
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  134 ( 1014),  selected  133 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  133 ( 1010),  selected  133 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.95     0.95
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.95     0.95
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.95     0.95
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  133
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S     2_A     S     2_A    133  133  133      0    3    3    3    3    6   42   51   90  125  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M     3_A     M     3_A    133  133  133      3   99  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A     4_A     A     4_A    133  133  133      4   99  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     5_A     E     5_A    133  133  133     34  105  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L     6_A     L     6_A    133  133  133     25  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K     7_A     K     7_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q     8_A     Q     8_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     9_A     E     9_A    133  133  133     72  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     W    10_A     W    10_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    11_A     I    11_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    12_A     N    12_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    13_A     T    13_A    133  133  133     76  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A    133  133  133     81  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    15_A     I    15_A    133  133  133     64  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    16_A     E    16_A    133  133  133     38  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    17_A     A    17_A    133  133  133      6   99  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    18_A     L    18_A    133  133  133      7   65  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    19_A     D    19_A    133  133  133     25  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    20_A     K    20_A    133  133  133     34  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    21_A     A    21_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    22_A     Y    22_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    24_A     P    24_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    25_A     Y    25_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    26_A     S    26_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    27_A     H    27_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    28_A     F    28_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    29_A     P    29_A    133  133  133     79  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    30_A     V    30_A    133  133  133     73  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    31_A     G    31_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    32_A     A    32_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    33_A     C    33_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    34_A     L    34_A    133  133  133     14  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    35_A     V    35_A    133  133  133     14  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    36_A     T    36_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    37_A     E    37_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    38_A     S    38_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    39_A     G    39_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    40_A     K    40_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A    133  133  133     49  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    42_A     Y    42_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    43_A     Q    43_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    44_A     G    44_A    133  133  133     71  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    45_A     I    45_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    46_A     N    46_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    47_A     I    47_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    48_A     E    48_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    49_A     N    49_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    50_A     A    50_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    52_A     F    52_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    53_A     G    53_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    54_A     L    54_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    55_A     T    55_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    56_A     N    56_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    57_A     C    57_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    58_A     A    58_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    59_A     E    59_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    60_A     R    60_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    61_A     T    61_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    62_A     A    62_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    63_A     F    63_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    64_A     F    64_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    65_A     K    65_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    66_A     A    66_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    67_A     V    67_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    68_A     S    68_A    133  133  133     59  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    69_A     E    69_A    133  133  133     49  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    70_A     G    70_A    133  133  133     49  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    71_A     E    71_A    133  133  133     49  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A    133  133  133     49  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    73_A     S    73_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    74_A     F    74_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    75_A     T    75_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    76_A     H    76_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    77_A     L    77_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    78_A     V    78_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    79_A     V    79_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    80_A     A    80_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    81_A     G    81_A    133  133  133     71  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    82_A     H    82_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    83_A     T    83_A    133  133  133     40  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    84_A     P    84_A    133  133  133     40  117  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    85_A     D    85_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    86_A     P    86_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    87_A     I    87_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    88_A     S    88_A    133  133  133     35  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    89_A     P    89_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    90_A     C    90_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    91_A     G    91_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    92_A     A    92_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    93_A     C    93_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    95_A     Q    95_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M    97_A     M    97_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    98_A     A    98_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    99_A     E    99_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    133  133  133     43  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C   101_A     C   101_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    133  133  133     58  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   103_A     P   103_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   104_A     D   104_A    133  133  133     35  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M   105_A     M   105_A    133  133  133     20  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   