
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  134 ( 1014),  selected  133 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  133 ( 1010),  selected  133 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       1.67     1.67
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       1.67     1.67
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   130       5_A - 134_A       0.99     1.72
  LCS_AVERAGE:     95.59

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  133
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S     2_A     S     2_A      3  133  133      3    3    3    3   36   51   67   76   86  110  128  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M     3_A     M     3_A      3  133  133      3    3    3    3    4    4    5   14   22   48   72  101  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A     4_A     A     4_A      3  133  133      3    4    4    4    7   14   31   92  127  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     5_A     E     5_A    130  133  133      3    4    4   23   36   76  105  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L     6_A     L     6_A    130  133  133     14   64  121  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K     7_A     K     7_A    130  133  133     14   97  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q     8_A     Q     8_A    130  133  133     14  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     9_A     E     9_A    130  133  133     15  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     W    10_A     W    10_A    130  133  133     64  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    11_A     I    11_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    12_A     N    12_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    13_A     T    13_A    130  133  133     61  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    15_A     I    15_A    130  133  133     54  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    16_A     E    16_A    130  133  133     35  106  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    17_A     A    17_A    130  133  133      4   60  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    18_A     L    18_A    130  133  133      4   35  119  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    19_A     D    19_A    130  133  133      5  104  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    20_A     K    20_A    130  133  133     34  106  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    21_A     A    21_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    22_A     Y    22_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    24_A     P    24_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    25_A     Y    25_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    26_A     S    26_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    27_A     H    27_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    28_A     F    28_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    29_A     P    29_A    130  133  133     63  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    30_A     V    30_A    130  133  133     65  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    31_A     G    31_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    32_A     A    32_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    33_A     C    33_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    34_A     L    34_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    35_A     V    35_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    36_A     T    36_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    37_A     E    37_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    38_A     S    38_A    130  133  133     65  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    39_A     G    39_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    40_A     K    40_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    42_A     Y    42_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    43_A     Q    43_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    44_A     G    44_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    45_A     I    45_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    46_A     N    46_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    47_A     I    47_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    48_A     E    48_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    49_A     N    49_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    50_A     A    50_A    130  133  133     58  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    52_A     F    52_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    53_A     G    53_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    54_A     L    54_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    55_A     T    55_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    56_A     N    56_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    57_A     C    57_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    58_A     A    58_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    59_A     E    59_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    60_A     R    