
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  134 ( 1014),  selected  133 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  133 ( 1010),  selected  133 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       2.07     2.07
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   132       3_A - 134_A       1.59     2.08
  LCS_AVERAGE:     99.23

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   129       6_A - 134_A       0.86     2.13
  LCS_AVERAGE:     94.84

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  133
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S     2_A     S     2_A      3  129  133      0    3    3    3    5    7    7    8   10   13   14   23   42   45   72  102  119  127  128  129 
LCS_GDT     M     3_A     M     3_A      3  132  133      0    3    3    3    5    7   41   62   93  109  120  127  128  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A     4_A     A     4_A      3  132  133      3    3    3    3    6    7    7   28   95  109  120  127  128  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     E     5_A     E     5_A    126  132  133      3    4    4    5   12   32   73   95  122  126  126  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     L     6_A     L     6_A    129  132  133      3    4    4    5   56   73  121  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     K     7_A     K     7_A    129  132  133      8   60  121  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     Q     8_A     Q     8_A    129  132  133     87  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     E     9_A     E     9_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     W    10_A     W    10_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     I    11_A     I    11_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     N    12_A     N    12_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     T    13_A     T    13_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     I    15_A     I    15_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     E    16_A     E    16_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A    17_A     A    17_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     L    18_A     L    18_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     D    19_A     D    19_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     K    20_A     K    20_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A    21_A     A    21_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     Y    22_A     Y    22_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     P    24_A     P    24_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     Y    25_A     Y    25_A    129  132  133     76  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     S    26_A     S    26_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     H    27_A     H    27_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     F    28_A     F    28_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     P    29_A     P    29_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     V    30_A     V    30_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     G    31_A     G    31_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A    32_A     A    32_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     C    33_A     C    33_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     L    34_A     L    34_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     V    35_A     V    35_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     T    36_A     T    36_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     E    37_A     E    37_A    129  132  133     85  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     S    38_A     S    38_A    129  132  133     58  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     G    39_A     G    39_A    129  132  133     96  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     K    40_A     K    40_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     Y    42_A     Y    42_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     Q    43_A     Q    43_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     G    44_A     G    44_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     I    45_A     I    45_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     N    46_A     N    46_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     I    47_A     I    47_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     E    48_A     E    48_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     N    49_A     N    49_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A    50_A     A    50_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    129  132  133     92  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     F    52_A     F    52_A    129  132  133     87  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     G    53_A     G    53_A    129  132  133     48  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     L    54_A     L    54_A    129  132  133     34  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     