
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  134 ( 1014),  selected  133 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  133 ( 1010),  selected  133 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.55     0.55
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.55     0.55
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.55     0.55
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  133
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S     2_A     S     2_A    133  133  133     39  119  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M     3_A     M     3_A    133  133  133     45  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A     4_A     A     4_A    133  133  133     27  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     5_A     E     5_A    133  133  133     40  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L     6_A     L     6_A    133  133  133    117  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K     7_A     K     7_A    133  133  133    117  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q     8_A     Q     8_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     9_A     E     9_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     W    10_A     W    10_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    11_A     I    11_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    12_A     N    12_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    13_A     T    13_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    15_A     I    15_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    16_A     E    16_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    17_A     A    17_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    18_A     L    18_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    19_A     D    19_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    20_A     K    20_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    21_A     A    21_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    22_A     Y    22_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    24_A     P    24_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    25_A     Y    25_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    26_A     S    26_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    27_A     H    27_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    28_A     F    28_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    29_A     P    29_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    30_A     V    30_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    31_A     G    31_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    32_A     A    32_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    33_A     C    33_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    34_A     L    34_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    35_A     V    35_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    36_A     T    36_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    37_A     E    37_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    38_A     S    38_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    39_A     G    39_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    40_A     K    40_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    42_A     Y    42_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    43_A     Q    43_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    44_A     G    44_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    45_A     I    45_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    46_A     N    46_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    47_A     I    47_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    48_A     E    48_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    49_A     N    49_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    50_A     A    50_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    52_A     F    52_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    53_A     G    53_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    54_A     L    54_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    55_A     T    55_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    56_A     N    56_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    57_A     C    57_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    58_A     A    58_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    59_A     E    59_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    60_A     R    60_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    61_A     T    61_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    62_A     A    62_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    63_A     