
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  134 ( 1014),  selected  133 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  133 ( 1010),  selected  133 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       1.01     1.01
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       1.01     1.01
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   132       2_A - 133_A       0.98     1.01
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   132       3_A - 134_A       0.83     1.01
  LCS_AVERAGE:     99.25

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  133
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S     2_A     S     2_A    132  133  133      0    3    3    3    4    6    7   12  121  128  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M     3_A     M     3_A    132  133  133      5  112  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A     4_A     A     4_A    132  133  133      3   38  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     5_A     E     5_A    132  133  133     14   85  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L     6_A     L     6_A    132  133  133     18  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K     7_A     K     7_A    132  133  133     75  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q     8_A     Q     8_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     9_A     E     9_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     W    10_A     W    10_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    11_A     I    11_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    12_A     N    12_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    13_A     T    13_A    132  133  133     75  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    15_A     I    15_A    132  133  133     60  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    16_A     E    16_A    132  133  133     36  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    17_A     A    17_A    132  133  133      5   84  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    18_A     L    18_A    132  133  133      6   84  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    19_A     D    19_A    132  133  133      8   91  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    20_A     K    20_A    132  133  133     30  112  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    21_A     A    21_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    22_A     Y    22_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    24_A     P    24_A    132  133  133     75  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    25_A     Y    25_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    26_A     S    26_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    27_A     H    27_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    28_A     F    28_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    29_A     P    29_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    30_A     V    30_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    31_A     G    31_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    32_A     A    32_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    33_A     C    33_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    34_A     L    34_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    35_A     V    35_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    36_A     T    36_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    37_A     E    37_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    38_A     S    38_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    39_A     G    39_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    40_A     K    40_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    42_A     Y    42_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    43_A     Q    43_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    44_A     G    44_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    45_A     I    45_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    46_A     N    46_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    47_A     I    47_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    48_A     E    48_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    49_A     N    49_A    132  133  133     49  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    50_A     A    50_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    52_A     F    52_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    53_A     G    53_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    54_A     L    54_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    55_A     T    55_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    56_A     N    56_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    57_A     C    57_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    58_A     A    58_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    59_A     E    59_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    60_A     R    60_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    61_A     T    61_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    62_A     A    62_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    63_A     F    63_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    64_A     F    64_A    132  133  133     75  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    65_A     K    65_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    66_A     A    66_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    67_A     V    67_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    68_A     S    68_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    69_A     E    69_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    70_A     G    70_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    71_A     E    71_A    132  133  133     55  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A    132  133  133     68  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    73_A     S    73_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    74_A     F    74_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    75_A     T    75_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    76_A     H    76_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    77_A     L    77_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    78_A     V    78_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    79_A     V    79_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    80_A     A    80_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    81_A     G    81_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    82_A     H    82_A    132  133  133     55  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    83_A     T    83_A    132  133  133     36  112  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    84_A     P    84_A    132  133  133     19   98  123  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    85_A     D    85_A    132  133  133     65  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    86_A     P    86_A    132  133  133     75  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    87_A     I    87_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    88_A     S    88_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    89_A     P    89_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    90_A     C    90_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    91_A     G    91_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    92_A     A    92_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    93_A     C    93_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    95_A     Q    95_A    132  133  133     65  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A    132  133  133     65  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M    97_A     M    97_A    132  133  133     71  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    98_A     A    98_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    99_A     E    99_A    132  133  133     75  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    132  133  133     24  111  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C   101_A     C   101_A    132  133  133     24  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    132  133  133     40  112  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   103_A     P   103_A    132  133  133     28  112  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   104_A     D   104_A    132  133  133      6   48  119  130  130  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M   105_A     M   105_A    132  133  133     40  112  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   106_A     P   106_A    132  133  133     40  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   107_A     V   107_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   108_A     T   108_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   109_A     L   109_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   110_A     V   110_A    132  133  133     64  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   111_A     G   111_A    132  133  133     62  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   112_A     D   112_A    132  133  133      3   52  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A    132  133  133      3   64  123  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   114_A     G   114_A    132  133  133     36  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   115_A     V   115_A    132  133  133     53  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   116_A     T   116_A    132  133  133     65  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   117_A     K   117_A    132  133  133     75  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   118_A     A   118_A    132  133  133     43  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   119_A     T   119_A    132  133  133     62  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   120_A     T   120_A    132  133  133     13  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   121_A     V   121_A    132  133  133     55  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R   122_A     R   122_A    132  133  133     55  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   123_A     E   123_A    132  133  133     42  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A    132  133  133     42  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   126_A     P   126_A    132  133  133     68  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y   127_A     Y   127_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   128_A     A   128_A    132  133  133     77  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   129_A     F   129_A    132  133  133     65  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   130_A     T   130_A    132  133  133     60  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   131_A     E   131_A    132  133  133     75  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A    132  133  133     75  113  124  130  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   133_A     D   133_A    132  133  133      3    4   75  125  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   134_A     L   134_A    132  133  133      3   62   97  125  131  132  132  132  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  99.75  (  99.25  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     77    113    124    130    131    132    132    132    132    132    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133 
GDT PERCENT_AT  57.89  84.96  93.23  97.74  98.50  99.25  99.25  99.25  99.25  99.25 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.32   0.50   0.61   0.73   0.80   0.83   0.83   0.83   0.83   0.83   1.01   1.01   1.01   1.01   1.01   1.01   1.01   1.01   1.01   1.01
GDT RMS_ALL_AT   1.03   1.02   1.01   1.01   1.01   1.01   1.01   1.01   1.01   1.01   1.01   1.01   1.01   1.01   1.01   1.01   1.01   1.01   1.01   1.01

