
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  128 (  974),  selected  128 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  133 ( 1010),  selected  128 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   128       7_A - 134_A       0.88     0.88
  LCS_AVERAGE:     96.24

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   128       7_A - 134_A       0.88     0.88
  LCS_AVERAGE:     96.24

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   128       7_A - 134_A       0.88     0.88
  LCS_AVERAGE:     96.24

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  128
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     K     7_A     K     7_A    128  128  128     12   99  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     Q     8_A     Q     8_A    128  128  128     12  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     E     9_A     E     9_A    128  128  128     38  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     W    10_A     W    10_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     I    11_A     I    11_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     N    12_A     N    12_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     T    13_A     T    13_A    128  128  128     61  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A    128  128  128     65  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     I    15_A     I    15_A    128  128  128     56  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     E    16_A     E    16_A    128  128  128     41  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     A    17_A     A    17_A    128  128  128     12   57  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     L    18_A     L    18_A    128  128  128      3   57  119  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     D    19_A     D    19_A    128  128  128      5   97  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     K    20_A     K    20_A    128  128  128     41  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     A    21_A     A    21_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     Y    22_A     Y    22_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     P    24_A     P    24_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     Y    25_A     Y    25_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     S    26_A     S    26_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     H    27_A     H    27_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     F    28_A     F    28_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     P    29_A     P    29_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     V    30_A     V    30_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     G    31_A     G    31_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     A    32_A     A    32_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     C    33_A     C    33_A    128  128  128     65  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     L    34_A     L    34_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     V    35_A     V    35_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     T    36_A     T    36_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     E    37_A     E    37_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     S    38_A     S    38_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     G    39_A     G    39_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     K    40_A     K    40_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     Y    42_A     Y    42_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     Q    43_A     Q    43_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     G    44_A     G    44_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     I    45_A     I    45_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     N    46_A     N    46_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     I    47_A     I    47_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     E    48_A     E    48_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     N    49_A     N    49_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     A    50_A     A    50_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     F    52_A     F    52_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     G    53_A     G    53_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     L    54_A     L    54_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     T    55_A     T    55_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     N    56_A     N    56_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     C    57_A     C    57_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     A    58_A     A    58_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     E    59_A     E    59_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     R    60_A     R    60_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     T    61_A     T    61_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     A    62_A     A    62_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     F    63_A     F    63_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     F    64_A     F    64_A    128  128  128     61  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     K    65_A     K    65_A    128  128  128     65  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     A    66_A     A    66_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     V    67_A     V    67_A    128  128  128     65  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     S    68_A     S    68_A    128  128  128     60  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     E    69_A     E    69_A    128  128  128     65  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     G    70_A     G    70_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     E    71_A     E    71_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     S    73_A     S    73_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     F    74_A     F    74_A    128  128  128     55  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     T    75_A     T    75_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     H    76_A     H    76_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     L    77_A     L    77_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     