
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  175 ( 1372),  selected  163 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  163 ( 1282),  selected  163 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:O  -ch2:B  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   163      13_B - 175_B       1.12     1.12
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   163      13_B - 175_B       1.12     1.12
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   153      13_B - 165_B       0.99     1.13
  LCS_AVERAGE:     92.48

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  163
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     V    13_O     V    13_B    153  163  163     62  112  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    14_O     D    14_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    15_O     P    15_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    16_O     Q    16_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    17_O     V    17_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    18_O     V    18_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    19_O     L    19_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    20_O     S    20_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    21_O     D    21_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    22_O     K    22_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T    23_O     T    23_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    24_O     R    24_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    25_O     A    25_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    26_O     H    26_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I    27_O     I    27_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    28_O     D    28_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    29_O     H    29_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W    30_O     W    30_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    31_O     L    31_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    32_O     A    32_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    33_O     K    33_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    34_O     F    34_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    35_O     P    35_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    36_O     P    36_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    37_O     D    37_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    38_O     R    38_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    39_O     K    39_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    40_O     R    40_B    153  163  163     59  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    41_O     S    41_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    42_O     A    42_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    43_O     V    43_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    44_O     L    44_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    45_O     Q    45_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    46_O     G    46_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    47_O     L    47_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    48_O     H    48_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    49_O     A    49_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    50_O     A    50_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    51_O     Q    51_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    52_O     E    52_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    53_O     Q    53_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N    54_O     N    54_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    55_O     Q    55_B    153  163  163     44  112  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    56_O     G    56_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W    57_O     W    57_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    58_O     L    58_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T    59_O     T    59_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    60_O     D    60_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    61_O     E    61_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    62_O     L    62_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I    63_O     I    63_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    64_O     V    64_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    65_O     G    65_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    66_O     V    66_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    67_O     A    67_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    68_O     K    68_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y    69_O     Y    69_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    70_O     L    70_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    71_O     E    71_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    72_O     L    72_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    73_O     P    73_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    74_O     P    74_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    75_O     V    75_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W    76_O     W    