
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  129 (  982),  selected  129 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  133 ( 1010),  selected  129 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   129       6_A - 134_A       0.86     0.85
  LCS_AVERAGE:     96.99

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   129       6_A - 134_A       0.86     0.85
  LCS_AVERAGE:     96.99

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   129       6_A - 134_A       0.86     0.85
  LCS_AVERAGE:     96.99

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  129
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     L     6_A     L     6_A    129  129  129     13   89  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     K     7_A     K     7_A    129  129  129     17  102  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     Q     8_A     Q     8_A    129  129  129     34  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     E     9_A     E     9_A    129  129  129     43  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     W    10_A     W    10_A    129  129  129     68  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     I    11_A     I    11_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     N    12_A     N    12_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     T    13_A     T    13_A    129  129  129     68  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     I    15_A     I    15_A    129  129  129     56  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     E    16_A     E    16_A    129  129  129     38  103  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     A    17_A     A    17_A    129  129  129     12   55  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     L    18_A     L    18_A    129  129  129      3   41  113  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     D    19_A     D    19_A    129  129  129     11  103  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     K    20_A     K    20_A    129  129  129     19  106  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     A    21_A     A    21_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     Y    22_A     Y    22_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     P    24_A     P    24_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     Y    25_A     Y    25_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     S    26_A     S    26_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     H    27_A     H    27_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     F    28_A     F    28_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     P    29_A     P    29_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     V    30_A     V    30_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     G    31_A     G    31_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     A    32_A     A    32_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     C    33_A     C    33_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     L    34_A     L    34_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     V    35_A     V    35_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     T    36_A     T    36_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     E    37_A     E    37_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     S    38_A     S    38_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     G    39_A     G    39_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     K    40_A     K    40_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     Y    42_A     Y    42_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     Q    43_A     Q    43_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     G    44_A     G    44_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     I    45_A     I    45_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     N    46_A     N    46_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     I    47_A     I    47_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     E    48_A     E    48_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     N    49_A     N    49_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     A    50_A     A    50_A    129  129  129     57  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     F    52_A     F    52_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     G    53_A     G    53_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     L    54_A     L    54_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     T    55_A     T    55_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     N    56_A     N    56_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     C    57_A     C    57_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     A    58_A     A    58_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     E    59_A     E    59_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     R    60_A     R    60_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     T    61_A     T    61_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     A    62_A     A    62_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     F    63_A     