
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  134 ( 1014),  selected  133 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  133 ( 1010),  selected  133 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       1.06     1.06
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       1.06     1.06
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   132       2_A - 133_A       0.94     1.06
  LCS_AVERAGE:     98.52

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  133
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S     2_A     S     2_A    132  133  133     76  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M     3_A     M     3_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A     4_A     A     4_A    132  133  133     76  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     5_A     E     5_A    132  133  133     76  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L     6_A     L     6_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K     7_A     K     7_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q     8_A     Q     8_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     9_A     E     9_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     W    10_A     W    10_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    11_A     I    11_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    12_A     N    12_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    13_A     T    13_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    15_A     I    15_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    16_A     E    16_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    17_A     A    17_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    18_A     L    18_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    19_A     D    19_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    20_A     K    20_A    132  133  133     67  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    21_A     A    21_A    132  133  133     67  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    22_A     Y    22_A    132  133  133     67  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A    132  133  133     73  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    24_A     P    24_A    132  133  133     30  112  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    25_A     Y    25_A    132  133  133     69  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    26_A     S    26_A    132  133  133     24  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    27_A     H    27_A    132  133  133     18  110  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    28_A     F    28_A    132  133  133     48  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    29_A     P    29_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    30_A     V    30_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    31_A     G    31_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    32_A     A    32_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    33_A     C    33_A    132  133  133     45  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    34_A     L    34_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    35_A     V    35_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    36_A     T    36_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    37_A     E    37_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    38_A     S    38_A    132  133  133     73  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    39_A     G    39_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    40_A     K    40_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    42_A     Y    42_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    43_A     Q    43_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    44_A     G    44_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    45_A     I    45_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    46_A     N    46_A    132  133  133     73  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    47_A     I    47_A    132  133  133     72  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    48_A     E    48_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    49_A     N    49_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    50_A     A    50_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    132  133  133     74  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    52_A     F    52_A    132  133  133      4  112  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    53_A     G    53_A    132  133  133      8  112  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    54_A     L    54_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    55_A     T    55_A    132  133  133     71  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    56_A     N    56_A    132  133  133     74  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    57_A     C    57_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    58_A     A    58_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    59_A     E    59_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    60_A     R    60_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    61_A     T    61_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    62_A     A    62_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    63_A     F    63_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    64_A     F    64_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    65_A     K    65_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    66_A     A    66_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    67_A     V    67_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    68_A     S    68_A    132  133  133     69  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    69_A     E    69_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    70_A     G    70_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    71_A     E    71_A    132  133  133     75  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A    132  133  133     11   74  126  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    73_A     S    73_A    132  133  133     60  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    74_A     F    74_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    75_A     T    75_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    76_A     H    76_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    77_A     L    77_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    78_A     V    78_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    79_A     V    79_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    80_A     A    80_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    81_A     G    81_A    132  133  133     74  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    82_A     H    82_A    132  133  133     34  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    83_A     T    83_A    132  133  133     44  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    84_A     P    84_A    132  133  133     59  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    85_A     D    85_A    132  133  133     64  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    86_A     P    86_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    87_A     I    87_A    132  133  133     68  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    88_A     S    88_A    132  133  133     17   96  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    89_A     P    89_A    132  133  133     37  110  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    90_A     C    90_A    132  133  133     68  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    91_A     G    91_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    92_A     A    92_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    93_A     C    93_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    95_A     Q    95_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A    132  133  133     76  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M    97_A     M    97_A    132  133  133     76  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    98_A     A    98_A    132  133  133     45  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    99_A     E    99_A    132  133  133     33  106  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    132  133  133      5  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C   101_A     C   101_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   103_A     P   103_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   104_A     D   104_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M   105_A     M   105_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   106_A     P   106_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   107_A     V   107_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   108_A     T   108_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   109_A     L   109_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   110_A     V   110_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   111_A     G   111_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   112_A     D   112_A    132  133  133     34  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A    132  133  133      7   53   98  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   114_A     G   114_A    132  133  133     44  112  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   115_A     V   115_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   116_A     T   116_A    132  133  133     76  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   117_A     K   117_A    132  133  133     73  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   118_A     A   118_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   119_A     T   119_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   120_A     T   120_A    132  133  133     76  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   121_A     V   121_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R   122_A     R   122_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   123_A     E   123_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A    132  133  133     77  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A    132  133  133     17  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   126_A     P   126_A    132  133  133     33  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y   127_A     Y   127_A    132  133  133     43  104  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   128_A     A   128_A    132  133  133     59  113  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   129_A     F   129_A    132  133  133     14  102  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   130_A     T   130_A    132  133  133      3  108  127  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   131_A     E   131_A    132  133  133      4   64  122  130  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A    132  133  133      4    6   25   88  128  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   133_A     D   133_A    132  133  133      4    4    5   11   13   16   22  130  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   134_A     L   134_A      4  133  133      4    4    5    6   52   74  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  99.51  (  98.52  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     77    113    127    130    130    131    131    132    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133 
GDT PERCENT_AT  57.89  84.96  95.49  97.74  97.74  98.50  98.50  99.25 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.30   0.49   0.63   0.70   0.70   0.77   0.77   0.92   1.06   1.06   1.06   1.06   1.06   1.06   1.06   1.06   1.06   1.06   1.06   1.06
GDT RMS_ALL_AT   1.13   1.11   1.09   1.08   1.08   1.08   1.08   1.06   1.06   1.06   1.06   1.06   1.06   1.06   1.06   1.06   1.06   1.06   1.06   1.06