76_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    77_O     A    77_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y    78_O     Y    78_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    79_O     E    79_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    80_O     V    80_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    81_O     A    81_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    82_O     S    82_B    153  163  163     77  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    83_O     F    83_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y    84_O     Y    84_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    85_O     S    85_B    153  163  163     44  113  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     M    86_O     M    86_B    153  163  163     78  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    87_O     F    87_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    88_O     E    88_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T    89_O     T    89_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    90_O     E    90_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    91_O     K    91_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    92_O     V    92_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    93_O     G    93_B    153  163  163     68  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    94_O     R    94_B    153  163  163     59  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    95_O     H    95_B    153  163  163     68   85  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N    96_O     N    96_B    153  163  163     68   91  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    97_O     V    97_B    153  163  163     68  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    98_O     A    98_B    153  163  163     68  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    99_O     F    99_B    153  163  163     68  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   100_O     C   100_B    153  163  163     78  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T   101_O     T   101_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N   102_O     N   102_B    153  163  163     68  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I   103_O     I   103_B    153  163  163     62  111  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S   104_O     S   104_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   105_O     C   105_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W   106_O     W   106_B    153  163  163     75  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   107_O     L   107_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N   108_O     N   108_B    153  163  163     68  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   109_O     G   109_B    153  163  163     73  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   110_O     A   110_B    153  163  163     68  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   111_O     E   111_B    153  163  163     68  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   112_O     D   112_B    153  163  163     68  103  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   113_O     L   113_B    153  163  163     68  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   114_O     L   114_B    153  163  163     68  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   115_O     A   115_B    153  163  163     68  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   116_O     H   116_B    153  163  163     68  111  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   117_O     A   117_B    153  163  163     68  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   118_O     E   118_B    153  163  163     68  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   119_O     K   119_B    153  163  163     68  107  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   120_O     K   120_B    153  163  163     68  108  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   121_O     L   121_B    153  163  163     68  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   122_O     G   122_B    153  163  163     68  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   123_O     C   123_B    153  163  163     68  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   124_O     K   124_B    153  163  163     68  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   125_O     L   125_B    153  163  163     77  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   126_O     G   126_B    153  163  163     68  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q   127_O     Q   127_B    153  163  163     68  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S   128_O     S   128_B    153  163  163     68  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T   129_O     T   129_B    153  163  163     68  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   130_O     A   130_B    153  163  163     36  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   131_O     D   131_B    153  163  163     38  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   132_O     G   132_B    153  163  163     63  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R   133_O     R   133_B    153  163  163     59  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V   134_O     V   134_B    153  163  163     68  