
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  134 ( 1014),  selected  133 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  133 ( 1010),  selected  133 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.62     0.62
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.62     0.62
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.62     0.62
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  133
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S     2_A     S     2_A    133  133  133     59  123  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M     3_A     M     3_A    133  133  133     64  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A     4_A     A     4_A    133  133  133     40  122  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     5_A     E     5_A    133  133  133     68  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L     6_A     L     6_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K     7_A     K     7_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q     8_A     Q     8_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     9_A     E     9_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     W    10_A     W    10_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    11_A     I    11_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    12_A     N    12_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    13_A     T    13_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    15_A     I    15_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    16_A     E    16_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    17_A     A    17_A    133  133  133     99  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    18_A     L    18_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    19_A     D    19_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    20_A     K    20_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    21_A     A    21_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    22_A     Y    22_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    24_A     P    24_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    25_A     Y    25_A    133  133  133    102  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    26_A     S    26_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    27_A     H    27_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    28_A     F    28_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    29_A     P    29_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    30_A     V    30_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    31_A     G    31_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    32_A     A    32_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    33_A     C    33_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    34_A     L    34_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    35_A     V    35_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    36_A     T    36_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    37_A     E    37_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    38_A     S    38_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    39_A     G    39_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    40_A     K    40_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    42_A     Y    42_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    43_A     Q    43_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    44_A     G    44_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    45_A     I    45_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    46_A     N    46_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    47_A     I    47_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    48_A     E    48_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    49_A     N    49_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    50_A     A    50_A    133  133  133    102  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    133  133  133     37  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    52_A     F    52_A    133  133  133     17  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    53_A     G    53_A    133  133  133     22  122  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    54_A     L    54_A    133  133  133     43  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    55_A     T    55_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    56_A     N    56_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    57_A     C    57_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    58_A     A    58_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    59_A     E    59_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    60_A     R    60_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    61_A     T    61_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    62_A     A    