
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  134 ( 1014),  selected  133 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  133 ( 1010),  selected  133 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       2.07     2.07
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   132       3_A - 134_A       1.61     2.08
  LCS_AVERAGE:     99.23

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   129       6_A - 134_A       0.88     2.14
  LCS_AVERAGE:     94.84

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  133
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S     2_A     S     2_A      3  129  133      0    3    3    3    4    5    5    6    8    9   14   25   43   61   73  102  116  128  129  129 
LCS_GDT     M     3_A     M     3_A      3  132  133      0    3    3    3    4    5   38   53   92  108  121  128  128  130  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A     4_A     A     4_A      3  132  133      3    3    3    3    5    6    7   29   98  114  124  128  128  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     E     5_A     E     5_A    126  132  133      3    3    4    5   12   32   68   92  121  126  126  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     L     6_A     L     6_A    129  132  133      3    3    4    5    5   96  107  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     K     7_A     K     7_A    129  132  133      5   58  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     Q     8_A     Q     8_A    129  132  133     56  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     E     9_A     E     9_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     W    10_A     W    10_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     I    11_A     I    11_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     N    12_A     N    12_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     T    13_A     T    13_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     I    15_A     I    15_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     E    16_A     E    16_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A    17_A     A    17_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     L    18_A     L    18_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     D    19_A     D    19_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     K    20_A     K    20_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A    21_A     A    21_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     Y    22_A     Y    22_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     P    24_A     P    24_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     Y    25_A     Y    25_A    129  132  133     96  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     S    26_A     S    26_A    129  132  133     96  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     H    27_A     H    27_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     F    28_A     F    28_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     P    29_A     P    29_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     V    30_A     V    30_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     G    31_A     G    31_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A    32_A     A    32_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     C    33_A     C    33_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     L    34_A     L    34_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     V    35_A     V    35_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     T    36_A     T    36_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     E    37_A     E    37_A    129  132  133     62  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     S    38_A     S    38_A    129  132  133     56  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     G    39_A     G    39_A    129  132  133     92  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     K    40_A     K    40_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     Y    42_A     Y    42_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     Q    43_A     Q    43_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     G    44_A     G    44_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     I    45_A     I    45_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     N    46_A     N    46_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     I    47_A     I    47_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     E    48_A     E    48_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     N    49_A     N    49_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A    50_A     A    50_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    129  132  133     90  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     F    52_A     F    52_A    129  132  133     82  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     G    53_A     G    53_A    129  132  133     34  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     L    54_A     L    54_A    129  132  133     83  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     T    55_A     T    55_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     N    56_A     N    56_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     C    57_A     C    57_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A    58_A     A    58_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     E    59_A     E    59_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     R    60_A     R    60_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     T    61_A     T    61_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A    62_A     A    62_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     F    63_A     F    63_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     F    64_A     F    64_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     K    65_A     K    65_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A    66_A     A    66_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     V    67_A     V    