
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  175 ( 1372),  selected  163 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  163 ( 1282),  selected  163 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:O  -ch2:B  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   163      13_B - 175_B       0.74     0.74
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   163      13_B - 175_B       0.74     0.74
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   163      13_B - 175_B       0.74     0.74
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  163
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     V    13_O     V    13_B    163  163  163     64  146  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    14_O     D    14_B    163  163  163     75  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    15_O     P    15_B    163  163  163     76  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    16_O     Q    16_B    163  163  163     75  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    17_O     V    17_B    163  163  163     76  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    18_O     V    18_B    163  163  163     76  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    19_O     L    19_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    20_O     S    20_B    163  163  163     94  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    21_O     D    21_B    163  163  163     78  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    22_O     K    22_B    163  163  163     80  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T    23_O     T    23_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    24_O     R    24_B    163  163  163     61  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    25_O     A    25_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    26_O     H    26_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I    27_O     I    27_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    28_O     D    28_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    29_O     H    29_B    163  163  163     88  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W    30_O     W    30_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    31_O     L    31_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    32_O     A    32_B    163  163  163     79  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    33_O     K    33_B    163  163  163     78  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    34_O     F    34_B    163  163  163     80  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    35_O     P    35_B    163  163  163     79  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    36_O     P    36_B    163  163  163     78  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    37_O     D    37_B    163  163  163     75  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    38_O     R    38_B    163  163  163     79  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    39_O     K    39_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    40_O     R    40_B    163  163  163     76  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    41_O     S    41_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    42_O     A    42_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    43_O     V    43_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    44_O     L    44_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    45_O     Q    45_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    46_O     G    46_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    47_O     L    47_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    48_O     H    48_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    49_O     A    49_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    50_O     A    50_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    51_O     Q    51_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    52_O     E    52_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    53_O     Q    53_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N    54_O     N    54_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q    55_O     Q    55_B    163  163  163     75  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    56_O     G    56_B    163  163  163     80  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W    57_O     W    57_B    163  163  163     87  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    58_O     L    58_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T    59_O     T    59_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D    60_O     D    60_B    163  163  163     78  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    61_O     E    61_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    62_O     L    62_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I    63_O     I    63_B    163  163  163     78  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    64_O     V    64_B    163  163  163     78  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    65_O     G    65_B    163  163  163     94  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    66_O     V    66_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    67_O     A    