
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  134 ( 1014),  selected  133 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  133 ( 1010),  selected  133 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       1.47     1.47
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       1.47     1.47
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 134_A       0.84     1.49
  LCS_AVERAGE:     97.05

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  133
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S     2_A     S     2_A      3  133  133      3    3    4    4    4    4    8    9    9   10   16   21   36   53   86  123  133  133  133  133 
LCS_GDT     M     3_A     M     3_A      3  133  133      3    3    4    4    4    4    8   25   40   63  102  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     A     4_A     A     4_A    131  133  133     62  112  124  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     5_A     E     5_A    131  133  133     45  111  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     L     6_A     L     6_A    131  133  133      7   34  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     K     7_A     K     7_A    131  133  133     18  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q     8_A     Q     8_A    131  133  133     60  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     9_A     E     9_A    131  133  133     52  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     W    10_A     W    10_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    11_A     I    11_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    12_A     N    12_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    13_A     T    13_A    131  133  133     63  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A    131  133  133     63  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    15_A     I    15_A    131  133  133     52  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    16_A     E    16_A    131  133  133     45  110  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    17_A     A    17_A    131  133  133     15   80  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    18_A     L    18_A    131  133  133      7   40  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    19_A     D    19_A    131  133  133      7   93  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    20_A     K    20_A    131  133  133     25  109  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    21_A     A    21_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    22_A     Y    22_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    24_A     P    24_A    131  133  133     60  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    25_A     Y    25_A    131  133  133     63  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    26_A     S    26_A    131  133  133     64  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    27_A     H    27_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    28_A     F    28_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    29_A     P    29_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    30_A     V    30_A    131  133  133     63  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    31_A     G    31_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    32_A     A    32_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    33_A     C    33_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    34_A     L    34_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    35_A     V    35_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    36_A     T    36_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    37_A     E    37_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    38_A     S    38_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    39_A     G    39_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    40_A     K    40_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    42_A     Y    42_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    43_A     Q    43_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    44_A     G    44_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    45_A     I    45_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    46_A     N    46_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    47_A     I    47_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    48_A     E    48_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    49_A     N    49_A    131  133  133     52  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    50_A     A    50_A    131  133  133     52  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    131  133  133     64  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    52_A     F    52_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    53_A     G    53_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    54_A     L    54_A    131  133  133     60  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    55_A     T    55_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    56_A     N    56_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    57_A     C    57_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    58_A     A    58_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    59_A     E    59_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    60_A     R    60_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    61_A     T    61_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    62_A     A    62_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    63_A     F    63_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    64_A     F    64_A    131  133  133     63  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    65_A     K    65_A    131  133  133     63  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    66_A     A    66_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    67_A     V    67_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    68_A     S    68_A    131  133  133     63  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    69_A     E    69_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    70_A     G    70_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    71_A     E    