67_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     S    68_A     S    68_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     E    69_A     E    69_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     G    70_A     G    70_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     E    71_A     E    71_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A    129  132  133     71  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     S    73_A     S    73_A    129  132  133     49  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     F    74_A     F    74_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     T    75_A     T    75_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     H    76_A     H    76_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     L    77_A     L    77_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     V    78_A     V    78_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     V    79_A     V    79_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A    80_A     A    80_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     G    81_A     G    81_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     H    82_A     H    82_A    129  132  133     93  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     T    83_A     T    83_A    129  132  133     93  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     P    84_A     P    84_A    129  132  133     93  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     D    85_A     D    85_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     P    86_A     P    86_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     I    87_A     I    87_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     S    88_A     S    88_A    129  132  133     50  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     P    89_A     P    89_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     C    90_A     C    90_A    129  132  133     93  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     G    91_A     G    91_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A    92_A     A    92_A    129  132  133     82  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     C    93_A     C    93_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     Q    95_A     Q    95_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     M    97_A     M    97_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A    98_A     A    98_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     E    99_A     E    99_A    129  132  133     92  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     C   101_A     C   101_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     P   103_A     P   103_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     D   104_A     D   104_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     M   105_A     M   105_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     P   106_A     P   106_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     V   107_A     V   107_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     T   108_A     T   108_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     L   109_A     L   109_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     V   110_A     V   110_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     G   111_A     G   111_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     D   112_A     D   112_A    129  132  133     93  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     G   114_A     G   114_A    129  132  133     88  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     V   115_A     V   115_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     T   116_A     T   116_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     K   117_A     K   117_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A   118_A     A   118_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     T   119_A     T   119_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     T   120_A     T   120_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     V   121_A     V   121_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     R   122_A     R   122_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     E   123_A     E   123_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A    129  132  133     97  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     P   126_A     P   126_A    129  132  133     41  115  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     Y   127_A     Y   127_A    129  132  133      3   75  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A   128_A     A   128_A    129  132  133      3  115  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     F   129_A     F   129_A    129  132  133     71  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     T   130_A     T   130_A    129  132  133     89  119  123  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     E   131_A     E   131_A    129  132  133      3    9   92  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A    129  132  133      3    4  119  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     D   133_A     D   133_A    129  132  133      3    3    5  112  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     L   134_A     L   134_A    129  132  133      3    3  119  124  127  128  128  128  129  129  129  129  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  98.02  (  94.84   99.23  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     97    119    123    124    127    128    128    128    129    129    129    129    130    131    132    132    132    132    132    132 
GDT PERCENT_AT  72.93  89.47  92.48  93.23  95.49  96.24  96.24  96.24  96.99  96.99  96.99  96.99  97.74  98.50  99.25  99.25  99.25  99.25  99.25  99.25
GDT RMS_LOCAL    0.30   0.41   0.47   0.49   0.67   0.73   0.73   0.73   0.88   0.88   0.88   0.88   1.13   1.38   1.61   1.61   1.61   1.61   1.61   1.61
GDT RMS_ALL_AT   2.13   2.12   2.12   2.12   2.14   2.15   2.15   2.15   2.14   2.14   2.14   2.14   2.11   2.10   2.08   2.08   2.08   2.08   2.08   2.08