67_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    68_O     K    68_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y    69_O     Y    69_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    70_O     L    70_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    71_O     E    71_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L    72_O     L    72_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    73_O     P    73_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P    74_O     P    74_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    75_O     V    75_B    163  163  163     79  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W    76_O     W    76_B    163  163  163     79  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    77_O     A    77_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y    78_O     Y    78_B    163  163  163     78  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    79_O     E    79_B    163  163  163     76  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    80_O     V    80_B    163  163  163     78  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    81_O     A    81_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    82_O     S    82_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    83_O     F    83_B    163  163  163     79  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y    84_O     Y    84_B    163  163  163     83  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S    85_O     S    85_B    163  163  163     81  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     M    86_O     M    86_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    87_O     F    87_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    88_O     E    88_B    163  163  163     61  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T    89_O     T    89_B    163  163  163     76  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E    90_O     E    90_B    163  163  163     75  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K    91_O     K    91_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    92_O     V    92_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G    93_O     G    93_B    163  163  163     95  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R    94_O     R    94_B    163  163  163     95  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H    95_O     H    95_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N    96_O     N    96_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V    97_O     V    97_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A    98_O     A    98_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     F    99_O     F    99_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   100_O     C   100_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T   101_O     T   101_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N   102_O     N   102_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I   103_O     I   103_B    163  163  163     93  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S   104_O     S   104_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   105_O     C   105_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     W   106_O     W   106_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   107_O     L   107_B    163  163  163     93  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N   108_O     N   108_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   109_O     G   109_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   110_O     A   110_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   111_O     E   111_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   112_O     D   112_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   113_O     L   113_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   114_O     L   114_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   115_O     A   115_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   116_O     H   116_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   117_O     A   117_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   118_O     E   118_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   119_O     K   119_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   120_O     K   120_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   121_O     L   121_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   122_O     G   122_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   123_O     C   123_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   124_O     K   124_B    163  163  163     94  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   125_O     L   125_B    163  163  163     23  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   126_O     G   126_B    163  163  163     13  140  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Q   127_O     Q   127_B    163  163  163     65  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S   128_O     S   128_B    163  163  163     78  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T   129_O     T   129_B    163  163  163     84  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   130_O     A   130_B    163  163  163     61  151  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   131_O     