F    63_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    64_A     F    64_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    65_A     K    65_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    66_A     A    66_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    67_A     V    67_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    68_A     S    68_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    69_A     E    69_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    70_A     G    70_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    71_A     E    71_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    73_A     S    73_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    74_A     F    74_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    75_A     T    75_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    76_A     H    76_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    77_A     L    77_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    78_A     V    78_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    79_A     V    79_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    80_A     A    80_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    81_A     G    81_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    82_A     H    82_A    133  133  133     99  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    83_A     T    83_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    84_A     P    84_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    85_A     D    85_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    86_A     P    86_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    87_A     I    87_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    88_A     S    88_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    89_A     P    89_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    90_A     C    90_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    91_A     G    91_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    92_A     A    92_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    93_A     C    93_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    95_A     Q    95_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M    97_A     M    97_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    98_A     A    98_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    99_A     E    99_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C   101_A     C   101_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   103_A     P   103_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   104_A     D   104_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M   105_A     M   105_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   106_A     P   106_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   107_A     V   107_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   108_A     T   108_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   109_A     L   109_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   110_A     V   110_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   111_A     G   111_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   112_A     D   112_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   114_A     G   114_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   115_A     V   115_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   116_A     T   116_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   117_A     K   117_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   118_A     A   118_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   119_A     T   119_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   120_A     T   120_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   121_A     V   121_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R   122_A     R   122_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   123_A     E   123_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   126_A     P   126_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y   127_A     Y   127_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   128_A     A   128_A    133  133  133     90  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   129_A     F   129_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   130_A     T   130_A    133  133  133    119  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   131_A     E   131_A    133  133  133     39  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A    133  133  133     67  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   133_A     D   133_A    133  133  133      3    3    5    5  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   134_A     L   134_A    133  133  133      3    3  130  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT    119    128    131    132    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133 