F    63_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     F    64_A     F    64_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     K    65_A     K    65_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     A    66_A     A    66_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     V    67_A     V    67_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     S    68_A     S    68_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     E    69_A     E    69_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     G    70_A     G    70_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     E    71_A     E    71_A    129  129  129     52  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A    129  129  129      4  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     S    73_A     S    73_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     F    74_A     F    74_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     T    75_A     T    75_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     H    76_A     H    76_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     L    77_A     L    77_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     V    78_A     V    78_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     V    79_A     V    79_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     A    80_A     A    80_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     G    81_A     G    81_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     H    82_A     H    82_A    129  129  129     52  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     T    83_A     T    83_A    129  129  129      4  102  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     P    84_A     P    84_A    129  129  129      5   69  112  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     D    85_A     D    85_A    129  129  129     67  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     P    86_A     P    86_A    129  129  129     67  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     I    87_A     I    87_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     S    88_A     S    88_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     P    89_A     P    89_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     C    90_A     C    90_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     G    91_A     G    91_A    129  129  129     68  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     A    92_A     A    92_A    129  129  129     68  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     C    93_A     C    93_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A    129  129  129     68  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     Q    95_A     Q    95_A    129  129  129     51  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A    129  129  129     60  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     M    97_A     M    97_A    129  129  129     52  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     A    98_A     A    98_A    129  129  129     44  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     E    99_A     E    99_A    129  129  129     49  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    129  129  129     13   97  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     C   101_A     C   101_A    129  129  129     17  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    129  129  129     26   91  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     P   103_A     P   103_A    129  129  129     32  104  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     D   104_A     D   104_A    129  129  129      9   67  113  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     M   105_A     M   105_A    129  129  129      5   91  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     P   106_A     P   106_A    129  129  129     59  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     V   107_A     V   107_A    129  129  129     68  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     T   108_A     T   108_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     L   109_A     L   109_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     V   110_A     V   110_A    129  129  129     57  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     G   111_A     G   111_A    129  129  129      3  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     D   112_A     D   112_A    129  129  129      3    4  114  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A    129  129  129      3   88  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     G   114_A     G   114_A    129  129  129     34  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     V   115_A     V   115_A    129  129  129     38  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     T   116_A     T   116_A    129  129  129     57  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     K   117_A     K   117_A    129  129  129     67  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     A   118_A     A   118_A    129  129  129     34  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     T   119_A     T   119_A    129  129  129     34  