D   131_B    163  163  163     61  151  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   132_O     G   132_B    163  163  163     87  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R   133_O     R   133_B    163  163  163     85  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V   134_O     V   134_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y   135_O     Y   135_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   136_O     L   136_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   137_O     K   137_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     R   138_O     R   138_B    163  163  163     10   69  125  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   139_O     E   139_B    163  163  163      5   10  100  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   140_O     E   140_B    163  163  163      3    4    5   48  151  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   141_O     E   141_B    163  163  163      9   74  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   142_O     C   142_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   143_O     L   143_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   144_O     A   144_B    163  163  163     85  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   145_O     A   145_B    163  163  163     93  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     C   146_O     C   146_B    163  163  163     70  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     S   147_O     S   147_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   148_O     A   148_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   149_O     A   149_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     P   150_O     P   150_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     M   151_O     M   151_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     M   152_O     M   152_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V   153_O     V   153_B    163  163  163     93  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     I   154_O     I   154_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     N   155_O     N   155_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   156_O     G   156_B    163  163  163     70  151  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   157_O     H   157_B    163  163  163     50  151  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     Y   158_O     Y   158_B    163  163  163     80  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   159_O     H   159_B    163  163  163     93  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   160_O     E   160_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     H   161_O     H   161_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   162_O     L   162_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     T   163_O     T   163_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   164_O     K   164_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   165_O     E   165_B    163  163  163     85  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     K   166_O     K   166_B    163  163  163     93  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     V   167_O     V   167_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   168_O     D   168_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     A   169_O     A   169_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   170_O     L   170_B    163  163  163     93  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   171_O     L   171_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     D   172_O     D   172_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     G   173_O     G   173_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     L   174_O     L   174_B    163  163  163     96  152  159  161  161  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_GDT     E   175_O     E   175_B    163  163  163      3    3    3   80  155  162  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163  163 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     96    152    159    161    161    162    163    163    163    163    163    163    163    163    163    163    163    163    163    163 
GDT PERCENT_AT  58.90  93.25  97.55  98.77  98.77  99.39 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.37   0.53   0.58   0.63   0.63   0.69   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74
GDT RMS_ALL_AT   0.75   0.75   0.75   0.75   0.75   0.75   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    52_O      E    52_B
#   possible swapping detected:  Y    69_O      Y    69_B
#   possible swapping detected:  E    71_O      E    71_B
#   possible swapping detected:  E    79_O      E    79_B
#   possible swapping detected:  E    88_O      E    88_B
#   possible swapping detected:  E    90_O      E    90_B
#   possible swapping detected:  F    99_O      F    99_B
#   possible swapping detected:  E   111_O      E   111_B
#   possible swapping detected:  E   118_O      E   118_B
#   possible swapping detected:  Y   135_O      Y   135_B
#   possible swapping detected:  E   160_O      E   160_B

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    V    13_O      V    13_B     1.197     0    0.041   1.074     2.763   79.286   75.510