62_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    63_A     F    63_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    64_A     F    64_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    65_A     K    65_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    66_A     A    66_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    67_A     V    67_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    68_A     S    68_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    69_A     E    69_A    133  133  133    104  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    70_A     G    70_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    71_A     E    71_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    73_A     S    73_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    74_A     F    74_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    75_A     T    75_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    76_A     H    76_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    77_A     L    77_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    78_A     V    78_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    79_A     V    79_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    80_A     A    80_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    81_A     G    81_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    82_A     H    82_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    83_A     T    83_A    133  133  133     76  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    84_A     P    84_A    133  133  133     81  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    85_A     D    85_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    86_A     P    86_A    133  133  133     87  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    87_A     I    87_A    133  133  133     37  122  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    88_A     S    88_A    133  133  133     66  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    89_A     P    89_A    133  133  133     77  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    90_A     C    90_A    133  133  133     77  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    91_A     G    91_A    133  133  133     44  122  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    92_A     A    92_A    133  133  133     77  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    93_A     C    93_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    95_A     Q    95_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M    97_A     M    97_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    98_A     A    98_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    99_A     E    99_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C   101_A     C   101_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   103_A     P   103_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   104_A     D   104_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M   105_A     M   105_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   106_A     P   106_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   107_A     V   107_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   108_A     T   108_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   109_A     L   109_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   110_A     V   110_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   111_A     G   111_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   112_A     D   112_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A    133  133  133     99  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   114_A     G   114_A    133  133  133    104  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   115_A     V   115_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   116_A     T   116_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   117_A     K   117_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   118_A     A   118_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   119_A     T   119_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   120_A     T   120_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   121_A     V   121_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R   122_A     R   122_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   123_A     E   123_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   126_A     P   126_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y   127_A     Y   127_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   128_A     A   128_A    133  133  133     87  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   129_A     F   129_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   130_A     T   130_A    133  133  133    105  124  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   131_A     E   131_A    133  133  133     33   97  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A    133  133  133     65  118  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   133_A     D   133_A    133  133  133      3    3    5  125  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   134_A     L   134_A    133  133  133     54  103  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT    105    124    131    132    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133 
