
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  134 ( 1014),  selected  133 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  133 ( 1010),  selected  133 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.56     0.56
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.56     0.56
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.56     0.56
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  133
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S     2_A     S     2_A    133  133  133     23  108  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M     3_A     M     3_A    133  133  133     32  114  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A     4_A     A     4_A    133  133  133     24  114  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     5_A     E     5_A    133  133  133     41  126  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L     6_A     L     6_A    133  133  133    106  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K     7_A     K     7_A    133  133  133    102  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q     8_A     Q     8_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     9_A     E     9_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     W    10_A     W    10_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    11_A     I    11_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    12_A     N    12_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    13_A     T    13_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    15_A     I    15_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    16_A     E    16_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    17_A     A    17_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    18_A     L    18_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    19_A     D    19_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    20_A     K    20_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    21_A     A    21_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    22_A     Y    22_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    24_A     P    24_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    25_A     Y    25_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    26_A     S    26_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    27_A     H    27_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    28_A     F    28_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    29_A     P    29_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    30_A     V    30_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    31_A     G    31_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    32_A     A    32_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    33_A     C    33_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    34_A     L    34_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    35_A     V    35_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    36_A     T    36_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    37_A     E    37_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    38_A     S    38_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    39_A     G    39_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    40_A     K    40_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    42_A     Y    42_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    43_A     Q    43_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    44_A     G    44_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    45_A     I    45_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    46_A     N    46_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    47_A     I    47_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    48_A     E    48_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    49_A     N    49_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    50_A     A    50_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    52_A     F    52_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    53_A     G    53_A    133  133  133     98  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    54_A     L    54_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    55_A     T    55_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    56_A     N    56_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    57_A     C    57_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    58_A     A    58_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    59_A     E    59_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    60_A     R    60_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    61_A     T    61_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    62_A     A    62_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    63_A     F    