106_A     P   106_A    133  133  133     20  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   107_A     V   107_A    133  133  133     71  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   108_A     T   108_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   109_A     L   109_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   110_A     V   110_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   111_A     G   111_A    133  133  133     72  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   112_A     D   112_A    133  133  133      3   63  121  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A    133  133  133      3  110  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   114_A     G   114_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   115_A     V   115_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   116_A     T   116_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   117_A     K   117_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   118_A     A   118_A    133  133  133     58  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   119_A     T   119_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   120_A     T   120_A    133  133  133     38  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   121_A     V   121_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R   122_A     R   122_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   123_A     E   123_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   126_A     P   126_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y   127_A     Y   127_A    133  133  133     84  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   128_A     A   128_A    133  133  133     73  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   129_A     F   129_A    133  133  133     62  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   130_A     T   130_A    133  133  133     57  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   131_A     E   131_A    133  133  133     72  118  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A    133  133  133     43  115  129  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   133_A     D   133_A    133  133  133      3    3    5  108  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   134_A     L   134_A    133  133  133     17   36  123  131  132  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     84    118    129    131    132    132    132    132    132    132    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133 
GDT PERCENT_AT  63.16  88.72  96.99  98.50  99.25  99.25  99.25  99.25  99.25  99.25 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.33   0.51   0.64   0.69   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.74   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95
GDT RMS_ALL_AT   1.00   0.97   0.96   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E     5_A      E     5_A
#   possible swapping detected:  E    16_A      E    16_A
#   possible swapping detected:  D    19_A      D    19_A
#   possible swapping detected:  Y    42_A      Y    42_A
#   possible swapping detected:  F   100_A      F   100_A
#   possible swapping detected:  D   112_A      D   112_A
#   possible swapping detected:  E   131_A      E   131_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S     2_A      S     2_A     6.940     0    0.057   0.634     8.779   21.190   15.397
LGA    M     3_A      M     3_A     1.573     0    0.624   1.350     5.865   73.214   50.476
LGA    A     4_A      A     4_A     1.565     0    0.033   0.036     2.001   77.143   74.667
LGA    E     5_A      E     5_A     1.420     0    0.085   0.696     5.311   81.429   58.307
LGA    L     6_A      L     6_A     1.088     0    0.052   1.409     5.822   83.690   63.988
LGA    K     7_A      K     7_A     0.684     0    0.043   0.875     2.126   92.857   83.757
LGA    Q     8_A      Q     8_A     0.424     0    0.027   1.610     6.637  100.000   70.582
LGA    E     9_A      E     9_A     0.608     0    0.024   0.887     2.988   92.857   80.265
LGA    W    10_A      W    10_A     0.572     0    0.032   1.416     6.579   95.238   68.707
LGA    I    11_A      I    11_A     0.209     0    0.016   0.077     0.610  100.000   97.619
LGA    N    12_A      N    12_A     0.204     0    0.012   1.130     2.526  100.000   90.238
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LGA    F   100_A      F   100_A     0.628     0    0.035   0.529     2.098   90.476   84.156
LGA    C   101_A      C   101_A     0.547     0    0.130   0.109     0.831   90.476   93.651
LGA    A   102_A      A   102_A     0.821     0    0.081   0.128     1.212   90.476   88.667
LGA    P   103_A      P   103_A     0.307     0    0.055   0.121     0.521   97.619   98.639
LGA    D   104_A      D   104_A     1.087     0    0.038   1.240     3.489   83.690   77.560
LGA    M   105_A      M   105_A     0.964     0    0.053   0.643     1.777   90.476   87.143
LGA    P   106_A      P   106_A     0.842     0    0.040   0.250     1.047   88.214   90.544
LGA    V   107_A      V   107_A     0.592     0    0.077   0.103     0.705   90.476   90.476
LGA    T   108_A      T   108_A     0.293     0    0.047   0.189     0.580  100.000   98.639
LGA    L   109_A      L   109_A     0.405     0    0.033   0.112     0.732   95.238   96.429
LGA    V   110_A      V   110_A     0.657     0    0.125   1.025     2.997   97.619   87.211
LGA    G   111_A      G   111_A     0.494     0    0.061   0.061     1.001   92.976   92.976
LGA    D   112_A      D   112_A     2.005     0    0.684   1.198     3.919   63.452   68.393
LGA    N   113_A      N   113_A     1.259     0    0.062   0.888     5.732   85.952   67.262
LGA    G   114_A      G   114_A     0.823     0    0.049   0.049     0.893   90.476   90.476
LGA    V   115_A      V   115_A     0.809     0    0.033   1.150     2.995   90.476   80.952
LGA    T   116_A      T   116_A     0.546     0    0.062   1.092     2.944   90.476   83.401
LGA    K   117_A      K   117_A     0.485     0    0.017   0.399     1.422  100.000   91.693
LGA    A   118_A      A   118_A     0.705     0    0.041   0.053     1.260   90.476   88.667
LGA    T   119_A      T   119_A     0.553     0    0.123   0.269     1.293   88.214   87.891
LGA    T   120_A      T   120_A     0.684     0    0.025   0.063     0.974   90.476   90.476
LGA    V   121_A      V   121_A     0.142     0    0.032   0.058     0.430  100.000  100.000
LGA    R   122_A      R   122_A     0.499     0    0.025   0.620     2.487   95.238   86.797
LGA    E   123_A      E   123_A     0.664     0    0.022   0.268     1.382   90.476   89.471
LGA    L   124_A      L   124_A     0.577     0    0.028   0.140     0.826   95.238   94.048
LGA    L   125_A      L   125_A     0.471     0    0.030   0.075     0.508   97.619   98.810
LGA    P   126_A      P   126_A     0.472     0    0.027   0.048     0.626   95.238   93.197
LGA    Y   127_A      Y   127_A     0.384     0    0.043   1.402     8.394  100.000   61.786
LGA    A   128_A      A   128_A     0.479     0    0.026   0.029     0.559   95.238   94.286
LGA    F   129_A      F   129_A     0.749     0    0.054   0.145     1.357   90.476   88.009
LGA    T   130_A      T   130_A     0.767     0    0.042   1.053     3.103   95.238   83.742
LGA    E   131_A      E   131_A     0.464     0    0.119   1.172     5.074   92.976   74.286
LGA    K   132_A      K   132_A     1.210     0    0.031   0.991     3.048   73.452   71.587
LGA    D   133_A      D   133_A     3.181     0    0.184   0.401     5.687   55.476   43.690
LGA    L   134_A      L   134_A     2.112     0    0.519   1.009     3.859   59.167   63.393

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      133     532    532  100.00    1010   1010  100.00               133
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.950          0.937                  1.530           92.977   88.204

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  134  133    4.0    132    0.74    96.617    98.533    15.686

LGA_LOCAL      RMSD:   0.742  Number of atoms:  132  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.953  Number of assigned atoms:  133 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.950  Standard rmsd on all 133 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.793741 * X  +  -0.119469 * Y  +  -0.596408 * Z  + -19.521221
  Y_new =  -0.439093 * X  +  -0.791072 * Y  +  -0.425913 * Z  +  62.221714
  Z_new =  -0.420919 * X  +   0.599943 * Y  +  -0.680364 * Z  +  -3.743400 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -0.505292  0.434458  2.418926   [DEG:  -28.9511   24.8926  138.5943 ]
ZXZ: -0.950650  2.319056 -0.611798   [DEG:  -54.4682  132.8721  -35.0534 ]
 
# END of job
