA    A   169_O      A   169_B     1.940     0    0.026   0.025     2.074   72.857   71.238
LGA    L   170_O      L   170_B     1.725     0    0.027   0.086     1.786   72.857   72.857
LGA    L   171_O      L   171_B     1.296     0    0.034   0.082     1.431   81.429   83.690
LGA    D   172_O      D   172_B     1.745     0    0.044   0.082     2.066   70.833   70.833
LGA    G   173_O      G   173_B     2.003     0    0.049   0.049     2.276   68.810   68.810
LGA    L   174_O      L   174_B     1.784     0    0.593   0.502     2.115   70.833   76.131
LGA    E   175_O      E   175_B     4.743     0    0.621   0.903    10.923   20.357   12.063

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      163     652    652  100.00    1282   1282  100.00               163
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.119          1.170                  1.624           86.410   83.182

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  175  163    4.0    163    1.12    92.178    96.524    13.373

LGA_LOCAL      RMSD:   1.119  Number of atoms:  163  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.119  Number of assigned atoms:  163 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.119  Standard rmsd on all 163 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.284537 * X  +   0.833931 * Y  +  -0.472862 * Z  +  14.491794
  Y_new =   0.926010 * X  +  -0.366726 * Y  +  -0.089542 * Z  +  37.100353
  Z_new =  -0.248083 * X  +  -0.412397 * Y  +  -0.876575 * Z  +  -0.514457 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  1.272682  0.250700 -2.701852   [DEG:   72.9193   14.3641 -154.8047 ]
ZXZ: -1.383651  2.639495 -2.600025   [DEG:  -79.2774  151.2319 -148.9705 ]
 
# END of job