60_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    61_A     T    61_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    62_A     A    62_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    63_A     F    63_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    64_A     F    64_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    65_A     K    65_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    66_A     A    66_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    67_A     V    67_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    68_A     S    68_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    69_A     E    69_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    70_A     G    70_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    71_A     E    71_A    130  133  133     56  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A    130  133  133     25  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    73_A     S    73_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    74_A     F    74_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    75_A     T    75_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    76_A     H    76_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    77_A     L    77_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    78_A     V    78_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    79_A     V    79_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    80_A     A    80_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    81_A     G    81_A    130  133  133     57  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    82_A     H    82_A    130  133  133     56  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    83_A     T    83_A    130  133  133      5  102  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    84_A     P    84_A    130  133  133      6   14  112  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    85_A     D    85_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    86_A     P    86_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    87_A     I    87_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    88_A     S    88_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    89_A     P    89_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    90_A     C    90_A    130  133  133     63  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    91_A     G    91_A    130  133  133     45  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    92_A     A    92_A    130  133  133     61  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    93_A     C    93_A    130  133  133     58  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A    130  133  133     59  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    95_A     Q    95_A    130  133  133     49  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A    130  133  133     45  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M    97_A     M    97_A    130  133  133     48  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    98_A     A    98_A    130  133  133     34  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    99_A     E    99_A    130  133  133     41  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    130  133  133     13   95  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C   101_A     C   101_A    130  133  133     13  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    130  133  133      9  102  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   103_A     P   103_A    130  133  133     40  106  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   104_A     D   104_A    130  133  133     16   97  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M   105_A     M   105_A    130  133  133     24  106  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   106_A     P   106_A    130  133  133     56  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   107_A     V   107_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   108_A     T   108_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   109_A     L   109_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   110_A     V   110_A    130  133  133     26  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   111_A     G   111_A    130  133  133     11  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   112_A     D   112_A    130  133  133      3    4  118  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A    130  133  133      3   90  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   114_A     G   114_A    130  133  133      3  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   115_A     V   115_A    130  133  133     40  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   116_A     T   116_A    130  133  133     49  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   117_A     K   117_A    130  133  133     64  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   118_A     A   118_A    130  133  133     39  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   119_A     T   119_A    130  133  133     27  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   120_A     T   120_A    130  133  133      9  106  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   