
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  134 ( 1014),  selected  133 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  133 ( 1010),  selected  133 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.95     0.95
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.95     0.95
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.95     0.95
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  133
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S     2_A     S     2_A    133  133  133      0    3    3    3    3    6   45   52   67  128  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M     3_A     M     3_A    133  133  133      3  101  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A     4_A     A     4_A    133  133  133      4   33  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     5_A     E     5_A    133  133  133     13  101  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L     6_A     L     6_A    133  133  133     18  114  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K     7_A     K     7_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q     8_A     Q     8_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     9_A     E     9_A    133  133  133     70  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     W    10_A     W    10_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    11_A     I    11_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    12_A     N    12_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    13_A     T    13_A    133  133  133     72  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    15_A     I    15_A    133  133  133     50  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    16_A     E    16_A    133  133  133     20  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    17_A     A    17_A    133  133  133      6   96  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    18_A     L    18_A    133  133  133      6   63  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    19_A     D    19_A    133  133  133     25  116  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    20_A     K    20_A    133  133  133     21  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    21_A     A    21_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    22_A     Y    22_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    24_A     P    24_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    25_A     Y    25_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    26_A     S    26_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    27_A     H    27_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    28_A     F    28_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    29_A     P    29_A    133  133  133     79  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    30_A     V    30_A    133  133  133     72  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    31_A     G    31_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    32_A     A    32_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    33_A     C    33_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    34_A     L    34_A    133  133  133     16  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    35_A     V    35_A    133  133  133     16  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    36_A     T    36_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    37_A     E    37_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    38_A     S    38_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    39_A     G    39_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    40_A     K    40_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A    133  133  133     66  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    42_A     Y    42_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    43_A     Q    43_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    44_A     G    44_A    133  133  133     70  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    45_A     I    45_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    46_A     N    46_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    47_A     I    47_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    48_A     E    48_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    49_A     N    49_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    50_A     A    50_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    52_A     F    52_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    53_A     G    53_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    54_A     L    54_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    55_A     T    55_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    56_A     N    56_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    57_A     C    57_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    58_A     A    58_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    59_A     E    59_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    60_A     R    60_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    61_A     T    61_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    62_A     A    62_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    63_A     F    63_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    64_A     F    64_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    65_A     K    65_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    66_A     A    66_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    67_A     V    67_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    68_A     S    68_A    133  133  133     66  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    69_A     E    69_A    133  133  133     48  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    70_A     G    70_A    133  133  133     48  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    71_A     E    71_A    133  133  133     29  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A    133  133  133     48  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    73_A     S    73_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    74_A     F    74_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    75_A     T    75_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    76_A     H    76_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    77_A     L    77_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    78_A     V    78_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    79_A     V    79_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    80_A     A    80_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    81_A     G    81_A    133  133  133     72  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    82_A     H    82_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    83_A     T    83_A    133  133  133     39  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    84_A     P    84_A    133  133  133     39  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    85_A     D    85_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    86_A     P    86_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    87_A     I    87_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    88_A     S    88_A    133  133  133     37  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    89_A     P    89_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    90_A     C    90_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    91_A     G    91_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    92_A     A    92_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    93_A     C    93_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    95_A     Q    95_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M    97_A     M    97_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    98_A     A    98_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    99_A     E    99_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    133  133  133     65  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C   101_A     C   101_A    133  133  133     70  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    133  133  133     39  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   103_A     P   103_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   104_A     D   104_A    133  133  133     37  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M   105_A     M   