
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  134 ( 1014),  selected  133 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  133 ( 1010),  selected  133 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       1.07     1.07
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       1.07     1.07
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   132       2_A - 133_A       0.97     1.07
  LCS_AVERAGE:     98.52

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  133
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S     2_A     S     2_A    132  133  133     69  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M     3_A     M     3_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A     4_A     A     4_A    132  133  133     58  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     5_A     E     5_A    132  133  133     69  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L     6_A     L     6_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K     7_A     K     7_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q     8_A     Q     8_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     9_A     E     9_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     W    10_A     W    10_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    11_A     I    11_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    12_A     N    12_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    13_A     T    13_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    15_A     I    15_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    16_A     E    16_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    17_A     A    17_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    18_A     L    18_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    19_A     D    19_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    20_A     K    20_A    132  133  133     68  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    21_A     A    21_A    132  133  133     57  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    22_A     Y    22_A    132  133  133     53  109  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A    132  133  133     69  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    24_A     P    24_A    132  133  133     24  109  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    25_A     Y    25_A    132  133  133     64  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    26_A     S    26_A    132  133  133     20  109  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    27_A     H    27_A    132  133  133     20  108  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    28_A     F    28_A    132  133  133     36  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    29_A     P    29_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    30_A     V    30_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    31_A     G    31_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    32_A     A    32_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    33_A     C    33_A    132  133  133     68  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    34_A     L    34_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    35_A     V    35_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    36_A     T    36_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    37_A     E    37_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    38_A     S    38_A    132  133  133     77  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    39_A     G    39_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    40_A     K    40_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    42_A     Y    42_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    43_A     Q    43_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    44_A     G    44_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    45_A     I    45_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    46_A     N    46_A    132  133  133     74  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    47_A     I    47_A    132  133  133     74  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    48_A     E    48_A    132  133  133     78  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    49_A     N    49_A    132  133  133     71  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    50_A     A    50_A    132  133  133     66  110  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    132  133  133     66  110  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    52_A     F    52_A    132  133  133     34  109  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    53_A     G    53_A    132  133  133      4   95  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    54_A     L    54_A    132  133  133     62  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    55_A     T    55_A    132  133  133     78  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    56_A     N    56_A    132  133  133     75  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    57_A     C    57_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    58_A     A    58_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    59_A     E    59_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    60_A     R    60_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    61_A     T    61_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    62_A     A    62_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    63_A     F    63_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    64_A     F    64_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    65_A     K    65_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    66_A     A    66_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    67_A     V    67_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    68_A     S    68_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    69_A     E    69_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    70_A     G    70_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    71_A     E    71_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A    132  133  133     17  100  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    73_A     S    73_A    132  133  133     57  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    74_A     F    74_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    75_A     T    75_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    76_A     H    76_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    77_A     L    77_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    78_A     V    78_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    79_A     V    79_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    80_A     A    80_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    81_A     G    81_A    132  133  133     68  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    82_A     H    82_A    132  133  133     39  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    83_A     T    83_A    132  133  133     35  110  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    84_A     P    84_A    132  133  133     68  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    85_A     D    85_A    132  133  133     68  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    86_A     P    86_A    132  133  133     76  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    87_A     I    87_A    132  133  133     47  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    88_A     S    88_A    132  133  133     15   93  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    89_A     P    89_A    132  133  133     32  107  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    90_A     C    90_A    132  133  133     48  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    91_A     G    91_A    132  133  133     77  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    92_A     A    92_A    132  133  133     76  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    93_A     C    93_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    95_A     Q    95_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M    97_A     M    97_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    98_A     A    98_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    99_A     E    99_A    132  133  133     32  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C   101_A     C   101_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   103_A     P   103_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   104_A     D   104_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M   105_A     M   105_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   106_A     P   106_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   107_A     V   107_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   108_A     T   108_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   109_A     L   109_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   110_A     V   110_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   111_A     G   111_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   112_A     D   112_A    132  133  133     36  110  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A    132  133  133      5   62  101  128  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   114_A     G   114_A    132  133  133     35  106  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   115_A     V   115_A    132  133  133     77  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   116_A     T   116_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   117_A     K   117_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   118_A     A   118_A    132  133  133     76  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   119_A     T   119_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   120_A     T   120_A    132  133  133     72  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   121_A     V   121_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R   122_A     R   122_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   123_A     E   123_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A    132  133  133     24  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   126_A     P   126_A    132  133  133     24  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y   127_A     Y   127_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   128_A     A   128_A    132  133  133     79  111  126  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   129_A     F   129_A    132  133  133      3   97  125  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   130_A     T   130_A    132  133  133      3   51  125  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   131_A     E   131_A    132  133  133      4   30  108  129  130  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A    132  133  133      4    7   23   73  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   133_A     D   133_A    132  133  133      4    4    5   12   17   23   36  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   134_A     L   134_A      4  133  133      4    4    5    7   83  109  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  99.51  (  98.52  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     79    111    126    129    130    131    131    132    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133 
GDT PERCENT_AT  59.40  83.46  94.74  96.99  97.74  98.50  98.50  99.25 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.30   0.48   0.63   0.71   0.74   0.82   0.82   0.94   1.07   1.07   1.07   1.07   1.07   1.07   1.07   1.07   1.07   1.07   1.07   1.07
GDT RMS_ALL_AT   1.11   1.10   1.11   1.09   1.09   1.08   1.08   1.07   1.07   1.07   1.07   1.07   1.07   1.07   1.07   1.07   1.07   1.07   1.07   1.07