121_A     V   121_A    130  133  133     56  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R   122_A     R   122_A    130  133  133     56  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   123_A     E   123_A    130  133  133     56  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A    130  133  133     40  106  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A    130  133  133     66  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   126_A     P   126_A    130  133  133     65  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y   127_A     Y   127_A    130  133  133     51  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   128_A     A   128_A    130  133  133     48  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   129_A     F   129_A    130  133  133     48  106  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   130_A     T   130_A    130  133  133     48  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   131_A     E   131_A    130  133  133     62  107  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A    130  133  133     23  103  122  127  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   133_A     D   133_A    130  133  133      3    3    5   69  126  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   134_A     L   134_A    130  133  133      3   77  104  126  128  129  129  129  130  130  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  98.53  (  95.59  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     66    107    122    127    128    129    129    129    130    130    131    132    132    133    133    133    133    133    133    133 
GDT PERCENT_AT  49.62  80.45  91.73  95.49  96.24  96.99  96.99  96.99  97.74  97.74  98.50  99.25  99.25 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.32   0.54   0.67   0.75   0.79   0.85   0.85   0.85   0.99   0.99   1.22   1.46   1.46   1.67   1.67   1.67   1.67   1.67   1.67   1.67
GDT RMS_ALL_AT   1.75   1.76   1.75   1.75   1.74   1.74   1.74   1.74   1.72   1.72   1.69   1.68   1.68   1.67   1.67   1.67   1.67   1.67   1.67   1.67

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  Y    25_A      Y    25_A
#   possible swapping detected:  E    48_A      E    48_A
#   possible swapping detected:  F    52_A      F    52_A
#   possible swapping detected:  F    64_A      F    64_A
#   possible swapping detected:  F    74_A      F    74_A
#   possible swapping detected:  D   112_A      D   112_A
#   possible swapping detected:  E   131_A      E   131_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S     2_A      S     2_A    10.024     0    0.055   0.586    14.561    2.500    1.667
LGA    M     3_A      M     3_A    10.130     0    0.266   0.365    14.132    1.190    0.595
LGA    A     4_A      A     4_A     8.411     0    0.353   0.362     9.048    9.167    7.905
LGA    E     5_A      E     5_A     6.026     0    0.592   0.695    13.916   23.452   11.217
LGA    L     6_A      L     6_A     1.698     0    0.605   0.639     5.868   77.143   56.190
LGA    K     7_A      K     7_A     1.257     0    0.032   0.546     1.630   83.690   80.529
LGA    Q     8_A      Q     8_A     1.105     0    0.032   1.116     3.545   85.952   74.762
LGA    E     9_A      E     9_A     0.991     0    0.039   1.026     5.147   88.214   66.349
LGA    W    10_A      W    10_A     0.525     0    0.031   0.160     0.872   95.238   91.837
LGA    I    11_A      I    11_A     0.166     0    0.059   0.066     0.968  100.000   97.619
LGA    N    12_A      N    12_A     0.146     0    0.029   0.043     0.385  100.000  100.000
LGA    T    13_A      T    13_A     0.579     0    0.027   0.141     1.163   92.857   90.544
LGA    A    14_A      A    14_A     0.393     0    0.025   0.026     0.724   95.238   96.190
LGA    I    15_A      I    15_A     0.710     0    0.060   0.081     1.121   90.595   88.274
LGA    E    16_A      E    16_A     1.066     0    0.000   0.206     1.593   81.548   85.503
LGA    A    17_A      A    17_A     1.661     0    0.195   0.197     1.990   75.000   74.571
LGA    L    18_A      L    18_A     1.809     0    0.080   1.179     3.102   72.857   70.000
LGA    D    19_A      D    19_A     1.224     0    0.014   0.119     1.705   83.690   81.488
LGA    K    20_A      K    20_A     1.020     0    0.006   0.170     1.775   85.952   81.534
LGA    A    21_A      A    21_A     0.329     0    0.114   0.114     0.667   97.619   98.095
LGA    Y    22_A      Y    22_A     0.200     0    0.014   0.141     0.863  100.000   96.825
LGA    V    23_A      V    23_A     0.050     0    0.107   1.186     2.442   97.619   88.571
LGA    P    24_A      P    24_A     0.491     0    0.041   0.041     0.768   95.238   94.558
LGA    Y    25_A      Y    25_A     0.285     0    0.021   0.167     0.945  100.000   96.825
LGA    S    26_A      S    26_A     0.271     0    0.017   0.095     0.632  100.000   98.413
LGA    H    27_A      H    27_A     0.368     0    0.073   0.334     2.509  100.000   84.000
LGA    F    28_A      F    28_A     0.241     0    0.020   0.137     1.132  100.000   93.160
LGA    P    29_A      P    29_A     0.504     0    0.019   0.072     0.717   92.857   93.197
LGA    V    30_A      V    30_A     0.453     0    0.019   0.057     0.589  100.000   97.279
LGA    G    31_A      G    31_A     0.379     0    0.019   0.019     0.473  100.000  100.000