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     T   120_A     T   120_A    129  129  129      7  104  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     V   121_A     V   121_A    129  129  129     52  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     R   122_A     R   122_A    129  129  129     54  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     E   123_A     E   123_A    129  129  129     54  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A    129  129  129     18  105  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A    129  129  129     69  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     P   126_A     P   126_A    129  129  129     67  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     Y   127_A     Y   127_A    129  129  129     67  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     A   128_A     A   128_A    129  129  129     52  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     F   129_A     F   129_A    129  129  129     45  106  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     T   130_A     T   130_A    129  129  129     45  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     E   131_A     E   131_A    129  129  129     68  107  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A    129  129  129     31  103  122  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     D   133_A     D   133_A    129  129  129      3    3   48  115  127  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_GDT     L   134_A     L   134_A    129  129  129      3   77  108  126  128  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129  129 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  96.99  (  96.99   96.99   96.99 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     69    107    122    126    128    129    129    129    129    129    129    129    129    129    129    129    129    129    129    129 
GDT PERCENT_AT  51.88  80.45  91.73  94.74  96.24  96.99  96.99  96.99  96.99  96.99  96.99  96.99  96.99  96.99  96.99  96.99  96.99  96.99  96.99  96.99
GDT RMS_LOCAL    0.32   0.53   0.67   0.74   0.80   0.86   0.86   0.86   0.86   0.86   0.86   0.86   0.86   0.86   0.86   0.86   0.86   0.86   0.86   0.86
GDT RMS_ALL_AT   0.89   0.87   0.86   0.87   0.86   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  Y    25_A      Y    25_A
#   possible swapping detected:  E    37_A      E    37_A
#   possible swapping detected:  E    48_A      E    48_A
#   possible swapping detected:  F    64_A      F    64_A
#   possible swapping detected:  F    74_A      F    74_A
#   possible swapping detected:  F   100_A      F   100_A
#   possible swapping detected:  D   112_A      D   112_A
#   possible swapping detected:  E   131_A      E   131_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    L     6_A      L     6_A     1.644     0    0.591   0.614     5.566   77.143   56.190
LGA    K     7_A      K     7_A     1.263     0    0.030   0.926     4.305   83.690   70.688
LGA    Q     8_A      Q     8_A     1.051     0    0.053   0.880     2.906   85.952   78.836
LGA    E     9_A      E     9_A     0.945     0    0.006   1.020     5.221   90.476   66.667
LGA    W    10_A      W    10_A     0.523     0    0.040   1.285     5.859   95.238   72.245
LGA    I    11_A      I    11_A     0.240     0    0.055   0.050     1.013  100.000   94.107
LGA    N    12_A      N    12_A     0.137     0    0.019   0.053     0.443  100.000  100.000
LGA    T    13_A      T    13_A     0.548     0    0.023   0.180     1.071   92.857   90.544
LGA    A    14_A      A    14_A     0.406     0    0.020   0.022     0.713   95.238   96.190
LGA    I    15_A      I    15_A     0.748     0    0.061   0.124     1.129   90.595   88.274
LGA    E    16_A      E    16_A     1.154     0    0.044   0.692     3.415   83.690   71.693
LGA    A    17_A      A    17_A     1.665     0    0.207   0.212     1.951   75.000   74.571
LGA    L    18_A      L    18_A     1.785     0    0.092   1.177     3.076   70.833   68.988
LGA    D    19_A      D    19_A     1.190     0    0.016   0.150     1.678   83.690   81.488
LGA    K    20_A      K    20_A     0.999     0    0.019   0.870     4.003   88.214   77.619
LGA    A    21_A      A    21_A     0.357     0    0.073   0.066     0.663   97.619   98.095
LGA    Y    22_A      Y    22_A     0.264     0    0.048   0.091     0.762  100.000   96.825
LGA    V    23_A      V    23_A     0.152     0    0.118   1.214     2.333   97.619   88.571
LGA    P    24_A      P    24_A     0.411     0    0.055   0.067     0.768   97.619   95.918
LGA    Y    25_A      Y    25_A     0.318     0    0.013   0.157     1.075  100.000   96.071
LGA    S    26_A      S    26_A     0.256     0    0.015   0.100     0.443  100.000  100.000
LGA    H    27_A      H    27_A     0.348     0    0.080   0.313     2.141  100.000   87.333
LGA    F    28_A      F    28_A     0.335     0    0.029   0.129     1.107   97.619   92.294
LGA    P    29_A      P    29_A     0.540     0    0.027   0.076     0.763   92.857   93.197
LGA    V    30_A      V    30_A     0.434     0    0.009   0.042     0.558  100.000   97.279
LGA    G    31_A      G    31_A     0.373     0    0.018   0.018     0.463  100.000  100.000
LGA    A    32_A      A    32_A     0.225     0    0.017   0.039     0.326  100.000  100.000