63_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    64_A     F    64_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    65_A     K    65_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    66_A     A    66_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    67_A     V    67_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    68_A     S    68_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    69_A     E    69_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    70_A     G    70_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    71_A     E    71_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    73_A     S    73_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    74_A     F    74_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    75_A     T    75_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    76_A     H    76_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    77_A     L    77_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    78_A     V    78_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    79_A     V    79_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    80_A     A    80_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    81_A     G    81_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    82_A     H    82_A    133  133  133     87  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    83_A     T    83_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    84_A     P    84_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    85_A     D    85_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    86_A     P    86_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    87_A     I    87_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    88_A     S    88_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    89_A     P    89_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    90_A     C    90_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    91_A     G    91_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    92_A     A    92_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    93_A     C    93_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    95_A     Q    95_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M    97_A     M    97_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    98_A     A    98_A    133  133  133    101  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    99_A     E    99_A    133  133  133    101  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C   101_A     C   101_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   103_A     P   103_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   104_A     D   104_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M   105_A     M   105_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   106_A     P   106_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   107_A     V   107_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   108_A     T   108_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   109_A     L   109_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   110_A     V   110_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   111_A     G   111_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   112_A     D   112_A    133  133  133     98  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   114_A     G   114_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   115_A     V   115_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   116_A     T   116_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   117_A     K   117_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   118_A     A   118_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   119_A     T   119_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   120_A     T   120_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   121_A     V   121_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R   122_A     R   122_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   123_A     E   123_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   126_A     P   126_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y   127_A     Y   127_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   128_A     A   128_A    133  133  133    102  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   129_A     F   129_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   130_A     T   130_A    133  133  133    117  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   131_A     E   131_A    133  133  133     67  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A    133  133  133     69  127  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   133_A     D   133_A    133  133  133      3    3    5    5  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   134_A     L   134_A    133  133  133      3    3  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT    117    127    132    132    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133 