GDT PERCENT_AT  89.47  96.24  98.50  99.25 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.28   0.36   0.42   0.47   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55
GDT RMS_ALL_AT   0.58   0.56   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E     5_A      E     5_A
#   possible swapping detected:  E    16_A      E    16_A
#   possible swapping detected:  Y    22_A      Y    22_A
#   possible swapping detected:  F    28_A      F    28_A
#   possible swapping detected:  E    37_A      E    37_A
#   possible swapping detected:  Y    42_A      Y    42_A
#   possible swapping detected:  E    48_A      E    48_A
#   possible swapping detected:  E    59_A      E    59_A
#   possible swapping detected:  E    69_A      E    69_A
#   possible swapping detected:  E    71_A      E    71_A
#   possible swapping detected:  E    99_A      E    99_A
#   possible swapping detected:  E   123_A      E   123_A
#   possible swapping detected:  F   129_A      F   129_A
#   possible swapping detected:  E   131_A      E   131_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S     2_A      S     2_A     1.457     0    0.027   0.598     3.299   81.429   74.762
LGA    M     3_A      M     3_A     1.255     0    0.035   1.048     2.077   83.690   79.405
LGA    A     4_A      A     4_A     1.377     0    0.054   0.067     1.708   83.690   81.524
LGA    E     5_A      E     5_A     1.111     0    0.053   0.111     1.640   85.952   80.582
LGA    L     6_A      L     6_A     0.443     0    0.043   0.126     0.794   97.619   95.238
LGA    K     7_A      K     7_A     0.471     0    0.027   0.911     4.697  100.000   75.661
LGA    Q     8_A      Q     8_A     0.258     0    0.024   0.112     0.456  100.000  100.000
LGA    E     9_A      E     9_A     0.187     0    0.040   0.345     1.701  100.000   94.868
LGA    W    10_A      W    10_A     0.235     0    0.017   0.102     0.418  100.000  100.000
LGA    I    11_A      I    11_A     0.235     0    0.058   0.074     0.297  100.000  100.000
LGA    N    12_A      N    12_A     0.301     0    0.044   0.138     0.531  100.000   98.810
LGA    T    13_A      T    13_A     0.399     0    0.018   0.091     0.821  100.000   95.918
LGA    A    14_A      A    14_A     0.206     0    0.023   0.029     0.230  100.000  100.000
LGA    I    15_A      I    15_A     0.090     0    0.065   0.096     0.251  100.000  100.000
LGA    E    16_A      E    16_A     0.255     0    0.061   0.260     0.747   97.619   97.884
LGA    A    17_A      A    17_A     0.416     0    0.022   0.036     0.590   97.619   96.190
LGA    L    18_A      L    18_A     0.359     0    0.086   0.108     0.748   97.619   98.810
LGA    D    19_A      D    19_A     0.168     0    0.024   0.140     0.632  100.000   97.619
LGA    K    20_A      K    20_A     0.215     0    0.020   0.231     0.943  100.000   97.884
LGA    A    21_A      A    21_A     0.063     0    0.070   0.078     0.353  100.000  100.000
LGA    Y    22_A      Y    22_A     0.299     0    0.021   0.038     0.870  100.000   94.444
LGA    V    23_A      V    23_A     0.357     0    0.032   0.042     0.413  100.000  100.000
LGA    P    24_A      P    24_A     0.461     0    0.027   0.029     0.627   95.238   94.558
LGA    Y    25_A      Y    25_A     0.384     0    0.007   0.149     0.642  100.000   98.413
LGA    S    26_A      S    26_A     0.326     0    0.018   0.036     0.479  100.000  100.000
LGA    H    27_A      H    27_A     0.482     0    0.027   0.408     2.126  100.000   87.286
LGA    F    28_A      F    28_A     0.247     0    0.027   0.044     0.736  100.000   96.537
LGA    P    29_A      P    29_A     0.345     0    0.034   0.034     0.345  100.000  100.000
LGA    V    30_A      V    30_A     0.228     0    0.039   0.048     0.289  100.000  100.000
LGA    G    31_A      G    31_A     0.232     0    0.028   0.028     0.261  100.000  100.000
LGA    A    32_A      A    32_A     0.106     0    0.029   0.036     0.231  100.000  100.000
LGA    C    33_A      C    33_A     0.090     0    0.016   0.038     0.241  100.000  100.000
LGA    L    34_A      L    34_A     0.233     0    0.020   0.048     0.333  100.000  100.000
LGA    V    35_A      V    35_A     0.242     0    0.032   0.035     0.405  100.000  100.000
LGA    T    36_A      T    36_A     0.167     0    0.019   0.076     0.367  100.000  100.000
LGA    E    37_A      E    37_A     0.190     0    0.056   0.520     1.494  100.000   94.815
LGA    S    38_A      S    38_A     0.226     0    0.034   0.051     0.480  100.000  100.000
LGA    G    39_A      G    39_A     0.295     0    0.051   0.051     0.295  100.000  100.000
LGA    K    40_A      K    40_A     0.124     0    0.017   0.722     4.077  100.000   79.788