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E     9_A      E     9_A
#   possible swapping detected:  Y    25_A      Y    25_A
#   possible swapping detected:  F    63_A      F    63_A
#   possible swapping detected:  F    74_A      F    74_A
#   possible swapping detected:  E    99_A      E    99_A
#   possible swapping detected:  F   100_A      F   100_A
#   possible swapping detected:  Y   127_A      Y   127_A
#   possible swapping detected:  F   129_A      F   129_A
#   possible swapping detected:  E   131_A      E   131_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S     2_A      S     2_A     1.046     0    0.220   0.275     3.446   88.214   77.937
LGA    M     3_A      M     3_A     0.288     0    0.091   0.266     1.560   97.619   91.905
LGA    A     4_A      A     4_A     0.642     0    0.092   0.094     1.113   90.476   88.667
LGA    E     5_A      E     5_A     0.701     0    0.034   0.739     5.028   90.476   69.894
LGA    L     6_A      L     6_A     0.595     0    0.038   0.135     0.811   92.857   91.667
LGA    K     7_A      K     7_A     0.341     0    0.031   0.917     4.285  100.000   79.101
LGA    Q     8_A      Q     8_A     0.409     0    0.026   1.481     5.405   97.619   73.545
LGA    E     9_A      E     9_A     0.615     0    0.037   0.374     1.249   97.619   93.704
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LGA    I    11_A      I    11_A     0.360     0    0.035   0.053     0.519  100.000   98.810
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LGA    F   100_A      F   100_A     0.300     0    0.023   0.114     0.389  100.000  100.000
LGA    C   101_A      C   101_A     0.199     0    0.015   0.038     0.228  100.000  100.000
LGA    A   102_A      A   102_A     0.209     0    0.031   0.033     0.314  100.000  100.000
LGA    P   103_A      P   103_A     0.460     0    0.070   0.067     0.648  100.000   95.918
LGA    D   104_A      D   104_A     0.325     0    0.016   1.251     4.542  100.000   78.631
LGA    M   105_A      M   105_A     0.272     0    0.050   0.089     0.508  100.000   98.810
LGA    P   106_A      P   106_A     0.517     0    0.017   0.247     0.753   97.619   94.558
LGA    V   107_A      V   107_A     0.466     0    0.035   0.040     0.646   97.619   98.639
LGA    T   108_A      T   108_A     0.361     0    0.029   0.057     0.393  100.000  100.000
LGA    L   109_A      L   109_A     0.232     0    0.036   0.089     0.325  100.000  100.000
LGA    V   110_A      V   110_A     0.153     0    0.091   0.158     0.814   97.619   97.279
LGA    G   111_A      G   111_A     0.282     0    0.095   0.095     0.343  100.000  100.000
LGA    D   112_A      D   112_A     1.100     0    0.626   1.061     2.830   77.619   79.583
LGA    N   113_A      N   113_A     2.434     0    0.111   0.740     5.921   70.952   54.583
LGA    G   114_A      G   114_A     1.286     0    0.046   0.046     1.673   83.810   83.810