LGA    D    14_O      D    14_B     1.036     0    0.011   0.424     1.679   85.952   83.750
LGA    P    15_O      P    15_B     0.814     0    0.055   0.096     0.929   90.476   90.476
LGA    Q    16_O      Q    16_B     1.046     0    0.087   0.895     2.640   88.214   77.090
LGA    V    17_O      V    17_B     0.913     0    0.030   0.042     1.094   90.476   89.184
LGA    V    18_O      V    18_B     0.807     0    0.095   1.172     3.195   92.857   81.293
LGA    L    19_O      L    19_B     0.361     0    0.009   0.097     0.590   95.238   97.619
LGA    S    20_O      S    20_B     0.543     0    0.076   0.126     0.743   90.476   90.476
LGA    D    21_O      D    21_B     0.681     0    0.028   0.561     2.176   90.476   86.131
LGA    K    22_O      K    22_B     0.603     0    0.025   0.579     2.049   95.238   90.794
LGA    T    23_O      T    23_B     0.357     0    0.013   0.073     0.476  100.000  100.000
LGA    R    24_O      R    24_B     0.781     0    0.198   0.772     1.929   95.238   89.004
LGA    A    25_O      A    25_B     0.445     0    0.025   0.029     0.547  100.000   98.095
LGA    H    26_O      H    26_B     0.524     0    0.018   0.520     1.719   95.238   90.667
LGA    I    27_O      I    27_B     0.477     0    0.040   0.118     0.723  100.000   98.810
LGA    D    28_O      D    28_B     0.406     0    0.024   0.161     0.537   97.619   96.429
LGA    H    29_O      H    29_B     0.653     0    0.034   1.154     2.488   90.476   82.667
LGA    W    30_O      W    30_B     0.346     0    0.019   0.186     1.042  100.000   94.592
LGA    L    31_O      L    31_B     0.468     0    0.078   0.146     0.588   95.238   96.429
LGA    A    32_O      A    32_B     0.721     0    0.064   0.061     1.164   88.214   88.667
LGA    K    33_O      K    33_B     0.851     0    0.036   0.281     1.758   90.476   83.545
LGA    F    34_O      F    34_B     0.711     0    0.015   0.072     0.796   90.476   91.342
LGA    P    35_O      P    35_B     0.766     0    0.049   0.063     0.924   90.476   90.476
LGA    P    36_O      P    36_B     0.872     0    0.032   0.043     1.008   90.476   89.184
LGA    D    37_O      D    37_B     0.910     0    0.064   0.090     1.224   90.476   85.952
LGA    R    38_O      R    38_B     0.752     0    0.077   0.692     5.582   92.857   69.307
LGA    K    39_O      K    39_B     0.384     0    0.074   0.818     1.944   97.619   91.799
LGA    R    40_O      R    40_B     0.674     0    0.084   0.574     2.126   95.238   84.199
LGA    S    41_O      S    41_B     0.505     0    0.030   0.152     0.608   95.238   95.238
LGA    A    42_O      A    42_B     0.272     0    0.060   0.072     0.442  100.000  100.000
LGA    V    43_O      V    43_B     0.400     0    0.077   0.874     1.871  100.000   90.884
LGA    L    44_O      L    44_B     0.438     0    0.037   0.820     3.275   97.619   82.917
LGA    Q    45_O      Q    45_B     0.273     0    0.048   0.349     1.688  100.000   91.799
LGA    G    46_O      G    46_B     0.372     0    0.014   0.014     0.372  100.000  100.000
LGA    L    47_O      L    47_B     0.356     0    0.022   0.106     0.490  100.000  100.000
LGA    H    48_O      H    48_B     0.485     0    0.022   1.149     2.631  100.000   88.381
LGA    A    49_O      A    49_B     0.350     0    0.012   0.024     0.409  100.000  100.000
LGA    A    50_O      A    50_B     0.227     0    0.051   0.064     0.383  100.000  100.000
LGA    Q    51_O      Q    51_B     0.373     0    0.012   0.190     0.793  100.000   96.825
LGA    E    52_O      E    52_B     0.459     0    0.023   0.097     1.079  100.000   94.762
LGA    Q    53_O      Q    53_B     0.439     0    0.019   0.212     0.704  100.000   98.942
LGA    N    54_O      N    54_B     0.352     0    0.047   0.111     0.630  100.000   98.810
LGA    Q    55_O      Q    55_B     0.805     0    0.041   0.323     2.705   92.857   81.958
LGA    G    56_O      G    56_B     0.774     0    0.089   0.089     0.774   90.476   90.476
LGA    W    57_O      W    57_B     0.623     0    0.036   0.116     0.970   95.238   91.837
LGA    L    58_O      L    58_B     0.399     0    0.032   0.121     0.675   97.619   95.238
LGA    T    59_O      T    59_B     0.394     0    0.020   0.065     0.569   95.238   97.279
LGA    D    60_O      D    60_B     0.689     0    0.039   0.158     1.201   90.476   89.345
LGA    E    61_O      E    61_B     0.547     0    0.045   1.164     4.753   90.476   70.794
LGA    L    62_O      L    62_B     0.507     0    0.016   0.093     0.653   92.857   94.048
LGA    I    63_O      I    63_B     0.665     0    0.044   0.112     0.780   90.476   90.476
LGA    V    64_O      V    64_B     0.759     0    0.021   0.037     1.075   90.476   87.891
LGA    G    65_O      G    65_B     0.538     0    0.038   0.038     0.594   95.238   95.238
LGA    V    66_O      V    66_B     0.384     0    0.018   0.041     0.460  100.000  100.000
LGA    A    67_O      A    67_B     0.517     0    0.010   0.008     0.642   92.857   92.381
LGA    K    68_O      K    68_B     0.476     0    0.036   0.423     1.899   97.619   88.730
LGA    Y    69_O      Y    69_B     0.394     0    0.007   0.135     0.785  100.000   96.032
LGA    L    70_O      L    70_B     0.313     0    0.019   0.090     0.691  100.000   98.810
LGA    E    71_O      E    71_B     0.344     0    0.016   0.404     1.453  100.000   94.762
