
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  134 ( 1014),  selected  133 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  133 ( 1010),  selected  133 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       2.05     2.05
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   132       3_A - 134_A       1.56     2.06
  LCS_AVERAGE:     98.52

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   129       6_A - 134_A       0.81     2.11
  LCS_AVERAGE:     94.85

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  133
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S     2_A     S     2_A      3    3  133      0    3    3    4    4    5    5    6    7    9   12   21   41   43   68   79  113  124  128  129 
LCS_GDT     M     3_A     M     3_A      3  132  133      0    3    3    4    4    5   36   60   89  106  120  128  129  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A     4_A     A     4_A      3  132  133      3    3    3    4    6    6    6   28   97  109  126  128  129  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     E     5_A     E     5_A    128  132  133      3    4    4    5   10   38   72   98  123  126  128  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     L     6_A     L     6_A    129  132  133      3    4    4    5    6   17  122  126  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     K     7_A     K     7_A    129  132  133      3   47  117  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     Q     8_A     Q     8_A    129  132  133     51  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     E     9_A     E     9_A    129  132  133     96  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     W    10_A     W    10_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     I    11_A     I    11_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     N    12_A     N    12_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     T    13_A     T    13_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     I    15_A     I    15_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     E    16_A     E    16_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A    17_A     A    17_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     L    18_A     L    18_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     D    19_A     D    19_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     K    20_A     K    20_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A    21_A     A    21_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     Y    22_A     Y    22_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     P    24_A     P    24_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     Y    25_A     Y    25_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     S    26_A     S    26_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     H    27_A     H    27_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     F    28_A     F    28_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     P    29_A     P    29_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     V    30_A     V    30_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     G    31_A     G    31_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A    32_A     A    32_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     C    33_A     C    33_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     L    34_A     L    34_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     V    35_A     V    35_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     T    36_A     T    36_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     E    37_A     E    37_A    129  132  133     71  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     S    38_A     S    38_A    129  132  133     69  117  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     G    39_A     G    39_A    129  132  133     91  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     K    40_A     K    40_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     Y    42_A     Y    42_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     Q    43_A     Q    43_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     G    44_A     G    44_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     I    45_A     I    45_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     N    46_A     N    46_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     I    47_A     I    47_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     E    48_A     E    48_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     N    49_A     N    49_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A    50_A     A    50_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    129  132  133     95  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     F    52_A     F    52_A    129  132  133     41  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     G    53_A     G    53_A    129  132  133     33  109  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     L    54_A     L    54_A    129  132  133     69  