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  Y    25_A      Y    25_A
#   possible swapping detected:  F    74_A      F    74_A
#   possible swapping detected:  E    99_A      E    99_A
#   possible swapping detected:  F   100_A      F   100_A
#   possible swapping detected:  Y   127_A      Y   127_A
#   possible swapping detected:  F   129_A      F   129_A
#   possible swapping detected:  E   131_A      E   131_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S     2_A      S     2_A     0.392     0    0.669   0.803     4.472   91.190   75.317
LGA    M     3_A      M     3_A     0.205     0    0.044   0.196     0.699  100.000   98.810
LGA    A     4_A      A     4_A     0.354     0    0.067   0.067     0.611   97.619   96.190
LGA    E     5_A      E     5_A     0.508     0    0.036   0.269     1.424   95.238   89.577
LGA    L     6_A      L     6_A     0.523     0    0.029   0.146     0.763   92.857   92.857
LGA    K     7_A      K     7_A     0.347     0    0.031   0.931     4.607  100.000   77.566
LGA    Q     8_A      Q     8_A     0.389     0    0.027   1.477     5.470  100.000   74.603
LGA    E     9_A      E     9_A     0.493     0    0.014   0.775     2.365  100.000   83.280
LGA    W    10_A      W    10_A     0.372     0    0.033   0.104     0.614  100.000   97.279
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LGA    N    12_A      N    12_A     0.336     0    0.023   0.051     0.635  100.000   96.429
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LGA    F   100_A      F   100_A     0.976     0    0.018   0.120     2.327   90.476   77.836
LGA    C   101_A      C   101_A     0.487     0    0.023   0.048     0.715   97.619   95.238
LGA    A   102_A      A   102_A     0.303     0    0.033   0.047     0.376  100.000  100.000
LGA    P   103_A      P   103_A     0.454     0    0.070   0.068     0.654  100.000   95.918
LGA    D   104_A      D   104_A     0.434     0    0.022   1.224     4.337  100.000   82.143
LGA    M   105_A      M   105_A     0.314     0    0.035   0.566     1.530  100.000   94.226
LGA    P   106_A      P   106_A     0.517     0    0.018   0.244     0.795   97.619   94.558
LGA    V   107_A      V   107_A     0.426     0    0.026   0.033     0.472  100.000  100.000
LGA    T   108_A      T   108_A     0.311     0    0.035   0.066     0.355  100.000  100.000
LGA    L   109_A      L   109_A     0.156     0    0.046   0.090     0.335  100.000  100.000
LGA    V   110_A      V   110_A     0.189     0    0.091   0.157     0.750   97.619   97.279
LGA    G   111_A      G   111_A     0.383     0    0.097   0.097     0.383  100.000  100.000
LGA    D   112_A      D   112_A     1.132     0    0.629   1.062     2.856   77.619   80.655
LGA    N   113_A      N   113_A     2.347     0    0.107   0.741     5.758   70.952   54.583
LGA    G   114_A      G   114_A     1.251     0    0.044   0.044     1.629   83.810   83.810