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E     9_A      E     9_A
#   possible swapping detected:  Y    42_A      Y    42_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S     2_A      S     2_A    15.933     0    0.030   0.623    17.565    0.000    0.000
LGA    M     3_A      M     3_A    10.132     0    0.619   1.038    12.193    0.238    0.595
LGA    A     4_A      A     4_A     9.320     0    0.640   0.605    10.885    1.548    1.238
LGA    E     5_A      E     5_A     8.360     0    0.630   0.564    11.621    8.214    4.286
LGA    L     6_A      L     6_A     5.587     0    0.602   1.340    10.929   27.024   15.952
LGA    K     7_A      K     7_A     1.708     0    0.635   0.963    12.762   79.286   42.487
LGA    Q     8_A      Q     8_A     0.694     0    0.041   0.072     1.046   90.595   92.646
LGA    E     9_A      E     9_A     0.511     0    0.009   0.225     0.767   95.238   93.651
LGA    W    10_A      W    10_A     0.291     0    0.006   0.079     0.365  100.000  100.000
LGA    I    11_A      I    11_A     0.383     0    0.028   0.072     0.671  100.000   97.619
LGA    N    12_A      N    12_A     0.366     0    0.008   0.089     0.667  100.000   97.619
LGA    T    13_A      T    13_A     0.397     0    0.008   0.061     0.607  100.000   98.639
LGA    A    14_A      A    14_A     0.283     0    0.035   0.035     0.413  100.000  100.000
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LGA    A   102_A      A   102_A     0.115     0    0.034   0.032     0.200  100.000  100.000
LGA    P   103_A      P   103_A     0.089     0    0.044   0.066     0.334  100.000  100.000
LGA    D   104_A      D   104_A     0.164     0    0.022   0.452     1.231  100.000   94.167
LGA    M   105_A      M   105_A     0.028     0    0.028   0.208     0.434  100.000  100.000
LGA    P   106_A      P   106_A     0.101     0    0.039   0.298     0.844  100.000   98.639
LGA    V   107_A      V   107_A     0.164     0    0.019   1.348     2.551  100.000   88.844
LGA    T   108_A      T   108_A     0.278     0    0.024   0.027     0.304  100.000  100.000
LGA    L   109_A      L   109_A     0.303     0    0.026   1.250     2.811  100.000   90.238
LGA    V   110_A      V   110_A     0.155     0    0.055   1.341     2.588  100.000   88.844
LGA    G   111_A      G   111_A     0.364     0    0.019   0.019     0.440  100.000  100.000
LGA    D   112_A      D   112_A     0.662     0    0.014   0.169     1.995   92.857   85.060
LGA    N   113_A      N   113_A     0.474     0    0.045   0.863     3.867   97.619   82.738
LGA    G   114_A      G   114_A     0.518     0    0.033   0.033     0.518   97.619   97.619
LGA    V   115_A      V   115_A     0.151     0    0.039   0.638     2.518   97.619   92.517
LGA    T   116_A      T   116_A     0.271     0    0.042   0.069     0.451  100.000  100.000
LGA    K   117_A      K   117_A     0.198     0    0.023   0.672     2.097  100.000   92.963
LGA    A   118_A      A   118_A     0.251     0    0.047   0.062     0.357  100.000  100.000
LGA    T   119_A      T   119_A     0.231     0    0.043   0.103     0.438  100.000  100.000
LGA    T   120_A      T   120_A     0.272     0    0.008   0.052     0.366  100.000  100.000
LGA    V   121_A      V   121_A     0.202     0    0.010   1.332     2.634  100.000   88.844
LGA    R   122_A      R   122_A     0.298     0    0.003   0.384     1.351  100.000   94.892
LGA    E   123_A      E   123_A     0.407     0    0.027   0.427     1.219  100.000   96.878
LGA    L   124_A      L   124_A     0.388     0    0.047   1.253     2.792  100.000   90.238
LGA    L   125_A      L   125_A     0.385     0    0.016   0.127     1.123   95.238   91.726
LGA    P   126_A      P   126_A     1.205     0    0.664   0.633     3.058   75.833   78.299
LGA    Y   127_A      Y   127_A     1.941     0    0.046   1.300     7.142   72.857   53.056
LGA    A   128_A      A   128_A     1.686     0    0.050   0.060     1.806   77.143   76.286
LGA    F   129_A      F   129_A     1.213     0    0.080   0.090     1.547   83.690   81.515
LGA    T   130_A      T   130_A     0.543     0    0.039   0.149     1.648   88.333   85.442
LGA    E   131_A      E   131_A     2.497     0    0.152   1.009     4.748   64.881   55.344
LGA    K   132_A      K   132_A     2.642     0    0.056   0.989     3.838   53.810   51.746
LGA    D   133_A      D   133_A     3.426     0    0.037   0.174     5.570   51.786   41.190
LGA    L   134_A      L   134_A     2.961     0    0.026   0.653     4.276   48.690   54.167

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      133     532    532  100.00    1010   1010  100.00               133
SUMMARY(RMSD_GDC):     2.072          2.036                  2.280           91.984   88.591

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  134  133    4.0    128    0.73    94.549    96.342    15.361

LGA_LOCAL      RMSD:   0.733  Number of atoms:  128  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   2.147  Number of assigned atoms:  133 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   2.072  Standard rmsd on all 133 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.391675 * X  +   0.919799 * Y  +   0.023666 * Z  + -27.675650
  Y_new =   0.578088 * X  +  -0.225991 * Y  +  -0.784055 * Z  +  24.844740
  Z_new =  -0.715825 * X  +   0.320776 * Y  +  -0.620240 * Z  + -11.721734 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  0.975307  0.797805  2.664295   [DEG:   55.8810   45.7109  152.6529 ]
ZXZ:  0.030175  2.239844 -1.149506   [DEG:    1.7289  128.3336  -65.8619 ]
 
# END of job