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     T    55_A     T    55_A    129  132  133     69  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     N    56_A     N    56_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     C    57_A     C    57_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A    58_A     A    58_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     E    59_A     E    59_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     R    60_A     R    60_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     T    61_A     T    61_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A    62_A     A    62_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     F    63_A     F    63_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     F    64_A     F    64_A    129  132  133    101  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     K    65_A     K    65_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A    66_A     A    66_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     V    67_A     V    67_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     S    68_A     S    68_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     E    69_A     E    69_A    129  132  133    100  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     G    70_A     G    70_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     E    71_A     E    71_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     S    73_A     S    73_A    129  132  133     78  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     F    74_A     F    74_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     T    75_A     T    75_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     H    76_A     H    76_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     L    77_A     L    77_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     V    78_A     V    78_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     V    79_A     V    79_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A    80_A     A    80_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     G    81_A     G    81_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     H    82_A     H    82_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     T    83_A     T    83_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     P    84_A     P    84_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     D    85_A     D    85_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     P    86_A     P    86_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     I    87_A     I    87_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     S    88_A     S    88_A    129  132  133     44  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     P    89_A     P    89_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     C    90_A     C    90_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     G    91_A     G    91_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A    92_A     A    92_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     C    93_A     C    93_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     Q    95_A     Q    95_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     M    97_A     M    97_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A    98_A     A    98_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     E    99_A     E    99_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     C   101_A     C   101_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     P   103_A     P   103_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     D   104_A     D   104_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     M   105_A     M   105_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     P   106_A     P   106_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     V   107_A     V   107_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     T   108_A     T   108_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     L   109_A     L   109_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     V   110_A     V   110_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     G   111_A     G   111_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     D   112_A     D   112_A    129  132  133     97  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     G   114_A     G   114_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     V   115_A     V   115_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     T   116_A     T   116_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     K   117_A     K   117_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A   118_A     A   118_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     T   119_A     T   119_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     T   120_A     T   120_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     V   121_A     V   121_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     R   122_A     R   122_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     E   123_A     E   