LGA    A    32_A      A    32_A     0.170     0    0.017   0.028     0.272  100.000  100.000
LGA    C    33_A      C    33_A     0.218     0    0.062   0.137     0.403  100.000  100.000
LGA    L    34_A      L    34_A     0.482     0    0.023   0.062     0.857   97.619   94.048
LGA    V    35_A      V    35_A     0.605     0    0.025   1.114     2.934   90.476   83.197
LGA    T    36_A      T    36_A     0.456     0    0.014   0.089     0.612  100.000   95.918
LGA    E    37_A      E    37_A     0.555     0    0.089   0.635     2.759   92.857   86.825
LGA    S    38_A      S    38_A     0.627     0    0.078   0.144     0.837   90.476   90.476
LGA    G    39_A      G    39_A     0.286     0    0.142   0.142     0.660   97.619   97.619
LGA    K    40_A      K    40_A     0.311     0    0.024   0.139     0.419  100.000  100.000
LGA    I    41_A      I    41_A     0.568     0    0.081   1.475     3.579   97.619   80.774
LGA    Y    42_A      Y    42_A     0.298     0    0.037   0.092     0.359  100.000  100.000
LGA    Q    43_A      Q    43_A     0.313     0    0.020   0.482     2.015  100.000   87.989
LGA    G    44_A      G    44_A     0.368     0    0.021   0.021     0.406  100.000  100.000
LGA    I    45_A      I    45_A     0.168     0    0.038   0.416     0.948  100.000   96.429
LGA    N    46_A      N    46_A     0.224     0    0.057   0.213     1.028  100.000   97.679
LGA    I    47_A      I    47_A     0.178     0    0.050   0.079     0.383  100.000  100.000
LGA    E    48_A      E    48_A     0.148     0    0.040   0.153     0.596  100.000   98.942
LGA    N    49_A      N    49_A     0.436     0    0.041   0.111     0.547  100.000   98.810
LGA    A    50_A      A    50_A     0.691     0    0.018   0.027     0.764   90.476   90.476
LGA    S    51_A      S    51_A     0.342     0    0.046   0.055     0.471  100.000  100.000
LGA    F    52_A      F    52_A     0.416     0    0.027   1.130     6.459   97.619   63.810
LGA    G    53_A      G    53_A     0.334     0    0.014   0.014     0.373  100.000  100.000
LGA    L    54_A      L    54_A     0.289     0    0.003   0.104     0.840  100.000   97.619
LGA    T    55_A      T    55_A     0.386     0    0.083   0.091     0.628   97.619   98.639
LGA    N    56_A      N    56_A     0.294     0    0.043   0.089     0.510  100.000   98.810
LGA    C    57_A      C    57_A     0.283     0    0.033   0.070     0.459  100.000  100.000
LGA    A    58_A      A    58_A     0.203     0    0.032   0.031     0.270  100.000  100.000
LGA    E    59_A      E    59_A     0.223     0    0.044   0.073     0.285  100.000  100.000
LGA    R    60_A      R    60_A     0.170     0    0.045   0.982     2.774  100.000   90.346
LGA    T    61_A      T    61_A     0.255     0    0.041   0.062     0.386  100.000  100.000
LGA    A    62_A      A    62_A     0.372     0    0.018   0.017     0.445  100.000  100.000
LGA    F    63_A      F    63_A     0.486     0    0.038   0.154     1.043   97.619   92.294
LGA    F    64_A      F    64_A     0.444     0    0.025   0.074     0.506  100.000   99.134
LGA    K    65_A      K    65_A     0.282     0    0.053   0.085     0.370  100.000  100.000
LGA    A    66_A      A    66_A     0.286     0    0.030   0.030     0.385  100.000  100.000
LGA    V    67_A      V    67_A     0.353     0    0.032   0.082     0.515  100.000   98.639
LGA    S    68_A      S    68_A     0.222     0    0.049   0.141     0.591  100.000   98.413
LGA    E    69_A      E    69_A     0.162     0    0.063   0.117     0.501   97.619   98.942
LGA    G    70_A      G    70_A     0.503     0    0.075   0.075     0.641   92.857   92.857
LGA    E    71_A      E    71_A     0.998     0    0.054   0.367     2.435   83.810   78.730
LGA    R    72_A      R    72_A     1.016     0    0.035   1.033     2.645   88.214   81.818
LGA    S    73_A      S    73_A     0.574     0    0.042   0.652     2.343   90.476   86.190
LGA    F    74_A      F    74_A     0.698     0    0.024   0.194     0.821   90.476   91.342
LGA    T    75_A      T    75_A     0.545     0    0.077   0.167     0.883   90.476   90.476
LGA    H    76_A      H    76_A     0.309     0    0.023   0.184     0.456  100.000  100.000
LGA    L    77_A      L    77_A     0.367     0    0.021   0.054     0.458  100.000  100.000
LGA    V    78_A      V    78_A     0.249     0    0.013   0.168     0.563  100.000   98.639
LGA    V    79_A      V    79_A     0.361     0    0.021   0.038     0.502  100.000   98.639
LGA    A    80_A      A    80_A     0.263     0    0.014   0.018     0.483  100.000  100.000
LGA    G    81_A      G    81_A     0.584     0    0.033   0.033     1.053   90.595   90.595
LGA    H    82_A      H    82_A     0.788     0    0.038   0.249     1.362   90.476   87.762
LGA    T    83_A      T    83_A     1.366     0    0.067   0.161     1.528   79.286   80.204
LGA    P    84_A      P    84_A     2.080     0    0.040   0.417     2.723   72.976   68.367
LGA    D    85_A      D    85_A     0.580     0    0.114   0.983     4.386   92.976   75.000
LGA    P    86_A      P    86_A     0.498     0    0.051   0.080     0.785   95.238   93.197
LGA    I    87_A      I    87_A     0.295     0    0.070   0.112     0.699  100.000   98.810
LGA    S    88_A      S    88_A     0.320     0    0.051   0.072     0.646   97.619   96.825