T    55_A     T    55_A    129  132  133     95  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     N    56_A     N    56_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     C    57_A     C    57_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A    58_A     A    58_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     E    59_A     E    59_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     R    60_A     R    60_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     T    61_A     T    61_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A    62_A     A    62_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     F    63_A     F    63_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     F    64_A     F    64_A    129  132  133     95  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     K    65_A     K    65_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A    66_A     A    66_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     V    67_A     V    67_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     S    68_A     S    68_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     E    69_A     E    69_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     G    70_A     G    70_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     E    71_A     E    71_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     S    73_A     S    73_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     F    74_A     F    74_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     T    75_A     T    75_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     H    76_A     H    76_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     L    77_A     L    77_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     V    78_A     V    78_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     V    79_A     V    79_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A    80_A     A    80_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     G    81_A     G    81_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     H    82_A     H    82_A    129  132  133     90  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     T    83_A     T    83_A    129  132  133     85  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     P    84_A     P    84_A    129  132  133     85  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     D    85_A     D    85_A    129  132  133     95  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     P    86_A     P    86_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     I    87_A     I    87_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     S    88_A     S    88_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     P    89_A     P    89_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     C    90_A     C    90_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     G    91_A     G    91_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A    92_A     A    92_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     C    93_A     C    93_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     Q    95_A     Q    95_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     M    97_A     M    97_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A    98_A     A    98_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     E    99_A     E    99_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     C   101_A     C   101_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     P   103_A     P   103_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     D   104_A     D   104_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     M   105_A     M   105_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     P   106_A     P   106_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     V   107_A     V   107_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     T   108_A     T   108_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     L   109_A     L   109_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     V   110_A     V   110_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     G   111_A     G   111_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     D   112_A     D   112_A    129  132  133     77  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A    129  132  133     32  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     G   114_A     G   114_A    129  132  133      5   10  121  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     V   115_A     V   115_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     T   116_A     T   116_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     K   117_A     K   117_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A   118_A     A   118_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     T   119_A     T   119_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     T   120_A     T   120_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     V   121_A     V   121_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     R   122_A     R   122_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     