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y   135_O     Y   135_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   136_O     L   136_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   137_O     K   137_B    153  163  163     79  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R   138_O     R   138_B    153  163  163     62  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   139_O     E   139_B    153  163  163     68  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   140_O     E   140_B    153  163  163      4   22   82  154  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   141_O     E   141_B    153  163  163     68   85  140  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   142_O     C   142_B    153  163  163     68   85  144  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   143_O     L   143_B    153  163  163     68   87  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   144_O     A   144_B    153  163  163     44   83  129  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   145_O     A   145_B    153  163  163     68   85  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   146_O     C   146_B    153  163  163     36  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S   147_O     S   147_B    153  163  163     36  104  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   148_O     A   148_B    153  163  163     62   87  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   149_O     A   149_B    153  163  163     68  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P   150_O     P   150_B    153  163  163     68  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     M   151_O     M   151_B    153  163  163     68  116  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     M   152_O     M   152_B    153  163  163     68  113  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V   153_O     V   153_B    153  163  163     68   85  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I   154_O     I   154_B    153  163  163     68   85  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N   155_O     N   155_B    153  163  163     68   83  119  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   156_O     G   156_B    153  163  163     49   83   98  141  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   157_O     H   157_B    153  163  163     49   83  100  149  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y   158_O     Y   158_B    153  163  163     68   85  129  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   159_O     H   159_B    153  163  163     68   85  142  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   160_O     E   160_B    153  163  163     68   87  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   161_O     H   161_B    153  163  163     68   87  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   162_O     L   162_B    153  163  163     68   91  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T   163_O     T   163_B    153  163  163     68   85  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   164_O     K   164_B    153  163  163     68   85  142  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   165_O     E   165_B    153  163  163     68   83  119  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   166_O     K   166_B    129  163  163     68   85  135  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V   167_O     V   167_B    129  163  163     68   87  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   168_O     D   168_B    127  163  163     68   85  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   169_O     A   169_B    117  163  163     68   85  131  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   170_O     L   170_B    117  163  163     68   85  142  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   171_O     L   171_B    117  163  163     68   87  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   172_O     D   172_B    117  163  163     68   85  145  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   173_O     G   173_B    104  163  163     68   83  125  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   174_O     L   174_B    104  163  163     49   83  125  159  162  162  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   175_O     E   175_B    102  163  163      3    3    3   88   97  116  161  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  97.49  (  92.48  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     79    116    145    159    162    162    162    163    163    163    163    163    163    163    163    163    163    163    163    163 
GDT PERCENT_AT  48.47  71.17  88.96  97.55  99.39  99.39  99.39 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.30   0.60   0.85   1.01   1.06   1.06   1.06   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12
GDT RMS_ALL_AT   1.41   1.24   1.15   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    52_O      E    52_B
#   possible swapping detected:  Y    69_O      Y    69_B
#   possible swapping detected:  E    71_O      E    71_B
#   possible swapping detected:  E    79_O      E    79_B
#   possible swapping detected:  E    88_O      E    88_B
#   possible swapping detected:  E    90_O      E    90_B
#   possible swapping detected:  F    99_O      F    99_B
#   possible swapping detected:  E   111_O      E   111_B
#   possible swapping detected:  E   118_O      E   118_B
#   possible swapping detected:  Y   135_O      Y   135_B
#   possible swapping detected:  E   160_O      E   160_B

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    V    13_O      V    13_B     1.177     0    0.019   0.225     1.906   79.286   80.272