LGA    P    89_A      P    89_A     0.343     0    0.034   0.066     0.364  100.000  100.000
LGA    C    90_A      C    90_A     0.499     0    0.051   0.086     0.642   95.238   96.825
LGA    G    91_A      G    91_A     0.704     0    0.050   0.050     0.704   90.476   90.476
LGA    A    92_A      A    92_A     0.519     0    0.025   0.024     0.561   90.476   90.476
LGA    C    93_A      C    93_A     0.569     0    0.034   0.112     0.648   90.476   92.063
LGA    R    94_A      R    94_A     0.550     0    0.043   0.169     0.671   90.476   93.939
LGA    Q    95_A      Q    95_A     0.676     0    0.065   0.103     0.797   90.476   90.476
LGA    V    96_A      V    96_A     0.698     0    0.052   0.051     0.818   90.476   90.476
LGA    M    97_A      M    97_A     0.697     0    0.019   0.714     2.842   90.476   86.310
LGA    A    98_A      A    98_A     0.807     0    0.027   0.025     0.969   90.476   90.476
LGA    E    99_A      E    99_A     0.728     0    0.068   0.152     1.142   90.476   85.450
LGA    F   100_A      F   100_A     1.315     0    0.027   0.125     1.740   79.286   75.195
LGA    C   101_A      C   101_A     1.043     0    0.054   0.167     1.160   83.690   85.952
LGA    A   102_A      A   102_A     1.397     0    0.019   0.022     1.898   81.429   79.714
LGA    P   103_A      P   103_A     1.178     0    0.066   0.133     1.286   81.429   81.429
LGA    D   104_A      D   104_A     1.717     0    0.020   1.271     2.705   72.857   73.155
LGA    M   105_A      M   105_A     1.197     0    0.020   0.618     1.997   85.952   83.750
LGA    P   106_A      P   106_A     0.634     0    0.081   0.179     0.826   92.857   93.197
LGA    V   107_A      V   107_A     0.429     0    0.033   0.038     0.499  100.000  100.000
LGA    T   108_A      T   108_A     0.272     0    0.038   0.178     0.609  100.000   98.639
LGA    L   109_A      L   109_A     0.319     0    0.025   0.074     0.660   97.619   96.429
LGA    V   110_A      V   110_A     0.674     0    0.123   0.907     2.964   97.619   88.503
LGA    G   111_A      G   111_A     0.787     0    0.035   0.035     1.380   88.333   88.333
LGA    D   112_A      D   112_A     1.954     0    0.668   1.158     3.782   65.476   70.595
LGA    N   113_A      N   113_A     1.495     0    0.082   1.121     6.498   81.429   57.560
LGA    G   114_A      G   114_A     1.096     0    0.017   0.017     1.339   81.429   81.429
LGA    V   115_A      V   115_A     1.080     0    0.031   0.074     1.692   85.952   82.789
LGA    T   116_A      T   116_A     0.711     0    0.136   1.094     2.767   88.214   83.129
LGA    K   117_A      K   117_A     0.600     0    0.018   0.667     2.336   92.857   87.672
LGA    A   118_A      A   118_A     0.819     0    0.069   0.075     1.180   90.476   88.667
LGA    T   119_A      T   119_A     0.852     0    0.133   0.197     1.295   88.214   85.306
LGA    T   120_A      T   120_A     1.161     0    0.034   0.109     1.465   85.952   84.014
LGA    V   121_A      V   121_A     0.791     0    0.033   0.067     0.882   90.476   90.476
LGA    R   122_A      R   122_A     0.917     0    0.026   1.195     4.347   90.476   78.615
LGA    E   123_A      E   123_A     0.889     0    0.060   0.545     2.748   90.476   83.757
LGA    L   124_A      L   124_A     1.143     0    0.063   1.376     4.177   88.214   78.214
LGA    L   125_A      L   125_A     0.318     0    0.039   0.076     1.338   97.619   92.976
LGA    P   126_A      P   126_A     0.796     0    0.084   0.118     1.453   90.476   86.599
LGA    Y   127_A      Y   127_A     0.899     0    0.044   1.286     8.358   95.238   56.706
LGA    A   128_A      A   128_A     0.891     0    0.043   0.054     1.354   90.476   88.667
LGA    F   129_A      F   129_A     0.945     0    0.030   0.096     1.638   88.214   82.338
LGA    T   130_A      T   130_A     0.816     0    0.020   0.193     1.324   92.857   89.252
LGA    E   131_A      E   131_A     0.442     0    0.124   1.075     3.858   90.595   75.873
LGA    K   132_A      K   132_A     1.189     0    0.048   0.617     4.967   73.452   59.683
LGA    D   133_A      D   133_A     3.494     0    0.091   0.173     5.451   50.119   40.952
LGA    L   134_A      L   134_A     2.606     0    0.064   0.954     3.841   55.357   59.405

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      133     532    532  100.00    1010   1010  100.00               133
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.670          1.585                  2.114           89.815   86.308

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  134  133    4.0    129    0.85    93.233    96.445    13.604

LGA_LOCAL      RMSD:   0.848  Number of atoms:  129  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.741  Number of assigned atoms:  133 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.670  Standard rmsd on all 133 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.334691 * X  +  -0.806964 * Y  +   0.486611 * Z  +  -4.674945
  Y_new =   0.176037 * X  +  -0.453760 * Y  +  -0.873563 * Z  + 109.296516
  Z_new =   0.925739 * X  +   0.378035 * Y  +  -0.009814 * Z  + -48.228092 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  0.484206 -1.182986  1.596750   [DEG:   27.7430  -67.7801   91.4870 ]
ZXZ:  0.508234  1.580610  1.183104   [DEG:   29.1196   90.5623   67.7868 ]
 
# END of job