E   123_A     E   123_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A    129  132  133     97  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     P   126_A     P   126_A    129  132  133     55  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     Y   127_A     Y   127_A    129  132  133      3   34  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     A   128_A     A   128_A    129  132  133      3  115  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     F   129_A     F   129_A    129  132  133     95  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     T   130_A     T   130_A    129  132  133     87  119  122  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     E   131_A     E   131_A    129  132  133      3   58  117  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A    129  132  133     19   63  117  126  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     D   133_A     D   133_A    129  132  133      3    3    5    6  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_GDT     L   134_A     L   134_A    129  132  133     14   50  117  125  128  128  128  129  129  129  129  130  130  131  132  132  132  132  132  132 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  98.02  (  94.84   99.23  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     97    119    122    126    128    128    128    129    129    129    129    130    130    131    132    132    132    132    132    132 
GDT PERCENT_AT  72.93  89.47  91.73  94.74  96.24  96.24  96.24  96.99  96.99  96.99  96.99  97.74  97.74  98.50  99.25  99.25  99.25  99.25  99.25  99.25
GDT RMS_LOCAL    0.28   0.40   0.45   0.60   0.71   0.71   0.71   0.86   0.86   0.86   0.86   1.11   1.11   1.36   1.59   1.59   1.59   1.59   1.59   1.59
GDT RMS_ALL_AT   2.12   2.12   2.11   2.13   2.14   2.14   2.14   2.13   2.13   2.13   2.13   2.11   2.11   2.09   2.08   2.08   2.08   2.08   2.08   2.08

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E     5_A      E     5_A
#   possible swapping detected:  E     9_A      E     9_A
#   possible swapping detected:  Y    42_A      Y    42_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S     2_A      S     2_A    16.037     0    0.039   0.636    17.942    0.000    0.000
LGA    M     3_A      M     3_A     9.989     0    0.623   1.059    12.041    0.833    0.893
LGA    A     4_A      A     4_A     9.265     0    0.638   0.607    10.829    1.786    1.429
LGA    E     5_A      E     5_A     8.183     0    0.632   0.696    10.064    9.048    4.709
LGA    L     6_A      L     6_A     5.458     0    0.608   1.340    10.981   31.190   18.036
LGA    K     7_A      K     7_A     1.671     0    0.633   0.997    12.760   79.286   42.487
LGA    Q     8_A      Q     8_A     0.702     0    0.036   1.036     2.274   90.595   85.873
LGA    E     9_A      E     9_A     0.491     0    0.011   0.188     0.868   97.619   93.651
LGA    W    10_A      W    10_A     0.239     0    0.012   0.089     0.339  100.000  100.000
LGA    I    11_A      I    11_A     0.357     0    0.024   0.060     0.677  100.000   97.619
LGA    N    12_A      N    12_A     0.240     0    0.008   0.083     0.339  100.000  100.000
LGA    T    13_A      T    13_A     0.300     0    0.006   0.061     0.501  100.000   98.639
LGA    A    14_A      A    14_A     0.229     0    0.033   0.036     0.306  100.000  100.000
LGA    I    15_A      I    15_A     0.176     0    0.015   0.085     0.326  100.000  100.000
LGA    E    16_A      E    16_A     0.343     0    0.007   0.501     1.500  100.000   94.815
LGA    A    17_A      A    17_A     0.466     0    0.030   0.029     0.551   97.619   98.095
LGA    L    18_A      L    18_A     0.368     0    0.018   1.259     2.586  100.000   90.238
LGA    D    19_A      D    19_A     0.247     0    0.014   0.149     0.904  100.000   96.429
LGA    K    20_A      K    20_A     0.145     0    0.040   0.179     0.314  100.000  100.000
LGA    A    21_A      A    21_A     0.278     0    0.039   0.053     0.460  100.000  100.000
LGA    Y    22_A      Y    22_A     0.445     0    0.007   0.069     0.989   95.238   92.857
LGA    V    23_A      V    23_A     0.593     0    0.046   0.082     0.778   90.476   90.476
LGA    P    24_A      P    24_A     0.583     0    0.067   0.069     0.918   90.476   91.837
LGA    Y    25_A      Y    25_A     0.808     0    0.023   0.068     0.948   90.476   90.476
LGA    S    26_A      S    26_A     0.631     0    0.013   0.033     0.703   90.476   92.063
LGA    H    27_A      H    27_A     0.411     0    0.044   0.375     1.410  100.000   94.381
LGA    F    28_A      F    28_A     0.248     0    0.003   0.168     0.671  100.000   96.537
LGA    P    29_A      P    29_A     0.384     0    0.042   0.060     0.399  100.000  100.000
LGA    V    30_A      V    30_A     0.211     0    0.024   1.334     2.634  100.000   88.844
LGA    G    31_A      G    31_A     0.149     0    0.013   0.013     0.332  100.000  100.000
LGA    A    32_A      A    32_A     0.175     0    0.015   0.023     0.243  100.000  100.000
LGA    C    33_A      C    33_A     0.188     0    0.048   0.052     0.303  100.000  100.000