GDT PERCENT_AT  87.97  95.49  99.25  99.25 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.28   0.34   0.49   0.49   0.56   0.56   0.56   0.56   0.56   0.56   0.56   0.56   0.56   0.56   0.56   0.56   0.56   0.56   0.56   0.56
GDT RMS_ALL_AT   0.59   0.58   0.56   0.56   0.56   0.56   0.56   0.56   0.56   0.56   0.56   0.56   0.56   0.56   0.56   0.56   0.56   0.56   0.56   0.56

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E     5_A      E     5_A
#   possible swapping detected:  E    16_A      E    16_A
#   possible swapping detected:  Y    22_A      Y    22_A
#   possible swapping detected:  F    28_A      F    28_A
#   possible swapping detected:  E    37_A      E    37_A
#   possible swapping detected:  Y    42_A      Y    42_A
#   possible swapping detected:  E    48_A      E    48_A
#   possible swapping detected:  E    59_A      E    59_A
#   possible swapping detected:  E    69_A      E    69_A
#   possible swapping detected:  E    71_A      E    71_A
#   possible swapping detected:  E    99_A      E    99_A
#   possible swapping detected:  E   123_A      E   123_A
#   possible swapping detected:  F   129_A      F   129_A
#   possible swapping detected:  E   131_A      E   131_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S     2_A      S     2_A     1.682     0    0.026   0.588     3.432   75.000   70.476
LGA    M     3_A      M     3_A     1.453     0    0.036   1.047     2.011   79.286   75.060
LGA    A     4_A      A     4_A     1.547     0    0.051   0.064     1.897   77.143   76.286
LGA    E     5_A      E     5_A     1.248     0    0.053   0.145     1.887   85.952   79.630
LGA    L     6_A      L     6_A     0.530     0    0.041   0.132     0.903   95.238   92.857
LGA    K     7_A      K     7_A     0.548     0    0.027   0.912     4.821   95.238   72.698
LGA    Q     8_A      Q     8_A     0.287     0    0.020   0.102     0.456  100.000  100.000
LGA    E     9_A      E     9_A     0.186     0    0.033   0.353     1.801  100.000   92.804
LGA    W    10_A      W    10_A     0.205     0    0.012   0.098     0.374  100.000  100.000
LGA    I    11_A      I    11_A     0.233     0    0.054   0.064     0.309  100.000  100.000
LGA    N    12_A      N    12_A     0.237     0    0.046   0.134     0.487  100.000  100.000
LGA    T    13_A      T    13_A     0.306     0    0.024   0.124     0.651  100.000   97.279
LGA    A    14_A      A    14_A     0.203     0    0.031   0.037     0.228  100.000  100.000
LGA    I    15_A      I    15_A     0.083     0    0.065   0.096     0.264  100.000  100.000
LGA    E    16_A      E    16_A     0.254     0    0.075   0.274     0.785   97.619   97.884
LGA    A    17_A      A    17_A     0.345     0    0.024   0.031     0.486  100.000  100.000
LGA    L    18_A      L    18_A     0.305     0    0.089   0.118     0.709   97.619   98.810
LGA    D    19_A      D    19_A     0.200     0    0.023   0.182     0.683  100.000   97.619
LGA    K    20_A      K    20_A     0.236     0    0.021   0.219     0.800  100.000   97.884
LGA    A    21_A      A    21_A     0.081     0    0.074   0.085     0.361  100.000  100.000
LGA    Y    22_A      Y    22_A     0.296     0    0.024   0.040     0.810  100.000   95.238
LGA    V    23_A      V    23_A     0.368     0    0.035   0.044     0.408  100.000  100.000
LGA    P    24_A      P    24_A     0.467     0    0.029   0.030     0.622   95.238   94.558
LGA    Y    25_A      Y    25_A     0.337     0    0.009   0.174     0.706  100.000   98.413
LGA    S    26_A      S    26_A     0.283     0    0.021   0.036     0.469  100.000  100.000
LGA    H    27_A      H    27_A     0.470     0    0.027   0.414     2.166  100.000   85.571
LGA    F    28_A      F    28_A     0.202     0    0.024   0.045     0.647  100.000   97.403
LGA    P    29_A      P    29_A     0.370     0    0.036   0.036     0.370  100.000  100.000
LGA    V    30_A      V    30_A     0.213     0    0.037   0.042     0.273  100.000  100.000
LGA    G    31_A      G    31_A     0.147     0    0.031   0.031     0.190  100.000  100.000
LGA    A    32_A      A    32_A     0.082     0    0.037   0.041     0.249  100.000  100.000
LGA    C    33_A      C    33_A     0.072     0    0.021   0.048     0.242  100.000  100.000
LGA    L    34_A      L    34_A     0.223     0    0.014   0.048     0.386  100.000  100.000
LGA    V    35_A      V    35_A     0.254     0    0.033   0.040     0.411  100.000  100.000
LGA    T    36_A      T    36_A     0.203     0    0.023   0.062     0.414  100.000  100.000
LGA    E    37_A      E    37_A     0.243     0    0.047   0.489     1.373  100.000   95.873
LGA    S    38_A      S    38_A     0.250     0    0.024   0.126     0.603  100.000   98.413
LGA    G    39_A      G    39_A     0.345     0    0.064   0.064     0.345  100.000  100.000