LGA    C    33_A      C    33_A     0.353     0    0.098   0.240     0.615  100.000   98.413
LGA    L    34_A      L    34_A     0.484     0    0.028   0.055     0.729   97.619   94.048
LGA    V    35_A      V    35_A     0.618     0    0.036   0.107     0.909   90.476   90.476
LGA    T    36_A      T    36_A     0.401     0    0.009   0.070     0.590  100.000   97.279
LGA    E    37_A      E    37_A     0.549     0    0.052   0.632     2.645   92.857   86.825
LGA    S    38_A      S    38_A     0.634     0    0.018   0.093     0.679   95.238   93.651
LGA    G    39_A      G    39_A     0.498     0    0.074   0.074     0.503   97.619   97.619
LGA    K    40_A      K    40_A     0.386     0    0.018   0.693     2.167  100.000   93.069
LGA    I    41_A      I    41_A     0.516     0    0.064   1.357     3.494   97.619   81.607
LGA    Y    42_A      Y    42_A     0.322     0    0.042   0.156     0.407  100.000  100.000
LGA    Q    43_A      Q    43_A     0.355     0    0.053   0.597     2.314   97.619   86.032
LGA    G    44_A      G    44_A     0.309     0    0.011   0.011     0.381  100.000  100.000
LGA    I    45_A      I    45_A     0.177     0    0.039   0.404     0.913  100.000   96.429
LGA    N    46_A      N    46_A     0.201     0    0.049   0.228     1.126  100.000   97.679
LGA    I    47_A      I    47_A     0.059     0    0.029   0.095     0.215  100.000  100.000
LGA    E    48_A      E    48_A     0.179     0    0.047   0.181     0.652  100.000   98.942
LGA    N    49_A      N    49_A     0.353     0    0.049   0.062     0.444  100.000  100.000
LGA    A    50_A      A    50_A     0.682     0    0.045   0.056     0.792   90.476   90.476
LGA    S    51_A      S    51_A     0.298     0    0.109   0.622     2.165   97.619   92.540
LGA    F    52_A      F    52_A     0.418     0    0.049   0.123     0.581   97.619   98.268
LGA    G    53_A      G    53_A     0.366     0    0.013   0.013     0.426  100.000  100.000
LGA    L    54_A      L    54_A     0.231     0    0.016   0.981     2.799  100.000   91.131
LGA    T    55_A      T    55_A     0.269     0    0.065   0.091     0.528   97.619   98.639
LGA    N    56_A      N    56_A     0.234     0    0.081   0.155     0.652   97.619   97.619
LGA    C    57_A      C    57_A     0.342     0    0.030   0.072     0.431  100.000  100.000
LGA    A    58_A      A    58_A     0.257     0    0.038   0.036     0.324  100.000  100.000
LGA    E    59_A      E    59_A     0.315     0    0.055   0.088     0.372  100.000  100.000
LGA    R    60_A      R    60_A     0.273     0    0.050   0.084     0.354  100.000  100.000
LGA    T    61_A      T    61_A     0.207     0    0.037   0.070     0.409  100.000  100.000
LGA    A    62_A      A    62_A     0.360     0    0.022   0.021     0.444  100.000  100.000
LGA    F    63_A      F    63_A     0.445     0    0.040   0.177     1.044   97.619   93.983
LGA    F    64_A      F    64_A     0.424     0    0.010   0.087     0.500  100.000   99.134
LGA    K    65_A      K    65_A     0.348     0    0.043   1.156     2.420  100.000   89.153
LGA    A    66_A      A    66_A     0.291     0    0.017   0.026     0.386  100.000  100.000
LGA    V    67_A      V    67_A     0.398     0    0.038   0.072     0.487  100.000  100.000
LGA    S    68_A      S    68_A     0.344     0    0.068   0.164     0.865  100.000   96.825
LGA    E    69_A      E    69_A     0.248     0    0.116   0.171     0.741   97.619   98.942
LGA    G    70_A      G    70_A     0.427     0    0.040   0.040     0.637   95.238   95.238
LGA    E    71_A      E    71_A     1.009     0    0.067   0.396     2.476   81.548   76.772
LGA    R    72_A      R    72_A     1.052     0    0.063   1.288     4.138   88.214   79.957
LGA    S    73_A      S    73_A     0.548     0    0.059   0.644     2.336   90.476   87.778
LGA    F    74_A      F    74_A     0.720     0    0.035   0.195     0.873   90.476   91.342
LGA    T    75_A      T    75_A     0.589     0    0.093   0.158     1.014   88.214   89.184
LGA    H    76_A      H    76_A     0.440     0    0.023   1.157     3.704  100.000   84.905
LGA    L    77_A      L    77_A     0.397     0    0.024   0.060     0.471  100.000  100.000
LGA    V    78_A      V    78_A     0.131     0    0.034   1.239     2.709  100.000   87.755
LGA    V    79_A      V    79_A     0.288     0    0.018   0.040     0.380  100.000  100.000
LGA    A    80_A      A    80_A     0.240     0    0.015   0.024     0.411  100.000  100.000
LGA    G    81_A      G    81_A     0.546     0    0.030   0.030     0.946   92.857   92.857
LGA    H    82_A      H    82_A     0.775     0    0.081   0.358     1.528   90.476   86.000
LGA    T    83_A      T    83_A     1.424     0    0.073   0.150     1.612   77.143   78.980
LGA    P    84_A      P    84_A     2.185     0    0.032   0.415     2.847   70.833   67.143
LGA    D    85_A      D    85_A     0.677     0    0.145   0.949     4.455   88.214   72.619
LGA    P    86_A      P    86_A     0.637     0    0.055   0.187     1.346   90.476   87.891
LGA    I    87_A      I    87_A     0.355     0    0.083   0.097     0.572   97.619   98.810
LGA    S    88_A      S    88_A     0.318     0    0.053   0.070     0.500  100.000  100.000
LGA    P    89_A      P    89_A     0.254     0    0.041   0.079     0.304  100.000  100.000
