
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  134 ( 1014),  selected  133 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  133 ( 1010),  selected  133 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       1.97     1.97
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       1.97     1.97
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   129       6_A - 134_A       0.79     2.03
  LCS_AVERAGE:     94.85

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  133
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S     2_A     S     2_A      3  133  133      0    3    3    3    4   16   19   22   25   29   33   38   46   73  101  114  127  129  130  133 
LCS_GDT     M     3_A     M     3_A      3  133  133      1    3    3    7   12   16   40   64  104  116  126  128  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     A     4_A     A     4_A      3  133  133      3    3    3    7   12   16   19   30  104  116  125  128  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     E     5_A     E     5_A    128  133  133      3    4    4    4   26   40   82  101  125  126  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     L     6_A     L     6_A    129  133  133      3    4    4    4    6   12   66  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     K     7_A     K     7_A    129  133  133      3   36  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     Q     8_A     Q     8_A    129  133  133     61  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     E     9_A     E     9_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     W    10_A     W    10_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     I    11_A     I    11_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     N    12_A     N    12_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     T    13_A     T    13_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     I    15_A     I    15_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     E    16_A     E    16_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     A    17_A     A    17_A    129  133  133     87  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     L    18_A     L    18_A    129  133  133     97  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     D    19_A     D    19_A    129  133  133     99  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     K    20_A     K    20_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     A    21_A     A    21_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     Y    22_A     Y    22_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     P    24_A     P    24_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     Y    25_A     Y    25_A    129  133  133     80  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     S    26_A     S    26_A    129  133  133     84  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     H    27_A     H    27_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     F    28_A     F    28_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     P    29_A     P    29_A    129  133  133     99  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     V    30_A     V    30_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     G    31_A     G    31_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     A    32_A     A    32_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     C    33_A     C    33_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     L    34_A     L    34_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     V    35_A     V    35_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     T    36_A     T    36_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     E    37_A     E    37_A    129  133  133     99  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     S    38_A     S    38_A    129  133  133     99  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     G    39_A     G    39_A    129  133  133     99  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     K    40_A     K    40_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     Y    42_A     Y    42_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     Q    43_A     Q    43_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     G    44_A     G    44_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     I    45_A     I    45_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     N    46_A     N    46_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     I    47_A     I    47_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     E    48_A     E    48_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     N    49_A     N    49_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     A    50_A     A    50_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     F    52_A     F    52_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     G    53_A     G    53_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     L    54_A     L    54_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     T    55_A     T    55_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     