
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  134 ( 1014),  selected  133 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  133 ( 1010),  selected  133 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.96     0.96
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.96     0.96
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.96     0.96
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  133
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S     2_A     S     2_A    133  133  133      0    3    3    3    3    6   42   52   90  125  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M     3_A     M     3_A    133  133  133      3   79  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A     4_A     A     4_A    133  133  133      4   69  125  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     5_A     E     5_A    133  133  133     13  103  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L     6_A     L     6_A    133  133  133     24  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K     7_A     K     7_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q     8_A     Q     8_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     9_A     E     9_A    133  133  133     72  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     W    10_A     W    10_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    11_A     I    11_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    12_A     N    12_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    13_A     T    13_A    133  133  133     73  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    15_A     I    15_A    133  133  133     63  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    16_A     E    16_A    133  133  133     25  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    17_A     A    17_A    133  133  133      6   95  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    18_A     L    18_A    133  133  133      6   62  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    19_A     D    19_A    133  133  133      6  116  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    20_A     K    20_A    133  133  133     25  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    21_A     A    21_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    22_A     Y    22_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    24_A     P    24_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    25_A     Y    25_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    26_A     S    26_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    27_A     H    27_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    28_A     F    28_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    29_A     P    29_A    133  133  133     73  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    30_A     V    30_A    133  133  133     73  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    31_A     G    31_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    32_A     A    32_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    33_A     C    33_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    34_A     L    34_A    133  133  133     16  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    35_A     V    35_A    133  133  133     16  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    36_A     T    36_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    37_A     E    37_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    38_A     S    38_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    39_A     G    39_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    40_A     K    40_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A    133  133  133     50  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    42_A     Y    42_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    43_A     Q    43_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    44_A     G    44_A    133  133  133     71  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    45_A     I    45_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    46_A     N    46_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    47_A     I    47_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    48_A     E    48_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    49_A     N    49_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    50_A     A    50_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    52_A     F    52_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    53_A     G    53_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    54_A     L    54_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    55_A     T    55_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    56_A     N    56_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    57_A     C    57_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    58_A     A    58_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    59_A     E    59_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    60_A     R    60_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    61_A     T    61_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    62_A     A    62_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    63_A     F    63_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    64_A     F    64_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    65_A     K    65_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    66_A     A    66_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    67_A     V    67_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    68_A     S    68_A    133  133  133     60  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    69_A     E    69_A    133  133  133     50  117  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    70_A     G    70_A    133  133  133     50  117  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    71_A     E    71_A    133  133  133     50  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A    133  133  133     50  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    73_A     S    73_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    74_A     F    74_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    75_A     T    75_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    76_A     H    76_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    77_A     L    77_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    78_A     V    78_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    79_A     V    79_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    80_A     A    80_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    81_A     G    81_A    133  133  133     71  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    82_A     H    82_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    83_A     T    83_A    133  133  133     45  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    84_A     P    84_A    133  133  133     45  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    85_A     D    85_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    86_A     P    86_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    87_A     I    87_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    88_A     S    88_A    133  133  133     29  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    89_A     P    89_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    90_A     C    90_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    91_A     G    91_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    92_A     A    92_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    93_A     C    93_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    95_A     Q    95_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M    97_A     M    97_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    98_A     A    98_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    99_A     E    99_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    133  133  133     63  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C   101_A     C   101_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    133  133  133     55  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   103_A     P   103_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   104_A     D   104_A    133  133  133     30  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M   105_A     M   105_A    133  133  133     17  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   106_A     P   106_A    133  133  133     17  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   107_A     V   107_A    133  133  133     71  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   108_A     T   108_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   109_A     L   109_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   110_A     V   110_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   111_A     G   111_A    133  133  133     71  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   112_A     D   112_A    133  133  133      3   35  110  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A    133  133  133      3  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   114_A     G   114_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   115_A     V   115_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   116_A     T   116_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   117_A     K   117_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   118_A     A   118_A    133  133  133     56  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   119_A     T   119_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   120_A     T   120_A    133  133  133     50  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   121_A     V   121_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R   122_A     R   122_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   123_A     E   123_A    133  133  133     80  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   126_A     P   126_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y   127_A     Y   127_A    133  133  133     82  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   128_A     A   128_A    133  133  133     72  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   129_A     F   129_A    133  133  133     53  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   130_A     T   130_A    133  133  133     53  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   131_A     E   131_A    133  133  133     70  118  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A    133  133  133     13  103  128  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   133_A     D   133_A    133  133  133      3    3    5  107  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   134_A     L   134_A    133  133  133      3   37  110  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     82    118    128    131    132    132    132    132    132    132    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133 
GDT PERCENT_AT  61.65  88.72  96.24  98.50  99.25  99.25  99.25  99.25  99.25  99.25 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.33   0.51   0.63   0.70   0.75   0.75   0.75   0.75   0.75   0.75   0.96   0.96   0.96   0.96   0.96   0.96   0.96   0.96   0.96   0.96
GDT RMS_ALL_AT   1.00   0.97   0.97   0.96   0.96   0.96   0.96   0.96   0.96   0.96   0.96   0.96   0.96   0.96   0.96   0.96   0.96   0.96   0.96   0.96

