
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  134 ( 1014),  selected  133 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  133 ( 1010),  selected  133 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       1.02     1.02
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       1.02     1.02
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   132       2_A - 133_A       0.93     1.02
  LCS_AVERAGE:     98.52

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  133
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S     2_A     S     2_A    132  133  133     77  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M     3_A     M     3_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A     4_A     A     4_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     5_A     E     5_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L     6_A     L     6_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K     7_A     K     7_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q     8_A     Q     8_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     9_A     E     9_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     W    10_A     W    10_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    11_A     I    11_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    12_A     N    12_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    13_A     T    13_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    15_A     I    15_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    16_A     E    16_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    17_A     A    17_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    18_A     L    18_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    19_A     D    19_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    20_A     K    20_A    132  133  133     67  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    21_A     A    21_A    132  133  133     67  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    22_A     Y    22_A    132  133  133     67  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A    132  133  133     76  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    24_A     P    24_A    132  133  133     38  112  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    25_A     Y    25_A    132  133  133     74  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    26_A     S    26_A    132  133  133     44  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    27_A     H    27_A    132  133  133     38  112  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    28_A     F    28_A    132  133  133     48  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    29_A     P    29_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    30_A     V    30_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    31_A     G    31_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    32_A     A    32_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    33_A     C    33_A    132  133  133     51  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    34_A     L    34_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    35_A     V    35_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    36_A     T    36_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    37_A     E    37_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    38_A     S    38_A    132  133  133     78  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    39_A     G    39_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    40_A     K    40_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    42_A     Y    42_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    43_A     Q    43_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    44_A     G    44_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    45_A     I    45_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    46_A     N    46_A    132  133  133     77  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    47_A     I    47_A    132  133  133     76  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    48_A     E    48_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    49_A     N    49_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    50_A     A    50_A    132  133  133     33  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    132  133  133     25  107  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    52_A     F    52_A    132  133  133      5  107  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    53_A     G    53_A    132  133  133     19   70  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    54_A     L    54_A    132  133  133     72  114  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    55_A     T    55_A    132  133  133     75  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    56_A     N    56_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    57_A     C    57_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    58_A     A    58_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    59_A     E    59_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    