N    56_A     N    56_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     C    57_A     C    57_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     A    58_A     A    58_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     E    59_A     E    59_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     R    60_A     R    60_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     T    61_A     T    61_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     A    62_A     A    62_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     F    63_A     F    63_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     F    64_A     F    64_A    129  133  133     98  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     K    65_A     K    65_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     A    66_A     A    66_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     V    67_A     V    67_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     S    68_A     S    68_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     E    69_A     E    69_A    129  133  133     56  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     G    70_A     G    70_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     E    71_A     E    71_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     S    73_A     S    73_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     F    74_A     F    74_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     T    75_A     T    75_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     H    76_A     H    76_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     L    77_A     L    77_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     V    78_A     V    78_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     V    79_A     V    79_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     A    80_A     A    80_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     G    81_A     G    81_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     H    82_A     H    82_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     T    83_A     T    83_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     P    84_A     P    84_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     D    85_A     D    85_A    129  133  133     99  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     P    86_A     P    86_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     I    87_A     I    87_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     S    88_A     S    88_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     P    89_A     P    89_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     C    90_A     C    90_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     G    91_A     G    91_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     A    92_A     A    92_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     C    93_A     C    93_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     Q    95_A     Q    95_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     M    97_A     M    97_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     A    98_A     A    98_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     E    99_A     E    99_A    129  133  133     99  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     C   101_A     C   101_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     P   103_A     P   103_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     D   104_A     D   104_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     M   105_A     M   105_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     P   106_A     P   106_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     V   107_A     V   107_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     T   108_A     T   108_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     L   109_A     L   109_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     V   110_A     V   110_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     G   111_A     G   111_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     D   112_A     D   112_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A    129  133  133     60  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     G   114_A     G   114_A    129  133  133      7  113  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     V   115_A     V   115_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     T   116_A     T   116_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     K   117_A     K   117_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     A   118_A     A   118_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     T   119_A     T   119_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     T   120_A     T   120_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     V   121_A     V   121_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     R   122_A     R   122_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     E   123_A     E   123_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A    