123_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     P   126_A     P   126_A    129  132  133     44  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     Y   127_A     Y   127_A    129  132  133      9   44  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A   128_A     A   128_A    129  132  133      5   35  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     F   129_A     F   129_A    129  132  133      5  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     T   130_A     T   130_A    129  132  133    104  118  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     E   131_A     E   131_A    129  132  133     24  109  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A    129  132  133     44   84  122  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     D   133_A     D   133_A    129  132  133      3    3    5    5  125  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     L   134_A     L   134_A    129  132  133      3   80  116  126  127  128  128  128  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  97.79  (  94.85   98.52  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT    104    118    122    126    127    128    128    128    129    129    129    130    130    131    132    132    132    132    132    132 
GDT PERCENT_AT  78.20  88.72  91.73  94.74  95.49  96.24  96.24  96.24  96.99  96.99  96.99  97.74  97.74  98.50  99.25  99.25  99.25  99.25  99.25  99.25
GDT RMS_LOCAL    0.27   0.38   0.44   0.55   0.59   0.67   0.67   0.67   0.81   0.81   0.81   1.07   1.07   1.32   1.56   1.56   1.56   1.56   1.56   1.56
GDT RMS_ALL_AT   2.12   2.12   2.12   2.12   2.12   2.12   2.12   2.12   2.11   2.11   2.11   2.09   2.09   2.07   2.06   2.06   2.06   2.06   2.06   2.06

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E     9_A      E     9_A
#   possible swapping detected:  E    37_A      E    37_A
#   possible swapping detected:  Y    42_A      Y    42_A
#   possible swapping detected:  E    48_A      E    48_A
#   possible swapping detected:  E   131_A      E   131_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S     2_A      S     2_A    16.174     0    0.040   0.596    17.830    0.000    0.000
LGA    M     3_A      M     3_A    10.068     0    0.616   1.080    12.235    0.476    0.714
LGA    A     4_A      A     4_A     9.224     0    0.636   0.609    10.805    2.143    1.714
LGA    E     5_A      E     5_A     8.073     0    0.628   0.544    10.872    9.048    5.185
LGA    L     6_A      L     6_A     5.370     0    0.615   1.342    10.872   32.262   18.750
LGA    K     7_A      K     7_A     1.754     0    0.633   0.993    12.733   81.548   42.857
LGA    Q     8_A      Q     8_A     0.782     0    0.024   0.079     1.149   90.595   92.646
LGA    E     9_A      E     9_A     0.526     0    0.011   0.706     2.064   95.238   87.778
LGA    W    10_A      W    10_A     0.278     0    0.014   0.127     0.417  100.000  100.000
LGA    I    11_A      I    11_A     0.360     0    0.019   0.057     0.728  100.000   97.619
LGA    N    12_A      N    12_A     0.186     0    0.012   0.110     0.470  100.000  100.000
LGA    T    13_A      T    13_A     0.168     0    0.016   0.061     0.301  100.000  100.000
LGA    A    14_A      A    14_A     0.183     0    0.045   0.050     0.288  100.000  100.000
LGA    I    15_A      I    15_A     0.169     0    0.021   0.071     0.370  100.000  100.000
LGA    E    16_A      E    16_A     0.312     0    0.048   0.371     1.495   97.619   92.698
LGA    A    17_A      A    17_A     0.369     0    0.020   0.022     0.403  100.000  100.000
LGA    L    18_A      L    18_A     0.237     0    0.054   1.254     2.726  100.000   90.238
LGA    D    19_A      D    19_A     0.277     0    0.014   0.107     0.497  100.000  100.000
LGA    K    20_A      K    20_A     0.252     0    0.038   0.184     0.645  100.000   97.884
LGA    A    21_A      A    21_A     0.258     0    0.044   0.057     0.505   97.619   98.095
LGA    Y    22_A      Y    22_A     0.385     0    0.016   0.048     0.746  100.000   96.032
LGA    V    23_A      V    23_A     0.469     0    0.056   0.066     0.580   97.619   98.639
LGA    P    24_A      P    24_A     0.393     0    0.061   0.061     0.586   97.619   97.279
LGA    Y    25_A      Y    25_A     0.493     0    0.019   0.067     0.737   95.238   92.857
LGA    S    26_A      S    26_A     0.406     0    0.012   0.029     0.482  100.000  100.000
LGA    H    27_A      H    27_A     0.256     0    0.023   0.385     1.781  100.000   90.810
LGA    F    28_A      F    28_A     0.152     0    0.012   0.037     0.272  100.000  100.000
LGA    P    29_A      P    29_A     0.330     0    0.030   0.061     0.399  100.000  100.000
LGA    V    30_A      V    30_A     0.270     0    0.010   1.334     2.608  100.000   88.844
LGA    G    31_A      G    31_A     0.155     0    0.018   0.018     0.246  100.000  100.000
LGA    A    32_A      A    32_A     0.165     0    0.012   0.023     0.264  100.000  100.000
LGA    C    33_A      C    33_A     0.175     0    0.050   0.055     0.335  100.000  100.000
LGA    L    34_A      L    34_A     0.242     0    0.010   0.041     0.281  100.000  100.000