LGA    I    41_A      I    41_A     0.361     0    0.081   1.443     3.743  100.000   81.964
LGA    Y    42_A      Y    42_A     0.154     0    0.100   0.136     0.520  100.000   99.206
LGA    Q    43_A      Q    43_A     0.146     0    0.012   0.462     1.562  100.000   90.794
LGA    G    44_A      G    44_A     0.246     0    0.006   0.006     0.267  100.000  100.000
LGA    I    45_A      I    45_A     0.145     0    0.015   0.092     0.602  100.000   98.810
LGA    N    46_A      N    46_A     0.133     0    0.050   0.095     0.372  100.000  100.000
LGA    I    47_A      I    47_A     0.269     0    0.026   0.061     0.459  100.000  100.000
LGA    E    48_A      E    48_A     0.315     0    0.040   0.106     0.507   97.619   98.942
LGA    N    49_A      N    49_A     0.492     0    0.018   0.039     1.059  100.000   94.107
LGA    A    50_A      A    50_A     0.344     0    0.012   0.019     0.476  100.000  100.000
LGA    S    51_A      S    51_A     0.468     0    0.085   0.117     1.107  100.000   95.317
LGA    F    52_A      F    52_A     0.378     0    0.043   0.069     0.604  100.000   97.403
LGA    G    53_A      G    53_A     0.564     0    0.014   0.014     0.571   92.857   92.857
LGA    L    54_A      L    54_A     0.424     0    0.018   0.109     1.035  100.000   95.298
LGA    T    55_A      T    55_A     0.110     0    0.075   0.078     0.390  100.000  100.000
LGA    N    56_A      N    56_A     0.205     0    0.028   0.104     0.412  100.000  100.000
LGA    C    57_A      C    57_A     0.125     0    0.014   0.055     0.422  100.000  100.000
LGA    A    58_A      A    58_A     0.180     0    0.029   0.037     0.181  100.000  100.000
LGA    E    59_A      E    59_A     0.188     0    0.029   0.159     0.703  100.000   98.942
LGA    R    60_A      R    60_A     0.123     0    0.048   0.110     1.223  100.000   93.203
LGA    T    61_A      T    61_A     0.203     0    0.023   0.074     0.252  100.000  100.000
LGA    A    62_A      A    62_A     0.219     0    0.036   0.039     0.241  100.000  100.000
LGA    F    63_A      F    63_A     0.251     0    0.051   0.067     0.370  100.000  100.000
LGA    F    64_A      F    64_A     0.268     0    0.018   0.078     0.502  100.000   99.134
LGA    K    65_A      K    65_A     0.192     0    0.038   0.561     2.591  100.000   83.492
LGA    A    66_A      A    66_A     0.267     0    0.022   0.032     0.330  100.000  100.000
LGA    V    67_A      V    67_A     0.251     0    0.048   0.050     0.304  100.000  100.000
LGA    S    68_A      S    68_A     0.153     0    0.041   0.088     0.411  100.000  100.000
LGA    E    69_A      E    69_A     0.457     0    0.037   0.787     3.281   95.238   83.280
LGA    G    70_A      G    70_A     0.602     0    0.032   0.032     0.602   90.476   90.476
LGA    E    71_A      E    71_A     0.525     0    0.028   0.198     1.223   90.476   89.471
LGA    R    72_A      R    72_A     0.451     0    0.051   0.100     0.691  100.000   93.939
LGA    S    73_A      S    73_A     0.164     0    0.056   0.060     0.316  100.000  100.000
LGA    F    74_A      F    74_A     0.137     0    0.007   0.081     0.310  100.000  100.000
LGA    T    75_A      T    75_A     0.070     0    0.079   0.088     0.422  100.000  100.000
LGA    H    76_A      H    76_A     0.063     0    0.051   0.732     3.942  100.000   77.381
LGA    L    77_A      L    77_A     0.064     0    0.017   0.079     0.350  100.000  100.000
LGA    V    78_A      V    78_A     0.061     0    0.010   0.041     0.204  100.000  100.000
LGA    V    79_A      V    79_A     0.043     0    0.027   0.058     0.235  100.000  100.000
LGA    A    80_A      A    80_A     0.083     0    0.031   0.059     0.316  100.000  100.000
LGA    G    81_A      G    81_A     0.340     0    0.010   0.010     0.663   97.619   97.619
LGA    H    82_A      H    82_A     0.691     0    0.050   0.106     0.983   92.857   91.429
LGA    T    83_A      T    83_A     0.678     0    0.036   0.056     0.921   90.476   90.476
LGA    P    84_A      P    84_A     0.572     0    0.020   0.384     0.995   95.238   94.558
LGA    D    85_A      D    85_A     0.556     0    0.016   0.069     0.960   97.619   94.048
LGA    P    86_A      P    86_A     0.651     0    0.052   0.049     0.679   90.476   90.476
LGA    I    87_A      I    87_A     0.522     0    0.025   0.067     0.666   90.476   90.476
LGA    S    88_A      S    88_A     0.512     0    0.026   0.144     0.700   90.476   92.063
LGA    P    89_A      P    89_A     0.439     0    0.012   0.094     0.526   97.619   98.639
LGA    C    90_A      C    90_A     0.474     0    0.021   0.064     0.540   95.238   96.825
LGA    G    91_A      G    91_A     0.628     0    0.062   0.062     0.628   95.238   95.238
LGA    A    92_A      A    92_A     0.380     0    0.018   0.022     0.477  100.000  100.000
LGA    C    93_A      C    93_A     0.102     0    0.015   0.039     0.312  100.000  100.000