129  133  133    101  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     P   126_A     P   126_A    129  133  133     56  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     Y   127_A     Y   127_A    129  133  133      6   91  123  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     A   128_A     A   128_A    129  133  133     39  111  123  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     F   129_A     F   129_A    129  133  133     67  120  123  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     T   130_A     T   130_A    129  133  133     68  120  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     E   131_A     E   131_A    129  133  133     17  101  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A    129  133  133     20  113  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     D   133_A     D   133_A    129  133  133      3    3    5  119  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_GDT     L   134_A     L   134_A    129  133  133      3   86  124  126  127  128  128  129  129  129  129  130  132  132  132  132  132  132  132  133 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  98.28  (  94.85  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT    101    120    124    126    127    128    128    129    129    129    129    130    132    132    132    132    132    132    132    133 
GDT PERCENT_AT  75.94  90.23  93.23  94.74  95.49  96.24  96.24  96.99  96.99  96.99  96.99  97.74  99.25  99.25  99.25  99.25  99.25  99.25  99.25 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.30   0.38   0.51   0.53   0.56   0.62   0.62   0.79   0.79   0.79   0.79   1.05   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.97
GDT RMS_ALL_AT   2.03   2.02   2.05   2.04   2.04   2.04   2.04   2.03   2.03   2.03   2.03   2.01   1.98   1.98   1.98   1.98   1.98   1.98   1.98   1.97

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    37_A      E    37_A
#   possible swapping detected:  Y    42_A      Y    42_A
#   possible swapping detected:  E   131_A      E   131_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S     2_A      S     2_A    15.130     0    0.024   0.638    16.706    0.000    0.000
LGA    M     3_A      M     3_A     9.715     0    0.625   1.440    11.690    1.190    2.024
LGA    A     4_A      A     4_A     8.989     0    0.631   0.602    10.530    2.976    2.381
LGA    E     5_A      E     5_A     7.980     0    0.634   0.553    10.570   10.238    6.085
LGA    L     6_A      L     6_A     5.579     0    0.609   1.353    11.120   28.333   16.369
LGA    K     7_A      K     7_A     1.628     0    0.635   0.986    12.612   79.286   43.016
LGA    Q     8_A      Q     8_A     0.626     0    0.030   1.062     2.533   95.238   89.048
LGA    E     9_A      E     9_A     0.343     0    0.044   0.638     1.739  100.000   90.794
LGA    W    10_A      W    10_A     0.348     0    0.016   0.129     0.497  100.000  100.000
LGA    I    11_A      I    11_A     0.328     0    0.025   0.071     0.522  100.000   98.810
LGA    N    12_A      N    12_A     0.324     0    0.008   0.057     0.394  100.000  100.000
LGA    T    13_A      T    13_A     0.435     0    0.006   0.052     0.672  100.000   95.918
LGA    A    14_A      A    14_A     0.299     0    0.041   0.047     0.438  100.000  100.000
LGA    I    15_A      I    15_A     0.166     0    0.017   0.097     0.369  100.000  100.000
LGA    E    16_A      E    16_A     0.436     0    0.022   0.400     1.570   95.238   89.630
LGA    A    17_A      A    17_A     0.639     0    0.011   0.013     0.798   92.857   92.381
LGA    L    18_A      L    18_A     0.574     0    0.034   1.258     2.611   90.476   84.286
LGA    D    19_A      D    19_A     0.472     0    0.013   0.162     0.941  100.000   95.238
LGA    K    20_A      K    20_A     0.404     0    0.052   0.193     0.686  100.000   95.767
LGA    A    21_A      A    21_A     0.092     0    0.055   0.064     0.281  100.000  100.000
LGA    Y    22_A      Y    22_A     0.340     0    0.009   0.058     0.851  100.000   95.238
LGA    V    23_A      V    23_A     0.516     0    0.043   0.060     0.694   92.857   91.837
LGA    P    24_A      P    24_A     0.443     0    0.077   0.075     0.872   95.238   95.918
LGA    Y    25_A      Y    25_A     0.762     0    0.028   0.088     1.250   90.476   88.214
LGA    S    26_A      S    26_A     0.672     0    0.010   0.038     0.686   90.476   92.063
LGA    H    27_A      H    27_A     0.435     0    0.033   0.380     1.396  100.000   94.381
LGA    F    28_A      F    28_A     0.344     0    0.005   0.243     0.908  100.000   96.537
LGA    P    29_A      P    29_A     0.531     0    0.042   0.068     0.564   97.619   97.279
LGA    V    30_A      V    30_A     0.318     0    0.021   1.335     2.551  100.000   88.844
LGA    G    31_A      G    31_A     0.272     0    0.010   0.010     0.375  100.000  100.000
LGA    A    32_A      A    32_A     0.156     0    0.014   0.022     0.164  100.000  100.000
LGA    C    33_A      C    33_A     0.165     0    0.034   0.033     0.292  100.000  100.000
LGA    L    34_A      L    34_A     0.244     0    0.024   0.051     0.341  100.000  100.000