LGA    C    90_A      C    90_A     0.371     0    0.064   0.106     0.617   97.619   96.825
LGA    G    91_A      G    91_A     0.477     0    0.042   0.042     0.477  100.000  100.000
LGA    A    92_A      A    92_A     0.450     0    0.022   0.043     0.561  100.000   98.095
LGA    C    93_A      C    93_A     0.399     0    0.049   0.058     0.481  100.000  100.000
LGA    R    94_A      R    94_A     0.494     0    0.040   0.174     0.623   95.238   95.671
LGA    Q    95_A      Q    95_A     0.653     0    0.053   0.069     0.835   90.476   90.476
LGA    V    96_A      V    96_A     0.568     0    0.073   0.073     0.745   90.476   94.558
LGA    M    97_A      M    97_A     0.603     0    0.029   0.728     2.796   90.476   86.310
LGA    A    98_A      A    98_A     0.781     0    0.036   0.035     1.010   88.214   88.667
LGA    E    99_A      E    99_A     0.785     0    0.056   0.231     1.116   90.476   88.466
LGA    F   100_A      F   100_A     1.214     0    0.030   0.318     1.850   83.690   79.134
LGA    C   101_A      C   101_A     0.939     0    0.050   0.121     1.042   85.952   87.460
LGA    A   102_A      A   102_A     1.426     0    0.032   0.070     2.048   81.429   78.095
LGA    P   103_A      P   103_A     1.355     0    0.151   0.337     1.650   77.143   77.755
LGA    D   104_A      D   104_A     2.262     0    0.135   0.647     4.382   70.833   59.702
LGA    M   105_A      M   105_A     1.273     0    0.056   0.635     2.214   81.548   80.536
LGA    P   106_A      P   106_A     0.620     0    0.095   0.247     0.957   92.857   93.197
LGA    V   107_A      V   107_A     0.406     0    0.027   0.060     0.493  100.000  100.000
LGA    T   108_A      T   108_A     0.277     0    0.034   0.116     0.434  100.000  100.000
LGA    L   109_A      L   109_A     0.284     0    0.039   0.070     0.692   97.619   96.429
LGA    V   110_A      V   110_A     0.678     0    0.115   0.891     2.943   97.619   88.503
LGA    G   111_A      G   111_A     0.666     0    0.025   0.025     1.288   88.333   88.333
LGA    D   112_A      D   112_A     1.959     0    0.671   1.149     3.800   65.476   70.595
LGA    N   113_A      N   113_A     1.497     0    0.071   1.105     6.521   81.429   57.083
LGA    G   114_A      G   114_A     1.127     0    0.027   0.027     1.429   81.429   81.429
LGA    V   115_A      V   115_A     1.067     0    0.069   1.049     3.439   85.952   78.299
LGA    T   116_A      T   116_A     0.693     0    0.129   1.075     2.695   90.476   84.422
LGA    K   117_A      K   117_A     0.562     0    0.010   0.668     2.074   95.238   88.730
LGA    A   118_A      A   118_A     0.798     0    0.071   0.075     1.133   90.476   88.667
LGA    T   119_A      T   119_A     0.824     0    0.133   0.197     1.154   88.214   86.599
LGA    T   120_A      T   120_A     1.171     0    0.036   0.148     1.623   85.952   82.789
LGA    V   121_A      V   121_A     0.826     0    0.031   0.059     0.896   90.476   90.476
LGA    R   122_A      R   122_A     0.887     0    0.017   1.203     4.701   90.476   79.913
LGA    E   123_A      E   123_A     0.860     0    0.065   0.567     2.823   90.476   83.757
LGA    L   124_A      L   124_A     1.105     0    0.069   1.367     4.158   88.214   78.214
LGA    L   125_A      L   125_A     0.270     0    0.020   0.120     1.339  100.000   94.167
LGA    P   126_A      P   126_A     0.696     0    0.088   0.108     1.502   90.476   85.374
LGA    Y   127_A      Y   127_A     0.607     0    0.036   1.295     8.526   95.238   57.619
LGA    A   128_A      A   128_A     0.933     0    0.015   0.016     1.329   90.476   88.667
LGA    F   129_A      F   129_A     1.017     0    0.015   0.134     1.684   83.690   80.693
LGA    T   130_A      T   130_A     0.933     0    0.016   0.973     2.284   88.214   81.701
LGA    E   131_A      E   131_A     0.488     0    0.161   0.874     4.642   90.595   73.016
LGA    K   132_A      K   132_A     1.158     0    0.068   0.608     4.923   71.667   59.683
LGA    D   133_A      D   133_A     3.475     0    0.098   0.188     5.365   50.119   40.952
LGA    L   134_A      L   134_A     2.585     0    0.061   0.972     3.831   55.357   59.405

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      129     516    516  100.00     982    982  100.00               133
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.855          0.872                  1.413           89.647   85.791

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  129  133    4.0    129    0.86    92.293    95.086    13.508

LGA_LOCAL      RMSD:   0.855  Number of atoms:  129  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.855  Number of assigned atoms:  129 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.855  Standard rmsd on all 129 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.332216 * X  +  -0.804498 * Y  +   0.492357 * Z  +  -5.040057
  Y_new =   0.181456 * X  +  -0.457740 * Y  +  -0.870372 * Z  + 109.182838
  Z_new =   0.925584 * X  +   0.378493 * Y  +  -0.006088 * Z  + -48.329472 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  0.499919 -1.182576  1.586879   [DEG:   28.6433  -67.7566   90.9215 ]
ZXZ:  0.514806  1.576884  1.182621   [DEG:   29.4962   90.3488   67.7592 ]
 
# END of job
