
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  134 ( 1014),  selected  133 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  133 ( 1010),  selected  133 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       1.09     1.09
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       1.09     1.09
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   132       2_A - 133_A       1.00     1.09
  LCS_AVERAGE:     98.52

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  133
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S     2_A     S     2_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M     3_A     M     3_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A     4_A     A     4_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     5_A     E     5_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L     6_A     L     6_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K     7_A     K     7_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q     8_A     Q     8_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     9_A     E     9_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     W    10_A     W    10_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    11_A     I    11_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    12_A     N    12_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    13_A     T    13_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    15_A     I    15_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    16_A     E    16_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    17_A     A    17_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    18_A     L    18_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    19_A     D    19_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    20_A     K    20_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    21_A     A    21_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    22_A     Y    22_A    132  133  133     66  110  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A    132  133  133     72  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    24_A     P    24_A    132  133  133     32  107  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    25_A     Y    25_A    132  133  133     72  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    26_A     S    26_A    132  133  133     42  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    27_A     H    27_A    132  133  133     13   75  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    28_A     F    28_A    132  133  133     42  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    29_A     P    29_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    30_A     V    30_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    31_A     G    31_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    32_A     A    32_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    33_A     C    33_A    132  133  133     62  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    34_A     L    34_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    35_A     V    35_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    36_A     T    36_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    37_A     E    37_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    38_A     S    38_A    132  133  133     74  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    39_A     G    39_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    40_A     K    40_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    42_A     Y    42_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    43_A     Q    43_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    44_A     G    44_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    45_A     I    45_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    46_A     N    46_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    47_A     I    47_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    48_A     E    48_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    49_A     N    49_A    132  133  133     62  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    50_A     A    50_A    132  133  133     19  104  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    52_A     F    52_A    132  133  133      3  111  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    53_A     G    53_A    132  133  133      3   11   21   74  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    54_A     L    54_A    132  133  133     72  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    55_A     T    55_A    132  133  133     70  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    56_A     N    56_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    57_A     C    57_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    58_A     A    58_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    59_A     E    59_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    60_A     R    60_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    61_A     T    61_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    62_A     A    62_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    63_A     F    63_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    64_A     F    64_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    65_A     K    65_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    66_A     A    66_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    67_A     V    67_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    68_A     S    68_A    132  133  133     70  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    69_A     E    69_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    70_A     G    70_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    71_A     E    71_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A    132  133  133     20   93  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    73_A     S    73_A    132  133  133     56  109  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    74_A     F    74_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    75_A     T    75_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    76_A     H    76_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    77_A     L    77_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    78_A     V    78_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    79_A     V    79_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    80_A     A    80_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    81_A     G    81_A    132  133  133     57  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    82_A     H    82_A    132  133  133     34  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    83_A     T    83_A    132  133  133     29  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    84_A     P    84_A    132  133  133     57  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    85_A     D    85_A    132  133  133     50  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    86_A     P    86_A    132  133  133     72  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    87_A     I    87_A    132  133  133     54  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    88_A     S    88_A    132  133  133     13   96  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    89_A     P    89_A    132  133  133     15  109  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    90_A     C    90_A    132  133  133     70  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    91_A     G    91_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    92_A     A    92_A    132  133  133     71  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    93_A     C    93_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    95_A     Q    95_A    132  133  133     74  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A    132  133  133     69  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M    97_A     M    97_A    132  133  133     59  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    98_A     A    98_A    132  133  133     49  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    99_A     E    99_A    132  133  133     42  109  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    132  133  133     52  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C   101_A     C   101_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   103_A     P   103_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   104_A     D   104_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M   105_A     M   105_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   106_A     P   106_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   107_A     V   107_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   108_A     T   108_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   109_A     L   109_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   110_A     V   110_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   111_A     G   111_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   112_A     D   112_A    132  133  133     29  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A    132  133  133      7   51  114  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   114_A     G   114_A    132  133  133      7  111  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   115_A     V   115_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   116_A     T   116_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   117_A     K   117_A    132  133  133     72  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   118_A     A   118_A    132  133  133     72  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   119_A     T   119_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   120_A     T   120_A    132  133  133     72  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   121_A     V   121_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R   122_A     R   122_A    132  133  133     77  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   123_A     E   123_A    132  133  133     72  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A    132  133  133     72  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A    132  133  133     49  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   126_A     P   126_A    132  133  133     42  110  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y   127_A     Y   127_A    132  133  133     44  105  123  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   128_A     A   128_A    132  133  133     67  112  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   129_A     F   129_A    132  133  133     16  101  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   130_A     T   130_A    132  133  133      4  103  124  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   131_A     E   131_A    132  133  133      4   45  116  129  130  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A    132  133  133      4    6   25   85  124  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   133_A     D   133_A    132  133  133      4    4    4   17   25   36   56  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   134_A     L   134_A      4  133  133      4    4    4    6   95  127  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  99.51  (  98.52  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     77    112    124    129    130    130    132    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133 
GDT PERCENT_AT  57.89  84.21  93.23  96.99  97.74  97.74  99.25 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.31   0.52   0.64   0.73   0.77   0.77   0.97   1.09   1.09   1.09   1.09   1.09   1.09   1.09   1.09   1.09   1.09   1.09   1.09   1.09
GDT RMS_ALL_AT   1.19   1.13   1.12   1.11   1.12   1.12   1.09   1.09   1.09   1.09   1.09   1.09   1.09   1.09   1.09   1.09   1.09   1.09   1.09   1.09