LGA    L    34_A      L    34_A     0.287     0    0.031   0.057     0.340  100.000  100.000
LGA    V    35_A      V    35_A     0.215     0    0.028   1.346     2.876  100.000   88.844
LGA    T    36_A      T    36_A     0.577     0    0.027   0.042     0.667   92.857   91.837
LGA    E    37_A      E    37_A     0.787     0    0.031   0.171     0.980   90.476   91.534
LGA    S    38_A      S    38_A     1.140     0    0.026   0.048     1.199   81.429   81.429
LGA    G    39_A      G    39_A     0.897     0    0.010   0.010     0.964   90.476   90.476
LGA    K    40_A      K    40_A     0.590     0    0.032   0.760     3.985   95.238   77.302
LGA    I    41_A      I    41_A     0.369     0    0.084   1.374     3.865   97.619   81.726
LGA    Y    42_A      Y    42_A     0.263     0    0.035   0.032     0.397  100.000  100.000
LGA    Q    43_A      Q    43_A     0.177     0    0.071   0.537     1.595  100.000   92.804
LGA    G    44_A      G    44_A     0.135     0    0.029   0.029     0.362  100.000  100.000
LGA    I    45_A      I    45_A     0.311     0    0.029   0.094     0.822  100.000   96.429
LGA    N    46_A      N    46_A     0.298     0    0.053   0.217     0.639   97.619   97.619
LGA    I    47_A      I    47_A     0.311     0    0.022   0.043     0.500  100.000   98.810
LGA    E    48_A      E    48_A     0.584     0    0.038   0.160     0.982   92.857   91.534
LGA    N    49_A      N    49_A     0.673     0    0.022   0.061     0.900   95.238   92.857
LGA    A    50_A      A    50_A     0.238     0    0.018   0.020     0.382  100.000  100.000
LGA    S    51_A      S    51_A     0.559     0    0.024   0.032     0.985   92.857   92.063
LGA    F    52_A      F    52_A     0.586     0    0.018   1.065     7.049   92.857   58.918
LGA    G    53_A      G    53_A     1.131     0    0.014   0.014     1.331   83.690   83.690
LGA    L    54_A      L    54_A     0.949     0    0.010   1.232     3.738   90.476   82.321
LGA    T    55_A      T    55_A     0.636     0    0.084   1.179     2.928   90.476   83.197
LGA    N    56_A      N    56_A     0.264     0    0.054   0.116     0.463  100.000  100.000
LGA    C    57_A      C    57_A     0.151     0    0.020   0.029     0.279  100.000  100.000
LGA    A    58_A      A    58_A     0.131     0    0.020   0.018     0.153  100.000  100.000
LGA    E    59_A      E    59_A     0.079     0    0.017   0.088     0.379  100.000  100.000
LGA    R    60_A      R    60_A     0.069     0    0.009   0.110     0.505  100.000   98.268
LGA    T    61_A      T    61_A     0.108     0    0.012   0.063     0.322  100.000  100.000
LGA    A    62_A      A    62_A     0.122     0    0.016   0.016     0.169  100.000  100.000
LGA    F    63_A      F    63_A     0.218     0    0.022   0.035     0.418  100.000  100.000
LGA    F    64_A      F    64_A     0.412     0    0.022   0.056     0.639  100.000   93.939
LGA    K    65_A      K    65_A     0.388     0    0.024   0.134     0.570  100.000   96.825
LGA    A    66_A      A    66_A     0.219     0    0.007   0.007     0.222  100.000  100.000
LGA    V    67_A      V    67_A     0.144     0    0.024   1.329     2.531  100.000   88.844
LGA    S    68_A      S    68_A     0.450     0    0.010   0.692     3.007   95.238   86.905
LGA    E    69_A      E    69_A     0.584     0    0.026   0.763     2.581   92.857   84.868
LGA    G    70_A      G    70_A     0.413     0    0.037   0.037     0.447  100.000  100.000
LGA    E    71_A      E    71_A     0.418     0    0.022   0.353     1.450   97.619   95.820
LGA    R    72_A      R    72_A     0.597     0    0.069   0.122     0.962   92.857   94.805
LGA    S    73_A      S    73_A     0.607     0    0.087   0.090     0.789   92.857   92.063
LGA    F    74_A      F    74_A     0.280     0    0.008   0.059     0.412  100.000  100.000
LGA    T    75_A      T    75_A     0.154     0    0.021   0.024     0.229  100.000  100.000
LGA    H    76_A      H    76_A     0.133     0    0.040   0.133     0.348  100.000  100.000
LGA    L    77_A      L    77_A     0.174     0    0.019   0.058     0.256  100.000  100.000
LGA    V    78_A      V    78_A     0.124     0    0.021   1.344     2.520  100.000   87.755
LGA    V    79_A      V    79_A     0.115     0    0.039   1.315     2.665  100.000   88.844
LGA    A    80_A      A    80_A     0.119     0    0.021   0.033     0.169  100.000  100.000
LGA    G    81_A      G    81_A     0.126     0    0.016   0.016     0.605   97.619   97.619
LGA    H    82_A      H    82_A     0.657     0    0.026   0.097     0.794   90.476   90.476
LGA    T    83_A      T    83_A     0.693     0    0.025   0.102     1.100   90.476   89.184
LGA    P    84_A      P    84_A     0.778     0    0.062   0.421     1.019   90.476   89.184
LGA    D    85_A      D    85_A     0.677     0    0.026   0.115     1.164   90.476   88.214
LGA    P    86_A      P    86_A     0.407     0    0.028   0.047     0.530   97.619   98.639
LGA    I    87_A      I    87_A     0.322     0    0.019   0.513     1.686  100.000   96.607
LGA    S    88_A      S    88_A     0.385     0    0.028   0.043     0.577  100.000   96.825
LGA    P    89_A      P    89_A     0.393     0    0.009   0.065     0.419  100.000  100.000