GDT PERCENT_AT  78.95  93.23  98.50  99.25 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.31   0.43   0.51   0.55   0.62   0.62   0.62   0.62   0.62   0.62   0.62   0.62   0.62   0.62   0.62   0.62   0.62   0.62   0.62   0.62
GDT RMS_ALL_AT   0.64   0.63   0.62   0.62   0.62   0.62   0.62   0.62   0.62   0.62   0.62   0.62   0.62   0.62   0.62   0.62   0.62   0.62   0.62   0.62

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E     5_A      E     5_A
#   possible swapping detected:  E    16_A      E    16_A
#   possible swapping detected:  Y    22_A      Y    22_A
#   possible swapping detected:  F    28_A      F    28_A
#   possible swapping detected:  E    37_A      E    37_A
#   possible swapping detected:  Y    42_A      Y    42_A
#   possible swapping detected:  E    48_A      E    48_A
#   possible swapping detected:  E    59_A      E    59_A
#   possible swapping detected:  E    69_A      E    69_A
#   possible swapping detected:  E    71_A      E    71_A
#   possible swapping detected:  E    99_A      E    99_A
#   possible swapping detected:  E   123_A      E   123_A
#   possible swapping detected:  F   129_A      F   129_A
#   possible swapping detected:  E   131_A      E   131_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S     2_A      S     2_A     1.115     0    0.029   0.603     3.035   83.690   77.698
LGA    M     3_A      M     3_A     1.005     0    0.060   0.821     3.475   83.690   80.893
LGA    A     4_A      A     4_A     1.252     0    0.054   0.067     1.592   83.690   81.524
LGA    E     5_A      E     5_A     0.963     0    0.058   0.106     1.532   90.595   84.550
LGA    L     6_A      L     6_A     0.286     0    0.036   0.187     0.653   97.619   97.619
LGA    K     7_A      K     7_A     0.426     0    0.027   0.897     4.362  100.000   77.143
LGA    Q     8_A      Q     8_A     0.287     0    0.022   0.110     0.547  100.000   98.942
LGA    E     9_A      E     9_A     0.218     0    0.043   0.329     1.515  100.000   95.926
LGA    W    10_A      W    10_A     0.232     0    0.014   0.095     0.354  100.000  100.000
LGA    I    11_A      I    11_A     0.291     0    0.057   0.075     0.394  100.000  100.000
LGA    N    12_A      N    12_A     0.347     0    0.046   0.130     0.542  100.000   98.810
LGA    T    13_A      T    13_A     0.447     0    0.028   0.119     0.840   97.619   94.558
LGA    A    14_A      A    14_A     0.267     0    0.032   0.037     0.289  100.000  100.000
LGA    I    15_A      I    15_A     0.142     0    0.069   0.099     0.273  100.000  100.000
LGA    E    16_A      E    16_A     0.331     0    0.057   0.259     0.855   97.619   95.767
LGA    A    17_A      A    17_A     0.500     0    0.028   0.039     0.648   95.238   94.286
LGA    L    18_A      L    18_A     0.413     0    0.075   0.111     0.742   97.619   98.810
LGA    D    19_A      D    19_A     0.334     0    0.027   0.176     0.997  100.000   96.429
LGA    K    20_A      K    20_A     0.297     0    0.016   0.227     0.475  100.000  100.000
LGA    A    21_A      A    21_A     0.222     0    0.083   0.094     0.554   97.619   98.095
LGA    Y    22_A      Y    22_A     0.322     0    0.022   0.041     0.860  100.000   95.238
LGA    V    23_A      V    23_A     0.441     0    0.029   0.048     0.475  100.000  100.000
LGA    P    24_A      P    24_A     0.509     0    0.038   0.039     0.704   90.476   90.476
LGA    Y    25_A      Y    25_A     0.623     0    0.006   0.110     0.966   90.476   90.476
LGA    S    26_A      S    26_A     0.545     0    0.015   0.032     0.588   90.476   93.651
LGA    H    27_A      H    27_A     0.518     0    0.025   0.396     2.037   95.238   86.286
LGA    F    28_A      F    28_A     0.299     0    0.023   0.055     0.735  100.000   96.537
LGA    P    29_A      P    29_A     0.485     0    0.039   0.040     0.509  100.000   98.639
LGA    V    30_A      V    30_A     0.259     0    0.049   0.061     0.323  100.000  100.000
LGA    G    31_A      G    31_A     0.276     0    0.028   0.028     0.335  100.000  100.000
LGA    A    32_A      A    32_A     0.063     0    0.036   0.041     0.182  100.000  100.000
LGA    C    33_A      C    33_A     0.139     0    0.016   0.046     0.273  100.000  100.000
LGA    L    34_A      L    34_A     0.161     0    0.021   0.060     0.204  100.000  100.000
LGA    V    35_A      V    35_A     0.096     0    0.025   0.031     0.299  100.000  100.000
LGA    T    36_A      T    36_A     0.272     0    0.013   0.031     0.400  100.000  100.000
LGA    E    37_A      E    37_A     0.361     0    0.051   0.497     1.306  100.000   95.873