LGA    K    40_A      K    40_A     0.149     0    0.021   0.722     4.111  100.000   79.101
LGA    I    41_A      I    41_A     0.366     0    0.098   1.418     3.721  100.000   81.964
LGA    Y    42_A      Y    42_A     0.198     0    0.129   0.133     0.457  100.000  100.000
LGA    Q    43_A      Q    43_A     0.235     0    0.013   0.098     0.474  100.000  100.000
LGA    G    44_A      G    44_A     0.311     0    0.017   0.017     0.311  100.000  100.000
LGA    I    45_A      I    45_A     0.152     0    0.018   0.087     0.541  100.000   98.810
LGA    N    46_A      N    46_A     0.138     0    0.049   0.085     0.355  100.000  100.000
LGA    I    47_A      I    47_A     0.258     0    0.028   0.059     0.423  100.000  100.000
LGA    E    48_A      E    48_A     0.353     0    0.042   0.102     0.534   97.619   98.942
LGA    N    49_A      N    49_A     0.539     0    0.013   0.038     1.050   97.619   92.917
LGA    A    50_A      A    50_A     0.257     0    0.010   0.014     0.416  100.000  100.000
LGA    S    51_A      S    51_A     0.568     0    0.068   0.068     1.055   95.238   92.143
LGA    F    52_A      F    52_A     0.437     0    0.053   0.083     0.921   97.619   93.939
LGA    G    53_A      G    53_A     0.680     0    0.018   0.018     0.680   90.476   90.476
LGA    L    54_A      L    54_A     0.553     0    0.013   0.103     1.210   95.238   90.595
LGA    T    55_A      T    55_A     0.141     0    0.080   0.080     0.398  100.000  100.000
LGA    N    56_A      N    56_A     0.231     0    0.029   0.135     0.466  100.000  100.000
LGA    C    57_A      C    57_A     0.097     0    0.014   0.061     0.423  100.000  100.000
LGA    A    58_A      A    58_A     0.181     0    0.027   0.034     0.182  100.000  100.000
LGA    E    59_A      E    59_A     0.163     0    0.034   0.154     0.672  100.000   98.942
LGA    R    60_A      R    60_A     0.112     0    0.051   0.115     1.249  100.000   93.203
LGA    T    61_A      T    61_A     0.208     0    0.017   0.072     0.260  100.000  100.000
LGA    A    62_A      A    62_A     0.229     0    0.040   0.045     0.247  100.000  100.000
LGA    F    63_A      F    63_A     0.262     0    0.051   0.072     0.390  100.000  100.000
LGA    F    64_A      F    64_A     0.277     0    0.015   0.063     0.512  100.000   99.134
LGA    K    65_A      K    65_A     0.160     0    0.040   0.633     1.968  100.000   87.937
LGA    A    66_A      A    66_A     0.182     0    0.014   0.027     0.262  100.000  100.000
LGA    V    67_A      V    67_A     0.219     0    0.041   0.048     0.259  100.000  100.000
LGA    S    68_A      S    68_A     0.177     0    0.054   0.130     0.391  100.000  100.000
LGA    E    69_A      E    69_A     0.422     0    0.023   0.173     0.651   97.619   95.767
LGA    G    70_A      G    70_A     0.563     0    0.024   0.024     0.613   92.857   92.857
LGA    E    71_A      E    71_A     0.537     0    0.030   0.234     1.257   90.476   89.471
LGA    R    72_A      R    72_A     0.464     0    0.043   0.098     0.754  100.000   93.939
LGA    S    73_A      S    73_A     0.157     0    0.061   0.063     0.316  100.000  100.000
LGA    F    74_A      F    74_A     0.099     0    0.006   0.088     0.379  100.000  100.000
LGA    T    75_A      T    75_A     0.064     0    0.072   0.070     0.442  100.000  100.000
LGA    H    76_A      H    76_A     0.071     0    0.053   0.826     4.371  100.000   74.714
LGA    L    77_A      L    77_A     0.051     0    0.015   0.079     0.312  100.000  100.000
LGA    V    78_A      V    78_A     0.051     0    0.009   0.043     0.223  100.000  100.000
LGA    V    79_A      V    79_A     0.020     0    0.027   0.059     0.203  100.000  100.000
LGA    A    80_A      A    80_A     0.078     0    0.028   0.056     0.273  100.000  100.000
LGA    G    81_A      G    81_A     0.318     0    0.012   0.012     0.669   97.619   97.619
LGA    H    82_A      H    82_A     0.686     0    0.059   0.116     0.980   92.857   91.429
LGA    T    83_A      T    83_A     0.672     0    0.034   0.057     0.935   90.476   90.476
LGA    P    84_A      P    84_A     0.549     0    0.038   0.391     1.017   95.238   93.265
LGA    D    85_A      D    85_A     0.567     0    0.019   0.061     0.945   97.619   94.048
LGA    P    86_A      P    86_A     0.655     0    0.048   0.045     0.675   90.476   90.476
LGA    I    87_A      I    87_A     0.540     0    0.022   0.067     0.711   90.476   90.476
LGA    S    88_A      S    88_A     0.524     0    0.030   0.050     0.765   90.476   92.063
LGA    P    89_A      P    89_A     0.456     0    0.013   0.100     0.546   95.238   97.279
LGA    C    90_A      C    90_A     0.485     0    0.022   0.059     0.559   95.238   96.825
LGA    G    91_A      G    91_A     0.642     0    0.057   0.057     0.642   92.857   92.857
LGA    A    92_A      A    92_A     0.373     0    0.017   0.022     0.481  100.000  100.000