LGA    L    72_O      L    72_B     0.398     0    0.036   0.209     0.725  100.000   97.619
LGA    P    73_O      P    73_B     0.509     0    0.051   0.105     0.758   95.238   93.197
LGA    P    74_O      P    74_B     0.516     0    0.025   0.076     0.745   90.476   90.476
LGA    V    75_O      V    75_B     0.637     0    0.021   1.274     3.020   90.476   79.932
LGA    W    76_O      W    76_B     0.656     0    0.053   0.064     0.969   90.476   90.476
LGA    A    77_O      A    77_B     0.482     0    0.033   0.034     0.553   92.857   94.286
LGA    Y    78_O      Y    78_B     0.783     0    0.021   0.116     1.270   90.476   87.460
LGA    E    79_O      E    79_B     0.960     0    0.053   0.104     1.150   90.476   88.466
LGA    V    80_O      V    80_B     0.722     0    0.077   0.118     0.827   90.476   90.476
LGA    A    81_O      A    81_B     0.507     0    0.050   0.048     0.592   95.238   94.286
LGA    S    82_O      S    82_B     0.531     0    0.055   0.295     1.387   95.238   92.143
LGA    F    83_O      F    83_B     0.665     0    0.021   0.047     0.771   90.476   90.476
LGA    Y    84_O      Y    84_B     0.575     0    0.093   0.143     0.956   92.857   91.270
LGA    S    85_O      S    85_B     0.687     0    0.051   0.200     1.215   95.238   90.635
LGA    M    86_O      M    86_B     0.259     0    0.015   0.802     4.016  100.000   90.952
LGA    F    87_O      F    87_B     0.458     0    0.100   0.214     0.685   97.619   97.403
LGA    E    88_O      E    88_B     1.001     0    0.106   0.175     1.686   85.952   82.487
LGA    T    89_O      T    89_B     0.697     0    0.093   0.145     1.041   90.476   89.184
LGA    E    90_O      E    90_B     0.578     0    0.038   1.046     3.572   90.476   74.180
LGA    K    91_O      K    91_B     0.353     0    0.091   1.002     5.794   95.238   77.778
LGA    V    92_O      V    92_B     0.388     0    0.039   0.091     0.529  100.000   98.639
LGA    G    93_O      G    93_B     0.447     0    0.041   0.041     0.497  100.000  100.000
LGA    R    94_O      R    94_B     0.451     0    0.017   1.029     2.985  100.000   89.307
LGA    H    95_O      H    95_B     0.229     0    0.026   0.192     0.980  100.000   95.238
LGA    N    96_O      N    96_B     0.331     0    0.065   0.302     1.432  100.000   94.107
LGA    V    97_O      V    97_B     0.256     0    0.032   0.057     0.378  100.000  100.000
LGA    A    98_O      A    98_B     0.334     0    0.053   0.073     0.451  100.000  100.000
LGA    F    99_O      F    99_B     0.487     0    0.016   0.039     0.530   95.238   96.537
LGA    C   100_O      C   100_B     0.504     0    0.070   0.093     0.606   95.238   95.238
LGA    T   101_O      T   101_B     0.445     0    0.037   0.055     0.524   95.238   95.918
LGA    N   102_O      N   102_B     0.469     0    0.068   0.136     0.720   97.619   95.238
LGA    I   103_O      I   103_B     0.555     0    0.031   1.317     4.013   95.238   78.929
LGA    S   104_O      S   104_B     0.432     0    0.036   0.108     0.606  100.000   96.825
LGA    C   105_O      C   105_B     0.352     0    0.032   0.089     0.418  100.000  100.000
LGA    W   106_O      W   106_B     0.407     0    0.045   0.379     1.237  100.000   91.293
LGA    L   107_O      L   107_B     0.549     0    0.070   0.072     0.883   92.857   91.667
LGA    N   108_O      N   108_B     0.291     0    0.106   1.105     2.874   97.619   90.060
LGA    G   109_O      G   109_B     0.447     0    0.044   0.044     0.447  100.000  100.000
LGA    A   110_O      A   110_B     0.229     0    0.073   0.076     0.498  100.000  100.000
LGA    E   111_O      E   111_B     0.132     0    0.047   0.881     3.680  100.000   81.958
LGA    D   112_O      D   112_B     0.100     0    0.036   0.130     0.730  100.000   98.810
LGA    L   113_O      L   113_B     0.370     0    0.022   1.117     2.791  100.000   90.060
LGA    L   114_O      L   114_B     0.396     0    0.063   0.172     0.433  100.000  100.000
LGA    A   115_O      A   115_B     0.324     0    0.019   0.025     0.424  100.000  100.000
LGA    H   116_O      H   116_B     0.215     0    0.049   0.081     0.738  100.000   97.143
LGA    A   117_O      A   117_B     0.299     0    0.053   0.061     0.357  100.000  100.000
LGA    E   118_O      E   118_B     0.268     0    0.021   0.271     1.380  100.000   95.820
LGA    K   119_O      K   119_B     0.309     0    0.024   0.766     6.120  100.000   77.619
LGA    K   120_O      K   120_B     0.091     0    0.051   0.581     1.622  100.000   94.868
LGA    L   121_O      L   121_B     0.099     0    0.025   0.096     0.300  100.000  100.000
LGA    G   122_O      G   122_B     0.091     0    0.046   0.046     0.411  100.000  100.000
LGA    C   123_O      C   123_B     0.343     0    0.023   0.190     1.013  100.000   96.905
LGA    K   124_O      K   124_B     0.456     0    0.021   0.865     4.496   95.238   79.524
LGA    L   125_O      L   125_B     0.968     0    0.061   1.330     2.967   85.952   79.702
LGA    G   126_O      G   126_B     1.248     0    0.143   0.143     1.393   81.429   81.429
LGA    Q   127_O      Q   127_B     0.905     0    0.030   0.198     1.299   90.476   87.460
LGA    S   128_O      S   128_B     0.788     0    0.056   0.087     0.971   90.476   90.476
LGA    T   129_O      T   129_B     0.705     0    0.038   0.046     1.009   88.214   89.184