105_A    133  133  133     18  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   106_A     P   106_A    133  133  133     18  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   107_A     V   107_A    133  133  133     71  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   108_A     T   108_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   109_A     L   109_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   110_A     V   110_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   111_A     G   111_A    133  133  133     72  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   112_A     D   112_A    133  133  133      3   59  126  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A    133  133  133      3  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   114_A     G   114_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   115_A     V   115_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   116_A     T   116_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   117_A     K   117_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   118_A     A   118_A    133  133  133     58  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   119_A     T   119_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   120_A     T   120_A    133  133  133     63  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   121_A     V   121_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R   122_A     R   122_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   123_A     E   123_A    133  133  133     81  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A    133  133  133     81  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   126_A     P   126_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y   127_A     Y   127_A    133  133  133     84  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   128_A     A   128_A    133  133  133     72  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   129_A     F   129_A    133  133  133     56  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   130_A     T   130_A    133  133  133     56  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   131_A     E   131_A    133  133  133     72  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A    133  133  133     13  101  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   133_A     D   133_A    133  133  133      3    3    5  108  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   134_A     L   134_A    133  133  133     12   46  123  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     84    117    129    131    132    132    132    132    132    132    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133 
GDT PERCENT_AT  63.16  87.97  96.99  98.50  99.25  99.25  99.25  99.25  99.25  99.25 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.34   0.49   0.64   0.69   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95
GDT RMS_ALL_AT   0.99   0.98   0.96   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E     5_A      E     5_A
#   possible swapping detected:  E    37_A      E    37_A
#   possible swapping detected:  Y    42_A      Y    42_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S     2_A      S     2_A     6.910     0    0.064   0.075     8.731   21.667   15.714
LGA    M     3_A      M     3_A     1.500     0    0.631   1.279     6.165   73.214   49.345
LGA    A     4_A      A     4_A     1.582     0    0.036   0.039     2.062   77.143   74.667
LGA    E     5_A      E     5_A     1.495     0    0.076   0.864     6.133   81.429   56.138
LGA    L     6_A      L     6_A     1.172     0    0.079   0.494     3.618   83.690   69.762
LGA    K     7_A      K     7_A     0.690     0    0.048   0.923     1.677   95.238   87.672
LGA    Q     8_A      Q     8_A     0.403     0    0.023   1.303     5.193  100.000   77.143
LGA    E     9_A      E     9_A     0.611     0    0.033   0.825     2.470   90.476   80.847
LGA    W    10_A      W    10_A     0.593     0    0.041   1.422     6.663   95.238   66.905
LGA    I    11_A      I    11_A     0.245     0    0.025   0.096     0.660  100.000   97.619
LGA    N    12_A      N    12_A     0.180     0    1.006   0.947     3.724   81.190   90.595
LGA    T    13_A      T    13_A     0.468     0    0.056   1.160     3.055   97.619   86.463
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LGA    C   101_A      C   101_A     0.624     0    0.645   0.721     2.844   84.524   88.095
LGA    A   102_A      A   102_A     0.959     0    0.044   0.099     1.262   88.214   86.857
LGA    P   103_A      P   103_A     0.315     0    0.056   0.309     1.084   97.619   95.986
LGA    D   104_A      D   104_A     1.128     0    0.030   1.257     3.241   83.690   77.560
LGA    M   105_A      M   105_A     1.003     0    0.055   0.824     2.777   88.214   81.845
LGA    P   106_A      P   106_A     0.862     0    0.039   0.245     1.059   88.214   90.544
LGA    V   107_A      V   107_A     0.598     0    0.085   1.209     2.864   90.476   82.041
LGA    T   108_A      T   108_A     0.308     0    0.050   0.907     2.308  100.000   89.932
LGA    L   109_A      L   109_A     0.393     0    0.023   1.276     3.139   95.238   86.964
LGA    V   110_A      V   110_A     0.657     0    0.119   1.192     2.903   97.619   85.986
LGA    G   111_A      G   111_A     0.514     0    0.060   0.060     1.034   90.595   90.595
LGA    D   112_A      D   112_A     1.966     0    0.679   1.323     3.912   65.476   69.464
LGA    N   113_A      N   113_A     1.225     0    0.055   1.054     5.635   85.952   63.452
LGA    G   114_A      G   114_A     0.843     0    0.058   0.058     0.924   90.476   90.476
LGA    V   115_A      V   115_A     0.812     0    0.026   1.100     3.421   90.476   81.020
LGA    T   116_A      T   116_A     0.571     0    0.061   1.174     3.175   90.476   81.020
LGA    K   117_A      K   117_A     0.494     0    0.019   0.856     2.759  100.000   91.058
LGA    A   118_A      A   118_A     0.709     0    0.045   0.057     1.249   90.476   88.667
LGA    T   119_A      T   119_A     0.558     0    0.125   0.277     1.277   88.214   89.184
LGA    T   120_A      T   120_A     0.690     0    0.030   0.071     1.000   90.476   89.184
LGA    V   121_A      V   121_A     0.142     0    0.027   0.076     0.599  100.000   98.639
LGA    R   122_A      R   122_A     0.499     0    0.020   0.553     2.103   95.238   86.797
LGA    E   123_A      E   123_A     0.673     0    0.023   0.420     1.646   90.476   88.519
LGA    L   124_A      L   124_A     0.581     0    0.028   0.136     0.843   95.238   92.857
LGA    L   125_A      L   125_A     0.474     0    0.027   0.074     0.507   97.619   98.810
LGA    P   126_A      P   126_A     0.483     0    0.026   0.047     0.631   95.238   93.197
LGA    Y   127_A      Y   127_A     0.401     0    0.041   0.173     1.175  100.000   92.143
LGA    A   128_A      A   128_A     0.532     0    0.027   0.033     0.628   92.857   92.381
LGA    F   129_A      F   129_A     0.770     0    0.052   0.136     1.274   90.476   88.009
LGA    T   130_A      T   130_A     0.779     0    0.046   1.065     2.963   95.238   85.918
LGA    E   131_A      E   131_A     0.498     0    0.107   0.749     2.221   92.976   84.762
LGA    K   132_A      K   132_A     1.250     0    0.031   0.878     6.029   73.452   62.063
LGA    D   133_A      D   133_A     3.093     0    0.157   0.413     5.633   57.262   45.298
LGA    L   134_A      L   134_A     2.097     0    0.537   0.904     2.905   64.881   66.964

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      133     532    532  100.00    1010   1010  100.00               133
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.947          0.953                  1.511           92.831   88.111

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  134  133    4.0    132    0.74    96.429    98.473    15.713

LGA_LOCAL      RMSD:   0.740  Number of atoms:  132  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.950  Number of assigned atoms:  133 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.947  Standard rmsd on all 133 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.731409 * X  +  -0.326595 * Y  +  -0.598645 * Z  + -10.616142
  Y_new =  -0.427594 * X  +  -0.903489 * Y  +  -0.029519 * Z  +  56.131245
  Z_new =  -0.531228 * X  +   0.277568 * Y  +  -0.800470 * Z  +   6.670669 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -0.529032  0.560050  2.807811   [DEG:  -30.3113   32.0885  160.8757 ]
ZXZ: -1.521527  2.498876 -1.089310   [DEG:  -87.1770  143.1750  -62.4129 ]
 
# END of job