71_A    131  133  133     56  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A    131  133  133     29  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    73_A     S    73_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    74_A     F    74_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    75_A     T    75_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    76_A     H    76_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    77_A     L    77_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    78_A     V    78_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    79_A     V    79_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    80_A     A    80_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    81_A     G    81_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    82_A     H    82_A    131  133  133     63  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    83_A     T    83_A    131  133  133     38  110  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    84_A     P    84_A    131  133  133      7   71  123  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    85_A     D    85_A    131  133  133     60  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    86_A     P    86_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    87_A     I    87_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    88_A     S    88_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    89_A     P    89_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    90_A     C    90_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    91_A     G    91_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    92_A     A    92_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    93_A     C    93_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    95_A     Q    95_A    131  133  133     63  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A    131  133  133     63  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     M    97_A     M    97_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    98_A     A    98_A    131  133  133     63  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    99_A     E    99_A    131  133  133     63  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    131  133  133      7  110  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     C   101_A     C   101_A    131  133  133      7  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    131  133  133     27  107  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   103_A     P   103_A    131  133  133     11  105  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   104_A     D   104_A    131  133  133      5   52  117  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     M   105_A     M   105_A    131  133  133      4  102  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   106_A     P   106_A    131  133  133     34  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   107_A     V   107_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   108_A     T   108_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   109_A     L   109_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   110_A     V   110_A    131  133  133     60  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   111_A     G   111_A    131  133  133     45  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   112_A     D   112_A    131  133  133      3    4  120  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A    131  133  133      3   74  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   114_A     G   114_A    131  133  133     27  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   115_A     V   115_A    131  133  133     27  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   116_A     T   116_A    131  133  133     60  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   117_A     K   117_A    131  133  133     60  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   118_A     A   118_A    131  133  133     45  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   119_A     T   119_A    131  133  133     45  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   120_A     T   120_A    131  133  133      7  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   121_A     V   121_A    131  133  133     27  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     R   122_A     R   122_A    131  133  133     59  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   123_A     E   123_A    131  133  133     59  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A    131  133  133     36  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   126_A     P   126_A    131  133  133     63  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y   127_A     Y   127_A    131  133  133     65  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   128_A     A   128_A    131  133  133     62  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   129_A     F   129_A    131  133  133     60  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   130_A     T   130_A    131  133  133     60  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   131_A     E   131_A    131  133  133     61  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A    131  133  133     60  112  125  128  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   133_A     D   133_A    131  133  133      3    3    7   34  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   134_A     L   134_A    131  133  133      3    4  102  127  130  131  131  131  131  131  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  99.02  (  97.05  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     65    112    125    128    130    131    131    131    131    131    131    132    132    132    132    132    133    133    133    133 
GDT PERCENT_AT  48.87  84.21  93.98  96.24  97.74  98.50  98.50  98.50  98.50  98.50  98.50  99.25  99.25  99.25  99.25  99.25 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.34   0.54   0.67   0.71   0.78   0.84   0.84   0.84   0.84   0.84   0.84   1.11   1.11   1.11   1.11   1.11   1.47   1.47   1.47   1.47
GDT RMS_ALL_AT   1.48   1.49   1.49   1.49   1.49   1.49   1.49   1.49   1.49   1.49   1.49   1.48   1.48   1.48   1.48   1.48   1.47   1.47   1.47   1.47