V    78_A     V    78_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     V    79_A     V    79_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     A    80_A     A    80_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     G    81_A     G    81_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     H    82_A     H    82_A    128  128  128     42  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     T    83_A     T    83_A    128  128  128      8   98  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     P    84_A     P    84_A    128  128  128      8   34  114  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     D    85_A     D    85_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     P    86_A     P    86_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     I    87_A     I    87_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     S    88_A     S    88_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     P    89_A     P    89_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     C    90_A     C    90_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     G    91_A     G    91_A    128  128  128     59  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     A    92_A     A    92_A    128  128  128     65  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     C    93_A     C    93_A    128  128  128     65  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A    128  128  128     60  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     Q    95_A     Q    95_A    128  128  128     51  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A    128  128  128     44  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     M    97_A     M    97_A    128  128  128     48  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     A    98_A     A    98_A    128  128  128     53  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     E    99_A     E    99_A    128  128  128     53  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    128  128  128      6   94  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     C   101_A     C   101_A    128  128  128     22  102  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    128  128  128      6   90  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     P   103_A     P   103_A    128  128  128     33   98  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     D   104_A     D   104_A    128  128  128     15   53  108  124  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     M   105_A     M   105_A    128  128  128      4   98  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     P   106_A     P   106_A    128  128  128     46  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     V   107_A     V   107_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     T   108_A     T   108_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     L   109_A     L   109_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     V   110_A     V   110_A    128  128  128     52  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     G   111_A     G   111_A    128  128  128     41  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     D   112_A     D   112_A    128  128  128      3   56  116  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A    128  128  128      3   29  114  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     G   114_A     G   114_A    128  128  128      3  104  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     V   115_A     V   115_A    128  128  128     20  105  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     T   116_A     T   116_A    128  128  128     60  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     K   117_A     K   117_A    128  128  128     67  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     A   118_A     A   118_A    128  128  128     45  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     T   119_A     T   119_A    128  128  128     42  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     T   120_A     T   120_A    128  128  128      5   99  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     V   121_A     V   121_A    128  128  128     17  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     R   122_A     R   122_A    128  128  128     60  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     E   123_A     E   123_A    128  128  128     42  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A    128  128  128      5  101  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A    128  128  128     65  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     P   126_A     P   126_A    128  128  128     26  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     Y   127_A     Y   127_A    128  128  128     27  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     A   128_A     A   128_A    128  128  128     48  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     F   129_A     F   129_A    128  128  128     44  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     T   130_A     T   130_A    128  128  128     44  106  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     E   131_A     E   131_A    128  128  128     13   97  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A    128  128  128      3  105  121  125  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     D   133_A     D   133_A    128  128  128      3    3   72  118  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_GDT     L   134_A     L   134_A    128  128  128      3   54   96  120  126  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128  128 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  96.24  (  96.24   96.24   96.24 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     67    106    121    125    126    128    128    128    128    128    128    128    128    128    128    128    128    128    128    128 
GDT PERCENT_AT  50.38  79.70  90.98  93.98  94.74  96.24  96.24  96.24  96.24  96.24  96.24  96.24  96.24  96.24  96.24  96.24  96.24  96.24  96.24  96.24
GDT RMS_LOCAL    0.34   0.55   0.68   0.75   0.78   0.88   0.88   0.88   0.88   0.88   0.88   0.88   0.88   0.88   0.88   0.88   0.88   0.88   0.88   0.88
GDT RMS_ALL_AT   0.92   0.89   0.89   0.89   0.89   0.88   0.88   0.88   0.88   0.88   0.88   0.88   0.88   0.88   0.88   0.88   0.88   0.88   0.88   0.88