LGA    D    14_O      D    14_B     0.811     0    0.018   0.408     1.577   90.476   87.143
LGA    P    15_O      P    15_B     0.743     0    0.045   0.087     0.819   90.476   90.476
LGA    Q    16_O      Q    16_B     0.765     0    0.101   0.877     2.821   88.214   78.889
LGA    V    17_O      V    17_B     0.953     0    0.034   0.047     1.021   88.214   87.891
LGA    V    18_O      V    18_B     0.856     0    0.105   1.155     3.084   90.476   79.932
LGA    L    19_O      L    19_B     0.919     0    0.032   0.095     1.210   85.952   88.214
LGA    S    20_O      S    20_B     1.062     0    0.083   0.124     1.364   81.429   81.429
LGA    D    21_O      D    21_B     0.954     0    0.034   0.541     2.975   90.476   82.976
LGA    K    22_O      K    22_B     0.884     0    0.019   0.587     2.401   90.476   86.614
LGA    T    23_O      T    23_B     0.654     0    0.018   0.111     0.849   90.476   90.476
LGA    R    24_O      R    24_B     0.838     0    0.197   0.770     2.085   88.214   83.290
LGA    A    25_O      A    25_B     0.916     0    0.022   0.029     1.004   88.214   88.667
LGA    H    26_O      H    26_B     0.912     0    0.012   0.274     1.439   90.476   89.619
LGA    I    27_O      I    27_B     0.937     0    0.038   0.098     1.072   88.214   88.214
LGA    D    28_O      D    28_B     1.000     0    0.022   0.082     1.141   85.952   87.083
LGA    H    29_O      H    29_B     1.195     0    0.028   1.153     2.907   81.429   75.667
LGA    W    30_O      W    30_B     0.831     0    0.023   0.208     1.254   90.476   87.891
LGA    L    31_O      L    31_B     0.928     0    0.083   0.158     1.118   88.214   89.405
LGA    A    32_O      A    32_B     1.147     0    0.051   0.048     1.553   79.286   79.714
LGA    K    33_O      K    33_B     1.255     0    0.012   0.270     1.633   81.429   79.524
LGA    F    34_O      F    34_B     1.195     0    0.011   0.071     1.316   81.429   85.541
LGA    P    35_O      P    35_B     1.279     0    0.043   0.060     1.443   81.429   81.429
LGA    P    36_O      P    36_B     1.344     0    0.034   0.047     1.464   81.429   81.429
LGA    D    37_O      D    37_B     1.294     0    0.080   0.149     1.930   81.429   77.143
LGA    R    38_O      R    38_B     1.285     0    0.082   0.721     6.399   81.429   60.779
LGA    K    39_O      K    39_B     0.868     0    0.063   0.839     1.894   88.214   85.556
LGA    R    40_O      R    40_B     0.867     0    0.088   0.563     1.802   90.476   82.381
LGA    S    41_O      S    41_B     0.997     0    0.032   0.114     1.115   90.476   88.968
LGA    A    42_O      A    42_B     0.775     0    0.073   0.086     0.945   90.476   90.476
LGA    V    43_O      V    43_B     0.731     0    0.080   0.878     1.856   90.476   85.442
LGA    L    44_O      L    44_B     0.720     0    0.032   0.743     3.620   90.476   78.155
LGA    Q    45_O      Q    45_B     0.656     0    0.050   0.512     2.149   90.476   85.714
LGA    G    46_O      G    46_B     0.870     0    0.021   0.021     0.870   90.476   90.476
LGA    L    47_O      L    47_B     0.601     0    0.025   0.111     0.629   90.476   92.857
LGA    H    48_O      H    48_B     0.698     0    0.009   1.173     4.613   90.476   68.714
LGA    A    49_O      A    49_B     0.864     0    0.026   0.027     0.909   90.476   90.476
LGA    A    50_O      A    50_B     0.673     0    0.040   0.052     0.723   90.476   90.476
LGA    Q    51_O      Q    51_B     0.767     0    0.012   0.134     0.816   90.476   91.534
LGA    E    52_O      E    52_B     0.847     0    0.033   0.109     0.926   90.476   90.476
LGA    Q    53_O      Q    53_B     0.848     0    0.008   0.194     1.061   90.476   89.524
LGA    N    54_O      N    54_B     0.545     0    0.034   0.123     0.785   90.476   94.048
LGA    Q    55_O      Q    55_B     1.216     0    0.036   1.033     2.202   85.952   78.836
LGA    G    56_O      G    56_B     0.527     0    0.035   0.035     0.684   92.857   92.857
LGA    W    57_O      W    57_B     0.568     0    0.039   0.063     0.594   92.857   97.279
LGA    L    58_O      L    58_B     0.601     0    0.038   0.117     0.906   90.476   90.476
LGA    T    59_O      T    59_B     0.612     0    0.026   0.062     0.677   90.476   90.476
LGA    D    60_O      D    60_B     0.770     0    0.019   0.104     1.175   90.476   87.083
LGA    E    61_O      E    61_B     0.640     0    0.059   1.165     4.824   90.476   70.159
LGA    L    62_O      L    62_B     0.682     0    0.017   0.128     1.081   90.476   89.345
LGA    I    63_O      I    63_B     0.720     0    0.043   0.110     0.799   90.476   90.476
LGA    V    64_O      V    64_B     0.700     0    0.016   0.045     0.883   90.476   90.476
LGA    G    65_O      G    65_B     0.677     0    0.047   0.047     0.677   90.476   90.476
LGA    V    66_O      V    66_B     0.717     0    0.017   0.036     0.813   90.476   90.476
LGA    A    67_O      A    67_B     0.724     0    0.011   0.010     0.767   90.476   90.476
LGA    K    68_O      K    68_B     0.667     0    0.030   0.426     1.450   90.476   88.466
LGA    Y    69_O      Y    69_B     0.896     0    0.005   0.138     1.415   88.214   85.952