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  Y    22_A      Y    22_A
#   possible swapping detected:  E    59_A      E    59_A
#   possible swapping detected:  F    74_A      F    74_A
#   possible swapping detected:  E    99_A      E    99_A
#   possible swapping detected:  F   100_A      F   100_A
#   possible swapping detected:  Y   127_A      Y   127_A
#   possible swapping detected:  F   129_A      F   129_A
#   possible swapping detected:  E   131_A      E   131_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S     2_A      S     2_A     0.434     0    0.665   0.803     4.501   86.905   71.508
LGA    M     3_A      M     3_A     0.287     0    0.043   0.192     0.749  100.000   97.619
LGA    A     4_A      A     4_A     0.338     0    0.067   0.067     0.573   97.619   98.095
LGA    E     5_A      E     5_A     0.500     0    0.038   0.273     1.272   92.857   89.524
LGA    L     6_A      L     6_A     0.600     0    0.033   0.146     0.833   90.476   90.476
LGA    K     7_A      K     7_A     0.484     0    0.030   0.929     4.800   97.619   75.873
LGA    Q     8_A      Q     8_A     0.492     0    0.027   1.480     5.662   97.619   71.111
LGA    E     9_A      E     9_A     0.502     0    0.014   0.776     2.523   97.619   81.376
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LGA    F   100_A      F   100_A     0.819     0    0.025   0.128     2.225   90.476   79.351
LGA    C   101_A      C   101_A     0.501     0    0.031   0.039     0.612   97.619   95.238
LGA    A   102_A      A   102_A     0.455     0    0.029   0.035     0.507   97.619   98.095
LGA    P   103_A      P   103_A     0.548     0    0.071   0.069     0.814   95.238   93.197
LGA    D   104_A      D   104_A     0.580     0    0.018   1.252     4.197   92.857   77.619
LGA    M   105_A      M   105_A     0.426     0    0.041   0.089     0.760   95.238   94.048
LGA    P   106_A      P   106_A     0.643     0    0.022   0.254     0.888   92.857   91.837
LGA    V   107_A      V   107_A     0.606     0    0.031   0.031     0.758   90.476   90.476
LGA    T   108_A      T   108_A     0.424     0    0.034   0.070     0.481  100.000  100.000
LGA    L   109_A      L   109_A     0.181     0    0.044   0.102     0.340  100.000  100.000
LGA    V   110_A      V   110_A     0.189     0    0.096   0.165     0.842   97.619   95.918
LGA    G   111_A      G   111_A     0.282     0    0.098   0.098     0.282  100.000  100.000
LGA    D   112_A      D   112_A     0.937     0    0.637   1.062     2.903   79.881   80.714
LGA    N   113_A      N   113_A     2.190     0    0.129   0.799     5.892   70.952   54.583
LGA    G   114_A      G   114_A     1.099     0    0.045   0.045     1.478   85.952   85.952
LGA    V   115_A      V   115_A     0.659     0    0.050   1.134     3.387   90.476   79.932
LGA    T   116_A      T   116_A     0.490     0    0.109   1.087     2.493   92.976   85.918
LGA    K   117_A      K   117_A     0.577     0    0.095   0.958     4.163   97.619   75.926
LGA    A   118_A      A   118_A     0.891     0    0.012   0.014     1.433   90.476   88.667
LGA    T   119_A      T   119_A     0.704     0    0.215   1.023     2.938   84.048   79.524
LGA    T   120_A      T   120_A     0.603     0    0.025   0.058     0.753   90.476   90.476
LGA    V   121_A      V   121_A     0.436     0    0.012   0.024     0.559  100.000   97.279
LGA    R   122_A      R   122_A     0.456     0    0.048   1.021     3.899  100.000   86.580
LGA    E   123_A      E   123_A     0.536     0    0.011   0.541     2.093   95.238   89.735
LGA    L   124_A      L   124_A     0.429     0    0.058   0.066     0.840   95.238   95.238
LGA    L   125_A      L   125_A     0.873     0    0.050   1.338     3.386   90.476   80.952
LGA    P   126_A      P   126_A     1.019     0    0.671   0.606     3.321   75.833   80.816
LGA    Y   127_A      Y   127_A     1.664     0    0.145   1.321     9.507   79.405   44.762
LGA    A   128_A      A   128_A     0.775     0    0.018   0.031     1.302   85.952   86.857
LGA    F   129_A      F   129_A     1.324     0    0.027   1.266     7.664   88.214   51.039
LGA    T   130_A      T   130_A     1.224     0    0.024   0.099     2.845   75.119   69.592
LGA    E   131_A      E   131_A     2.103     0    0.098   1.019     4.210   61.190   56.138
LGA    K   132_A      K   132_A     3.811     0    0.127   0.605    10.549   37.738   21.852
LGA    D   133_A      D   133_A     5.808     0    0.201   0.264     7.861   22.857   16.964
LGA    L   134_A      L   134_A     5.038     0    0.255   1.100     7.491   26.310   23.095

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      133     532    532  100.00    1010   1010  100.00               133
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.090          1.158                  1.925           90.533   85.027

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  134  133    4.0    133    1.09    95.301    97.708    11.175

LGA_LOCAL      RMSD:   1.090  Number of atoms:  133  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.090  Number of assigned atoms:  133 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.090  Standard rmsd on all 133 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.806747 * X  +   0.069456 * Y  +   0.586800 * Z  + -34.134579
  Y_new =   0.283429 * X  +   0.916857 * Y  +   0.281142 * Z  +   2.969477
  Z_new =  -0.518485 * X  +   0.393127 * Y  +  -0.759358 * Z  +  -7.413637 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  2.803739  0.545078  2.663878   [DEG:  160.6424   31.2307  152.6290 ]
ZXZ:  2.017593  2.433122 -0.922053   [DEG:  115.5996  139.4076  -52.8298 ]
 
# END of job