LGA    V   115_A      V   115_A     0.596     0    0.051   1.131     3.332   92.857   82.381
LGA    T   116_A      T   116_A     0.476     0    0.110   1.087     2.644   92.976   84.626
LGA    K   117_A      K   117_A     0.639     0    0.058   0.936     4.380   97.619   74.444
LGA    A   118_A      A   118_A     0.659     0    0.058   0.078     1.229   97.619   94.381
LGA    T   119_A      T   119_A     0.384     0    0.140   0.248     1.312   92.976   95.986
LGA    T   120_A      T   120_A     0.550     0    0.036   0.048     0.715   95.238   93.197
LGA    V   121_A      V   121_A     0.345     0    0.011   0.019     0.408  100.000  100.000
LGA    R   122_A      R   122_A     0.363     0    0.034   1.219     7.827  100.000   67.186
LGA    E   123_A      E   123_A     0.319     0    0.019   0.252     1.077  100.000   97.937
LGA    L   124_A      L   124_A     0.264     0    0.062   0.082     0.751   97.619   96.429
LGA    L   125_A      L   125_A     0.776     0    0.046   1.340     3.428   92.857   82.143
LGA    P   126_A      P   126_A     0.930     0    0.668   0.616     3.329   78.095   83.401
LGA    Y   127_A      Y   127_A     1.517     0    0.151   1.318     9.425   81.548   47.183
LGA    A   128_A      A   128_A     0.814     0    0.018   0.034     1.297   85.952   85.048
LGA    F   129_A      F   129_A     1.395     0    0.018   1.248     7.557   88.214   50.736
LGA    T   130_A      T   130_A     1.307     0    0.018   0.104     3.021   75.119   68.571
LGA    E   131_A      E   131_A     2.034     0    0.104   1.016     4.212   62.976   56.931
LGA    K   132_A      K   132_A     3.696     0    0.131   0.607    10.610   37.738   21.852
LGA    D   133_A      D   133_A     6.090     0    0.192   0.238     8.290   19.762   13.929
LGA    L   134_A      L   134_A     5.724     0    0.542   1.258     8.493   25.119   18.690

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      133     532    532  100.00    1010   1010  100.00               133
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.058          1.098                  1.835           91.950   86.356

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  134  133    4.0    132    0.92    95.489    97.952    12.883

LGA_LOCAL      RMSD:   0.925  Number of atoms:  132  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.062  Number of assigned atoms:  133 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.058  Standard rmsd on all 133 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.964423 * X  +   0.181777 * Y  +  -0.191953 * Z  + -31.695261
  Y_new =   0.096767 * X  +   0.918432 * Y  +   0.383560 * Z  +   2.653511
  Z_new =   0.246018 * X  +   0.351339 * Y  +  -0.903347 * Z  + -12.159531 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  3.041590 -0.248570  2.770665   [DEG:  174.2703  -14.2420  158.7474 ]
ZXZ: -2.677585  2.698306  0.610880   [DEG: -153.4143  154.6015   35.0008 ]
 
# END of job