60_A     R    60_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    61_A     T    61_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    62_A     A    62_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    63_A     F    63_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    64_A     F    64_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    65_A     K    65_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    66_A     A    66_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    67_A     V    67_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    68_A     S    68_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    69_A     E    69_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    70_A     G    70_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    71_A     E    71_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A    132  133  133     15   66  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    73_A     S    73_A    132  133  133     31  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    74_A     F    74_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    75_A     T    75_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    76_A     H    76_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    77_A     L    77_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    78_A     V    78_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    79_A     V    79_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    80_A     A    80_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    81_A     G    81_A    132  133  133     48  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    82_A     H    82_A    132  133  133     58  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    83_A     T    83_A    132  133  133     51  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    84_A     P    84_A    132  133  133     51  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    85_A     D    85_A    132  133  133     51  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    86_A     P    86_A    132  133  133     71  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    87_A     I    87_A    132  133  133     68  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    88_A     S    88_A    132  133  133     16  105  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    89_A     P    89_A    132  133  133     46  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    90_A     C    90_A    132  133  133     71  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    91_A     G    91_A    132  133  133     77  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    92_A     A    92_A    132  133  133     71  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    93_A     C    93_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    95_A     Q    95_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M    97_A     M    97_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    98_A     A    98_A    132  133  133     75  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    99_A     E    99_A    132  133  133     48  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C   101_A     C   101_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   103_A     P   103_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   104_A     D   104_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M   105_A     M   105_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   106_A     P   106_A    132  133  133     78  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   107_A     V   107_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   108_A     T   108_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   109_A     L   109_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   110_A     V   110_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   111_A     G   111_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   112_A     D   112_A    132  133  133     35  114  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A    132  133  133      6   60  125  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   114_A     G   114_A    132  133  133      6  113  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   115_A     V   115_A    132  133  133     78  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   116_A     T   116_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   117_A     K   117_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   118_A     A   118_A    132  133  133     37  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   119_A     T   119_A    132  133  133     78  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   120_A     T   120_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   121_A     V   121_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R   122_A     R   122_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   123_A     E   123_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A    132  133  133     80  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A    132  133  133     38  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   