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E     9_A      E     9_A
#   possible swapping detected:  F    63_A      F    63_A
#   possible swapping detected:  E    71_A      E    71_A
#   possible swapping detected:  F   100_A      F   100_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S     2_A      S     2_A     6.766     0    0.115   0.182     8.486   21.667   16.429
LGA    M     3_A      M     3_A     1.074     0    0.626   1.303     5.183   77.262   56.667
LGA    A     4_A      A     4_A     1.959     0    0.667   0.643     4.053   61.905   60.952
LGA    E     5_A      E     5_A     1.539     0    0.063   0.202     2.722   77.143   68.624
LGA    L     6_A      L     6_A     1.013     0    0.103   0.291     1.460   85.952   83.690
LGA    K     7_A      K     7_A     0.676     0    0.055   0.922     4.147   90.476   78.836
LGA    Q     8_A      Q     8_A     0.580     0    0.048   1.339     5.444   90.476   72.540
LGA    E     9_A      E     9_A     0.575     0    0.036   1.090     4.824   90.476   72.857
LGA    W    10_A      W    10_A     0.461     0    0.050   0.083     0.879   97.619   92.517
LGA    I    11_A      I    11_A     0.143     0    0.026   0.096     0.723  100.000   97.619
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LGA    T    13_A      T    13_A     0.434     0    0.023   1.158     2.912   97.619   87.483
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LGA    C   101_A      C   101_A     0.980     0    0.022   0.117     1.075   88.214   88.968
LGA    A   102_A      A   102_A     1.236     0    0.076   0.079     1.513   81.429   79.714
LGA    P   103_A      P   103_A     1.188     0    0.128   0.131     1.434   81.429   81.429
LGA    D   104_A      D   104_A     2.249     0    0.176   1.199     3.399   72.976   67.083
LGA    M   105_A      M   105_A     1.125     0    0.058   0.860     2.746   85.952   77.500
LGA    P   106_A      P   106_A     0.709     0    0.034   0.285     0.913   90.476   93.197
LGA    V   107_A      V   107_A     0.429     0    0.033   0.078     0.458  100.000  100.000
LGA    T   108_A      T   108_A     0.307     0    0.015   0.088     0.516  100.000   98.639
LGA    L   109_A      L   109_A     0.225     0    0.024   0.059     0.549   97.619   98.810
LGA    V   110_A      V   110_A     0.725     0    0.116   0.163     2.102   97.619   87.075
LGA    G   111_A      G   111_A     0.585     0    0.053   0.053     1.189   88.333   88.333
LGA    D   112_A      D   112_A     1.779     0    0.646   1.216     3.354   69.286   71.250
LGA    N   113_A      N   113_A     2.035     0    0.267   0.995     7.245   75.119   50.298
LGA    G   114_A      G   114_A     1.175     0    0.071   0.071     1.508   79.286   79.286
LGA    V   115_A      V   115_A     1.076     0    0.031   1.170     3.433   85.952   75.034
LGA    T   116_A      T   116_A     0.633     0    0.083   0.133     1.019   88.214   89.184
LGA    K   117_A      K   117_A     0.553     0    0.041   0.872     2.027   95.238   87.778
LGA    A   118_A      A   118_A     0.888     0    0.045   0.051     1.366   90.476   88.667
LGA    T   119_A      T   119_A     0.748     0    0.121   1.056     2.644   88.214   80.612
LGA    T   120_A      T   120_A     0.975     0    0.031   1.143     2.887   88.214   79.660
LGA    V   121_A      V   121_A     0.640     0    0.042   0.111     0.776   90.476   91.837
LGA    R   122_A      R   122_A     0.780     0    0.056   1.236     6.261   90.476   72.294
LGA    E   123_A      E   123_A     0.828     0    0.034   0.289     1.543   90.476   89.577
LGA    L   124_A      L   124_A     0.790     0    0.065   0.140     1.178   90.476   87.083
LGA    L   125_A      L   125_A     0.366     0    0.090   1.050     3.668   97.619   84.821
LGA    P   126_A      P   126_A     0.605     0    0.039   0.119     1.345   97.619   90.680
LGA    Y   127_A      Y   127_A     0.383     0    0.039   0.208     1.479   97.619   92.976
LGA    A   128_A      A   128_A     0.546     0    0.060   0.061     0.878   95.238   94.286
LGA    F   129_A      F   129_A     0.810     0    0.071   0.280     3.096   88.214   72.814
LGA    T   130_A      T   130_A     0.958     0    0.035   0.155     1.461   90.476   86.599
LGA    E   131_A      E   131_A     0.549     0    0.177   0.685     1.689   88.214   83.545
LGA    K   132_A      K   132_A     0.695     0    0.084   1.080     7.756   81.667   57.249
LGA    D   133_A      D   133_A     3.156     0    0.240   0.247     4.406   53.690   46.190
LGA    L   134_A      L   134_A     2.949     0    0.657   1.129     5.802   57.143   50.000

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      133     532    532  100.00    1010   1010  100.00               133
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.007          1.016                  1.527           91.985   87.164

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  134  133    4.0    132    0.83    95.489    97.853    14.268

LGA_LOCAL      RMSD:   0.825  Number of atoms:  132  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.010  Number of assigned atoms:  133 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.007  Standard rmsd on all 133 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.219108 * X  +  -0.881643 * Y  +   0.417969 * Z  +   8.472466
  Y_new =   0.363289 * X  +  -0.471294 * Y  +  -0.803681 * Z  + 103.075516
  Z_new =   0.905546 * X  +  -0.024250 * Y  +   0.423555 * Z  + -46.993183 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  2.113510 -1.132664 -0.057190   [DEG:  121.0952  -64.8969   -3.2768 ]
ZXZ:  0.479573  1.133430  1.597569   [DEG:   27.4775   64.9408   91.5340 ]
 
# END of job