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E     9_A      E     9_A
#   possible swapping detected:  Y    25_A      Y    25_A
#   possible swapping detected:  F    52_A      F    52_A
#   possible swapping detected:  F    63_A      F    63_A
#   possible swapping detected:  E    71_A      E    71_A
#   possible swapping detected:  F   100_A      F   100_A
#   possible swapping detected:  D   104_A      D   104_A
#   possible swapping detected:  E   131_A      E   131_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    K     7_A      K     7_A     1.333     0    0.152   0.890     2.647   83.690   76.032
LGA    Q     8_A      Q     8_A     1.148     0    0.043   1.351     4.779   83.690   72.328
LGA    E     9_A      E     9_A     1.095     0    0.025   0.656     4.221   85.952   73.915
LGA    W    10_A      W    10_A     0.500     0    0.050   0.210     0.745   95.238   97.279
LGA    I    11_A      I    11_A     0.272     0    0.029   0.111     0.847  100.000   96.429
LGA    N    12_A      N    12_A     0.254     0    0.034   0.609     1.591   97.619   93.095
LGA    T    13_A      T    13_A     0.559     0    0.032   1.002     2.469   92.857   85.646
LGA    A    14_A      A    14_A     0.454     0    0.041   0.045     0.872   95.238   96.190
LGA    I    15_A      I    15_A     0.697     0    0.026   1.364     3.821   90.476   76.310
LGA    E    16_A      E    16_A     1.016     0    0.047   0.718     2.920   83.690   78.095
LGA    A    17_A      A    17_A     1.527     0    0.096   0.093     1.758   75.000   76.286
LGA    L    18_A      L    18_A     1.716     0    0.022   0.855     3.241   72.857   73.274
LGA    D    19_A      D    19_A     1.288     0    0.060   0.170     1.909   83.690   79.345
LGA    K    20_A      K    20_A     1.003     0    0.102   0.735     1.707   85.952   82.487
LGA    A    21_A      A    21_A     0.240     0    0.078   0.092     0.567   97.619   98.095
LGA    Y    22_A      Y    22_A     0.413     0    0.045   0.086     0.942  100.000   93.651
LGA    V    23_A      V    23_A     0.125     0    0.113   0.926     2.180  100.000   89.932
LGA    P    24_A      P    24_A     0.434     0    0.108   0.406     1.323   92.976   90.612
LGA    Y    25_A      Y    25_A     0.266     0    0.028   0.315     1.756  100.000   89.246
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LGA    N   113_A      N   113_A     1.978     0    0.299   1.164     4.867   79.405   61.607
LGA    G   114_A      G   114_A     1.220     0    0.071   0.071     1.546   79.286   79.286
LGA    V   115_A      V   115_A     1.121     0    0.040   1.098     3.816   85.952   76.190
LGA    T   116_A      T   116_A     0.692     0    0.084   0.142     1.052   88.214   89.184
LGA    K   117_A      K   117_A     0.602     0    0.026   0.992     3.234   92.857   79.577
LGA    A   118_A      A   118_A     0.789     0    0.068   0.073     1.119   90.476   88.667
LGA    T   119_A      T   119_A     0.826     0    0.128   0.276     1.320   88.214   85.306
LGA    T   120_A      T   120_A     1.135     0    0.029   0.047     1.205   83.690   84.014
LGA    V   121_A      V   121_A     0.879     0    0.037   0.118     1.166   90.476   89.184
LGA    R   122_A      R   122_A     0.799     0    0.048   1.218     5.446   90.476   75.628
LGA    E   123_A      E   123_A     0.844     0    0.030   0.533     2.165   90.476   87.619
LGA    L   124_A      L   124_A     1.123     0    0.092   1.067     2.964   85.952   77.500
LGA    L   125_A      L   125_A     0.374     0    0.095   1.077     3.481  100.000   84.762
LGA    P   126_A      P   126_A     0.749     0    0.048   0.151     1.762   90.476   85.374
LGA    Y   127_A      Y   127_A     0.794     0    0.035   0.210     2.177   95.238   82.579
LGA    A   128_A      A   128_A     0.984     0    0.086   0.100     1.611   90.476   86.952
LGA    F   129_A      F   129_A     0.994     0    0.057   0.142     1.907   88.214   82.381
LGA    T   130_A      T   130_A     1.022     0    0.074   1.148     2.807   85.952   79.320
LGA    E   131_A      E   131_A     1.276     0    0.160   1.285     7.724   81.429   53.968
LGA    K   132_A      K   132_A     1.030     0    0.106   0.794     8.962   79.405   51.693
LGA    D   133_A      D   133_A     3.402     0    0.256   0.329     5.157   50.119   41.607
LGA    L   134_A      L   134_A     3.194     0    0.464   1.090     5.273   48.333   49.821

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      128     512    512  100.00     974    974  100.00               133
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.884          0.899                  1.542           88.686   83.389

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  128  133    4.0    128    0.88    91.541    94.285    13.010

LGA_LOCAL      RMSD:   0.884  Number of atoms:  128  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.884  Number of assigned atoms:  128 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.884  Standard rmsd on all 128 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.436890 * X  +   0.897415 * Y  +   0.061423 * Z  + -68.928360
  Y_new =  -0.258104 * X  +  -0.059655 * Y  +  -0.964274 * Z  +  91.227760
  Z_new =  -0.861690 * X  +  -0.437135 * Y  +   0.257690 * Z  +   4.339109 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -2.607983  1.038590 -1.038136   [DEG: -149.4264   59.5068  -59.4808 ]
ZXZ:  0.063612  1.310166 -2.040267   [DEG:    3.6447   75.0670 -116.8987 ]
 
# END of job