126_A     P   126_A    132  133  133     38  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y   127_A     Y   127_A    132  133  133     74  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   128_A     A   128_A    132  133  133     75  115  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   129_A     F   129_A    132  133  133     17  104  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   130_A     T   130_A    132  133  133      4  109  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   131_A     E   131_A    132  133  133      4   28  119  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A    132  133  133      4    7   23   71  127  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   133_A     D   133_A    132  133  133      4    4    5   12   19   26   51  131  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   134_A     L   134_A      4  133  133      4    4    5   13   64  125  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  99.51  (  98.52  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     80    115    126    129    130    131    131    132    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133 
GDT PERCENT_AT  60.15  86.47  94.74  96.99  97.74  98.50  98.50  99.25 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.31   0.51   0.61   0.66   0.69   0.77   0.77   0.89   1.02   1.02   1.02   1.02   1.02   1.02   1.02   1.02   1.02   1.02   1.02   1.02
GDT RMS_ALL_AT   1.07   1.05   1.06   1.05   1.04   1.03   1.03   1.02   1.02   1.02   1.02   1.02   1.02   1.02   1.02   1.02   1.02   1.02   1.02   1.02

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  Y    25_A      Y    25_A
#   possible swapping detected:  E    59_A      E    59_A
#   possible swapping detected:  F    63_A      F    63_A
#   possible swapping detected:  F    74_A      F    74_A
#   possible swapping detected:  E    99_A      E    99_A
#   possible swapping detected:  F   100_A      F   100_A
#   possible swapping detected:  Y   127_A      Y   127_A
#   possible swapping detected:  F   129_A      F   129_A
#   possible swapping detected:  E   131_A      E   131_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S     2_A      S     2_A     0.291     0    0.669   0.804     4.337   91.190   75.317
LGA    M     3_A      M     3_A     0.199     0    0.050   0.206     0.618  100.000   97.619
LGA    A     4_A      A     4_A     0.232     0    0.071   0.071     0.454  100.000  100.000
LGA    E     5_A      E     5_A     0.287     0    0.038   0.270     1.210  100.000   94.762
LGA    L     6_A      L     6_A     0.352     0    0.037   0.144     0.484  100.000  100.000
LGA    K     7_A      K     7_A     0.385     0    0.030   0.928     4.817  100.000   76.931
LGA    Q     8_A      Q     8_A     0.391     0    0.027   1.477     5.425  100.000   74.603
LGA    E     9_A      E     9_A     0.328     0    0.013   0.776     2.602  100.000   83.492
LGA    W    10_A      W    10_A     0.322     0    0.031   0.122     0.825  100.000   97.279
LGA    I    11_A      I    11_A     0.390     0    0.031   0.055     0.574  100.000   96.429
LGA    N    12_A      N    12_A     0.340     0    0.021   0.047     0.744  100.000   96.429
LGA    T    13_A      T    13_A     0.398     0    0.026   0.136     0.979  100.000   97.279
LGA    A    14_A      A    14_A     0.280     0    0.015   0.019     0.312  100.000  100.000
LGA    I    15_A      I    15_A     0.210     0    0.045   0.073     0.341  100.000  100.000
LGA    E    16_A      E    16_A     0.344     0    0.029   0.151     1.008  100.000   94.762
LGA    A    17_A      A    17_A     0.498     0    0.053   0.058     0.630   97.619   96.190
LGA    L    18_A      L    18_A     0.400     0    0.022   0.115     0.798  100.000   96.429
LGA    D    19_A      D    19_A     0.451     0    0.045   0.152     1.041   95.238   91.726
LGA    K    20_A      K    20_A     0.696     0    0.046   0.557     1.281   90.476   87.460
LGA    A    21_A      A    21_A     0.820     0    0.044   0.054     1.039   88.214   88.667
LGA    Y    22_A      Y    22_A     1.061     0    0.031   0.060     1.780   88.214   80.833
LGA    V    23_A      V    23_A     0.749     0    0.030   0.056     1.034   88.214   90.544
LGA    P    24_A      P    24_A     1.192     0    0.025   0.059     1.290   81.429   81.429
LGA    Y    25_A      Y    25_A     0.846     0    0.036   0.129     1.748   88.214   85.238
LGA    S    26_A      S    26_A     0.838     0    0.003   0.656     2.757   85.952   81.905
LGA    H    27_A      H    27_A     1.141     0    0.029   0.296     2.439   83.690   75.619
LGA    F    28_A      F    28_A     0.710     0    0.042   0.713     2.421   95.238   83.463
LGA    P    29_A      P    29_A     0.284     0    0.066   0.076     0.618   97.619   97.279
LGA    V    30_A      V    30_A     0.347     0    0.007   0.018     0.675  100.000   98.639
LGA    G    31_A      G    31_A     0.264     0    0.033   0.033     0.270  100.000  100.000
LGA    A    32_A      A    32_A     0.185     0    0.032   0.048     1.028   92.976   92.476
LGA    C    33_A      C    33_A     0.802     0    0.108   0.845     2.826   92.857   85.000