LGA    C    90_A      C    90_A     0.412     0    0.020   0.106     0.615  100.000   96.825
LGA    G    91_A      G    91_A     0.399     0    0.040   0.040     0.399  100.000  100.000
LGA    A    92_A      A    92_A     0.438     0    0.009   0.011     0.503  100.000   98.095
LGA    C    93_A      C    93_A     0.173     0    0.012   0.038     0.280  100.000  100.000
LGA    R    94_A      R    94_A     0.228     0    0.022   0.124     1.033  100.000   95.714
LGA    Q    95_A      Q    95_A     0.214     0    0.035   0.090     0.239  100.000  100.000
LGA    V    96_A      V    96_A     0.174     0    0.011   1.339     2.612  100.000   88.844
LGA    M    97_A      M    97_A     0.327     0    0.005   0.874     2.446  100.000   93.214
LGA    A    98_A      A    98_A     0.288     0    0.013   0.019     0.375  100.000  100.000
LGA    E    99_A      E    99_A     0.352     0    0.013   0.244     1.262  100.000   94.815
LGA    F   100_A      F   100_A     0.142     0    0.024   0.083     0.493  100.000  100.000
LGA    C   101_A      C   101_A     0.245     0    0.018   0.026     0.270  100.000  100.000
LGA    A   102_A      A   102_A     0.271     0    0.029   0.028     0.394  100.000  100.000
LGA    P   103_A      P   103_A     0.246     0    0.015   0.048     0.355  100.000  100.000
LGA    D   104_A      D   104_A     0.386     0    0.029   0.226     0.871   97.619   95.238
LGA    M   105_A      M   105_A     0.207     0    0.039   0.181     0.533  100.000   98.810
LGA    P   106_A      P   106_A     0.192     0    0.022   0.291     0.884  100.000   98.639
LGA    V   107_A      V   107_A     0.072     0    0.010   1.342     2.632  100.000   88.844
LGA    T   108_A      T   108_A     0.248     0    0.018   0.041     0.343  100.000  100.000
LGA    L   109_A      L   109_A     0.278     0    0.036   1.248     2.822  100.000   90.238
LGA    V   110_A      V   110_A     0.218     0    0.051   1.335     2.583  100.000   88.844
LGA    G   111_A      G   111_A     0.505     0    0.019   0.019     0.568   92.857   92.857
LGA    D   112_A      D   112_A     0.780     0    0.030   0.165     2.440   92.857   81.905
LGA    N   113_A      N   113_A     0.676     0    0.058   0.844     3.276   85.952   79.821
LGA    G   114_A      G   114_A     1.597     0    0.039   0.039     1.597   79.286   79.286
LGA    V   115_A      V   115_A     0.448     0    0.039   0.636     2.763   95.238   88.435
LGA    T   116_A      T   116_A     0.194     0    0.044   0.072     0.629  100.000   98.639
LGA    K   117_A      K   117_A     0.040     0    0.023   0.667     1.818  100.000   93.862
LGA    A   118_A      A   118_A     0.239     0    0.048   0.064     0.368  100.000  100.000
LGA    T   119_A      T   119_A     0.204     0    0.030   0.100     0.469  100.000  100.000
LGA    T   120_A      T   120_A     0.227     0    0.010   0.032     0.292  100.000  100.000
LGA    V   121_A      V   121_A     0.183     0    0.029   1.331     2.500  100.000   89.932
LGA    R   122_A      R   122_A     0.329     0    0.022   0.994     2.820  100.000   89.481
LGA    E   123_A      E   123_A     0.286     0    0.018   0.291     1.438  100.000   96.878
LGA    L   124_A      L   124_A     0.282     0    0.028   1.253     2.871  100.000   90.238
LGA    L   125_A      L   125_A     0.140     0    0.030   0.097     1.050   97.619   95.298
LGA    P   126_A      P   126_A     1.058     0    0.660   0.634     2.974   77.619   80.544
LGA    Y   127_A      Y   127_A     1.785     0    0.080   1.197     8.248   72.857   48.175
LGA    A   128_A      A   128_A     1.468     0    0.055   0.077     1.682   79.286   79.714
LGA    F   129_A      F   129_A     0.813     0    0.052   0.168     1.249   88.214   88.052
LGA    T   130_A      T   130_A     0.712     0    0.037   0.095     1.743   88.333   84.150
LGA    E   131_A      E   131_A     2.443     0    0.134   0.818     3.655   64.881   59.101
LGA    K   132_A      K   132_A     2.461     0    0.065   0.646     3.428   59.167   55.661
LGA    D   133_A      D   133_A     3.313     0    0.030   0.212     5.461   53.571   42.679
LGA    L   134_A      L   134_A     2.798     0    0.022   0.603     3.927   50.238   58.810

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      133     532    532  100.00    1010   1010  100.00               133
SUMMARY(RMSD_GDC):     2.066          2.035                  2.313           92.131   88.655

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  134  133    4.0    129    0.86    95.113    96.507    13.489

LGA_LOCAL      RMSD:   0.856  Number of atoms:  129  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   2.132  Number of assigned atoms:  133 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   2.066  Standard rmsd on all 133 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.365537 * X  +   0.912001 * Y  +  -0.186111 * Z  + -27.616566
  Y_new =   0.444838 * X  +   0.346803 * Y  +   0.825740 * Z  +  24.248150
  Z_new =   0.817620 * X  +   0.219049 * Y  +  -0.532462 * Z  + -11.317632 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  2.258647 -0.957265  2.751307   [DEG:  129.4109  -54.8472  157.6383 ]
ZXZ: -2.919910  2.132303  1.309033   [DEG: -167.2985  122.1719   75.0021 ]
 
# END of job