LGA    V   115_A      V   115_A     0.610     0    0.046   1.129     3.293   92.857   82.381
LGA    T   116_A      T   116_A     0.370     0    0.094   1.082     2.579   92.976   85.986
LGA    K   117_A      K   117_A     0.411     0    0.028   0.668     1.497  100.000   91.693
LGA    A   118_A      A   118_A     0.666     0    0.014   0.018     1.227   97.619   94.381
LGA    T   119_A      T   119_A     0.420     0    0.131   1.033     2.304   92.976   85.918
LGA    T   120_A      T   120_A     0.589     0    0.024   0.057     0.660   92.857   91.837
LGA    V   121_A      V   121_A     0.460     0    0.010   0.030     0.602  100.000   97.279
LGA    R   122_A      R   122_A     0.432     0    0.041   1.024     3.585  100.000   84.892
LGA    E   123_A      E   123_A     0.458     0    0.009   0.547     1.608   97.619   92.804
LGA    L   124_A      L   124_A     0.312     0    0.052   0.065     0.599   97.619   98.810
LGA    L   125_A      L   125_A     0.699     0    0.051   1.330     3.193   92.857   82.262
LGA    P   126_A      P   126_A     0.749     0    0.054   0.057     0.957   90.476   90.476
LGA    Y   127_A      Y   127_A     0.557     0    0.179   1.301     8.590   90.476   55.556
LGA    A   128_A      A   128_A     0.610     0    0.024   0.032     1.194   88.214   88.667
LGA    F   129_A      F   129_A     1.631     0    0.007   1.252     7.215   86.190   50.996
LGA    T   130_A      T   130_A     1.642     0    0.016   0.042     3.153   68.810   64.966
LGA    E   131_A      E   131_A     2.397     0    0.068   1.015     4.510   57.381   52.169
LGA    K   132_A      K   132_A     3.979     0    0.127   0.606    10.847   36.071   20.212
LGA    D   133_A      D   133_A     5.957     0    0.187   0.259     8.160   20.595   14.345
LGA    L   134_A      L   134_A     5.280     0    0.537   1.257     7.720   28.929   23.452

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      133     532    532  100.00    1010   1010  100.00               133
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.066          1.070                  1.710           92.055   87.015

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  134  133    4.0    132    0.94    94.925    97.725    12.688

LGA_LOCAL      RMSD:   0.940  Number of atoms:  132  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.070  Number of assigned atoms:  133 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.066  Standard rmsd on all 133 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.124466 * X  +   0.976373 * Y  +  -0.176645 * Z  + -37.430832
  Y_new =   0.088385 * X  +  -0.166411 * Y  +  -0.982087 * Z  +   6.542248
  Z_new =  -0.988280 * X  +  -0.137849 * Y  +  -0.065584 * Z  +  -3.817551 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  2.524111  1.417542 -2.014871   [DEG:  144.6209   81.2192 -115.4436 ]
ZXZ: -0.177964  1.636427 -1.709386   [DEG:  -10.1966   93.7604  -97.9406 ]
 
# END of job