LGA    V    35_A      V    35_A     0.073     0    0.027   1.344     2.889  100.000   88.844
LGA    T    36_A      T    36_A     0.482     0    0.021   0.052     0.661   95.238   93.197
LGA    E    37_A      E    37_A     0.880     0    0.036   1.016     3.607   90.476   80.423
LGA    S    38_A      S    38_A     1.050     0    0.044   0.064     1.050   88.214   87.460
LGA    G    39_A      G    39_A     0.814     0    0.016   0.016     0.884   90.476   90.476
LGA    K    40_A      K    40_A     0.398     0    0.051   0.755     3.884   97.619   78.360
LGA    I    41_A      I    41_A     0.269     0    0.072   1.355     3.988  100.000   82.917
LGA    Y    42_A      Y    42_A     0.255     0    0.026   0.059     0.328  100.000  100.000
LGA    Q    43_A      Q    43_A     0.272     0    0.012   0.973     2.193  100.000   92.169
LGA    G    44_A      G    44_A     0.302     0    0.001   0.001     0.323  100.000  100.000
LGA    I    45_A      I    45_A     0.212     0    0.034   0.094     0.781  100.000   97.619
LGA    N    46_A      N    46_A     0.150     0    0.047   0.167     0.461  100.000  100.000
LGA    I    47_A      I    47_A     0.198     0    0.036   0.067     0.387  100.000  100.000
LGA    E    48_A      E    48_A     0.249     0    0.027   0.134     0.786  100.000   97.884
LGA    N    49_A      N    49_A     0.289     0    0.011   0.054     0.663  100.000   96.429
LGA    A    50_A      A    50_A     0.294     0    0.015   0.016     0.673   97.619   98.095
LGA    S    51_A      S    51_A     0.719     0    0.024   0.043     1.212   92.857   90.556
LGA    F    52_A      F    52_A     1.020     0    0.039   0.510     2.580   83.690   77.749
LGA    G    53_A      G    53_A     1.406     0    0.013   0.013     1.528   79.286   79.286
LGA    L    54_A      L    54_A     0.979     0    0.015   1.233     3.439   90.476   82.083
LGA    T    55_A      T    55_A     0.743     0    0.109   1.162     2.925   88.214   80.748
LGA    N    56_A      N    56_A     0.078     0    0.053   0.090     0.271  100.000  100.000
LGA    C    57_A      C    57_A     0.058     0    0.015   0.047     0.161  100.000  100.000
LGA    A    58_A      A    58_A     0.119     0    0.012   0.013     0.127  100.000  100.000
LGA    E    59_A      E    59_A     0.152     0    0.020   0.111     0.502  100.000   98.942
LGA    R    60_A      R    60_A     0.129     0    0.012   0.097     0.449  100.000  100.000
LGA    T    61_A      T    61_A     0.092     0    0.025   0.053     0.243  100.000  100.000
LGA    A    62_A      A    62_A     0.195     0    0.023   0.023     0.252  100.000  100.000
LGA    F    63_A      F    63_A     0.405     0    0.029   0.059     0.532   97.619   93.939
LGA    F    64_A      F    64_A     0.493     0    0.036   0.094     0.945  100.000   93.939
LGA    K    65_A      K    65_A     0.286     0    0.045   0.138     0.552  100.000   96.825
LGA    A    66_A      A    66_A     0.105     0    0.020   0.018     0.185  100.000  100.000
LGA    V    67_A      V    67_A     0.063     0    0.045   1.327     2.566  100.000   88.844
LGA    S    68_A      S    68_A     0.355     0    0.013   0.693     3.027  100.000   90.079
LGA    E    69_A      E    69_A     0.589     0    0.026   0.794     2.973   92.857   83.016
LGA    G    70_A      G    70_A     0.519     0    0.061   0.061     0.519   97.619   97.619
LGA    E    71_A      E    71_A     0.346     0    0.037   0.229     1.207   97.619   93.704
LGA    R    72_A      R    72_A     0.562     0    0.084   0.156     1.064   90.595   90.519
LGA    S    73_A      S    73_A     0.799     0    0.101   0.654     2.445   90.476   84.683
LGA    F    74_A      F    74_A     0.228     0    0.021   0.068     0.451  100.000  100.000
LGA    T    75_A      T    75_A     0.154     0    0.017   0.031     0.214  100.000  100.000
LGA    H    76_A      H    76_A     0.087     0    0.059   0.187     0.425  100.000  100.000
LGA    L    77_A      L    77_A     0.144     0    0.022   0.044     0.259  100.000  100.000
LGA    V    78_A      V    78_A     0.204     0    0.030   1.340     2.518  100.000   87.755
LGA    V    79_A      V    79_A     0.204     0    0.039   1.326     2.714  100.000   88.844
LGA    A    80_A      A    80_A     0.210     0    0.011   0.020     0.250  100.000  100.000
LGA    G    81_A      G    81_A     0.094     0    0.016   0.016     0.551   97.619   97.619
LGA    H    82_A      H    82_A     0.488     0    0.019   0.076     0.764   97.619   93.333
LGA    T    83_A      T    83_A     0.460     0    0.029   0.055     0.768   97.619   94.558
LGA    P    84_A      P    84_A     0.483     0    0.016   0.046     0.601  100.000   95.918
LGA    D    85_A      D    85_A     0.319     0    0.017   0.091     0.502  100.000   98.810
LGA    P    86_A      P    86_A     0.337     0    0.046   0.054     0.468  100.000  100.000
LGA    I    87_A      I    87_A     0.401     0    0.013   0.078     0.623  100.000   95.238
LGA    S    88_A      S    88_A     0.912     0    0.077   0.121     1.816   92.857   87.619
LGA    P    89_A      P    89_A     0.566     0    0.036   0.359     1.361   90.476   89.184
LGA    C    90_A      C    90_A     0.509     0    0.023   0.095     0.658   95.238   93.651