LGA    A   130_O      A   130_B     1.136     0    0.032   0.034     1.367   83.690   83.238
LGA    D   131_O      D   131_B     1.119     0    0.032   0.094     1.125   85.952   85.952
LGA    G   132_O      G   132_B     0.652     0    0.040   0.040     0.854   92.857   92.857
LGA    R   133_O      R   133_B     0.630     0    0.037   1.525     6.996   95.238   69.048
LGA    V   134_O      V   134_B     0.235     0    0.013   0.033     0.611  100.000   98.639
LGA    Y   135_O      Y   135_B     0.162     0    0.042   0.216     1.416  100.000   91.429
LGA    L   136_O      L   136_B     0.207     0    0.109   0.152     0.770   97.619   97.619
LGA    K   137_O      K   137_B     0.359     0    0.034   0.638     1.848   92.976   91.746
LGA    R   138_O      R   138_B     1.967     0    0.619   0.905     4.696   67.262   52.424
LGA    E   139_O      E   139_B     2.524     0    0.036   0.773     8.916   57.976   32.698
LGA    E   140_O      E   140_B     3.593     0    0.656   0.596    11.070   52.143   26.085
LGA    E   141_O      E   141_B     1.530     0    0.207   1.045     7.333   83.810   54.127
LGA    C   142_O      C   142_B     0.412     0    0.145   0.190     0.752   97.619   95.238
LGA    L   143_O      L   143_B     0.370     0    0.083   0.173     0.708   97.619   97.619
LGA    A   144_O      A   144_B     0.731     0    0.142   0.142     1.390   88.214   88.667
LGA    A   145_O      A   145_B     0.583     0    0.041   0.056     0.661   90.476   90.476
LGA    C   146_O      C   146_B     0.663     0    0.023   0.152     0.745   90.476   90.476
LGA    S   147_O      S   147_B     0.334     0    0.024   0.197     0.938  100.000   98.413
LGA    A   148_O      A   148_B     0.442     0    0.020   0.056     0.610   97.619   96.190
LGA    A   149_O      A   149_B     0.328     0    0.026   0.031     0.468  100.000  100.000
LGA    P   150_O      P   150_B     0.297     0    0.040   0.050     0.355  100.000  100.000
LGA    M   151_O      M   151_B     0.475     0    0.054   0.249     0.780  100.000   95.238
LGA    M   152_O      M   152_B     0.401     0    0.029   0.785     2.184  100.000   94.405
LGA    V   153_O      V   153_B     0.524     0    0.034   0.086     0.852   97.619   94.558
LGA    I   154_O      I   154_B     0.305     0    0.030   0.087     0.670   97.619   98.810
LGA    N   155_O      N   155_B     0.396     0    0.023   0.125     0.744   95.238   96.429
LGA    G   156_O      G   156_B     1.006     0    0.016   0.016     1.267   83.690   83.690
LGA    H   157_O      H   157_B     1.049     0    0.025   1.148     3.049   88.214   76.048
LGA    Y   158_O      Y   158_B     0.784     0    0.042   0.217     1.087   90.476   88.214
LGA    H   159_O      H   159_B     0.592     0    0.015   0.156     0.972   90.476   90.476
LGA    E   160_O      E   160_B     0.482     0    0.049   0.160     0.926   95.238   93.651
LGA    H   161_O      H   161_B     0.383     0    0.040   0.153     0.899  100.000   97.143
LGA    L   162_O      L   162_B     0.252     0    0.075   0.089     0.454  100.000  100.000
LGA    T   163_O      T   163_B     0.344     0    0.017   0.069     0.471  100.000  100.000
LGA    K   164_O      K   164_B     0.393     0    0.054   0.568     1.566   97.619   92.804
LGA    E   165_O      E   165_B     0.559     0    0.018   0.435     1.623   92.857   88.624
LGA    K   166_O      K   166_B     0.539     0    0.052   0.419     2.008   92.857   86.667
LGA    V   167_O      V   167_B     0.505     0    0.027   0.050     0.626   92.857   91.837
LGA    D   168_O      D   168_B     0.457     0    0.023   0.158     0.494  100.000  100.000
LGA    A   169_O      A   169_B     0.478     0    0.010   0.014     0.520   95.238   96.190
LGA    L   170_O      L   170_B     0.511     0    0.019   0.066     0.590   95.238   95.238
LGA    L   171_O      L   171_B     0.358     0    0.057   0.115     0.487  100.000  100.000
LGA    D   172_O      D   172_B     0.298     0    0.020   0.058     0.384  100.000  100.000
LGA    G   173_O      G   173_B     0.334     0    0.114   0.114     0.727   97.619   97.619
LGA    L   174_O      L   174_B     0.473     0    0.597   0.525     1.692   90.833   94.226
LGA    E   175_O      E   175_B     3.733     0    0.539   0.898    10.672   32.262   18.360

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      163     652    652  100.00    1282   1282  100.00               163
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.745          0.804                  1.478           94.243   90.268

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  175  163    4.0    163    0.74    98.006    99.080    19.297

LGA_LOCAL      RMSD:   0.745  Number of atoms:  163  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.745  Number of assigned atoms:  163 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.745  Standard rmsd on all 163 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.279640 * X  +   0.297209 * Y  +  -0.912945 * Z  +  16.697609
  Y_new =   0.848173 * X  +   0.522044 * Y  +  -0.089849 * Z  +  38.353390
  Z_new =   0.449894 * X  +  -0.799460 * Y  +  -0.398069 * Z  +  -0.713829 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  1.889271 -0.466647 -2.032780   [DEG:  108.2473  -26.7369 -116.4697 ]
ZXZ: -1.472696  1.980207  2.629015   [DEG:  -84.3792  113.4575  150.6315 ]
 
# END of job