LGA    C    93_A      C    93_A     0.143     0    0.014   0.042     0.347  100.000  100.000
LGA    R    94_A      R    94_A     0.338     0    0.045   0.059     0.914  100.000   95.671
LGA    Q    95_A      Q    95_A     0.282     0    0.051   0.101     0.380  100.000  100.000
LGA    V    96_A      V    96_A     0.170     0    0.026   0.044     0.419  100.000  100.000
LGA    M    97_A      M    97_A     0.302     0    0.017   0.747     2.208  100.000   94.405
LGA    A    98_A      A    98_A     0.484     0    0.018   0.025     0.654   95.238   94.286
LGA    E    99_A      E    99_A     0.449     0    0.045   0.147     1.037  100.000   93.704
LGA    F   100_A      F   100_A     0.405     0    0.024   0.231     1.067  100.000   92.294
LGA    C   101_A      C   101_A     0.223     0    0.020   0.046     0.288  100.000  100.000
LGA    A   102_A      A   102_A     0.204     0    0.022   0.027     0.288  100.000  100.000
LGA    P   103_A      P   103_A     0.238     0    0.081   0.089     0.378  100.000  100.000
LGA    D   104_A      D   104_A     0.203     0    0.037   0.396     1.448  100.000   95.298
LGA    M   105_A      M   105_A     0.259     0    0.015   0.099     0.559  100.000   98.810
LGA    P   106_A      P   106_A     0.255     0    0.051   0.239     0.447  100.000  100.000
LGA    V   107_A      V   107_A     0.216     0    0.027   0.040     0.274  100.000  100.000
LGA    T   108_A      T   108_A     0.220     0    0.020   0.028     0.249  100.000  100.000
LGA    L   109_A      L   109_A     0.309     0    0.019   0.045     0.417  100.000  100.000
LGA    V   110_A      V   110_A     0.284     0    0.041   0.062     0.319  100.000  100.000
LGA    G   111_A      G   111_A     0.648     0    0.024   0.024     0.648   90.476   90.476
LGA    D   112_A      D   112_A     0.747     0    0.019   0.116     1.694   90.476   86.012
LGA    N   113_A      N   113_A     0.639     0    0.052   0.856     3.738   95.238   82.560
LGA    G   114_A      G   114_A     0.586     0    0.061   0.061     0.586   90.476   90.476
LGA    V   115_A      V   115_A     0.547     0    0.071   1.086     2.734   90.476   80.952
LGA    T   116_A      T   116_A     0.256     0    0.030   0.041     0.312  100.000  100.000
LGA    K   117_A      K   117_A     0.252     0    0.054   0.666     1.632  100.000   93.862
LGA    A   118_A      A   118_A     0.311     0    0.045   0.070     0.437  100.000  100.000
LGA    T   119_A      T   119_A     0.234     0    0.040   0.071     0.421  100.000  100.000
LGA    T   120_A      T   120_A     0.306     0    0.021   0.034     0.456  100.000  100.000
LGA    V   121_A      V   121_A     0.225     0    0.011   0.039     0.261  100.000  100.000
LGA    R   122_A      R   122_A     0.228     0    0.013   1.086     4.169  100.000   83.377
LGA    E   123_A      E   123_A     0.266     0    0.018   0.325     1.218  100.000   96.878
LGA    L   124_A      L   124_A     0.207     0    0.061   0.065     0.573  100.000   97.619
LGA    L   125_A      L   125_A     0.285     0    0.025   0.099     1.064  100.000   94.107
LGA    P   126_A      P   126_A     0.252     0    0.049   0.350     1.007  100.000   97.347
LGA    Y   127_A      Y   127_A     0.594     0    0.047   1.296     7.941   95.238   62.460
LGA    A   128_A      A   128_A     0.859     0    0.023   0.028     1.015   90.476   88.667
LGA    F   129_A      F   129_A     0.577     0    0.013   0.107     0.687   95.238   92.208
LGA    T   130_A      T   130_A     0.127     0    0.030   0.137     0.652   97.619   95.918
LGA    E   131_A      E   131_A     0.763     0    0.088   0.798     2.740   92.857   82.857
LGA    K   132_A      K   132_A     1.043     0    0.096   0.606     5.335   73.452   59.101
LGA    D   133_A      D   133_A     3.150     0    0.011   0.240     5.159   52.024   42.560
LGA    L   134_A      L   134_A     2.183     0    0.620   1.025     3.820   55.714   64.345

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      133     532    532  100.00    1010   1010  100.00               133
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.557          0.584                  0.990           96.892   94.231

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  134  133    4.0    133    0.56    98.684    99.535    20.235

LGA_LOCAL      RMSD:   0.557  Number of atoms:  133  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.557  Number of assigned atoms:  133 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.557  Standard rmsd on all 133 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.599797 * X  +   0.799006 * Y  +  -0.042814 * Z  + -29.206758
  Y_new =  -0.301737 * X  +   0.176302 * Y  +  -0.936949 * Z  +  22.096182
  Z_new =  -0.741079 * X  +   0.574897 * Y  +   0.346835 * Z  + -16.363432 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -0.466097  0.834677  1.027955   [DEG:  -26.7054   47.8234   58.8975 ]
ZXZ: -0.045664  1.216602 -0.911014   [DEG:   -2.6163   69.7062  -52.1972 ]
 
# END of job