LGA    L    34_A      L    34_A     0.406     0    0.036   1.028     2.892  100.000   86.667
LGA    V    35_A      V    35_A     0.343     0    0.047   0.129     0.887   97.619   95.918
LGA    T    36_A      T    36_A     0.562     0    0.016   0.078     0.682   90.476   90.476
LGA    E    37_A      E    37_A     0.645     0    0.009   0.502     2.194   90.476   81.746
LGA    S    38_A      S    38_A     0.797     0    0.047   0.046     0.797   90.476   90.476
LGA    G    39_A      G    39_A     0.664     0    0.052   0.052     0.723   90.476   90.476
LGA    K    40_A      K    40_A     0.512     0    0.029   0.683     4.214   95.238   75.026
LGA    I    41_A      I    41_A     0.212     0    0.057   1.229     2.806  100.000   85.833
LGA    Y    42_A      Y    42_A     0.210     0    0.039   0.064     0.279  100.000  100.000
LGA    Q    43_A      Q    43_A     0.226     0    0.043   0.096     0.451  100.000  100.000
LGA    G    44_A      G    44_A     0.511     0    0.033   0.033     0.511   97.619   97.619
LGA    I    45_A      I    45_A     0.350     0    0.046   0.887     3.153   92.976   80.298
LGA    N    46_A      N    46_A     0.701     0    0.114   1.004     3.394   90.476   82.083
LGA    I    47_A      I    47_A     0.807     0    0.055   0.656     3.429   90.476   84.286
LGA    E    48_A      E    48_A     0.740     0    0.098   0.180     1.399   88.214   92.646
LGA    N    49_A      N    49_A     0.838     0    0.050   1.049     4.600   90.476   73.869
LGA    A    50_A      A    50_A     1.222     0    0.068   0.076     1.715   79.286   79.714
LGA    S    51_A      S    51_A     1.518     0    0.586   0.801     3.102   69.286   68.095
LGA    F    52_A      F    52_A     1.468     0    0.611   0.870     3.102   69.286   63.636
LGA    G    53_A      G    53_A     1.822     0    0.251   0.251     2.449   70.833   70.833
LGA    L    54_A      L    54_A     1.013     0    0.336   0.343     2.251   85.952   78.452
LGA    T    55_A      T    55_A     0.490     0    0.110   1.164     2.521   92.857   83.401
LGA    N    56_A      N    56_A     0.663     0    0.077   0.843     3.881   92.857   80.357
LGA    C    57_A      C    57_A     0.274     0    0.040   0.057     0.350  100.000  100.000
LGA    A    58_A      A    58_A     0.212     0    0.018   0.027     0.263  100.000  100.000
LGA    E    59_A      E    59_A     0.230     0    0.018   0.543     1.577  100.000   93.862
LGA    R    60_A      R    60_A     0.291     0    0.047   1.150     4.666  100.000   83.117
LGA    T    61_A      T    61_A     0.235     0    0.010   0.046     0.256  100.000  100.000
LGA    A    62_A      A    62_A     0.304     0    0.014   0.021     0.321  100.000  100.000
LGA    F    63_A      F    63_A     0.316     0    0.006   0.108     0.940  100.000   95.671
LGA    F    64_A      F    64_A     0.447     0    0.037   0.098     1.812  100.000   86.667
LGA    K    65_A      K    65_A     0.332     0    0.020   0.613     1.644  100.000   93.862
LGA    A    66_A      A    66_A     0.183     0    0.006   0.016     0.205  100.000  100.000
LGA    V    67_A      V    67_A     0.289     0    0.056   0.083     0.576  100.000   98.639
LGA    S    68_A      S    68_A     0.383     0    0.088   0.710     2.104  100.000   94.127
LGA    E    69_A      E    69_A     0.270     0    0.032   0.820     3.401  100.000   86.455
LGA    G    70_A      G    70_A     0.250     0    0.039   0.039     0.309  100.000  100.000
LGA    E    71_A      E    71_A     0.270     0    0.150   0.229     2.720   90.833   81.005
LGA    R    72_A      R    72_A     1.510     0    0.075   0.760     2.625   79.405   74.632
LGA    S    73_A      S    73_A     1.197     0    0.044   0.046     1.719   85.952   83.016
LGA    F    74_A      F    74_A     0.390     0    0.037   0.084     0.788   97.619   94.805
LGA    T    75_A      T    75_A     0.423     0    0.039   0.067     0.603   97.619   98.639
LGA    H    76_A      H    76_A     0.276     0    0.062   1.160     2.731  100.000   89.571
LGA    L    77_A      L    77_A     0.207     0    0.018   0.812     2.399  100.000   92.083
LGA    V    78_A      V    78_A     0.340     0    0.035   1.185     2.531  100.000   88.844
LGA    V    79_A      V    79_A     0.124     0    0.008   0.132     0.731  100.000   98.639
LGA    A    80_A      A    80_A     0.162     0    0.039   0.041     0.431  100.000  100.000
LGA    G    81_A      G    81_A     0.978     0    0.065   0.065     0.978   90.476   90.476
LGA    H    82_A      H    82_A     0.865     0    0.087   1.090     2.941   88.214   82.762
LGA    T    83_A      T    83_A     0.972     0    0.041   0.143     1.116   88.214   85.306
LGA    P    84_A      P    84_A     0.855     0    0.036   0.078     0.986   90.476   90.476
LGA    D    85_A      D    85_A     0.968     0    0.019   0.057     1.784   88.214   81.607
LGA    P    86_A      P    86_A     0.633     0    0.020   0.029     0.816   90.476   90.476
LGA    I    87_A      I    87_A     0.806     0    0.145   1.049     2.781   86.071   79.702
LGA    S    88_A      S    88_A     1.329     0    0.117   0.137     2.057   83.690   78.730
LGA    P    89_A      P    89_A     0.989     0    0.099   0.311     1.517   88.214   84.082