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    16_A      E    16_A
#   possible swapping detected:  Y    25_A      Y    25_A
#   possible swapping detected:  E    48_A      E    48_A
#   possible swapping detected:  E    59_A      E    59_A
#   possible swapping detected:  F    63_A      F    63_A
#   possible swapping detected:  E    71_A      E    71_A
#   possible swapping detected:  E    99_A      E    99_A
#   possible swapping detected:  E   123_A      E   123_A
#   possible swapping detected:  Y   127_A      Y   127_A
#   possible swapping detected:  E   131_A      E   131_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S     2_A      S     2_A    11.508     0    0.585   0.762    11.834    0.476    0.317
LGA    M     3_A      M     3_A     8.493     0    0.050   0.915    12.167   12.262    6.190
LGA    A     4_A      A     4_A     1.003     0    0.629   0.599     3.658   81.190   79.524
LGA    E     5_A      E     5_A     1.023     0    0.046   1.229     7.715   86.071   57.249
LGA    L     6_A      L     6_A     1.729     0    0.070   1.039     6.987   79.286   58.690
LGA    K     7_A      K     7_A     1.126     0    0.034   0.690     1.679   85.952   81.534
LGA    Q     8_A      Q     8_A     0.671     0    0.049   1.225     4.734   90.476   76.772
LGA    E     9_A      E     9_A     0.710     0    0.041   1.184     5.117   90.476   66.349
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LGA    I    11_A      I    11_A     0.193     0    0.032   0.129     0.724  100.000   97.619
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LGA    F   100_A      F   100_A     1.065     0    0.082   0.359     1.278   83.690   86.407
LGA    C   101_A      C   101_A     0.922     0    0.025   0.117     1.002   88.214   88.968
LGA    A   102_A      A   102_A     1.215     0    0.075   0.077     1.536   81.429   79.714
LGA    P   103_A      P   103_A     1.328     0    0.133   0.136     1.569   77.143   78.980
LGA    D   104_A      D   104_A     2.339     0    0.163   1.038     3.443   72.976   68.036
LGA    M   105_A      M   105_A     1.234     0    0.038   0.813     2.325   83.810   79.464
LGA    P   106_A      P   106_A     0.789     0    0.057   0.308     0.999   90.476   93.197
LGA    V   107_A      V   107_A     0.449     0    0.028   0.069     0.482  100.000  100.000
LGA    T   108_A      T   108_A     0.388     0    0.026   0.063     0.665  100.000   98.639
LGA    L   109_A      L   109_A     0.215     0    0.027   0.073     0.504   97.619   98.810
LGA    V   110_A      V   110_A     0.665     0    0.107   0.147     2.000   97.619   87.075
LGA    G   111_A      G   111_A     0.661     0    0.068   0.068     1.373   88.333   88.333
LGA    D   112_A      D   112_A     1.950     0    0.576   1.063     5.065   67.619   54.167
LGA    N   113_A      N   113_A     1.641     0    0.095   0.988     6.839   77.143   54.286
LGA    G   114_A      G   114_A     1.016     0    0.039   0.039     1.158   81.429   81.429
LGA    V   115_A      V   115_A     0.977     0    0.034   1.176     3.404   88.214   76.327
LGA    T   116_A      T   116_A     0.683     0    0.081   0.129     1.089   88.214   89.184
LGA    K   117_A      K   117_A     0.633     0    0.038   0.910     2.987   92.857   79.418
LGA    A   118_A      A   118_A     0.889     0    0.060   0.061     1.337   90.476   88.667
LGA    T   119_A      T   119_A     0.745     0    0.127   1.057     2.582   88.214   80.612
LGA    T   120_A      T   120_A     0.995     0    0.032   0.054     1.071   88.214   87.891
LGA    V   121_A      V   121_A     0.723     0    0.038   0.103     0.831   90.476   91.837
LGA    R   122_A      R   122_A     0.709     0    0.049   1.190     2.771   90.476   77.316
LGA    E   123_A      E   123_A     0.732     0    0.037   0.638     1.790   90.476   87.513
LGA    L   124_A      L   124_A     0.892     0    0.069   1.072     3.430   90.476   82.024
LGA    L   125_A      L   125_A     0.311     0    0.097   0.094     1.410  100.000   92.976
LGA    P   126_A      P   126_A     0.680     0    0.034   0.125     1.511   90.476   85.374
LGA    Y   127_A      Y   127_A     0.528     0    0.043   1.347     9.033   95.238   56.746
LGA    A   128_A      A   128_A     0.593     0    0.060   0.069     1.034   92.857   90.571
LGA    F   129_A      F   129_A     0.774     0    0.059   0.086     1.191   90.476   87.186
LGA    T   130_A      T   130_A     0.850     0    0.025   0.118     1.136   90.476   89.184
LGA    E   131_A      E   131_A     0.664     0    0.175   1.455     6.471   88.214   63.915
LGA    K   132_A      K   132_A     0.836     0    0.060   0.866     2.469   79.643   79.735
LGA    D   133_A      D   133_A     3.418     0    0.239   0.226     5.126   51.786   41.786
LGA    L   134_A      L   134_A     2.849     0    0.224   1.004     3.313   55.357   58.274

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      133     532    532  100.00    1010   1010  100.00               133
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.469          1.401                  1.937           90.892   85.564

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  134  133    4.0    131    0.84    94.549    97.339    13.970

LGA_LOCAL      RMSD:   0.838  Number of atoms:  131  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.493  Number of assigned atoms:  133 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.469  Standard rmsd on all 133 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.191862 * X  +  -0.900289 * Y  +   0.390728 * Z  +  11.179718
  Y_new =   0.386798 * X  +  -0.435265 * Y  +  -0.812977 * Z  + 100.877968
  Z_new =   0.901985 * X  +  -0.004847 * Y  +   0.431741 * Z  + -48.806667 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  2.031260 -1.124344 -0.011226   [DEG:  116.3826  -64.4202   -0.6432 ]
ZXZ:  0.448018  1.124374  1.576170   [DEG:   25.6696   64.4219   90.3079 ]
 
# END of job