LGA    S    38_A      S    38_A     0.321     0    0.029   0.059     0.387  100.000  100.000
LGA    G    39_A      G    39_A     0.370     0    0.024   0.024     0.370  100.000  100.000
LGA    K    40_A      K    40_A     0.191     0    0.020   0.720     4.020  100.000   79.788
LGA    I    41_A      I    41_A     0.324     0    0.083   1.410     3.612  100.000   81.964
LGA    Y    42_A      Y    42_A     0.047     0    0.092   0.097     0.469  100.000  100.000
LGA    Q    43_A      Q    43_A     0.056     0    0.011   0.514     1.626  100.000   91.799
LGA    G    44_A      G    44_A     0.139     0    0.013   0.013     0.204  100.000  100.000
LGA    I    45_A      I    45_A     0.200     0    0.010   0.094     0.557  100.000   98.810
LGA    N    46_A      N    46_A     0.294     0    0.056   0.090     0.389  100.000  100.000
LGA    I    47_A      I    47_A     0.283     0    0.011   0.047     0.411  100.000  100.000
LGA    E    48_A      E    48_A     0.370     0    0.072   0.145     0.645   97.619   97.884
LGA    N    49_A      N    49_A     0.317     0    0.028   0.059     0.774  100.000   95.238
LGA    A    50_A      A    50_A     0.431     0    0.018   0.026     0.944   95.238   96.190
LGA    S    51_A      S    51_A     1.073     0    0.087   0.087     1.700   83.690   81.508
LGA    F    52_A      F    52_A     1.059     0    0.062   0.469     2.176   83.690   79.221
LGA    G    53_A      G    53_A     1.367     0    0.025   0.025     1.367   81.429   81.429
LGA    L    54_A      L    54_A     0.967     0    0.022   0.151     1.390   88.214   85.952
LGA    T    55_A      T    55_A     0.374     0    0.056   0.066     0.612   97.619   98.639
LGA    N    56_A      N    56_A     0.285     0    0.035   0.290     0.692  100.000   98.810
LGA    C    57_A      C    57_A     0.285     0    0.027   0.120     0.398  100.000  100.000
LGA    A    58_A      A    58_A     0.282     0    0.020   0.027     0.320  100.000  100.000
LGA    E    59_A      E    59_A     0.164     0    0.037   0.250     0.827  100.000   98.942
LGA    R    60_A      R    60_A     0.119     0    0.019   0.193     1.057  100.000   95.714
LGA    T    61_A      T    61_A     0.167     0    0.019   0.063     0.354  100.000  100.000
LGA    A    62_A      A    62_A     0.182     0    0.036   0.040     0.186  100.000  100.000
LGA    F    63_A      F    63_A     0.199     0    0.055   0.052     0.288  100.000  100.000
LGA    F    64_A      F    64_A     0.331     0    0.015   0.059     0.810  100.000   93.939
LGA    K    65_A      K    65_A     0.364     0    0.036   0.592     1.615  100.000   88.783
LGA    A    66_A      A    66_A     0.264     0    0.012   0.025     0.371  100.000  100.000
LGA    V    67_A      V    67_A     0.209     0    0.033   0.038     0.244  100.000  100.000
LGA    S    68_A      S    68_A     0.379     0    0.061   0.129     0.747  100.000   98.413
LGA    E    69_A      E    69_A     0.681     0    0.025   0.229     1.013   90.476   89.471
LGA    G    70_A      G    70_A     0.648     0    0.024   0.024     0.648   90.476   90.476
LGA    E    71_A      E    71_A     0.464     0    0.030   0.222     0.936   95.238   96.825
LGA    R    72_A      R    72_A     0.444     0    0.055   0.113     0.629   97.619   93.074
LGA    S    73_A      S    73_A     0.348     0    0.067   0.070     0.488  100.000  100.000
LGA    F    74_A      F    74_A     0.149     0    0.011   0.046     0.214  100.000  100.000
LGA    T    75_A      T    75_A     0.097     0    0.040   0.094     0.269  100.000  100.000
LGA    H    76_A      H    76_A     0.114     0    0.055   0.085     0.318  100.000  100.000
LGA    L    77_A      L    77_A     0.124     0    0.010   0.065     0.252  100.000  100.000
LGA    V    78_A      V    78_A     0.114     0    0.011   0.036     0.229  100.000  100.000
LGA    V    79_A      V    79_A     0.134     0    0.041   0.100     0.260  100.000  100.000
LGA    A    80_A      A    80_A     0.175     0    0.022   0.049     0.202  100.000  100.000
LGA    G    81_A      G    81_A     0.290     0    0.014   0.014     0.290  100.000  100.000
LGA    H    82_A      H    82_A     0.225     0    0.032   0.056     0.338  100.000  100.000
LGA    T    83_A      T    83_A     0.690     0    0.022   0.053     1.203   95.238   91.905
LGA    P    84_A      P    84_A     0.785     0    0.057   0.404     2.378   90.476   84.218
LGA    D    85_A      D    85_A     0.330     0    0.063   0.096     0.946  100.000   96.429
LGA    P    86_A      P    86_A     0.707     0    0.068   0.064     0.843   92.857   93.197
LGA    I    87_A      I    87_A     1.305     0    0.024   1.272     4.113   85.952   79.345
LGA    S    88_A      S    88_A     0.866     0    0.039   0.145     1.540   85.952   83.016
LGA    P    89_A      P    89_A     0.752     0    0.020   0.113     0.882   90.476   90.476
LGA    C    90_A      C    90_A     0.882     0    0.015   0.056     0.916   90.476   90.476
LGA    G    91_A      G    91_A     1.090     0    0.058   0.058     1.090   85.952   85.952