LGA    C    90_A      C    90_A     0.702     0    0.033   0.051     0.814   90.476   90.476
LGA    G    91_A      G    91_A     0.772     0    0.090   0.090     0.772   92.857   92.857
LGA    A    92_A      A    92_A     0.652     0    0.014   0.021     0.854   95.238   94.286
LGA    C    93_A      C    93_A     0.290     0    0.009   0.067     0.409  100.000  100.000
LGA    R    94_A      R    94_A     0.162     0    0.030   0.222     1.278  100.000   94.892
LGA    Q    95_A      Q    95_A     0.153     0    0.057   0.251     0.596  100.000   97.884
LGA    V    96_A      V    96_A     0.247     0    0.043   0.048     0.531   97.619   98.639
LGA    M    97_A      M    97_A     0.351     0    0.040   0.921     2.711  100.000   92.262
LGA    A    98_A      A    98_A     0.504     0    0.035   0.038     0.642   92.857   94.286
LGA    E    99_A      E    99_A     0.716     0    0.042   1.045     3.440   95.238   75.185
LGA    F   100_A      F   100_A     0.397     0    0.020   0.127     0.458  100.000  100.000
LGA    C   101_A      C   101_A     0.247     0    0.019   0.050     0.342  100.000  100.000
LGA    A   102_A      A   102_A     0.193     0    0.027   0.030     0.286  100.000  100.000
LGA    P   103_A      P   103_A     0.349     0    0.077   0.336     0.731  100.000   97.279
LGA    D   104_A      D   104_A     0.336     0    0.040   1.264     4.680  100.000   80.714
LGA    M   105_A      M   105_A     0.365     0    0.020   0.656     2.165   95.238   90.833
LGA    P   106_A      P   106_A     0.648     0    0.056   0.279     0.841   92.857   91.837
LGA    V   107_A      V   107_A     0.598     0    0.037   0.049     0.822   90.476   90.476
LGA    T   108_A      T   108_A     0.451     0    0.037   0.073     0.526   97.619   98.639
LGA    L   109_A      L   109_A     0.275     0    0.047   0.106     0.411  100.000  100.000
LGA    V   110_A      V   110_A     0.117     0    0.097   0.165     0.832   97.619   97.279
LGA    G   111_A      G   111_A     0.173     0    0.093   0.093     0.211  100.000  100.000
LGA    D   112_A      D   112_A     1.019     0    0.638   1.060     3.083   75.833   78.690
LGA    N   113_A      N   113_A     1.979     0    0.130   0.807     5.660   79.405   59.583
LGA    G   114_A      G   114_A     1.118     0    0.055   0.055     1.410   85.952   85.952
LGA    V   115_A      V   115_A     0.599     0    0.053   1.128     3.256   90.476   81.020
LGA    T   116_A      T   116_A     0.382     0    0.109   1.091     2.611   92.976   84.830
LGA    K   117_A      K   117_A     0.488     0    0.097   0.960     4.283  100.000   76.984
LGA    A   118_A      A   118_A     0.894     0    0.011   0.015     1.422   90.476   88.667
LGA    T   119_A      T   119_A     0.751     0    0.224   1.018     2.874   81.786   78.231
LGA    T   120_A      T   120_A     0.554     0    0.026   0.062     0.638   92.857   91.837
LGA    V   121_A      V   121_A     0.442     0    0.012   0.030     0.564  100.000   97.279
LGA    R   122_A      R   122_A     0.402     0    0.049   1.089     4.477  100.000   88.615
LGA    E   123_A      E   123_A     0.430     0    0.011   0.532     1.947  100.000   92.751
LGA    L   124_A      L   124_A     0.283     0    0.059   0.079     0.991   97.619   95.238
LGA    L   125_A      L   125_A     0.727     0    0.045   1.335     3.203   92.857   83.274
LGA    P   126_A      P   126_A     0.811     0    0.060   0.060     1.003   88.214   89.184
LGA    Y   127_A      Y   127_A     0.595     0    0.156   1.295     8.523   90.476   56.032
LGA    A   128_A      A   128_A     0.582     0    0.030   0.034     1.206   88.214   88.667
LGA    F   129_A      F   129_A     1.523     0    0.031   1.264     7.725   86.071   49.697
LGA    T   130_A      T   130_A     1.356     0    0.033   0.113     3.096   75.119   68.571
LGA    E   131_A      E   131_A     2.189     0    0.112   1.024     4.483   62.976   55.291
LGA    K   132_A      K   132_A     3.850     0    0.142   0.606    10.912   37.738   21.270
LGA    D   133_A      D   133_A     5.805     0    0.139   0.205     7.913   21.905   16.131
LGA    L   134_A      L   134_A     5.064     0    0.581   1.355     6.392   34.762   28.869

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      133     532    532  100.00    1010   1010  100.00               133
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.019          1.052                  1.707           92.269   86.928

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  134  133    4.0    132    0.89    95.677    97.962    13.283

LGA_LOCAL      RMSD:   0.894  Number of atoms:  132  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.023  Number of assigned atoms:  133 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.019  Standard rmsd on all 133 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.854957 * X  +  -0.072613 * Y  +   0.513591 * Z  + -31.217190
  Y_new =   0.173968 * X  +   0.892660 * Y  +   0.415805 * Z  +   3.118811
  Z_new =  -0.488655 * X  +   0.444844 * Y  +  -0.750553 * Z  +  -9.165361 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  2.940852  0.510547  2.606567   [DEG:  168.4984   29.2522  149.3453 ]
ZXZ:  2.251365  2.419696 -0.832296   [DEG:  128.9937  138.6384  -47.6870 ]
 
# END of job