LGA    V    35_A      V    35_A     0.106     0    0.030   1.346     2.833  100.000   88.844
LGA    T    36_A      T    36_A     0.426     0    0.023   0.042     0.549   95.238   97.279
LGA    E    37_A      E    37_A     0.658     0    0.043   1.030     4.102   90.476   79.894
LGA    S    38_A      S    38_A     0.690     0    0.035   0.063     0.695   90.476   90.476
LGA    G    39_A      G    39_A     0.589     0    0.033   0.033     0.663   95.238   95.238
LGA    K    40_A      K    40_A     0.424     0    0.032   0.730     4.060  100.000   78.730
LGA    I    41_A      I    41_A     0.344     0    0.083   1.368     3.774  100.000   82.917
LGA    Y    42_A      Y    42_A     0.196     0    0.021   0.070     0.581  100.000   99.206
LGA    Q    43_A      Q    43_A     0.131     0    0.090   0.556     1.738  100.000   91.799
LGA    G    44_A      G    44_A     0.183     0    0.024   0.024     0.304  100.000  100.000
LGA    I    45_A      I    45_A     0.166     0    0.025   0.081     0.434  100.000  100.000
LGA    N    46_A      N    46_A     0.214     0    0.050   0.199     0.572  100.000   98.810
LGA    I    47_A      I    47_A     0.224     0    0.024   0.058     0.398  100.000  100.000
LGA    E    48_A      E    48_A     0.328     0    0.049   0.196     1.106  100.000   94.762
LGA    N    49_A      N    49_A     0.153     0    0.011   0.119     0.305  100.000  100.000
LGA    A    50_A      A    50_A     0.176     0    0.014   0.017     0.317  100.000  100.000
LGA    S    51_A      S    51_A     0.249     0    0.027   0.042     0.450  100.000  100.000
LGA    F    52_A      F    52_A     0.308     0    0.031   1.011     5.889  100.000   67.619
LGA    G    53_A      G    53_A     0.238     0    0.012   0.012     0.243  100.000  100.000
LGA    L    54_A      L    54_A     0.131     0    0.012   1.236     2.857  100.000   90.238
LGA    T    55_A      T    55_A     0.249     0    0.014   0.037     0.293  100.000  100.000
LGA    N    56_A      N    56_A     0.163     0    0.037   0.054     0.320  100.000  100.000
LGA    C    57_A      C    57_A     0.090     0    0.000   0.049     0.115  100.000  100.000
LGA    A    58_A      A    58_A     0.062     0    0.015   0.016     0.086  100.000  100.000
LGA    E    59_A      E    59_A     0.048     0    0.024   0.072     0.369  100.000  100.000
LGA    R    60_A      R    60_A     0.261     0    0.009   0.091     0.452  100.000  100.000
LGA    T    61_A      T    61_A     0.319     0    0.011   0.046     0.479  100.000  100.000
LGA    A    62_A      A    62_A     0.133     0    0.015   0.015     0.175  100.000  100.000
LGA    F    63_A      F    63_A     0.178     0    0.017   0.053     0.487  100.000  100.000
LGA    F    64_A      F    64_A     0.463     0    0.025   0.106     0.936   97.619   93.074
LGA    K    65_A      K    65_A     0.512     0    0.033   0.139     0.799   97.619   93.651
LGA    A    66_A      A    66_A     0.317     0    0.001   0.005     0.325  100.000  100.000
LGA    V    67_A      V    67_A     0.164     0    0.024   1.330     2.557  100.000   88.844
LGA    S    68_A      S    68_A     0.544     0    0.011   0.694     3.139   92.857   85.317
LGA    E    69_A      E    69_A     0.769     0    0.018   0.770     2.546   90.476   82.804
LGA    G    70_A      G    70_A     0.588     0    0.052   0.052     0.594   90.476   90.476
LGA    E    71_A      E    71_A     0.550     0    0.046   0.417     1.475   90.476   90.529
LGA    R    72_A      R    72_A     0.640     0    0.091   0.128     0.990   90.476   90.476
LGA    S    73_A      S    73_A     0.551     0    0.079   0.657     2.250   92.857   87.778
LGA    F    74_A      F    74_A     0.223     0    0.021   0.063     0.352  100.000  100.000
LGA    T    75_A      T    75_A     0.187     0    0.031   0.048     0.221  100.000  100.000
LGA    H    76_A      H    76_A     0.197     0    0.053   0.211     0.405  100.000  100.000
LGA    L    77_A      L    77_A     0.167     0    0.016   0.050     0.239  100.000  100.000
LGA    V    78_A      V    78_A     0.122     0    0.029   1.342     2.543  100.000   88.844
LGA    V    79_A      V    79_A     0.112     0    0.027   1.332     2.638  100.000   88.844
LGA    A    80_A      A    80_A     0.226     0    0.011   0.020     0.240  100.000  100.000
LGA    G    81_A      G    81_A     0.175     0    0.026   0.026     0.469  100.000  100.000
LGA    H    82_A      H    82_A     0.373     0    0.048   0.080     0.511   97.619   99.048
LGA    T    83_A      T    83_A     0.386     0    0.019   0.064     0.779  100.000   95.918
LGA    P    84_A      P    84_A     0.320     0    0.074   0.420     1.188  100.000   97.347
LGA    D    85_A      D    85_A     0.555     0    0.020   1.126     4.520   95.238   75.417
LGA    P    86_A      P    86_A     0.491     0    0.015   0.046     0.604   95.238   95.918
LGA    I    87_A      I    87_A     0.353     0    0.033   0.502     1.556  100.000   96.607
LGA    S    88_A      S    88_A     0.549     0    0.050   0.103     0.967   97.619   95.238
LGA    P    89_A      P    89_A     0.495     0    0.035   0.350     1.185  100.000   94.626
LGA    C    90_A      C    90_A     0.526     0    0.019   0.089     0.717   95.238   93.651