LGA    R    94_A      R    94_A     0.249     0    0.041   0.105     1.187  100.000   94.848
LGA    Q    95_A      Q    95_A     0.236     0    0.050   0.103     0.313  100.000  100.000
LGA    V    96_A      V    96_A     0.141     0    0.026   0.053     0.392  100.000  100.000
LGA    M    97_A      M    97_A     0.235     0    0.019   0.873     2.635  100.000   93.452
LGA    A    98_A      A    98_A     0.436     0    0.015   0.022     0.637   95.238   96.190
LGA    E    99_A      E    99_A     0.424     0    0.043   0.144     1.023  100.000   93.704
LGA    F   100_A      F   100_A     0.355     0    0.019   0.138     0.780  100.000   93.939
LGA    C   101_A      C   101_A     0.209     0    0.025   0.045     0.285  100.000  100.000
LGA    A   102_A      A   102_A     0.194     0    0.021   0.026     0.282  100.000  100.000
LGA    P   103_A      P   103_A     0.242     0    0.074   0.083     0.387  100.000  100.000
LGA    D   104_A      D   104_A     0.194     0    0.037   0.412     1.484  100.000   95.298
LGA    M   105_A      M   105_A     0.267     0    0.013   0.096     0.518  100.000   98.810
LGA    P   106_A      P   106_A     0.266     0    0.041   0.229     0.443  100.000  100.000
LGA    V   107_A      V   107_A     0.202     0    0.035   0.041     0.272  100.000  100.000
LGA    T   108_A      T   108_A     0.186     0    0.026   0.038     0.240  100.000  100.000
LGA    L   109_A      L   109_A     0.331     0    0.020   0.041     0.447  100.000  100.000
LGA    V   110_A      V   110_A     0.303     0    0.031   0.042     0.341  100.000  100.000
LGA    G   111_A      G   111_A     0.605     0    0.022   0.022     0.610   90.476   90.476
LGA    D   112_A      D   112_A     0.713     0    0.025   0.110     1.617   90.476   86.012
LGA    N   113_A      N   113_A     0.572     0    0.050   0.862     3.798   95.238   81.548
LGA    G   114_A      G   114_A     0.544     0    0.062   0.062     0.544   97.619   97.619
LGA    V   115_A      V   115_A     0.430     0    0.048   1.177     2.843   97.619   86.395
LGA    T   116_A      T   116_A     0.209     0    0.033   0.044     0.315  100.000  100.000
LGA    K   117_A      K   117_A     0.242     0    0.048   0.668     1.606  100.000   93.862
LGA    A   118_A      A   118_A     0.343     0    0.047   0.073     0.486  100.000  100.000
LGA    T   119_A      T   119_A     0.230     0    0.039   0.068     0.403  100.000  100.000
LGA    T   120_A      T   120_A     0.303     0    0.020   0.029     0.465  100.000  100.000
LGA    V   121_A      V   121_A     0.226     0    0.011   0.039     0.288  100.000  100.000
LGA    R   122_A      R   122_A     0.246     0    0.012   1.107     4.138  100.000   84.719
LGA    E   123_A      E   123_A     0.274     0    0.014   0.273     1.087  100.000   97.937
LGA    L   124_A      L   124_A     0.201     0    0.061   0.069     0.557  100.000   97.619
LGA    L   125_A      L   125_A     0.282     0    0.022   0.098     1.071  100.000   94.107
LGA    P   126_A      P   126_A     0.234     0    0.047   0.349     0.972  100.000   98.639
LGA    Y   127_A      Y   127_A     0.667     0    0.048   1.292     7.831   90.476   61.230
LGA    A   128_A      A   128_A     0.923     0    0.023   0.027     1.045   90.476   88.667
LGA    F   129_A      F   129_A     0.602     0    0.011   0.108     0.741   92.857   91.342
LGA    T   130_A      T   130_A     0.126     0    0.028   0.140     0.705   97.619   95.918
LGA    E   131_A      E   131_A     0.851     0    0.092   0.848     3.020   90.595   80.106
LGA    K   132_A      K   132_A     1.152     0    0.096   0.611     5.239   71.667   58.307
LGA    D   133_A      D   133_A     3.201     0    0.011   0.247     5.195   52.024   42.560
LGA    L   134_A      L   134_A     2.278     0    0.617   1.017     4.102   54.167   63.571

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      133     532    532  100.00    1010   1010  100.00               133
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.546          0.581                  0.990           97.196   94.389

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  134  133    4.0    133    0.55    98.872    99.538    20.603

LGA_LOCAL      RMSD:   0.546  Number of atoms:  133  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.546  Number of assigned atoms:  133 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.546  Standard rmsd on all 133 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.547348 * X  +   0.517359 * Y  +  -0.657837 * Z  + -30.295279
  Y_new =   0.093591 * X  +  -0.743266 * Y  +  -0.662417 * Z  +  27.688086
  Z_new =  -0.831656 * X  +  -0.424140 * Y  +   0.358405 * Z  + -11.200501 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  2.972240  0.982082 -0.869204   [DEG:  170.2968   56.2692  -49.8017 ]
ZXZ: -0.781929  1.204238 -2.042408   [DEG:  -44.8012   68.9977 -117.0214 ]
 
# END of job