LGA    A    92_A      A    92_A     0.879     0    0.018   0.022     0.964   90.476   90.476
LGA    C    93_A      C    93_A     0.310     0    0.013   0.077     0.538   97.619   98.413
LGA    R    94_A      R    94_A     0.486     0    0.048   0.106     1.595  100.000   89.870
LGA    Q    95_A      Q    95_A     0.493     0    0.058   0.127     0.905   97.619   93.651
LGA    V    96_A      V    96_A     0.260     0    0.025   0.047     0.372  100.000  100.000
LGA    M    97_A      M    97_A     0.283     0    0.025   0.734     1.953  100.000   93.095
LGA    A    98_A      A    98_A     0.337     0    0.018   0.024     0.425  100.000  100.000
LGA    E    99_A      E    99_A     0.320     0    0.028   0.148     0.895  100.000   96.825
LGA    F   100_A      F   100_A     0.050     0    0.023   0.074     0.208  100.000  100.000
LGA    C   101_A      C   101_A     0.210     0    0.026   0.040     0.287  100.000  100.000
LGA    A   102_A      A   102_A     0.199     0    0.015   0.023     0.267  100.000  100.000
LGA    P   103_A      P   103_A     0.268     0    0.077   0.084     0.497  100.000  100.000
LGA    D   104_A      D   104_A     0.349     0    0.026   0.370     1.369  100.000   96.488
LGA    M   105_A      M   105_A     0.342     0    0.011   0.650     1.875  100.000   94.226
LGA    P   106_A      P   106_A     0.345     0    0.075   0.212     0.579  100.000   98.639
LGA    V   107_A      V   107_A     0.365     0    0.035   0.048     0.432  100.000  100.000
LGA    T   108_A      T   108_A     0.306     0    0.039   0.040     0.356  100.000  100.000
LGA    L   109_A      L   109_A     0.340     0    0.014   0.054     0.468  100.000  100.000
LGA    V   110_A      V   110_A     0.132     0    0.049   0.077     0.224  100.000  100.000
LGA    G   111_A      G   111_A     0.489     0    0.043   0.043     0.687   95.238   95.238
LGA    D   112_A      D   112_A     0.601     0    0.021   0.139     1.142   90.476   89.345
LGA    N   113_A      N   113_A     0.709     0    0.035   0.853     2.915   90.476   85.179
LGA    G   114_A      G   114_A     0.675     0    0.039   0.039     0.691   90.476   90.476
LGA    V   115_A      V   115_A     0.402     0    0.075   1.108     2.773   97.619   87.483
LGA    T   116_A      T   116_A     0.179     0    0.031   0.038     0.311  100.000  100.000
LGA    K   117_A      K   117_A     0.289     0    0.056   0.656     2.065  100.000   93.968
LGA    A   118_A      A   118_A     0.370     0    0.047   0.072     0.665   97.619   98.095
LGA    T   119_A      T   119_A     0.393     0    0.043   0.069     0.541   97.619   97.279
LGA    T   120_A      T   120_A     0.412     0    0.020   0.033     0.520  100.000   98.639
LGA    V   121_A      V   121_A     0.403     0    0.013   0.041     0.449  100.000  100.000
LGA    R   122_A      R   122_A     0.469     0    0.013   1.060     4.298   95.238   79.307
LGA    E   123_A      E   123_A     0.600     0    0.010   0.368     1.187   90.476   88.466
LGA    L   124_A      L   124_A     0.495     0    0.065   0.067     0.711  100.000   96.429
LGA    L   125_A      L   125_A     0.421     0    0.022   0.094     0.805  100.000   95.238
LGA    P   126_A      P   126_A     0.417     0    0.044   0.047     0.487  100.000  100.000
LGA    Y   127_A      Y   127_A     0.789     0    0.040   1.297     7.495   90.476   63.452
LGA    A   128_A      A   128_A     0.792     0    0.014   0.018     0.832   92.857   92.381
LGA    F   129_A      F   129_A     0.653     0    0.013   0.134     0.954   90.476   90.476
LGA    T   130_A      T   130_A     0.385     0    0.020   0.146     0.884   95.238   94.558
LGA    E   131_A      E   131_A     1.307     0    0.093   0.874     3.604   83.690   73.492
LGA    K   132_A      K   132_A     1.311     0    0.105   0.613     5.431   69.405   56.614
LGA    D   133_A      D   133_A     3.149     0    0.021   0.275     5.307   53.810   43.452
LGA    L   134_A      L   134_A     2.175     0    0.614   1.032     3.683   55.714   63.393

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      133     532    532  100.00    1010   1010  100.00               133
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.615          0.640                  0.994           96.037   93.615

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  134  133    4.0    133    0.62    98.120    99.301    18.597

LGA_LOCAL      RMSD:   0.615  Number of atoms:  133  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.615  Number of assigned atoms:  133 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.615  Standard rmsd on all 133 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.032682 * X  +   0.808722 * Y  +   0.587283 * Z  + -30.079676
  Y_new =  -0.310124 * X  +   0.566800 * Y  +  -0.763257 * Z  +  25.436022
  Z_new =  -0.950134 * X  +  -0.157186 * Y  +   0.269328 * Z  + -12.462899 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -1.465799  1.253666 -0.528289   [DEG:  -83.9841   71.8298  -30.2687 ]
ZXZ:  0.655829  1.298101 -1.734746   [DEG:   37.5762   74.3757  -99.3937 ]
 
# END of job