LGA    G    91_A      G    91_A     0.410     0    0.023   0.023     0.451  100.000  100.000
LGA    A    92_A      A    92_A     0.492     0    0.015   0.016     0.536  100.000   98.095
LGA    C    93_A      C    93_A     0.309     0    0.015   0.050     0.377  100.000  100.000
LGA    R    94_A      R    94_A     0.304     0    0.025   0.122     0.975  100.000   96.537
LGA    Q    95_A      Q    95_A     0.351     0    0.024   0.103     0.573  100.000   97.884
LGA    V    96_A      V    96_A     0.305     0    0.016   1.338     2.766  100.000   88.844
LGA    M    97_A      M    97_A     0.341     0    0.017   0.903     2.562  100.000   92.262
LGA    A    98_A      A    98_A     0.280     0    0.015   0.018     0.424  100.000  100.000
LGA    E    99_A      E    99_A     0.488     0    0.015   0.250     1.618  100.000   90.741
LGA    F   100_A      F   100_A     0.330     0    0.016   0.085     0.355  100.000  100.000
LGA    C   101_A      C   101_A     0.182     0    0.030   0.038     0.207  100.000  100.000
LGA    A   102_A      A   102_A     0.262     0    0.035   0.031     0.291  100.000  100.000
LGA    P   103_A      P   103_A     0.309     0    0.030   0.061     0.484  100.000  100.000
LGA    D   104_A      D   104_A     0.256     0    0.014   0.418     1.122  100.000   96.488
LGA    M   105_A      M   105_A     0.160     0    0.031   0.147     0.272  100.000  100.000
LGA    P   106_A      P   106_A     0.142     0    0.024   0.288     0.891  100.000   98.639
LGA    V   107_A      V   107_A     0.176     0    0.020   1.343     2.640  100.000   88.844
LGA    T   108_A      T   108_A     0.327     0    0.022   0.029     0.338  100.000  100.000
LGA    L   109_A      L   109_A     0.363     0    0.047   1.251     2.801   97.619   89.048
LGA    V   110_A      V   110_A     0.151     0    0.057   1.340     2.547  100.000   88.844
LGA    G   111_A      G   111_A     0.343     0    0.012   0.012     0.355  100.000  100.000
LGA    D   112_A      D   112_A     0.456     0    0.048   0.186     2.177  100.000   87.619
LGA    N   113_A      N   113_A     0.779     0    0.022   0.853     3.120   90.595   83.214
LGA    G   114_A      G   114_A     1.198     0    0.021   0.021     1.198   88.214   88.214
LGA    V   115_A      V   115_A     0.322     0    0.031   0.627     2.351  100.000   93.605
LGA    T   116_A      T   116_A     0.184     0    0.045   0.057     0.459  100.000  100.000
LGA    K   117_A      K   117_A     0.272     0    0.016   0.824     3.798  100.000   89.630
LGA    A   118_A      A   118_A     0.337     0    0.015   0.016     0.337  100.000  100.000
LGA    T   119_A      T   119_A     0.250     0    0.037   0.090     0.377  100.000  100.000
LGA    T   120_A      T   120_A     0.184     0    0.015   0.064     0.346  100.000  100.000
LGA    V   121_A      V   121_A     0.103     0    0.007   1.328     2.551  100.000   88.844
LGA    R   122_A      R   122_A     0.145     0    0.010   1.010     3.357  100.000   91.991
LGA    E   123_A      E   123_A     0.271     0    0.015   0.498     1.341  100.000   95.873
LGA    L   124_A      L   124_A     0.226     0    0.037   1.255     2.864  100.000   90.238
LGA    L   125_A      L   125_A     0.184     0    0.014   0.101     0.922   97.619   96.429
LGA    P   126_A      P   126_A     0.824     0    0.659   0.634     2.721   82.143   83.129
LGA    Y   127_A      Y   127_A     2.105     0    0.081   1.231     8.045   70.833   46.151
LGA    A   128_A      A   128_A     1.434     0    0.008   0.013     1.698   81.548   81.524
LGA    F   129_A      F   129_A     1.044     0    0.051   0.311     1.567   83.690   83.939
LGA    T   130_A      T   130_A     0.730     0    0.035   0.128     1.470   85.952   84.014
LGA    E   131_A      E   131_A     1.975     0    0.122   0.830     3.680   75.000   64.392
LGA    K   132_A      K   132_A     1.874     0    0.068   0.631     3.087   66.905   60.741
LGA    D   133_A      D   133_A     3.015     0    0.054   0.221     5.261   57.262   44.524
LGA    L   134_A      L   134_A     2.161     0    0.007   0.617     3.088   59.167   63.095

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      133     532    532  100.00    1010   1010  100.00               133
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.966          1.921                  2.224           93.190   89.216

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  134  133    4.0    129    0.79    95.301    96.887    14.431

LGA_LOCAL      RMSD:   0.794  Number of atoms:  129  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   2.032  Number of assigned atoms:  133 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.966  Standard rmsd on all 133 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.950058 * X  +  -0.143656 * Y  +  -0.277045 * Z  + -28.585447
  Y_new =  -0.121523 * X  +  -0.987978 * Y  +   0.095562 * Z  +  27.170149
  Z_new =  -0.287442 * X  +  -0.057122 * Y  +  -0.956093 * Z  + -10.549322 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -0.127220  0.291555 -3.081918   [DEG:   -7.2892   16.7049 -176.5809 ]
ZXZ: -1.902950  2.844164 -1.766966   [DEG: -109.0310  162.9586 -101.2397 ]
 
# END of job