LGA    G    91_A      G    91_A     0.432     0    0.032   0.032     0.442  100.000  100.000
LGA    A    92_A      A    92_A     0.511     0    0.013   0.015     0.532   97.619   96.190
LGA    C    93_A      C    93_A     0.285     0    0.010   0.037     0.361  100.000  100.000
LGA    R    94_A      R    94_A     0.292     0    0.029   0.125     0.863  100.000   96.537
LGA    Q    95_A      Q    95_A     0.296     0    0.043   0.109     0.475  100.000  100.000
LGA    V    96_A      V    96_A     0.273     0    0.011   1.340     2.621  100.000   88.844
LGA    M    97_A      M    97_A     0.340     0    0.024   0.910     2.514  100.000   92.262
LGA    A    98_A      A    98_A     0.310     0    0.006   0.007     0.432  100.000  100.000
LGA    E    99_A      E    99_A     0.452     0    0.021   0.237     1.322  100.000   91.693
LGA    F   100_A      F   100_A     0.238     0    0.020   0.102     0.323  100.000  100.000
LGA    C   101_A      C   101_A     0.109     0    0.020   0.028     0.251  100.000  100.000
LGA    A   102_A      A   102_A     0.137     0    0.036   0.033     0.204  100.000  100.000
LGA    P   103_A      P   103_A     0.126     0    0.040   0.064     0.300  100.000  100.000
LGA    D   104_A      D   104_A     0.112     0    0.012   0.473     1.080  100.000   95.357
LGA    M   105_A      M   105_A     0.054     0    0.029   0.333     0.865  100.000   98.810
LGA    P   106_A      P   106_A     0.129     0    0.032   0.293     0.861  100.000   98.639
LGA    V   107_A      V   107_A     0.085     0    0.015   1.347     2.562  100.000   88.844
LGA    T   108_A      T   108_A     0.229     0    0.020   0.026     0.290  100.000  100.000
LGA    L   109_A      L   109_A     0.276     0    0.025   1.250     2.975  100.000   90.238
LGA    V   110_A      V   110_A     0.144     0    0.055   1.336     2.568  100.000   88.844
LGA    G   111_A      G   111_A     0.485     0    0.025   0.025     0.554   95.238   95.238
LGA    D   112_A      D   112_A     0.740     0    0.008   0.193     2.225   90.476   81.726
LGA    N   113_A      N   113_A     0.487     0    0.039   0.830     3.341   97.619   85.655
LGA    G   114_A      G   114_A     0.465     0    0.019   0.019     0.465  100.000  100.000
LGA    V   115_A      V   115_A     0.239     0    0.036   0.644     2.773  100.000   93.878
LGA    T   116_A      T   116_A     0.134     0    0.020   0.067     0.417  100.000  100.000
LGA    K   117_A      K   117_A     0.209     0    0.024   0.656     1.986  100.000   92.804
LGA    A   118_A      A   118_A     0.212     0    0.044   0.055     0.298  100.000  100.000
LGA    T   119_A      T   119_A     0.135     0    0.029   0.100     0.367  100.000  100.000
LGA    T   120_A      T   120_A     0.172     0    0.009   0.057     0.313  100.000  100.000
LGA    V   121_A      V   121_A     0.076     0    0.016   1.330     2.537  100.000   88.844
LGA    R   122_A      R   122_A     0.233     0    0.009   1.255     6.775  100.000   74.978
LGA    E   123_A      E   123_A     0.213     0    0.016   0.255     0.994  100.000   98.942
LGA    L   124_A      L   124_A     0.187     0    0.035   1.251     2.798  100.000   90.238
LGA    L   125_A      L   125_A     0.199     0    0.027   0.096     1.064   95.238   92.917
LGA    P   126_A      P   126_A     1.066     0    0.666   0.636     2.947   77.619   80.544
LGA    Y   127_A      Y   127_A     2.030     0    0.016   1.274     7.181   66.786   51.032
LGA    A   128_A      A   128_A     1.806     0    0.051   0.064     1.923   75.000   74.571
LGA    F   129_A      F   129_A     1.477     0    0.069   0.095     1.697   77.143   78.312
LGA    T   130_A      T   130_A     0.410     0    0.037   0.078     1.183   92.857   90.544
LGA    E   131_A      E   131_A     1.480     0    0.132   0.852     3.369   81.548   70.582
LGA    K   132_A      K   132_A     1.842     0    0.085   0.600     4.820   63.690   54.392
LGA    D   133_A      D   133_A     3.504     0    0.038   0.158     5.841   48.452   37.500
LGA    L   134_A      L   134_A     2.384     0    0.640   0.939     3.359   57.381   64.167

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      133     532    532  100.00    1010   1010  100.00               133
SUMMARY(RMSD_GDC):     2.049          2.007                  2.276           92.828   89.043

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  134  133    4.0    128    0.67    94.737    96.180    16.629

LGA_LOCAL      RMSD:   0.670  Number of atoms:  128  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   2.123  Number of assigned atoms:  133 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   2.049  Standard rmsd on all 133 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.841098 * X  +  -0.273721 * Y  +  -0.466509 * Z  + -28.229776
  Y_new =   0.200413 * X  +   0.643389 * Y  +  -0.738840 * Z  +  22.323509
  Z_new =   0.502383 * X  +  -0.714932 * Y  +  -0.486297 * Z  + -11.741899 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  2.907680 -0.526352 -2.168110   [DEG:  166.5978  -30.1578 -124.2235 ]
ZXZ: -0.563193  2.078643  2.529057   [DEG:  -32.2686  119.0975  144.9043 ]
 
# END of job