LGA    L    70_O      L    70_B     0.989     0    0.011   0.091     1.215   85.952   87.083
LGA    E    71_O      E    71_B     1.125     0    0.017   0.323     2.092   81.429   79.630
LGA    L    72_O      L    72_B     1.067     0    0.034   0.234     1.248   85.952   85.952
LGA    P    73_O      P    73_B     0.972     0    0.043   0.094     1.153   85.952   85.306
LGA    P    74_O      P    74_B     0.626     0    0.024   0.070     0.670   90.476   90.476
LGA    V    75_O      V    75_B     0.782     0    0.023   1.278     3.545   90.476   80.068
LGA    W    76_O      W    76_B     0.884     0    0.053   0.081     1.111   88.214   88.537
LGA    A    77_O      A    77_B     0.703     0    0.021   0.024     0.822   90.476   90.476
LGA    Y    78_O      Y    78_B     0.718     0    0.018   0.084     0.947   90.476   90.476
LGA    E    79_O      E    79_B     1.000     0    0.043   0.210     1.416   88.214   84.444
LGA    V    80_O      V    80_B     0.783     0    0.064   0.114     1.027   92.857   90.544
LGA    A    81_O      A    81_B     0.433     0    0.019   0.017     0.567   97.619   96.190
LGA    S    82_O      S    82_B     0.439     0    0.045   0.200     0.845   97.619   95.238
LGA    F    83_O      F    83_B     0.329     0    0.025   0.142     0.786  100.000   97.403
LGA    Y    84_O      Y    84_B     0.206     0    0.105   0.128     1.065  100.000   93.690
LGA    S    85_O      S    85_B     1.020     0    0.010   0.208     1.766   88.214   83.095
LGA    M    86_O      M    86_B     0.639     0    0.035   0.681     3.013   90.476   79.048
LGA    F    87_O      F    87_B     0.621     0    0.058   0.203     0.818   90.476   90.476
LGA    E    88_O      E    88_B     0.681     0    0.111   0.177     0.884   90.476   90.476
LGA    T    89_O      T    89_B     0.578     0    0.071   0.123     0.988   90.476   90.476
LGA    E    90_O      E    90_B     0.610     0    0.034   1.059     4.555   97.619   72.222
LGA    K    91_O      K    91_B     0.746     0    0.114   0.984     5.817   90.476   74.603
LGA    V    92_O      V    92_B     0.687     0    0.051   0.116     0.810   90.476   90.476
LGA    G    93_O      G    93_B     0.542     0    0.031   0.031     0.664   90.476   90.476
LGA    R    94_O      R    94_B     0.795     0    0.032   1.104     3.253   85.952   85.195
LGA    H    95_O      H    95_B     1.199     0    0.051   0.053     2.028   83.690   78.095
LGA    N    96_O      N    96_B     1.306     0    0.039   1.133     4.456   81.429   69.702
LGA    V    97_O      V    97_B     0.932     0    0.017   0.051     0.968   90.476   90.476
LGA    A    98_O      A    98_B     0.955     0    0.029   0.047     1.131   88.214   86.857
LGA    F    99_O      F    99_B     0.564     0    0.011   0.037     0.746   90.476   93.074
LGA    C   100_O      C   100_B     0.524     0    0.077   0.082     0.524   95.238   95.238
LGA    T   101_O      T   101_B     0.578     0    0.011   0.030     0.823   90.476   91.837
LGA    N   102_O      N   102_B     0.912     0    0.070   0.236     1.454   92.857   87.143
LGA    I   103_O      I   103_B     1.285     0    0.030   1.342     5.354   85.952   69.107
LGA    S   104_O      S   104_B     0.462     0    0.010   0.063     0.806   97.619   96.825
LGA    C   105_O      C   105_B     0.206     0    0.028   0.052     0.591   97.619   98.413
LGA    W   106_O      W   106_B     0.874     0    0.055   0.277     2.285   88.214   79.796
LGA    L   107_O      L   107_B     0.859     0    0.079   0.080     1.146   90.476   89.345
LGA    N   108_O      N   108_B     0.611     0    0.126   1.099     2.469   90.476   84.048
LGA    G   109_O      G   109_B     0.433     0    0.057   0.057     0.740   95.238   95.238
LGA    A   110_O      A   110_B     0.757     0    0.085   0.089     0.918   90.476   90.476
LGA    E   111_O      E   111_B     0.894     0    0.037   0.697     3.269   88.214   76.402
LGA    D   112_O      D   112_B     1.137     0    0.028   0.094     1.536   81.429   79.286
LGA    L   113_O      L   113_B     0.833     0    0.028   1.140     3.180   90.476   83.214
LGA    L   114_O      L   114_B     0.379     0    0.069   0.156     0.645   92.857   96.429
LGA    A   115_O      A   115_B     0.792     0    0.018   0.024     0.936   90.476   90.476
LGA    H   116_O      H   116_B     0.995     0    0.055   0.088     1.651   90.476   84.238
LGA    A   117_O      A   117_B     0.718     0    0.056   0.064     0.818   90.476   90.476
LGA    E   118_O      E   118_B     0.601     0    0.020   0.266     1.434   90.476   89.471
LGA    K   119_O      K   119_B     1.051     0    0.025   0.765     7.144   88.214   65.767
LGA    K   120_O      K   120_B     1.063     0    0.056   0.572     2.080   85.952   79.683
LGA    L   121_O      L   121_B     0.771     0    0.031   0.095     0.953   90.476   91.667
LGA    G   122_O      G   122_B     0.747     0    0.035   0.035     0.801   90.476   90.476
LGA    C   123_O      C   123_B     0.561     0    0.017   0.182     1.051   90.476   90.556
LGA    K   124_O      K   124_B     0.518     0    0.016   0.845     5.419   95.238   74.074
LGA    L   125_O      L   125_B     0.396     0    0.063   0.132     0.719   95.238   95.238
LGA    G   126_O      G   126_B     0.802     0    0.168   0.168     1.598   86.071   86.071
LGA    Q   127_O      Q   127_B     0.672     0    0.027   0.170     1.530   92.857   86.561
LGA    S   128_O      S   128_B     0.465     0    0.052   0.092     0.596   95.238   93.651