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    16_A      E    16_A
#   possible swapping detected:  Y    42_A      Y    42_A
#   possible swapping detected:  E   131_A      E   131_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S     2_A      S     2_A     6.970     0    0.066   0.673     9.714   21.190   14.683
LGA    M     3_A      M     3_A     1.575     0    0.622   1.442     4.990   73.214   59.524
LGA    A     4_A      A     4_A     1.666     0    0.034   0.035     2.147   77.143   74.667
LGA    E     5_A      E     5_A     1.546     0    0.088   0.720     6.696   77.143   54.127
LGA    L     6_A      L     6_A     1.095     0    0.062   0.974     3.292   83.690   73.512
LGA    K     7_A      K     7_A     0.667     0    0.041   0.893     1.761   92.857   84.656
LGA    Q     8_A      Q     8_A     0.441     0    0.030   1.556     6.552  100.000   71.958
LGA    E     9_A      E     9_A     0.615     0    0.027   0.867     2.447   92.857   81.905
LGA    W    10_A      W    10_A     0.582     0    0.029   1.248     5.087   95.238   66.224
LGA    I    11_A      I    11_A     0.216     0    0.013   0.079     0.611  100.000   97.619
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LGA    T    13_A      T    13_A     0.446     0    0.019   0.987     2.640   97.619   87.279
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LGA    C   101_A      C   101_A     0.576     0    0.119   0.100     0.877   90.476   93.651
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LGA    P   103_A      P   103_A     0.298     0    0.050   0.120     0.499  100.000  100.000
LGA    D   104_A      D   104_A     1.085     0    0.040   1.255     3.384   83.690   78.631
LGA    M   105_A      M   105_A     0.977     0    0.054   0.851     2.295   90.476   83.929
LGA    P   106_A      P   106_A     0.858     0    0.037   0.250     1.068   88.214   90.544
LGA    V   107_A      V   107_A     0.610     0    0.076   0.105     0.718   90.476   90.476
LGA    T   108_A      T   108_A     0.293     0    0.045   0.132     0.461  100.000  100.000
LGA    L   109_A      L   109_A     0.411     0    0.035   0.114     0.745   95.238   96.429
LGA    V   110_A      V   110_A     0.664     0    0.123   0.229     1.834   97.619   89.456
LGA    G   111_A      G   111_A     0.501     0    0.057   0.057     1.016   90.595   90.595
LGA    D   112_A      D   112_A     1.940     0    0.678   1.323     3.887   67.619   70.536
LGA    N   113_A      N   113_A     1.243     0    0.057   1.043     5.635   85.952   63.452
LGA    G   114_A      G   114_A     0.862     0    0.061   0.061     0.930   90.476   90.476
LGA    V   115_A      V   115_A     0.830     0    0.027   0.156     1.318   90.476   89.184
LGA    T   116_A      T   116_A     0.570     0    0.064   0.087     0.812   90.476   90.476
LGA    K   117_A      K   117_A     0.501     0    0.019   0.606     1.426   97.619   90.635
LGA    A   118_A      A   118_A     0.716     0    0.041   0.052     1.251   90.476   88.667
LGA    T   119_A      T   119_A     0.562     0    0.122   0.273     1.319   88.214   87.891
LGA    T   120_A      T   120_A     0.676     0    0.028   0.070     0.974   90.476   90.476
LGA    V   121_A      V   121_A     0.146     0    0.032   0.074     0.534  100.000   98.639
LGA    R   122_A      R   122_A     0.490     0    0.027   1.163     4.030   95.238   76.407
LGA    E   123_A      E   123_A     0.665     0    0.020   0.266     1.393   90.476   89.471
LGA    L   124_A      L   124_A     0.568     0    0.026   0.141     0.818   95.238   94.048
LGA    L   125_A      L   125_A     0.474     0    0.032   0.074     0.511   97.619   98.810
LGA    P   126_A      P   126_A     0.480     0    0.027   0.048     0.622   95.238   93.197
LGA    Y   127_A      Y   127_A     0.395     0    0.048   1.012     7.079   97.619   63.333
LGA    A   128_A      A   128_A     0.529     0    0.029   0.032     0.627   92.857   92.381
LGA    F   129_A      F   129_A     0.769     0    0.051   0.147     1.313   90.476   88.009
LGA    T   130_A      T   130_A     0.784     0    0.041   0.179     1.676   92.857   88.027
LGA    E   131_A      E   131_A     0.521     0    0.117   1.026     3.576   90.595   77.619
LGA    K   132_A      K   132_A     1.203     0    0.046   0.730     5.471   73.452   59.101
LGA    D   133_A      D   133_A     3.132     0    0.142   0.384     6.132   55.476   43.333
LGA    L   134_A      L   134_A     2.293     0    0.523   0.882     2.986   64.881   65.893

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      133     532    532  100.00    1010   1010  100.00               133
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.956          0.938                  1.509           92.965   88.318

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  134  133    4.0    132    0.75    96.617    98.476    15.575

LGA_LOCAL      RMSD:   0.748  Number of atoms:  132  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.959  Number of assigned atoms:  133 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.956  Standard rmsd on all 133 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.900853 * X  +  -0.166323 * Y  +  -0.401000 * Z  + -23.652130
  Y_new =  -0.296235 * X  +  -0.910739 * Y  +  -0.287749 * Z  +  61.891891
  Z_new =  -0.317347 * X  +   0.378009 * Y  +  -0.869712 * Z  +   3.457446 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -0.317700  0.322931  2.731587   [DEG:  -18.2029   18.5026  156.5084 ]
ZXZ: -0.948371  2.625416 -0.698379   [DEG:  -54.3376  150.4252  -40.0142 ]
 
# END of job