LGA    T   129_O      T   129_B     0.459     0    0.038   0.052     0.616   95.238   93.197
LGA    A   130_O      A   130_B     0.851     0    0.027   0.033     1.238   90.476   88.667
LGA    D   131_O      D   131_B     0.755     0    0.040   0.098     1.071   90.476   89.345
LGA    G   132_O      G   132_B     0.231     0    0.015   0.015     0.570   97.619   97.619
LGA    R   133_O      R   133_B     0.695     0    0.019   1.591     6.576   92.857   71.645
LGA    V   134_O      V   134_B     0.700     0    0.016   0.029     1.050   92.857   90.544
LGA    Y   135_O      Y   135_B     0.646     0    0.020   0.163     2.440   90.476   79.603
LGA    L   136_O      L   136_B     0.468     0    0.066   0.137     0.748   95.238   96.429
LGA    K   137_O      K   137_B     0.791     0    0.037   0.448     1.859   90.476   86.508
LGA    R   138_O      R   138_B     0.988     0    0.012   0.782     3.158   90.476   72.208
LGA    E   139_O      E   139_B     0.756     0    0.016   0.329     2.013   81.786   81.587
LGA    E   140_O      E   140_B     2.182     0    0.068   0.758     7.345   67.024   45.820
LGA    E   141_O      E   141_B     1.801     0    0.069   1.014     7.371   77.143   52.434
LGA    C   142_O      C   142_B     1.652     0    0.064   0.172     2.064   72.857   71.508
LGA    L   143_O      L   143_B     1.487     0    0.028   0.065     1.655   75.000   79.345
LGA    A   144_O      A   144_B     2.157     0    0.151   0.151     2.741   64.881   63.333
LGA    A   145_O      A   145_B     1.516     0    0.067   0.077     1.516   79.286   79.714
LGA    C   146_O      C   146_B     0.933     0    0.026   0.260     1.574   88.214   86.032
LGA    S   147_O      S   147_B     1.069     0    0.026   0.215     2.069   83.690   80.159
LGA    A   148_O      A   148_B     1.306     0    0.023   0.053     1.585   81.429   79.714
LGA    A   149_O      A   149_B     0.675     0    0.026   0.031     0.888   90.476   90.476
LGA    P   150_O      P   150_B     0.503     0    0.042   0.062     0.885   90.476   90.476
LGA    M   151_O      M   151_B     0.896     0    0.062   0.452     1.535   90.476   84.881
LGA    M   152_O      M   152_B     0.982     0    0.033   0.786     2.076   85.952   80.536
LGA    V   153_O      V   153_B     1.543     0    0.040   0.086     2.099   79.286   75.374
LGA    I   154_O      I   154_B     1.472     0    0.034   0.086     2.107   75.119   77.202
LGA    N   155_O      N   155_B     1.940     0    0.022   0.294     2.563   66.905   68.869
LGA    G   156_O      G   156_B     2.603     0    0.017   0.017     2.868   59.048   59.048
LGA    H   157_O      H   157_B     2.572     0    0.021   1.149     3.936   60.952   52.429
LGA    Y   158_O      Y   158_B     1.948     0    0.022   0.243     2.230   68.810   69.484
LGA    H   159_O      H   159_B     1.687     0    0.043   0.147     2.336   75.000   71.286
LGA    E   160_O      E   160_B     1.302     0    0.074   0.191     1.573   81.429   79.524
LGA    H   161_O      H   161_B     1.231     0    0.037   0.151     1.677   81.429   79.714
LGA    L   162_O      L   162_B     1.137     0    0.056   0.070     1.271   81.429   84.821
LGA    T   163_O      T   163_B     1.523     0    0.014   0.064     1.806   77.143   75.306
LGA    K   164_O      K   164_B     1.664     0    0.052   0.560     2.164   72.857   71.958
LGA    E   165_O      E   165_B     2.136     0    0.008   0.444     2.805   66.786   64.815
LGA    K   166_O      K   166_B     1.840     0    0.056   0.800     3.637   72.857   69.735
LGA    V   167_O      V   167_B     1.345     0    0.031   0.051     1.534   79.286   80.204
LGA    D   168_O      D   168_B     1.559     0    0.034   0.200     1.747   75.000   73.929
LGA    A   169_O      A   169_B     1.947     0    0.009   0.017     1.993   72.857   72.857
LGA    L   170_O      L   170_B     1.722     0    0.031   0.072     1.799   72.857   72.857
LGA    L   171_O      L   171_B     1.276     0    0.068   0.117     1.432   81.429   82.560
LGA    D   172_O      D   172_B     1.683     0    0.037   0.065     1.952   72.857   73.929
LGA    G   173_O      G   173_B     2.034     0    0.090   0.090     2.402   66.786   66.786
LGA    L   174_O      L   174_B     1.867     0    0.597   0.524     2.130   70.833   76.131
LGA    E   175_O      E   175_B     4.769     0    0.559   0.996    11.107   21.190   12.434

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      163     652    652  100.00    1282   1282  100.00               163
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.120          1.173                  1.628           86.303   83.146

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  175  163    4.0    163    1.12    92.178    96.615    13.362

LGA_LOCAL      RMSD:   1.120  Number of atoms:  163  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.120  Number of assigned atoms:  163 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.120  Standard rmsd on all 163 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.284194 * X  +   0.833860 * Y  +  -0.473193 * Z  +  14.494193
  Y_new =   0.925932 * X  +  -0.366760 * Y  +  -0.090200 * Z  +  37.096413
  Z_new =  -0.248762 * X  +  -0.412511 * Y  +  -0.876329 * Z  +  -0.511524 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  1.272996  0.251402 -2.701637   [DEG:   72.9373   14.4043 -154.7924 ]
ZXZ: -1.382437  2.638983 -2.598938   [DEG:  -79.2078  151.2026 -148.9082 ]
 
# END of job
